Aplicació d’una signatura pronòstica de 3 proteïnes per la millora … · 2016-02-19 ·...

28
Aplicació d’una signatura pronòstica de 3 proteïnes per la millora de l’estratificació clínica del pacient amb hepatoblastoma Marina Simon; Mikel Azkargorta; Laura Guerra; Lara Nonell; Manuel López Santamaría; Marta Garrido; María Vázquez; Diego Plaza; Francisco Hernandez; Marta Mendiola; Marie Annick Buendia; Félix Elortza; Isabel Ojanguren; Ramon Bartolí; Ramon Planas; Maria-Rosa Sarrias; Margarita Sala; Carolina Armengol Childhood Liver Oncology Group (c-LOG)

Transcript of Aplicació d’una signatura pronòstica de 3 proteïnes per la millora … · 2016-02-19 ·...

Page 1: Aplicació d’una signatura pronòstica de 3 proteïnes per la millora … · 2016-02-19 · Aplicació d’una signatura pronòstica de 3 proteïnes per la millora de l’estratificació

Aplicació d’una signatura pronòstica de 3 proteïnes per la millora de l’estratificació clínica del pacient amb hepatoblastoma

Marina Simon; Mikel Azkargorta; Laura Guerra; Lara Nonell; Manuel López Santamaría; Marta

Garrido; María Vázquez; Diego Plaza; Francisco Hernandez; Marta Mendiola; Marie Annick

Buendia; Félix Elortza; Isabel Ojanguren; Ramon Bartolí; Ramon Planas; Maria-Rosa Sarrias;

Margarita Sala; Carolina Armengol

Childhood Liver Oncology Group (c-LOG)

Page 2: Aplicació d’una signatura pronòstica de 3 proteïnes per la millora … · 2016-02-19 · Aplicació d’una signatura pronòstica de 3 proteïnes per la millora de l’estratificació

Introducció: l’Hepatoblastoma

Adaptat de: Darbari et al. Hepatology, 2003

Tumors hepàtics en menors de 20 anys Tumors hepàtics en menors de 5 anys

67% 91%

INCIDÈNCIA ANUAL 1.5 casos/milió infants

31%

Page 3: Aplicació d’una signatura pronòstica de 3 proteïnes per la millora … · 2016-02-19 · Aplicació d’una signatura pronòstica de 3 proteïnes per la millora de l’estratificació

Introducció: l’Hepatoblastoma

FACTORS DE RISC 95% esporàdics5% associats a factors genètics

INCIDÈNCIA ANUAL 1.5 casos/milió infants

Page 4: Aplicació d’una signatura pronòstica de 3 proteïnes per la millora … · 2016-02-19 · Aplicació d’una signatura pronòstica de 3 proteïnes per la millora de l’estratificació

PRONÒSTIC

Introducció: l’Hepatoblastoma

FACTORS DE RISC 95% esporàdics5% associats a factors genètics

INCIDÈNCIA ANUAL 1.5 casos/milió infants

(Maibach et al, European Journal of Cancer, 2012)

Abreviacions: PRETEXT: Extensió del tumor pre-tractament; AFP: Alfa-fetoproteïna; M: Metastasis; SCU: Cèl·lules petites i indiferenciades

PrognosticStrata

PRETEXT 1/2/3

PRETEXT 4

Age > 5yrs

AFP > 1.2x106

Multi-focal M+ AFP <

100 SCU

1: good + - - - - - - -2: intermediate +/- at least one - - -3: poor +/- +/- +/- +/- +/- at least one

Page 5: Aplicació d’una signatura pronòstica de 3 proteïnes per la millora … · 2016-02-19 · Aplicació d’una signatura pronòstica de 3 proteïnes per la millora de l’estratificació

PRONÒSTIC

Introducció: l’Hepatoblastoma

FACTORS DE RISC 95% esporàdics5% associats a factors genètics

INCIDÈNCIA ANUAL 1.5 casos/milió infants

(Maibach et al, European Journal of Cancer, 2012)

Abreviacions: PRETEXT: Extensió del tumor pre-tractament; AFP: Alfa-fetoproteïna; M: Metastasis; SCU: Cèl·lules petites i indiferenciades

PrognosticStrata

PRETEXT 1/2/3

PRETEXT 4

Age > 5yrs

AFP > 1.2x106

Multi-focal M+ AFP <

100 SCU

1: good + - - - - - - -2: intermediate +/- at least one - - -3: poor +/- +/- +/- +/- +/- at least one

Quimioteràpia + CirurgiaTRACTAMENT

Page 6: Aplicació d’una signatura pronòstica de 3 proteïnes per la millora … · 2016-02-19 · Aplicació d’una signatura pronòstica de 3 proteïnes per la millora de l’estratificació

PRONÒSTIC

Introducció: l’Hepatoblastoma

FACTORS DE RISC 95% esporàdics5% associats a factors genètics

INCIDÈNCIA ANUAL 1.5 casos/milió infants

(Maibach et al, European Journal of Cancer, 2012)

Abreviacions: PRETEXT: Extensió del tumor pre-tractament; AFP: Alfa-fetoproteïna; M: Metastasis; SCU: Cèl·lules petites i indiferenciades

PrognosticStrata

PRETEXT 1/2/3

PRETEXT 4

Age > 5yrs

AFP > 1.2x106

Multi-focal M+ AFP <

100 SCU

1: good + - - - - - - -2: intermediate +/- at least one - - -3: poor +/- +/- +/- +/- +/- at least one

OS 3 anys > 75% (Maibach et al, European Journal of Cancer, 2012)

SUPERVIVÈNCIA

Quimioteràpia + CirurgiaTRACTAMENT

Page 7: Aplicació d’una signatura pronòstica de 3 proteïnes per la millora … · 2016-02-19 · Aplicació d’una signatura pronòstica de 3 proteïnes per la millora de l’estratificació

PRONÒSTIC

Introducció: l’Hepatoblastoma

FACTORS DE RISC 95% esporàdics5% associats a factors genètics

INCIDÈNCIA ANUAL 1.5 casos/milió infants

CARACTERÍSTIQUES MOLECULARS

Activació de la via Wnt/B-Catenina >80% casos(Buendia, Journal of Hepatology, 2014)

Identificació de 2 subclasses pronòstiques: C1 i C2(Cairo-Armengol et al , Cancer Cell 2008)

(Maibach et al, European Journal of Cancer, 2012)

Abreviacions: PRETEXT: Extensió del tumor pre-tractament; AFP: Alfa-fetoproteïna; M: Metastasis; SCU: Cèl·lules petites i indiferenciades

PrognosticStrata

PRETEXT 1/2/3

PRETEXT 4

Age > 5yrs

AFP > 1.2x106

Multi-focal M+ AFP <

100 SCU

1: good + - - - - - - -2: intermediate +/- at least one - - -3: poor +/- +/- +/- +/- +/- at least one

OS 3 anys > 75% (Maibach et al, European Journal of Cancer, 2012)

SUPERVIVÈNCIA

Quimioteràpia + CirurgiaTRACTAMENT

Page 8: Aplicació d’una signatura pronòstica de 3 proteïnes per la millora … · 2016-02-19 · Aplicació d’una signatura pronòstica de 3 proteïnes per la millora de l’estratificació

- Definir una signatura pronòstica a nivell proteic, de fàcilincorporació a la pràctica clínica, mitjançant l’estudi proteòmicde les dues subclasses moleculars d’HB.

- Identificar vies de senyalització implicades en l’agressivitattumoral.

Objectius

Page 9: Aplicació d’una signatura pronòstica de 3 proteïnes per la millora … · 2016-02-19 · Aplicació d’una signatura pronòstica de 3 proteïnes per la millora de l’estratificació

Extracció ProteïnesHomogenització FastPrep + ultracentrifugació

2D- DIGE + MS/MS Label Free(Digestió Trips, LC-MS/MS, MASCOT)

Dades clíniques i patològiques

Dades proteòmiques

Anàlisi bioinformàticaIngenuity Pathway Analysis Software

Validació(n=129HB)

Western Blot (WB)Immunohistoquímica (IHC )

16 HB + 8 NT

Mètodes

Identificació biomarcadors pronòstic i vies de senyalització

Page 10: Aplicació d’una signatura pronòstica de 3 proteïnes per la millora … · 2016-02-19 · Aplicació d’una signatura pronòstica de 3 proteïnes per la millora de l’estratificació

Sèrie 1Estudi Proteòmic

(n=16)

Sèrie 2Estudi IHQ

(n=129)Edat, mesos (mediana, [rang]) 29 [12-204] 13 [0.26-159]Sèrum AFP, ng/mL (rang) 448-1.708.400 107-7.627.330Quimioteràpia pre-operatòria (S/N/NA) 15/1/0 109/15/5Estadi tumoral

Estadi PRETEXT (I-II/III-IV/NA) 7/9 53/52/24Metàstasis al diagnòstic (S/N/NA) 5/11/0 17/101/11Multifocalitat (S/N/NA) 7/9/0 62/52/15

HistologiaHB: Epitelial/Mixt/NA 13/3/0 74/49/6

Component Epitelial majoritari: Fetal/No-fetal 10/6/0 83/35/11

Classificació clínica (Good/Intermediate/Poor) [% Poor] 6/5/5 [31%] 28/62/20 [18%]Classificació signatura 16-gens (subtipus molecular C1/C2) 11/5 -Seguiment, mesos (mitjana) 45.7 78.3Morts per càncer [%] 6 [37.5%] 10 [9%]

Abreviacions: IHQ, Immunohistoquimica; NA, no disponible

Pacients N=145 HB

Page 11: Aplicació d’una signatura pronòstica de 3 proteïnes per la millora … · 2016-02-19 · Aplicació d’una signatura pronòstica de 3 proteïnes per la millora de l’estratificació

Resultats: Seleccio i validació de biomarcadors (BM)

Validació per Western Blot (WB)Sèrie 1 (n=15)

Proteïnesdiferencialment

expressadesC2 vs C1(n=230)

P-val ≤0,01FC ≥±3

Selecció de 8 biomarcadors

Page 12: Aplicació d’una signatura pronòstica de 3 proteïnes per la millora … · 2016-02-19 · Aplicació d’una signatura pronòstica de 3 proteïnes per la millora de l’estratificació

Resultats: Definició cut-offs d’expressió proteica (WB)

Page 13: Aplicació d’una signatura pronòstica de 3 proteïnes per la millora … · 2016-02-19 · Aplicació d’una signatura pronòstica de 3 proteïnes per la millora de l’estratificació

Mitjana expressió NL

BM Cut-off Puntuació

1 > NL x 2 + 1

2 > NL x 2 + 1

3 < NL / 2 + 1

Resultats: Definició cut-offs d’expressió proteica (WB)

Page 14: Aplicació d’una signatura pronòstica de 3 proteïnes per la millora … · 2016-02-19 · Aplicació d’una signatura pronòstica de 3 proteïnes per la millora de l’estratificació

Mitjana expressió NL

+0 +3 +2

BM Cut-off Puntuació

1 > NL x 2 + 1

2 > NL x 2 + 1

3 < NL / 2 + 1

Resultats: Definició cut-offs d’expressió proteica (WB)

Puntuació

Page 15: Aplicació d’una signatura pronòstica de 3 proteïnes per la millora … · 2016-02-19 · Aplicació d’una signatura pronòstica de 3 proteïnes per la millora de l’estratificació

+0 +3 +2

0 BM (n=4; 0% events)

1 or 2 BM (n=9; 33% events)

3 BM (n=2; 100% events)

Time of survival (months)

P=0.0027

0.5

Even

tFre

e Su

rviv

al

1.0

Resultats: Definició cut-offs d’expressió proteica (WB)

Page 16: Aplicació d’una signatura pronòstica de 3 proteïnes per la millora … · 2016-02-19 · Aplicació d’una signatura pronòstica de 3 proteïnes per la millora de l’estratificació

Resultats: Validació dels 3 biomarcadors (IHQ)

% de cèl·lulespositives

Score %

0 0

<5% 1

5-19% 2

20-39% 3

40-59% 4

60-79% 5

80-100% 6

Intensitattinció

Scoreintensitat

Baix 1

Moderat 2

Alt 3

Puntuació global = Score % x Score intensitat (rang: 0-18)

Page 17: Aplicació d’una signatura pronòstica de 3 proteïnes per la millora … · 2016-02-19 · Aplicació d’una signatura pronòstica de 3 proteïnes per la millora de l’estratificació

Resultats: Definició de cut-offs (IHQ)

Criteri 2 x màx NL 2 x màx NL Mín NL/2

Cut-off > 12 > 12 = 0

Puntuació + 1 +1 +1

Page 18: Aplicació d’una signatura pronòstica de 3 proteïnes per la millora … · 2016-02-19 · Aplicació d’una signatura pronòstica de 3 proteïnes per la millora de l’estratificació

Resultats: Definició de la signatura proteica

Biomarcador 1 2 3

Criteri 2 x màx NL 2 x màx NL Mín NL/2

Cut-off > 12 > 12 = 0

Puntuació + 1 +1 +1

Suma = signatura[0-1-2-3]

Page 19: Aplicació d’una signatura pronòstica de 3 proteïnes per la millora … · 2016-02-19 · Aplicació d’una signatura pronòstica de 3 proteïnes per la millora de l’estratificació

Resultats: Efecte de la signatura en la supervivència

Page 20: Aplicació d’una signatura pronòstica de 3 proteïnes per la millora … · 2016-02-19 · Aplicació d’una signatura pronòstica de 3 proteïnes per la millora de l’estratificació

Resultats: Efecte de la signatura en la supervivència

Even

tFre

e Su

rviv

al0

0.5

1

0 50 100 150

P=0.018

0 BM (n=43, 5% events)

1 or 2 BM (n=81, 25% events)

3 BM (n=5, 40% events)

Time of survival (months)

Page 21: Aplicació d’una signatura pronòstica de 3 proteïnes per la millora … · 2016-02-19 · Aplicació d’una signatura pronòstica de 3 proteïnes per la millora de l’estratificació

PrognosticStrata

PRETEXT 1/2/3

PRETEXT 4

Age > 5yrs

AFP > 1.2x106

Multi-focal M+ AFP <

100 SCU

1: good + - - - - - - -2: intermediate +/- at least one - - -3: poor +/- +/- +/- +/- +/- at least one

Resultats: Signatura 3 proteïnes i classificació clínica

N=110

Page 22: Aplicació d’una signatura pronòstica de 3 proteïnes per la millora … · 2016-02-19 · Aplicació d’una signatura pronòstica de 3 proteïnes per la millora de l’estratificació

Resultats: Signatura 3 proteïnes i classificació clínica

N=110 N=62 intermediate

Page 23: Aplicació d’una signatura pronòstica de 3 proteïnes per la millora … · 2016-02-19 · Aplicació d’una signatura pronòstica de 3 proteïnes per la millora de l’estratificació

Resultats: Anàlisi de vies de senyalització

P-value:* <0.005 ** <0.0005 *** <0.00005Ac

tivat

ion

z-sc

ore

Page 24: Aplicació d’una signatura pronòstica de 3 proteïnes per la millora … · 2016-02-19 · Aplicació d’una signatura pronòstica de 3 proteïnes per la millora de l’estratificació

Resultats: Anàlisi de vies de senyalització

P-value:* <0.005 ** <0.0005 *** <0.00005

PI3K/Akt pathway HIPPO pathway

(Ser

473)

Page 25: Aplicació d’una signatura pronòstica de 3 proteïnes per la millora … · 2016-02-19 · Aplicació d’una signatura pronòstica de 3 proteïnes per la millora de l’estratificació

• A partir de l’estudi proteòmic de 145 HBs hem identificat ivalidat una signatura pronòstica de 3 proteïnes que milloral’actual estratificació clínica.

• L’anàlisi de vies de senyalització de les dades proteòmiques amés, ha permès identificar les vies PI3K/Akt, Hippo i EIF2desregulades en l’Hepatoblastoma.

Conclusions

Page 26: Aplicació d’una signatura pronòstica de 3 proteïnes per la millora … · 2016-02-19 · Aplicació d’una signatura pronòstica de 3 proteïnes per la millora de l’estratificació

Childhood Liver Oncology GroupCarolina ArmengolLaura RoyoMargarita SalaRamon Planas

Grupo Español para el Estudio de los Tumores de Hígado (GEETHI)Carolina ArmengolMª Elena MateosCristina BeléndezMarta GarridoDiego PlazaPurificación GarcíaManuel López Santamaría

Hospital Vall d’Hebron (Barcelona)Marta GarridoJoan Carles FerreresAlexandra NavarroConstantino Sábado

SIOPEL groupMargaret ChildsRudolf Maibach

Institut Pasteur (Paris)Marie Annick Buendia

Hôpital de Bicêtre (Paris)Monique Fabre

CIC bioGUNE (Bilbao)Mikel AzkargortaFelix Elortza

Hong Kong UniversityIrene OL Ng

University of Gdansk (Poland)Piotr CzaudernaMaciej Murawski

IMIM (Barcelona)Lara Nonell

Agraïments

Innate Immunity GroupMaria Rosa SarriasLucía SanjurjoGemma Aran

Page 27: Aplicació d’una signatura pronòstica de 3 proteïnes per la millora … · 2016-02-19 · Aplicació d’una signatura pronòstica de 3 proteïnes per la millora de l’estratificació
Page 28: Aplicació d’una signatura pronòstica de 3 proteïnes per la millora … · 2016-02-19 · Aplicació d’una signatura pronòstica de 3 proteïnes per la millora de l’estratificació