Clase 10 -Deriva y Flujo génicos
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Deriva y Flujo génicos
Clase 10
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Coeficientes F e IBD• Las estadísticas F se puedes ver como probabilidad de
alelos IBD en diferentes muestras:
Probabilidad total de IBD
Probabilidad de alelos IBD para dos individuos en una
sub-población
Probabilidad de IBD dentro de un
individuo
)1)(1(1 ISSTIT FFF
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Estructura poblacional según el modelo de Islas
1)2
11(
2
1 tt f
NNf
qm
q0
mm m m
m
q0 q0 q0
q0
Homocigosidad Esperada en tiempo t sin migración:
Si el tamaño de población en las islas es pequeño y/o el flujo génico es poco; el efecto de la deriva será grande
21 )1]()
2
11(
2
1[ mf
NNf tt
Incorporando migración:
2
2
)1)(12(2
)1(
mNN
mFST
Equilibrio Migración-Deriva:
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Equilibrio Migración - Deriva
2
2
)1)(12(2
)1(
mNN
mFST
Equilibrio:
14
1
Nm
FST
Asumiendo que m2 es pequeño e ignorando 2m en numerador y
denominador:
ST
ST
F
FNm
4
1
• Se permite una estimación del número de emigrantes por generación
• Es una aproximación en condiciones de equilibrio, para el modelo de Islas.
• Sólo es válido para Nm bajos– FST = 0.01, Nm ≈ 24.8
– Valor real (N=50) es 14.6
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Tiempo a equilibrio
NtST eF 2/1
Comienza en 0 y se aproxima a 1 con el tiempo
• En ausencia de flujo génico (bajo flujo), la deriva causará que las poblaciones difieran en el tiempo
• El equilibrio se alcanza lentamente si N es grande y m pequeño
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21 )1]()
2
11(
2
1[ mf
NNf tt
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Diferenciación de sub-poblaciones
• Las sub-poblaciones serán más uniformes dependiendo de la cantidad de flujo génico y/o N
• Si:
• Nm << 1– deriva es más importante que flujo
génico
– diferenciación completa: FST=1
• 1 < Nm < 4– hay equilibrio entre deriva y flujo
• Nm > 4– flujo es más importante
– FST 0
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FST: ¿Cuánto es alto?
• Grado de diferenciación– 0.05 to 0.15 es leve a moderado– 0.15 to 0.25 diferenciación moderada a fuerte– >0.25 diferenciación muy fuerte
• Se relaciona a nivel histórico de flujo génico entre poblaciones
• Usualmente NO representa condiciones actuales
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Tipo de Flujo génico
• Varias formas de dispersar genes en modelo de islas– Cada modelo impactará la estructura génica
de forma diferente– Modelos de colonización (Whitlock &
McCauley[1990])
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“Fuente de Propágulos”
• Todos los colonizadores provienen de una única población seleccionada al azar– Estructura aumenta si alelos son IBD por
estructura interna
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“Fuentes de Migrantes”• Colonos representan una muestra al azar de
todas las poblaciones existentes. Diferenciación usualmente baja, pero depende de estructura previa
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Migración estructurada por familia