Microsatelites
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23/09/2014
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MICROSATELITES
Blgo. F. Javier Alvarez A.
Septiembre – 2014.
Secuencias de ADN
repetidas.
Se encuentran tanto en organismos procariotas como eucariotas.
Zonas de alta inestabilidad genómica (mutaciones dinámicas).
Estas repeticiones pueden consistir desde múltiples copias de secuencias sencillas de pocos nucleótidos repetidas en tándem a secuencias largas dispersas por todo el genoma.
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Microsatélites.
Conocidos también como SSR (Simple
Secuence Repeats) o STR (Simple
Tandem Repeat).
Repeticiones en tandem de secuencias
cortas de 1 a 5 *(10) pb. Con una
longitud no mayor a los 150 pb
Ejemplo de Microsatélite:
Otros: (GA)14, (GAT)10, (CATC)8, etc.
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¿Cómo se estudian los
microsatélites?
Se basa en la amplificación por PCR de las zonas repetitivas.
Debido a su alta inestabilidad se pueden hacer estudios de diversidad genética intra e inter especies.
Debido a la diferencia en la longitud de estos SSR.
¿Cómo se estudian los
microsatélites?
Se pueden utilizar geles de policrilamida
o agarosa.
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Origen del polimorfismo.
Aplicaciones.
Estudios de diversidad genética.
Genética forense.
Análisis de paternidad.
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Ventajas de los SSR.
Herencia codominante.
Abundantes en el genoma.
Alta diversidad alélica.
Fácil de realizar (PCR).
Reproducible.
Desventajas de los SSR.
Se necesita ADN de alta calidad.
Debe tenerse un previo conocimiento del
genoma a estudiar.
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Mejoramiento Genético
Vegetal.
Los microsatélites son usados ampliamente en MG asistido por marcadores.
Caracterización molecular de bancos de germoplasmas.
Búsqueda de fenotipos deseados, etc.
Lectura de un gel
Policrilamida para SSR.
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Análisis de Paternidad.
Basados en el uso de Microsatélites.
Se excluye o incluye al supuesto padre
según análisis del índice de paternidad.
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Reporte de Análisis de Paternidad
Reporte de Análisis de Paternidad
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Muchas gracias.