Subtipificación molecular de Salmonella Typhimurium, Costa Rica 2003-2005 Dra. Elena Campos Centro...
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Subtipificación molecular deSubtipificación molecular de
SalmonellaSalmonella Typhimurium, Costa Rica 2003-2005 Typhimurium, Costa Rica 2003-2005
Dra. Elena CamposDra. Elena CamposCentro Nacional de Referencia en Bacteriología, INCIENSACentro Nacional de Referencia en Bacteriología, INCIENSA
COSTA RICACOSTA RICA
V Reunión Internacional Red PulseNet América LatinaV Reunión Internacional Red PulseNet América LatinaBuenos Aires, Argentina, 23 - 25 de octubre 2007
AntecedentesAntecedentes
• El INCIENSA envío al Instituto Malbrán 26 cepas de
Salmonella Typhimurium para subtipificación molecular,
seleccionadas entre cepas aisladas durante 2003–2005:
– Cepas clínicas multiresistentes con perfil ACSSuT y algunas a
NAL, de casos aislados de diarrea y otras de pacientes
relacionados epidemiológicamente a un brote ETA
– Cepas aisladas de alimentos con un perfil de resistencia a los
antibióticos similar al de las cepas clínicas
– Cepas clínicas y de alimentos sensibles a los antibióticos
antes mencionados
ObjetivoObjetivo
• Estudiar la variabilidad genética de aislamientos de S.
Typhimurium (resistentes y sensibles a los antibióticos) de Costa Rica,
del período 2003 – 2005
• Confirmar la sospecha epidemiológica de asociación de
algunas de las cepas multiresistentes a un brote ETA
• Comparar los perfiles de las cepas de S. Typhimurium clínicas
con cepas aisladas de alimentos
Estrategia de estudioEstrategia de estudio
• En INCIENSA se realizó la caracterización fenotípica de los
aislamientos:– pruebas bioquímicas
– serotipificación
– susceptibilidad a los antimicrobianos por difusión en discos (Kirby-Bauer)
• En el Instituto Malbrán se realizó el PFGE:– Con XbaI a todos los aislamientos referidos
– Con BlnI para los aislamientos que presentaron idéntico perfil con XbaI
• En el LCDC-Canadá se determinó el fagotipo de algunos aislamientos
con perfil de resistencia compatible con la variante DT104
ResultadosResultados
Qué sabemos actualmente de Qué sabemos actualmente de
S.S. Typhimurium DT104 en Costa Rica Typhimurium DT104 en Costa Rica
• S. Typhimurium compatible con DT104 se ha documentado en todas
las provincias del país a partir del 2003. Desde el 2004 se tienen
cepas caracterizadas por fagotipo.
• Estas cepas se han asociado a:
– Casos aislados de diarrea
– Un brote ETA
– Una defunción con antecedentes de diarrea
– Infecciones invasivas (septicemia)
• En el 2006, 61% de los aislamientos clínicos de S. Typhimurium
confirmados en INCIENSA presentaron un perfil de resistencia
compatible con la variante DT104
Qué sabemos actualmente de Qué sabemos actualmente de
S.S. Typhimurium DT104 en Costa Rica Typhimurium DT104 en Costa Rica
• Existe evidencia de una cepa de canal porcino (2004) con
resistencia ACSSuT que posee perfiles de PFGE (con XbaI y BlnI)
idénticos a los de cepas clínicas multiresistentes.
• Además, un alimento importado (hígado) presenta un perfil de PFGE
muy similar con XbaI al de las cepas clínicas multiresistentes. Sin
embargo, el análisis con BlnI muestra que dicha cepa tiene una
homología menor al 80 % con las cepas clínicas del país.
• Las cepas de S. Typhimuriun de Costa Rica compatibles con la
variante DT104 muestran un patrón de PFGE idéntico a un perfil
descrito en Argentina y presentan un 93% de similitud con
aislamientos de Colombia.
Plan de TrabajoPlan de Trabajo
2007-20082007-2008
Caracterización molecular (por PFGE) de aislamientos Caracterización molecular (por PFGE) de aislamientos
clínicos y de alimentos de clínicos y de alimentos de Listeria monocytogenesListeria monocytogenes
(a realizar en el 2007)(a realizar en el 2007)
Caracterización molecular (por PFGE) de aislamientos Caracterización molecular (por PFGE) de aislamientos
clínicos y de alimentos de clínicos y de alimentos de Listeria monocytogenesListeria monocytogenes
(a realizar en el 2007)(a realizar en el 2007)
• Siete aislamientos clínicos de Siete aislamientos clínicos de Listeria Listeria
monocytogenesmonocytogenes (1998-2006)
• 23 cepas aisladas de queso fresco, 23 cepas aisladas de queso fresco, como parte
de la investigación: “Calidad microbiológica del queso
fresco en expendios de la Región Central Norte, Costa
Rica”, realizada por Ministerio de Salud, INCIENSA e
INISA en el 2004
• Siete aislamientos clínicos de Siete aislamientos clínicos de Listeria Listeria
monocytogenesmonocytogenes (1998-2006)
• 23 cepas aisladas de queso fresco, 23 cepas aisladas de queso fresco, como parte
de la investigación: “Calidad microbiológica del queso
fresco en expendios de la Región Central Norte, Costa
Rica”, realizada por Ministerio de Salud, INCIENSA e
INISA en el 2004
• Brote ocurrido entre abril y mayo 2007, con más de 25 enfermos
• Asociado al consumo de alimentos en un restaurante de mariscos
• El INCIENSA cuenta con las cepas de Shigella sonnei de seis pacientes y de un manipulador de alimentos
• El estudio se podría complementar con el análisis por PFGE de cepas la misma localidad y de otras regiones del país, tanto del 2007 como de años anteriores.
Caracterización molecular de aislamientos clínicos de Caracterización molecular de aislamientos clínicos de
Shigella sonneiShigella sonnei relacionados a un brote ETA, 2007. relacionados a un brote ETA, 2007.
(a realizar en el 2008)(a realizar en el 2008)
Desde el 2005 en Costa Rica S. sonnei es la especie más comúnmente aislada por los laboratorios de la red (69% de los aislamientos referidos
al INCIENSA en el 2006).
Avances en la adquisición de Avances en la adquisición de
equipo para PFGEequipo para PFGE
Actualmente se realiza la licitación para la compra del equipo para PFGE