Microsatelites

9
23/09/2014 1 MICROSATELITES Blgo. F. Javier Alvarez A. Septiembre 2014. Secuencias de ADN repetidas. Se encuentran tanto en organismos procariotas como eucariotas. Zonas de alta inestabilidad genómica (mutaciones dinámicas). Estas repeticiones pueden consistir desde múltiples copias de secuencias sencillas de pocos nucleótidos repetidas en tándem a secuencias largas dispersas por todo el genoma.

description

en pcr

Transcript of Microsatelites

Page 1: Microsatelites

23/09/2014

1

MICROSATELITES

Blgo. F. Javier Alvarez A.

Septiembre – 2014.

Secuencias de ADN

repetidas.

Se encuentran tanto en organismos procariotas como eucariotas.

Zonas de alta inestabilidad genómica (mutaciones dinámicas).

Estas repeticiones pueden consistir desde múltiples copias de secuencias sencillas de pocos nucleótidos repetidas en tándem a secuencias largas dispersas por todo el genoma.

Page 2: Microsatelites

23/09/2014

2

Microsatélites.

Conocidos también como SSR (Simple

Secuence Repeats) o STR (Simple

Tandem Repeat).

Repeticiones en tandem de secuencias

cortas de 1 a 5 *(10) pb. Con una

longitud no mayor a los 150 pb

Ejemplo de Microsatélite:

Otros: (GA)14, (GAT)10, (CATC)8, etc.

Page 3: Microsatelites

23/09/2014

3

¿Cómo se estudian los

microsatélites?

Se basa en la amplificación por PCR de las zonas repetitivas.

Debido a su alta inestabilidad se pueden hacer estudios de diversidad genética intra e inter especies.

Debido a la diferencia en la longitud de estos SSR.

¿Cómo se estudian los

microsatélites?

Se pueden utilizar geles de policrilamida

o agarosa.

Page 4: Microsatelites

23/09/2014

4

Origen del polimorfismo.

Aplicaciones.

Estudios de diversidad genética.

Genética forense.

Análisis de paternidad.

Page 5: Microsatelites

23/09/2014

5

Ventajas de los SSR.

Herencia codominante.

Abundantes en el genoma.

Alta diversidad alélica.

Fácil de realizar (PCR).

Reproducible.

Desventajas de los SSR.

Se necesita ADN de alta calidad.

Debe tenerse un previo conocimiento del

genoma a estudiar.

Page 6: Microsatelites

23/09/2014

6

Mejoramiento Genético

Vegetal.

Los microsatélites son usados ampliamente en MG asistido por marcadores.

Caracterización molecular de bancos de germoplasmas.

Búsqueda de fenotipos deseados, etc.

Lectura de un gel

Policrilamida para SSR.

Page 7: Microsatelites

23/09/2014

7

Análisis de Paternidad.

Basados en el uso de Microsatélites.

Se excluye o incluye al supuesto padre

según análisis del índice de paternidad.

Page 8: Microsatelites

23/09/2014

8

Reporte de Análisis de Paternidad

Reporte de Análisis de Paternidad

Page 9: Microsatelites

23/09/2014

9

Muchas gracias.