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Neumonía: diagnóstico microbiológico Mariana Fernandez Pittol Hospital Clínic de Barcelona

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Neumonía: diagnóstico

microbiológicoMariana Fernandez Pittol

Hospital Clínic de Barcelona

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Neumonía: diagnóstico microbiológico

Neumonía adquirida en la comunidad

Neumonía nosocomial en el paciente no ventilado

Neumonía en el paciente ventilado

Neumonía en el paciente inmunodeprimido

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Neumonía adquirida en la comunidad

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• Neumonía adquirida en la comunidad (NAC): causa importante demorbimortalidad, con una incidencia de 2-10 casos por 1.000habitantes/año, cifra que se eleva a 25-35 casos por 1.000 en laspersonas mayores de 70 años.

• Etiología:

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Diagnóstico

Hemocultivo

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Análisis del esputo:

Tinción de Gram: calidad de la muestra

Buena calidad Mala calidad

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Tinción de Zhiehl-Neelsen:

Tinción de auramina rodamida

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M.tuberculosis

Gonzalez et al., 1998

M.xenopi

M.kansasii

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Cultivo:• Medios aerobios + medio de Legionella

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S.pneumoniae

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Cultivo de Micobacterias

Medios sólidos: Lowenstein-Jensen

Medios líquidos

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Orina:

Antígeno neumocócico

Antígeno de Legionella

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Técnicas moleculares:

Filmarray Liat Flow Xpert MTB/RIF

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Técnicas serológicas:

ELISA

Mycoplasma, Chlamydia y Coxiella. (IFD)

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Neumonía nosocomial en el paciente no ventilado y ventilado

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Etiología

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19

Lavado broncoalveolar

Medios aerobios

Tinción de Gram

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Staphylococcus.aureus

Aglutinación +

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Pseudomonas aeruginosa

Tinción de Gram

Crecimiento en placa de agar sangre

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Enterobacterias multiresistentes

Antibiograma Disco placaMicrodilución

ICT

Técnicas moleculares

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Microarrays

Mayor número de dianas que las PCRs.

Kits comerciales

Verigene: Gram negative blood culture test. IMP, KPC, NDM, OXA, VIM.

BioFire: Blood Culture ID PannelKPC

Check-Points

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Neumonía en el paciente inmunodeprimido

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Etiología

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Estudio de virus en inmunodeprimido

Detección de VHS

VVZ

VEB

CMV

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Aspergillus spp.

Tinción de blanco de calcofluor

Tinción con azul de lactophenol

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Cultivo

Sabouraud miel Agar patata

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MALDI-TOF MS: protocolo de procesamiento de la muestra

Etanol absoluto + agua destilada

AF 70%

Acetonitrilo 100%

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Detección antigénica de galactomanano

Sangre

Lavado broncoalveolar

PCR Aspergillus

Aspergillus sppAspergillus terreus

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Pneumocystis

Técnicas moleculares

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Otras técnicas moleculares

Región ITS

β–tubulina

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Microbiota pulmonar Filos Bacteroidetes (Prevotella y Bacteroides), Firmicutes(Veillonella, Streptococcus y Staphylococcus), y Proteobacteria(Pseudomonas, Haemophilus, Moraxella, Neisseria yAcinetobacter)

Paciente EPOC

Metagenómica

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WGS ID patógenos, detecta genes de resistencia, nuevos mecanismos de resistencia

Otras contribuciones a la resistencia: mutaciones en porinas

Precio elevado.

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Gracias!!!