TRABAJO PRÁCTICO Nº 1 - Bioestadistica I y II · PDF fileEjercicios varios ... El...

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UNIVERSIDAD NACIONAL DE CORDOBA FACULTAD DE CIENCIAS EXACTAS, FISICAS Y NATURALES ESCUELA DE BIOLOGIA DEPARTAMENTO DE MATEMATICA BIOESTADÍSTICA II GUIA DE TRABAJOS PRACTICOS 2013 Analía González Arnaldo Mangeaud María Gabriela Molina

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  • UNIVERSIDAD NACIONAL DE CORDOBA FACULTAD DE CIENCIAS EXACTAS, FISICAS Y NATURALES

    ESCUELA DE BIOLOGIA DEPARTAMENTO DE MATEMATICA

    BIOESTADSTICA II

    GUIA DE TRABAJOS PRACTICOS

    2013

    Anala Gonzlez Arnaldo Mangeaud

    Mara Gabriela Molina

  • Bioestadstica II 2013 Pg. 2

    Indice Programa analtico........ 3Reglamento interno... 4Trabajos prcticos. 5 Trabajo prctico no 1....... 5 Trabajo prctico no 2.... 5 Trabajo prctico no 3... 8 Trabajo prctico no 4...... 10 Trabajo prctico no 5... 12 Trabajo prctico no 6.. 15 Trabajo prctico no 7... 16 Trabajo prctico no 8... 19 Trabajo prctico no 9... 19 Trabajo prctico no 10..... 20 Trabajo prctico no 11.... 21 Trabajo prctico no 12.... 23Lineamientos del TRABAJO FINAL ... 24Ejercicios varios ..... 25Bibliografa ... 34Anexos ... 35 Anexo 1: Bases de datos .. 35 Anexo 2: Resolucin de ejercicios.. 44 Anexo 3: Listado de Modelos .. 57

  • Bioestadstica II 2013 Pg. 3

    PROGRAMA ANALITICO Unidad 1. Conceptos bsicos La ciencia, construccin de teoras y modelos. Objetivos e hiptesis en la investigacin biolgica. Datos experimentales y observacionales. Preguntas biolgicas. Conversin de Hiptesis en Hiptesis Estadsticas. Hiptesis Nula y Alternativa. Predicciones. Supuestos estadsticos y biolgicos. El diseo de experimentos. Principios: aleatorizacin, repeticin, y control local. Unidad experimental u observacional. Factores y niveles del factor. Variable respuesta y variables independientes. Unidad 2. Introduccin Estimacin por intervalos para diferentes parmetros. Pruebas de Hiptesis. Errores. Pruebas para la media y la varianza poblacional. Pruebas para la diferencia de medias y el cociente de varianzas. Valor p. Unidad 3. Diseo completamente aleatorizado a un factor El modelo del Anlisis de la varianza (Anova) a efectos fijos. Hiptesis. Supuestos. Suma de cuadrados, Cuadrados Medios, Esperanza y valor p. Contrastes, Comparaciones mltiples. Conclusiones. Verificacin del modelo: Supuestos. Transformaciones. Anlisis de la Varianza No Paramtrico: Test de Kruskal-Wallis. Unidad 4. Diseo aleatorizado a un factor con bloques Las restricciones a la aleatorizacin. El efecto bloque como representante de un gradiente. Modelo, hiptesis, supuestos. Comparaciones mltiples. Conclusiones. Anlisis de la Varianza No Paramtrico con Bloques: Test de Friedman. Unidad 5. Diseos factoriales Diseo a dos factores con interaccin. Modelo, hiptesis, supuestos. Suma de cuadrados, Cuadrados Medios y Esperanza. Comparaciones mltiples. Conclusiones. Modelos anidados. Unidad 6. Diseo a efectos aleatorios y mixtos Modelo. Hiptesis. Suma de cuadrados, Cuadrados Medios, Esperanza. Diseos que incluyen seudorrplicas. Unidad 7. Regresin Modelo de la regresin lineal simple. Mtodo de los mnimos cuadrados. Hiptesis Supuestos. Verificacin de los supuestos. Ajuste. R2. Regresiones mltiples. Conceptos. Hiptesis Supuestos. Verificacin de los supuestos. Ajuste. R2. Mtodo de stepwise. Variables categricas. Transformaciones. Introduccin a Regresiones no lineales. Unidad 8. Anlisis de la Covarianza Hiptesis. Modelo del AnCova. Supuestos. Comparaciones de pendientes de regresin. Unidad 9. Anlisis Multivariado de la Varianza

  • Bioestadstica II 2013 Pg. 4

    Modelo de Manova. Supuestos. Hiptesis. Lambda de Wilks. T2 de Hotelling. Conceptos de Anlisis multivariado de la Covarianza (Mancova). Unidad 10. Anlisis Multivariados de Clasificacin y Ordenacin Clasificacin: Objetivos. Medidas de similitud y distancia. Dendrogramas. Ordenacin: Objetivos. La combinacin lineal de variables. Anlisis de componentes principales (ACP). Biplot. Anlisis de Correspondencia. Unidad 11. Modelos Lineales Generalizados. Modelos. Funcin de distribucin. Variable dependiente. Predictor lineal. Variables independientes. Funcin de Enlace. Estimaciones por mtodo de mxima verosimilitud. REGLAMENTO INTERNO El alumno que curse la Asignatura podr optar por las siguientes condiciones: REGULAR Para obtener la Regularidad en Bioestadstica II deber tener Regularizadas Bioestadstica I, Fisiologa Animal y Fisiologa Vegetal, asistir al 80 % de las clases (Terico-prcticos) y obtener en cada una de las 4 evaluaciones parciales una nota mayor o igual a 40 % (nota 4). PROMOCIONADO Para obtener la Promocin en Bioestadstica II deber tener Regularizadas Bioestadstica I, Fisiologa Animal y Fisiologa Vegetal, pero aprobada antes de la fecha de Examen, asistir al 80 % de las clases (Terico-prcticos). Obtener en cada una de las 4 evaluaciones una nota mayor o igual a 40 % (nota 4) y como promedio una nota igual o mayor a 70 % (nota 7). Evaluaciones. La primera evaluacin consiste en un examen de los conocimientos necesarios de Estadstica Bsica para el cursado de la Asignatura. Las evaluaciones 2 y 3 consistirn de un examen terico-prctico La cuarta evaluacin es una exposicin oral sobre un trabajo en grupo que ser guiado por los Profesores. Existirn tres recuperatorios: un recuperatorio exclusivamente para la evaluacin 1 y un recuperatorio para los parciales 2 3. Casos Particulares. Para el anlisis de casos particulares dirigirse a los horarios de consulta de la Asignatura bien al correo electrnico: [email protected]

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    TRABAJO PRCTICO N 1

    MTODO CIENTFICO - CONCEPTOS BSICOS DE DISEO

    En un grupo de 2 a 4 integrantes, diagramar un problema de ndole biolgica, en el cual se deber especificar correctamente:

    a) problema, objetivos, hiptesis biolgicas y estadsticas, b) poblacin, c) unidad estadstica, d) muestra y forma de obtenerla, e) variable/s de respuesta, f) variable/s independiente/s g) forma de medir y analizar dichas variables, h) factores controlados y no controlados; i) supuestos biolgicos y estadsticos.

    TRABAJO PRCTICO N 2

    DISEO AL AZAR SIMPLE A UN FACTOR A. Comparaciones mltiples

    Ejercicio N 2.1: Elegir cuidadosamente slo una de las cuatro opciones (A, B, C D), Buscar los datos en Anexos. Ejercicio N 2.1A: En un estudio se desea investigar sobre la capacidad colonizadora de una especie vegetal introducida. Para ello se decide, a campo, contar el nmero de semillas en parcelas de un m2. Adems se tomaron otras variables: Porcentaje de cobertura, Altura promedio de las plantas, Desmalezado el ao anterior (No desmalezado, 50% 100%), Especie de rbol dominante (5 categoras), Exposicin al sol (Ladera oriental, occidental o llano), Efecto riego (sin riego, una vez a la semana, dos veces a la semana). Cree Ud. que existen diferencias significativas en la variable respuesta con respecto a la Variable desmalezado? Ejercicio N 2.1B: En un estudio se desea investigar sobre la capacidad de un insecto homptero para transformarse en una especie plaga debido a su abundancia. La capacidad que poseen las hembras de colocar huevos es una variable interesante para medir, por eso es que en un campo se colectaron hembras y se contabiliz el nmero de huevos viables colocados por cada una de ellas en 24 horas. Adems se tomaron otras variables: Peso de la hembra, Longitud, Lugar donde fue colectada (Hoja, Pecolo o Tallo principal), Zona del campo donde se realiz la colecta (N, S, E, W, Centro), poca de la colecta (Fecha 1, 2 3), Tamao de la planta donde se hallaba la hembra (80 cm). Cree Ud. que existen diferencias significativas en la variable respuesta con respecto a la Variable Lugar de la colecta? Ejercicio N 2.1C: En un estudio se desea investigar la capacidad de una promisoria especie vegetal de producir aceites esenciales. Se sembraron semillas en bandejas y se las cultiv en cmaras de cultivo. Se obtuvo la concentracin de aceites por bandeja. Adems se tomaron otras variables: Biomasa por bandeja, Nmero de semillas

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    germinadas, Fotoperiodo (12L/12O, 10L/14O 8L/16O), Concentracin de salinidad (Control, 1, 2, 3 y 4), Posicin en la cmara (Superior, Media o Inferior) y Condiciones de Riego (1, 2 y 3). Cree Ud. que existen diferencias significativas en la variable respuesta con respecto a la Variable Fotoperiodo? Ejercicio N 2.1D: El comportamiento de freezing en ratas es una de las maneras de evaluar el estrs. Para esto se colocan a ratas en cajas especiales y se controla durante 10 minutos el tiempo que stas permanecen quietas (freezadas) en un ambiente desconocido para ellas. En estudios previos se demostr que en ratas sometidas a pequeas dosis de alcohol y luego con una abstinencia de alcohol antes del experimento, se presentaba un mayor tiempo de freezing. Ahora se est queriendo probar si distintas concentraciones de una droga consiguen disminuir el estrs del perodo de abstinencia alcohlico. Se tom el tiempo de freezing de cada rata. Adems se tom el peso de cada rata, la edad (en das), Alcohol en la dieta materna (No, Concentracin A Concentracin B), Concentracin de alcohol inyectado en las ratas (0, 1, 2, 3 4), Hora del da en que fue realizada la experiencia (Maana, Siesta, Tarde) y Concentracin de la droga antiestrs (A, B Control) Cree Ud. que existen diferencias significativas en la variable respuesta con respecto a la Variable Alcohol en la dieta materna? Ejercicio N 2.2: Supongamos que un investigador desea determinar la temperatura ptima de almacenamiento para la conservacin de manzanas. La variabl