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Rol del laboratorio en infecciones respiratorias

(contexto COVID-19)Dr. Cristian Pérez Corrales

ARSDT-CNLCCCSS – 2020

Dr. Cristian Pérez C.

¿Por qué?

• Comprensión de patrones de transmisión

• Gravedad

• Características clínicas

• Factores de riesgo de infección

• Afección en poblaciones• General

• Trabajadores de salud

• Entorno familiar

• Ambiente

Reducidas

https://www.who.int/emergencies/diseases/novel‐coronavirus‐2019/technical‐guidance/early‐investigationsDr. Cristian Pérez C.

En contextoEvidencia (>100 000 casos) COVID-19 Influenza

Presentación clínica Asintomática, moderada, grave, muerte

Asintomática, moderada, grave, muerte

Transmisión Contacto, gotículas, fomites Contacto, gotículas, fomites

Prevención Higiene de manos, protocolo de estornudo

Higiene de manos, protocolo de estornudo

Intervalo de serie (tiempo entre casos)

5-6 días 3 días

Transmisión pre-sintomática ± 48 horas* 3-5 días

R0 2-2.5* 1.2-1.6

Grupos más afectados Adultos > 55 años + Factores de riesgo

Niños, embarazadas, adultos con factores de riesgo

Mortalidad 3-4 % * 0.1%

* Información en desarrollo.

WHO. Coronavirus COVID-19 Situation report - 46Dr. Cristian Pérez C.

Rol del laboratorio

Recepción y atención de pacientes

Toma de muestras

Embalaje y transporte de muestras

Procesamiento de muestras

Comunicación de resultados


Recepción y atención de pacientes

• Ventanilla• Barrera de contención

• >1 m

• Higiene de manos

• Limpieza de superficies

• Bolsas de bioseguridad

• Manejo de derrames

• EPP disponible

• Comunicación


Derrames

Pequeño

Colóquese guantes

Limpie con toalla con cloro 0.5%

Descarte toalla y limpie

Retire guantes

Higiene de manos

Grande

Colóquese guantes

Cubra con toallas

Agregue cloro 0.5% de fuera hacia adentro

Deje por 10 minutos

WHO, 2004. Laboratory Biosafety Manual. 3rd Ed. 2004.WHO. 2020. Laboratory biosafety guidance related to coronavirus disease 2019 (COVID-19): interim recommendations

Otros desinfectantes:Etanol 70%Peróxido 0.5%Sales de aminio 4°


Recolección y manipulación de muestras• Toda muestra → POTENCIALMENTE INFECCIOSA

• Personal:• Equipo de protección personal completo en sospechosos para toma de hisopado

• Gafas• Guantes• Gabacha manga larga• N95• Higiene de manos

• Ambiente• Desinfección de áreas antes y después del procedimiento• Procedimiento de descontaminación de derrames

• Transporte:• Embalaje triple

• Otras muestras• Mascarilla quirúrgica en paciente y en trabajador• EPP estándar

OMS, 2020. Prevención y control de infecciones durante la atención sanitaria de casos en los que se sospecha una infección por el nuevo coronavirus (nCoV): orientaciones provisionales


Antes de colocar su EPP recuerde• Colocar en toma de muestra

• Bolsa para descarte del EPP

• Materiales para el embalaje

• Pilot/Rotulador

• Etiquetas adhesivas

• Alcohol

• Desinfectante en aerosol si está disponible

• Toallas de papel

• DOBLE GUANTE

• Cloro


Tipos de muestra y transporte

WHO. 2020. Laboratory testing for coronavirus disease 2019 (COVID-19) in suspected human cases

Tipo de muestra Material de recolección Almacenamiento Temperatura de transporte

Hisopado nasofaríngeo Hisopo flocado, Dacrón 2-8 °C 2-8 °C

LBA Contenedor estéril 2-8 °C 2-8 °C

Aspirado nasofaríngeo Contenedor estéril 2-8 °C 2-8 °C


Toma de muestra



Necesidades de hisopos:1. Supervisor regional. 2. SR consolida y envía a la Coordinación Nacional LC.3. CNLC coordina con la Dirección de Red4. DR coordina con ALDI

Muestras (v 7)Aspirado NasofaríngeoHisopado nasofaríngeoLBA y otros

Lineamientos Nacionales para la Vigilancia de la enfermedad COVID-19. v 7.0

Tipos de Muestra (v 7)

Embalaje de muestras para transporte• Muestra identificada

• Bolsa hermética

OMS, 2020. Prevención y control de infecciones durante la atención sanitaria de casos en los que se sospecha una infección por el nuevo coronavirus (nCoV): orientaciones provisionales PAHO 2020. Directrices provisionales de bioseguridad de laboratorio para el manejo y transporte de muestras asociadas al nuevo coronavirus 20191 (2019-nCoV)


OMS, 2020. Prevención y control de infecciones durante la atención sanitaria de casos en los que se sospecha una infección por el nuevo coronavirus (nCoV): orientaciones provisionales PAHO 2020. Directrices provisionales de bioseguridad de laboratorio para el manejo y transporte de muestras asociadas al nuevo coronavirus 20191 (2019-nCoV)


Procesamiento de las muestras

• Procedimientos de rutina• Hacer evaluación de riesgo

• Determinar puntos críticos de riesgo

• Mantener precauciones estándar en• Manipulación

• Riesgo de salpicaduras

• Riesgo de derrame

• Procedimientos específicos• Centrifugación

• Apertura de tubos

• Introducción a equipos

• Microscopía

WHO. 2020. Laboratory biosafety guidance related to coronavirus disease 2019 (COVID-19). Dr. Cristian Pérez C.

Hospital Escalante Pradilla

AS Corredores

Hospital Tony Facio

AS Talamanca

AS La Cruz

AS Paraíso

AS Los Chiles

AS Los Santos

AS Oreamuno

Hospital Max Peralta

Hospital Enrique Baltodano

AS Barranca

Hospital Monseñor Sanabria

AS La Fortuna

Hospital San Carlos

AS Pavas

Hospital San Vicente Paul

Regional Hospital

Primary Care Center

Especialized Hospital

National Influenza Center (Inciensa)

CNI, CNR

Virología,

Inciensa

Fortalecimiento de la red Institucionalde vigilancia de virus respiratorios basada en

laboratorio


AS Corredores

Hospital Tony Facio

AS Talamanca

AS Paraíso




CENTROS ccDM


Hosp Villa Neilly

Hospital Tony Facio




Hospital San Carlos

HSRA

Hospital San Vicente Paul

H. Nacional

Niños

Hospital ccDM

CD COVID-19

HSJD

HMex

H Guapiles

Fuente: Dra. Guiselle Guzmán. ASC

ActividadActores / Responsables

Médico tratante

Personal designado

Red de Laboratorios Clínicos CCSS

INCIENSAObservaciones

4. ¿El Laboratorio Clínico del establecimientode salud dispone de diagnóstico molecularpara virus respiratorios?

1. Inicio

2. Identifica un caso sospechoso por COVID-19 e indica toma de muestra.

5. Embala la muestra y la envía al LaboratorioClínico de su red de servicios de salud quedisponga de diagnóstico molecular.

6. Procesa la muestra para diagnóstico devirus respiratorios y coordina el registro delos resultados en el PAHO-FLU con laComisión Local de Vigilancia Epidemiológica.

Si

No

En la solicitud de análisis hacia elLaboratorio de referencia debe indicarse losmedios de contacto del Laboratoriosolicitante para que se les informe de losresultados.

Consultar Guía práctica de trabajo para losLaboratorios Clínicos institucionales para larecepción, toma, embalaje y transporte demuestras respiratorias para análisis de virusrespiratorios.

3. Toma la muestra para diagnóstico de virusrespiratorios.

7. Reporta los resultados al LaboratorioClínico o establecimiento de salud solicitantesegún los medios de contacto indicados en lasolicitud.

La persona designada en el LaboratorioClínico o establecimiento de saludsolicitante debe informar los resultados alepidemiólogo local.

Completa la ficha R85.

Créditos: Ing. Andrey Mora Bermúdez


Médico tratante

Personal designado



11. Procesa la muestra para análisis deCOVID-19 y coordina el registro de losresultados en el PAHO-FLU con la ComisiónLocal de Vigilancia Epidemiológica.

8. ¿El resultado de Laboratorio es positivopara los patógenos analizados?

9. ¿El Laboratorio Clínico dispone de análisismolecular por COVID-19?


En la solicitud de análisis hacia elLaboratorio de referencia debeindicarse los medios de contacto del ode los Laboratorios solicitantes para quese les informe de los resultados.

En caso afirmativo se continúa con larevaloración clínica y abordaje delpaciente, así como la re-valoraciónepidemiológica cuando corresponda.

La persona designada en el LaboratorioClínico o establecimiento de saludsolicitante debe informar los resultadosal epidemiólogo local.

10. Deriva la muestra al INCIENSA o alLaboratorio Clínico de su red de servicios desalud que disponga del análisis COVID-19.

13. ¿Los resultados de la prueba COVID-19son positivos?

En caso negativo continúa con la re-valoración médica y abordaje delpaciente.

Si

No

A

No

Si

14. Remite la muestra al INCIENSA paraconfirmación diagnóstica

Si

NoA

En la solicitud de análisis haciaINCIENSA debe indicarse los medios decontacto de los Laboratoriossolicitantes para que se les informe delos resultados.

B



Médico tratante

Personal designado



17. Continúa con el abordaje del paciente deacuerdo con los protocolos institucionales.De ser necesario se reinicia en la actividad 2.

15. Procesa la muestra y analiza losresultados.


18. Fin

La persona designada en elLaboratorio Clínico oestablecimiento de saludsolicitante debe informarlos resultados alepidemiólogo local.

B

A


Importante

• Actualizar datos en Inciensa:• [email protected]


Nombre de responsable

Teléfono Correo electrónico

Laboratorio

Fortalecimiento de la red de vigilancia de virus respiratorios basada en laboratorio


FilmArray existentes1. Hmex2. HNN3. HSJD4. HSRA5. HEBB6. HMP7. HCG8. HMS

Nuevos FilmArray8. HSC9. H Guápiles10. HTF11. Hciudad Neilly12. HEP13. Hosp Heredia14. Respaldo

COVID-19 CR1. Hmex2. HNN3. HSJD

Diagnóstico molecular

• FilmArray

BioFire Diagnostics. BioMerieux


BioFire Diagnostics. BioMerieuxDr. Cristian Pérez C.

PCR COVID-19

CDC. 2020. Real-Time RT-PCR Panel for Detection 2019-Novel CoronavirusDr. Cristian Pérez C.

Seegene. COVID-19 PanelDr. Cristian Pérez C.


GRACIAS

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