Diagnóstico de enfermedades en plantas

Diagnstico de enfermedades en plantasHaga clic para modificarSnchez-Cuevas Maria Claudia el estilo de subttulo del patrn

Postgrado en Agricultura Tropical Universidad de Oriente Maturn, agosto 2011

Qu es diagnstico?

Es la identificacin de la causa de la enfermedad. Inicialmente es importante determinar si los sntomas son inducidos por un agente bitico o por un agente abitico.

Agente bitico o abitico?

Para una persona experimentada, es relativamente fcil determinar si los sntomas o signos observados en el campo son causados por un agente bitico o abitico, a ms de determinar exactamente cul agente es el causante de la enfermedad.

Agente bitico o abitico?

Con frecuencia es necesario comparar los sntomas observados en la plantas con los encontrados en la bibliografa especializada (fotos de alta calidad). En la mayora de los casos, sin embargo, se requiere revisar los sntomas con mayor cuidado e indagar muchos otros aspectos ms all de los sntomas para lograr un diagnstico correcto.

Diagnstico

Es importante obtener informacin para tener una historia del problema:

Descripcin del estado de la planta Tipo de planta, cultivar o variedad. Edad, tamao Ubicacin del sitio donde se encuentra la planta Otras plantas afectadas o cercanas Condiciones edafo-climticas recientes Manejo dado a la planta

Diagnstico

Los sntomas con las caractersticas fsicas de la enfermedad que se manifiestan en una planta. Los signos son la evidencia fsica de la presencia del patgeno y estn formados por estructuras del patgeno o

Agentes causales de enfermedades en las plantasFactores biticos:

Causas de las enfermedades de las plantasFactores abiticos:

Requisitos para que ocurra una enfermedad

El tringulo de la enfermedadHospedero susceptible

Patgeno

Ambiente favorable

Principales manifestaciones patolgicas en la plantas

- Manchas foliares

- Marchitez - Pudriciones

Alternaria solani

Alternaria solani

Alternaria solani

Alternaria solani

Principales manifestaciones patolgicas en la plantasDamping-off (sancocho) Candelilla Roya

Principales manifestaciones patolgicas en la plantas

Agallas Enanismo Mosaicos Pudriciones

Diagnstico fitosanitarioArte o Ciencia? Haga clic para modificar el estilo de subttulo del patrn

Diagnstico de plantas enfermas Historial del campo y del manejo del cultivo.-Registros del manejo de cultivos en ciclos o aos anteriores y del cultivo en desarrollo (riego, fertilizacin, control qumico, mecanizacin) -Enfermedades reportadas en cultivos anteriores -Reportes agroclimticos anuales (T, precipitacin, etc.) -Topografa del terreno y caractersticas del suelo -Espectro de especies sintomticas -Caractersticas de morfologa y fenologa del cultivo.

Caracterizacin de la enfermedad en el campo

a- Examinar el campo y alrededores b- Identificacin de la especie o variedad enferma

Patrones de anormalidad :Distribucin de la enfermedad en el campo y comparacin de plantas

Examinacin de plantas individuales, posicin de sntomas y signos

Colecta, preparacin y envo de muestra :

Consideraciones Generales-

Apropiada cantidad y calidad de ejemplares No mezclar diferentes componentes de la muestra No colectar despus de la aplicacin de plaguicidas Evitar muestras hmedas Refrigerar las muestras hasta el anlisis

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Diagnstico en el laboratorio Observacin directa de la muestra (sntomas y signos) Signos: Sntomas:

Observacin de sntomas








Meloidogyne en Guayaba

Meloidogyne en Tabaco


SN O A I T MS I II LS NC AE

SN O A I T MS AA Z D S V NA O

Observacin de sntomas y signos

www.ucs.louisiana .edu

Observacin de sntomas y signos

www.agrosanmartin.gob.pe

www.ucs.louisiana .edu www.nacion.com

Diagnstico en el laboratorio Observacin directa de la muestra (sntomas y signos)

Diagnstico en el laboratorio



Observacin estereoscpica de los signos


Antracnosis en cacao

Observacin de los signos



Aislamiento en medios de cultivo

Observacin en microscopio electrnico

Observacin microscpica de los signos

Alternaria solani

Lavado, desinfeccin y siembra

Cmara hmeda y aislamiento del patgeno

Cmo determinamos si un microorganismo es patgeno? Realizando las pruebas de patogenicidad

Postulados de Koch

Informes fitosanitariosHaga clic para modificar el estilo de subttulo del patrn

PCR: Reaccin en Cadena de la Polimerasa

El propsito de la PCR es hacer un gran nmero de copias de un gen. Esto es necesario para tener suficiente material patrn para el proceso de secuenciacin.

PCR: Reaccin en Cadena de la PolimerasaLa PCR tiene dos pasos esenciales: 1. Las reacciones cclicas. 2. Asegurarse de que el gen de inters se copi y si es del tamao correcto.

PCR: Reaccin en Cadena de la PolimerasaLa PCR tiene dos pasos esenciales: 1. Las reacciones cclicas. 2. Asegurarse de que el gen de inters se copi y si es del tamao correcto.

PCR: Las reacciones cclicasLas reacciones cclicas se repiten unas 30 a 40 veces. Esto se hace automticamente en un termociclador, que calienta y enfra los tubos con la mezcla en un tiempo muy corto. Las reacciones son las siguientes: Desnaturalizacin a 94C. Separacin de la cadena doble en dos cadenas sencilla de ADN. Unin (annealing) a 54C entre la cadena sencilla de ADN y el primer (cebador o iniciador). Extensin a 72C. La polimerasa se une e inicia el copiado. Las bases (complementarias con la cadena patrn) son unidas al primer en el lado 3(la polimerasa aade dNTPs de 5a 3, leyendo la cadena patrn en la direccin 3a 5. Las bases son complementarias al patrn.

PCR: Amplificacin exponencialDebido a que ambas cadenas son copiadas durante la PCR, hay un incremento exponencial del nmero de copias de un gen. Suponiendo que hay una sola copia del gen de inters antes del inicio del proceso, despus de un ciclo habrn dos copias, despus de dos habrn cuatro, en tres ciclos habrn 8 copias y as sucesivamente.

PCR: Los resultados son los esperados?1.

2.

3.

Antes de que el producto de la PCR sea usado, debe verificarse que: Se haya formado un producto. El DNA puede ser de mala calidad, que uno de los primers no funcione o que hay demasiado patrn inicial. El producto es del tamao adecuado. Si se espera un producto de 1800 bases pero se obtiene uno de 500bp, es posible que uno de los primers encaja en otro lado del gen cercano al otro primer o que ambos encajan en otro gen totalmente diferente. Varias bandas se forman. Es posible que el primer encaje en la posicin deseada y en otros sitios tambin.

El estndard es una mezcla de fragmentos de tamao conocido, con una distancia logaritmica. 1 : Fragmento PCR fragment de 1850 bases. 2 y 4: Los fragmentos tienen aprox. 800 bases. 3: No se form producto. the fragments are approximately 800 bases long. 5: Mltiples bandas se formaron.

No olvidar los aliados!!!!

MUCHA S GRACIA S

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