1. Vaya a http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=Genome 2. Seleccione la opción de Nucleotides localizada en la parte superior izquierda.3. En el recuadro de Draft Human Genome, seleccione la opción de Map Viewer.4. ¿Cuántos cromosomas tiene un perro, una rata y Arabidopsis?

Perro- 78 cromosomas (38 pares autosómicos + 2 sexuales)

Rata- 42 cromosomas (20 pares autosómicos + 2 sexuales)

Arabidopsis- 5 cromosomas

5. Utilizando el recuadro de Search, determine en qué cromosoma(s), se encuentran los genes relacionados con lo siguiente: (recuerde presionar find luego de escribir la premisa)

a. Anemia falciforme (sickle cell anemia)- cromosoma 11

b. Parkinson- cromosomas 1,2,4,5,6,8,9,11,12,17,18,22,X,not placed

c. Alzheimer- cromosomas 1,3,4,6,7,8,9,10,11,12,14,17,19,20,21,X

d. fibrosis cística- cromosomas 1,7,13,19

e. Diabetes- cromosomas 1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20,X

f. cáncer (seleccione uno de ellos y mencione el cromosoma en el que se encuentra) Cáncer de Lengua- cromosomas 5,11,20

6. Vaya a http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ Usando GenBank, realice una búsqueda de la siguiente secuencia de de acceso: AF321136

Abra el archivo y conteste:a. organismo del cual proviene la secuencia: Rhodobacter sphaeroidesb. número de genes presentes en la secuencia: 3,905 pb (2 genes)c. función sugerida de alguno de los genes: ccmH - putative c-type cytochrome disulfided. Seleccione 20 nucleótidos de cualquier región de uno de los genes: tcttcagcgc

cgcggtccag

e. Seleccione los aminoácidos que desee de una de las secuencias de proteínas presentes.

MIVEFGHFALVLSLAVAFVQVRGAVRRRRIGVVLAGWRCRTRGGHPSSADRFSFAALTWAFATSDFSVRLVVLNSHTLKPMLYKISGVWGNHEGSLLLWVLILALFGACAAVFGQNLPPTLKARVLAVQGMIGAAFLAFLLFTSNPFLRMGEVPFDGEDLNPLLQDPGLAFHPPFLYLGYVGLSMAFSFAVAALIEGRVDAAWGRWVRPWTLAAWVFLTIGIALGSWWAYYELGWGGFWFWDPVENASFMPWLIAAALLHSAIVVEKREALKSWTILLAILAFGFSLIGTFIVRSGVITSVHAFANDPERGIFILMILAVFMGGALTLFAARASAMEAKGVFGIVSRESGLVLNNVLLTVACFVVFIGTIWPLPAELLWGRKLSVGAPFFNAAFTPFMVVIALVLPYGRRPPWKRAELGRGMRPLWGALALSAALGALVFALQTGRSALGPVGLALGAWLVFGTLLDLWGRTGRGALGGRLARLRRLPRADWGKTAHAGLGVTIFAVAAITAWQVESIRVMKPGETFALGRYDVLLEGVREIEGPNYRSTVADFRVTRDGPNGELHPEKRVYPVAAMPTTEAPSIRFTRDSYLVIGDPQEGGGYAVRSYIKPFANWIWGGALLMALGGLLSLSDRRYRIAAGARRMPAAVAAE

7. Vaya a http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/ y determine a qué organismo pertenece la siguiente secuencia de:

a. Realice una búsqueda usando la secuencia de DNA y proteínas que copio en 2d y 2e (arriba).

b. ¿Cuáles fueron los tres primeros “hits” obtenidos de cada una? Para la secuencia de nucleótidos:

1. CP000143.1 – Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 chromosome 1, complete sequence2. AF321136.1- Rhodobacter sphaeroides maturation protein CcmF (ccmF) and

maturation protein CcmH (ccmH) genes,3. CP000474.1- Arthrobacter aurescens TC1, complete genome

Para la secuencia de proteínas:1. AAK08205.1 - maturation protein CcmF [Rhodobacter sphaeroides]2. YP_002525305.1 - Cytochrome c-type biogenesis protein CcmF precursor

[Rhodobacter sphaeroides KD131]3. YP_001167375.1 - cytochrome c-type biogenesis protein CcmF [Rhodobacter

sphaeroides ATCC 17025]

8. Vaya a http://expasy.cbr.nrc.ca/tools/scnpsit1.html a. Seleccione la secuencia completa de CcmH en AF321136 y realice una búsqueda.b. Escriba el primer motif, motivo o secuencia conservada que encuentre y su función.

29 - 40:   CtCggGcaGGtC= EGF-like domain signature 1: Factor de crecimiento epidérmico. En primer lugar, se une con gran afinidad a receptores específicos de la superficie celular y luego se provoca su dimerización, que es esencial para la activación de la tirosina quinasa en el receptor de dominio citoplasmático, iniciando una señal de transducción que resulta en la síntesis de ADN y proliferación celular.