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UNIVERSIDAD AUTÓNOMA DEL ESTADO DE MÉXICOFACULTAD DE QUÍMICA
UNIDAD DE APRENDIZAJE: BACTERIOLOGÍA CLÍNICA BÁSICATAXONOMÍA BACTERIANA
MSP SERGIO H. PAVÓN ROMEROFEBRERO 2013
TAXONOMÍA BACTERIANA
TAXONOMÍA: CIENCIA DE LA CLASIFICACIÓN BIOLÓGICA.
CLASIFICAR: Ordenar o disponer en clases. Del latín classificare. Dividir o disponer en clases o categorias. Determinar la clase a la que pertenece algo.
TAXONOMÍA BACTERIANA
TAXONOMÍA:
taxis: ESTRUCTURA U ORDEN.nomos: LEYnemein: DISTRIBUIR O GOBERNAR.
TAXONOMÍA BACTERIANA
CLASIFICACIÓN NOMENCLATURA
IDENTIFICACIÓN
TAXONOMÍA BACTERIANA
IDENTIFICACIÓN: PROCESO QUE DETERMINA QUE UN AISLAMIENTO PERTENECE A UN TAXÓN ESPECÍFICO.
En biología, un taxón del griego (ταξις) taxis, «ordenamiento» es un grupo de organismos emparentados, que en una clasificación dada han sido agrupados asignándole un nombre en latín.
TAXONOMÍA BACTERIANA
CLASFICACIÓN: ESTRUCTURACIÓN DE LOS ORGANISMOS EN GRUPOS O TAXONES CONSIDERANDO SUS SEMEJANZAS Ó PARENTEZCO EVOLUTIVO.
TAXONOMÍA BACTERIANA
IDENTIFICACIÓN: ASIGNAR NOMBRES CONFORME A NORMAS A GRUPOS TAXONÓMICOS.
Escherichia coli
TAXONOMÍA BACTERIANA
IMPORTANCIA
AGRUPA A LOS MICROORGANISMOS CON NOMBRES PRECISOS QUE PERMITE UNA COMUNICACIÓN
EFICIENTE ENTRE MICROBIÓLOGOS.
TAXONOMÍA BACTERIANA
IMPORTANCIA
PERMITE LA IDENTIFICACIÓN EXACTA DE LOS MICROORGANISMOS
Familia Pseudomonadaceae. Bacilos Gram-negativos, con flagelos polares.Producen citocromo oxidasa.Género: Pseudomonas: P. aeruginosa
TAXONOMÍA BACTERINA
TAXONOMÍA SISTEMÁTICA
ESTUDIO CIENTÍFICO DE LOS MICROORGANISMOS CUYOOBJETIVO FINAL ES CARACTERIZARLOS Y AGRUPARLOS EN FORMA ORDENADA.
TAXONOMÍA BACTERIANA
DISCIPLINAS QUE ABORDA:
MORFOLOGÍAECOLOGÍA
EPIDEMIOLOGÍA
BIOQUÍMICA
BIOLOGÍA MOLECULAR
FISIOLOGÍA
TAXONOMÍA BACTERIANA
EVOLUCIÓN Y DIVERSIDAD MICROBIANA
ESTROMATOLITOS (CIANOBACTERIAS)
BACTERIAS FÓSILES3500-3800 MILLONESDE AÑOS,
KARL WOOSEÁRBOLFILOGENÉTICO
EUBACTERIAS
EUCARIOTAS
ARQUEOBACTERIAS
(RNAr)
TAXONOMÍA BACTERIANA
RANGOS TAXONÓMICOS
DOMINIO
REINO
SECCIÓN
ORDEN
FAMILIA
GENERO
ESPECIE
TAXONOMÍA BACTERIANA
CONCEPTOS:
CEPA: POBLACIÓN QUE DESCIENDE DE UNA SOLA BACTERIAO DE UN CULTIVO PURO.
TAXONOMÍA BACTERIANA
CEPA TIPO: PRIMERAS CEPAS ESTUDIADAS Y ESTÁ MASCARACTERIZADA QUE OTRAS.
TAXONOMÍABACTERIANA
GÉNERO: GRUPO BIEN DEFINIDO DE UNA O MÁS ESPECIES
ESPECIE: CEPAS QUE COMPARTEN PROPIEDADES ESTABLESY QUE DIFIEREN EN FORMA SIGNIFICATIVA DE OTROS GRUPOS DE CEPAS.
TAXONOMÍA BACTERIANA.
SISTEMA BINOMIAL
LINNEONOMBRE LATINIZADO Y LETRA CURSIVA
Escherichia coli, Bacillus subtilis, …
TAXONOMÍA BACTERIANA
(1980) International JournalOf Systematic Bacteriology LISTA DE NOMBRES
APROBADOS
BERGEY´S MANUAL OF SYSTEMATIC BACTERIOLOGY
BERGEY´S MANUAL OF DETERMINATIVE BACTERIOLOGY
TAXONOMÍA BACTERIANA
SISTEMAS DE CLASIFICACIÓN
CLASIFICACIÓN NATURALDE LINNEO
TAXONOMÍA NUMÉRICA
CLASIFICACIÓNFILOGENÉTICA
TAXONOMÍA BACTERIANA
CLASIFICACIÓN NATURAL
CARACTERÍSTICAS ANATÓMICAS(MEDIADOS DEL SIGLO XVIII)
SISTEMA FENÉTICO
TAXONOMÍA BACTERIANA
TAXONOMÍA NUMÉRICAORDENADORESCÓMPUTO
ORDENAMIENTO POR MÉTODOS NUMÉRICOSDE UNIDADES TAXONÓMICAS EN TAXONES.(ANÁLISIS NUMÉRICO)
TAXONOMÍA BACTERIANA
TAXONOMÍA NUMÉRICA:
REQUIERE COMPARAR DECENAS O CENTENAS DE CARACTERES PARA REALIZAR UNA CLASIFICACIÓN PRECISA Y CONFIABLE.(MORFOLÓGICOS, BIOQUÍMICOS, FISIOLÓGICOS,ETC)
TAXONOMÍA BACTERIANA
DETERMINACIÓN DE LA CONCORDANCIA
COEFICIENTE DE EMPAREJAMIENTOSIMPLE (Ssm)
COEFICIENTE DE JACCARD(Sj)
MATRÍZ DE SEMEJANZA
FENONES
DENDROGRAMAS
TAXONOMÍA NUMÉRICA
TAXONOMÍA BACTERIANA
ESTUDIO DE LA FILOGENIEBACTERIANA
CRONÓMETROS MOLECULARES
ARBOLES FILOGENÉTICOS
DISTANCIA EVOLUTIVA
SECUENCIA DEOLIGONUCLEÓTIDOSFIRMA
TAXONOMÍA BACTERIANA
CARACTERÍSTICAS APLICADAS EN LATAXONOMÍA
CLÁSICAS
MORFOLÓGICAS
FISIOLÓGICAS
BIOQUÍMICAS
ECOLÓGICAS
MOLECULARES
. PROTEÍNAS
. ÁCIDOS NUCLÉICOS:COMPOSICIÓNTEMP. DE FUSIÓNHIBRIDACIÓNSECUENCIACIÓN
TAXONOMÍA BACTERIANA
HISTORIA DEL MANUAL DE BERGEY.
1923 PRIMERA EDICIÓN (1925,1930,1934,1939,1948,1957,1966)1974 OCTAVA EDICIÓN.1977 EDICIÓN ABREVIADA.1981 Suplemento al Index Bergeyana (1966)
1984 Primera edición-Bergey´s Manual of Systematic BacteriologyVolumenes I-IV.Reino: Procariotae ( Divisiones: Gracilicutes, Firmicutes,Tenericutes y Mendosicutes)
1994 Bergey´s Manual of Determinative Bacteriology (Novena Edición)
TAXONOMÍA BACTERIANA
BERGEY´S MANUAL OF SYSTEMATIC BACTERIOLOGY.
REINO: PROCARYOTAE
DIVISION: GRACILICUTESDIVISIÓN: FIRMICUTESDIVISIÓN: TENERICUTESDIVISIÓN: MENDOSICUTES
TAXONOMÍA BACTERIANA.
CLASES INCLUIDAS EN LAS DIVISIONES DEL REINO PROCARYOTAE
DIVISIÓN I. GRACILICUTESCLASE I: ScotobacteriaCLASE II. AnoxyphotobacteriaCLASE III. Oxyphotobacteria
DIVISIÓN II. FIRMICUTESCLASE I: FirmibacteriaCLASE II: Thallobacteria
TAXONOMÍA BACTERIANA
DIVISIÓN III. TENERICUTESCLASE I: Mollicutes
DIVISIÓN IV. MENDOSICUTESCLASE I: Archeobacterias.
TAXONOMÍA BACTERIANA
BERGEY´S MANUAL OF SYSTEMATIC BACTERIOLOGY
SECCIONES
ORDEN
FAMILIA
GÉNERO
ESPECIES
TAXONOMÍA BACTERIANA
SECCIONES:
1. THE SPIROCHETES1. ORDEN: SPIROCHAETALES
FAMILIA I: SPIROCHAETACEAEGÉNERO: Spirochaeta
FAMILIA II: LEPTOSPIRACEAEGÉNERO: Leptospira
TAXONOMÍA BACTERIANA
SECCIÓN 2. AEROBIC/MICROAEROPHILIC, MOTILE, HELICAL VIBRIOID GRAM NEGATIVE BACTERIA.
FAMILIA: SPIRILLACEAE
GÉNEROS: ENTRE OTROS– Campylobacter y Vibrio.
TAXONOMÍA BACTERIANA
SECCIÓN 3. NONMOTILE (O RARELY MOTILE), GRAM NEGATIVE CURVED BACTERIA.
FAMILIA: SPIROSOMACEAE
(APARENTEMENTE NO INCLUYE GÉNEROS PATÓGENOS PARA EL HOMBRE)
SECCIÓN 4. GRAM NEGATIVE AEROBIC RODS AND COCCI.
FAMILIAS: Entre otras: PSEUDOMONADACEAELEGIONELLACEAENEISSERIACEAE
TAXONOMÍA BACTERIANA
SECCIÓN 5. FACULTATIVELY ANAEROBIC GRAM NEGATIVE RODS.
FAMILIAS: I. ENTEROBACTERIACEAE II. VIBRIONACEAE III. PASTEURELLACEAE
TAXONOMÍA BACTERIANA
SECCIÓN 6. ANAEROBIC GRAM NEGATIVE STRAIGHT, CURVED AND HELICAL RODS.
FAMILIA I. BACTEROIDACEAE
SECCIÓN 7. DISSIMILATORY SULFATE OR SULFUR REDUCING BACTERIA.
I. BACTERIAS CAPACES DE OXIDAR ACETATO HASTA CO2
GÉNERO: Desulfuromonas
II. BACTERIAS REDUCTORAS DE SULFATO, SULFITO, TIO-SULFATO U OTROS COMPUESTOS OXIDADOS DEAZUFRE.
GENEROS: Desulfovibrios, Desulfomonas, Desulfococcus, Desulfobacter, Desulfobulbus, Desulfotomaculum, Desulfosarcina, Desulfonema
TAXONOMÍA BACTERIANA
SECCIÓN 8. ANAEROBIC GRAM NEGATIVE COCCI.
FAMILIA I. VEILLONELLACEAEGENERO I. Veillonella (7)
II. Acidaminococcus (1) III. Megasphera (1)
SECCIÓN 9. THE RICKETTSIAS AND CHLAMYDIA
SECCIÓN 10. THE MYCOPLASMAS
SECCIÓN 11. ENDOSYMBIONTES (Simbiosis con Protozooarios)
TAXONOMÍA BACTERIANA
VOLUMEN 2.
SECCIÓN 12. GRAM POSITIVE COCCI.
FAMILIA I. MICROCOCCACEAEGENEROS I. Micrococcus
II. Stomatococcus III. Planococcus IV. Staphylococcus
FAMILIA II. DEINOCOCCACEAEGENERO I: Deinococcus
OTROS GENEROS: Streptococcus,Leuconostoc, Pediococcus Aerococcus, Gemella, Peptococcus, Pepto- streptococcus, Ruminococcus, Coproco- ccus, Sarcina.
TAXONOMÍA BACTERIANA
SECCIÓN 13. ENDOSPORE FORMING GRAM POSITIVE RODS AND COCCI.
GENEROS: Bacillus, Clostridium, (+4)
SECCIÓN 14. REGULAR NON SPORING GRAM POSITIVE RODS.
GENEROS: Lactobacillus, Listeria, (+5)
SECCIÓN 15. IRREGULAR NON-SPORING GRAM POSITIVE RODS
GENEROS: Corynebacterium, Gardnerella, Propionibacterium Eubacterium, Actinomyces, Bifidobacterim, (+15)
TAXONOMIA BACTERIANA
SECCIÓN 16. THE MYCOBACTERIA
FAMILIA. MYCOBACTERIACEAEGENERO: Mycobacterium (49 )
SECCIÓN 17. NOCARDIOFORMS
GENEROS: Nocardia (+8)
TAXONOMÍA BACTERIANA
VOLUMEN 3.
SECCIÓN 18. ANOXYGENIC PHOTOTROPHIC BACTERIA
( Purple non sulfur bacteria, Green sulfur bacteria, otros)
SECCIÓN 19. OXYGENIC PHOTOSYNTHETIC BACTERIA
(Cyanobacterias, otras…..)
SECCIÓN 20. AEROBIC CHEMOLITHOTROPHIC BACTERIA AND ASSOCIATED ORGANISMS.
( Bacterias nitrificantes, bacterias sulfurosas incoloras, Bacterias quimiolitotróficas obligadas(H2), Bacterias oxidantes de Hierro y Manganeso)
TAXONOMÍA BACTERIANA
SECCIÓN 21. BUDDING AND/OR APPENDAGED BACTERIA.
SECCIÓN 22. SHEATHED BACTERIA.
SECCIÓN 23. NONPHOTOSYNTHETIC, NONFRUITING GLIDING BACTERIA.
SECCIÓN 24. FRUITING, GLIDING BACTERIA: THE MYXOBACTERIA
SECCIÓN 25. ARCHAEOBACTERIAS
TAXONOMÍA BACTERIANA
VOLUMEN 4. THE ACTINOMYCETES
SECCIÓN 26. NOCARDIOFORM ACTINOMYCETES
SECCIÓN 27. ACTINOMYCETES WITH MULTILOCULAR SPORANGIA
SECCIÓN 28. ACTINOPLANETES
SECCIÓN 29. STREPTOMYCETES AND RELATED GENERA
SECCIÓN 30. MADUROMYCETES
SECCIÓN 31. THERMOMONOSPORA
SECCIÓN 32. THERMOACTINOMYCETES
SECCIÓN 33. OTROS GENEROS
TAXONOMÍA BACTERIANA
2001 BERGEY´S MAMANUAL OF SYSTEMATIC BACTERIOLOGY2ND. EDITION. VOLUMES I-V.
VOL. I. The Archea, Cyanobacteria, Phototrophos, and deeplybranching genera.(Secciones I-XIV)
VOL. II. The Proteobacteria (Secciones XV-XIX)(Subdivisiones alfa, beta, gamma, delta y épsilon)
VOL. III. The Low G+C Gram Positives (Secciones XX-XXII)VOL. IV. The High G+C Gram Positives (Sección XXIII)VOL. V. The Planctonmycetes, Spirochaetes, Fibrobacteres,
Bacteroides y Fusobacteria (Secciones XXIV-XXXI)