1.- Fundamentos para la construcción de un mapa genético. 2.- Detección de ligamiento entre dos...

10
1.- Fundamentos para la construcción de un mapa genético. 2.- Detección de ligamiento entre dos genes 3. Cálculo de la frecuencia de recombinación 4.- Cruzamiento de tres puntos 5.- Interferencia y coincidencia 6.- Relación entre distancia genética y frecuencia de recombinación * Unidad de mapa * Función de mapa

Transcript of 1.- Fundamentos para la construcción de un mapa genético. 2.- Detección de ligamiento entre dos...

Page 1: 1.- Fundamentos para la construcción de un mapa genético. 2.- Detección de ligamiento entre dos genes 3. Cálculo de la frecuencia de recombinación 4.-

1.- Fundamentos para la construcción de un mapa genético.

2.- Detección de ligamiento entre dos genes

3. Cálculo de la frecuencia de recombinación

4.- Cruzamiento de tres puntos

5.- Interferencia y coincidencia

6.- Relación entre distancia genética y frecuencia de recombinación

* Unidad de mapa* Función de mapa

Page 2: 1.- Fundamentos para la construcción de un mapa genético. 2.- Detección de ligamiento entre dos genes 3. Cálculo de la frecuencia de recombinación 4.-

CARTOGRAFÍA DEL GENOMA EN EUCARIOTAS

I.- MAPA GENÉTICO TEMA 10

Localización de genes basada en frecuencia de recombinación

II.- MAPA FÍSICO TEMA 11

Localización de genes basada en:- Hibridación somática interespecífica- FISH- Secuenciación....

Page 3: 1.- Fundamentos para la construcción de un mapa genético. 2.- Detección de ligamiento entre dos genes 3. Cálculo de la frecuencia de recombinación 4.-

"The linear order of the genes implies distance between them, for which the crossover values stand as indices. It is obvious that if the order of the genes remained the same but something doubled the number of crossovers between two loci, their 'distance' apart would at thesame time appear to have doubled… "

- Thomas Hunt Morgan, The Physical Basis of Heredity, 1919

(concluding remarks from the chapter entitled "The Order of the Genes".)

Page 4: 1.- Fundamentos para la construcción de un mapa genético. 2.- Detección de ligamiento entre dos genes 3. Cálculo de la frecuencia de recombinación 4.-

“ Cuanto mayor es la distancia entre genes ligados, mayor es la probabilidad de que ocurra un

entrecruzamiento entre cromátidas no hermanas en la zona de separación de estos genes y por tanto mayor será

el número de descendientes recombinantes “

% de recombinación medida de la distancia genética

INDIVIDUO AaBb

- Si A y B son independientes

aB Ab

- Si A y B están ligados (en acoplamiento)

aBAb

A principios de siglo...

50%

< 50% (Frecuencia de recombinación < 0.5)

Page 5: 1.- Fundamentos para la construcción de un mapa genético. 2.- Detección de ligamiento entre dos genes 3. Cálculo de la frecuencia de recombinación 4.-

CALCULO FRECUENCIA DE RECOMBINACIÓN

Page 6: 1.- Fundamentos para la construcción de un mapa genético. 2.- Detección de ligamiento entre dos genes 3. Cálculo de la frecuencia de recombinación 4.-

CRUZAMIENTO DE TRES PUNTOS

- Estudiar el ligamiento entre tres loci1.- Orden2.- Distancia genética (frec. Recomb.)

TRES GENESColor del cuerpo b

+

, bColor de los ojos p

+

, pMorfología del alac

+

, c

Tres notaciones distintas -bbppcc b/b p/p c/c bpc/bpc

b+

b+

p+

p+

c+

c+

x bbppcc

b+

bp+

pc+

c x bbppcc

bbppcc 5617 bbppc

+

c 1383bbp

+

pcc 72bbp

+

pc+

c 367b

+

bppcc 388b

+

bppc+

c 60b

+

bp+

pcc 1412b

+

bp+

pc+

c 5701 / TOTAL 15000

Page 7: 1.- Fundamentos para la construcción de un mapa genético. 2.- Detección de ligamiento entre dos genes 3. Cálculo de la frecuencia de recombinación 4.-

MAPA GENÉTICO DE TRES LOCI

1º. El gen que está en el centro se puede determinar mirando los dobles recombinantes.

b p c

b + p

+ c

+

XX 2Q bbp+pcc

b+bppc

+c

2º. La distancia más grande determina los loci de los extremos.

3º. bpc o cpb

4º. La distancia entre los loci dos a dos es > que la calculada entre los loci de los extremos

“Las distancias de mapa mas exactas son las que se establecen entre loci ligados muy próximos”

Page 8: 1.- Fundamentos para la construcción de un mapa genético. 2.- Detección de ligamiento entre dos genes 3. Cálculo de la frecuencia de recombinación 4.-

COEFICIENTE DE COINCIDENCIA

Nº de dobles recombinantes observado

Nº de dobles recombinantes esperado

- Si es < que 1 quiere decir que la presencia de determinados quiasmas influye para que no

se produzca otro en un lugar próximo

COEFICIENTE DE INTERFERENCIA

Expresa la reducción del número de dobles quiasmas observados, en relación a los

esperados( 1 - coeficiente de coincidencia)

Page 9: 1.- Fundamentos para la construcción de un mapa genético. 2.- Detección de ligamiento entre dos genes 3. Cálculo de la frecuencia de recombinación 4.-

MAPA DE LIGAMIENTO óMAPA GENÉTICO

Frecuencia de recombinación

Distancia genética

1 UNIDAD DE MAPA = 1cM = F.R. de 0.01 (1%)

Unidad de mapa unidad de medida de mapa genéticoDef. Distancia entre dos genes para la que uno de cada 100 productos de la meiosis resulta ser recombinante

Función de mapaDef. Función matemática que relaciona la frecuencia de recombinación y la distancia genética

Page 10: 1.- Fundamentos para la construcción de un mapa genético. 2.- Detección de ligamiento entre dos genes 3. Cálculo de la frecuencia de recombinación 4.-

FUNCIONES DE MAPA