“Año de la Diversificación Productiva y del Fortalecimiento de la Educación”

INFORME DE INFORMÁTICA MÉDICA:

PUBMED

Alumna: Córdova Castro, Catherine Vanessa

Docente: Ing. Jorge Carreño Escobedo

Grupo: 08 T

Fecha: Jueves 4 de junio de 2015

Lima - Perú

CONTENIDO

1. Introducción

2. ¿Por qué cree Usted que es importante PubMed, para los estudiantes de Medicina Humana?

3. ¿Qué tipo de búsquedas utiliza PubMed?

4. ¿Cómo es la búsqueda combinada?

5. ¿Qué es el truncado?, de un ejemplo.

6. ¿Para qué se utiliza Limits (Límites) en PubMed?

7. Bibliografía

INTRODUCCIÓN

El sistema de búsqueda PubMed es un proyecto desarrollado por la National Center for Biotechnology Information (NCBI) en la National Library of Medicine (NLM). Permite el acceso a bases de datos bibliográficas compiladas por la NLM: MEDLINE, PreMEDLINE, Genbak y Complete Genoma. Medline contiene subbases: AIDS, Bioethics,

Cancer, Complementary Medicine, Core Clinical Journals, Dental Journals, Nursing Journals, PubMed Central que podemos consultarlas individualmente pulsando la opción Limits y seleccionar Subsets.

MEDLINE es la base de datos más importante de la NLM abarcando los campos de la medicina, oncología, enfermería, odontología, veterinaria, salud pública y ciencias preclínicas. Actualmente contiene más de 15 millones de referencias bibliográficas de artículos de revistas desde el año 1960, provenientes de 4800 revistas internacionales de ciencias de la salud (datos 2006).

En 1996 se creó PREMEDLINE, una base de datos que suministra datos básicos y resúmenes antes de que se añadan todos los campos en los registros completos y sean incorporados a Medline. Diariamente se introducen nuevos registros en Premedline. Cada registro recibe un número de identificación PMID. Una vez que se les incorpore los términos MeSH y otros datos de la indización, se suprimen de Premedline y se incorporan en Medline.

DESARROLLO

¿Por qué cree Usted que es importante PubMed, para los estudiantes de Medicina Humana?

PubMed es muy importante para los estudiantes de Medicina Humana ya que es un sistema de búsqueda desarrollado y mantenido por el National Center for Biotechnology Information (NCBI) de la National Library of Medicine (NLM); y Medline es posiblemente una de las bases de datos de bibliografía médica más importante y más utilizada en el mundo. Con esto los estudiantes podrán mantenerse actualizados en cuanto a publicaciones médicas y podrán contar con una gran cantidad de recursos para desarrollar los distintos trabajos

que nos solicitan en los diversos cursos que llevamos a lo largo de nuestra carrera.

PubMed nos ofrece:

Diversas modalidades de búsqueda. Acceso a los descriptores MeSH. La posibilidad de almacenar, crear alertas bibliográficas, etc.  a

través de la aplicación My NCBI. Enlaces al texto completo de artículos. Acceso a otros sistemas de búsqueda de la NLM como:

ClinicalTrials.gov, MedlinePlus, NIH Clinical Alerts and Advisories, PubMed Central.

PubMed proporciona acceso gratuito a:

Medline: Base de datos bibliográfica más importante de la NLM. Su cobertura abarca desde 1966 hasta el momento actual.

OldMedline: Contiene referencias bibliográficas desde 1949 a 1965.

PreMedline: Referencias bibliográficas de artículos publicados en proceso de ser indizados en Medline.

Referencias bibliográficas proporcionadas por lo editores. Artículos disponibles a texto completo en PubMed Central.

¿Qué tipo de búsquedas utiliza PubMed?

En la pantalla de inicio podemos buscar por términos, frases, autores etc. 

o Búsqueda por autor/es Para buscar por autor  podemos introducir el apellido seguido de la inicial o iniciales del nombre. No se utilizan signos de puntuación.

o Búsqueda por frase En PubMed podemos buscar frases. Para ello debemos introducir el término entre comillas  “  ”

o Búsqueda por campos Para realizar una búsqueda por un campo específico  es necesario introducir el término  directamente en la caja de búsqueda, especificando entre corchetes la etiqueta del campo correspondiente. Cada campo de un registro bibliográfico se identifica mediante una etiqueta de dos o más letras encerrada entre corchetes.

Los límites (Limits), permiten acotar la búsqueda por tipo de documentos, idiomas, edad, etc. La búsqueda en PubMed

podemos limitarla a artículos que se encuentren a texto completo, a determinados grupos de edad, sexo, estudios en humanos o animales, idiomas, tipos de publicación, periodos cronológicos determinados y otros parámetros.

La opción de índices (Index) nos permite acceder a una lista de términos dentro de un campo específico, visualiza los términos presentes en los diferentes índices: descriptor (MeSH), autor, palabra del título o resumen, revista etc. y seleccionar los términos para elaborar una estrategia de búsqueda utilizando los operadores booleanos o lógicos: AND, OR, NOT.

También podemos optar por consultar directamente el descriptor pulsando en el menú MeSH Database¸ consultar una revista en Journal Database. 

Resulta de gran utilidad para las búsquedas de información clínica el filtro metodológico CLINICAL QUERIES, elaborado con una metodología de MBE, poniendo el énfasis en la terapia, diagnóstico, etiología o pronóstico o localizar revisiones sistemáticas o meta-análisis.

¿Cómo es la búsqueda combinada?Búsqueda combinada utilizando operadores booleanos. Nos van a permitir combinar (AND), sumar (OR) o excluir (NOT) términos. • Intersección (AND) - recupera solo aquellas citas que contengan los términos. Ej.: "rheumatic diseases" AND pregnancy • Unión (OR) - recupera citas que contengan los dos términos, o al menos uno de ellos Ej.: fever OR hyperthermia • Exclusión (NOT) - excluye las citas que contengan el término Ej.: Hypertension NOT pulmonary Importante: Los operadores booleanos AND, OR, NOT deben escribirse en mayúscula

Si queremos buscar artículos  de Baker DC que traten sobre el uso de corticoides o antihistamínicos en el tratamiento de la rinitis vasomotora. Formularíamos la siguiente estrategia de búsqueda:

rhinitis, vasomotor[MeSH] AND (adrenal cortex hormones[MeSH] OR histamine h1 antagonists[MeSH]) AND

Baker DC[au]

Si queremos buscar citas que traten de la influencia del calor o la humedad en la rinitis alérgica estacional y que hayan sido

publicadas en 2008. Formularíamos la siguiente estrategia de búsqueda: rhinitis, allergic, seasonal [mh] AND (heat OR humidity) AND

2008 [dp]

Si queremos buscar revisiones de artículos en inglés o en español que traten sobre el tratamiento de la obesidad infantil formularíamos la siguiente estrategia de búsqueda:

obesity/therapy[Mesh Terms] AND (english[la] OR Spanish[la]) AND review[pt] AND child[MeSH Terms]

¿Qué es el truncado?, de un ejemplo.

El truncado permite recuperar todos los términos que poseen la misma raíz.  Si colocamos un asterisco (*) al final de un término de búsqueda, PubMed busca en todas aquellas palabras que tengan la misma cadena de letras como raíz.  Así por ejemplo, si escribimos neurol* se incluye en la búsqueda los términos neurology; neuroleptic; neurolekin; neurologic; etc. 

PubMed usa las primeras variantes del término truncado. No localiza frases, por ejemplo "infection*" incluye "infections",  pero no "infection control."  En “Details” podemos ver las variaciones utilizadas en el término truncado.Importante: El truncado anula el mapeo automático de términos.

¿Para qué se utiliza Limits (Límites) en PubMed?

Para limitar la búsqueda hay seleccionar las variables que se correspondan con nuestra necesidad de información. Es posible limitar por fechas, tipo de artículo, especie, idioma, género, grupos de edad, opciones del texto completo, o límites por campos.

Limitar por campos: Puede limitarse la búsqueda de un término a un campo específico. Si desplegamos el menú, aparece un listado de todas las opciones. Ejemplo: si seleccionamos All Fields ("todos los campos"), localiza el término de búsqueda en cualquier parte del registro; Author name, en el campo autor; Journal name, en el de la revista, etc., mientras que si seleccionamos MeSH Terms localizará exclusivamente términos MeSH en ese campo.

Limitar por fechas: es posible limitar por varias fechas o incluso especificar un rango específico. PubMed contiene citas desde 1966 hasta la actualidad. Entrez Date es la fecha en que la cita fue incorporada a PubMed. Usar Entrez Date para limitar la búsqueda desde 30 días a 10 años. Publication Date es la fecha en que el artículo fue publicado. Usar Publication Date según un rango de fechas que deben ser escritas de la siguiente forma: AAAA/MM/DD; el mes y día son opcionales, ej.: 1999/06/18 ó 1999/11.

Limitar por tipos de artículo: Puede limitarse la búsqueda según el tipo de estudio publicado (ej. Clinical Trials or Review articles). El menú desplegado contiene un listado: Ensayo Clínico; Editorial; Carta; Meta-análisis; Las guías de práctica; Ensayo controlado aleatorio; Revisión

Limitar por Idioma: Para seleccionar un idioma, hay que pulsar en languages" y seleccionar todos ("All") o alguno de estos: English; French; German; Italian; Japanese; Russian; Spanish,etc.

Limitar por Edad: Para seleccionar un grupo de edad específico en los estudios humanos, selecciónelo desde el menú desplegable: All Infant: nacimiento-23 meses; All Child: 0-18 años; All Adult:19+ años; Newborn: nacimiento-1mes ; Infant: 1-

23 meses; Preschool Child: 2-5 años; Child: 6-12 años; Adolescent: 13-18 años; Adult:19-44 años; Middle Aged:45-64 años; Aged:65+ años; 80 and over: 80+ años.

Limitar a humano / animal o limitar por sexo: Es una opción útil para seleccionar el grupo o el sexo al que se desea aplicar el estudio. Si la opción no se activa, el sistema no aplicará el límite para este criterio.

 Limitar por sexo: Puede limitar los estudios humanos por sexo (mujer o varón). Si no se selecciona, no se establecerá límite por géneros.

Limitar por Subsets: Este menú permite limitar la búsqueda de acuerdo con alguno de los subconjuntos o subcategorías contenidos en PubMed. Para utilizarlo hay que pulsar el menú desplegable y ver las opciones disponibles. Opciones disponibles: Aids, Bioethics, Cancer, Complementary Medicine, PubRef, Core Clinical Journals, Dental journals, History of Medicine, MEDLINE, Nursing journals, OldMedline, PubMed Central, Space Life Sciences, Toxicology.

Limitar con citas con abstracts/resúmenes o textos completos: Para la búsqueda exclusiva de artículos que contengan resúmenes desde Limits deberá seleccionar la opción “Abstracts”, “Link to free full text”.

Limitar por Journal Groups (Revistas): Los siguientes grupos de revistas están disponibles desde el menú desplegable: Core clinical journals: Es una selección de 120 títulos de

revistas del  desaparecido “Abridge Index Medicus”. Usar este “Subset” supone limitar la búsqueda a este grupo reducido de revistas que son relevantes para la práctica clínica.

Dental journals: Limitará la búsqueda a cerca de 420 títulos de revistas que integran el “Index to Dental Literature”.

Nursing journals: Limitará la búsqueda a cerca de 330 títulos de revistas que forman parte del “International Nursing Index”.

BIBLIOGRAFÍA

http://www.fisterra.com/guias-clinicas/mas- sobre-guias/buscar-pubmed/#que

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez

https://nnlm.gov/training/resources/ pubmedguia.pdf

http://www.aepap.org/pdf/pubmed.pdf

http://www.iacs.aragon.es/econocimiento/ documentos/biblioteca/Guia_Pubmed_espanol.pdf

http://www.atheneum.doyma.es/Socios/ sala_l/lec07pub.htm