Sin título de diapositiva - IFIC Indico Server (Indico) · atención sanitaria con el foco en...

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Área Clínica de Imagen Médica Luis Martí-Bonmatí Hospital Universitario y Politécnico La Fe Universidad de Valencia Medicina Personalizada Biomarcadores de Imagen Firmas Biológicas

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Área Clínica de Imagen Médica

Luis Martí-Bonmatí

Hospital Universitario y Politécnico La Fe

Universidad de Valencia

Medicina Personalizada

Biomarcadores de Imagen

Firmas Biológicas

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Ciencia que estudia las propiedades y el comportamiento de los tejidos a partir de sus imágenes en un intento de describir los fenómenos relevantes a la medicina con exactitud y veracidad.

Imagen Médica y Biomarcadores

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Promover una medicina más precisa y precoz en el diagnóstico, tratamiento y prevención de la enfermedad del ciudadano europeo.

Esta medicina personalizada sitúa al paciente en el centro de la atención sanitaria con el foco en “Predecir, Prevenir, Personalizar y hacerlo Participar” (P4).

La computación y la minería de datos aplicada a la representación in-vivo de los diferentes sistemas biológicos será la base de la red-de-redes que constituye el análisis del individuo y su enfermedad.

Las ómicas (con la radiómica) serán fundamentales para que las decisiones clínicas se ajusten a cada sujeto en el mejor momento (lo más acertado lo antes posible).

El entorno de la Medicina P4

http://www.esf.org/activities/forward-looks/medical-sciences-emrc/current-forward-looks-in-medical-

sciences/personalised-medicine-for-the-european-citizen/more-information.html.

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La Medicina P4 (MP4) y la Basada en la Evidencia (MBE) se distinguen por:

MP4 y MBE: un Cambio de Paradigma

Medicina Personalizada P4 Medicina Basada en Evidencia

Proactiva Reactiva

Mantenimiento de la Salud Enfermedad

Muchos Datos Pocos Datos

Centrado en el Individuo Centrada en la Población

Integra muchas Variables Analiza pocos Detalles

Red de Redes de Sistemas Simplifica la Etiopatogenia

Estratifica la Enfermedad Homogeniza los Subtipos

Cuantificación Observación

Hood L et al. Revolutionizing medicine in the 21th century through systems approaches.

Biotechnol J 2012; 7:1-10

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Física Médica e Imagen Médica

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Glioblastoma Multiforme

Lesión única expansiva de márgenes infiltrativos con amplia necrosis central.

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Imagen e Información

• Neuroimagen

– Cuantitativa

• Alteraciones locales vs difusas

Glioma Esquizofrenia

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¿Qué puede hacer la Imagen en la MP4?

Estructura y Función

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La imagen funcional y molecular puede demostrar una

respuesta temprana del tumor y/o

áreas diana persistentes antes de que aparezcan

cambios anatómicos relevantes (como la

disminución de tamaño)

Respuesta Temprana del Tumor

Figueiras RG et al. Radiographics 2011;31:2059-2091

¿cómo?

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¿Qué son los Biomarcadores?

Biomarcador: característica de un tejido que se pueda medir objetivamente y represente un parámetro de su organización estructural, funcional o biológica.

Biomarcador de Imagen: cualquier parámetro que explote y cuantifique una propiedad tisular específica obtenida a través de modelos computacionales.

Información resuelta en espacio (mapas paramétricos) y tiempo (variaciones temporales) que pueden considerarse como Biopsias Virtuales (imágenes sintéticas y simuladas).

T1 mapping

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Imagen derivada en la que los píxeles representan valores de un determinado parámetro (morfológico, funcional, molecular) obtenido mediante el ajuste numérico de un modelo matemático.

Imagen Paramétrica

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Water Map

Iron Map

Fat Map

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Fuentes

de Error

Sesgos de

Normalidad

Adquisición de Imágenes

Análisis y Modelado de la señal

Parametrización Uni - Multivariante

Medidas

Procesado de las Imágenes

Prueba de Concepto

RSR - RCR

Resolución espacial

Cobertura anatómica

Resolución temporal

Ausencia de artefactos

Reproducibilidad

Filtros de Reducción de Ruido

Suprarresolución

Corregistro y Coherencia Espacial

Corrección inhomogeneidades

Segmentación y Extracción

Normalización

Informe Estructurado

Volumen y Forma

Topología

Propiedades

Parametrizaciones

Visualización

Representación y Simulación

Prueba de Mecanismo

Prueba de Principio

Prueba de Eficacia y

Efectividad

Calibraciones

Histograma

Kurtosis

Patrón de Referencia

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Desarrollo de un biomarcador de imagen

Prueba de concepto

Prueba de mecanismo

Adquisición de imágenes

Preparación imágenes

Modelado de la Señal

Medidas Prueba de principio

Prueba de eficacia y

efectividad

Informe estructurado

Prueba de Concepto

Definir el principio teórico que justifica el

desarrollo y validación de un biomarcador,

verificando que el proceso biológico que se desea

estudiar es susceptible de explorarse y medirse

con las pruebas disponibles de imagen digital y

computación.

Si la biopsia prostática muestrea el 1% de la

glándula con un VPN bajo (menor al 50%),

¿pueden emplearse biomarcadores de imagen

(celularidad, angiogénesis, replicación celular)

para definir las dianas terapéuticas?

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Prueba de Mecanismo

Demostrar que existe una relación mutua entre

el biomarcador y el concepto fisiopatológico,

ayudando a comprender la acción (en magnitud

y dirección) que una determinada enfermedad o

un tratamiento tienen sobre el biomarcador.

Si el tratamiento del carcinoma de próstata

localizado está focalmente dirigido, ¿pueden

emplearse biomarcadores de imagen

(celularidad, angiogénesis, replicación

celular) para definir la eficacia terapéuticas?

Desarrollo de un biomarcador de imagen

Prueba de concepto

Prueba de mecanismo

Adquisición de imágenes

Preparación imágenes

Modelado de la Señal

Medidas Prueba de principio

Prueba de eficacia y

efectividad

Informe estructurado

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Adquisición y Análisis de un Biomarcador

Adquisición de Imágenes

Sin unas imágenes adecuadas es imposible extraer biomarcadores útiles. Independientemente de la técnica elegida (TC, RM, SPECT o PET) se deben tener en cuenta varios aspectos para asegurar la necesaria calidad de imagen.

En RM son necesarias imágenes de alta resolución espacial con técnicas específicas.

Prueba de concepto

Prueba de mecanismo

Adquisición de imágenes

Preparación imágenes

Modelado de la Señal

Medidas Prueba de principio

Prueba de eficacia y

efectividad

Informe estructurado

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Preparación de las Imágenes

Previo al análisis y modelado de los vóxeles debe garantizarse su calidad y adecuación para el estudio pormenorizado de su señal.

Prueba de concepto

Prueba de mecanismo

Adquisición de imágenes

Preparación imágenes

Modelado de la Señal

Medidas Prueba de principio

Prueba de eficacia y

efectividad

Informe estructurado

Desarrollo de un biomarcador de imagen

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Tipos de Biomarcadores de Imagen

Anatómico-Estructural Funcional-Modelado de Señal Molecular-Componentes

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IVIM T1/R1 T2*/R2*

PKM Modelado de la señal Extracción de variables Estracción de estimaciones

Prueba de concepto

Prueba de mecanismo

Adquisición de imágenes

Preparación imágenes

Modelado de la Señal

Medidas Prueba de principio

Prueba de eficacia y

efectividad

Informe estructurado

Desarrollo de un biomarcador de imagen

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Modelado Dinámico de la Señal

Influencia del ajuste de la curva en el coeficiente de difusión en un experimento DW

Ajuste Mono-Exponential; b: 0,2000 Ajuste Bi-Exponential; b:0, 50, 200, 400, 1000, 2000

ADC=0.799e-3 mm2/s D=0.439e-3 mm2/s

b=0 b=50 b=200 b=400 b=1000 b=2000

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Imagen de PKM

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Generación de mapas y curvas de relajatividad R2* dependientes de los acúmulos de hierro

Depósitos de hierro

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Calibración y Fantomas

Maniquí

R2* Fe [mM] Media (s-1) DS (s-1) Mediana (s-1)

Prueba1 1 87.48 26.08 91.42

Prueba2 0.5 77.57 33.05 79.66

Prueba3 0.25 57.76 31.45 51.91

Prueba4 0.15 40.16 22.73 36.58

Prueba5 0.1 36.78 17.85 38.81

Prueba6 0 29.98 18.05 29.56

UPSIO - P904 (Guerbet) en agar at 3%. Mapas R2* (correlación lineal).

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Simulación

Condiciones de contorno /Limites

TCMD

Segmentación

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Distribución de Flujo

Válvula sana Válvula con Estenosis

St. Jude Planar St. Jude Ortogonal

Simulación

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Medidas

De las imágenes derivadas, tanto paramétricas como multivariantes, se pueden obtener mediciones de todo el tejido-órgano estudiado o bien sólo de aquellas áreas que se consideren más representativas o anormales (histogramas).

Prueba de concepto

Prueba de mecanismo

Adquisición de imágenes

Preparación imágenes

Modelado de la Señal

Medidas Prueba de principio

Prueba de eficacia y

efectividad

Informe estructurado

Desarrollo de un biomarcador de imagen

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D f D*

Medidas

Las alteraciones que expresan una

anormalidad son heterogéneas en el espacio

(variabilidad de grado) y en el tiempo

(variabilidad biológica)

Analizar los cambios relevantes y su distribución: el histograma

Medición de un biomarcador

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Morfometría cerebral

Cálculo del espesor cortical

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Fuentes

de Error

Sesgos de

Normalidad

Prueba de Principio

Prueba de Eficacia y

Efectividad

• ¿Influye el sexo o la edad? Población estudiada

• ¿Qué variabilidad tiene mi método? Medición utilizada

• ¿Existe otro factor que esté influyendo en mi resultado?

• ¿Es la causa o el resultado de la adicción?

Confusión por covariables explicativas

• ¿Cómo se ha elegido la referencia para validar el biomarcador?

Patrón de referencia seleccionado

• ¿Puede el biomarcador de imagen extraerse en cualquier entorno con una metodología reproducible?

No-universalidad del resultado

• ¿Realmente es útil a pesar de los sesgos? Inutilidad final

Sesgos y variables de confusión

Biomarcadores de Imagen

Prueba de concepto

Prueba de mecanismo

Adquisición de imágenes

Preparación imágenes

Modelado de la Señal

Medidas Prueba de principio

Prueba de eficacia y

efectividad

Informe estructurado

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Un Ejemplo

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Fast

Slow

• La señal proviene de los vóxeles y estos son complejos en sus componentes y sus propiedades fisicoquímicas.

• Para que las medidas obtenidas representen una realidad biológica, deben tener guardar una relación precisa (coeficiente de correlación entre-clases).

La Incertidumbre del Biomarcador

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Validación del Biomarcador

• Medidas de Variabilidad

• Repetibilidad

• Variabilidad entre observaciones diferentes (test-retest): • Errores de Medida • Variabilidad Biológica

• Reproducibilidad

• Variabilidad entre mediciones diferentes: • Procesos Técnicos • Equipos (hardware, software) • Operadores • Sistemas de Medida • Centros – Localización

• Perfiles de Precisión en Rangos de Valores

Precisión

(en situaciones estables y/o de

variables de medida

controladas)

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Área Clínica de Imagen Médica Martí-Bonmatí L et al. Chronic auditory hallucinations in schizophrenic patients: MR analysis

of coincidence between functional and morphologic abnormalities. Radiology 2007;244:549-556

Functional Contrast Maps

Original structural data

Morphometry

ROI selection

Coincidence Maps

Análisis Multidimensional

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Subject

Imaging modalities and protocols

Multimodal-Fusion images

Parametric images

Biological Tissue classifier

Nosologic images

Análisis Multiparamétrico

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Subject

Co-registered Parametric Imaging + Circulating Biomarkers +

Genomic Data

Tissue Signature Imaging

Vo

xel-

Wis

e M

ult

idim

en

sio

nal

Ap

pro

ach

…..

Signature Biological-Clinical Endpoints

Models

…..

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CBF CBV BBB Vp Ktrans

Biomarcadores de Perfusión

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Imagen Médica

Precisa diagnóstico

precoz

Evalúa agresividad

biológica

Monitoriza respuesta

tratamiento

Imagen Anatómica-Funcional-Molecular

Pruebas específicas, agentes de contraste o

métodos RM

Información biológica in vivo, alta resolución

Entender biología celular

Proporcionar diagnóstico precoz

Apoyar nuevas terapias dirigidas

Multidimensional in silico

Pruebas de imagen y propiedades basadas

en diferentes parámetros

Equipamiento avanzado alta

resolución

Visualizar cambios moleculares, celulares

y estructurales complejos

Técnicas multiparamétricas,

mutivariables y multimodales

Fenotipo biológico

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El Informe Estructurado

Comunicar los resultados en la práctica clínica (innovar) y organizar

los datos para análisis posterior (investigar) de una forma amigable

y fiable, incluyendo variabilidad y normalidad.

Prueba de concepto

Prueba de mecanismo

Adquisición de imágenes

Preparación imágenes

Modelado de la Señal

Medidas Prueba de principio

Prueba de eficacia y

efectividad

Informe estructurado

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El Informe Estructurado

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Interrogante Clínico

Energía-Detector-Reconstruir-Modelar-Integrar

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Biomarcadores e Imagen Médica

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Luis Martí-Bonmatí

[email protected]