ALTERACIONES DEL GEN IKZF1 (IKAROS) EN LA LEUCEMIA LINFOBLÁSTICA AGUDA Inés Gómez Seguí Mayo...
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ALTERACIONES DEL GEN IKZF1
(IKAROS) EN LA LEUCEMIA
LINFOBLÁSTICA AGUDA
Inés Gómez Seguí
Mayo 2010
HELIOS
IKZF1 Locus 7p12
Ikaros en LLA
FACTOR DE TRANSCRIPCIÓN DE LA FAMILIA DE DEDOS DE
ZINC KRUPPLE-LIKE
IKAROS
AIOLOS
IKZF1 (Ikaros Zinc Finger 1)
- Proteina de unión al ADN que actúa como factor de transcripción
Alteraciones genéticas en LLA
Ikaros en LLA
-COOH
-COOH
NH2NH2 NH2 NH2
IKZF1 (Ikaros Zinc Finger 1)
- Estructura y dominios funcionales
SUBDOMINIO
HIDROFÓBICO
SUBDOMINIO
ACÍDICO
- Máxima actividad si coopera el subdominio hidrofóbico
Isoformas largas
con capacidad de unión al
ADN
Isoformas cortas
o inhibidores dominantes negativos
Ikaros en LLA
IKZF1 (Ikaros Zinc Finger 1): Isoformas
Ikaros en LLA
IKZF1 (Ikaros Zinc Finger 1)
- Regulación por homo y heterodimerización, además de splicing alternativo
HOMODÍMEROS HETERODÍMEROS
ISOFORMA ACTIVA (LARGA)
ISOFORMA ACTIVA (LARGA)
ISOFORMA INACTIVA (CORTA)
ISOFORMA ACTIVA (LARGA)
+ +
ACTIVIDAD TRANSCRIPCIONAL POTENCIADA
SIN ACTIVIDAD TRANSCRIPCIONAL
Ikaros en LLAIkaros en LLA
IKZF1 (Ikaros Zinc Finger 1): Función
FACTOR DE TRANSCRIPCIÓN
Ratón con infraexpresión
Bloqueo madurativo en el estadío linfoide pro-B
ONCOGENMutación
heterocigota dominante-negativa
Neoplasia T agresiva (ratón)
GEN SUPRESOR DE TUMORES
Infraexpresión de isoformas largas
leucemia
Kirstetter P et al. Eur J Immunol.2002;32: 720-730. Winandy S et al. Cell. 1995; 83: 289-299.
Tonnelle C et al. Blood 2001; 98: 2673-2680.
Ikaros en LLA
Ikaros en neoplasias hematológicas
TABLA de Rebollo pag 173
Tomada de Rebollo et al. Immunol Cell Biol. 2003
Ikaros en LLA
Ikaros en leucemia linfoblástica aguda
Mullighan et al. Nature 2008
Frequency of recurring DNA copy number abnormalities in ALL
DELECIONES DE IKZF1
- 84% de LLA-Phi+
- 11% LLA-B Phi-
- Expresión de Ik6 sólo en los casos con deleción de los exones 3 al 6.
Ikaros en LLA
Ikaros en leucemia linfoblástica aguda
n Ik6 del IKZF1Iacobucci. Blood 2008 47 92%Iacobucci. Haematologica 2008 46 59%Iacobucci. JCO 2009 83 37% 63%Iacobucci. Blood 2009 106 42% 75%
- Estudios en LLA-B BCR-ABL+ del adulto
RT-PCR CNA
- Hipótesis inicial: splicing alternativo
Ikaros en LLA
Deleciones: - completas: del locus 7p12 o monosomía 7.
- parciales: exones 3-6 (=Ik6) ~55%
exones 1-6 ~30%
otras ~15%
Ikaros en leucemia linfoblástica aguda
Ik6
Ik10
Ikaros en LLA
Mullighan. NEJM 2009
Detección de CNA en todo el genoma de niños con LLA-B
Las deleciones más frecuentes: CDKN2A/B (46%), PAX5 (32%) e IKZF1 (29%)
n deleciones Ik6COHORTE ORIGINAL 16 completas LLA-B alto riesgo 47 parciales (excluyendo Phi+, hipodiploide y <1año) Total: 63 (29%)COHORTE DE VALIDACIÓN 258 riesgo estándar y alto riesgo
221 20
48 (19%)
Ikaros en leucemia linfoblástica aguda
IKAROS
Ikaros en LLA
Mullighan. NEJM 2009
- Asociación con elevada EMR, recaída y evento adverso, en ambas cohortes
- Implicación pronóstica independientemente de BCR-ABL
- Elevado % de casos sin alteraciones recurrentes (39% cohorte original y 23% cohorte validación)
IKZF1 WT del IKZF1 p IKZF1 WT del IKZF1 pTasa de recaída (5 años) 25% 73% <0.001 26% 48% 0.004Tasa de evento adverso (5 años) 27% 74% <0.001 28% 61% <0.001EMR elevada (día +8 y +19) 43% 62% 0,04 9% 62% <0.001
cohorte de validacióncohorte original
Ikaros en leucemia linfoblástica aguda
Ikaros en LLA
-Iacobucci. LAS DELECIONES DE IKZF1 SON INDEPENDIENTES
DEL REORDENAMIENTO BCR-ABL Y SE ASOCIAN CON UN
PERFIL DE EXPRESIÓN GÉNICA PARTICULAR Y UN PEOR
PRONÓSTICO EN PACIENTES ADULTOS CON LLA-B. 144 LLA
del adulto de novo (106 BCR-ABL+ y 38 BCR-ABL – sin otros
reordenamientos conocidos).
-Volejnikova. LA EXPRESIÓN RELATIVA DE ISOFORMAS DE
IKAROS TIENE VALOR PRONÓSTICO EN LA LLA-PHI
NEGATIVA DEL NIÑO. 94 niños con LLA. Ratio isoformas
cortas/funcionales relacionada con peor pronóstico.
Ikaros en leucemia linfoblástica aguda
Comunicaciones ASH 2009
Ikaros en LLA
Kuiper. Leukemia 2010
Ikaros en leucemia linfoblástica aguda
LAS DELECIONES DE IKZF1 PREDICEN RECAÍDA EN
LAS LLA-B PEDIÁTRICAS UNIFORMEMENTE
TRATADAS
Estudian 34 muestras pareadas de diagnóstico/recaída.
Las deleciones de IKAROS están preservadas en la
recaída, a diferencia de PAX5, CDKN2A y EBF1.
Deleciones (n=13, 38%) relacionadas con menor SLR.
Kuiper. Leukemia 2010
Ikaros en LLA
Ikaros en leucemia linfoblástica aguda
Kuiper. Leukemia 2010
Validado en una cohorte de 131 niños tratados homogéneamente.
Pacientes de riesgo estándar (n=102) : RR de recaída x12.
Ikaros en LLA
Ikaros en LLA
Hipótesis
- Las deleciones de IKZF1 son un evento frecuente en la
LLA-B.
- Un gran porcentaje de estos casos se correlaciona con
la expresión de la isoforma Ik6.
- Implicación pronóstica en el adulto y aplicación al
algoritmo diagnóstico y terapéutico.
Ikaros en LLA
Muestra
- 65 muestras de RNA de adultos con LLA
(50-55 con muestra de DNA)
+ 10 -12 nuevos casos por año
- aproximadamente, 150 niños con LLA + 30 nuevos casos por año
Ikaros en LLA
Metodología
- Expresión de isoformas cortas: RT-PCR con cebadores en exón 1 y 7
- Deleciones génicas: (MLPA®)
Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification
gen locus exonesIKZF1 7p12 1,2,3,4,5,6,7,8
CDKN2A/B 9p21.3 1,2,4PAX5 9p13.2. 1,2,5,6,8,10ETV6 12p13.2, 1,2,3,5,8
Objetivos
- Determinar la frecuencia de Ik6 en nuestra serie
- Correlación con deleciones génicas de IKZF1
- Determinar su implicación pronóstica
Ikaros en LLA
Fondos
- Generalitat Valenciana
B + - 1 2 3 4 MVI
Ikaros en LLA
Resultados
Ik6
Ik4
Ik2
Ik1
Ikaros en LLA
Resultados
Ikaros en neoplasias hematológicas
Marcais et al. Leukemia Research 2009
25 casos de LLA-T
Deleciones n=1
Mutaciones n=0
Proteína: localización citoplasmática
INACTIVACIÓN GÉNICA EN NEOPLASIAS B VS. INACTIVACIÓN FUNCIONAL EN NEOPLASIAS T.