árbol filogenético
4
Alineamiento múltiple e identificación y búsqueda de motivos UNAL SECUENCIAS BIOINFORMÁTICA NP_006735.1 (Retinol Binding Protein 4, human) BAB25881.1 (Retinol Binding Protein 4, mouse) NP_001638.1 (human apolipoprotein D) MUP4_MOUSE (Major urinary protein 4, mouse) P0A902.1 RecName: Full=Outer membrane lipoprotein Blc; Flags: Precursor Las anteriores secuencias son procesadas en NCBI formato FASTA, cada una de ellas son alineadas en CLUSTAL OMEGA, este programa es encargado de agrupar las secuencias y posterior a eso hacer un respectivo alineamiento. El programa CLUSTAL OMEGA tambien tiene una opcion de general un árbol filogenético, el cual se
-
Upload
alex-arevalo -
Category
Documents
-
view
218 -
download
0
description
en este trabajo se muestra la familia de una especie.
Transcript of árbol filogenético
Alineamiento múltiple e identificación y búsqueda de motivosUNAL
SECUENCIAS BIOINFORMÁTICA
NP_006735.1 (Retinol Binding Protein 4, human) BAB25881.1 (Retinol Binding Protein 4, mouse) NP_001638.1 (human apolipoprotein D) MUP4_MOUSE (Major urinary protein 4, mouse) P0A902.1 RecName: Full=Outer membrane lipoprotein Blc; Flags: Precursor
Las anteriores secuencias son procesadas en NCBI formato FASTA, cada una de ellas son alineadas en CLUSTAL OMEGA, este programa es encargado de agrupar las secuencias y posterior a eso hacer un respectivo alineamiento. El programa CLUSTAL OMEGA tambien tiene una opcion de general un árbol filogenético, el cual se encarga de mostrar las relaciones evolutivas entre varias especies u otras entidades que se cree que tienen una ascendencia común.
ÁRBOL FILOGENETICO DE LAS SECUENCIAS
Una vez alineadas las secuencias las pegamos en un bloc de notas, este programa se encarga de convertir los archivos en formato FASTA, para que puede ser leido por el programa BIOEDIT, en este programa las secuencias son reconocidas, permite establecer un patron, el cual especifica las semejanzas entre estos organismos de la siguiente manera:
