CAT Biotica50...Lili

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Catálogos de Autoridades Taxonómicas (CAT) Biótica 5.0 Subcoordinación de Catálogos de Autoridades Taxonómicas [email protected]

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catabolismo

Transcript of CAT Biotica50...Lili

  • Catlogos de Autoridades Taxonmicas

    (CAT)

    Bitica 5.0

    Subcoordinacin de Catlogos de

    Autoridades Taxonmicas [email protected]

  • Qu son los Catlogos de Autoridades

    Taxonmicas?

    Bases de datos que renen los nombres cientficos de las especies de diferentes grupos taxonmicos con distribucin

    natural en Mxico

    Arreglo taxonmico basado en sistemas de clasificacin reconocidos (jerrquico desde reino hasta especies e

    infraespecies)

    Nomenclatura basada en los cdigos de nomenclatura vigentes

    Diferentes niveles de completitud dependiendo del contenido y disponibilidad de la informacin

    Bases de datos que pueden usarse como estndares Basados en consideraciones importantes de taxonoma

    y nomenclatura

  • Por qu usar estndares?

    Estndares: modelos o patrones usados como referencia para

    objetivos particulares

    Requisitos mnimos que garantizan informacin homognea y de calidad

    Reglas internacionalmente aceptadas

    Referidos por un elevado nmero de personas

    Ejemplos:

    Cdigos internacionales de Nomenclatura

    Autores de plantas. Brummitt & Powell, 1992

    Botanico Periodicum Huntianum

    Los CAT estn basados en dos grandes estndares:

    nomenclatura biolgica

    taxonoma

  • Taxonoma

    : arreglar, poner en orden

    Taxonoma: de Candolle, 1813

    Taxon, taxa: Meyer, 1926

    Taxonoma: Disciplina cientfica (parte de la sistemtica) que

    propone una clasificacin cientfica

    de los organismos vivos en

    unidades biolgicas particulares

    llamados taxones o taxa (Dubois,

    2012)

  • Nomenclatura

    : nombre, sustantivo, palabra, trmino Nomenclatura: Disciplina de la taxonoma que incluye

    la teora y reglas para nombrar a los taxones o taxa

    Resulta en la aplicacin de las reglas nomenclaturales de la taxonoma de un grupo de organismos (Dubois, 2012)

  • Reino: Plantae

    Divisin: Magnoliphyta (phyta)

    Clase: Dicotyledonae (opsida)

    Subclase: --- (idae)

    Orden: Rosales (ales)

    Suborden: --- (inales)

    Familia: Rosaceae (aceae)

    Subfamilia: --- (oideae)

    Tribu: --- (eae)

    Subtribu: --- (ineae)

    Gnero: Prunus

    Subgnero: ---

    Seccin: ---

    Subseccin: ---

    Serie: --

    Subserie: ---

    Especie: Prunus serotina Ehrh.

    Subespecie: P. serotina subesp. capuli (Cav.) McVaugh

    Variedad: ---

    Subvariedad: ---

    Forma: ---

    Subforma: ---

    Rangos de los taxones

    Con base en el Cdigo

    Internacional de

    Nomenclatura Botnica

    Slo en grupos grandes y complejos llegan a utilizarse

    el total de las categoras

    Esta forma de establecer categoras da orden y

    accesibilidad a la

    clasificacin de los

    organismos y proporciona un

    importante sistema de

    entrada y recuperacin de

    informacin

  • Importancia de los CAT

    Bases de datos sistematizadas para un grupo taxonmico

    Permiten conocer el estatus taxonmico actual de cada uno de los taxones que conforman dichos grupos, as como las

    relaciones de sinonimia

    Facilitan la captura de informacin taxonmica

    Sirven de control de la calidad de los datos

    Facilitan la consulta e intercambio de la informacin taxonmica con otras bases sistemticas(GSDs)

  • Vincular y armonizar los catlogos

    taxonmicos de

    programas mundiales

    de biodiversidad con el

    Catalogue of Life

    (CoL) para crear una

    comunidad

    taxonmica virtual.

  • Imgenes de satlite

    Cartografa electrnica de numerosos temas

    Monitoreo de ecosistemas

    Deteccin temprana de incendios

    Herramientas estadsticas, analticas y para extrapolacin, desarrollos bioinformticos

    Sntesis

    Anlisis

    Evaluaciones

    Caractersticas:

    Se actualiza constantemente Fuente pblica de informacin Accesible va www para diferentes usuarios

    Fuentes de informacin:

    Apoyo a proyectos Repatriacin de datos Literatura cientfica Minera de datos Colaboracin con expertos

    Procesos de control

    de calidad

    Nomenclatura (CAT)

    Bases de datos de ejemplares y de observaciones

    Informacin ecolgica de las especies y sus principales factores de amenaza

    Datos sobre el uso de las especies

    Redes de expertos nacionales e internacionales

    SNIB

    Sistema Nacional de Informacin

    sobre Biodiversidad

  • Listados

    comentados*

    Listado taxonmico*

    (especies vlidas y sinnimos)

    Listado nomenclatural*

    (Checklists)

    (especies vlidas)

    Niveles de CAT (de acuerdo al contenido)

    *Modificados de

    GBIF, 2011

  • Proyectos

    Control de calidad

    (SIB)

    Desarrollo /

    actualizacin

    de CAT en DTAP

    Revisin por

    taxnomos

    expertos

    Catlogo completo y finalizado

    Asesoras para

    actualizacin de CAT

    CD de Bitica Pgina CONABIO

    Publicaciones

    (poltica

    editorial)

    Lineamientos CAT Criterios de calidad

    (DTAP, SIB)

    Desarrollo de Bds

    (especialista / DTAP)

    Memos de revisin

    y correccin

    Validacin de

    especies

    Metadatos

    Lineamientos

    CAT

    Mtodo

    Lineamientos

    CAT Lineamientos

    CAT

  • Los CAT en Bitica

    Categoras taxonmicas:

    obligatorias intermedias

  • Mdulo nomenclatural

  • Relaciones entre nombres

    Es importante asociar la bibliografa

    que respalda la relacin

  • Distribucin

    asociado al

    vlido

    Definir el nivel

  • Nombre comn

    asociado

    al vlido

    Definir la regin

  • Ambiente (u otras

    caractersticas)

    asociado al

    vlido

  • Lista taxonmica

    en formato PDF.

    Contiene la

    totalidad de

    nombres en una

    lista alfabtica con

    los nombres

    actualmente en

    uso y sus

    sinnimos

  • Escritura de los nombres regulada por cdigos de nomenclatura (ICBN y ICZN)

    Taxones deben estar referidos a un autor y un ao de descripcin, as como a un sistema de clasificacin, arreglo taxonmico o referencia

    Consistencia en la escritura de la informacin:

    Autor, ao. Autores concatenados con & en lugar de and, y o et

    Sinnimos, SIEMPRE relacionados a un nombre vlido

    No se permiten relaciones entre nombres con el mismo estatus

    Cita nomenclatural debe corresponder con el ao de descripcin del taxn

    Uniformidad del contenido y en la estructura general de la base de datos.

    Tipos de errores: omisin, redundancia, contenido, contexto

    Criterios de revisin de la informacin

  • Cmo solicito un CAT en Bitica?

    Utilidad de un CAT?

    Solicitar al correo [email protected] el catlogo del

    grupo de inters

    Formatos de entrega: Bitica, checklist (pdf) y tabla plana (excel)

    Taxonoma ya ingresada en el sistema

    Revisar utilidad en el documento de metadatos de cada CAT

    Posibilidad de unir en una sola BDs la taxonoma de grupos biolgicos muy distintos (plantas e insectos)

  • Metadatos CAT

    Documento que informa el contenido general del catlogo:

    Nmero de gneros, especies e infraespecies (vlidos y sinnimos)

    Informacin adicional incluida

    Sistemas de clasificacin y

    catlogos de referencia

    Calidad de los datos

    Mtodo y actualizaciones

    Informacin tcnica de Bitica

    (registros por categora taxonmica)

    Referencias bibliogrficas

  • Proyecto Titulo CAT

    KT001 Catlogo de autoridades taxonmicas de platyhelmithes y acanthocephala parsitos de vertebrados silvestres de Mxico

    Vertebrados (para asociar con los helmintos)

    KT003 Protistas ciliados y flagelados hetertrofos

    Ciliados (elaboracin) KT004 Catlogo de Autoridades Taxonmicas de las especies de

    poliquetos (Annelida: Polychaeta) del Pacfico Mexicano y otras localidades del Pacfico Oriental Tropical Poliquetos (elaboracin)

    KT006 Catlogo de especies de fitoplancton marino del Pacfico mexicano Fitoplancton (actualizacin)

    JE011 Flora vascular y endemismos de las partes altas de varios macizos montaosos de Quertaro y norte de Michoacn-1ra Fase

    Plantas (facilitar captura)

    JF212 Anfibios y reptiles de las regiones Chimalapas (7) y bosque de conferas y BMM de Veracruz (11)

    Anfibios y reptiles (facilitar captura)

    Diferentes usuarios, diferentes

    necesidades

  • CAT Grupos incluidos Especies

    vlidas

    Algas y

    Protozoarios

    Cianobacterias, Diatomeas, Macroalgas,

    Protozoarios

    4,465

    Hongos Micromicetos y macromicetos 2,252

    Plantas Briofitas, Pteridofitas, Gimnospermas,

    Angiospermas

    25,853

    Invertebrados

    Esponjas, placozoos, cnidarios, platelmintos,

    rotferos, nematodos, acantocfalos,

    anlidos, onicforos, tardgrados,

    artrpodos, moluscos, fornidos,

    equinodermos, quetognatos

    44,064

    Vertebrados Peces, anfibios, reptiles, aves, mamferos 5,594

    En la descripcin de cada CAT se presenta el dato

    de cobertura taxonmica de cada grupo

    Catlogos por grupos taxonmicos (contenido 2013)

  • Contenido CAT de vertebrados

    CAT Informacin adicional adems de la lista de nombres

    correctos

    Especies

    vlidas

    Peces Incluye sinonimia y nombres comunes

    Actualizacin y revisin por pares pendiente.

    Fuentes: Nelson, 2006.; Espinosa et al., 2008

    2718

    Anfibios Incluye sinonimia, citas, nombres comunes.

    Revisin por pares pendiente.

    Fuentes: Frost, 2011

    380

    Reptiles Sinonimia

    Fuentes: Flores-Villela, 1993; Flores y Canseco, 2004; Reptile

    Data Base, 2011, entre otros.

    888

    Aves Incluye sinonimia, nombres comunes y regin

    Fuentes: American Ornithologist Union, 2012, Clements,

    2011

    1073

    Mamferos Sinonimia, Regin. Diferente grado de avance en distintas

    familias.

    Fuentes: Ceballos et al., 2002; Ceballos y Oliva, 2005:

    Ramrez-Pulido et al., 2005; entre otros.

    532

  • CAT Informacin adicional adems de la lista de nombres

    correctos

    Especies

    vlidas

    Briofitas sinonimia y distribucin. Se requiere actualizar la

    informacin.

    Fuentes: Sharp, Crum & Eckel, 1994; Delgadillo, 2003

    1,242

    Pteridofitas sinonimia y distribucin. Informacin ms o menos

    actualizada y completa.

    Fuentes: Mickel & Smith, 2004; Smith, Pryer, Shuettpelz,

    Korrall, Shneider & Wolf, 2006

    1,101

    Gimnospermas sinonimia y distribucin. Informacin ms o menos

    actualizada y completa.

    Fuentes: Farjon, A., J. Prez de la Rosa y B.T. Styles. 1997;

    Farjon, A., 2001

    162

    Angiospermas sinonimia, distribucin y nombres comunes. La informacin

    es muy completa para algunas familias y muy incompleta en

    otras familias.

    Fuentes: Cronquist, 1981; Dahlgren, Clifford & Yeo, 1985 y

    referencias particulares por familia

    23,069

    Contenido CAT de plantas

  • Retos en la construccin de

    los CAT

    Relacin inversa entre el nmero de especies y los taxnomos expertos (impedimento taxonmico)

    Tiempo extenso para su elaboracin

    Informacin escasa / dispersa

    Cambios contnuos en la taxonoma

    Necesidad de validar las especies reportadas con ejemplares (visita a diferentes colecciones)

    Cotejar y sintetizar diferentes puntos de vista en relacin con la clasificacin y la taxonoma

    Decisiones colegiadas entre especialistas

  • GRACIAS!!!