La taxonoma es la ciencia de la clasificacin biolgicaLa clasificacin, que es la ordenacin de los seres vivos en grupos o taxones en funcin de semejanzas o parentesco evolutivo.Comprende tres partes independientes pero relacionadas:La nomenclatura, que se ocupa de asignar nombres a los grupostaxonmicos de acuerdo con normas establecidas.La identificacin, es el proceso para determinar que un aislamiento particular pertenece a un taxn reconocido. (es el lado prctico de la taxonoma)TAXONOMA BACTERIANA

Al preparar un sistema de clasificacin, se ubican todos los microorganismos en grupos homogneos, que a su vez pertenecen a otro grupo ms extenso siguiendo una estructura jerrquica sin superposiciones. Una categora de cualquier rango une grupos de nivel inferior en funcin de propiedades comunes. En la taxonoma bacteriana los niveles o rangos utilizados son los siguientes (en orden ascendente):

ESPECIE GNERO FAMILIA ORDEN CLASE REINO DOMINIOEl grupo taxonmico bsico es la ESPECIE

Definicin de especieESPECIE es un grupo de poblaciones naturales que se reproducen entre si y que estn aisladas de otros grupos desde el punto de vista de la reproduccin.ESPECIE BACTERIANA es una coleccin de cepas que comparten numerosas propiedades estables y que difieren de forma significativa de otros grupos de cepas.Una CEPA es una poblacin de microorganismos que desciende de un nico organismo o de un aislamiento en cultivo puro.Cada especie se asigna a un GNERO, el siguiente rango de la jerarqua taxonmica.Un GNERO es un grupo bien definido de una o ms especies que est claramente separado de otros gneros.Para los taxnomos que trabajan con organismos superiores

Para los microbilogos

NOMENCLATURA Los microbilogos asignan nombre a los microorganismos de acuerdo con el SISTEMA BINOMIAL del botnico sueco Carl Von Linneo. El nombre latinizado y en cursiva consta de dos partes:El primer nombre, escrito con mayscula, es el nombre genrico.El segundo nombre, en minscula, es el epteto de la especie. Escherichia coli A menudo se abrevia el nombre genrico con una letra maysculaE. coli

ESTRUCTURACIN JERRQUICA EN TAXONOMA

RangoNombre taxonmicoDominioPhylum o ReinoClaseOrdenFamiliaGneroEspecieBacteriaProteobacteria

-ProteobacteriaEnterobacterialesEnterobacteriaceaeShigellaS. dysenteriae

SISTEMAS DE CLASIFICACINLas caractersticas taxonmicas de los microorganismos se utilizan para formar un sistema de clasificacin. Existen dos formas generales para elaborar un sistema de clasificacin:SISTEMA FENTICO Los microorganismos se agrupan en funcin de semejanzas en sus caractersticas fenotpicas.Los microorganismos que comparten muchas caractersticas forman un nico taxn.

SISTEMA FILOGENTICOLos microorganismos se agrupan en funcin de probables relaciones evolutivas.Es difcil de realizar para las bacterias debido a la falta de registros fsiles.

PRINCIPALES CARACTERSTICAS APLICADAS EN TAXONOMA BACTERIANACARACTERSTICASCLSICASMORFOLGICASForma celularTamao de las clulasMorfologa de las coloniasCaractersticas ultraestructuralesTincinCilios y flagelosMecanismo de movilidadForma y localizacin de endoesporasInclusiones celularescolorFISIOLOGICAS Y METABLICASFuentes de C y NComponentes de la pared celularFuentes de energaProductos de fermentacinTipo nutricionalTemperatura de crecimientoLuminiscenciaMecanismo de conversin de energaMovilidadTolerancia osmticaRelaciones con el oxgenopH ptimo de crecimientoPigmentos fotosintticosNecesidad y tolerancia a la salMetabolitos secundariosSensibilidad a antibiticosECOLGICASCiclo vitalRelaciones simbiticasPatogenicidadPreferencia de hbitatNecesidad de temperatura; pH;Necesidad de oxgenoNecesidad de concentracin osmticaGENTICASPosibilidad de recombinacin porConjugacin oTransformacin

Plsmidos

Identificacin de una bacteria entrica mediante tcnicas microbiolgicas clsicas utilizando exclusivamente criterios fenotpicos.La mayora de los pasos a seguir requieren que el microorganismo crezca en cultivo puro.

PRINCIPALES CARACTERSTICAS APLICADAS EN TAXONOMA BACTERIANACARACTERSTICASMOLECULARESCOMPARACIN DE PROTENASHIBRIDACIN DE CIDOS NUCLEICOSSECUENCIACIN DE CIDOS NUCLEICOSCOMPOSICIN DE CIDOS NUCLICOS(CONTENIDO EN G+C)

Estructura secundaria del ARNr 16/18 S de los tres Dominios Los puntos rojos sealan posiciones en las que arqueas y bacterias suelen diferirBacteriaArchaeaEucarya

rbol filogentico de todos los seres vivos

Resumen de las principales caractersticas diferenciales entre Bacteria, Archaea y Eukarya

CaractersticaBacteriaArchaeaEukarya- Estructura celular procaritica- ADN circular- Histonas- Ncleo rodeado de membranaSSNoAusenteSSSAusenteNoNoSPresente- Pared celular de peptidoglicano- Lpidos de membrana- Ribosomas- IntronesSEnlaces ster70SNoNoEnlaces ter70SNoNoEnlaces ster80SS- Plsmidos- Sensibilidad de ribosomas a la toxina diftrica- Sensibilidad a cloranfenicol, estreptomicina y kanamicinaSiNo

SSS

NoRaroS

No- Metanognesis- Reduccin desasimilativa de sulfatos y frrico- Nitrificacin- DesnitrificacinNoS

SSSS

NoSNoNo

NoNo- Fijacin de nitrgeno- Fotosntesis oxignica- Quimiolitotrofa- Vesculas de gas- Sintesis de grnulos de reserva de carbono (-hidroxialcanoatos)- Crecimiento por encima de 80SSSSS

SSNoSSS

SNoS (en cloroplastos)NoNoNo

No

Arbol filogentico de los principales linajes de Bacteria basado en la comparacin de secuencias de ARNr 16S

Figure: 11-17

Caption:Example of methods that would be used for identification of a newly isolated enteric bacterium, using classic microbiological methods (the example given shows the procedures that would be used for identifying Escherichia coli). Note that most of the analyses here require that the organisms be grown in pure culture and that solely phenotypic criteria be used in the identification. A description of biochemical tests is presented in Chapter 24 (Section 24.2, Table 24.3, and Figure 24.7).

Figure: 11-13

Caption:Universal phylogenetic tree as determined from comparative ribosomal RNA sequencing. Only a few key organisms or lineages are shown in each domain. For detailed domain trees refer to Figures 12.1, 13.1, and 14.11. Of the three domains, two (Bacteria and Archaea) contain only prokaryotic representatives. The location highlighted in red is the hypothetical root of the tree, which represents the position of the universal ancestor of all cells.