IBIOLOGi,6. CB13apregrado.udg.mx/sites/default/files/...Ejercicios a realizar de como a partir del...

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-- UNIVERSIDAD DE G UADALAJAR A Centro Vniversitario de los Lagos Divisi6n de Estudios de 1a Biodiversidad e Innovaci6n Tecnol6gica Departamento de Clenelas de la Tier ra y de la Vida 1. IDENTIFICACION DEL CURSO Nombre de la materia I BIOLOGi,6. Val or en Total de Horas: Clave de la Horas de Horas de teorfa: credit os: practica: materia: g 20 . 80 9 CB13a 60 Tipo de curso: (Marq ue con un-a X) c= X . T= . CT = s= X C= L= M- m6dulo Laboratorio clfnica curso Taller curso- seminario taller Prerrequisitos fonnale s (Materias previas establecidas en el Plan de Estudios} CB'137 Biologia Celular CB 141 Bioquimica artamento: Prerrequisitos recomendados (Materias sug er idas en la ruta academica aprobada) ca 141 Bioquhnica artamento de Cie nci as de la Tierra y de la Vida Carrera: I ..... .... n .c.:. ia"--· _ _ __________ _ g-"-e.;..; le;..:.r .;.; _ _ _ Area de formaci6n' Area ' de formaci6n basica comun obligatoria. Area de formaci6n basica particular obligatoria. X Area de formaci6n basica particular selectiva . Area de formaci6n especializante selectiva. Area de formaci6n optativa abierta. Historial de revisiones: Acci6n: ' . Fecha: Responsable Revisi6n, Elaboracl6'n 01 de Febrero de Ora. Maria de la LuzMiranda Beltran 200 5 Revisi6n 15 de JUlio de 2013 MESA CORNEJO VIVIANA MATILDE MIRANDA BELTRAN MARIA DE LA LUZ SORIA FREGOZO CESAR VILLALAZ UREt'JA MA. ISABEL - . , . Enrique D[ az de Le6n No. 1144, Colonia Paseos de 1a Montafia C.P. 47460. Lagos de Moreno, Jalisco. M6 xico Tels. [52] (474) 7424314,7423678, 7464563 Ext. 66512, Fax Ext. 66527 www.lagos.udg.mx

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UNIVERSIDAD DE GUADALAJARA Centro Vniversitario de los Lagos Divisi6n de Estudios de 1a Biodiversidad e Innovaci6n Tecnol6gica Departamento de Clenelas de la Tierra y de la Vida

1 IDENTIFICACION DEL CURSO Nombre de la materia

IBIOLOGi6 MO~ECULAR

Valor enTotal de Horas Clave de la Horas deHoras de teorfa credit ospracticamateria g20 80 9CB13a 60

Tipo de curso (Marque con un-a X) c= X T= CT = s= X C= L= Mshy

m6duloLaboratorio clfnica curso Taller cursoshy seminario taller

Prerrequisitos fonnales (Materias previas establecidas en el Plan de Estudios CB137 Biologia Celular CB 141 Bioquimica

artamento

Prerrequisitos recomendados (Materias sugeridas en la ruta academica aprobada)

ca 141 Bioquhnica

artamento de Ciencias de la Tierra y de la Vida

Carrera I--L~ic--e---n~c_ia--tu_ra~ecn_lcn nc ia--middotB---io--qJ-ucicmci~c--a_~_ _ __________ _ ~g--e ler _ _ _

Area de formaci6n Area de formaci6n basica comun obligatoria

Area de formaci6n basica particular obligatoria

X Area de formaci6n basica particular selectiva

Area de formaci6n especializante selectiva

Area de formaci6n optativa abierta

Historial de revisiones Acci6n

Fecha Responsable Revisi6n ~laboraci6n Elaboracl6n 01 de Febrero de Ora Maria de la LuzMiranda Beltran

2005

Revisi6n 15 de JUlio de 2013 MESA CORNEJO VIVIANA MATILDE MIRANDA BELTRAN MARIA DE LA LUZ SORIA FREGOZO CESAR VILLALAZ UREtJA MA ISABEL-

Enrique D[az de Le6n No 1144 Colonia Paseos de 1a Montafia CP 47460 Lagos de Moreno Jalisco M6xico Tels [52] (474) 74243147423678 7464563 Ext 66512 Fax Ext 66527

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Revision 31 de Enero 2014

GUTIERREZ CORONADO OSCAR SOFIA LOZA CORNEJO MTRO JUAN JOSE ZARAGOZA BARBA

MESA CORNEJO VIVIANA MATILDE MIRANDA BELTRAN MARIA DE LA LUZ SORIA FREGOZO CESAR VILLALAZ URENA MA ISABEL GUTIERREZ CORONADO OSCAR SOFIA LOZA CORNEJO MTRO JUAN JOSE ZARAGOZA BARBA

Revision 31 de Enero 2015 MESA CORNEJO VIVIANA MATILDE MIRANDA BELTRAN MARIA DE LA LUZ SORIA FREGOZO CESAR GUTIERREZ CORONADO OSCAR SOFIA LOZA CORNEJO MTRO JUAN JOSE ZARAGOZA BARBA

Revision

Revision

Enero 2017

Enero 2018

MESA CORNEJO VIVIANA MATILDE MIRANDA BELTRAN MARIA DE LA LUZ SORIA FREGOZO CESAR GUTIERREZ CORONADO OSCAR SOFIA LOZA CORNEJO MTRO JUAN JOSE ZARAGOZA BARBA MESA CORNEJO VIVIANA MATILDE MIRANDA BELTRAN MARIA DE LA LUZ SORIA FREGOZO CESAR GUTIERREZ CORONADO OSCAR SOFIA LOZA CORNEJO MTRO JUAN JOSE ZARAGOZA BARBA MARfA ISABEL PEREZ VEGA

Academia I Ciencias Biologicas

Aval de la Academia Enero 2018 Nombre Cargo Firma

Presidente Secreta rio Vocales

Maria Isabel Perez Vega Presidente ~ Juan Jose Zaragoza Barba Secretario ~J -t -shy---shy

2 PRESENT ACION LA ASIGNATURA DE BIOLOGiA MOLECULAR SE UBICA DENTRO DE LA CARRERA DE INGENIERIA BIOQUIMICA EN EL AREA BAslCA PARTICULAR OBLIGATORIA Y LE SERVIRA AL ESTUDIANTE PARA COMPRENDER LAS BASES MOLECULARES DEL FUNCIONAMIENTO CELULAR LOS MECANISMOS QUE PUEDEN ESTAR AL TERADOS PARA DAR LUGAR A UNA PATOLOGIA Y LAS TECNICAS MOLECULARES QUE LE SERVIRAN EN UN MOMENTO DADO PARA REALIZAR UN ESTUDIO ADECUADO EN EL AREA BIOMEDICA DE LA AGRICUL TURA INDUSTRIAL Y FARMACEUTICA ESTA ~SIGNATURA CONSISTE EN EL ESTUDIO DE LOS PROCESOS CELULARES

Enrique Diaz de Leon No 11 44 Colonia Paseos de la Montana CP 47460 Lagos de Moreno lalisco Mexico Tel s [52] (474) 742 4314 742 3678 746 4563 Ext 66512 Fax Ext 66527

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B SICOS QUE REGULAN LA EXPRESI6N GENICA EN middot LA CUAL EL ALUMNO REAlIZARA UNA INTEGRACI6N DE LOS CONOCIMIENTOS PREVIAMENTE RECIBIDOS EN LA ASIGNATURA DE BIOQulMICA Y TENDRA CONTINUACION CON LOS CONOCIMIENTOS QUE SE ADQUIRIRAN EN LA ASIGNATURA DE GENETICA OBJETIVO GENERAL - -

COMPRENDER LA RELACI6N QUE EXISTE ENTRE ELDNA Y LOS PROCESOS CELULARES PARA ENTENDER LOS MECANISMOS QUE RIGEN EL FUNCIONAMIENTO CELULAR Y LOS FUNDAMENTOS DE LA TECNOLOGIA DEL DNA RECOMBINANTE UTILES EN LA IDENTIFICACI 6N DE LAS DIFERENTES AREAS COMO LAS BIOMEDICAS Y BIOTECNOL6GICAS ENTRE OTRAS MEDIANTE LA COMPRENSI6N DE LOS ELEMENTOS BAs lCOS QUE PARTICIPAN EN EL MANTENIMIENTO DE LA EXPRESI6N Y REGULACI6N GENICA OBJETIVbS ESPECIFICOS 1- CONOCER EL DESARROLLO DE LA BIOLOGIA MOLECULAR LOS CONCEPTOS BAslCOS DE ESTRUCTURA Y FUNCIONAMIENTO CELULAR Y SU RELACI6N CON EL DNA Asl COMO LOS FUNDAMENTOS DE LA EXPRESI6N DE LOS GENES As i MISMO CONOCER LAS BASES MOLECULARES DE LAS PATOLOGIAS HUMANAS QUE MAs IMPACTO TIENEN EN LA POBLACI6N MEXICANA LA AGRICUL TURA LA BIOTECNOLOGIA EN LA INSDUSTRIA Y FARMACEUTICA 2- IDENTIFICAR LOS METODOS MAs COMUNES DE LA BIOLOG[A MOLECULAR SU APlICACI6N E INTERPRETACI6N Y RELACIONAR LAS ALTERACIONES MOLECULARES EN LA MEDICINA EN LAS PLANTAS Y ANIMALES 3- ELEGIR Y MANEJAR LAS MUESTRAS PARA ESTUDIOS MOLECULARES ASI COMO INTERPRETAR LOS RESULTADOS Y APlICARLOS EN El TRATAMIENTO PRAcTICO ADEMAs DE ENTENDER ARTICULOS DE ACTUALIZACION QUE VERSEN SOBRE TEMAS MOlECULARES 4- SE FOMENTARA EN El ALUMNO EL ESPIRITU DE LA INVESTIGACI6N Y LA NECESIDAD DE ACTUAlIZARSE CONSTANTEMENTE EL TRABAJO EN EQU IPO Y LA AUTOCRITICA Asl MISMO LA DISCIPlINA EL ORDEN Y LA ETICA PROFESIONAL ANTE CUAlQUIER ACCI6N RELACIONADA CON LA VIDA HUMANA

CONTENIDO Temas y=Su-b-=-te-m-as-middot-------shy

Introducci6n ala Biologla Molecular

------middotmiddot--shy

Experimentos sobre como se descubri6 la naturaleza aportaciones para el descubrimiento del DNA por cientificos

de los como

acidos nucleicos Chargaff Griffith

Avery MacLeod Beadle Tatum Garrod Watson y Crick Jacob Monod Termin Baltimore Conceptos generales del DNA gen nucleotido cromatina RNA dogma central de la biologla molecular Definir su objeto de estudio dar ejemplos de aplicaciones de la biologfa molecular en

general Organizaci6n del genoma humane

~1 Ac Nuclelcos c9nformaci6n de la dobl=-ehelic-=-eDNA-A~B _ _ ___ _ ---l=Z_ Enrique Dlaz de Le6n No 1144 Colonia Paseos de la Monlafa cP 47460

Lagos de Moreno Jalisco Mexico Tels [52] (474) 742 4314 742 3678 746 4563 Ext 66512 Fax Ext 66527 wwwlagosudgmx

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22 Niveles de organizacion en eucariotes Nucleosoma fibra de 10nm 30nm solenoide bucles cromosomas su estructura y comportamiento durante el cicio celular tipos y funcion 23 Tipos de cromatina Eucromatina heterocromatina constitutiva y facultativa DNA Gen y cromosomas 24 EI cicio celular y sus etapas con enfasis en comportamiento del DNA Cicio de descompactacion duplicacion y preparacion para la division de la cromatina (G1 S Y G2) Y de compactacion (division) 25 Participacion de las ciclinas y kinasas dependientes de ciclinas (cdks) en el cicio asf como de las protefnas p53 y p21 p27 26 Organizacion del genoma Clases de DNA De copia unica y repetitivo asf como la clasificacion de cada una de estas

Replicacion 31 Definicion de Replicacion en celulas procariotes y eucariotes 32 Caracterfsticas de DNA Semiconservativa bidireccional cadena Ifder retrazada 33 Enzimas involucradas en la replicacion primasa helicasa protefnas (RPA) SSB topoisomerasas ligasas y polimerasas I II y III 34 Conceptos de replicon replisoma horquilla formacion de los fragmentos de Okazaki 35 Iniciacioh elongacion y terminacion en procariotes yeucariotes 36 La telomerosa y mecanismo de accion de la telomerasa en replicacion

Expresion de genes (Transcripcion)

41 Definicion funcion clasificacion y estructura 42 Conceptos de Gen eucariote Elementos estructurales (exones intrones sitio de iniciacion de la transcripcion y elementos reguladores de un gen (region promotora y otras regiones reguladoras) 43 Conceptos elementales de expresion productos primarios de expresion (RNA primario RNAm RNAr y RNAt polipeptido 0 proteina) 44 Elementos que conforman el reconocimiento del promotor sitios de inicio regiones consenso RNA polimerasas I II Y III detalle de la region transcrita incluyendo la de terminacion 45 Iniciacion elongacion y terminacion 46 Participacion de los factores transcripcionales 47 Corte y empalme edicion caperuza 5 cola poliA 48 Niveles de regulacion pretranscripcional transcripcional postranscripcional 49 Ejercicios a realizar de como a partir del DNA se obtiene un RNA

Traduccion

51 Definicion 52 Codigo geneticb 53 Iniciacion elongacion y terminacion de Traduccion en eucariotes 54 lVIodificaciones Postraduccibnales del polipeptido que sufre en la celula (tipos de modificaciones ejemplos etc) 55 Proteinas involucradas en el procesamiento de maduracion del polipeptido (Carabinas c~~eroheS entre otras)

Enrique Dfaz de Le6n No 1144 Colonia Paseos de Ia Montaila cP 47460 Lagos de Moreno lalisco Mexico Tels [52] (474)742431474236787464563 Ext 66512 Fax Ext 66527

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V 11 Y Jtl-HVnv lI11 -J U rul JLJJfil1

Centro Universitario de los Lagos Divisi6n de Estudios de la Biodiversidad e Innovaci6n Tecnol6gica Departamento de Clendas de tn Tierra y de In Vida

Mutaciones y la Reparaci6n en el DNA

61 Tipos de mutaciones por el tipo de dano al DNA clasificaci6n puntuales deleciones inserciones etc 62 Mutagenos qulmicos flsicos y biol6gicos 63 Terat6genos carcin6genos 0 clast6genos 64 Reparaci6n por excisi6n fotoreparaci6n sistemas SOS Rad etc Tecnicas DNA recomblnante

Diagn6stico Molecular Extracci6n de acidos nuclelcos manejo de muestras Enzimas de restricci6n nucleasas polimerasas Desnaturalizaci6n renaturalizaci6n hibridaci6n obtenci6n y utilidad de las sondas Clasificaci6n de las ER descubrimiento nomenclatura Secuencia palindr6micas Tipos de extremos que generan romo cohes iv~

mapas de restricci6n Electroforesis principios basicos Tecnicas de hibridaci6n blot dot slot Northern Southern con ejemplos de aplicaciones hibridaci6n in situ PCR tipos (simple semicuantitativo cuantitativo y tiempo real) aplicaciones PCR e interpretaci6n de estudios Vectores de clonaci6n y expresi6n fundamentos y aplicaciones bibliotecas Secuenciaci6n M icroarreg los

Bases moleculares de las principales patologias en Mexico

81 - Serializaci6n de insulina Mecanismos moleculares en la DM2 82- Biologla molecular en lipid os y obesidad Bases moleculares de hambre-saciedad Diabesidad 83- Bases moleculares de Enfermedades infecciosas (Hepatitis Virales ABC y VIH) 84- Biologla molecular del Cancer (cicio celular CDK ciclinas puntos de restricci6n proto-oncogenes oncogenes genes supresores de tumor (APC p53 pRb BRCA)) 85 Biologla molecular en Diferentes tipos de cancer ( Cancer de colon CA de mama) 86 Farmacologla Molecular Epigenetica

Proyecto del Genoma Humano y la Etica

91- Terapia genica Estrategias moleculares de terapia genica metodos de envlo de genes) 92- Biologla molecular y etica medica DNA y medicina predictiva Consejo Genetico Etica y terapia genica Aspectos legales La Biologla Molecular y la Sociedad 93-Proyecto genoma humano estado actual genomita prote6mica 94- Perspectivas en la agricultura (malz transgenico)

6 TAREAS ACCIONES YO PRAcTICAS DE LABORATORIO Aprendizaje grupal mediante lecturas relacionadas con los te=--m-a-s--------~ Pre untas sobre el tema antes de iniciar la clase ~

Enrique Dlaz de Le6n No 1144 Colonia Paseos de la Montafla CP 47460 Lagos de Moreno Jalisco Mexico Tels [52] (474) 742 4314 742 3678 746 4563 Ext 66512 Fax Ext 66527

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Ejercicias en clase trabajos de investigaci6n presentaciones entre otros) Realizaci6n de una prcktica demostrativa

7 BIBLIOGRAFiA BAslCA (Preferentemente ediciones recientes 5 arios) BIOLOGIA MoLECULAR E I NGENIERIA GENETICA JOSE LUQUE Y ANGEL HE RRAEZ ED HARCOURT5a EDICI6N MEXICO 2012 BIOLOGiA MOLECULAR FUNDAMENTOS Y APLICACIONES EN LA SALUD ADRIANA MARIA SALAZAR MONTES ANA SOLDEAD SANDOVAL RODRIGUEZ JUAN SOCORRO ARMENDARIZ BORUNDA ED fV1C GRAW HILL2016 BIOLOGiA MOLECULAR DEL GEN JAMES D WATSON TANIA A BAKER STEPHEN P BELL ALEXANDER GANN MICHAEL LEVINE RICHARD LOSICK ED PANAMERICANA 2016

1

4 CELL AND MOLECULAR BIOLOGY 8TH EDITION GERALD KARP JANET IWAM WALLACE MARSHALL WILEY DECEMBER 2015 copy20 16

5 BIOLOGiA CELULAR Y MOLECULAR HARVEY LODISH ARNOLD BERK CHRIS A KAISER MONTY KRIEGER ANTHONY BRETSCHER HIDDE PLOEGH ANGELIKA AMON MATTH EW P SCOTT EDICION 78 PANAMERICANA 2016 bull

8 BIBLIOGRAFiA COMPLEMENTARIA (PREFERENTEMENTE EDICIONES RECIENTES 5 ANOS) _ _ __ 1 LEWINS GENES XI ~--

ESCRITO POR JOCELYN E KREBSBENJAMIN LEWINELLIOTT S GOLDSTEINSTEPHEN T KILPATRICK JONES amp BARTLETT PUBLISHERS 2014

2 MOLECULAR BIOLOGY OF THE CELL SIXTH EDITION ESCRITO POR BRUCE ALBERTS ALEXANDER JOHNSON JULIAN LEWIS DAVID MORGAN MARTIN RAFF KEITH ROBERTS PETER WALTER 2014

GS ~y~~~~~S ~~~nce

9 CRITERIOS Y MECANISMOS PARA LA ACREDITACION Acreditaci6ri Para tener derecho a examen ordinario el alumno debera cumplir con un 80 de las asistencias y para tener derecho a examen extraordinario el alum no debera cumplir con el 60 de las asistencias Asimismo esta nlateria puede ser acreditada par competencias para 10 cual el alumno debera registrar su solicitud en el departamento al cual pertenece la materia de acuerdo con el calendario escolar vigente Esta materia tambien puede ser sujeta a revalidaci6n acreditaci6n 0 convalidaci6n de acuerdo con la normatividad vigente

~------

Enrique Diaz de Le6n No 1144 Colonia Paseos de la Montaila CP 47460 Lagos de Moreno Jalisco Mexico Tel s [52] (474) 742 4314 742 3678 746 4563 Ext 66512 Fax Ext 66527

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3 lJNIVERSIDAD DE GUADALAJARA Centro Universitario de los Lagos Divisi6n de ESlUdios de la Biodiversidad e Innovacion Tecnol6gica Departamento de Ciencias de la Tierra y de la Vida

Participaci6n em clase 105 _I~eas pres~ntsectlci~n de a rtic~los

Total - -----shy 100

Enrique Diaz de Le6n No 1144 Colonia Paseos de la Montana CP 47460 Lagos de Moreno Jalisco Mexico Tels [52] (474) 742 4314 742 3678 7464563 Ext 66512 Fax Ext 66527

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Revision 31 de Enero 2014

GUTIERREZ CORONADO OSCAR SOFIA LOZA CORNEJO MTRO JUAN JOSE ZARAGOZA BARBA

MESA CORNEJO VIVIANA MATILDE MIRANDA BELTRAN MARIA DE LA LUZ SORIA FREGOZO CESAR VILLALAZ URENA MA ISABEL GUTIERREZ CORONADO OSCAR SOFIA LOZA CORNEJO MTRO JUAN JOSE ZARAGOZA BARBA

Revision 31 de Enero 2015 MESA CORNEJO VIVIANA MATILDE MIRANDA BELTRAN MARIA DE LA LUZ SORIA FREGOZO CESAR GUTIERREZ CORONADO OSCAR SOFIA LOZA CORNEJO MTRO JUAN JOSE ZARAGOZA BARBA

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MESA CORNEJO VIVIANA MATILDE MIRANDA BELTRAN MARIA DE LA LUZ SORIA FREGOZO CESAR GUTIERREZ CORONADO OSCAR SOFIA LOZA CORNEJO MTRO JUAN JOSE ZARAGOZA BARBA MESA CORNEJO VIVIANA MATILDE MIRANDA BELTRAN MARIA DE LA LUZ SORIA FREGOZO CESAR GUTIERREZ CORONADO OSCAR SOFIA LOZA CORNEJO MTRO JUAN JOSE ZARAGOZA BARBA MARfA ISABEL PEREZ VEGA

Academia I Ciencias Biologicas

Aval de la Academia Enero 2018 Nombre Cargo Firma

Presidente Secreta rio Vocales

Maria Isabel Perez Vega Presidente ~ Juan Jose Zaragoza Barba Secretario ~J -t -shy---shy

2 PRESENT ACION LA ASIGNATURA DE BIOLOGiA MOLECULAR SE UBICA DENTRO DE LA CARRERA DE INGENIERIA BIOQUIMICA EN EL AREA BAslCA PARTICULAR OBLIGATORIA Y LE SERVIRA AL ESTUDIANTE PARA COMPRENDER LAS BASES MOLECULARES DEL FUNCIONAMIENTO CELULAR LOS MECANISMOS QUE PUEDEN ESTAR AL TERADOS PARA DAR LUGAR A UNA PATOLOGIA Y LAS TECNICAS MOLECULARES QUE LE SERVIRAN EN UN MOMENTO DADO PARA REALIZAR UN ESTUDIO ADECUADO EN EL AREA BIOMEDICA DE LA AGRICUL TURA INDUSTRIAL Y FARMACEUTICA ESTA ~SIGNATURA CONSISTE EN EL ESTUDIO DE LOS PROCESOS CELULARES

Enrique Diaz de Leon No 11 44 Colonia Paseos de la Montana CP 47460 Lagos de Moreno lalisco Mexico Tel s [52] (474) 742 4314 742 3678 746 4563 Ext 66512 Fax Ext 66527

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B SICOS QUE REGULAN LA EXPRESI6N GENICA EN middot LA CUAL EL ALUMNO REAlIZARA UNA INTEGRACI6N DE LOS CONOCIMIENTOS PREVIAMENTE RECIBIDOS EN LA ASIGNATURA DE BIOQulMICA Y TENDRA CONTINUACION CON LOS CONOCIMIENTOS QUE SE ADQUIRIRAN EN LA ASIGNATURA DE GENETICA OBJETIVO GENERAL - -

COMPRENDER LA RELACI6N QUE EXISTE ENTRE ELDNA Y LOS PROCESOS CELULARES PARA ENTENDER LOS MECANISMOS QUE RIGEN EL FUNCIONAMIENTO CELULAR Y LOS FUNDAMENTOS DE LA TECNOLOGIA DEL DNA RECOMBINANTE UTILES EN LA IDENTIFICACI 6N DE LAS DIFERENTES AREAS COMO LAS BIOMEDICAS Y BIOTECNOL6GICAS ENTRE OTRAS MEDIANTE LA COMPRENSI6N DE LOS ELEMENTOS BAs lCOS QUE PARTICIPAN EN EL MANTENIMIENTO DE LA EXPRESI6N Y REGULACI6N GENICA OBJETIVbS ESPECIFICOS 1- CONOCER EL DESARROLLO DE LA BIOLOGIA MOLECULAR LOS CONCEPTOS BAslCOS DE ESTRUCTURA Y FUNCIONAMIENTO CELULAR Y SU RELACI6N CON EL DNA Asl COMO LOS FUNDAMENTOS DE LA EXPRESI6N DE LOS GENES As i MISMO CONOCER LAS BASES MOLECULARES DE LAS PATOLOGIAS HUMANAS QUE MAs IMPACTO TIENEN EN LA POBLACI6N MEXICANA LA AGRICUL TURA LA BIOTECNOLOGIA EN LA INSDUSTRIA Y FARMACEUTICA 2- IDENTIFICAR LOS METODOS MAs COMUNES DE LA BIOLOG[A MOLECULAR SU APlICACI6N E INTERPRETACI6N Y RELACIONAR LAS ALTERACIONES MOLECULARES EN LA MEDICINA EN LAS PLANTAS Y ANIMALES 3- ELEGIR Y MANEJAR LAS MUESTRAS PARA ESTUDIOS MOLECULARES ASI COMO INTERPRETAR LOS RESULTADOS Y APlICARLOS EN El TRATAMIENTO PRAcTICO ADEMAs DE ENTENDER ARTICULOS DE ACTUALIZACION QUE VERSEN SOBRE TEMAS MOlECULARES 4- SE FOMENTARA EN El ALUMNO EL ESPIRITU DE LA INVESTIGACI6N Y LA NECESIDAD DE ACTUAlIZARSE CONSTANTEMENTE EL TRABAJO EN EQU IPO Y LA AUTOCRITICA Asl MISMO LA DISCIPlINA EL ORDEN Y LA ETICA PROFESIONAL ANTE CUAlQUIER ACCI6N RELACIONADA CON LA VIDA HUMANA

CONTENIDO Temas y=Su-b-=-te-m-as-middot-------shy

Introducci6n ala Biologla Molecular

------middotmiddot--shy

Experimentos sobre como se descubri6 la naturaleza aportaciones para el descubrimiento del DNA por cientificos

de los como

acidos nucleicos Chargaff Griffith

Avery MacLeod Beadle Tatum Garrod Watson y Crick Jacob Monod Termin Baltimore Conceptos generales del DNA gen nucleotido cromatina RNA dogma central de la biologla molecular Definir su objeto de estudio dar ejemplos de aplicaciones de la biologfa molecular en

general Organizaci6n del genoma humane

~1 Ac Nuclelcos c9nformaci6n de la dobl=-ehelic-=-eDNA-A~B _ _ ___ _ ---l=Z_ Enrique Dlaz de Le6n No 1144 Colonia Paseos de la Monlafa cP 47460

Lagos de Moreno Jalisco Mexico Tels [52] (474) 742 4314 742 3678 746 4563 Ext 66512 Fax Ext 66527 wwwlagosudgmx

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22 Niveles de organizacion en eucariotes Nucleosoma fibra de 10nm 30nm solenoide bucles cromosomas su estructura y comportamiento durante el cicio celular tipos y funcion 23 Tipos de cromatina Eucromatina heterocromatina constitutiva y facultativa DNA Gen y cromosomas 24 EI cicio celular y sus etapas con enfasis en comportamiento del DNA Cicio de descompactacion duplicacion y preparacion para la division de la cromatina (G1 S Y G2) Y de compactacion (division) 25 Participacion de las ciclinas y kinasas dependientes de ciclinas (cdks) en el cicio asf como de las protefnas p53 y p21 p27 26 Organizacion del genoma Clases de DNA De copia unica y repetitivo asf como la clasificacion de cada una de estas

Replicacion 31 Definicion de Replicacion en celulas procariotes y eucariotes 32 Caracterfsticas de DNA Semiconservativa bidireccional cadena Ifder retrazada 33 Enzimas involucradas en la replicacion primasa helicasa protefnas (RPA) SSB topoisomerasas ligasas y polimerasas I II y III 34 Conceptos de replicon replisoma horquilla formacion de los fragmentos de Okazaki 35 Iniciacioh elongacion y terminacion en procariotes yeucariotes 36 La telomerosa y mecanismo de accion de la telomerasa en replicacion

Expresion de genes (Transcripcion)

41 Definicion funcion clasificacion y estructura 42 Conceptos de Gen eucariote Elementos estructurales (exones intrones sitio de iniciacion de la transcripcion y elementos reguladores de un gen (region promotora y otras regiones reguladoras) 43 Conceptos elementales de expresion productos primarios de expresion (RNA primario RNAm RNAr y RNAt polipeptido 0 proteina) 44 Elementos que conforman el reconocimiento del promotor sitios de inicio regiones consenso RNA polimerasas I II Y III detalle de la region transcrita incluyendo la de terminacion 45 Iniciacion elongacion y terminacion 46 Participacion de los factores transcripcionales 47 Corte y empalme edicion caperuza 5 cola poliA 48 Niveles de regulacion pretranscripcional transcripcional postranscripcional 49 Ejercicios a realizar de como a partir del DNA se obtiene un RNA

Traduccion

51 Definicion 52 Codigo geneticb 53 Iniciacion elongacion y terminacion de Traduccion en eucariotes 54 lVIodificaciones Postraduccibnales del polipeptido que sufre en la celula (tipos de modificaciones ejemplos etc) 55 Proteinas involucradas en el procesamiento de maduracion del polipeptido (Carabinas c~~eroheS entre otras)

Enrique Dfaz de Le6n No 1144 Colonia Paseos de Ia Montaila cP 47460 Lagos de Moreno lalisco Mexico Tels [52] (474)742431474236787464563 Ext 66512 Fax Ext 66527

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Centro Universitario de los Lagos Divisi6n de Estudios de la Biodiversidad e Innovaci6n Tecnol6gica Departamento de Clendas de tn Tierra y de In Vida

Mutaciones y la Reparaci6n en el DNA

61 Tipos de mutaciones por el tipo de dano al DNA clasificaci6n puntuales deleciones inserciones etc 62 Mutagenos qulmicos flsicos y biol6gicos 63 Terat6genos carcin6genos 0 clast6genos 64 Reparaci6n por excisi6n fotoreparaci6n sistemas SOS Rad etc Tecnicas DNA recomblnante

Diagn6stico Molecular Extracci6n de acidos nuclelcos manejo de muestras Enzimas de restricci6n nucleasas polimerasas Desnaturalizaci6n renaturalizaci6n hibridaci6n obtenci6n y utilidad de las sondas Clasificaci6n de las ER descubrimiento nomenclatura Secuencia palindr6micas Tipos de extremos que generan romo cohes iv~

mapas de restricci6n Electroforesis principios basicos Tecnicas de hibridaci6n blot dot slot Northern Southern con ejemplos de aplicaciones hibridaci6n in situ PCR tipos (simple semicuantitativo cuantitativo y tiempo real) aplicaciones PCR e interpretaci6n de estudios Vectores de clonaci6n y expresi6n fundamentos y aplicaciones bibliotecas Secuenciaci6n M icroarreg los

Bases moleculares de las principales patologias en Mexico

81 - Serializaci6n de insulina Mecanismos moleculares en la DM2 82- Biologla molecular en lipid os y obesidad Bases moleculares de hambre-saciedad Diabesidad 83- Bases moleculares de Enfermedades infecciosas (Hepatitis Virales ABC y VIH) 84- Biologla molecular del Cancer (cicio celular CDK ciclinas puntos de restricci6n proto-oncogenes oncogenes genes supresores de tumor (APC p53 pRb BRCA)) 85 Biologla molecular en Diferentes tipos de cancer ( Cancer de colon CA de mama) 86 Farmacologla Molecular Epigenetica

Proyecto del Genoma Humano y la Etica

91- Terapia genica Estrategias moleculares de terapia genica metodos de envlo de genes) 92- Biologla molecular y etica medica DNA y medicina predictiva Consejo Genetico Etica y terapia genica Aspectos legales La Biologla Molecular y la Sociedad 93-Proyecto genoma humano estado actual genomita prote6mica 94- Perspectivas en la agricultura (malz transgenico)

6 TAREAS ACCIONES YO PRAcTICAS DE LABORATORIO Aprendizaje grupal mediante lecturas relacionadas con los te=--m-a-s--------~ Pre untas sobre el tema antes de iniciar la clase ~

Enrique Dlaz de Le6n No 1144 Colonia Paseos de la Montafla CP 47460 Lagos de Moreno Jalisco Mexico Tels [52] (474) 742 4314 742 3678 746 4563 Ext 66512 Fax Ext 66527

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UNIVERSIDAD DE GUADALAJARA Centro Universitario de los Lagos Division de Estudios de la Biodivers idad e Lnnovaci6n Tecnol6gica Depanamento de Ciencias de la Tierra y de In Vida

Ejercicias en clase trabajos de investigaci6n presentaciones entre otros) Realizaci6n de una prcktica demostrativa

7 BIBLIOGRAFiA BAslCA (Preferentemente ediciones recientes 5 arios) BIOLOGIA MoLECULAR E I NGENIERIA GENETICA JOSE LUQUE Y ANGEL HE RRAEZ ED HARCOURT5a EDICI6N MEXICO 2012 BIOLOGiA MOLECULAR FUNDAMENTOS Y APLICACIONES EN LA SALUD ADRIANA MARIA SALAZAR MONTES ANA SOLDEAD SANDOVAL RODRIGUEZ JUAN SOCORRO ARMENDARIZ BORUNDA ED fV1C GRAW HILL2016 BIOLOGiA MOLECULAR DEL GEN JAMES D WATSON TANIA A BAKER STEPHEN P BELL ALEXANDER GANN MICHAEL LEVINE RICHARD LOSICK ED PANAMERICANA 2016

1

4 CELL AND MOLECULAR BIOLOGY 8TH EDITION GERALD KARP JANET IWAM WALLACE MARSHALL WILEY DECEMBER 2015 copy20 16

5 BIOLOGiA CELULAR Y MOLECULAR HARVEY LODISH ARNOLD BERK CHRIS A KAISER MONTY KRIEGER ANTHONY BRETSCHER HIDDE PLOEGH ANGELIKA AMON MATTH EW P SCOTT EDICION 78 PANAMERICANA 2016 bull

8 BIBLIOGRAFiA COMPLEMENTARIA (PREFERENTEMENTE EDICIONES RECIENTES 5 ANOS) _ _ __ 1 LEWINS GENES XI ~--

ESCRITO POR JOCELYN E KREBSBENJAMIN LEWINELLIOTT S GOLDSTEINSTEPHEN T KILPATRICK JONES amp BARTLETT PUBLISHERS 2014

2 MOLECULAR BIOLOGY OF THE CELL SIXTH EDITION ESCRITO POR BRUCE ALBERTS ALEXANDER JOHNSON JULIAN LEWIS DAVID MORGAN MARTIN RAFF KEITH ROBERTS PETER WALTER 2014

GS ~y~~~~~S ~~~nce

9 CRITERIOS Y MECANISMOS PARA LA ACREDITACION Acreditaci6ri Para tener derecho a examen ordinario el alumno debera cumplir con un 80 de las asistencias y para tener derecho a examen extraordinario el alum no debera cumplir con el 60 de las asistencias Asimismo esta nlateria puede ser acreditada par competencias para 10 cual el alumno debera registrar su solicitud en el departamento al cual pertenece la materia de acuerdo con el calendario escolar vigente Esta materia tambien puede ser sujeta a revalidaci6n acreditaci6n 0 convalidaci6n de acuerdo con la normatividad vigente

~------

Enrique Diaz de Le6n No 1144 Colonia Paseos de la Montaila CP 47460 Lagos de Moreno Jalisco Mexico Tel s [52] (474) 742 4314 742 3678 746 4563 Ext 66512 Fax Ext 66527

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3 lJNIVERSIDAD DE GUADALAJARA Centro Universitario de los Lagos Divisi6n de ESlUdios de la Biodiversidad e Innovacion Tecnol6gica Departamento de Ciencias de la Tierra y de la Vida

Participaci6n em clase 105 _I~eas pres~ntsectlci~n de a rtic~los

Total - -----shy 100

Enrique Diaz de Le6n No 1144 Colonia Paseos de la Montana CP 47460 Lagos de Moreno Jalisco Mexico Tels [52] (474) 742 4314 742 3678 7464563 Ext 66512 Fax Ext 66527

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UNIVERSIDAD DE GUADALAJARA Centro Universitario de los Lagos Divisi6n de Estudios de la Bioc1iversidad e Innovaci6n Tecnol6gica Departamento de Cleoclas de 1M T ier ra y de la Vida

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B SICOS QUE REGULAN LA EXPRESI6N GENICA EN middot LA CUAL EL ALUMNO REAlIZARA UNA INTEGRACI6N DE LOS CONOCIMIENTOS PREVIAMENTE RECIBIDOS EN LA ASIGNATURA DE BIOQulMICA Y TENDRA CONTINUACION CON LOS CONOCIMIENTOS QUE SE ADQUIRIRAN EN LA ASIGNATURA DE GENETICA OBJETIVO GENERAL - -

COMPRENDER LA RELACI6N QUE EXISTE ENTRE ELDNA Y LOS PROCESOS CELULARES PARA ENTENDER LOS MECANISMOS QUE RIGEN EL FUNCIONAMIENTO CELULAR Y LOS FUNDAMENTOS DE LA TECNOLOGIA DEL DNA RECOMBINANTE UTILES EN LA IDENTIFICACI 6N DE LAS DIFERENTES AREAS COMO LAS BIOMEDICAS Y BIOTECNOL6GICAS ENTRE OTRAS MEDIANTE LA COMPRENSI6N DE LOS ELEMENTOS BAs lCOS QUE PARTICIPAN EN EL MANTENIMIENTO DE LA EXPRESI6N Y REGULACI6N GENICA OBJETIVbS ESPECIFICOS 1- CONOCER EL DESARROLLO DE LA BIOLOGIA MOLECULAR LOS CONCEPTOS BAslCOS DE ESTRUCTURA Y FUNCIONAMIENTO CELULAR Y SU RELACI6N CON EL DNA Asl COMO LOS FUNDAMENTOS DE LA EXPRESI6N DE LOS GENES As i MISMO CONOCER LAS BASES MOLECULARES DE LAS PATOLOGIAS HUMANAS QUE MAs IMPACTO TIENEN EN LA POBLACI6N MEXICANA LA AGRICUL TURA LA BIOTECNOLOGIA EN LA INSDUSTRIA Y FARMACEUTICA 2- IDENTIFICAR LOS METODOS MAs COMUNES DE LA BIOLOG[A MOLECULAR SU APlICACI6N E INTERPRETACI6N Y RELACIONAR LAS ALTERACIONES MOLECULARES EN LA MEDICINA EN LAS PLANTAS Y ANIMALES 3- ELEGIR Y MANEJAR LAS MUESTRAS PARA ESTUDIOS MOLECULARES ASI COMO INTERPRETAR LOS RESULTADOS Y APlICARLOS EN El TRATAMIENTO PRAcTICO ADEMAs DE ENTENDER ARTICULOS DE ACTUALIZACION QUE VERSEN SOBRE TEMAS MOlECULARES 4- SE FOMENTARA EN El ALUMNO EL ESPIRITU DE LA INVESTIGACI6N Y LA NECESIDAD DE ACTUAlIZARSE CONSTANTEMENTE EL TRABAJO EN EQU IPO Y LA AUTOCRITICA Asl MISMO LA DISCIPlINA EL ORDEN Y LA ETICA PROFESIONAL ANTE CUAlQUIER ACCI6N RELACIONADA CON LA VIDA HUMANA

CONTENIDO Temas y=Su-b-=-te-m-as-middot-------shy

Introducci6n ala Biologla Molecular

------middotmiddot--shy

Experimentos sobre como se descubri6 la naturaleza aportaciones para el descubrimiento del DNA por cientificos

de los como

acidos nucleicos Chargaff Griffith

Avery MacLeod Beadle Tatum Garrod Watson y Crick Jacob Monod Termin Baltimore Conceptos generales del DNA gen nucleotido cromatina RNA dogma central de la biologla molecular Definir su objeto de estudio dar ejemplos de aplicaciones de la biologfa molecular en

general Organizaci6n del genoma humane

~1 Ac Nuclelcos c9nformaci6n de la dobl=-ehelic-=-eDNA-A~B _ _ ___ _ ---l=Z_ Enrique Dlaz de Le6n No 1144 Colonia Paseos de la Monlafa cP 47460

Lagos de Moreno Jalisco Mexico Tels [52] (474) 742 4314 742 3678 746 4563 Ext 66512 Fax Ext 66527 wwwlagosudgmx

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22 Niveles de organizacion en eucariotes Nucleosoma fibra de 10nm 30nm solenoide bucles cromosomas su estructura y comportamiento durante el cicio celular tipos y funcion 23 Tipos de cromatina Eucromatina heterocromatina constitutiva y facultativa DNA Gen y cromosomas 24 EI cicio celular y sus etapas con enfasis en comportamiento del DNA Cicio de descompactacion duplicacion y preparacion para la division de la cromatina (G1 S Y G2) Y de compactacion (division) 25 Participacion de las ciclinas y kinasas dependientes de ciclinas (cdks) en el cicio asf como de las protefnas p53 y p21 p27 26 Organizacion del genoma Clases de DNA De copia unica y repetitivo asf como la clasificacion de cada una de estas

Replicacion 31 Definicion de Replicacion en celulas procariotes y eucariotes 32 Caracterfsticas de DNA Semiconservativa bidireccional cadena Ifder retrazada 33 Enzimas involucradas en la replicacion primasa helicasa protefnas (RPA) SSB topoisomerasas ligasas y polimerasas I II y III 34 Conceptos de replicon replisoma horquilla formacion de los fragmentos de Okazaki 35 Iniciacioh elongacion y terminacion en procariotes yeucariotes 36 La telomerosa y mecanismo de accion de la telomerasa en replicacion

Expresion de genes (Transcripcion)

41 Definicion funcion clasificacion y estructura 42 Conceptos de Gen eucariote Elementos estructurales (exones intrones sitio de iniciacion de la transcripcion y elementos reguladores de un gen (region promotora y otras regiones reguladoras) 43 Conceptos elementales de expresion productos primarios de expresion (RNA primario RNAm RNAr y RNAt polipeptido 0 proteina) 44 Elementos que conforman el reconocimiento del promotor sitios de inicio regiones consenso RNA polimerasas I II Y III detalle de la region transcrita incluyendo la de terminacion 45 Iniciacion elongacion y terminacion 46 Participacion de los factores transcripcionales 47 Corte y empalme edicion caperuza 5 cola poliA 48 Niveles de regulacion pretranscripcional transcripcional postranscripcional 49 Ejercicios a realizar de como a partir del DNA se obtiene un RNA

Traduccion

51 Definicion 52 Codigo geneticb 53 Iniciacion elongacion y terminacion de Traduccion en eucariotes 54 lVIodificaciones Postraduccibnales del polipeptido que sufre en la celula (tipos de modificaciones ejemplos etc) 55 Proteinas involucradas en el procesamiento de maduracion del polipeptido (Carabinas c~~eroheS entre otras)

Enrique Dfaz de Le6n No 1144 Colonia Paseos de Ia Montaila cP 47460 Lagos de Moreno lalisco Mexico Tels [52] (474)742431474236787464563 Ext 66512 Fax Ext 66527

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Centro Universitario de los Lagos Divisi6n de Estudios de la Biodiversidad e Innovaci6n Tecnol6gica Departamento de Clendas de tn Tierra y de In Vida

Mutaciones y la Reparaci6n en el DNA

61 Tipos de mutaciones por el tipo de dano al DNA clasificaci6n puntuales deleciones inserciones etc 62 Mutagenos qulmicos flsicos y biol6gicos 63 Terat6genos carcin6genos 0 clast6genos 64 Reparaci6n por excisi6n fotoreparaci6n sistemas SOS Rad etc Tecnicas DNA recomblnante

Diagn6stico Molecular Extracci6n de acidos nuclelcos manejo de muestras Enzimas de restricci6n nucleasas polimerasas Desnaturalizaci6n renaturalizaci6n hibridaci6n obtenci6n y utilidad de las sondas Clasificaci6n de las ER descubrimiento nomenclatura Secuencia palindr6micas Tipos de extremos que generan romo cohes iv~

mapas de restricci6n Electroforesis principios basicos Tecnicas de hibridaci6n blot dot slot Northern Southern con ejemplos de aplicaciones hibridaci6n in situ PCR tipos (simple semicuantitativo cuantitativo y tiempo real) aplicaciones PCR e interpretaci6n de estudios Vectores de clonaci6n y expresi6n fundamentos y aplicaciones bibliotecas Secuenciaci6n M icroarreg los

Bases moleculares de las principales patologias en Mexico

81 - Serializaci6n de insulina Mecanismos moleculares en la DM2 82- Biologla molecular en lipid os y obesidad Bases moleculares de hambre-saciedad Diabesidad 83- Bases moleculares de Enfermedades infecciosas (Hepatitis Virales ABC y VIH) 84- Biologla molecular del Cancer (cicio celular CDK ciclinas puntos de restricci6n proto-oncogenes oncogenes genes supresores de tumor (APC p53 pRb BRCA)) 85 Biologla molecular en Diferentes tipos de cancer ( Cancer de colon CA de mama) 86 Farmacologla Molecular Epigenetica

Proyecto del Genoma Humano y la Etica

91- Terapia genica Estrategias moleculares de terapia genica metodos de envlo de genes) 92- Biologla molecular y etica medica DNA y medicina predictiva Consejo Genetico Etica y terapia genica Aspectos legales La Biologla Molecular y la Sociedad 93-Proyecto genoma humano estado actual genomita prote6mica 94- Perspectivas en la agricultura (malz transgenico)

6 TAREAS ACCIONES YO PRAcTICAS DE LABORATORIO Aprendizaje grupal mediante lecturas relacionadas con los te=--m-a-s--------~ Pre untas sobre el tema antes de iniciar la clase ~

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Ejercicias en clase trabajos de investigaci6n presentaciones entre otros) Realizaci6n de una prcktica demostrativa

7 BIBLIOGRAFiA BAslCA (Preferentemente ediciones recientes 5 arios) BIOLOGIA MoLECULAR E I NGENIERIA GENETICA JOSE LUQUE Y ANGEL HE RRAEZ ED HARCOURT5a EDICI6N MEXICO 2012 BIOLOGiA MOLECULAR FUNDAMENTOS Y APLICACIONES EN LA SALUD ADRIANA MARIA SALAZAR MONTES ANA SOLDEAD SANDOVAL RODRIGUEZ JUAN SOCORRO ARMENDARIZ BORUNDA ED fV1C GRAW HILL2016 BIOLOGiA MOLECULAR DEL GEN JAMES D WATSON TANIA A BAKER STEPHEN P BELL ALEXANDER GANN MICHAEL LEVINE RICHARD LOSICK ED PANAMERICANA 2016

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5 BIOLOGiA CELULAR Y MOLECULAR HARVEY LODISH ARNOLD BERK CHRIS A KAISER MONTY KRIEGER ANTHONY BRETSCHER HIDDE PLOEGH ANGELIKA AMON MATTH EW P SCOTT EDICION 78 PANAMERICANA 2016 bull

8 BIBLIOGRAFiA COMPLEMENTARIA (PREFERENTEMENTE EDICIONES RECIENTES 5 ANOS) _ _ __ 1 LEWINS GENES XI ~--

ESCRITO POR JOCELYN E KREBSBENJAMIN LEWINELLIOTT S GOLDSTEINSTEPHEN T KILPATRICK JONES amp BARTLETT PUBLISHERS 2014

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9 CRITERIOS Y MECANISMOS PARA LA ACREDITACION Acreditaci6ri Para tener derecho a examen ordinario el alumno debera cumplir con un 80 de las asistencias y para tener derecho a examen extraordinario el alum no debera cumplir con el 60 de las asistencias Asimismo esta nlateria puede ser acreditada par competencias para 10 cual el alumno debera registrar su solicitud en el departamento al cual pertenece la materia de acuerdo con el calendario escolar vigente Esta materia tambien puede ser sujeta a revalidaci6n acreditaci6n 0 convalidaci6n de acuerdo con la normatividad vigente

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Enrique Diaz de Le6n No 1144 Colonia Paseos de la Montaila CP 47460 Lagos de Moreno Jalisco Mexico Tel s [52] (474) 742 4314 742 3678 746 4563 Ext 66512 Fax Ext 66527

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Enrique Diaz de Le6n No 1144 Colonia Paseos de la Montana CP 47460 Lagos de Moreno Jalisco Mexico Tels [52] (474) 742 4314 742 3678 7464563 Ext 66512 Fax Ext 66527

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22 Niveles de organizacion en eucariotes Nucleosoma fibra de 10nm 30nm solenoide bucles cromosomas su estructura y comportamiento durante el cicio celular tipos y funcion 23 Tipos de cromatina Eucromatina heterocromatina constitutiva y facultativa DNA Gen y cromosomas 24 EI cicio celular y sus etapas con enfasis en comportamiento del DNA Cicio de descompactacion duplicacion y preparacion para la division de la cromatina (G1 S Y G2) Y de compactacion (division) 25 Participacion de las ciclinas y kinasas dependientes de ciclinas (cdks) en el cicio asf como de las protefnas p53 y p21 p27 26 Organizacion del genoma Clases de DNA De copia unica y repetitivo asf como la clasificacion de cada una de estas

Replicacion 31 Definicion de Replicacion en celulas procariotes y eucariotes 32 Caracterfsticas de DNA Semiconservativa bidireccional cadena Ifder retrazada 33 Enzimas involucradas en la replicacion primasa helicasa protefnas (RPA) SSB topoisomerasas ligasas y polimerasas I II y III 34 Conceptos de replicon replisoma horquilla formacion de los fragmentos de Okazaki 35 Iniciacioh elongacion y terminacion en procariotes yeucariotes 36 La telomerosa y mecanismo de accion de la telomerasa en replicacion

Expresion de genes (Transcripcion)

41 Definicion funcion clasificacion y estructura 42 Conceptos de Gen eucariote Elementos estructurales (exones intrones sitio de iniciacion de la transcripcion y elementos reguladores de un gen (region promotora y otras regiones reguladoras) 43 Conceptos elementales de expresion productos primarios de expresion (RNA primario RNAm RNAr y RNAt polipeptido 0 proteina) 44 Elementos que conforman el reconocimiento del promotor sitios de inicio regiones consenso RNA polimerasas I II Y III detalle de la region transcrita incluyendo la de terminacion 45 Iniciacion elongacion y terminacion 46 Participacion de los factores transcripcionales 47 Corte y empalme edicion caperuza 5 cola poliA 48 Niveles de regulacion pretranscripcional transcripcional postranscripcional 49 Ejercicios a realizar de como a partir del DNA se obtiene un RNA

Traduccion

51 Definicion 52 Codigo geneticb 53 Iniciacion elongacion y terminacion de Traduccion en eucariotes 54 lVIodificaciones Postraduccibnales del polipeptido que sufre en la celula (tipos de modificaciones ejemplos etc) 55 Proteinas involucradas en el procesamiento de maduracion del polipeptido (Carabinas c~~eroheS entre otras)

Enrique Dfaz de Le6n No 1144 Colonia Paseos de Ia Montaila cP 47460 Lagos de Moreno lalisco Mexico Tels [52] (474)742431474236787464563 Ext 66512 Fax Ext 66527

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Mutaciones y la Reparaci6n en el DNA

61 Tipos de mutaciones por el tipo de dano al DNA clasificaci6n puntuales deleciones inserciones etc 62 Mutagenos qulmicos flsicos y biol6gicos 63 Terat6genos carcin6genos 0 clast6genos 64 Reparaci6n por excisi6n fotoreparaci6n sistemas SOS Rad etc Tecnicas DNA recomblnante

Diagn6stico Molecular Extracci6n de acidos nuclelcos manejo de muestras Enzimas de restricci6n nucleasas polimerasas Desnaturalizaci6n renaturalizaci6n hibridaci6n obtenci6n y utilidad de las sondas Clasificaci6n de las ER descubrimiento nomenclatura Secuencia palindr6micas Tipos de extremos que generan romo cohes iv~

mapas de restricci6n Electroforesis principios basicos Tecnicas de hibridaci6n blot dot slot Northern Southern con ejemplos de aplicaciones hibridaci6n in situ PCR tipos (simple semicuantitativo cuantitativo y tiempo real) aplicaciones PCR e interpretaci6n de estudios Vectores de clonaci6n y expresi6n fundamentos y aplicaciones bibliotecas Secuenciaci6n M icroarreg los

Bases moleculares de las principales patologias en Mexico

81 - Serializaci6n de insulina Mecanismos moleculares en la DM2 82- Biologla molecular en lipid os y obesidad Bases moleculares de hambre-saciedad Diabesidad 83- Bases moleculares de Enfermedades infecciosas (Hepatitis Virales ABC y VIH) 84- Biologla molecular del Cancer (cicio celular CDK ciclinas puntos de restricci6n proto-oncogenes oncogenes genes supresores de tumor (APC p53 pRb BRCA)) 85 Biologla molecular en Diferentes tipos de cancer ( Cancer de colon CA de mama) 86 Farmacologla Molecular Epigenetica

Proyecto del Genoma Humano y la Etica

91- Terapia genica Estrategias moleculares de terapia genica metodos de envlo de genes) 92- Biologla molecular y etica medica DNA y medicina predictiva Consejo Genetico Etica y terapia genica Aspectos legales La Biologla Molecular y la Sociedad 93-Proyecto genoma humano estado actual genomita prote6mica 94- Perspectivas en la agricultura (malz transgenico)

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7 BIBLIOGRAFiA BAslCA (Preferentemente ediciones recientes 5 arios) BIOLOGIA MoLECULAR E I NGENIERIA GENETICA JOSE LUQUE Y ANGEL HE RRAEZ ED HARCOURT5a EDICI6N MEXICO 2012 BIOLOGiA MOLECULAR FUNDAMENTOS Y APLICACIONES EN LA SALUD ADRIANA MARIA SALAZAR MONTES ANA SOLDEAD SANDOVAL RODRIGUEZ JUAN SOCORRO ARMENDARIZ BORUNDA ED fV1C GRAW HILL2016 BIOLOGiA MOLECULAR DEL GEN JAMES D WATSON TANIA A BAKER STEPHEN P BELL ALEXANDER GANN MICHAEL LEVINE RICHARD LOSICK ED PANAMERICANA 2016

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8 BIBLIOGRAFiA COMPLEMENTARIA (PREFERENTEMENTE EDICIONES RECIENTES 5 ANOS) _ _ __ 1 LEWINS GENES XI ~--

ESCRITO POR JOCELYN E KREBSBENJAMIN LEWINELLIOTT S GOLDSTEINSTEPHEN T KILPATRICK JONES amp BARTLETT PUBLISHERS 2014

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9 CRITERIOS Y MECANISMOS PARA LA ACREDITACION Acreditaci6ri Para tener derecho a examen ordinario el alumno debera cumplir con un 80 de las asistencias y para tener derecho a examen extraordinario el alum no debera cumplir con el 60 de las asistencias Asimismo esta nlateria puede ser acreditada par competencias para 10 cual el alumno debera registrar su solicitud en el departamento al cual pertenece la materia de acuerdo con el calendario escolar vigente Esta materia tambien puede ser sujeta a revalidaci6n acreditaci6n 0 convalidaci6n de acuerdo con la normatividad vigente

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Enrique Diaz de Le6n No 1144 Colonia Paseos de la Montaila CP 47460 Lagos de Moreno Jalisco Mexico Tel s [52] (474) 742 4314 742 3678 746 4563 Ext 66512 Fax Ext 66527

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Mutaciones y la Reparaci6n en el DNA

61 Tipos de mutaciones por el tipo de dano al DNA clasificaci6n puntuales deleciones inserciones etc 62 Mutagenos qulmicos flsicos y biol6gicos 63 Terat6genos carcin6genos 0 clast6genos 64 Reparaci6n por excisi6n fotoreparaci6n sistemas SOS Rad etc Tecnicas DNA recomblnante

Diagn6stico Molecular Extracci6n de acidos nuclelcos manejo de muestras Enzimas de restricci6n nucleasas polimerasas Desnaturalizaci6n renaturalizaci6n hibridaci6n obtenci6n y utilidad de las sondas Clasificaci6n de las ER descubrimiento nomenclatura Secuencia palindr6micas Tipos de extremos que generan romo cohes iv~

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Bases moleculares de las principales patologias en Mexico

81 - Serializaci6n de insulina Mecanismos moleculares en la DM2 82- Biologla molecular en lipid os y obesidad Bases moleculares de hambre-saciedad Diabesidad 83- Bases moleculares de Enfermedades infecciosas (Hepatitis Virales ABC y VIH) 84- Biologla molecular del Cancer (cicio celular CDK ciclinas puntos de restricci6n proto-oncogenes oncogenes genes supresores de tumor (APC p53 pRb BRCA)) 85 Biologla molecular en Diferentes tipos de cancer ( Cancer de colon CA de mama) 86 Farmacologla Molecular Epigenetica

Proyecto del Genoma Humano y la Etica

91- Terapia genica Estrategias moleculares de terapia genica metodos de envlo de genes) 92- Biologla molecular y etica medica DNA y medicina predictiva Consejo Genetico Etica y terapia genica Aspectos legales La Biologla Molecular y la Sociedad 93-Proyecto genoma humano estado actual genomita prote6mica 94- Perspectivas en la agricultura (malz transgenico)

6 TAREAS ACCIONES YO PRAcTICAS DE LABORATORIO Aprendizaje grupal mediante lecturas relacionadas con los te=--m-a-s--------~ Pre untas sobre el tema antes de iniciar la clase ~

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7 BIBLIOGRAFiA BAslCA (Preferentemente ediciones recientes 5 arios) BIOLOGIA MoLECULAR E I NGENIERIA GENETICA JOSE LUQUE Y ANGEL HE RRAEZ ED HARCOURT5a EDICI6N MEXICO 2012 BIOLOGiA MOLECULAR FUNDAMENTOS Y APLICACIONES EN LA SALUD ADRIANA MARIA SALAZAR MONTES ANA SOLDEAD SANDOVAL RODRIGUEZ JUAN SOCORRO ARMENDARIZ BORUNDA ED fV1C GRAW HILL2016 BIOLOGiA MOLECULAR DEL GEN JAMES D WATSON TANIA A BAKER STEPHEN P BELL ALEXANDER GANN MICHAEL LEVINE RICHARD LOSICK ED PANAMERICANA 2016

1

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8 BIBLIOGRAFiA COMPLEMENTARIA (PREFERENTEMENTE EDICIONES RECIENTES 5 ANOS) _ _ __ 1 LEWINS GENES XI ~--

ESCRITO POR JOCELYN E KREBSBENJAMIN LEWINELLIOTT S GOLDSTEINSTEPHEN T KILPATRICK JONES amp BARTLETT PUBLISHERS 2014

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9 CRITERIOS Y MECANISMOS PARA LA ACREDITACION Acreditaci6ri Para tener derecho a examen ordinario el alumno debera cumplir con un 80 de las asistencias y para tener derecho a examen extraordinario el alum no debera cumplir con el 60 de las asistencias Asimismo esta nlateria puede ser acreditada par competencias para 10 cual el alumno debera registrar su solicitud en el departamento al cual pertenece la materia de acuerdo con el calendario escolar vigente Esta materia tambien puede ser sujeta a revalidaci6n acreditaci6n 0 convalidaci6n de acuerdo con la normatividad vigente

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Enrique Diaz de Le6n No 1144 Colonia Paseos de la Montaila CP 47460 Lagos de Moreno Jalisco Mexico Tel s [52] (474) 742 4314 742 3678 746 4563 Ext 66512 Fax Ext 66527

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3 lJNIVERSIDAD DE GUADALAJARA Centro Universitario de los Lagos Divisi6n de ESlUdios de la Biodiversidad e Innovacion Tecnol6gica Departamento de Ciencias de la Tierra y de la Vida

Participaci6n em clase 105 _I~eas pres~ntsectlci~n de a rtic~los

Total - -----shy 100

Enrique Diaz de Le6n No 1144 Colonia Paseos de la Montana CP 47460 Lagos de Moreno Jalisco Mexico Tels [52] (474) 742 4314 742 3678 7464563 Ext 66512 Fax Ext 66527

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UNIVERSIDAD DE GUADALAJARA Centro Universitario de los Lagos Division de Estudios de la Biodivers idad e Lnnovaci6n Tecnol6gica Depanamento de Ciencias de la Tierra y de In Vida

Ejercicias en clase trabajos de investigaci6n presentaciones entre otros) Realizaci6n de una prcktica demostrativa

7 BIBLIOGRAFiA BAslCA (Preferentemente ediciones recientes 5 arios) BIOLOGIA MoLECULAR E I NGENIERIA GENETICA JOSE LUQUE Y ANGEL HE RRAEZ ED HARCOURT5a EDICI6N MEXICO 2012 BIOLOGiA MOLECULAR FUNDAMENTOS Y APLICACIONES EN LA SALUD ADRIANA MARIA SALAZAR MONTES ANA SOLDEAD SANDOVAL RODRIGUEZ JUAN SOCORRO ARMENDARIZ BORUNDA ED fV1C GRAW HILL2016 BIOLOGiA MOLECULAR DEL GEN JAMES D WATSON TANIA A BAKER STEPHEN P BELL ALEXANDER GANN MICHAEL LEVINE RICHARD LOSICK ED PANAMERICANA 2016

1

4 CELL AND MOLECULAR BIOLOGY 8TH EDITION GERALD KARP JANET IWAM WALLACE MARSHALL WILEY DECEMBER 2015 copy20 16

5 BIOLOGiA CELULAR Y MOLECULAR HARVEY LODISH ARNOLD BERK CHRIS A KAISER MONTY KRIEGER ANTHONY BRETSCHER HIDDE PLOEGH ANGELIKA AMON MATTH EW P SCOTT EDICION 78 PANAMERICANA 2016 bull

8 BIBLIOGRAFiA COMPLEMENTARIA (PREFERENTEMENTE EDICIONES RECIENTES 5 ANOS) _ _ __ 1 LEWINS GENES XI ~--

ESCRITO POR JOCELYN E KREBSBENJAMIN LEWINELLIOTT S GOLDSTEINSTEPHEN T KILPATRICK JONES amp BARTLETT PUBLISHERS 2014

2 MOLECULAR BIOLOGY OF THE CELL SIXTH EDITION ESCRITO POR BRUCE ALBERTS ALEXANDER JOHNSON JULIAN LEWIS DAVID MORGAN MARTIN RAFF KEITH ROBERTS PETER WALTER 2014

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9 CRITERIOS Y MECANISMOS PARA LA ACREDITACION Acreditaci6ri Para tener derecho a examen ordinario el alumno debera cumplir con un 80 de las asistencias y para tener derecho a examen extraordinario el alum no debera cumplir con el 60 de las asistencias Asimismo esta nlateria puede ser acreditada par competencias para 10 cual el alumno debera registrar su solicitud en el departamento al cual pertenece la materia de acuerdo con el calendario escolar vigente Esta materia tambien puede ser sujeta a revalidaci6n acreditaci6n 0 convalidaci6n de acuerdo con la normatividad vigente

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Enrique Diaz de Le6n No 1144 Colonia Paseos de la Montaila CP 47460 Lagos de Moreno Jalisco Mexico Tel s [52] (474) 742 4314 742 3678 746 4563 Ext 66512 Fax Ext 66527

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Total - -----shy 100

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