Replicón y Replicación
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Replicación del DNA
Conflicto entre la direccion de lareplicación y la trancripción.
Casi todas las unidades activas detranscripción están orientadas deforma que se expresan en la mismadirección que la horquilla dereplicación que pasa sobre ellas.
Cadena codificante
Cadena templado3’ 5’
5’ 3’
Transcripción
Replicación
Tamaño de los replicones eucarióticos:≈ 40 kb en moscas o levadura - ≈ 100 kb en animales superiores
Tasa de replicación:2,000 pb/min (en bacterias es de 50,000 pb/min)
En una célula somática típica, la fase S dura > 6h
Cada foco contiene >300 horquillas de replicación
ARS = AutonomousReplicating Sequence(levadura)
ORC = Origin RecognitionComplexComplejo de 6 proteínas de400 kDa.
Al contar el número de sitios a los que se uneORC, se puede estimar que hay unos 400orígenes de replicación en el genoma delevadura.
Esto significa que la longitud promedio de unreplicón es de ~35,000 bp.
Un origen puede ser una secuenciade DNA que sirve para iniciar lasíntesis de DNA utilizando comomolde UNA de las cadenas. Laapertura del duplex no conducenecesariamente al comienzo de lareplicación de la otra cadena.
El problema de los replicones lineales:
El problema de los replicones lineales; otras soluciones:
� Convertir el replicón lineal en una molécula circular o multimérica (T4 y Lambda)
� Crear un horquilla en el extremo, de forma que no haya un extremo libre (mitocondrias deParamecium)
� Tener un extremo variable y un mecanismo para añadir o eliminar unidades (cromosomaseucarióticos)
Los genomas de cadena sencilla se generan para laconjugación bacteriana
La maquinaria de replicación
Los puntos GATC del origen continúan hemimetilados unos 13 min después de la replicación
El promotor del gene dnaA también muestra retraso antes de empezar a metilarse
SeqA se une al DNA hemimetilado con más fuerza que al DNA completamente metilado. Las mutantesseqA inician la replicación del DNA demasiado pronto, acumulando así un número excesivo de orígenes
Tasa de errores en baterias:10-8-10-10
Helicasa (DnaB)
Pol III α
Primasa (DnaG)
Pol III β
Pol III γδ
Pol III τ
RNA primer
dsDNA
ssDNA
Telómeros
Todas las secuencias teloméricas tienen la fórmula Cn(A/T)m, n>1 y m=1 a 4
En células animales, el tamaño promedio del asa es de 5-10 kb