Vigilancia centinela de virus respiratorio chavez-09-feb-11
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VIGILANCIA CENTINELA DE INFLUENZA Y OTRO VIRUS RESPIRATORIOS Gloria Chauca, Maria Gamero, Jane Ríos, Merly Sobero, Juan Pérez, Patricia Aguilar, Josefina García, Mónica Nieto, Ruth Centeno, Sonia Ampuero, Alberto Laguna, Eric Halsey, Edward Chávez, Víctor Ocaña, Centro Salud Militar Trujillo
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VIGILANCIA CENTINELA DE INFLUENZA Y OTRO VIRUS
RESPIRATORIOSGloria Chauca, Maria Gamero, Jane Ríos, Merly Sobero, Juan Pérez,
Patricia Aguilar, Josefina García, Mónica Nieto, Ruth Centeno, Sonia Ampuero, Alberto Laguna, Eric Halsey, Edward Chávez, Víctor Ocaña,
Centro Salud Militar Trujillo
METODOS DE IDENTIFICACION
• Cultivo celular: CPE y IFA• PCR/Secuenciamiento
FLUJOGRAMA
Aislamiento viral de una línea celular
Extracción de RNA
RT-PCR
FLU A FLU B
Secuenciamiento
Purificación de ADN
Subtipo
LÍNEA CELULAR MDCK
• Células de riñón canino (Madin-Darby Canine Kidney)
• Aislamiento virus de influenza A y B
• ECP: Forma de vacuolización y degeneración celular
LÍNEA CELULAR VERO
• Células de riñón de mono verde africano
• Aislamiento de Adenovirus, VRS, Herpes, Enterovirus
• ECP: Formación de sincitios y destrucción celular
LÍNEA CELULAR LLCMK2• Células de riñón de mono Rhesus• Aislamiento de Parainfluenza,
Influenza, Metapneumovirus• ECP: celulas pequeñas redondas
granulares y refringentes, sin grandes sincitios en muchos casos
ESTUDIO DE INFLUENZA – - PERU LABORATORIO NMRCD - LIMA, PERU AÑO 2008
ABRIL MAYO
JUNIO AGOSTO
Total De Sujetos Enrolados 58 1 1No. De Sujetos Con Muestra Procesada 56 1 1No. De Sujetos Con Cultivo Viral Pendiente* 2 0 0
Positivos: 43 1 0AdenovirusFLU A 42 1FLU A-HSVFLU A-Para FLU 1FLU BHSV 1FLU 1RSV
Negativo 13 1Genotipificación FLU A & B
Total 42 1FLU A 42 1
A/H1 28 1A/H3Genotipificación no realizada 14
FLU B 0 0Genotipificación no realizada
*Resultado De Prueba Rápida En Muestra Con Cultivo Viral Pendiente
2 0
FLU A 2FLU BNegativoNo resultado
ESTUDIO DE INFLUENZA – - PERUREPORTE DE RESULTADOS AÑO 2009
DIC-ENE FEBRERO MARZO ABRIL
TOTAL SUJETOS ENROLADOS 14 16 16 31
No. de sujetos con muestra procesada 14 0 16 31
No de sujetos con cultivo viral pendiente* 0 16 0 0
Positivos: 5 0 12 16Adenovirus-Enterovirus 0 1Adenovirus-Enterovirus 70/71 0Adenovirus-HSV 0 2Adenovirus-Para Flu 3 0Adenovirus 0Enterovirus-Coxsakie B 0 11Enterovirus 70/71 0 4
Flu A 0 10Flu B-Adenovirus 0Flu B 5
HMPV 0HSV 0Para Flu 1 0Para Flu 2 0Para Flu 3 0
Negativo 9 0 15
Total muestras positivas Influenza A & B 5 12 15
Total muestra genotipificadas 3 0 3
Flu A 0 0 3H1N1 0
Flu B 3Illinois 0Mississippi 0Nevada 3Texas 0Washington 0
*Resultado de prueba rápida en muestras con cultivo viral pendiente 0 16
FLU A 0 4 0FLU B 0
Negativo 0 12No resultado 0
ESTUDIO DE INFLUENZA - PERU - NMRCDCENTRO MEDICO MILITAR TRUJILLO 2009 2010JUL AGO SEP OCT NOV DIC TOTAL ENE FEB
Total sujetos enrolados 184 221 388 308 382 279 1762 73 149Cultivo viral:
Total muestras procesadas 70 2 80 37 107 207 503 63 52Muestras con cultivo viral pendiente* 114 219 308 271 275 72 1259 10 97Positivos 49 1 43 20 69 138 320 32 15
Adenovirus 2 0 0 0 0 2 0 1Adenovirus - HSV 0 0 0 0 0 0 0 1Coxsackie B 1 0 0 0 0 1 0 0Coxsackie B - HSV 0 0 0 0 1 1 0 0Echovirus 0 0 0 68 1 69 0 0Enterovirus 2 1 0 0 0 129 132 31 1Enterovirus - FLU A 0 42 19 0 0 61 0 0Enterovirus - HSV 0 0 0 0 5 5 0 0FLU A 42 0 0 0 0 42 0 0FLU A - HSV 1 0 0 0 0 1 1 0FLU A - Para FLU 2 0 0 0 0 0 0 0 0FLU A - RSV 0 0 0 0 0 0 0 0FLU B 0 0 0 0 1 1 0 1HMPV 0 1 1 1 0 3 0 0HSV 1 0 0 0 0 1 0 3HSV - RSV 0 0 0 0 0 0Para FLU 1 0 0 0 1 1 0Para FLU 2 0 0 0 0 0 2Para FLU 3 0 0 0 6RSV 0 0 0 0
No Aislamiento viral 21 1 37 17 38 69 183 31 37
*Resultado de prueba rapida en muestras con viral pendiente 114
219 308 271 27572
1259 1097
Influenza A 47 96 157 143 143 25 611 1 10Influenza B 0 1 1 1 0 0 3 0 1Positivo 3 4 2 1 1 1 12 0 0Negativo 64 118 145 123 128 46 624 9 82Sin resultado 0 0 3 3 3 0 9 0 4
Influenza A(H1N1)v (RT-PCR):Positivo 85 77 82 39 28 6 317 5 17Negativo 71 77 82 45 26 12 313 9 131Pendiente 28 67 224 224 328 261 1132 59 1
Bocavirus (RT-PCR):Positivo 0 0 0 0 0 0 0 0 0Negativo 0 1 75 2 2 0 80 0 0Pendiente 184 220 313 306 380 279 1682 73 149
ESTUDIO DE INFLUENZA - PERUREPORTE DE RESULTADOS DESDE EL 05 DE NOVIEMBRE DEL 2010 AL 06 DE DICIEMBRE DEL 2010LABORATORIO NMRCD, LIMA-PERU
Total 1190 100.0 3 117 58 15 13 234 26 16 92 159 347 110
Numero de Pacientes con Cultivo Viral: 961 80.8 0 117 57 4 5 163 26 16 68 87 308 110Positivos 547 56.9 0 82 22 1 1 102 15 1 32 38 196 57Negativos 414 43.1 0 35 35 3 4 61 11 15 36 49 112 53
En Proceso 229 19.2 3 0 1 11 8 71 0 0 24 72 39 0
Numero de virus aislados (cultivo):Adenovirus 20 3.7 0 3 0 0 0 5 1 1 0 5 3 2Enterovirus 2 0.4 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0FLU A 330 60.3 0 49 7 1 1 45 13 0 16 11 132 55FLU B 171 31.3 0 27 13 0 0 45 0 0 16 17 52 1HMPV 1 0.2 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0Para FLU 1 15 2.7 0 0 0 0 0 5 1 0 0 3 6 0Para FLU 2 2 0.4 0 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0Para FLU 3 10 1.8 0 1 2 0 0 2 0 0 0 2 3 0Para FLU 4 1 0.2 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0
Co-Infecciones:Adenovirus - FLU A 1 0.2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1Adenovirus - FLU B 1 0.2 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0Adenovirus - Para FLU 2 1 0.2 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0Adenovirus - Para FLU 4 1 0.2 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0Enterovirus - Para FLU 1 1 0.2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0
gPCR-RTTotal muestras procesadas 448 37.6 3 16 6 15 13 129 3 1 89 8 154 11
FLU A 197 44.0 0 12 6 5 8 81 0 0 35 0 42 8H1N1 (SW) pandémico 9 4.6 0 0 3 0 2 0 0 0 4 0 0 0FLU A Estacional H1 0 0.0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0FLU A Estacional H3 188 95.4 0 12 3 5 6 81 0 0 31 0 42 8
FLU B 91 20.3 0 2 0 0 0 22 0 1 17 2 47 0Negativo 160 35.7 3 2 0 10 5 26 3 0 37 6 65 3
La Libertad Tumbes YurimaguasCallao Piura Ucayali Madre De Dios
Total PERU
Count % Arequipa Junin Cusco IquitosLima
ESTUDIO DE INFLUENZA - PERU
REPORTE DE RESULTADOS DESDE EL 06 DE DICIEMBRE DEL 2010 AL 05 DE ENERO DEL 2011
LABORATORIO NAMRU-6, LIMA-PERU
Count % Arequipa Callao Junin Cusco Iquitos Lima PiuraMadre de
DiosPuno Trujillo Tumbes
Total 780 100.0 31 14 13 30 302 39 83 2 4 50 212
Numero de Pacientes con Cultivo Viral: 717 91.9 31 10 0 30 281 36 76 0 0 46 207Positivos 422 58.9 13 3 0 13 180 12 55 0 0 21 125Negativos 295 41.1 18 7 0 17 101 24 21 0 0 25 82
En Proceso 63 8.1 0 4 13 0 21 3 7 2 4 4 5
Numero de virus aislados (cultivo):Adenovirus 10 2.4 0 0 0 0 0 5 1 0 0 0 4Enterovirus 2 0.5 0 0 0 0 2 0 0 0 0 0 0FLU A 311 73.7 4 3 0 11 147 5 42 0 0 9 90FLU B 90 21.3 7 0 0 2 31 1 12 0 0 12 25HMPV 1 0.2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1Para FLU 1 6 1.4 0 0 0 0 2 0 0 0 0 0 4Para FLU 2 1 0.2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1Para FLU 3 4 0.9 1 0 0 0 0 2 0 0 0 0 1RSV 1 0.2 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
Co - Infecciones:Adenovirus - FLU A 1 0.2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1Adenovirus - Para FLU 3 1 0.2 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0Enterovirus - FLU A 2 0.5 0 0 0 0 2 0 0 0 0 0 0
PCR - RTTotal muestras procesadas 466 59.7 3 14 13 3 283 10 73 2 4 50 11
FLU A 264 56.7 0 8 10 3 175 2 47 0 0 16 3H1N1 (SW) pandémico 1 0.4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0FLU A Estacional H1 0 0.0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0FLU A Estacional H3 263 99.6 0 8 10 3 175 2 47 0 0 15 3
FLU B 71 15.2 0 0 1 0 43 0 10 0 2 14 1Negativo 131 28.1 3 6 2 0 65 8 16 2 2 20 7
Total PERU
ESTUDIO DE INFLUENZA - PERU
REPORTE DE RESULTADOS DESDE EL 06 DE ENERO DEL 2011 AL 31 DE ENERO DEL 2011
LABORATORIO NAMRU-6, LIMA-PERU
Count % Junin Loreto Lima Callao Piura Madre de Dios Puno La Libertad Tumbes Yurimaguas
Total 411 100.0 115 95 7 6 74 24 9 53 26 2
Numero de Pacientes con Cultivo Viral: 360 87.6 115 63 4 4 60 24 9 53 26 2Positivos 191 53.1 78 36 1 4 28 6 3 21 14 0Negativos 169 46.9 37 27 3 0 32 18 6 32 12 2
En Proceso 51 12.4 0 32 3 2 14 0 0 0 0 0
Numero de virus aislados (cultivo):ADENOVIRUS 2 1.0 0 0 0 0 2 0 0 0 0 0ENTEROVIRUS 8 4.2 0 0 0 0 4 0 1 2 1 0FLU A 119 62.3 62 10 1 4 17 3 2 12 8 0FLU B 52 27.2 9 25 0 0 6 2 1 4 5 0HMPV 3 1.6 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0PARA FLU 1 2 1.0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0PARA FLU 2 3 1.6 2 0 0 0 1 0 0 0 0 0PARA FLU 3 7 3.7 5 0 0 0 1 0 0 1 0 0PARA FLU 4 1 0.5 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0
Co - Infecciones:ADENOVIRUS-FLU A 2 1.0 0 0 0 0 2 0 0 0 0 0ENTEROVIRUS-FLU A 2 1.0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0FLU A-PARA FLU 2 1 0.5 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0FLU A-PARA FLU 4 1 0.5 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0
PCR - RTTotal muestras procesadas 129 31.4 13 67 6 6 18 3 4 7 5 0
FLU A 25 19.4 10 6 0 4 0 0 0 3 2 0H1N1 (SW) pandémico 2 8.0 0 2 0 0 0 0 0 0 0 0FLU A Estacional H1 0 0.0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0FLU A Estacional H3 23 92.0 10 4 0 4 0 0 0 3 2 0
FLU B 22 17.1 1 18 0 0 1 0 2 0 0 0Negativo 82 63.6 2 43 6 2 17 3 2 4 3 0
Total PERU
ProvinciaEstablecimiento de
Nombres y
Apel l i
EdadSex
oInicio de
enfermedad
RapitTest_Result
Code Date PLACE FLU_A FLU_B SW-FLU FLU A_H3 FLU A_H1
TRUJILLO C.M.M.VALDIVIEZO 19. M 21-ago-10 FLU B OBT9157 07/09/2010 CHOCOPE-TRUJILLO negative Positive
TRUJILLO C.M.M.UNKAHO/IT 18. M 24-ago-10 NEGATIVO OBT9158 07/09/2010 CHOCOPE-TRUJILLO negative Positive
TRUJILLO C.M.M.ASENCIO/ME 19. M 25-ago-10 FLU B OBT9159 07/09/2010 CHOCOPE-TRUJILLO negative Positive
TRUJILLO C.M.M.KASHKUM/Y 18. M 20-ago-10 FLU B OBT9160 07/09/2010 CHOCOPE-TRUJILLO negative Positive
TRUJILLO C.M.M.PUOPA/HU 19. M 21-ago-10 FLU B OBT9161 07/09/2010 CHOCOPE-TRUJILLO negative Positive
TRUJILLO C.M.M.YAMPIES/PU 18. M 25-ago-10 FLU B OBT9162 07/09/2010 CHOCOPE-TRUJILLO negative Positive
TRUJILLO C.M.M.REYES/COLO 18. M 21-ago-10 FLU B OBT9163 07/09/2010 CHOCOPE-TRUJILLO negative Positive
TRUJILLO C.M.M.ABANTO/CH 21. M 20-ago-10 FLU B OBT9164 07/09/2010 CHOCOPE-TRUJILLO negative Positive
TRUJILLO C.M.M.TEJIN/UHUA 18. M 21-ago-10 FLU B OBT9165 07/09/2010 CHOCOPE-TRUJILLO negative Positive
TRUJILLO C.M.M.PIZANGO/T 18. M 21-ago-10 NEGATIVO OBT9166 07/09/2010 CHOCOPE-TRUJILLO negative Positive
TRUJILLO C.M.M.VELDA/RICO 20. M 23-ago-10 NEGATIVO OBT9167 07/09/2010 CHOCOPE-TRUJILLO negative negative
TRUJILLO C.M.M.SABOCAY/PA 30. M 21-ago-10 NEGATIVO OBT9168 07/09/2010 CHOCOPE-TRUJILLO negative negative
TRUJILLO C.M.M.GUILLEN/RI 18. M 23-ago-10 NEGATIVO OBT9169 07/09/2010 CHOCOPE-TRUJILLO negative negative
TRUJILLO C.M.M.RODRIGUEZ 18. M 21-ago-10 NEGATIVO OBT9170 07/09/2010 CHOCOPE-TRUJILLO negative Positive
TRUJILLO C.M.M.ARSE/ARREL 21. M 21-ago-10 NEGATIVO OBT9171 07/09/2010 CHOCOPE-TRUJILLO negative negative
TRUJILLO C.M.M.PITUC/TAIS 19. M 24-ago-10 NEGATIVO OBT9172 07/09/2010 CHOCOPE-TRUJILLO negative negative
BROTE DE INFLUENZA B CUARTEL DE CHOCOPE – AGOS10
NOMENCLATURA DEL VIRUS DE INFLUENZA
A/Brisbane/59/07(H1N1)
TIPO DE VIRUS
REGION GEOGRAFICA DE ORIGEN
N° DE LINAJE
AÑO DE AISLAMIENTO
TIPO ENTIGENICO
