Presentación - Instituto Nacional de Medicina … Presentación La Medicina Genómica avanza a...

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PresentaciónPresentación

La Medicina Genómica avanza a nivel global y México no es la excepción. A diez años de la publi-cación de la primera secuencia del genoma humano y en el marco de la apertura de la sede perma-nente del Instituto Nacional de Medicina Genómica (INMEGEN), celebramos el Encuentro Internacional de Medicina Genómica: Retos en Investigación e Im-pacto social.

Este evento científico contará con la participación de especialistas nacionales e internacionales de excelen-cia académica en genómica, en el que se abordarán diversos temas de actualidad como la genómica po-blacional, la epigenética, la proteómica médica, la genómica de enfermedades autoinmunes, diabetes mellitus, adicciones y enfermedad mental, la genó-mica funcional de la oncogénesis, la educación y la medicina personalizada, la innovación en ciencias de la vida y se revisarán los retos éticos y legales a los que nos enfrenta esta nueva disciplina.

Dr. Xavier Soberón MaineroPresidente del Encuentro

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Encuentro Internacional de Medicina Genómica Retos en Investigación e Impacto Social

Presidente

Comité Organizador Junta de Gobierno

Patronato

Directorio

CoordinadorDr. Santiago March Mifsut•

Act. Cuauhtémoc Valdés Olmedo•Ma. del Carmen Álvarez-Buylla Roces•Lic. Juan Manuel García Rocha•Lic. Paulino Jaime Arzate•Lic. Alejandro López Franco•Mtra. Nancy Álvarez Vázquez•Ing. Carlos Dávila García•Ing. Francisco Vega Torres•Ing. Rodrigo García Herrera•Mtro. Alejandro Rodríguez Torres•Lic. José Bedolla Castro•Lic. Antonio Torres Macías•Lic. Berenice González Miranda•José Luis Ávila Moreno•Ing. Juan Carlos Macías Romero•Lic. Angélica Martell Rodríguez•Lic. Rumi Tsumura García•Tec. Francisco Machargo Oviedo•Tec. Gloria Arévalo Hernández•Lic. Beatriz Romero Ángeles•Mtra. Elia Rodríguez Barraza•Lic Yadira Padilla Monterrubio•Lic. Diana María Rodríguez Arzate•Lic. Gabriela Burgoa Gutiérrez•Jorge Enrique Blando Hernández•Mario Moreno Barranco•Sara Echánove Ortiz•

Comité CientíficoDra. Alessandra Carnevale Cantoni•Dr. Rubén Lisker • YourkowitzkyDr. Fabio Salamanca Gómez•Dr. Jorge Meléndez Zajgla•Dra. Lorena Orozco Orozco•

Dr. José Ángel Córdova Villalobos•Dr. Romeo Sergio Rodriguez Suárez•Dr. Adolfo Martínez Palomo•Dr. Rubén Lisker Yourkowitzky•Dr. Misael Uribe Esquivel•Dra. Teresita Corona Vázquez•Lic. José David Méndez Santa Cruz•Dr. Francisco Bolivar Zapata•Lic. Carlos Eduardo Represas De Almeida•Lic. Enrique José Garcini Elizondo•Lic. Mónica Zendejas Ángeles•Maria Del Carmen Álvarez-Buylla Roces•Lic. Carlos Gracias Nava•Lic. María de Los Ángeles Carrera•L.C. Carlos Ruiz De Esparza Cervera•

Lic. Carlos Eduardo Represas de Almeida•Presidente

Lic. Jorge Arévalo Chávez•Secretario

Lic. Emilio Azcárraga Jean•C.P. Luis Germán Cárcoba García•Min. Dr. José Ramón Cossío Díaz•Lic. Henry Davis Sigoret•Lic. César Salvador de Anda Molina•Sra. Laura Diez Barroso de Laviada•Sr. Augusto Elías Paullada•Lic. Pablo Escandón Cusi•Ing. y Lic. Pierre Froidevaux Chavan•Lic. Claudio X. González Guajardo•Dra. Mercedes Juan López•Ing. y M. en A. Marcos Martínez Gavica•Dr. Guillermo Ortíz Martínez•Lic. Ernesto Rubio del Cueto•Dr. Jaime Serra Puche•Sra. Nina Zambrano•

Dr. Xavier Soberón MaineroInstituto Nacional de Medicina Genómica (INMEGEN), México

Directorio

Retos en Investigación e Impacto Social

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Caracterización de algunos fenómenos moleculares asociados al Cáncer: una oportunidad para su mejor control Dr. Alejandro Mohar BetancourtInstituto Nacional de Cancerología, México.

La Genética Poblacional en la era del genoma personalizadoDr. Carlos BustamanteStanford University, California, EUA.

De los estudios de Asociación del Genoma Completo a la Secuenciación de Nueva GeneraciónDr. Ivo Glynne GutCentro Nacional de Análisis Genómico, España.

Las Alianzas Público-Privadas en Genómica para Beneficio de la Salud PúblicaDr. Roberto Tapia ConyerInstituto Carlos Slim de la Salud, México.

Conferencias Magistrales

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2.

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4.

Conferencias Magistrales

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Encuentro Internacional de Medicina Genómica Retos en Investigación e Impacto Social

Programa AcadémicoPrograma Académico

Jueves 21 Octubre

9:00InauguraciónConferencia Magistral 1Dr. Alejandro Mohar Betancourt

10:30 Receso

10:45 Simposio 1Genómica del Cáncer

12:15 Receso

12:30 Simposio 2Retos y Tendencias

14:00 Comida

15:30Conferencia Magistral 2Dr. Carlos Bustamante

16:20 Receso

16:40 Simposio 3Genómica de Enfermedades Complejas

18:10 Receso

18:20Conferencia Magistral 3Dr. Ivo Glynne Gut

19:15 Cocktail de bienvenida

Viernes 22 Octubre

9:00Conferencia Magistral 4Dr. Roberto Tapia Conyer

9:50 Receso

10:05 Simposio 4La Medicina Genómica en la Educación Médica del Siglo XXI

11:35 Receso

11:50 Sesión de ClausuraGenómica y Sociedad

14:20 Clausura

Retos en Investigación e Impacto Social

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SimposiosSimposios

Simposio No 2. Retos y TendenciasCoordinador: Dr. Xavier Soberón Mainero, INMEGEN

Horario: 12:30 a 14:00 hrs.Horario Ponencia Ponente

1. 12:30 – 12:40 Introducción Dr. Xavier Soberón Mainero, INMEGEN

2. 12:40 – 13:00 La participación de la epigenética en el genoma y la fisiología celular

Dr. Félix Recillas Targa, Instituto de Fisiología Celular, UNAM

3. 13:00 – 13:20 Modelaje biológico y computacional de la regulación genética microbiana

Dr. Julio Collado Vides, Centro de Ciencias Genómicas, UNAM

4. 13:20 – 13:40 Análisis proteómico basado en la espectometría de masas

Dr. César Ferreira Batista, Instituto de Biotecnología, UNAM

5. 13:40 – 14:00 Preguntas y RespuestasSimposio No 3. Genómica de Enfermedades Complejas

Coordinador: Dr. Rubén Lisker, Instituto Nacional de Ciencias Médicas y Nutrición Salvador ZubiránHorario: 16:40 a 14:00 hrs.

Horario Ponencia Ponente1. 16:40 – 16:50 Introducción Dr. Rubén Lisker, Instituto Nacional

de Ciencias Médicas y Nutrición Salvador Zubirán

2. 16:50 – 17:10 Arquitectura genética de la diabetes tipo 2 y otros rasgos metabólicos en la población mestiza mexicana

Dra. María Teresa Tusié Luna, Instituto Nacional de Ciencias Médicas y Nutrición Salvador Zubirán

3. 17:10 – 17:30 Análisis genómico de enfermedades autoinmunes en niños mexicanos

Dra. Lorena Orozco Orozco, Instituto Nacional de Medicina Genómica

4. 17:30 – 17:50 Genómica de las adicciones y la enfermedad mental

Dr. Humberto Nicolini, Universidad Autónoma de la Ciudad de México

5. 17:50 – 18:10 Preguntas y Respuestas

Jueves 21 de Octubre de 2010

Simposio No 1. Genómica del CáncerCoordinador: Dr. Fabio Salamanca Gómez, Instituto Mexicano del Seguro Social

Horario: 10:45 a 12:15 hrs.Horario Ponencia Ponente

1. 10:45 – 10:55 Introducción Dr. Fabio Salamanca Gómez, Instituto Mexicano del Seguro Social

2. 10:55 – 11:15 Genómica Funcional de la Oncogénesis mediada por Kras

Dr. Alejandro Sweet Cordero, Stanford University School of Medicine, California, EUA.

3. 11:15 – 11:35 Medicina personalizada en el cáncer Dr. Jorge Meléndez Zajgla, Instituto Nacional de Medicina Genómica

4. 11:35 – 11:55 Aneuploidías y Cáncer: El origen genético de las aneuploidías

Dr. Luis Herrera Montalvo, Instituto Nacional de Cancerología

5. 11:55 – 12:15 Preguntas y Respuestas

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Encuentro Internacional de Medicina Genómica Retos en Investigación e Impacto Social

Viernes 22 de octubre de 2010

Simposio No 4. La Medicina Genómica en la Educación Médica del S. XXICoordinador: Santiago March Mifsut, INMEGEN

Horario: 10:05 a 11:35 hrs.Horario Ponencia Ponente

1. 10:05 – 10:15 Introducción al tema Dr. Santiago March Mifsut, Instituto Nacional de Medicina Genómica

2. 10:15 – 10:35 Educación para la medicina personalizada Dr. Alberto Lifshitz Guinzberg, Instituto Mexicano del Seguro Social

3. 10:35 – 10:55 Licenciatura en Ciencias Genómicas: Educación estratégica de nivel internacional

Dr. Rafael Palacios de la Lama, Cen-tro de Ciencias Genómicas, UNAM

4. 10:55 – 11:15 Formando los Profesionales de la Salud del futuro en el presente

Dr. Luis Felipe Abreu Hernández, Facultad de Medicina, UNAM

5. 11:15 – 11:35 Preguntas y Respuestas

Sesión de Clausura Genómica y Sociedad

Coordinadora: Dra. Alessandra Carnevale Cantoni, INMEGENHorario: 11:50 a 14:20 hrs.

Horario Ponencia Ponente1. 11:50 – 12:40 Innovación en Ciencias de la Vida Dr. Emilio Sacristán, Centro Nacional

de Investigación en Instrumentación e Imagenología, Universidad Autónoma Metropolitana.

2. 12:40 – 13:30 Aspectos jurídicos de la medicina genómica Dr. Fernando Cano Valle, Instituto de Investigaciones Jurídicas, UNAM

3. 13:30 – 14:20 Retos éticos para las aplicaciones clínicas de la medicina genómica

Dra. Ellen Wright Clayton, Vanderbilt University, EUA

Retos en Investigación e Impacto Social

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Instituciones participantes

Patrocinadores

Instituciones participantes

Patrocinadores

Instituto Nacional de Medicina Genómica•

Fundación Mexicana para la Salud•

Instituto Mexicano del Seguro Social•

Instituto Carlos Slim de la Salud•

Iniciativa Slim en Medicina Genómica•

Centro Nacional de Análisis Genómico•

Vanderbilt University•

Stanford University•

Universidad Autónoma Metropolitana•

Universidad Nacional Autónoma de México•

Universidad Autónoma de la Ciudad de México•

Secretaría de Salud, México•

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Encuentro Internacional de Medicina Genómica Retos en Investigación e Impacto Social

Dr. Xavier Soberón Mainero

Director GeneralInstituto Nacional de Medicina Genómica

(INMEGEN) México

Originario de México, D.F. Químico de la Universidad Iberoamericana, Doctorado en Investiga-ción Biomédica por la Universidad Nacional Autónoma de México. Desde 1981 es investigador de la UNAM, participando en la instalación y consolidación de la ingeniería genética y la bio-tecnología en la institución. Ha realizado estancias de investigación en el City of Hope Medical Center, en el área de Los Ángeles, California; en la Universidad de California, San Francisco y en la Universidad de California, San Diego. Su investigación se ha centrado en la síntesis química del ADN y sus aplicaciones en el estudio de las proteínas, así como el desarrollo de biofármacos y vacunas y a la biocatálisis.

Ha publicado más de 50 artículos de investigación original, en revistas de circulación internacio-nal, así como otros tantos trabajos de análisis y divulgación científica, incluyendo un libro editado por el Fondo de Cultura Económica. Cuenta también con tres patentes que cubren aplicaciones del ADN sintético en el desarrollo de nuevos biocatalizadores, así como de sus aplicaciones a la ingeniería metabólica. Ha coordinado la instalación, desarrollo y operación de las Unidades de Síntesis y Secuenciación de Macromoléculas y la de Cómputo del Instituto de Biotecnología de la UNAM (IBt). Ha sido profesor de los programas de maestría y doctorado en Ciencias Biomé-dicas y en Ciencias Bioquímicas de la UNAM y ha dirigido una veintena de tesis de licenciatura y posgrado. Asimismo, imparte cátedra en la Licenciatura en Ciencias Genómicas de la UNAM, misma que contribuyó a crear. Fue director del IBt durante dos cuatrienios, entre 1997 y 2005.

PonentesPonentes

Retos en Investigación e Impacto Social

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Dr. Alberto Lifshitz Guizberg

Médico Cirujano, nacido en México, D.F. el 27 de marzo de 1944, egresado de la Facultad de Medicina de la Universidad Nacional Autónoma de México. Examen profesional (Mención Honorífica) en octubre de 1967. Especialista en Medicina Interna, certificado por el Consejo Mexicano de Medicina Interna.

Miembro Fundador de la Asociación de Medicina Interna de México y del Consejo Mexicano de Medicina Interna. Egresado del Centro de Formación de Profesores del Instituto Mexicano del Seguro Social. Profesor definitivo de asignatura de la Facultad de Medicina de la UNAM, desde 1972. Jefe de Departamento, Jefe de División y Director del Hospital de Especialidades del Cen-tro Médico Nacional del IMMS. Coordinador de Educación Médica del Instituto Mexicano del Seguro Social de 1991 a 1999. Gobernador por el Capítulo Mexicano del American College of Physicians de 1992 a 1996. Presidente del Consejo Mexicano de Medicina Interna de 1987 a 1990. Miembro Titular de la Academia Nacional de Medicina y de la Academia Mexicana de Cirugía. Investigador del IMSS de 1983 a 1999. Miembro del Sistema Nacional de Inves-tigadores de 1989 a 1995. Miembro del H. Consejo Técnico de la Facultad de Medicina por el período de 1981-1987. Integrante de los cuerpos editoriales de 11 revistas. Presidente de la Asociación de Medicina Interna de México durante el período 1999-2000. Director General de Medicamentos y Tecnologías para la Salud de la Secretaría de Salud 2000-2001. Director Ge-neral de Coordinación de los Institutos Nacionales de Salud de la Secretaría de Salud. Integrante de la Sociedad Mexicana de Historia y Filosofía de la Medicina.

Actualmente, es Miembro Fundador y Presidente de la Academia Nacional de Educación Médi-ca, y Titular de la Unidad de Educación, Investigación y Políticas de Salud del Instituto Mexicano del Seguro Social.

Además el Dr. Lifshitz ha sido Tutor de las Maestrías en Medicina, Educación Médica, y en Cien-cias Médicas y de la Salud. Ha dirigido 26 tesis de especialización y de maestría. Ha publicado 19 libros, 72 capítulos de libro y 314 artículos en revistas, incluyendo 47 de investigación.

Instituto Mexicano del Seguro SocialMéxico

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Encuentro Internacional de Medicina Genómica Retos en Investigación e Impacto Social

Dr. Alejandro Mohar Betancourt

Instituto Nacional de CancerologíaMéxico

El Dr. Alejandro Mohar Betancourt obtuvo el título de Médico Cirujano por la UNAM en el año de 1981. Al término de sus estudios de licenciatura inició la especialidad en Anatomía Patológica en el Instituto Nacional de la Nutrición, bajo la tutela del Dr. Ruy Pérez-Tamayo. Concluyó su especialidad en 1985. En ese mismo año obtuvo una beca de CONACYT para desarrollar sus estudios de Maestría y Doctorado en Epidemiología por la Harvard School of Public Health.

En 1990, se incorporó como investigador al Instituto Nacional de Cancerología (INCan). Fue Jefe del Departamento de Epidemiología, posteriormente Subdirector de Investigación Clínica, y a partir de 1993 Director de Investigación. Desde su incorporación al INCan ha dedicado su tiempo y esfuerzo a conformar un grupo de investigadores clínicos y básicos con carácter inter-disciplinario para el estudio de las enfermedades neoplásicas en México.

Fue Maestro e Investigador Asociado en la Harvard School of Public Health (HSPH). A partir de 1991 se incorporó como tutor del Programa de Maestría y Doctorado en Ciencias Médicas y Epi-demiología de la UNAM. Ha dirigido Tesis de Licenciatura, Maestría y Doctorado. En el 2000 obtuvo la distinción de Edward Laroque Tinker Visiting Professor por la Universidad de Stanford.

Ha publicado más de 135 trabajos científicos y de divulgación, 105 de ellos en revistas indexa-das. Se incorporó al Instituto de Investigaciones Biomédicas de la UNAM en 1998 y es Investi-gador Titular B con definitividad del Departamento de Genética y Toxicología Ambiental. Bajo su coordinación se estableció la Unidad de Investigación Biomédica en Cáncer dentro del INCan. El Dr. Mohar cuenta con más de 2,500 citas a sus trabajos de investigación.

Nivel III del Sistema Nacional de Investigadores. Pertenece a varias asociaciones científicas nacionales e internacionales, destacan: Academia Nacional de Medicina, Academia Mexicana de Ciencias, Harvard Alumnae Association, American Society of Clinical Oncology.

Actualmente cumple su segundo período como Director General del Instituto Nacional de Can-cerología.

Retos en Investigación e Impacto Social

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Dr. Alejandro Sweet Cordero

El Dr. Eric Alejandro Sweet Cordero nació en la ciudad de Mexico. Inició sus estudios de me-dicina en la Universidad Nacional Autónoma de México. Al obtener una beca para estudiar biología, se trasladó a la Universidad de Stanford, E.U.A. Después de obtener la licenciatura en biología de esta institución, continuó sus estudios de medicina en la Universidad de California en San Francisco (UCSF) y realizó su especialidad en Pediatría también en UCSF. Posteriormente realizó una especialidad en Oncología y Hematología Pediátrica en el Children’s Hospital y Dana Farber Cancer Institute en Boston, E.U.A. Realizó tambien estudios de posgrado en el laboratorio del Dr. Tyler Jacks en el Center for Cancer Research (CCR) del Massachussets Institute of Technology.

Desde el 2005 es Profesor Titular de Pediatría y Biología del Cáncer en la Escuela de Medicina de la Universidad de Stanford en California, E.U.A. Es jefe de laboratorio y su trabajo se ha enfocado hacia el análisis genómico del cáncer y el desarrollo de modelos animales de cáncer pulmonar y de sarcomas pediátricos. Es también médico adscrito al servicio de oncología pe-diátrica del Lucile Packard Children’s Hospital de la Universidad de Stanford. Su labor docente incluye el asesorar tesis de doctorado así como la enseñanza clínica de estudiantes de medicina, residentes de pediatría y residentes de oncología pediátrica. Actualmente es el director asociado del programa de residencia (fellowship) en oncología pediátrica en el Lucile Packard Children’s Hospital de la Universidad de Stanford.

Es miembro de la Sociedad Americana de Oncología Pediátrica (ASPHO), de la Sociedad Ame-ricana para el Estudio del Cáncer (AACR) y de la Sociedad Mexicana de Medicina Genómica (SOMEGEN). Ha participado como profesor visitante en cursos impartidos por el INMEGEN desde su fundación. Ha recibido varias becas en reconocimiento a su labor de investigación, entre las cuales destacan la Sidney Kimmel Scholar Award, la Doris Duke Clinical Scientist Deve-lopment Award y la Rita Allen Scholar Award. Actualmente dirige un laboratorio donde coordina los proyectos de investigación de estudiantes de licenciatura doctorado y posdoctorado.

Stanford University School of MedicineCalifonia, EUA.

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Encuentro Internacional de Medicina Genómica Retos en Investigación e Impacto Social

Dra. Alessandra Carnevale Cantoni

Instituto Nacional de Medicina Genómica(INMEGEN) México

La Dra. Carnevale se graduó como Médico Cirujano en la Facultad de Medicina de la Universi-dad Nacional Autónoma de México, UNAM y es Especialista en Genética Médica, certificada por el Consejo Mexicano de Genética desde 1978 y recertificada en 2008. Su labor profesio-nal se desarrolló de 1970 a 2005 en el Instituto Nacional de Pediatría, en donde se desempeñó como Médico especialista del Servicio de Genética, Jefe del Servicio de Genética, Jefe de la División de Investigación Médica, Subdirectora General de Investigación, Directora General y Directora de Investigación.

A partir de 2005, se incorporó al ISSSTE como Coordinadora Nacional de Medicina Genómica en la Dirección Médica del ISSSTE y posteriormente como Coordinadora de las Actividades de Investigación y de Medicina Genómica del ISSSTE. A partir de 2010, es Directora de Investiga-ción en el Instituto Nacional de Medicina Genómica. Es miembro del Sistema Nacional de In-vestigadores, (SNI), Nivel III. A partir de 1980, la Dra. Carnevale fue fundadora y profesor titular del Curso de Especialidad en Genética Médica de la Facultad de Medicina, UNAM con sede en el Instituto Nacional de Pediatría y actualmente inició la Especialidad en el Centro Médico Nacional “20 de Noviembre”.

Desde 1986, es tutor de Maestría y Doctorado en Ciencias Médicas, Odontológicas y de la Sa-lud de la Facultad de Medicina, UNAM. Ha participado como ponente en más de 200 cursos de Genética Humana. He dirigido 15 tesis de especialidad, 5 de maestría y 2 de doctorado. Ha publicado 147 artículos científicos sobre diferentes aspectos de la genética humana, de los cuales 73 en revistas nacionales de circulación internacional, y 74 en revistas internacionales, edi-tadas en el extranjero. Sus artículos han sido citados en 812 ocasiones. También cuenta con 24 capítulos de libro y ha participado en la edición de siete libros y monografías. Es miembro titular y ex Presidente de la Asociación Mexicana de Genética Humana, de la Academia Nacional de Medicina, de la Academia Mexicana de Ciencias, de la Academia Mexicana de Pediatría, de la Academia Nacional Mexicana de Bioética, de la American Society of Human Genetics y de la European Society of Human Genetics, entre otras.

Retos en Investigación e Impacto Social

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Dr. Fabio Salamanca

El Dr. Salamanca es Jefe de la Unidad de Investigación Médica en Genética Humana, Centro Médico Nacional Siglo XXI del Instituto Mexicano del Seguro Social, Profesor Titular del Curso de Especialización en Genética Médica de la División de Estudios de Posgrado, en la Facultad de Medicina UNAM.

Es Miembro de la Academia Nacional de Medicina, de la Academia Mexicana de Cirugía, de la Academia Mexicana de Ciencias, de la Academia Mexicana de Pediatría, de la American Society of Human Genetics, del American College of Medical Genetics, de la European Society of Human Genetics y miembro Fundador del Sistema Nacional de Investigadores, Nivel III.

Fue Presidente de la Asociación Mexicana de Genética Humana y de la Asociación Mexicana de Antropología Biológica. Integrante del Comité Científico del Consorcio Promotor del Instituto de Medicina Genómica.

Instituto Mexicano del Seguro SocialMéxico

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Encuentro Internacional de Medicina Genómica Retos en Investigación e Impacto Social

Dr. Félix Recillas-Targa

Instituto de Fisiología CelularUNAM, México

El Dr. Recillas-Targa es Biólogo por la Facultad de Ciencias de la UNAM y Doctor por la Universi-dad Paris 7, de París, Francia trabajando con el Dr. Klaus Scherrer, en el Instituto Jacques Monod del CNRS. Realizó estancias posdoctorales en el Departamento de Genética y Fisiología Molecular del Instituto de Biotecnología de la UNAM y en el National Institutes of Health, NIH, en el laboratorio del Dr. Gary Felsenfeld, en Bethesda, Maryland EUA. Es Investigador Titular C, definitivo del Instituto de Fisiología Celular de la UNAM.

Es actualmente Jefe del Departamento de Genética Molecular del mismo Instituto. Miembro del Sis-tema Nacional de Investigadores, nivel II. Actualmente cuenta con más de 60 artículos publicados en revistas internacionales y más de 50 conferencias impartidas en México y en el extranjero.

Es tutor activo de diversos posgrado dentro y fuera de la UNAM. Recibió la Beca Fogarty como Visiting Fellow at the National Institutes of Health Visiting Program en Bethesda Maryland, EUA. Es Miembro Regular de la Academia Mexicana de Ciencias (2001). Es editor asociado de las revistas BMC Molecular Biology y Genetics & Epigenetics.

Ha sido revisor de varías revistas internacionales como Proceedings of the Nacional Academy of Sciences, Nucleic Acids Research, International Journal of Cancer, Nature Structural & Molecular Biology entre otras.

Retos en Investigación e Impacto Social

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Dr. Humberto Nicolini

Egresado de la Facultad de Medicina de la Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM).Doctorado en Ciencias Médicas graduándose con Mención Honorífica. Realizó también estudios de especialización en Psiquiatría en el Hospital Español de México, bajo la tutela del Dr. Carlos Campillo, y dos estancias postdoctorales en Los Angeles, California en los E.U. en el Neuropsy-chiatric Institute de la University of California (UCLA), bajo la tutela de la Dra. M. Anne Spence, Ph.D, financiado por los National Institutes of Health de los E.U. Posteriormente, hizo otra estancia postdoctoral en la Universidad Autónoma de Madrid en el Instituto Severo Ochoa bajo la tutela de la Dra. Magdalena Ugarte, con el financiamiento de la UNESCO.

Sus principales contribuciones científicas han sido la creación del primer departamento de psi-quiatría genética en América Latina, ha sido subdirector de investigación clínica en el Instituto Nacional de Psiquiatría y Presidente de la Asociación Mexicana de Biología Molecular en Medicina.

Forma parte del cuerpo editorial de varias revistas internacionales como: Annals of Clinical Psy-chiatry, Current Psychiatric Reviews, Salud Mental, CNS spectrums, Psiquiatría y Salud Integral, Notitoc, Revista Brasileira de Psiquiatría, Internacional Journal of Neuropsychopharmacology. Ha recibido varias distinciones y premios por ejemplo de la OCD Foundation (USA), Tourette Foundation (USA), Fundación Miguel Alemán (México), Premio “Manuel Camelo” en Psiquiatría, la medalla de plata “Alfonso Caso” de la facultad de Medicina de la UNAM, Premio Nacional de Investigación, otorgado por la Fundación Glaxo, México, Premio 2006 de la Academia Na-cional de Medicina y Laboratorios Quest al mejor trabajo de Investigación Clínica. y ha dirigido 24 Tesis (Doctorado, Maestría, especialidad, diplomado y licenciatura).

Actualmente es investigador Nacional nivel III por el Sistema Nacional de Investigadores, miem-bro numerario de la Academia Nacional de Medicina, desde el año 2004 es profesor del posgrado de ciencias genómicas de la UACM e Investigador en Ciencias Médicas F de la Secretaría de Salud.

Universidad Autónoma de la Ciudad de MéxicoMéxico

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Encuentro Internacional de Medicina Genómica Retos en Investigación e Impacto Social

Dr. Ivo Glynne Gut

Centro Nacional de Análisis GenómicoEspaña

El Dr. Ivo Gut es Director del Centro Nacional de Análisis Genómico, en Barcelona, España. Estudió Química en la Universidad de Basel y recibió su Doctorado, por la misma Institución, en el año de 1990. De 1990 a 1993, fue Becario de Investigación en Dermatología con la Prof. Irene Koche-var en la Harvard Medical School, Laboratorios de Fotomedicina Wellman, Massachusetts, y de 1993 a 1996, Investigador en el laboratorio del Dr. Stephan Beck, en el Imperial Cancer Research Foundation de Londres.

De 1996 a 1999 fue Jefe de Grupo en el Departamento de Genómica de Vertebrados del Prof. Hans Lehrach en el Max-Planck de Genética Molecular de Berlín, Alemania. De 1999 a 2009 laboró en el Centro Nacional de Génotypage, Evry, Francia, primero como Jefe de Desarrollo de Tecnología y desde 2007 como Director Asociado.

En enero de 2010 asumió la dirección del Centro Nacional de Análisis Genómico.

El Dr. es autor de más de 100 trabajos de investigación, el inventor de 24 patentes o solicitudes de patentes, fundador de 4 empresas de biotecnología (Genom Analytik GmbH, GmbH Biopsytec y Epigenomics AG, Integragen SA). También es coordinador de la EU FP7-financiado por el Proyecto Integrado READNA en el desarrollo de la tecnología de secuenciación de ADN.

Retos en Investigación e Impacto Social

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Dra. Lorena Orozco Orozco

La Dra. Lorena Orozco es Subdirectora de Investigación Médica en el INMEGEN. Es Médico Cirujano, Graduada en la Facultad de Medicina de la Universidad Autónoma de Chihuahua. Obtuvo el grado de Maestro y Doctor en Ciencias en el Centro de Investigaciones y Estudios Avanzados del IPN, realizó un posdoctorado en el Laboratorio de Diversidad Genómica del National Cancer Institute, de los Institutos Nacionales de Salud en Frederick, Maryland, Estados Unidos.

Es miembro del Sistema Nacional de Investigadores, Nivel II. Ha publicado más de 50 artículos en el área de la Genética Molecular y es coeditora del libro “Genética y Biomedicina Molecu-lar”. Así también, ha participado con más de 200 presentaciones en congresos nacionales e in-ternacionales. Destaca su labor en la docencia y formación de recursos humanos por la dirección de 43 tesis de doctorado, maestría y licenciatura.

Durante su trayectoria ha recibido varios premios y distinciones, entre los más destacados son:

Premio a la Excelencia en Investigación Clínica Pediátrica, 1993.•En 1996 el Jurado del Premio Nacional de Administración Pública le otorgó un reconocimien-•to por su trayectoria en investigación,Fue distinguida por la fundación Fogarty, quién le otorgó una beca en Estados Unidos.•Obtuvo el 1er. lugar del Premio Rosenkranz a la Investigación Clínica 2008.•

Pertenece a diversas asociaciones y destaca su participación como cofundadora de la Aso-ciación de Biología Molecular en Medicina (AMBMM), la Sociedad de Medicina Genómica (SOMEGEN) y de la Asociación Mexicana de Egresados de los National Institutes of Health de los Estados Unidos (AMENAC). Así también ha ocupado diversos cargos destacando su labor como Presidente de la Asociación de Biología Molecular en Medicina y como Presidente de la Asociación Mexicana de Genética Humana.

Instituto Nacional de Medicina Genómica(INMEGEN) México

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Encuentro Internacional de Medicina Genómica Retos en Investigación e Impacto Social

Dr. Luis Felipe Abreu Hernández

Facultad de MedicinaUNAM, México

El Dr. Luis Felipe Abreu Hernández es Médico Cirujano de la Facultad de Medicina UNAM. Realizó sus estudios de posgrado (maestría y doctorado) en el campo de la enseñanza superior y en pedagogía, en la Facultad e Filosofía y Letras de la UNAM. Es Profesor Titular “B” Tiempo Completo definitivo de la División de Estudios de Posgrado de la Facultad de Medicina (área Sociomédica). Organizador y Coordinador del Programa de Maestría y Doctorado en Ciencias Médicas, Odontológicas y de la Salud en la UNAM, el cual dirigió por 11 años. Es Experto en Educación Médica y Educación Superior, sus actividades de investigación y docencia se orientan hacia la relación entre los cambios científicos y tecnológicos y la educación superior y la relación entre tecnociencias de la Vida y Bioética. Dirige proyectos de investigación sobre tutoría en el pos-grado; factores que obstaculizan o favorecen la graduación de los alumnos de posgrado; calidad de la formación y certificación de los médicos; diseño, instrumentación, medición y evaluación de competencias médicas, así como en la calidad de la educación superior. En su carácter de experto integra parte del Comité Nacional para las competencias del Médico General de la Asociación Mexicana de Facultades y Escuelas de Medicina (AMFEM) y participan en el comité sobre licenciamiento de los médicos de la Academia Nacional de Medicina.

Resaltan sus aportaciones sobre las repercusiones de las revoluciones científicas y tecnológicas sobre la educación superior y los sistemas de salud, asimismo se encuentra vinculado al estudio de la relación entre tecnociencias de la vida y la bioética, por lo cual es miembro del Seminario Interdisciplinario de Bioética de la UNAM. Ha estudiado con particular atención el desarrollo de pensamiento complejo y la articulación teoría práctica en la educación superior. Tiene participaciones en 10 libros colectivos, publicado 16 capítulos en libros especializados y más de 62 artículos en revistas arbitradas, ha reali-zado más de 80 conferencias por invitación, presentaciones en congresos, es socio numerario de la Academia Nacional de Medicina de México y del Consejo Mexicano de Investigación Educativa. Ha sido coordinador técnico del proyecto Competencias Profesionales del Médico General Mexicano de la Asociación Mexicana de Facultades y Escuelas de Medicina (AMFEM), del cual se ha publicado el libro “Competencias profesionales del Médico General Mexicano 2008” México: Mason Doyma, 2008. Del cual es coautor, Actualmente a cargo de instrumentar la segunda fase del proyecto.

Fue secretario Académico de la Coordinación General de Estudios de Posgrado de la UNAM 89-91, desde entonces se halla vinculado al posgrado. Fue durante once años, coordinador del Programa de Maestría y Doctorado en Ciencias Médicas, Odontológicas y de la Salud de la UNAM. Participó en el Colegio para la Reforma del Reglamento General de Estudios de Pos-grado. Actualmente es el responsable de la Maestría y Doctorado en el campo de educación médica de la UNAM. Es considerado uno de los principales expertos iberoamericanos sobre educación de posgrado, lo cual le condujo a ser designado coordinador del proceso de revisión de la cuarta y quinta edición de la Guía para Autoevaluación de la Asociación Universitaria de Posgrado con sede en Salamanca, España. Además es miembro, por concurso de méritos, del Consejo Mexicano de Investigación Educativa (COMIE).

Retos en Investigación e Impacto Social

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Dr. Roberto Tapia-Conyer

El Dr. Tapia-Conyer es Presidente Ejecutivo del Instituto Carlos Slim de la Salud. Realizó sus estudios de Medicina en la Universidad Nacional Autónoma de México, maestrías en Salud Pública y en Ciencias en la Universidad de Harvard y doctorado en Ciencias de la Salud en la Universidad Nacional Autónoma de México.

En nuestro país, es Profesor definitivo de la Facultad de Medicina de la UNAM; es miembro de las Academias Nacionales de Medicina y Cirugía; y de la Academia Mexicana de Ciencias; asimis-mo, es investigador Nivel III del Sistema Nacional de Investigadores.

En el ámbito internacional, es Profesor de Salud Pública y Migración en la Universidad de Califor-nia; miembro del Consejo Directivo del Public Health Institute de California; Miembro del Grupo Asesor de la Organización Mundial de la Salud del Plan Global de Influenza y Presidente emérito del Grupo Técnico Asesor del Programa Mundial de Tuberculosis también de la Organización Mundial de la Salud. Integrante durante 10 años del Grupo Técnico Asesor del Programa de Inmu-nizaciones de la Organización Panamericana de la Salud. En fecha reciente fue nombrado patrono de la Fundación La Caixa de Barcelona. Ha sido consultor de la Fundación Rockefeller, la agencia USAID y la Organización de las Naciones Unidas.

Instituto Carlos Slim de la SaludMéxico

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Encuentro Internacional de Medicina Genómica Retos en Investigación e Impacto Social

Dr. Rubén Lisker

Instituto Nacional de Ciencias Médicas y Nutrición Salvador Zubirán

México

El Dr. Rubén Lisker se graduó de Médico (UNAM) en 1954. Posteriormente realizó tres años de estudios de postgrado en Chicago, donde se formó como Hematólogo y regresó a laborar al entonces Hospital de Enfermedades de la Nutrición en 1957.

En 1965 pasó un año en Seattle estudiando Genética y en 1967 inauguró el Departamento de Genética en Nutrición. En esa misma institución fue Editor de la revista de investigación clínica de 1970 a 1998, Director de Enseñanza de 1973 a 1992 y desde ese año se desempeña como Director de Investigación.

Desde 1958 es profesor de la Facultad de Medicina de la UNAM, y en 2003 fue nombrado Profesor Emérito de esa institución.

Su principal actividad ha sido la investigación, habiendo trabajado en la estructura genética de la población mexicana, deficiencia de lactasa intestinal y los últimos años en asuntos relaciona-dos con los dilemas éticos de la práctica médica actual.

Ha publicado más de 250 trabajos y tres libros, recibiendo múltiples reconocimientos por su la-bor, destacando que en 1997 fue nombrado Emérito por el Sistema Nacional de Investigadores, Doctor Honoris Causa en 1998 por la Benemérita Universidad Autónoma de Puebla, Premio Na-cional de Ciencias y Artes en 2004. Investigador Emérito, Secretaría de Salud, 2007, Miembro Correspondiente de la Real Academia de Medicina de Catalunya, 2008.

Retos en Investigación e Impacto Social

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Dr. Santiago March Mifsut

El Dr. Santiago Mach Mifsut obtuvo la Licenciatura de Médico Cirujano en la Facultad de Me-dicina de la Universidad Nacional Autónoma de México, UNAM. Recibió entrenamiento en Anatomía Patológica en el Hospital General de México.

Cuenta con un Diplomado en Planeación y Desarrollo de Negocios del Instituto Tecnológico Autónomo de México (ITAM). Profesor de Fisiología Humana y Profesor adjunto de la Unidad de Medicina Experimental en la Facultad de Medicina de la UNAM. De 2001 a 2004, participó en el Consorcio Promotor del Instituto de Medicina Genómica como Consultor Académico. De 2005 a 2006, el Dr. March se desempeñó como Director de Ense-ñanza y Divulgación del Instituto Nacional de Medicina Genómica, (INMEGEN). Desde 2004 ha coordinado los cursos de posgrado en Medicina Genómica del INMEGEN primeros en su género en América Latina. De 2007 a 2009 se desempeñó como Director de Investigación del INMEGEN.

De 2004 a 2009 fue Coordinador del Programa de Reclutamiento de Investigadores y Técnicos de Laboratorio, Secretario de la Comisión de Investigación, Enlace para la vinculación científica con diferentes Instituciones Nacionales e Internacionales y Vocal del Consejo Técnico de Admi-nistración y Programación. Es Miembro Fundador de la Organización del Proteoma Humano (HUPO). Así también, es miembro de la Sociedad Mexicana de Medicina Genómica, de la Asociación Mexicana de Genética Humana y de la Human Genome Organization (HUGO). A partir de 2007 participa como profesor de Medicina Genómica en la Escuela Nacional de Me-dicina y Homeopatía del Instituto Politécnico Nacional. Es miembro del grupo P3G (The People Population Project in Genomics) y Miembro fundador de la Academia Nacional de Educación Médica.

Desde hace más de 10 años, conjuntamente a sus actividades de investigación, el Dr. March realiza tareas de divulgación científica. Cuenta con 10 publicaciones que incluyen tanto artículos científicos como de divulgación de la medicina genómica. Actualmente tiene a su cargo la Direc-ción de Enseñanza y Divulgación del INMEGEN.

Instituto Nacional de Medicina Genómica(INMEGEN) México

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Encuentro Internacional de Medicina Genómica Retos en Investigación e Impacto Social

01 - Combination of genotyPing Platforms to develoP a HaPlotyPe maP in mexiCan mestizo

and amerindian PoPulationsGuilhem Richard, Claudia Rangel-Escareño, Juan-Carlos

Fernández-López, Irma Silva-Zolezzi, Gerardo Jiménez-Sánchez

The aim of the Mexican Genome Diversity Project (MGDP) is to characterize genetic diversity and linkage disequilibrium structure to generate a ~1.5 million SNP haplotype map. This will allow the implementation of efficient tagging and imputation strategies for association studies in Mexicans. To increase SNP density and hence genome coverage, we merged genotype data of same individuals from three genotyping platforms. We analyzed genotypes generated for the MGDP from 300 Mexican Mes-tizos and 156 Amerindians from three populations (Mayas, Te-pehuanes and Zapotecas). Data was stored in a database and several checkups were performed to ensure its highest quality.

02 - fases en el análisis de datos de un ProyeCto Con miCroarreglos de exPresión

Iván Imaz Rosshandler, Claudia Rangel Escareño

La tecnología de microarreglos ha impulsado el desarrollo de diversos y complejos algoritmos enfocados al análisis de datos genómicos provenientes de diferentes tipos de experimentos. Además de traba jar con volumenes masivos de datos, dichos algoritmos manejan decenas de miles de medidas de expre-sión utilizando un pequeño número de replicados. En general, el análisis de expresión génica se puede dividir en tres fases. La primera fase corresponde al “procesamiento” de datos y con-siste en la preparación de estos para un correcto análisis, a su vez, esta puede dividirse en cuatro etapas (control de calidad, corrección de fondo, normalización y generación de niveles de expresión). En la segunda fase “clasificación”, se deben identi-ficar dentro de los resultados del experimento, los genes que presentan cambios significativos. Debido a la naturaleza de los datos, los métodos estadísticos más utilizados en esta fase se basan en modelos Bayesianos. En la tercera fase, la “predic-ción”, se aplican métodos de agrupamiento para identificar o bien descubrir patrones de expresión similares. En este trabajo, presentamos una revisión de las distintas fases y mostrar el im-pacto de la elección del método de normalización sobre los po-sibles resultados o lista de genes diferencialmente expresados.

03 - diseño de un Panel de marCadores gené-tiCos Para la CorreCCión de estratifiCaCión PoblaCional en estudios de asoCiaCión en

PoblaCiones mestizas mexiCanas Juan Carlos Fernández López, Irma Silva Zolezzi,

Claudia Rangel Escareño

Recientemente los estudios de asociación de genoma completo (GWAS, por sus siglas en inglés) han acelerado el progreso en la búsqueda de variaciones genéticas subyacentes a la he-rencia y desarrollo de rasgos y enfermedades complejos, tales como obesidad, diabetes, hipertensión, cáncer, entre otras. En general estas variaciones son marcadores putativos de riesgo y en muchos de los casos no son los verdaderos responsables de los efectos biológicos relacionados a los rasgos y patolo-gías. La búsqueda de las variantes funcionales es esencial para comprender mejor los fenómenos biológicos responsables de la diversidad en los rasgos y en el desarrollo de enfermedades complejas. En los últimos años se han desarrollado una varie-dad de métodos para minimizar el efecto de la estratificación poblacional en los GWAS, que utilizan todos o una gran pro-porción de los cientos de miles a millones de datos genotípicos que se generan por individuo en estos estudios . De cualquier manera controlar para este fenómeno es tan importante en los GWAS como los es en los estudios de replicación, mapeo fino y re-secuenciación en muestras independientes, los cuales ge-neralmente se realizan utilizando un mucho menor número de marcadores, en un orden que va desde decenas hasta uno cuantos miles. Lo anterior hace de extrema importancia el ge-nerar herramientas óptimas para el abordaje de este fenómeno en la o las poblaciones de interés en los que se quieran realizar este tipo de estudios.

04 - evaluation of miCrornas in urine samPles as indiCators of Prostate CanCer oCCurrenCe

Sálido-Guadarrama I, Miranda-Ortiz H, García-Tobilla P, Solórzano-Rosales S, Saavedra- Briones D, Morales-Montor G,

Sánchez-Alarcón M and Rodríguez-Dorantes M.

Prostate Cancer (PCa) is the second cause of death in men in in-dustrialized countries. In Mexico, ~40% of men between 60-69 years old suffer from this disease. To date serum prostate specific antigen (PSA) remains the only molecular marker used as indi-

Selección de Proyectos de Investigación del INMEGEN

Resúmenes/Abstracts

Selección de Proyectos de Investigación del INMEGEN

Retos en Investigación e Impacto Social

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cator in the detection and management of PCa; although very sensitive, it suffers from low specificity. Androgens are essential for normal differentiation and malignant growth of the prostate is related to alterations in androgen signaling. At the beginning of the disease the most effective therapy is radical prostatectomy and androgen ablation, unfortunately many of these patients cross to androgen independence, developing very aggressive tumors with poor prognosis. New markers that differentiate BPH from PCa to decrease false-positive rates and improve early de-tection are needed. The important role of microRNAs (miRNAs) and the consequences of their deregulation in the progression of human cancer have been well established. Our data could suggest that miRNAs could have an important role in prostate cancer to predict biopsy outcome in patients with suspected prostate cancer promising to be a tool for molecular urine analy-sis in patients, with great potential in reducing the number of unnecessary biopsies.

05 - análisis de variantes farmaCogenómiCas en la PoblaCión mexiCana utilizando la Plata-

forma de miCroarreglos dmetLaura I. Uribe-Figueroa, Alfredo Hidalgo-Miranda, Juan Carlos Fernandez-Lopez, Francisco Sanchez-Girón, Claudia Rangel-Es-careño, Dan J. Gutierrez-Fuentes, Kevin Long2, Howard McLeod

La farmacogenómica se define como el estudio de la variabili-dad genómica interindividual y su relación con la eficacia y se-guridad de los tratamientos. En los países desarrollados, ya se integran recomendaciones para la administración de fármacos de acuerdo a características farmacogenómicas individuales1. Sin embargo, en los países en desarrollo, la utilidad de los estu-dios farmacogenómicos se proyecta a largo plazo1. El proyecto PGENI (Pharmacogenomics for every nation initiative) es una ini-ciativa cuyo objetivo es generar los perfiles farmacogenómicos de los grupos poblacionales más comunes en las naciones con una infraestructura de salud aceptable, pero que no cuenta con el presupuesto para incorporar la genotipificación de sus pa-cientes en la practica clínica. Nuestro paìs, participa en dicha iniciativa y se presentan algunos de los resultados del análisis de un grupo de individuos de la población mexicana.

06 - transPorte HiPerbóliCo en ProCesos de regulaCión transCriPCional

María D. Correa Rodríguez, Enrique Hernández

En este trabajo estudiamos los fenómenos de memoria y trans-porte irreversible en un modelo de termodinámica fuera de equi-

librio para los procesos de regulación de la transcripción ge-nética. Los mecanismos de regulación transcripcional presentan una fenomenología compleja y son de importancia extrema en el desarrollo celular de los organismos y en los procesos asocia-dos a patogénesis de enfermedades complejas. Comprender de qué manera funciona la regulación de la expresión genética a nivel energético, resulta de suma importancia para construir redes regulatorias y también para conectar éstas con fenóme-nos de múltiples escalas como el metabolismo, en un enfoque integrador del tipo de Biología de Sistemas. En este proyecto analizamos 3 mecanismos simples de estímulo genético, un pul-so instantáneo, una señal bioquímica periódica y un proceso de saturación con una cinética sigmoidal del tipo Michaelis-Menten y la respuesta irreversible que el sistema presenta en la forma de estallidos transcripcionales anómalos.

07 - físiCa biológiCa y analisis de exPresión en la regulaCión transCriPCional en CánCer

Karol Baca López, Enrique Hernández Lemus

El cáncer de mama constituye un problema de salud pública y es la primera causa de incidencia (una de cada 10 mujeres) y mortalidad por cáncer en la mujer adulta en nuestro país. Nos encontramos ante un problema de gran magnitud para el que pocos han sido los avances de carácter preventivo y clínico debido a la complejidad de la patología. Dicha complejidad surge en la descripcion del problema a nivel molecular o ge-nético, además el gran número de factores ambientales. El análisis de las interacciones bioquímicas relacionadas se basa frecuentemente en la consideración de las relaciones de regula-ción genética. Puesto que la regulación genética es un proceso fuera del equilibrio, la inferencia y el análisis de ésta puede hacerse siguiendo los principios de la termodinámica irrever-sible y la mecánica estadística fuera del equilibrio. El enfoque tradicional de la mecánica estadística es inferir la distribución de probabilidad conjunta para los estados del sistema en térmi-nos de un modelo para las interacciones. Un problema inverso en mecánica estadística consiste en considerar una realización de la distribución de probabilidad y emplearla para inferir las interacciones entre las partículas. Tomamos este enfoque para analizar 261 experimentos de expresión de mRNA de genoma completo, en pacientes con cáncer de mama y, a través de una medida basada en la teoría de la información descubrir el conjunto de interacciones transcripcionales asociadas. Mostramos cómo aplicar las herra-mientas de la física estadística no-lineal para generar hipótesis (es decir, el conjunto de interacciones inferidas) que pueden ser probadas en ensayos clínicos y bioquímicos con relación a la fenomenología del cáncer.

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Encuentro Internacional de Medicina Genómica Retos en Investigación e Impacto Social

08 - determinaCión de la PrevalenCia de los subtiPos moleCulares intrínseCos de tumores

de mama mediante análisis de exPresión géniCaAlfredo Hidalgo Miranda, Sergio Arturo Rodríguez Cuevas,

Sandra Lorena Romero Córdoba, Antonio Maffuz, Laura Uribe Figueroa, Verónica Bautista Piña, Rosa Rebollar Vega, Isabel Cicerón Arellano,

Valeria Quintanar Jurado.

El análisis genómico ha identificado subgrupos de tumores de mama en base a sus patrones de expresión génica, permitiendo el desarrollo de pruebas de evaluación y predicción de riesgo en relación a respuesta a tratamiento, desarrollo de metástasis y tiempo de sobrevida. Entre los primeros perfiles de expresión que permitieron sub-clasificar a los tumores de mama en grupos de relevancia clínica está el denominado perfil intrínseco de ex-presión. Este perfil identifica cinco subtipos tumorales: parecido a normal, enriquecido en HER2, parecido a basal, luminar A y luminar B. Siendo los subtipos enriquecido en HER2 y basales los que presentan un comportamiento clínico más agresivo. En México no existen datos acerca de la prevalencia de los dife-rentes subtipos tumorales definidos por perfiles de expresión, por lo que el objetivo de este trabajo fue identificar y determinar de la prevalencia de los cinco subtipos tumorales intrínsecos en muestras de tumores de mama mediante el uso de microarreglos de expresión génica.

09 - análisis de alta resoluCión de alteraCiones en el número de CoPias de dna

en tumores de mamaRebollar, R., Rodríguez, S., Romero, S., Quintanar, V.,

Bautista, V., Cicerón, I., Uribe, L., Hidalgo, A

El cáncer de mama representa la segunda causa de muerte relacionada con cáncer en la población femenina de México. Un perfil específico de alteraciones en el número de copias de DNA ha sido descritos en los tumores de mama, el cual se ha asociado a diversas variables clínicas y patológicas. El análisis de estas alteraciones en el número de copias de DNA se ha llevado a cabo con diferentes métodos, incluyendo la hibrida-ción genómica comparativa y recientemente, a través del uso de arreglos de oligonucleótidos de alta densidad para genoti-pificación de SNPs. El uso de una microarreglos con una ma-yor densidad, así como la introducción de métodos estadísticos para evaluar la significancia de las alteraciones en el número de copias, ha permitido la detección de genes específicos invo-lucrados en el desarrollo de diversas neoplasias. Sin embargo, en el caso del cáncer de mama, existen muy pocos estudios

que combinen el análisis de alta resolución con un análisis es-tadístico astringente.Con el fin de identificar las alteraciones en el número de copias de DNA estadísticamente significativas en tumores de mama, analizamos el DNA de 100 muestras pareadas; usando la pla-taforma de microarreglos SNP 6.0 de Affymetrix.

10 - el Perfil de exPresión de 86 miCrornas Permite diferenCiar entre tumores de mama

y tejido mamario normalRomero-Cordoba S.L., Rodriguez-Cuevas S, Quintanar-Jurado

V, Bautista-Pina V, Ciceron-Arellano I, Rebollar-Vega R.G., Jimenez-Sanchez G, Uribe-Figueroa L, Hidalgo-Miranda A.

Las alteraciones en la regulación de la expresión génica, tanto de RNAs mensajeros como de microRNAs juega un importan-te papel en el desarrollo de los tumores mamarios. Las firmas moleculares basadas en la expresión de un número limitado de miRNAs son capaces de diferenciar tejido normal del tu-moral y distinguir los fenotipos clinopatológicos de los tumores de mama. En este trabajo analizamos los perfiles de expresión de microRNAs en tejidos mamarios sanos y los comparamos contra los de tejido tumoral, mediante el uso de una plataforma que permite evaluar un mayor número de microRNAs que otras plataformas reportadas. Este análisis nos permitió identificar un grupo de microRNAs diferencialmente expresados cuyo papel en la carcinogénesis mamaria no ha sido descrito.

11 - análisis de il-1β en PaCientes Con leisHmaniasis Cutánea loCalizada y difusaEdith Fernández-Figueroaa, Valeria Espinosa-Mateosb, Norma Salaiza-Suazoa, Karol Carrillo-Sánchezb, Valeria Quintanar-Juradob, Santiago March-Mifsutb, Claudia Rangel-Escareñob, Ingeborg Beckera. aDepartamento de Medicina Experimental,

Facultad de Medicina, UNAM., bInstituto Nacional de Medicina Genómica.

Leishmania mexicana es el parasito causante de la leishma-niasis cutánea localizada (LCL) y difusa (LCD), cada año se diagnostican en nuestro país 400 casos nuevos. Poco es lo que se sabe acerca de la inflamación y su papel en esta enferme-dad. En este trabajo se analizó la susceptibilidad de pacientes con LC a través del análisis de SNPs (IL-1β (-511), CXCL8 (-251) e IL-1RA 2018) en 58 pacientes mestizos mexicanos con LCL, 6

Retos en Investigación e Impacto Social

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pacientes de DCL y 123 controles. También se analizó la pro-ducción in vitro de IL-1β en monocitos y en lesiones de ambos grupos de pacientes. Nuestros resultados muestran resultados estadísticamente significativos en el SNP para IL-1β (-511 C / T) entre pacientes y controles (OR= 3.23, IC del 95% (= 1.2, 8.7) y p-value = 0,0167), adicionalmente, la producción de IL-1β en monocitos y en lesiones de los pacientes se correlaciona direc-tamente con la gravedad de la enfermedad, siendo el más alto en los pacientes de LCD gravemente infectados con Leishmania mexicana. Estos datos sugieren que la citocina pro-inflamatoria IL-1β, esta posiblemente, jugando un papel importante en la susceptibilidad a la enfermedad y aún está por establecerse si esto se relaciona con una respuesta inflamatoria exacerbada en estos pacientes.

12 - análisis e identifiCaCión de Proteínas diferenCialmente exPresadas en sueros

de PaCientes Con leisHmaniasis Cutánea loCalizada y difusa

Edith Fernández-Figueroaa, Karla Calderón-Gonzálezb, Isabel Ruiz-Olmedob, Claudia Rangel-Escareñob, Ingeborg Becker-Fau-sera, Juan Pablo Reyes-Grajedab. aDepartamento de Medicina

Experimental, Facultad de Medicina, UNAM., bInstituto Nacional de Medicina Genómica.

La leishmaniasis cutánea (LC) incluye diferentes manifestaciones clínicas dando lugar a diversas intensidades en el infiltrado in-flamatorio dérmico. En México la LC puede presentarse en dos formas clínicas polarmente opuestas: la localizada (LCL) y la difusa (LCD). Pacientes con LCL presentan una intensa respuesta inmune celular, que limita al parásito al sitio de la picadura de la mosca transmisora, mientras que pacientes con LCD pre-sentan una anergia de la respuesta inmune celular específica contra el parásito, permitiendo la propagación del mismo a toda la piel, formando nódulos que contienen abundantes ma-crófagos intensamente parásitados. Experimentos realizados en nuestro laboratorio con células NK y monocitos de pacientes analizando diferentes proteínas (citocinas, receptores y factores de transcripción) demuestran que existen diferencias en la ex-presión de las mismas en cada grupo de pacientes. El objetivo de este trabajo es analizar el perfil e identificación de proteínas mediante geles 2D y espectrometría de masas utilizando sue-ros de ambos grupos de pacientes y controles del estado de Tabasco. Los resultados preliminares muestran que existen pro-teínas diferencialmente expresadas entre los grupos de casos y controles, entre ellas se identificaron proteínas involucradas en la inflamación como: Apolipoproteína AI y AII, Haptoglobina y C3 y C4 del sistema de complemento.

13 - variaCiones en el número de CoPias de tlr8 Pero no de tlr9 se asoCian a la susCePtibilidad a desarrollar luPus eritematoso sistémiCo en

PoblaCión PediátriCa mexiCanaRafael Velázquez Cruz1, Humberto García Ortiz1, Francisco Espinosa Rosales2, Vicente Baca3, Lorena Orozco1. 1Labora-

torio de Enfermedades Multifactoriales, INMEGEN. 2Servicio de Inmunología Instituto Nacional de Pediatría. 3Hospital de

Pediatría CMN Siglo XXI, IMSS. SS.

Introducción: Los receptores “Toll-like” (TLR) juegan un papel clave en la respuesta inmune innata, de los cuáles TLR7 y TLR8 recono-cen moléculas de RNA derivadas de virus y TLR9 moléculas de DNA. No obstante, estos receptores también son capaces de reconocer ácidos nucleicos endógenos contenidos en complejos inmunes y pueden contribuir en el desarrollo de autoinmunidad. Recientemente demostramos que variaciones en el número de copias (CNVs) del gen TLR7 se asocian con el riesgo a desarro-llar lupus eritematoso sistémico (LES) pediátrico, probablemente a través de la inducción de la expresión de IFN-α. Objetivo: El ob-jetivo del presente estudio fue determinar si CNVs de TLR8 y TLR9 se encuentran asociadas al desarrollo de LES en la población pediátrica mexicana. Material y Métodos: Se incluyeron un total de 328 pacientes con diagnóstico de LES antes de los 16 años de edad, 269 (82%) fueron femeninos y 59 (18%) masculinos. Como grupo control se incluyeron 403 individuos sanos (85% femeninos y 15% masculinos). La cuantificación del número de copias (NC) se llevó a cabo por PCR en tiempo real utilizando dos pares de oligonucleótidos específicos para TLR8 y TLR9 y dos genes endógenos como controles. Así mismo, se midieron los niveles de expresión de TLR8, TLR9 e IFNα en una muestra de 31 pacientes con LES con número conocido de copias. Alterna-tivamente, se evaluó la actividad de IFNa en un modelo in vitro estimulando células Wish con suero de pacientes y midiendo los niveles de expresión de tres genes específicamente inducidos por IFNa (MX1, PKR e IFIT1). Resultados: Los pacientes mostraron un incremento significativo en el NC de TLR8 cuando se compararon con el grupo control (P=0.0065) en cambio, no se observaron diferencias significativas en el NC de TLR9 entre los casos y los controles (P=0.529). Sin embargo, cuando se estratificó por gé-nero, sólo el grupo de pacientes femeninos mostró diferencias significativas en el NC del gen TLR8 cuando se comparó con los controles femeninos (P=0.0008). La presencia de más de 2 copias del gen TLR8 (3 a 5) confirió un OR de 1.66 (95% I.C. = 1.39-1.98) en el grupo femenino. Por otra parte, se encontró una correlación altamente significativa con el NC y los niveles de mRNA de TLR8 (P= 0.002, r=0.55) y TLR9 (P=0.0001, r=0.65); sin embargo, sólo los niveles de expresion de TLR8 correlaciona-ron con los niveles de expresión de IFN-a (p=0.017, r=0.49) y su actividad (p=0.008, r=0.54). Conclusiones: Nuestros resultados muestran que la dosis génica de TLR8 pero no la de TLR9 es un factor de riesgo para el desarrollo de LES pediátrico y sugieren que el mecanismo es a través de la inducción de IFN-a.

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Encuentro Internacional de Medicina Genómica Retos en Investigación e Impacto Social

14 - CaraCterizaCión del Perfil de exPresión de Células linfoblastoides en resPuesta a una

exPosiCión aguda a arséniCoEmilio J. Córdova1, Federico Centeno1, Mirna Morales-Marín2, Laura Uribe1, Lorena Orozco1. 1Instituto Nacional de Medicina Genómica, SS; 2Posgrado de Ciencias Genómicas, UACM.

El arsénico es uno de los principales contaminantes ambientales asociados al desarrollo de diferentes neoplasias humanas. El metabolismo celular del arsénico genera la formación de pro-ductos secundarios tóxicos, sin embargo, se desconoce el tipo de mecanismos celulares que responden al arsénico y aquellos asociados con sus metabolitos. El uso de células linfoblastoides, que carecen de las enzimas necesarias para el metabolismo del arsénico, podría permitir identificar los mecanismos de defensa celular asociados únicamente con la presencia del arsénico y no de sus metabolitos. El objetivo de este trabajo fue identificar las vías de señalización activadas por la exposición a arsénico en células linfoblastoides. Cultivos de la línea celular NL-1 fue-ron expuestos por 2 y 12 hrs a 5μM de NaAsO2 para la poste-rior extracción de RNA La expresión génica se analizó a través del uso de el microarreglo Human Gene 1.0 ST (affymetrix), siguiendo las especificaciones del proveedor. Los resultados fue-ron analizados usando el software Genomatix (Genomatix, UK) y la identificación de los genes diferencialmente expresados se realizó por un análisis de ANOVA. Al menos 15 genes fueron validados por qRT-PCR. La exposición a arsénico por 2 y 12 hrs, produjo la alteración de 81 y 224 genes respectivamente. Del total de genes que mostraron una expresión alterada, 33 fueron comunes en ambos períodos de tratamientos, 48 exclusivos del tiempo de 2 hrs y 191 de 12 hrs. Cabe resaltar que HMOX1 fue el gen que mostró un mayor incremento en sus niveles de expresión tanto a 2 como a 12 hrs, en forma dependiente del tiempo. Los datos de Gene Ontology mostraron que los genes alterados de manera común en ambos tiempos de exposición participan en procesos celulares tales como: respuesta al estrés, apoptosis, procesos metabólicos y de óxido-reducción entre otros. Los genes alterados únicamente a 2 hrs de exposición se asocian principalmente a la regulación de la muerte celular y respuesta a estímulos externos. Por otro lado, a 12 hrs los principales procesos alterados son la regulación del ciclo celu-lar y la replicación del DNA. A través del programa Ingenuity se determinó que la ruta de señalización más importantemente alterada en ambos tiempos de exposición fue la regulada por el gen antioxidante NEF2L2. Conclusiones. Nuestros resultados sugieren que el principal sistema de protección celular que res-ponde ante una exposición temprana al arsénico es la vía de señalización Nrf2-Keap1. De esta forma, la activación de esta ruta, a través de un número importante de elementos derivados de la dieta, podría ser una estrategia potencial para disminuir los efectos del arsénico en poblaciones con alta exposición a este contaminante ambiental. Además, el gen HMOX1 podría ser un biomarcador útil de exposición a arsénico.

15 - sub-Cellular ProteomiC analysis in breast CanCer

Gutierrez-Najera N., Alvarado-Nuño A., Calderon-Gonzalez K., Cruz J. L., Gallegos J. L., March S. and Jimenez-Sanchez G. Department of Medical Proteomics, National Institute of

Genomic Medicine (INMEGEN).

In breast cancer, genetic alterations lead to abnormal expres-sion patterns, as well as changes in the structure and function of proteins involved in several pathways. We used a proteomic approach to identify differences in protein profiles aiming to iden-tify potential disease biomarkers. We studied protein profiles of cell cultures from adenocarcinomas by DIGE (Differential in Gel Electrophoresis). We obtained total protein extracts from human MCF-7, Hs578t and Hs578Bst (normal breast epithelium). Also soluble and membrane proteins were extracted by differential centrifugation and separated by DIGE. Proteins were identified by mass spectrometry. Our results indicated that 77% of the spots found by 2D-gel in normal breast tissue did not show any change compared to cancer. We identified differential proteins between cancer and normal breast and we found 17 proteins in membrane fraction and 4 in soluble fraction. The use of subce-llular fractionation in order to find breast cancer biomarkers is a useful strategy in proteomics of cancer.

16 - Potential biomarker in breast CanCer derived from ProteomiC analysis: bioCHemiCal CaraCterization of Pyruvate-kinase m2 (Pk-m2) Díaz-Tufinio, Carlos Alejandro, Cruz-Colín, José Luis, Gallegos-Perez José Luis, Calderon-González Karla, Gutiérrez-Nájera, Nora Andrea Medical Proteomics Unit, National Institute of

Genomic Medicine, Mexico Breast cancer is one of the main feminine death causes in Mexi-co. In this study after a comparative proteomic analysis in diffe-rential two-dimensional gel electrophoresis (DIGE) of three pure breast cancer cell lines (MCF7, Hs578t, MDA-MB23), we iden-tified pyruvate-kinase M2 isozyme (PK-M2). We performed bio-chemical characterization of this enzyme.We achieved yields greater than 80% of the enzyme in chromatography purification steps, as well as fractions with purity factors about 50. With the addition of fructose-1,6-diphosphate (F-1,6-dP), we induced an increase of the PK activity. With this, we confirmed the effect, already reported in the literature, PK-M2 tetramerization and an increased enzymatic activity in presence of high F-1,6-dP concentration, a common molecular mechanism in advanced cancer stages.

Retos en Investigación e Impacto Social

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17 - estudio ProteómiCo de los Cambios en fosforilaCión y gliCosilaCión

en CánCer de mamaMerino-Vaquero J. C.c, Cruz-Colín J. L.a, Mendoza-Hernández G.b, Quintanar-Jurado V.a y Gutiérrez-Nájera, N.a aInstituto Na-cional de Medicina Genómica, bDepartamento de Bioquímica,

cFacultad de Química, Universidad Nacional Autónoma de México

En la actualidad las tasas de mortalidad por cáncer de mama son altas. Se han observado cambios en la fosforilación y en la N-glicosilación de proteínas durante el desarrollo del cáncer. El objetivo de este trabajo fue encontrar proteínas que en cáncer de mama se modifican por fosforilación o glicosilación. Utilizamos células de cáncer de mama, las líneas Hs578t, MCF7, MDA-MB231 y de mama normal, Hs578BsT. De éstas se extrajeron proteínas de fracciones celulares y se comparararon a través de su separación por electroforesis. Del análisis de los geles de la electroforesis se seleccionaron bandas y éstas se identificaron espectrometría de masas. Entre las proteínas identificadas como fosforiladas están la piruvato cinasa, la citoqueratina 9 y la iso-forma 2 de la actina β y de las glicosiladas VLA-3, CD44E, el precursor de la reticulocalbina-1 y la citoqueratina 9.

18 - deteCCión de biomarCadores Para diagnóstiCo de CánCer de mama en muestras

de suero Por téCniCas ProteómiCasRoman-Tamez M.2, Quintanar-Jurado V.1, Hernández-Lemus E.1, Mojica-Espinosa R.1, Tirado-Gómez L.3, Antonio-Urrutia G.2,

Mendoza-Hernández G6, Ramírez-Salcedo J.5, Bargallo-Rocha E.4 y Gutierrez-Najera N2. 1Instituto Nacional de Medicina

Genómica, 2Facultad de Química, 3Coordinación de Proyectos Especiales, Facultad de Medicina, 4Departamento de Tumores

Mamarios. Instituto Nacional de Cancerología 5Instituto de Fisiología Celular, Universidad Nacional Autónoma de

México, 6Departamento de Bioquímica, Edificio de investiga-ción 2º. Piso, Facultad de Medicina, Universidad Nacional

Autónoma de México, Ciudad Universitaria

Un alto porcentaje de los casos en cáncer de mama se diagnosti-can a una etapa tardía. Debido a esto se buscan nuevos biomar-cadores que podrían ser específicos para esta enfermedad. Este trabajo tiene como objetivo establecer un proceso de descubri-miento de biomarcadores de cáncer de mama en suero. Se rea-lizó la extracción de proteínas de suero, éstas se separaron por electroforesis diferencial en geles 2D (DIGE) y se identificaron por espectrometría de masas. También se analizaron en microarreglo de anticuerpos para proteínas de la vía de p53. De aquí se

identificaron 6 proteínas que se presentaron como incrementadas en estos sueros y al menos unas 20 proteínas del análisis con el microarreglo de anticuerpos cuyos niveles cambiaron en sueros de cáncer de mama. Estas proteínas podrían ser candidatas a detectarse en estudios de diagnóstico temprano.

19 - imPlementaCión de la Plataforma maldi-imaging en Cerebro de ratón

Calderón-González K.G.*1, Regalado-Santiago D.J.*1, 2, López-Luna A.2, Monroy Núñez G. Y.1,3 Quintanar-Jurado V.1, Pérez-Carreón J. I.1, Gimeno M.2, Bárzana E.2, Villanueva-González

P.2, Gallegos-Pérez J. L.1 1Instituto Nacional de Medicina Genó-mica, 2Facultad de Química, Universidad Nacional Autónoma de México, 3Facultad de Química, Universidad Autónoma de Baja California. *Ambos autores contribuyeron de igual forma

en este trabajo.

Matrix Assisted Laser Desorption/Ionization-Imaging Mass Spec-trometry (MALDI-IMS), es una poderosa herramienta para investi-gar la distribución de proteínas y pequeñas moléculas dentro de sistemas biológicos a través del análisis in situ de tejidos. Cientos de péptidos y proteínas pueden ser simultáneamente mapeados en un tejido con una resolución de aproximadamente 30 a 50 μm. La intensidad de cada señal genera un mapa de los com-puestos presentes sobre la superficie. El objetivo de este traba-jo fue implementar MALDI-IMS y optimizar la aplicación de la matriz sobre cerebro de ratón para obtener óptimas señales de espectros de masas. Los resultados mostraron que la deposición de la matriz por sublimación presenta una adecuada distribución de la misma sobre el tejido, favoreciendo la detección de masas correspondientes a moléculas de naturaleza lipídica.

20 - farmaCoCinétiCa de la administraCión Conjunta de albendazol y nitazoxanida en

Plasma y líquido Cefalorraquídeo.Ruiz-Olmedo María-Isabel1,2, Franco-Pérez Javier3, González-Hernández Iliana3, Ruiz-Ramírez Moisés4, Gallegos-Pérez José Luis2, Jung-Cook Helgi1,3 1Universidad Nacional Autónoma de México, 2Instituto Nacional de Medicina Genómica, 3Instituto Nacional de Neurología y Neurocirugía, 4Escuela Tominaga-

Nakamotokamoto

El albendazol es un fármaco ampliamente utilizado en el tratamien-to de la neurocisticercosis. Se sabe que presenta una baja solu-

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Encuentro Internacional de Medicina Genómica Retos en Investigación e Impacto Social

bilidad, lo cual da lugar a una gran variabilidad en la absorción y por ende en los niveles plasmáticos y la respuesta terapéutica en pacientes bajo tratamiento con este fármaco. Recientemente se demostró que la nitazoxanida y su metabolito activo, la tizoxa-nida, presentan eficacia cisticida en el modelo de T. crasisseps encontrándose que el efecto de la combinación de tizoxanida-sulfóxido de albendazol, metabolito activo del albendazol, fue aditivo y más rápido que el observado con cada fármaco por separado, lo cual sugiere que la administración conjunta de al-bendazol y nitazoxanida podrían ser útiles en el tratamiento de la cisticercosis, aun que para esto se requiere de más estudios. Con el fin de continuar con la investigación, se llevó a cabo el presen-te estudio cuyo objetivo fue comparar “in vivo” la farmacocinética de la administración a dosis única de albendazol y nitazoxanida con la resultante de la administración conjunta. El estudio se lle-vó a cabo en ratas de la cepa Sprague-Dawley las cuales se dividieron en diferentes grupos de acuerdo a un esquema alea-torio. Se tomaron muestras de plasma y líquido cefalorraquídeo durante 16 horas, empleando técnicas de canulación en cola y cisterna magna de manera simultánea. Para la cuantificación de los fármacos, se desarrollaron métodos analíticos por cromato-grafía de líquidos con detección UV-Vis para sulfóxido de alben-dazol en líquido cefalorraquídeo y para tizoxanida en plasma y líquido cefalorraquídeo, mientras que, para la cuantificación de sulfóxido de albendazol en plasma se desarrolló un método por cromatografía de líquidos acoplado a espectrometría de masas-masas. Los métodos fueron validados siguiendo los lineamientos que marca la Norma Oficial Mexicana 177 de la Secretaría de Salud. Los resultados del estudio demostraron que después de la administración conjunta de albendazol-nitazoxanida los valores de Cmax y AUC(0→t) del albendazol en plasma fueron 1.2 ve-ces más altos en relación a los obtenidos con la administración de albendazol solo, mientras que, el Tmax fue menor. De igual manera los valores de Cmax y AUC (0→t) para la combinación en líquido cefalorraquídeo fueron 2.1 y 2.4 veces más altos (p < 0.05) respectivamente, aunque el Tmax y el tiempo medio de re-sidencia fue mayor para el sulfóxido. En conclusión, los resultados de este trabajo hacen pensar que la combinación de nitazoxa-nida con albendazol podría ser benéfica en aquellos pacientes que no responden a la terapia de albendazol.

21 - desarrollo y validaCión de un método analítiCo Para la CuantifiCaCión de tizoxanida en Plasma Por HPlC

Ruiz-Olmedo María-Isabel1,2, Calderón-Gonzalez Karla-Grisel2, Gallegos-Pérez José-Luis2, Jung-Cook Helgi1,3 1Universidad

Nacional Autónoma de México, 2Instituto Nacional de Medicina Genómica, 3Instituto Nacional de Neurología y

Neurocirugía

La Nitazoxanida (NTZ) es un fármaco antihelmíntico de amplio espectro que al ser administrado se metaboliza a Tizoxanida (TZO) metabolito que ha demostrado actividad cestocida con-tra cisticercos de Taenia crassiceps. Se cree que los efectos antiparasitarios de este fármaco, son debidos a la interferencia con la piruvato ferrodoxin oxido reductasa enzima que interfiere con la vía energética del parásito. Estudios “in vivo” han demos-trado que la administración conjunta con el Albendazol (ABZ), fármaco administrado por excelencia en el tratamiento contra la neurocisticercosis, podría llegar a eliminar hasta el 98% de cisti-cercos de la cepa parasitaria ya mencionada. Debido a que el ABZ presenta una alta variabilidad interindividual, es necesario continuar con la búsqueda de tratamientos seguros y efectivos para esta enfermedad. El presente trabajo tiene como enfoque principal desarrollar y validar un método que permita la cuan-tificación de TZO en plasma para poder desarrollar estudios preclínicos de la conjunción de ABZ y NTZ. Para el desarrollo y la validación de este método se utilizó un equipo marca Waters-Alliance 2690 con bomba cua-ternaria y detector UV-Vis 2996 con arreglo de diodos. La cromatografía se llevó a cabo en una columna X-Terra C18 (250mm x 4.6mm con d.i. 5μm), con una fase móvil ternaria de MeOH:ACN:KH2PO4 pH 5.7;50mM con un gradiente acuoso-orgánico (90:10 a 10:90) a flujo de 0.4 mL/min y lon-gitud de onda de 416 nm. El estándar interno utilizado fue la nifuroxazida, que presentó un tiempo de retención de 18 min y en el caso de TZO fue de 23 min. Para el tratamiento de la muestra se realizó una precipitación de proteínas con ACN a 200 μL de fármaco adicionado a plasma y una inyección de 100 μL de solvente orgánico fue inyectado al sistema cromatográfico Este método analítico fue validado según la NOM-177-SSA-1998 (linealidad, exactitud, precisión, especificidad, recobro y estabilidad a corto y largo plazo) en plasma de rata y se verifico su reproducibilidad en muestras de plasma humano. Además, muestras de un estudio farmacociné-tico (FC) a dosis única de 7.5 mg/Kg de NTZ en un modelo de rata fueron analizadas. El promedio de recobro fue de 103 % para los tres puntos con-trol (70, 400 y 1000 ng/mL). El método fue específico tanto para muestras de plasma de rata como de humano. Es lineal en un rango de concentraciones de 0.01 a 1280 μg/mL y pre-senta una R 2 de 0.9997. Demostró ser preciso y exacto con un coeficiente de variación no mayor al 8% y una desviación absoluta no mayor al 7.8 % para cada punto control; el límite de cuantificación es de 10 ng/mL y las muestras son estables tanto a corto como a largo plazo(45 días). Los parámetros FC del estudio realizado fueron: Cmax 258 ng/mL, Tmax 0.25 h, AUC de 450.13 ng*mL/h y un tiempo medio de residencia de 2.31 h ajustado a un modelo no compartimental. El método desarrollado es confiable y puede ser utilizado para cuantificar muestras de TZO en plasma provenientes de estudios FC y de monitoreo terapéutico de humanos y animales.

Retos en Investigación e Impacto Social

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22 - desarrollo y validaCión de un método analítiCo Para la CuantifiCaCión de ioHexol en Plasma Por Cromatografía de líquidos de alta

resoluCiónVásquez-Bochm Luz-Xochiquetzalli1,2 , Reyes-Grajeda Juan-Pa-blo2 Ruiz-Olmedo María-Isabel1,2 1Universidad Nacional Autó-noma de México, 2Instituto Nacional de Medicina Genómica

El Iohexol es un marcador radiológico no iónico, fármaco que después de ser administrado vía intravascular más del 90% se elimina sin ser modificado por medio de la orina durante las primeras 24 horas. El corto tiempo de vida media de elimi-nación y la baja unión a proteínas que presenta le confieren propiedades farmacocinéticas muy semejantes a la creatinina lo que permite utilizarlo como marcador de la depuración re-nal. El presente trabajo tiene como objetivo desarrollar y validar un método que permita la cuantificación de Iohexol en plasma para poder analizar muestras de pacientes con daño renal de una institución perteneciente al sistema nacional de salud.Para el desarrollo y la validación de este método se utilizó un equipo marca Waters-Alliance 2690 con bomba cuaternaria y detector UV-Vis 2996 con arreglo de diodos. La cromatografía se llevó a cabo en una columna Spherisorb de 250 mm x 4.6 mm x 5 μm a un flujo de 1 mL/min, con una longitud de onda de 245 nm y un gradiente de elución de 98:2 a 50:50 en 15 minutos de H2O (0.1% TFA): acetonitrilo (v/v). El estándar interno utilizado fue Naproxeno, el cual presentó un tiempo de retención de 22 minutos, y en el caso del Iohexol fue de 9.9 minutos para el primer isómero y 10.3 minutos para el segundo con un factor de resolución mayor a 1La muestra fue procesada utilizando una precipitación de proteí-nas con ACN (0.1% TFA) 2:1 con una posterior centrifugación. Se inyectaron 100 μL del sobrenadante al sistema previamente diluidos en una proporción 10:90 (v/v) con H20 (0.1% TFA). Este método analítico fue validado siguiendo los lineamientos que marca la Norma Oficial Mexicana 177 de la Secretaría de Salud (recuperación absoluta, linealidad, exactitud, precisión, especificidad y estabilidad a corto y largo plazo) en plasma humano. El promedio de recobro fue de 102 % para ambos isómeros en los tres puntos control (30, 140 y 800 μg/mL). El método es lineal en un rango de concentraciones de 10 a 1000 μg/mL y presenta una r 2 de 0.998. Demostró ser preciso y exacto con un coeficiente de variación no mayor al 3% y una desviación absoluta no mayor a 10 % para cada punto control; el límite de cuantificación es de 10 μg/mL y las muestras son estables tanto a corto como a largo plazo (30 días). El método desarrollado es confiable y puede ser utilizado para cuantificar muestras de Iohexol en plasma humano.

23 - evaluaCión del uso de muestras inCluidas en Parafina Para la búsqueda

de biomarCadores ProteómiCosReyes Grajeda, J.P., Romero Romero, S., Lemus Minor, C.,

Castellanos-Tapia, L., Calderón-González, K., Vera Cruz, S., Quintanar-Jurado, V., Rodríguez Dorantes, M., Gallegos-Pérez,

J.L., March, S. & Jiménez-Sánchez. G.

El tratamiento eficiente de diferentes enfermedades requiere de una detección e identificación temprana de biomarcadores con-fiables en tejidos específicos. Descifrar la identidad química de biomarcadores proteómicos es necesario si se desea tener prue-bas cada vez más eficientes, robustas y sensibles con la finali-dad de detectar, monitorear e incluso encontrar nuevos blancos terapéuticos.El análisis proteómico de muestras de tejido fijado en formaldehído e incluidas en parafina puede darnos entrada a un extenso acervo de muestras clínicas bien caracterizadas a nivel histológico y poco exploradas a nivel molecular. Así, nosotros estamos interesados en la estandarización y la búsqueda sistemáticade métodos eficientes de extracción de proteínas (péptidos) para su identificación por espectrometría de masas a partir de muestras incluidas en parafina en búsque-da de nuevos biomarcadores.

24 - análisis ProteómiCo del estrés oxidativo en un modelo de arteriosClerosis

induCido Por la dietaJuan Pablo Reyes, Lyssia Castellanos, Karla Grisel Calderón, José Luis Gallegos, Azucena Jiménez Corona, Abel Moreno,

Gerardo Jiménez-Sánchez, Jaime Mas Oliva.

La arteriosclerosis es la principal causa de morbilidad en países desarrollados y en nuestro país ocupa la segunda causa de muerte. Esta es una enfermedad de etiología multifactorial que involucra la interacción de factores tanto genéticos como medio-ambientales. En este aspecto la dieta, en específico el aumento en las grasas saturadas, juegan un papel importante en la con-tribución a la formación de la placa arteriosclerótica. En este estudio realizamos la búsqueda de patrones de expre-sión diferencial en un modelo animal de arteriosclerosis por métodos proteómicos en geles bidimensionales (DIGE) y espec-trometría de masas.

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Encuentro Internacional de Medicina Genómica Retos en Investigación e Impacto Social

25 - internalizaCión de liPoProteínas de baja densidad evaluada mediante miCroarreglos

Reyes-Grajeda, J.P., Ibarra Abundis, M.Z., Damián Zamacona, S., Moreno, A., Uribe Figueroa, L.,

Mojica Espinosa R., Mas Oliva, J.

El estrés oxidativo es un estado de la célula en la cual se en-cuentra alterada la homeostasis óxido-reducción intracelular, es decir el balance entre prooxidantes y antioxidantes. Este des-balance se produce a causa de una excesiva producción de especies reactivas de oxígeno (EROs) y/o por deficiencia en los mecanismos antioxidantes, conduciendo al daño celular.A la par, cada vez más enfermedades en cuya etiología está involucrado el estrés oxidativo se han descrito, llamando la aten-ción fuertemente la arteriosclerosis.La hipótesis de modificación oxidativa en la arteriosclerosis pre-dice que la oxidación de las lipoproteínas de baja densidad (LDL) es un evento temprano y que las LDL oxidadas contribuyen a la aterogénesis. Nosotros evaluamos mediante microarreglos de expresión la internalización de lipoproteínas nativas y lipoproteínas oxida-das usando una línea celular de músculo liso vascular de aorta humana a tres diferentes tiempos (1, 5 y 24 horas) usando la plataforma Affymetrix.

26 - identifiCaCión de loCi asoCiados a resistenCia a CistiCerCosis exPerimental

murina: análisis en el set de CePas reCombinantes CongéniCas aCb/bCa

y Progenie de la interCruza Con la CePa susCePtible

Rubén Ramírez-Aquino2, Anny Fortin3, Philippe Gros3, Edda Sciutto-Conde2, Gladis Fragoso-González2, Irma Aguilar-

Delfin*1. 1Laboratorio de Enfermedades Multifactoriales-INME-GEN, 2Departamento de Inmunología-IIB/UNAM; 3Centre for

the Study of Host Resistance, McGill University.

El grado de permisividad al crecimiento del parásito Taenia crassiceps en el peritoneo del ratón es un rasgo cuantitativo que se expresa diferencialmente en cepas singénicas. El fenotipo de restrictividad al parásito se evaluó en un conjunto de 36 cepas congénicas recombinantes desarrolladas por el CSHR a partir de A/J y C57BL/6, que han sido genotipificadas para 625 microsatélites. Se definieron dos regiones en los cromosomas 2 y 6 con evidencias de ligamiento a partir del patrón de dis-tribución de marcadores. La cepa AcB55, que mostró los más altos niveles de restrictividad de entre las líneas en las que 7/8 del genoma corresponden al de la parental susceptible A/J, se

utilizó para la intercruza (AcB55xA/J)F2. Los 90 individuos de la progenie con fenotipos más extremos fueron genotipificados con marcadores para las regiones candidatas, encontrándose evidencia de ligamiento al fenotipo de restrictividad para los alelos de B6 en una región de 5 cM localizada en el extremo proximal del cromosoma 2.

27 - sobreexPresión de Hemo-oxigenasa 1 en Células Humanas HePg2

exPuestas a arséniCoF. Centeno, E. Córdova, E.M. Rojo de la Vega, J.L. Cruz, L. Orozco. Laboratorio de Enfermedades Multifactoriales,

Instituto Nacional de Medicina Genómica

La exposición humana a arsénico es un importante problema de salud pública en diferentes regiones donde se encuentran con-centraciones elevadas del metaloide. La exposición a arsénico se ha asociado a un incremento en el riesgo de varios tipos de cáncer y lesiones no malignas en piel. Uno de los principales mecanismos de daño celular generado por la exposición al arsénico es la generación de estrés oxidativo. El factor de trans-cripción Nf2 regula la expresión de genes que codifican para enzimas antioxidantes y detoxificantes. Se ha propuesto a la activación de Nrf2 como un mecanismo importante contra el estrés oxidativo generado por arsénico, sin embargo no se ha definido la participación de los diferentes genes dependientes de Nrf2, por lo que se evaluó el papel de un gen altamente res-ponsivo a Nrf2, la enzima Hemo-oxigenasa 1 (HO-1), en célu-las HepG2. Se encontró una alta expresión del mensajero y de la proteína de HO-1 después de exposición del cultivo celular a arsénico, en una forma dependiente de la dosis. Ensayos de gen reportero mostraron que la activación de HO-1 refleja una alta activación de su promotor en respuesta a arsénico. El silen-ciamiento y la sobreexpresión de Nrf2 indican que este factor de transcripción tienen una participación importante en la acti-vación de HO-1 por arsénico. Por otra parte, el silenciamiento de HO-1 incrementa la toxicidad inducida por arsénico, lo que sugiere que la inducción de la expresión de HO-1 a través de Nrf2 es uno de los principales mecanismos de defensa celular en respuesta al daño inducido por el metaloide.

Retos en Investigación e Impacto Social

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28 - exPresión de yin yang 2 en el CánCer de ovario

Alejandra Beatriz Cervantes Garduño, Magali Espinosa, Jorge Meléndez Zajgla, Vilma Maldonado Lagunas INCan,

Ma. Delia Pérez Montiel INCan

En México, el cáncer de ovario ocupa el tercer lugar en mor-talidad y el segundo lugar en frecuencia de las neoplasias gi-necológicas. El cáncer de ovario es una enfermedad que se diagnostica en etapas avanzadas, por lo tanto es necesario encontrar nuevos marcadores moleculares que permitan un ma-nejo adecuado de esta enfermedad. Las proteínas Yin Yang intervienen en diferentes procesos normales y tumorogénicos de las células. Estos factores regulan diversos genes que participan en procesos como apoptosis, proliferación, metástasis, carcino-genésis, entre otros. La proteína Yin Yang 2 (YY2) es un factor de transcripción que regula la expresión de genes que participan en la regulación del ciclo celular, tumorogenésis, por lo tanto, la proteína YY2 podría servir como marcador pronóstico en el cáncer de ovario. En el presente proyecto se analizó la expre-sión de YY2 en el cáncer de ovario por medio de microarreglos de tejidos. Metodología. Se analizó la expresión de YY2 en muestras de cáncer de ovario por medio de microarreglos de tejido. El análisis de la expresión se hizo con inmunohistoquími-ca. Y el análisis bioestadístico se hizo con el programa Stata. Resultados. YY2 tuvo una expresión significativa en las muestras de tipo seroso y está asociada al subtipo seroso del cáncer de ovario. Conclusiones En el proyecto se analizó la expresión de YY2 en muestras de cáncer de ovario de diferentes subtipos. En el análisis se observó que la expresión de YY2 está asociada al subtipo histológico seroso en 80% de los casos. Este subtipo de cáncer el de peor pronóstico y el más agresivo, por lo tanto la expresión de YY2 podría ayudar a diagnosticar este tipo de cáncer o para determinar el tipo de tratamiento que se la dará a las pacientes.

29 - HaPlotiPos en el reCePtor beta-2-adrenérgiCo Confieren

un alto riesgo Para desarrollar obesidad en la PoblaCión mexiCana

Saldaña-Alvarez Y1, Salas-Martínez MG1,2, Jiménez-Morales S1, Luckie-Duque A3, García-Cárdenas G4, Vicenteño-Ayala H5, Carnevale-Cantoni A1 y Orozco L1,2. 1Lab. de Enferme-dades Multifactoriales-INMEGEN, 2 Posgrado en Ciencias Genómicas,UACM. 3Hospital Regional “1° de Octubre”,

ISSSTE. 4Clínica de Diagnóstico Autorizado, ISSSTE, 5Hospital Regional “Adolfo López Mateos”, ISSSTE.

Actualmente alrededor del 70% de los mexicanos adultos cursa con sobrepeso u obesidad y la prevalencia de ésta en la po-blación infantil es la más alta descrita a nivel mundial, lo que hace de esta entidad un importante problema de Salud Públi-ca. Se ha demostrado que polimorfismos de un sólo nucleótido (SNPs) de genes que codifican para proteínas involucradas en la regulación del gasto energético, particularmente el gen que codifica para el receptor beta adrenérgico 2 (ADRB2), están fuertemente involucrados en la fisiopatología de esta enferme-dad. El objetivo de este trabajo es determinar si SNPs del gen ADRB2 se asocian a la susceptibilidad a padecer obesidad en población mexicana. Se realizó un estudio de asociación en 544 pacientes con obesidad (índice de masa corporal: IMC >30 kg/m2) y 360 controles con un IMC entre 20-25 kg/m2, reclutados de tres instituciones del ISSSTE, en la Ciudad de México. Se analizaron cinco polimorfismos del gen ADRB2 mediante discriminación alélica por el método TaqMan. El equilibrio de Hardy Weinberg (HWE) y asociación de los SNPs y haplotipos fueron evaluados por los paquetes FINETTI, Haploview y EPIINFO, respectivamente. La distribución de los genotipos en pacientes y controles se observaron en HWE. Al comparar las frecuencias alélicas y genotípicas entre casos y controles de los 5 polimorfismos analizados en el gen ADRB2, no se observaron diferencias estadísticamente significativas. En contraste, se encontraron 4 haplotipos que confieren un alto ries-go a padecer obesidad con ORs que van desde 8.44 a 10.19. Nuestros resultados sugieren la presencia de 4 haplotipos en el gen ABRB2 que confieren un alto riesgo a padecer obesidad en población mexicana; todos ellos con valores de OR entre los más altos descritos a la fecha para esta entidad.

30 - abordaje genómiCo del asma en PoblaCión PediátriCa mexiCana

Jiménez-Morales Silvia1, Jiménez-Ruíz Juan Luis1, Huerta-Magaña Ivan2, López-Ley Diana Y2, Gamboa-Becerra R2, Del Río-Navarro Blanca Estela3, Martínez-Aguilar Nora Ernestina1,

Saldaña-Álvarez Yolanda1, Gómez-Vera Javier4, Escamilla-Guerrero G5, Orozco Lorena1,2. 1Lab. de Inmunogenómica y Enfermedades Metabólicas, INMEGEN, SS; 2Posgrado en

Ciencias Genómicas, Universidad Autónoma de la Ciudad de México ; 3Servicio de Alergia, Hospital Infantil de México, SS; 4Servicio de Alergía, Hospital Regional Adolfo López Mateos,

ISSSTE; 5Banco de Sangre, Instituto Nacional de Pediatría. e-mail: [email protected]

Introducción: El asma es una de las enfermedades crónicas de las vías respiratorias más común en niños, de hecho algunos estudios epidemiológicos estiman que la prevalencia de la en-fermedad en la población infantil mexicana puede ser hasta del

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Encuentro Internacional de Medicina Genómica Retos en Investigación e Impacto Social

15%. Ésta, es una entidad multifactorial en donde se ha repor-tado que además del ambiente, polimorfismos de un sólo nu-cleótido (SNPs) en más de 120 genes candidato contribuyen en su desarrollo. Objetivo: Identificar factores genéticos asociados con la susceptibilidad para padecer asma en niños mexicanos. Material y métodos: Se llevó acabo un estudio de asociación de caso-control en el que se incluyeron 240 pacientes de 5-16 años con diagnóstico clínico de asma y como controles 400 donadores de sangre mayores de 18 años y sin anteceden-tes de asma y atopia. Por medio de la técnica 5 exonucleasa (TaqMan), se analizaron 90 polimorfismos localizados en 26 genes candidato. Mediante microarreglos de DNA (Affymetrix V 6.0) se realizó un estudio amplio del genoma incluyendo 120 casos y 120 controles. Para evaluar estructura de la población, equilibrio de Hardy-Weinberg, construir haplotipos, determinar la significancia estadística de los resultados e identificar nuevos loci o SNPs asociados a asma, se utilizaron los programas AD-MIXMAP, FINETTI, HAPLOVIEW, EPIINFO y GOLDEN HELIX. Resultados: Se identificaron SNPs en los genes CHRM2, GATA3 y PDCD1 como nuevos factores de riesgo genético para asma y se confirmó la asociación descrita entre TNFa, IL13, MMP9 e IL17 y la enfermedad. El análisis de microarreglos reveló a ETS1 y ADAMTS19 como nuevos genes candidato. Conclusión: Este estudio aporta evidencias de la complejidad genética del asma en la población pediátrica mexicana. Es necesario confirmar si los genes ETS1 y ADAMTS19 contribuyen a la etiología del asma y evaluar la relación entre los SNPs que no resultaron asociados con la gravedad de la enfermedad.

31 - seCuenCiaCión de nueva generaCión en Plataforma solid: estandarizaCión,

aPliCaCiones y abordajes Con biblioteCas de fragmentos y mate Pair

Miranda-Ortíz Haydee, Hernandez-Morales José Salvador y Carrillo-Sanchez Karol

La estandarización de protocolos para secuenciación de nueva generación en el INMEGEN inició en abril del 2010 en la plataforma SOLiD de Applied Biosystems. Hasta la fecha se han estandarizado 2 tipos de bibliotecas: Fragmentos y Mate Pair, en este trabajo se describen las características de ambas bibliotecas, sus principales aplicaciones, el abordaje que se utilizó para cada una y la capacidad que posee el equipo SOLiD V4.

32 - asoCiaCión del marCador genétiCo de Hi-Persensibilidad a abaCavir Hla-b*5701 Con HCP5

rs2395029(g) en mestizos mexiCanos Francisco Sánchez-Girón*, Beatriz Villegas-Torres, Karla Jarami-llo-Villafuerte, Irma Silva-Zolezzi, Juan Carlos Fernández-López,

Gerardo Jiménez-Sánchez..Instituto Nacional de Medicina Genómica (INMEGEN)

Los portadores del alelo HLA-B*5701 tienen un riesgo elevado de desarrollar hipersensibilidad a abacavir (HA). El tamizaje genético prospectivo de HLA-B*5701 disminuye grandemente o elimina la (HA). En caucásicos, el alelo HCP5 rs2395029(G) está en desequilibrio de ligamiento (DL) completo con HLA-B*5701 (R2=1). Para evaluar la frecuencia del HLA-B*5701 y su DL con el alelo HCP5 rs2395029(G), genotipificamos el pa-nel de 300 mestizos mexicanos del Proyecto de la Diversidad Genómica de los Mexicanos (PDGM). La genotipificación de HLA-B*5701 se hizo por un método de secuenciación. El HCP5 rs2395029(G) se genotipificó con un ensayo TaqMan SNP y se confirmó por secuenciación directa. De la base de datos del PDGM se extrajeron los genotipos de 14 SNPs dentro de la región del HCP5, se pusieron en fase y se analizaron para caracterizar mejor la estructura del DL. La prevalencia de porta-dores de HLA-B*5701 fue de 2.0% y la frecuencia alélica fue de 0.010. El análisis de haplotipos mostró que en los mestizos mexicanos el HLA-B*5701 y el alelo HCP5 rs2395029(G) es-tán en DL completo (r2=1) La genotipificación de un solo SNP es mas fácil, de menor costo y tiempo de proceso comparado con la secuenciación. Estos resultados hacen posible tener un programa de farmacogenética de tamizaje prospectivo basa-do en la genotipificación del SNP rs2395029 para prevenir la HA en pacientes mexicanos que iniciarán tratamiento con abacavir.

33 - estrategia integral Para la identifiCaCión de biomarCadores del CánCer de Hígado

Julio Isael Pérez Carreón1*, Julia Torres Mena1, Ricardo Sánchez Rodríguez1, Mónica de la Luz Cruz1, Gloria Bernal Ramos1, Valeria Quintanar Jurado1, Karol Carrillo Sánchez1, Salvador Hernández Morales1, Haydee Miranda Ortíz1, Juan Pablo

Reyes1, Karla Calderón González1, Laura Uribe Figueroa1, Raúl Mojica Espinosa1, Nelly Patiño Uriostegui1, Rebeca García Ro-mán2, Victoria Chagoya3, Saúl Villa Treviño4 y Jorge Meléndez

Zajgla1. 1INMEGEN, 2UV, 3IFC-UNAM, 4CINVESTAV

Objetivo: La identificación de biomarcadores del cáncer de hí-gado es relevante para generar métodos de tratamiento y/o diagnóstico temprano de la enfermedad y así disminuir la eleva-

Retos en Investigación e Impacto Social

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da mortalidad. Metodología: Con un equipo multidisciplinario de investigación, abordamos el estudio del cáncer hepático en dos perspectivas: 1) Descubrimiento; en modelos animales de hepatocarcinogénesis identificamos cambios moleculares, del transcriptoma y del proteoma, en las lesiones nodulares (pre-tumores) y en el hepatocarcinoma temprano. 2) Validación; en muestras de pacientes con enfermedades hepáticas exploramos la presencia de aquellos posibles cambios moleculares deriva-dos de la investigación en los modelos animales. Resultados: Los modelos en animales recapitulan la progresión del cáncer de hígado de forma muy similar a como ocurre en el ser humano, con la ventaja de poder estudiar las lesiones tumorales tempra-nas. Con las muestras experimentales estamos investigando el transcriptoma y se ha esclarecido lo relevante que es el perfil de expresión de genes de varias rutas metabólicas relacionadas a la S-Adenosilmetionina. Investigando parte del proteoma, iden-tificamos varias proteínas, involucradas en el metabolismo de xenobióticos, que se expresan abundantemente en los tumores. Con las muestras clínicas desarrollamos microarreglos de tejido que nos apoyarán en la validación de los biomarcadores candi-dato. Conclusión: La investigación integral del genoma, el trans-criptoma y el proteoma utilizando la tecnología de vanguardia del Inmegen acelera el descubrimiento de biomarcadores del cáncer. La investigación multidisciplinaría y en equipo con un enfoque integral sobre la patología promete oportunidad de éxito en la investigación.

34 - diseño de un Panel de marCadores genéti-Cos

Para la CorreCCión de estratifiCaCión Pobla-Cional

en estudios de asoCiaCión en PoblaCiones mes-tizas mexiCanas

M. en. C. Juan Carlos Fernández López, Dra. Irma Silva Zo-lezzi, Dra. Claudia Rangel Escareño

Recientemente los estudios de asociación de genoma completo (GWAS, por sus siglas en inglés) han acelerado el progreso en la búsqueda de variaciones genéticas subyacentes a la he-rencia y desarrollo de rasgos y enfermedades complejos, tales como obesidad, diabetes, hipertensión, cáncer, entre otras . Una de varias fuentes de resultados falsos positivos en estudios de asociación genética es la estratificación poblacional. Diver-sos análisis de estructura genética poblacional han demostra-do que los grupos continentales pueden ser identificados si se examinan las diferencias en la frecuencia alélica de variantes genéticas, así como la existencia de miles de marcadores tipo SNP distribuidos a lo largo del genoma con diferencias muy grandes en frecuencia entre estos grupos, los cuales se conocen

como Marcadores Informativos de Origen Ancestral o AIMs. El Instituto Nacional de Medicina Genómica (INMEGEN) cuenta como parte del Proyecto de Diversidad Genómica de Mexica-nos (PDGM) con una base de datos amplia (>1millón de varian-tes genéticas tipo SNP) acerca de la variabilidad genética de poblaciones mestizas e indígenas de México, y cuenta también con la plataforma de análisis genómica Illumina, lo que nos enfrenta a la posibilidad de diseñar un panel de AIMs óptimo para corrección de estratificación poblacional en mexicanos. El objetivo principal es generar un panel de 384 marcadores de origen ancestral (AIMs por sus siglas en inglés) para la correc-ción de estratificación poblacional en estudios de asociación genética para el desarrollo de un microarreglo de genotipifica-ción de mediana capacidad.

35 - sobreexPresión de Proteínas susCePtibles al diseño de fármaCos.

Montoya Gama, K.P., Reyes-Grajeda, J.P. , Uribe Figueroa, L.

Resumen: En abril del 2009, una nueva cepa virulenta de la gri-pe infecto a miles de personas en México y los Estados Unidos y se extendió rápidamente por todo el mundo, declarándose como pandemia por la Organización Mundial de la Salud el 11 de junio del mismo año. Así, para poder enfrentar un problema de tal envergadura, es necesaria la rápida producción de vacunas a escala masiva, ya que ésta es la manera más efectiva hasta la fecha para prevenir la morbilidad y mortalidad a gran escala.Sin embargo, el proceso tradicional de producción de vacunas contra influenza es un proceso lento y laborioso por lo que no cumple con los requerimientos globales de vacunación para reducir una pandemia de influenza. Basados en estas premisas nosotros nos hemos enfocado me-diante técnicas moleculares a la clonación y sobreexpresión de la proteína Hemaglutinina (HA) del virus de la influenza AH1N1, el cual es el principal antígeno de superficie del virus, pudien-do así usarse como blanco terapéutico y/o para el diseño de nuevos fármacos.

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36 - desarrollo de estrategias

de desCubrimiento de biomarCadores Para el diagnóstiCo temPrano de CánCer en méxiCoReyes-Grajeda J.P., Gallegos-Perez J.L., Gutierrez-Najera N., Velazquez D., Ramos-Aboites H., Castellanos L., Calderon-

Gonzalez K., March S., Jimenez-Sanchez G.

Resumen: En México, así como en muchos países del mundo, el cáncer representa uno de los principales problemas de sa-lud pública y una de las principales causas de morbilidad y mortalidad. En la Unidad de Proteómica Médica del Instituto Nacional de Medicina Genómica (INMEGEN), estamos usan-do un abordaje multidisciplinario con aproximaciones variadas para el desarrollo y validación de nuevos métodos enfocados a la búsqueda de biomarcadores, prevención y diagnóstico de cáncer. Todo esto con la finalidad de dar cabal cumplimiento a la mi-sión del instituto: “Contribuir al cuidado de la salud de los mexicanos desarrollan-do investigación científica de excelencia y formando recursos humanos de alto nivel, que conduzcan a la aplicación médica del conocimiento genómico y proteómico a través de una cul-tura innovadora, tecnología de vanguardia y alianzas estratégi-cas, con apego a principios éticos universales”.

37 - exPresion diferenCial de mirnas en PaCientes Con HiPerPlasia ProstátiCa benigna y CánCer de

PróstataAlberto Iván Salido Guadarrama1, Haydee Miranda Ortiz1,

Gustavo Morales Montor2, Dorian Saavedra Briones2, Mauricio Rodríguez Dorantes1.

1Instituto Nacional de Medicina Genómica, 2Hospital General Dr. Manuel Gea Gonzáles

El cáncer de Próstata (CaP) es la segunda causa de muerte de-bida a neoplasia en países industrializados. En México, ~40% de los hombres entre 60 y 69 años sufren de este padecimien-to. A la fecha, el antígeno prostático específico (PSA) sigue sien-do el único marcador molecular empleado como indicador en la identificación y manejo de pacientes con CaP; a pesar de su alta sensibilidad, el PSA presenta una baja especificidad. Es por ello que se tiene la necesidad de encontrar nuevos marcadores que permitan diferenciar la hiperplasia prostática benigna (HPB) del CaP para disminuir las tasas de falsos positivos y mejorar la detección temprana. Se ha establecido la importancia del papel crucial de los microRNAs (miRNAs) y las consecuencias de su alteración en la progresión del cáncer. Estudios recientes han revelado que es posible clasificar diferentes tipos de tumor

con base en su perfil particular de microRNAs. El objetivo de este estudio es evaluar la utilidad potencial de miRNAs en orina como posibles indicadores de la enfermedad prostática. Se colectaron 36 muestras de orina provenientes de pacientes con diagnostico positivo de CaP o HPB (hiperplasia prostática benigna) obtenidas después de la aplicación de examen recta digital (DRE). Se realizó la extracción de RNA total, haciendo uso del kit RNAeasy kit (Quiagen Inc.) de acuerdo a las instruccio-nes del fabricante. La concentración de RNA se determinó por espectrofotometría a 260 nm, utilizando el equipo Nanodrop-1000. Se realizaron reacciones de RT y de pre-amplificación. La cuantificación relativa de miRNAs se llevó a cabo por PCR en tiempo real y el arreglo TaqMan low density array (TLDA) (Applied Biosystems Inc.) que permite medir la expresión simul-tanea de 667 miRNAs. Pare al análisis de datos y estadístico se utilizaron, el software DataAssist™ v 1.0 y Bioconductor. La cuantificación relativa de miRNAs se determino mediante el mé-todo comparativo de Ct (2-∆∆Ct). Las diferencias con un valor-p <0.05 se consideraron como estadísticamente significativos.Después de normalizar los datos de Ct, utilizando como contro-les endógenos, se realizo una prueba t para encontrar diferen-cias significativas en la expresión de microRNAs entre el grupo de CaP y el de HPB. Identificamos un grupo de 21 microR-NAs diferencialmente expresados, con un valor-p= 0.05. De este conjunto, hsa-miR-150 y hsa-miR-328 se encuentran subex-presados y el resto está sobre-expresado. Particularmente hsa-miR-184 ha sido reportado previamente como sobre-expresado en perfiles de expresión de miRNAs en CaP. Otro ejemplo es hsa-miR-100, también sobre-expresado en circulación, como lo reporta Mitchell et.al. 2008. La familia de microRNAs hsa-let7 están relacionados con actividad supresora de tumores en con-diciones fisiológicas normales y han sido reportados como sub-expresados en Cap. De manera interesante, nosotros encontra-mos una regulación a la alta de varios miembros de la familia hsa-let7 (let-7b-c-d-e). Un agrupamiento jerárquico supervisado muestra que el perfil de 21 miRNAs seleccionados permite rea-lizar una separación adecuada entre las 3 muestras del grupo de CaP y las 3 del grupo de HPB. Estos resultados, reflejan el potencial uso de miRNAs obtenidos de muestras de orina como elementos de una firma molecular que permita distinguir a los individuos en riesgo de sufrir de CaP de aquellos con HPB.

38 - unidad de validaCión de biomarCadoresValeria Quintanar Jurado y Julio Isael Pérez Carreón

Instituto Nacional de Medicina GenómicaAbstractLa Unidad de Validación de Biomarcadores apoya la investiga-ción biomédica que se realiza en el Inmegen, ofrece servicios en dos especialidades; la histología y la microscopía. La unidad

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tiene la capacidad de identificar proteínas dentro de su contex-to celular y tisular, cuya presencia o cantidad indique toxicidad o enfermedad en el organismo. Así, los biomarcadores son in-dicadores de los cambios bioquímicos, fisiológicos o morfoló-gicos que se asocian a una patología. La unidad tiene varios alcances experimentales que serán presentados en el cartel.

39 - variaCión genétiCa de gen tCf7l2 en PoblaCión de origen mexiCano

Laura del Bosque-Plata, Berenice Chávez Florencio, Elvia Yamilet Ramírez Vega, Sandra N. Cazañas Padilla, Carolina Acosta Correa, Haydé Miranda Ortiz, Salvador Hernández

Morales, Tulia Monge Cázeres, Alma Cristal Hernández Mondragón, Gerardo Jiménez Sánchez. Instituto Nacional de

Medicina Genómica, México.

Recientemente se ha reportado que variantes en el gene TCF7L2 confieren suscetibilidad a la diabetes tipo 2 (DM2) en múltiples poblaciones, este gene codifica para un factor de transcrip-ción de la vía de señalamiento WNT y previamente se había asociado al cancer. En poblaciones china y mexicoamericana han descubierto diferentes variantes asociadas con el riesgo a la enfermedad de las inicialmente reportadas en población caucásica, como lo es el SNP rs290487. Estos reportes mues-tran que en los estudios de asociación es esencial secuenciar el gene completo, particularmente si la cohorte de replicación no es del mismo grupo étnico que la del reporte original, lo que es importante en población mexicana, la cual tiene patrones genéticos, demográficos y de mestizaje complejos, además de poblaciones aisladas como los indígenas. Se analizaron 30 mestizos mexicanos del Proyecto de Diversidad Genómica de los Mexicanos y tres poblaciones indígenas: 30 zapotecoas, 60 mazatecos y 32 nahuas en 17 exones del gene TCF7L2. En los resultados iniciales hemos identificado patrones complejos de variación en microsatélites y nuevas variantes en el gene TCF7L2, algunas de estas variantes tienen mayor frecuencia en algunos grupos indígenas en México. Estas variantes se tienen que analizar en un estudo de asociación (casos-controles) en población mexicana para saber si están asociadas a DM2.

40 - identifiCaCión ProteómiCa de biomarCadores de nefroPatía diabétiCa

Laura del Bosque Plata1, Nora Gutierrez Nájera1, Sendi Rafael Adame García1, Alejandro Treviño Becerra3, Clemente Meza Coria3, Guillermo Mendoza Hernández2, Jose Luis Gallegos

Pérez1, Gerardo Jiménez Sánchez1. 1Instituto Nacional de Medicina Genómica, 2Universidad Nacional Autónoma de

México y 3Hospital Juárez of México

La insuficiencia renal por nefropatía diabética (ND) es la prime-ra causa de insuficiencia renal (IR) en México. Entre los factores de riesgo para la IR se encuentran la susceptibilidad genética, la hipertensión arterial, la proteinuria y la hiperfiltración. El daño renal es mediado por glicosilación de proteínas, proteinuria y alteraciones hemodinámicas secundarias a hipertensión arterial y autorregulación deficiente. Los pacientes presentan síntomas clínicos, como son presión sanguínea alta, proteinuria, disminu-ción progresiva de la filtración glomerular y eventos cardiovas-culares; un incremento de la proteinuria es uno de los primeros signos de la existencia de la ND, la cual se desarrolla en etapas caracterizadas por hiperfiltración, seguida por microalbuminu-ria y uremia. No existen predictores de la ND. Las herramientas proteómicas han sido aplicadas para explorar la complejidad de los mecanismos asociados con ND y para identificar nuevos biomarcadores y blancos terapéuticos. Como estrategia inicial en la búsqueda de biomarcadores tempranos de ND usamos métodos de shotgun y electoforesis bidimensional, analizando pooles de tres grupos: grupo 1 (control), sin DT2, albumina y creatinina urinarias normales, grupo 2: con DT2, albuminuria y creatinina normales y grupo 3: con DT2, albuminuria > 7.6 mg/L, creatinina, normal o > 1.3 mg/dL. Los resultados preli-minares mostraron varias proteínas diferenciales, entre ellas hay algunas expresadas exlusivamente en el grupo de diabéticos, la mayoría de ellas pertenecen al metabolismo celular y a la respuesta inmune.

Nota: El contenido de los resúmenes es responsabilidad de los autores.

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Notas

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