Software 4 Science Developments  · 2015. 10. 27. · Análisis matemático “avanzado”...

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AFFINImeter

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Software 4 Science Developments

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Áreas de estudio típicas

Biología, medicina e investigación básica Farmacia Cosméticos Materiales Alimentos Disolventes Pinturas Productos de limpieza Biotech: sensores moleculares

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¿ Cómo se investigan este tipo de interacciones? GENERACIÓN DE OBSERVABLES

Intercambio de calor, emisión/absorción de luz, tensión superficial, reflectividad de luz o partículas,

desplazamientos químicos (RMN), etc

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What do we need? O

bse

rvab

le

Ob

serv

able

Concentration Time

Kinetics Equilibrium

Estructura ¿?

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Escasez de métodos de análisis automatizados

Problema

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AFFINImeter = AFFINITY meter

Software para estudiar la interacción entre dos o más moléculas: reconocimiento molecular, unión (competitiva),

agregación, disociación, cambios conformacionales, etc

Nuestra propuesta

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Cómo funciona AFFINImeter?

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Análisis matemático “avanzado”

Optimización de muestreo + mínimos locales + cálculo numérico y estadístico

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AFFINImeter - ITC

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AFFINImeter - ITC

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AFFINImeter - ITC • Automated analysis of raw data files (power-time plots) with automated removal of noise, baseline

correction, peak integration and determination of the corresponding uncertainty. At the moment this functionality is working only for microcal itc files.

• Unlimited amount of models available throughout our model builder: the user can design her own models

• The first public implementation of kinITC, the method developed by Philippe Dumas to get kinetic constants (kon and koff) from a standard binding titration is now available. High quality measurements and a good estimation of the instrument response time are required for a reliable determination of the kinetic constants. The results are expected to be comparable to those obtained by SPR.

• Detailed pdf reports for the analysis of the raw data and of model fitting projects are now automatically produced.

• The molar heat uncertainties are now estimated and considered to normalize c2. • Powerful fitting algorithms allowing to identify local minima. • Reference experiments can be subtracted or modeled. • 1-year flat rate licenses or installation in local servers

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Servidor web

(PHP/Ajax)

Servidores cálculo

peticiones datos

Base datos (SQL)

almacenamiento

Servidores cálculo

Servidores cálculo

Servidores cálculo

Servidores cálculo

Servidores cálculo

Director (C++)

usuario Director

Agent

Director Agent

Director Agent

Director Agent

cifrado

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Agradecimientos

Desarrollo e Innovación Javier Rial Daniel Pérez Ángel Piñeiro

Validación y soporte Eva Muñoz Juan Sabín

Gestión, marketing y finanzas Norma Díaz Miguel Fernández

Asesores científicos Philippe Dumas (CNRS-Strasbourg) Margarida Bastos (CIQ-Porto) Luis García (CIQUS-USC) Adrián Velázquez (BIFI-Zaragoza)

Inversores y colaboradores USC CESGA MestreLab Research Particulares

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