PubMed. Búsqueda bibiográfica en la base de datos MEDLINE

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Objetivo: Aprender a diseñar y ejecutar estrategias de búsqueda bibliográfica para obtener resultados relevantes en la base de datos MEDLINE, a través de la plataforma PubMed. Descripción: PubMed es la base de datos bibliográfica de la National Library of Medicine de los EEUU. Incluye más de 19 millones de registros de artículos biomédicos de MEDLINE, así como de otras revistas sobre ciencias de la vida. Programa: 1. Acceso personalizado a PubMed a través de Bibliosalut (www.bibliosalut.com). 2. La búsqueda bibliográfica: cómo se interroga una base de datos. Los lenguajes documentales. El ruido y el silencio documental. Los operadores booleanos y de proximidad. Cómo se analizan los resultados. 3. El uso del MeSH (Medical Subject Headings). El tesaurus de Medline. 4. La búsqueda simple y la búsqueda avanzada. 5. Opciones para guardar los resultados y crear citaciones. 6. Los límites. 7. La cuenta personal de PubMed (My NCBI). Creación de colecciones de referencia y de autoalertas. 8. La herramienta para encontrar una citación concreta: Single Citation Matcher.

Transcript of PubMed. Búsqueda bibiográfica en la base de datos MEDLINE

PubMed Búsqueda bibliográfica en la base de datos

Medline

Comissió de Formació Continuada de les Professions Sanitàries de les Illes Balears

(0,5 crèdits)

www.bibliosalut.com

Objetivo

Aprender a diseñar y ejecutar estrategias de búsqueda

bibliográfica para obtener resultados relevantes en la

base de datos MEDLINE, a través de la plataforma

PubMed.

2

Sumario

• Acceso personalizado a través de Bibliosalut. • La búsqueda bibliográfica. • El uso del MeSH (Medical Subject Headings).• La búsqueda simple y la búsqueda avanzada. • Opciones para guardar los resultados y crear

citaciones. • Los límites. • La cuenta personal de PubMed (My NCBI). Creación de

colecciones de referencias y de autoalertas. • La herramienta para encontrar una citación concreta:

el Single Citation Matcher. 3

Esta presentación

Importancia de la MBE

5

PubMed

• PubMed es la base de datos bibliográfica de la National

Library of Medicine de los EE.UU. Incluye más de 19

millones de registros de artículos biomédicos de MEDLINE,

así como de otras revistas sobre ciencias de la vida.

• Más de 19 millones de registros de 5.400 revistas de 80

países del mundo, en 37 idiomas. Diariamente se

incorporan entre 2.000 y 4.000 referencias de artículos.

• Años de cobertura: desde 1947 hasta la actualidad.

6

Acceso personalizado a Bibliosalut

7

Búsqueda bibliográfica

Identificar la necesidad de información

• La pregunta clínica es la herramienta para elaborar la

estrategia de búsqueda y en ella tienen que estar

representados todos los términos relevantes.

• Hay que formularla correctamente para obtener unos

resultados precisos de una manera eficiente y evitar

recuperar un elevado número de artículos

irrelevantes.

9

Identificar la necesidad de información

• Cuanto más concreta y concisa sea la pregunta más posibilidades tendremos de obtener unos resultados satisfactorios.

10

Algunos ejemplos a mejorar:

11

“Prevención del asma”

Algunos ejemplos a mejorar:

12

“Prevención del asma en ancianos de más de 80 años

en Calviá”

Algunos ejemplos a mejorar:

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“Prevención del asma en ancianos que padecen alergias crónicas, tratamiento más eficaz y menos adverso, y pronóstico a corto y

a medio plazo”

¿Cómo funciona una base de datos?

15

La indexación: identificación del contenido

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El concepto de tesauro y los descriptores

• Los tesauros son herramientas de control terminológico, vocabularios controlados y dinámicos de términos (descriptores) que pueden mantener relaciones entre ellos de jerarquía, asociación y equivalencia.

• Los descriptores son los términos que forman parte de un tesauro y que sirven para identificar el contenido de un documento y recuperarlo.

17

El concepto de tesauro y los descriptores

• Los tesauros asociados a bases de datos admiten un

único término para designar un único concepto.

Por ejemplo:

accidente vascular cerebral AVC ictus

apoplegíaaccidente vascular cerebral

Lenguaje libre

Descriptor del tesauro

18

El MeSH: el tesauro de PubMed

19

El MeSH: el tesauro de PubMed

20

Lenguaje natural Lenguaje controlado

Las palabras clave y los descriptores

Palabras clave

Términos libres del lenguaje natural, suficientemente

significativos, extraídos del título o del contenido del

documento.

Descriptores

Términos de un tesauro (vocabulario controlado), utilizado

para la indexación con el fin de identificar el contenido de los documentos: MeSH, DeCS...

RUIDO PRECISIÓN

Protocolo de búsqueda

• La necesidad de información requiere la construcción

de una pregunta simple y concreta con la que poder

dar respuesta bibliográfica a esta necesidad.

Por ejemplo:

¿Puede la motivación de los médicos incidir en la calidad de la asistencia sanitaria que dan a los pacientes?

1º Plantear una pregunta clínica

22

2º Identificar las palabras clave

• Se trata de determinar, mediante el lenguaje

libre, las ideas clave que se esconden tras la

pregunta inicial.

Por ejemplo:

Motivación / Incentivos / Médicos / Calidad asistencial

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3º Seleccionar los descriptores en el tesauro

• Tendremos que utilizar el tesauro (por ejemplo, el MeSH de PubMed o el DeCS de BIREME). Se trata de identificar los términos más apropiados que esta herramienta ofrece para cada uno de los términos en lenguaje libre identificados en la pregunta.

Exemple: Motivación / Incentivos / Médicos / Calidad de la atención de salud

(BIREME) Motivation / Incentives / Physician / Quality of healthcare

(Pubmed)

24

4º Utilizar máscaras y truncamientos (si procede)• En una búsqueda de texto libre, se puede conseguir un mayor grado de

exhaustividad aplicando los caracteres de truncamiento: (*) o ($)

Por ejemplo:

Para localizar términos relacionados con la “motivación” hay que escribir “motivat*”

(Motivat* OR Incentive*) AND Physician* AND Quality of healthcare

• Ralentiza enormemente la búsqueda.

• Con según que términos es delicado porque se pueden obtener referencias que no

tengan nada que ver con la materia que estamos buscando: (al truncar “phys*”, en

lugar de “physician*”, la búsqueda recupera términos como “physiology“ o

“physics”, que nada tienen que ver con el término “physicians”.

25

5º Relacionar los términos

• Una vez identificados los términos (MeSH o DeCS) más pertinentes, hay que combinarlos (utilizado los operadores booleanos) con lógica para poder ejecutar la pregunta a la base de datos.

26

Operador “Y” (AND)

• Para la intersección de los dos términos:

Con el operador “Y” se obtienen solo las referencias que contienen ambos términos, pero no las

referencias que contienen solo uno de los términos.

27

Motivación Médicos

AND

Operador “O” (OR)

• Para la suma de dos términos:

Con el operador “O” se obtienen las referencias que contienen uno de los dos términos, o el otro o los

dos.

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Motivación Incentivos

OR

Operador NO (NOT)

• Para la exclusión de un término:

Con el operador “NO” se obtienen todas las referencias relativas a “motivación” en cualquier grupo de

profesionales sanitarios excepto en el personal de enfermería, por el hecho de haber excluido

expresamente este grupo mediante el término “enfermeras”.

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Motivación Enfermería

NOT

6º Operadores booleanos: relacionar los términos

Motivation AND Physicians AND Quality of healthcare

7º Ejecutar la búsqueda• Finalmente, hay que llevar a la práctica la estrategia

de búsqueda diseñada y planificada en la teoría, y que se tendrá que adecuar a las características y funcionalidades específicas de cada base de datos.

¿Y si hubiéramos pasado del MESH?

La búsqueda en lenguaje libre vs. lenguaje controlado

Pros y contras del lenguaje libre

34

Útil para temas inequívocos, nuevas intervenciones que todavía no han sido indexadas, marcas comerciales de medicamentos y nombres propios.

• Recupera muchos resultados irrelevantes.

• No tiene en cuenta los plurales.• Ignora las diferencias ortográficas.

¿Cómo podemos limitar los resultados?

35

¿Cómo podemos limitar los resultados?

36

Permiten restringir la búsqueda por:• Tipo de artículo• Disponibilidad del texto completo • Fecha de publicación • Especies• Sexo• Categoría de la revista• Edad• Campo del registro (autor, título,

revista...)

Valoración de los resultados

37

Al acabar la búsqueda, es necesario realizar una valoración

de los resultados obtenidos, tanto en lo referente a la

exhaustividad (cuántos de los posibles), como a la precisión

(cuántos de los recuperados) y a la relevancia (cuáles serán

útiles para contestar a nuestra pregunta).

Valoración de los resultados

38

Filtros

Acceso al texto completo o al SOD

Estrategia de búsqueda

Formulario de búsqueda básica

Valoración de los resultados

39

• Utiliza términos más

específicos.

• Utiliza frases (“”)

• Refina con los límites.

• Marca como Major Topic

los descriptores principales.

• Utiliza términos más amplios.

• Utiliza sinónimos.

• Refina con los límites.

• Si encuentras algún artículo

interesante mira qué

descriptores utiliza.

¿Demasiados resultados? ¿Pocos resultados?

40

Acceso al texto completo

41

Acceso al texto completo

42

Acceso al texto completo

43

Acceso al texto completo

44

Servicio de Obtención de Documentos: SOD

Tiene como objetivo facilitar a sus usuarios los documentos no

accesibles electrónicamente a través de la biblioteca virtual.

Servicio de Obtención de Documentos: SOD

Servicio de Obtención de Documentos (SOD)

¿Cómo funciona?

47

¿Cómo funciona?

48

¿Cómo funciona?

49

¿Cómo funciona?

50

SOD: ¿cómo pedir un documento?

SOD: ¿cómo pedir un documento?

My NCBI

Es una herramienta que permite guardar en un

servidor remoto (accesible en cualquier

momento, solo hay que conectarse a Internet)

estrategias de búsqueda, referencias

bibliográficas, e incluso permite personalizar,

mediante la elección de filtros, el uso de

PubMed. 53

Las autoalertas

54

Herramientas web 2.0

Sindicación de contenidos

Es un sistema de intercambio de información

basado en XML.

Conocer las novedades de: Sumarios de revistas Bases de datos Webs oficiales Prensa Blogs ... y en muchos otros lugares

¿Para qué sirve?

Localización

• Explorer

• Firefox

http://www.feedly.com/

http://www.netvibes.com

http://www.bloglines.com/

Algunas herramientas...

Funcionamiento

Funcionamiento de Feedly

Apps de PubMed

62

http://www.nlm.nih.gov/mobile/

Apps de PubMed

63

¿Y si queremos una referencia concreta?

64

¿Dónde puedo encontrar

aquel artículo que leí el año

pasado en el New England

sobre el trastorno bipolar?

En PubMed Tools

65

Ahora ya sabéis! La importancia de consultar la documentación

científica basada en la evidencia.Cómo plantear una pregunta de investigación.Hacer una estrategia de búsqueda bibliográfica. La utilidad del tesauro. Limitar los resultados según nuestra demanda.Crear y gestionar las alertas y los canales RSS. Encontrar un artículo concreto o incompleto.

67

Recordad! Bibliosalut es 2.0!

Compartimos lo que os interesa:

• Novedades sobre: Bibliosalut, el uso de bases de datos,

nuevas publicaciones, eventos importantes, formación,

actualizaciones de guías de práctica clínica, etc.

• Nuestro conocimiento: presentaciones y FAQ.

• Vuestra producción científica.

Recordad! Bibliosalut es 2.0!

#PublicaSalutIB es un servicio de difusión a través de Twitter, para dar a conocer

la producción científica más reciente de los profesionales del sistema sanitario

público de las Islas Baleares.

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