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2015 ESTUDIOS MOLECULARES

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BIOMAKERS es una Institución especializada en estudios genéticos y moleculares para el cáncer y otras enfermedades complejas de la

Argentina y Latinoamérica. Nuestro equipo de profesionales posee una amplia trayectoria en el ámbito científico, médico y de investigación

clínica, características que nos permiten brindar tanto al médico como al paciente un servicio integral de diagnóstico y asesoría molecular.

Desde los inicios, BIOMAKERS mantiene y promueve un compromiso con la Investigación & Desarrollo que se plasma en la búsqueda

sistemática de metodologías de nueva generación para la determinación de nuevos biomarcadores.

BIOMAKERS sienta sus bases como Institución sobre los valores de:

Calidad

Credibilidad

Rigor Científico

Profesionalidad

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ÍNDICE

I. BIOMARCADORES ASOCIADOS A DISTINTAS PATOLOGÍAS 3

a. Biomarcadores en Cáncer de Pulmón 4

b. Biomarcadores en Cáncer Colorrectal 5

c. Biomarcadores en Cáncer de Mama 6

d. Biomarcadores en Cáncer de Tiroides 6

e. Biomarcadores en Melanoma 7

f. Biomarcadores en Tumores del Sistema Nervioso Central (SNC) 7

g. Biomarcadores en Leucemia Mieloide Aguda (LMA) 8

h. Biomarcadores en Leucemia Mieloide Crónica (LMC) 8

i. Biomarcadores en Tumores del Estroma Gastrointestinal (GIST) 9

II. BIOMARCADORES ASOCIADOS A ENFERMEDADES HEREDITARIAS 10

a. Biomarcadores de Cáncer de Mama y Ovario Hereditario (CMOH) 11

b. Biomarcadores en Poliposis Adenomatosa Familiar (PAF) 12

c. Biomarcadores en Síndrome de Lynch (HNPCC) 12

d. Biomarcadores en Neoplasia Endócrina Múltiple (MEN) 12

e. Biomarcadores en Cáncer Gástrico Difuso 13

f. Biomarcadores en Síndrome de Cowden 13

g. Biomarcadores en Alzhéimer 13

h. Paneles en Síndrome de Li-Fraumeni 13

III. PANELES DE BIOMARCADORES 14

IV. BIOMARCADORES ASOCIADOS A TOXICIDAD A DROGAS 16

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BIOMARCADORES ASOCIADOS A DISTINTAS PATOLOGÍAS

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Biomarcadores en Cáncer de Pulmón

Biomarcador Evidencia Tipo Alteración Molecular Implicancia Terapéutica Metodología* Test ID

EGFR De rutina Predictivo Mutaciones Sensibilidad a inhibidores de Tirosina

quinasa (TKI; Afatinib, Gefitinib, Erlotinib) S. Sanger PlEGsa

EML4-ALK De rutina Predictivo Rearreglos Sensibilidad a inhibidores de ALK

(Crizotinib, Ceritinib)

FISH PlEMALfh

IHQ PlEMALih

BRAF Recomendado Predictivo Mutaciones Sensibilidad a inhibidores de BRAF

(Vemurafenib, Dabrafenib)

S. Sanger PlBRsa

qPCR PlBRqp

Fusiones de RET Recomendado Predictivo Rearreglos

Sensibilidad a inhibidores multidiana

tirosina quinasa

(Vandetanib, Sunitinib, Sorafenib)

FISH PlFRETfh

HER2 Recomendado Predictivo Mutaciones Sensibilidad a TKI de segunda generación

(Afatinib) S. Sanger PlHR2sa

ROS-1 Recomendado Predictivo Rearreglos Sensibilidad a inhibidores de ALK

(Crizotinib)

IHQ PlRSih

FISH PlRSfh

cKit Recomendado Predictivo Mutaciones

Sensibilidad a inhibidores multidiana

tirosina quinasa

(Imatinib, Sunitinib, Sorafenib y Nilotinib)

S. Sanger PlCKsa

KRAS Recomendado Pronostico

Predictivo Mutaciones

Sensibilidad a anticuerpos anti-EGFR

(Cetuximab, Panitumumab) y

Pronóstico de enfermedad

S. Sanger PlKRsa

PI3KCA En Investigación Predictivo Mutaciones Resistencia a TKI y anticuerpos anti EGFR S. Sanger PlPIsa

MET En Investigación Predictivo Amplificación Sensibilidad a inhibidores de MET y

resistencia a TKI FISH PlMTfh

DDR2 En Investigación Predictivo Mutaciones Sensibilidad a tirosina quinasas BCR/ABL,

SRC, c-Kit, varias quinasas Eph (Dasatinib) S. Sanger PlDDsa

PD-L1 En Investigación Predictivo Sobreexpresión Sensibilidad a anti-PDL1 y anti-PD1 IHQ PlPDih

PTEN En Investigación Predictivo Sobreexpresión Resistencia a anticuerpos anti-EGFR IHQ PlPTih

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Biomarcadores en Cáncer Colorrectal

Biomarcador Evidencia Tipo Alteración Molecular Implicancia Terapéutica Metodología* Test ID

KRAS De rutina Predictivo Mutaciones Sensibilidad a anticuerpos anti-EGFR

(Cetuximab, Panitumumab)

S. Sanger CcKRsa

qPCR CcKRqp

NRAS De rutina Predictivo Mutaciones Sensibilidad a anticuerpos anti-EGFR

(Cetuximab, Panitumumab)

S. Sanger CcNRsa

qPCR CcNRqp

EGFR De rutina Expresión Expresión Sensibilidad a anticuerpos anti-EGFR

(Cetuximab, Panitumumab) IHQ CcEGih

BRAF Recomendado Predictivo

Pronóstico Mutaciones

Sensibilidad a anticuerpos anti-EGFR

(Cetuximab, Panitumumab). Pronóstico de

enfermedad

S. Sanger CcBRsa

qPCR CcBRqp

MSI Recomendado Diagnóstico Inestabilidad

Microsatelital Diagnóstico de enfermedad Genotipificación CcMSIgn

PI3KCA En Investigación Predictivo Mutaciones

Sensibilidad a anticuerpos anti-EGFR

(Cetuximab, Panitumumab) y

Pronóstico de enfermedad

S. Sanger CcPKsa

qPCR CcPKqp

PTEN En Investigación Predictivo Amplificación Sensibilidad a anticuerpos anti-EGFR

(Cetuximab, Panitumumab) IHQ CcPTih

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Biomarcadores en Cáncer de Mama

Biomarcador Evidencia Tipo Alteración Molecular Implicancia Terapéutica Metodología* Test ID

BRCA1 y BRCA2 De rutina Predictivo Mutaciones somáticas

Sensibilidad a inhibidor de PARP (Olaparib)

NGS MoBA12ng

HER2 De rutina Predictivo Pronóstico

Amplificación Sensibilidad a anticuerpo anti-HER2 IHQ MoHR2fh

FISH MoHR2fh

Receptor de Estrógeno

De rutina Predictivo Pronóstico

Expresión Sensibilidad a terapia hormonal IHQ MoREih

Receptor de Progesterona

De rutina Predictivo Pronóstico

Expresión Sensibilidad a terapia hormonal IHQ MoRPih

Ki-67 De rutina Pronóstico Expresión Marcador de proliferación celular IHQ MoK67ih

p16 De rutina Pronóstico Expresión Diagnóstico de lesiones pre-cancerosas en el TGI

IHQ MoP16ih

Biomarcadores en Cáncer de Tiroides

Biomarcador Evidencia Tipo Alteración Molecular Implicancia Terapéutica Metodología* Test ID

BRAF Recomendado Diagnóstico Mutaciones Carcinoma papilar S. Sanger TrBRsa

qPCR TrBRqp

KRAS Recomendado Diagnóstico Mutaciones Carcinoma papilar, folicular y anaplásico S. Sanger TrKRsa

HRAS Recomendado Diagnóstico Mutaciones Carcinoma papilar, folicular y anaplásico S. Sanger TrHRsa

NRAS Recomendado Diagnóstico Mutaciones Carcinoma papilar, folicular y anaplásico S. Sanger TrNRsa

RET Recomendado Diagnóstico Rearreglos Carcinoma papilar FISH TrRTfh

PAX8 Recomendado Diagnóstico Rearreglos Carcinoma folicular FISH TrPX8fh

RET Recomendado Diagnóstico Mutaciones Carcinoma medular de tiroides S. Sanger TrMRETsa

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Biomarcadores en Melanoma

Biomarcador Evidencia Tipo Alteración Molecular Implicancia Terapéutica Metodología* Test ID

BRAF De rutina Predictivo Mutaciones Inhibidores de BRAF e Inhibiddores de MEK

S. Sanger MlBRsa

qPCR MlBRqp

cKIT Recomendado Predictivo Mutaciones Sensibilidad a inhibidores Inhibidor multidiana tirosina quinasa (Imatinib, Sunitinib, Sorafenib y Nilotinib)

S. Sanger MlCKsa

NRAS En investigación Predictivo Mutaciones Sensibilidad a la combinación Sorafenib-Tivantinib

S. Sanger MlNRsa

Biomarcadores en Tumores del Sistema Nervioso Central (SNC)

Biomarcador Evidencia Tipo Alteración Molecular Implicancia Terapéutica Metodología* Test ID

1p19q De rutina Diagnóstico Rearreglos Diagnóstico de oligodendrogliomas FISH Sn1p19qfh

IDH1/2 Recomendado Diagnóstico Mutaciones Diagnóstico de gliomas grado II y III y en GBMs secundarios

S. Sanger SnIDsa

MGMT Recomendado Predictivo Metilación promotor Respuesta a los agentes alquilantes Metilación / S. Sanger SnMGmtsa

10q23 En investigación Diagnóstico Deleción Diagnóstico de glioblastomas FISH Sn10q23fh

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Biomarcadores en Leucemia Mieloide Aguda (LMA)

Biomarcador Evidencia Tipo Alteración Molecular Implicancia Terapéutica Metodología* Test ID

AML1/ETO De rutina Pronóstico Rearreglos Factor de pronóstico favorable qPCR LmaAMqp

BCR-ABL1 De rutina Pronóstico Rearreglos Factor de pronóstico desfavorable qPCR LmaABqp

CBFB/MYH11 De rutina Pronóstico Rearreglos Factor de pronóstico favorable qPCR LmaCMqp

CBFB/MYH11 De rutina Pronóstico Rearreglos Factor de pronóstico favorable FISH LmaCMfh

CEPBA De rutina Pronóstico Mutaciones Factor de pronóstico favorable S. Sanger LmaSEPsa

cKIT De rutina Pronóstico Mutaciones Factor de pronóstico favorable S. Sanger LmaCKsa

20q De rutina Pronóstico Deleción Factor de pronóstico favorable FISH Lma20qfh

-5, 5q-, -7, 7q- De rutina Pronóstico Rearreglos Factor de pronóstico desfavorable FISH Lma5q7q

11q23 -non t(9;11)

De rutina Pronóstico Rearreglos Factor de pronóstico desfavorable FISH Lma11q23fh

FLT3 De rutina Pronóstico Mutaciones Factor de pronóstico desfavorable S. Sanger LmaFLsa

NPM1 De rutina Pronóstico Mutaciones Factor de pronóstico favorable S. Sanger LmaNPMsa

PML/RARA De rutina Pronóstico Rearreglos Factor de pronóstico favorable qPCR LmaLqp

IDH1/2 De rutina Pronóstico Mutaciones Factor de pronóstico favorable S. Sanger LmaIDsa

Biomarcadores en Leucemia Mieloide Crónica (LMC)

Biomarcador Evidencia Tipo Alteración Molecular Implicancia Terapéutica Metodología* Test ID

BCR-ABL1 De rutina Diagnóstico Predictivo

Rearreglos Sensibilidad a inhibidores multidiana tirosina quinasa (Imatinib)

qPCR LmcAB922qp

BCR-ABL1 De rutina Diagnóstico Predictivo

Mutaciones Sensibilidad a inhibidores multidiana tirosina quinasa (Dasatinib, Nilotinib y Bosutinib)

qPCR LmcABqp

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Biomarcadores en Tumores del Estroma Gastrointestinal (GIST)

Biomarcador Evidencia Tipo Alteración Molecular Implicancia Terapéutica Metodología* Test ID

cKIT Recomendado Predictivo Mutaciones Sensibilidad a inhibidores multidiana tirosina quinasa (Imatinib)

S. Sanger GiCKsa

PDGFR-α Recomendado Predictivo Mutaciones Sensibilidad a inhibidores multidiana tirosina quinasa (Imatinib)

S. Sanger GiPGsa

BRAF Recomendado Pronóstico y Predictivo

Mutaciones

Alto riesgo de malignidad. Sensibilidad a inhibidores multidiana tirosina quinasa (Imatinib)

S. Sanger GiBRsa

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BIOMARCADORES ASOCIADOS A ENFERMEDADES HEREDITARIAS

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Biomarcadores de Cáncer de Mama y Ovario Hereditario (CMOH)

Biomarcador Evidencia Tipo Alteración Molecular Metodología * Test ID

BRCA1 y BRCA2 De rutina Diagnóstico Mutaciones NGS MhBA12ng

Paneles de biomarcadores Evidencia Tipo Alteración Molecular Metodología * Test ID

Panel de mutaciones Judío Ashkenazí

De rutina Diagnóstico Mutaciones Fundadoras: BRCA1 185delAG y 5382insC BRCA 2: 6174delT

S. Sanger

MhPJAsa

Panel de Cáncer de Mama En investigación Diagnóstico

ACVR1B EP300 IRAK4 PBRM1 TP53 AKT1 ERBB2 ITCH PCGF2 TRAF5 ATM ERBB3 KMT2C PIK3CA WEE1 BAP1 ESR1 MAP2K4 PIK3R1 ZBED4 BRCA1 EXOC2 MAP3K1 PPM1L BRCA2 EXT2 MDM2 PTEN CBFB FBXO32 MUC16 PTGFR CDH1 FGFR1 MYC RB1 CDKN2A FGFR2 NCOR1 RET EGFR GATA3 NEK2 SEPT9

NGS

PtPCMng

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Biomarcadores en Poliposis Adenomatosa Familiar (PAF)

Biomarcador Evidencia Tipo Alteración Molecular Metodología* Test ID

APC De rutina Diagnóstico Mutaciones S. Sanger PafAPCsa

MYH De rutina Diagnóstico Mutaciones S. Sanger PafMYHsa

Biomarcadores en Síndrome de Lynch (HNPCC)

Biomarcador Evidencia Tipo Alteración Molecular Metodología* Test ID

MLH1 De rutina Diagnóstico Ausencia de expresión IHQ LynL1ih

MSH6 De rutina Diagnóstico Ausencia de expresión IHQ LyS6ih

MSH2 De rutina Diagnóstico Ausencia de expresión IHQ LynS2ih

PMS2 De rutina Diagnóstico Ausencia de expresión IHQ LynPM2ih

Inestabilidad Microsatelital (MSI) Recomendado Diagnóstico Alteración en Microsatélites Genotipificación LynMSIgn

Mutaciones MSH2 Recomendado Diagnóstico Mutaciones S. Sanger LynS2sa

Mutaciones MLH1 Recomendado Diagnóstico Mutaciones S. Sanger LynL1sa

Mutaciones MSH6 Recomendado Diagnóstico Mutaciones S. Sanger LynS6sa

Mutaciones PMS2 Recomendado Diagnóstico Mutaciones S. Sanger LynPM2sa

Biomarcadores en Neoplasia Endócrina Múltiple (MEN)

Biomarcador Evidencia Tipo Alteración Molecular Metodología * Test ID

RET Recomendado Diagnóstico Polimorfismos S. Sanger AzAE2qp

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Biomarcadores en Cáncer Gástrico Difuso

Biomarcador Evidencia Tipo Alteración Molecular Metodología* Test ID

CDH1 Recomendado Diagnóstico Mutaciones S. Sanger GdCDH1sa

Biomarcadores en Síndrome de Cowden

Biomarcador Evidencia Tipo Alteración Molecular Metodología* Test ID

PTEN Recomendado Diagnóstico Mutaciones germinales S. Sanger GdCDH1sa

Biomarcadores en Alzhéimer

Biomarcador Evidencia Tipo Alteración Molecular Metodología* Test ID

APOE e2 Recomendado Diagnóstico Polimorfismos qPCR AzAE2qp

APOE e3 Recomendado Diagnóstico Polimorfismos qPCR AzAE3qp

APOE e4 Recomendado Diagnóstico Polimorfismos qPCR AzAE4qp

Proteína precursora amiloide (APP), presenilina-1 (PS1) y presenilina-2 (PS-2)

Recomendado Diagnóstico Mutaciones S. Sanger AzAPSsa

Paneles en Síndrome de Li-Fraumeni

Panel Evidencia Tipo Alteración Molecular Metodología* Test ID

Panel Tp53 Recomendado Diagnóstico Tp53 NGS PtPTP53ng

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PANELES DE BIOMARCADORES

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Paneles de Biomarcadores

Panel Evidencia Tipo Alteración Molecular Enfermedad Asociada Test ID

Panel Pulmón (22 genes)

Recomendado Predictivo

Mutaciones en KRAS, EGFR, BRAF, PIK3CA, AKT1, ERBB2, PTEN, NRAS, STK11, MAP2K1, ALK, DDR2, CTNNB1, MET, TP53, SMAD4, FBXW7, FGFR3, NOTCH1, ERBB4, FGFR1, FGFR2

Pronóstico de enfermedad en Cáncer de Pulmón

PlPPng

Panel de Cáncer Colorrectal (22 genes)

Recomendado Predictivo

Mutaciones en KRAS, EGFR, BRAF, PIK3CA, AKT1, ERBB2, PTEN, NRAS, STK11, MAP2K1, ALK, DDR2, CTNNB1, MET, TP53, SMAD4, FBXW7, FGFR3, NOTCH1, ERBB4, FGFR1, FGFR2

Pronóstico de enfermedad en CCR

CcPCng

Panel Tp53 Recomendado Diagnóstico Tp53 Li-Fraumeni PtPTP53ng

Panel Cáncer de Mama En investigación Diagnóstico

ACVR1B EP300 IRAK4 PBRM1 TP53 AKT1 ERBB2 ITCH PCGF2 TRAF5 ATM ERBB3 KMT2C PIK3CA WEE1 BAP1 ESR1 MAP2K4 PIK3R1 ZBED4 BRCA1 EXOC2 MAP3K1 PPM1L BRCA2 EXT2 MDM2 PTEN CBFB FBXO32 MUC16 PTGFR CDH1 FGFR1 MYC RB1 CDKN2A FGFR2 NCOR1 RET EGFR GATA3 NEK2 SEPT9

Clasificación del tumor en cáncer de mama

PtPCMng

Panel de enfermedades hereditarias-328 genes asociados a 700 enfermedades hereditarias

En investigación Diagnóstico Consultar en el siguiente link: https://goo.gl/jADVk9

Diagnóstico de enfermedades hereditarias

PtPEHng

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BIOMARCADORES ASOCIADOS A TOXICIDAD A DROGAS

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Biomarcadores asociados a Toxicidad a Drogas

Biomarcador

Evidencia Tipo Alteración Molecular Sensibilidad a Droga Metodología* Test ID

DPYD Recomendado Predictivo Polimorfimos 5FU S. Sanger TxDPYD

TYMS Recomendado Predictivo Polimorfimos 5' UTR 5FU S. Sanger TxTYMS5

TYMS Recomendado Predictivo Polimorfimos 3' UTR Metrotexato qPCR TxTYMS3

UGT1A1 Recomendado Predictivo Polimorfimos *28A Irinotecan S. Sanger TxUGT1A1

MTHFR Recomendado Predictivo Polimorfimos Metrotexato S. Sanger TxMTHFR

ERCC1 En investigación Predictivo Expresión Cisplatinos IHQ TxERCC1

RRM1 En investigación Predictivo Expresión Gemcitabina IHQ TxRRM1

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La clasificación de los estudios moleculares disponibles actualmente ha sido supervisada por el equipo de especialistas de BIOMAKERS. Las

recomendaciones aquí presentes no pretenden sustituir a las directrices de consensos de sociedades médicas o de las guías de tratamiento

oncológico vigentes en la actualidad.

* Metodología de Análisis:

FISH: Hibridación in situ de fluorescencia

IHQ: Inmunohistoquímica

NGS: Next-Generation Sequencing

qPCR: Real Time PCR

S. Sanger: Secuenciación Sanger

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