Rendimiento potencial de materiales para un ambiente...
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Rendimiento Potencial deMateriales para un AmbienteEspecífico
Hernán Mauricio Romero, Ph.D. Coordinador del Programa de Biología y Mejoramiento
CenipalmaProfesor Asociado Departamento de Biología
Universidad Nacional de Colombia
Fruto racimo
Mesocarpio/FrutoAceite/Mesocarpio
Número de racimos
Peso de racimo
RFF ARX
PA
Altura
Longitud de raquis
C= (R0 x RI x E x IC) x (T x P)C: Rendimiento agronómico de la especie cultivada.
R0: Radiación solar fotosintéticamente activa (RFA) que incide en el dosel.
RI: Fracción de RFA interceptada por el dosel.
E: Eficiencia fotosintética del cultivo, normalmente expresada como unidad de materia seca producida por unidad de RFA. También conocida como Uso Eficiente de la Radiación Solar (UERS).
IC: Indice de cosecha, expresado como la relación entre el rendimiento agronómico y el rendimiento biológico de un cultivo.
T: Temperatura media del aire, durante el periodo de crecimiento
P: Precipitación, o en su defecto cantidad de agua disponible para aplicar en forma de riego.
LIMITACIONES
Toxicidad de aluminio
Déficit hídrico
Inundaciones
Altas temperaturas
Plagas
Enfermedades
Años de producción
AAR Deli x Ghana Deli x Nigeria Corpoica
DAMI 103-101 DAMI 104-404 DAMI 114-112 FELDA
GOLDEN HOPE GUTHRIE IOI IRHO 1001
IRHO 1401 IRHO 2528 UNIPALM Y22683 UP
RF
F (
ton/h
a)
Rendimiento de materiales comerciales para un ambiente específico
Rendimiento de aceite potencial en materiales comerciales
0
2
4
6
8
10
12
Ton
ela
das
(ha/
año
)
Toneladas de aceite por hectarea (año)
0
5
10
15
20
25
30
35
RF
F (
To
n/h
a)
RENDIMIENTO ANUAL (RFF)Z. Oriental Plantación A
1001 AAR FELDA GH GUTHRIE IOI UP
0
5
10
15
20
25
30
35
RENDIMIENTO ANUAL (RFF)Z. Central CEPDV
Año 1 Año 2 Año 3 Año 4 Año 1 Año 2 Año 3 Año 4
Mismos materiales diferentes productividades
Productividad y déficit hídrico anual (IRHO)
6
10
14
18
22
26
0 200 400 600 800
Déficit hídrico anual
RF
F (
t/h
a añ
o)
(Caliman and Southworth, 1998)
Producción de un mismo material (LM2T x DA10D) en tres diferentes zonas con diferentes climas, palmas de 6 a 10 años
Aek Kwasan
Indonesia
La Me, Costa
de Marfil
Akpadanou
Benin
Déficit hídrico anual (mm)
RFF (Kg. / palma año)
No. racimos año
Peso de racimos (Kg.)
% TEA
% Frutos / racimo
% Mesocarpo / fruto
% Aceite / racimo
50
205
16.6
12.4
22.5
61
79
54
350
110
10.4
10.0
20.4
60
78
52
550
50
6.0
8.2
21.8
60
78
55
(Henson, 1998)
Efecto del déficit hídrico en E. guineensis e híbrido interespecíficoOxG en diferentes épocas del año con y sin riego
0
2
4
6
8
10
12
14
16
Seca Transición Húmeda Seca Transición Húmeda
Guineensis Hibrido
CON RIEGO
A (
(µm
ol
CO
2 /
m2*s
g)
0
2
4
6
8
10
12
14
16
Seca Transición Húmeda Seca Transición Húmeda
Guineensis Hibrido
SIN RIEGO
0
1
2
3
4
5
6
7
Seca Transición Húmeda Seca Transición Húmeda
Guineensis Hibrido
CON RIEGO
UE
Af
(µm
ol
CO
2/m
mo
l H
2O
)
0
1
2
3
4
5
6
7
Seca Transición Húmeda Seca Transición Húmeda
Guineensis Hibrido
SIN RIEGO
0
0,5
1
1,5
2
2,5
3
3,5
4
4,5
5
Seca Transición Húmeda Seca Transición Húmeda
Guineensis Hibrido
CON RIEGO
E (
mm
ol
H2
O/m
2s
g)
0
0,5
1
1,5
2
2,5
3
3,5
4
4,5
5
Seca Transición Húmeda Seca Transición Húmeda
Guineensis Hibrido
SIN RIEGO
Cenipalma – Bayona et al., 2016
Ambiente GenotiposAños (2007-2012) Años (2011-2012)
RFF NR PMR AR AMF AF MF FR PMF
Hacienda
Ariguani
No riego
Dami 68,3 10,6 6,3 32,1 56,4 9,6 82,5 69,0 11,8
DxN 86,0 11,7 7,0 29,5 56,1 9,7 79,9 65,7 7,9
Felda 71,4 11,8 5,7 31,8 56,5 10,0 80,8 69,7 9,7
GH 80,2 10,6 7,3 33,4 59,2 8,4 84,1 67,1 10,4
Guthrie 102,1 11,9 8,2 31,0 55,8 8,8 83,6 66,4 8,9
UP 91,4 11,7 7,5 32,5 56,9 7,8 84,1 67,9 11,0
Media 83,2 11,4 7,0 31,7 56,8 9,1 82,5 67,6 10,0
SuramericaRiego a
saturación cada
20 días
Dami 157,9 20,1 8,0 32,1 57,7 9,2 83,9 66,3 13,0
DxN 170,2 20,2 8,2 29,8 58,2 9,6 79,3 64,5 9,5
Felda 157,8 22,2 7,1 31,9 57,8 9,4 81,0 68,0 10,5
GH 130,7 17,0 7,4 30,8 58,1 9,3 82,1 64,7 11,5
Guthrie 141,6 18,3 7,4 31,9 58,7 8,3 84,0 64,7 12,1
UP 150,4 18,4 8,1 32,5 58,2 7,8 85,5 65,1 12,5
Media 151,4 19,4 7,7 31,5 58,1 8,9 82,6 65,6 11,5
Efecto del déficit hídrico en la producción en materiales E. guineensis expuestos a riego y sin riego
Tamizaje de la colección biológica ‘Angola’ de palma de aceite
- Competencia por el agua disponible.
- Disminución de fuentes naturales.
- Escasez de lluvias.
Mejoramiento genético
Tratamientos
• Tensiones hídricas del suelo : -0,042 y -1,0 MPa, durante 30 días.
• Materiales: 25 materiales obtenidos de cruzamientos “Angola”.
• DCA: En arreglo factorial, 25 materiales y 2 condiciones de humedad edáfica.
No CódigoProgenitor
femenino
Progenitor
masculino
1 1.1.1.11 1-1 1-11
2 1.4.1.8 1-4 1-8
3 1.8.1.8 1-8 1-6
4 1.9.1.2 1-9 1-2
5 1.9.1.5 1-9 1-5
6 2.3.2.6 2-3 2-6
7 2.4.1.2 2-4 1-2
8 3.3.1.13 3-3 1-13
9 3.10.1.4 3-10 1-4
10 3.4.2.3 3-4 2-3
11 3.4.3.3 3-4 3-3
12 3.5.1.8 3-5 1-8
13 3.8.1.14 3-8 1-14
14 3.8.2.2 3-8 2-2
15 3.9.3.9 3-9 3-9
16 4.1.1.7 4-1 1-7
17 4.1.3.5 4-1 3-5
18 5.2.1.8 5-2 1-8
19 5.9.1.8 5-9 1-8
20 IRHO1001 1001 na
21 IRHO2501 2501 na
22 IRHO7001 7001 na
23 T1 T 1-1-1 2-8 (Polen 68)
24 T2 T 2-1-1 2-8(Polen 103)
25 T3 T3-3-8 1-9(Polen 68)
na: no aplica por ser material comercial, sin embrago es
Deli x La Mé
Efecto del déficit hídrico en
fotosíntesis
0
2
4
6
8
10
12
14
16
Fo
tosin
tesis
(μ
mo
l C
O2
·m-2
·s-1
)
Capacidad Deficit
CIRAD 1001
CIRAD 2501
CIRAD 7001
1.11.11
1.4.1.8
1.8.1.61.9.1.2
1.9.1.5
2.3.2.6
2.4.1.2
3.10.1.4
3.3.1.1.3
3.4.2.3
3.4.3.3
3.5.1.8
3.8.1.14
3.8.2.2
3.9.3.9
4.1.1.7
4.1.3.55.2.1.8
5.9.1.8T1
T2
T3
0.0
0.5
1.0
1.5
2.0
2.5
3.0
3.5
4.0
4.5
5.0
5.5
8.0 8.5 9.0 9.5 10.0 10.5 11.0 11.5 12.0 12.5 13.0 13.5 14.0
__
__
__
_C
on
dic
ión
de
Dé
fic
it H
ídri
co
__
__
__
_F
oto
sín
tes
is (μ
mo
l C
O2m
-2s
-1)
Fotosíntesis (μmol CO2m-2s-1)
________________Condición de Capacidad de Campo______________
• Secuenciar dos materiales colectados en Diciembre 2013 por Illumina HiSeq2000
• Análisis bioinformáticas: Obtener el perfil de todo transcriptoma y expresión génicapara las muestras de 2011 y 2013
• RT-qPCR: cuantificar genes escogidos y determinar su nivel de expresión bajo de déficithídrico
• Analizar los datos y resultados
Búsqueda de genes relacionados contolerancia a sequía
Incidencia acumulada de PC
31.25
10.00
7.50
21.25
6.25
41.25
0.003.75 1.25
26.25
16.2517.50
17.5020.00
8.75 6.25
0.00
10.00
20.00
30.00
40.00
50.00
60.00
70.00
80.00
90.00
100.00
Inci
de
nci
a ac
um
ula
da
(%
)
Materiales Promedio: 14,69
MATERIALES Incidencia Tiempo Rec Incidencia Tiempo Rec
IOI 84.0 25.6 ±7.5 a 66.2 22.0 ± 10.5 ab
Golden Hope 76.0 23.6 ±8.5 ab 67.3 22.5 ± 8.9 ab
Guthrie 79.0 21.5 ±9.0 bc 74.6 26.7 ± 11.3 a
AAR 72.2 20.8 ±8.3 bc 61.0 19.6 ± 8.3 b
Felda 48.7 19.0 ±9.8 cd 71.8 19.7 ± 8.8 b
UP 52.4 16.2 ±7.9 d 72.3 19.8 ± 9.4 b
BARRANCA DE UPÍA ACACÍAS
Prueba Regional Materiales Malasios – Reacción a PC
Material Incidencia acumulada final (%)
r
Coari x La Mé 83 0,0024
Coari x Pobé 86 0,0020
Patuca 100 0,0060
Pepilla 96 0,0020
Material
Severidad acumulada
final (%)
Grado de severidad
final
rho
Coari x La Mé 52,2 3 0,00024
Coari x Pobé 44,0 3 0,00017
Patuca 98,0 5 0,00063
Pepilla 96,0 5 0,00052
El análisis de las tasas de progreso para laincidencia no encontró diferenciasestadísticas entre materiales de E. guineensisy de Híbrido OxG
El análisis de las tasas de progreso para laseveridad encontró diferencias estadísticasentre materiales de E. guineensis y de HíbridoOxG
Curvas de progreso de Incidencia de PC en dos materiales de E. guineensis e Híbrido OxG
Curvas de progreso de Severidad de PC en dos materiales de E. guineensis e Híbrido OxG
Uso de herramientas epidemiológicas para la evaluación
de la reacción a enfermedades en campo
Búsqueda de fuentes de resistencia a la pudrición del cogollo en la colección biológica de Elaeis guineensis Jacq proveniente de Angola (Angola x Tester).
Metodologías desarrolladas por equipo de fitopatología
Umbráculo Condiciones semi ~ controladas:
HR > 80% y
T° < 35°C
Objetivo: Selección temprana de material Angola resistente a PC
Búsqueda de fuentes de resistencia a la pudrición del cogollo en la colección biológica de Elaeis guineensis Jacq proveniente de Angola (Angola x Tester).
Revisión de Lesiones
CENSO PRE~INOCULACIÓN (11-02-16)R1 R2 R3 R4 R5 R6 R7 R8 R9 R10
10 61 14 3 9 9 3 9 49 3
21 65 20 124 19 15 133 34 56 5
70 94 34 205 37 29 147 223 153 8
95 96 38 53 53 153 246 176 29
186 108 41 69 54 174 250 178 67
306 121 49 73 96 186 272 192 71
159 52 93 104 197 215 74
174 56 94 108 210 220 75
182 74 114 138 215 229 78
259 84 115 141 216 241 89
294 85 134 145 229 243 97
304 89 159 224 241 271 122
370 96 178 285 247 1 125
103 181 295 265 X control ↑ 138
110 193 309 272 146
111 197 319 274 153
114 208 501 360 164
117 245 167
126 253 182
147 281 186
163 200
173 208
176 210
178 231
180 234
185 250
188 251
192 255
219 261
220 263
225 287
241 293
243 300
244 312
255 313
265 315
266 497
269 503
273
280
289
291
292
303
306
314
327
370
6 13 48 3 20 17 17 6 13 38 Palmas / repetición
2.3 4.9 18.3 1.1 7.6 6.5 6.5 2.3 4.9 14.4 % / Repetición
181 >> total de plantas con PC o evidencia pre-inoculación
6.9 >> % de plantas con síntomas o evidencia de PC Pre-inoculación
CENSO PRE~INOCULACIÓN (11-02-16)
Plantas con síntomas o evidencia de PC desde vivero:
R1 R2 R3 R4 R5 R6 R7 R8 R9 R10
6 13 48 3 20 17 17 6 13 38
Porcentaje de plantas con síntomas o evidencia de PC por Repetición:
R1 R2 R3 R4 R5 R6 R7 R8 R9 R10
2.3 4.9 18.3 1.1 7.6 6.5 6.5 2.3 4.9 14.4
181 >> Total de plantas síntomas o evidencia de PC, pre-inoculación en el montaje 1
6.9 >> % de plantas con síntomas o evidencia de PC Pre-inoculación en el montaje 1
• 2630 Plántulas dentro del montaje 1
• Se realizó un censo de PC previa inoculación
Resultados parciales:
2630 Plántulas
263 códigos evaluados
10 Repeticiones
66 códigos con lesiones
• 2.5% de infección en la inoculación 1• La repetición 7 fue usada como control sin
inoculación
Qué tenemos
OR
TE
T 1
OR
TE
T 2
8
OR
TE
T 3
3
OR
TE
T 3
4
OR
TE
T 3
5
OR
TE
T 5
7
Gráfico ANOM para INCIDENCIA
Con 99% Límites de Decisión
0
10
20
30
40
50
Med
ia
LDS=33,33LC=19,26LDI=5,18
24 hpi: 143 genes (DE) – 41 Genes Patogenicidad
ID log2FoldChange Name Respuesta Patógeno
Eg01_g001950 2,203028954 V-type proton ATPase subunit b
Eg01_g003180 3,134160484 Putative O-acyltransferase WSD1 SI
Eg01_g006290 2,121051247 Ethylene-responsive transcription factor ERF023 SI
Eg01_g007670 2,023510545 Calceneurin B-like protein CBL CIPK 26 SI
Eg01_g011450 2,002952554 Elongation Factor EF1
Eg01_g013840 2,257468086 Uncharacterized oxidoreductase
Eg01_g014400 2,084185544 Protein TIFY 10A-like SI
Eg02_g000810 2,45084184 Probable protein phosphatase
Eg02_g003120 2,085498078 Probable tyrosine-protein phosphatase
Eg02_g006960 2,493238077 Putative Serine/theorine protein kinase SI
Eg02_g008410 -2,052803003 Eukarytic translation initiarion factor 4E-1
Eg02_g010030 2,116389484 Thioredoxin domain-containing protein 9 homolog SI
Eg02_g013410 2,866389435 Histone-lysine N-methyltransferase ASHR3
Eg03_g003860 2,262142528 Putative uncharacterized protein
Eg03_g007980 2,319963412 Probable glutathione peroxidase 4 SI
Eg03_g008390 2,577811616 kinesin-4-like
Eg04_g001560 3,140605996 Putative Uncharacterized mitochondrial protein
Eg04_g002030 2,019511081 GATA transcription factor 16-like
Eg04_g002650 2,541031927 Transport inhibitor response 1-like protein SI
72 hpi: 350 DE, 85 genes patogenicidad
ID log2FoldChange Name Rta Patógeno
Eg01_g001130 2,232520166 Predicted GPI-anchored protein 58
Eg01_g001180 2,86066227 ATP synthase subunit d, mitochondrial
Eg01_g002610 2,792029337 Probable inositol oxygenase
Eg01_g002830 2,44361435 Putative Acid phosphatase 1 SI
Eg01_g003180 2,442941537 Putative o-ayltransferase WSD1 SI
Eg01_g003720 2,674163329 Peroxidase 4
Eg01_g003730 2,339468271 peroxidase P7-like
Eg01_g006290 2,943527663 Disease resistance protein (TIR-NBS-LRR class) family SI
Eg01_g007330 2,841070249 Pathogenesis-related SI
Eg01_g007610 2,225726165 robable carboxylesterase 17
Eg01_g008390 2,070869783 Glycosyltransferase family 61
Eg01_g010990 2,034477587 Root phototropism protein 3 RPT3
Eg01_g012530 2,203554945 Lipid transfer protein LTP 3 SI
Eg01_g012740 2,297935566 Pectinesterase 31
Eg01_g013840 2,286282025 Uncharacterized oxidoreductase
Eg01_g015220 2,135161374 Leucine-rich repeat protein kinase SI
Eg01_g015320 3,005924569 Uncharacterized protein
Eg01_g015840 2,826088018 MACPF domain-containing protein
Eg01_g015930 2,319782718 Uncharacterized protein
Eg01_g016550 2,028708189 Putative serine/threonine kinase BR1 SI
Eg01_g016770 2,651917632 Disease resistance protein (TIR_NBS_LRR) SI
Eg01_g017770 2,869026 Transcription factor bHLH61 isoform 1 SI
120 hpi: 300 genes DE, Genes patogenicidad 68
ID log2FoldChange Name Rta Patogeno
Eg01_g001180 2,04720188ATP synthase subunit d, mitochondrial
Eg01_g002830 2,305148682Putative Acid phosphatase 1 SI
Eg01_g003720 2,377466611Peroxidase 4
Eg01_g004360 2,080518879GDSL esterase/lipase SI
Eg01_g006290 2,723940231Ethylene-responsive transcription factor ERF023-like SI
Eg01_g011630 2,33359089754S ribosomal protein L12, mitochondrial-like
Eg01_g012510 2,390175588Putative Cyclic dof factor 2
Eg01_g012530 2,39675299Hypothetical protein
Eg01_g012740 2,036138947Pectinesterase 31 SI
Eg01_g013640 2,441324331MLO 6 SI
Eg01_g013840 2,249800285Hypothetical protein
Eg01_g015840 2,483513962Uncharacterized protein
Eg01_g015930 2,230912487proline-rich receptor-like protein kinase PERK2 SI
Eg01_g016770 2,730981309Disease resistance protein (TIR_NBS_LRR) SI
Eg01_g017770 2,852146671Transcription factor bHLH61 isoform 1
Eg02_g005860 2,048561743Calcineurin B-like protein 3 SI
Eg02_g007200 2,426473003Uncharacterized protein
Eg02_g010030 2,379192476Thioredoxin domain-containing protein 9 homolog SI
Eg02_g011190 2,0422460443-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase
Eg02_g013410 2,264608317Histone-lysine N-methyltransferase ASHR3
Híbrido OxG
Elaeis oleifera Elaeis guineensis
Híbrido interspecífico Oleífera x Guineensis
CoaríManaosTaishaBrasil
LaMéAVROSCompactaEkonaDjongo
Generalidades
Híbridos OxGPolinización asistida:
Incremento en los costos de producción
Dependencia del polen E. guineensis
Deficiencias en calidad de las aplicaciones
ANA 300 [2] ANA 300 [2-3] ANA 300 [1-3-4] ANA 300 [1-2-3-4] ANA 600 [1-2-3-4]
Efecto de la aplicación de ANA en el peso y conformación de racimos en el material híbrido OXG Coarí x LaMé
Peso medio de racimos (kg)
17.0 16.815.9 15.6 15.5
14.914.3 14.2 14.2
13.2 13.0 12.8 12.8 12.6 12.6 12.511.5
11.0 10.6
9.2
6.4
0
2
4
6
8
10
12
14
16
18
1,2,3,4 2 1,2,3,4 1,2,3,4 2,3,4 1,2,3,4 1,2,4 2,4 2 1,2,3 2,3 1,4 3,4 1,3 1,2 1,3,4 1 2 3 4 1,2,3,4
ANA 600 Cen. ANA 300 ANA 400 ANA 300 ANA 200 ANA 300 ANA 300 Trad. ANA 300 ANA 300 ANA 300 ANA 300 ANA 300 ANA 300 ANA 300 ANA 300 ANA 300 ANA 300 ANA 300 Agua-Carrier
Pe
so (
Kg)
Concentración y momento de aplicación
Peso de racimo (Kg)
Momentos de aplicación
Pre-antesis Antesis Post-antesis Post-antesis
EF-603 EF-607 7 días 14 días
1 2 3 4
Aceite a racimo
Momentos de aplicación
Pre-antesis Antesis Post-antesis Post-antesis
EF-603 EF-607 7 días 14 días
1 2 3 4
30.629.5 29.5 29.2 28.7 28.7 28.6 28.5 28.1 28.0 28.0 28.0 27.9 27.8 27.7 27.3
25.9 25.9 25.523.8
19.0
0
5
10
15
20
25
30
35
2,3 1,2,3,4 1,2,3,4 2,3,4 1,2,3 1,2,3,4 2 1,2,4 2 3,4 1,2 2,4 1,2,3,4 1,3 1,4 1,3,4 1 3 2 4 1,2,3,4
ANA 300 ANA 300 ANA 200 ANA 300 ANA 300 ANA 400 Cen. ANA 300 ANA 300 ANA 300 ANA 300 ANA 300 ANA 600 ANA 300 ANA 300 ANA 300 ANA 300 ANA 300 Trad. ANA 300 Agua-Carrier
AR
(%
)
Concentración y momento de aplicación
Aceite a racimo (%)
Contenido de aceite a racimo (kg aceite/racimo)
Momentos de aplicación
Pre-antesis Antesis Post-antesis Post-antesis
EF-603 EF-607 7 días 14 días
1 2 3 4
4.8 4.7 4.6 4.5 4.5 4.44.1 4.1 4.0 4.0
3.7 3.6 3.6 3.5 3.5 3.53.1 3.1
2.8
2.3
1.3
0
1
2
3
4
5
6
1,2,3,4 1,2,3,4 2 1,2,3,4 2,3,4 1,2,3,4 1,2,4 2,3 2,4 1,2,3 2 1,3,4 3,4 1,4 1,3 1,2 2 1 3 4 1,2,3,4
ANA 300 ANA 600 Cen. ANA 400 ANA 300 ANA 200 ANA 300 ANA 300 ANA 300 ANA 300 Trad. ANA 300 ANA 300 ANA 300 ANA 300 ANA 300 ANA 300 ANA 300 ANA 300 ANA 300 Agua-Carrier
CA
(kg
. ace
ite
/ra
cim
o)
Concentración y momento de aplicación
Contenido de aceite a racimo (kg de aceite/racimo)
Resultados Fase III
ANA = 600 ppm produjo racimos de un peso medio y contenido de aceite superior al obtenido mediante polinización asistida tradicional
ANA (> 300 ppm) estimuló la formación total de frutos (0 % abortos)
Agua PolenANA 600 [1-2-
3-4]ANA 300 [1-2-
3-4]
GRUPO DE INVESTIGACION• Hernán Mauricio Romero
• Ivan Ayala
• Edison Daza
• Andres Tupaz
• Norman Correa
• Rodrigo Ruiz
• Cristihian Bayona
• Arley Caicedo
• Stephany Guataquira
• Yurany Rivera
• Sophya Millan
• Carmenza Montoya
• Juan Camilo Ochoa
• Mariana Herrera
• Kelly Avila
• Leonardo Araque
• Rodrigo Avila
PROGRAMA DE BIOLOGIA DE LA PALMA Y FITOMEJORAMIENTO