Vigilancia de la Infección Respiratoria Aguda en Colombia · IFA / IFD Fuente: Grupo de Virología...
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Vigilancia de la Infección Respiratoria Aguda en Colombia
Dirección Redes en Salud Pública
Dirección de Vigilancia y Análisis del Riesgo en Salud Pública
Instituto Nacional de Salud
Introdución
Aproximadamente 4.000.000 de muertes por año son notificados con IRA.(Chonmaitree, 2008)
3,6 millones de casos fatales ocurre en los menores de 5 años. (Chonmaitree,
2008; Lopez A, 2006; Mathers C, 2008).
Principal causa de hospitalización y de administración de antibióticos en
menores de 5 años. (Neuzil y Cols, 2003; Navarro-Mari y Cols, 2003)
Instituto Nacional de Salud
Virus Sincitial Respiratorio (A, B)
Parainfluenza virus (1, 2, 3, 4A,B)
Coronavirus (229E, OC43)
Rinovirus (100+ serotipos) & Enterovirus (65 serotipos)
Adenovirus (51+ serotipos)
Virus Respiratorios “ clásicos”
Instituto Nacional de Salud
• Metapneumovirus humano, 2002
• SARS coronavirus, 2003
• Coronavirus humanos NL63, 2004; HKU1, 2005
• Bocavirus humanos, 2005
• Mimivirus, 2005
• Adenovirus tipo 14, 2006
• Rinovirus especie C, 2006
• WU & KI polyomavirus, 2007
• Enterovirus 68, 2010
• Nuevo coronavirus, 2012 MERS
Virus respiratorios “emergentes”descubiertos entre 2002-2012
Instituto Nacional de Salud
Virus de influenza tipo A y B
Tipo de virus de
influenzaCaracterísticas del virus
Influenza A
• Puede causar epidemias y pandemias.
• Puede infectar a varias especies
• La combinación de dos proteínas en la superficie del virus, la
hemaglutinina (HA) y la neuraminidasa (NA), determina los
subtipos
Hay 16 variedades conocidas de HA
Hay 9 variedades conocidas de NA
Hay 144 (16x9) combinaciones posibles
Influenza B
• Produce casos mayormente leves
• Puede causar epidemias
• Ocurre sólo en seres humanos
Dos linajes (yamagata y Victoria)
Influenza C Ocurre sólo en seres humanos
• A / H3
• A (H1N1)pdm09
• A / H3 sw
• A (H5N1)
• A (H7N9)
Instituto Nacional de Salud
¿Como lo hacemos?
Hospitalización (IRAG o IRAGi)
Donde se realiza una vigilancia:
Nacional
Centinela
Ambulatorio (ESI)
vigilamos
IFITécnicas
moleculares
Análisis de datosRT-PCR en tiempo real (protocolo CDC).
Instituto Nacional de Salud
¿Por que la vigilancia Virológica?
Instituto Nacional de Salud
Antecedentes en Colombia
NIC (WHO Global Influenza
Surveillance Network (GISN)
5 centinelas
1997•Plan anti
pandemia
•40 UPGDs
• IFI en 12 LSPD.
2006
•Pandemia A (H1N1)pdm09
•40 UPGDs
•15 LSPD con IFI, 3 con rRT-PCR
2009
UPGD centinela:•Atención médica ambulatoria y/o de hospitalización•Atención a población menor y mayores de cinco años.•Pertenezcan a la red pública o privada.•Cuenten con recurso humano.•Compromiso institucional y capacidad logística para implementar y desarrollar los procesos operativos y técnicos de la vigilancia de ESI/IRAG
NIC: Centro Nacional de Influenza
UPGD: Unidad primaria generadora de de datos
Instituto Nacional de Salud
¿Qué es un NIC?
• Centros Nacionales deInfluenza que hacen partede la red de laboratoriosde la OMS
• En 23 países:• 24 NICs + 6 labs nacionales
= Red Global de Influenza(GISRS).
• RT-PCR / IFI
• 1 CC-OMS (CDC Atlanta,USA)
CC-OMS: Centro colaborador de la orgnización Mundial de la SaludFuente:OPS/OMS
Instituto Nacional de Salud
Red de IRA por laboratorio
LSPD con Dx IFI
LSPD que remiten mx
LSP Bogotá
LSPD con Dx rRT-PCR
LSPD CON CAPACIDAD
DIAGNOSTICA VIGIALNCIA
CENTINELA DE ESI - IRAG
Amazonas
Arauca
Antioquia
Atlántico
Bogotá
Boyacá
Caldas
Cundinamarca
Cesar
Huila
Meta
Quindío
Risaralda
Santander
Nariño
Nte. Santander
Valle
DEPARTAMENTOS QUE
REMITEN MUESTRAS AL INS
EN LA VIGILANCIA
CENTINELA DE ESI-IRAG
Guaviare
Tolima
Bolívar (Cartagena)
Instituto Nacional de Salud
14 laboratorios departamentales
26 UPGD
Red de laboratorio para la vigilancia de influenza
Flu A : qRT-PCR: (protocolo CDC)
- Gen M: influenza A
- Subtipos (Gen H): (H1N1)pdm09, H3
Virus no Flu (21): qRT-PCR (protocolo CDC)
Instituto Nacional de Salud
Capacidad de laboratorio en Colombia
Flu A y B: qRT-PCR: (protocolo CDC)
Virus no Flu (19 ) : qRT-PCR (protocolo CDC)
PCR convencional
Aislamiento viral: Flu (MDCK), VSR (Hep-2),
AdV(H292), hMPV (LLMCK-2)
Envió al CDC: Formulación anual de la vacuna
de Influenza
Estandarización de técnicas moleculares para:
Resistencia a Oseltamivir
Linaje de Influenza B
Estudios: Carga de la enfermedad de influenza –
Efectividad de la vacuna de influenza.
Instituto Nacional de Salud
OPS/OMS
Sistema de información regional/global
Instituto Nacional de Salud
Circulación de influenza en la region de las Americas
Fuente:OPS/OMS
Instituto Nacional de Salud
Circulación de VSR
Fuente:OPS/OMS
Instituto Nacional de Salud
Algoritmo de información
Médicos / Instituciones Centinelas
Departamentos (LSP)
Instituto Nacional de Salud
Centro Colaborador de Referencia Para la Investigación contra Influenza
CDC de Atlanta, Georgia, USA
Organización Mundial de la Salud
(OMS - Ginebra)/Flunet
Instituto Nacional de Salud
Vigilancia virológica
IRA
ESI
(centinela)
IRAG (centinela)
IRAGi
Morbilidad y
mortalidad <5años
ESI: Enfermedad similar a influenza (ambulatorio)IRAG: Infecció Respiratoria Aguda Grave (hospitalizado)IRAG: Infección Respiratoria Aguda Grave inusitada
La recolección de muestras
respiratorias únicamente y
semanalmente (100%) en las
UPGDs seleccionadas para la
vigilancia centinela en los
departamentos priorizados.
Monitorear semanalmente los
agentes virales
Identificar grupos de riesgo
Implementar medidas de salud
pública
Instituto Nacional de Salud
• Cálidad de la muestra:
• Bien tomada (Celularidad)
• Bien conservada (Viabilidad viral, Integridad de AN)
• Bien enviada (Oportunidad y bioseguridad)
• Momento de la infección en que se toma la mx:
• Dinámica viral
• Respuesta inmune
El éxito dependera de:
Detección por laboratorio
Instituto Nacional de Salud
Ensayos Virológico
Muestras nasofaríngeas
(siete primeros días de inicio
de los síntomas)
CULTIVO CELULAR
METODOS TRADICIONALES
rRT-PCRINMUNOFLUORESCENCIA
IFA / IFD
Fuente: Grupo de Virología –SRNL -INS Fuente: Grupo de Virología –SRNL -INS
METODOS MOLECULARES
Instituto Nacional de Salud
Dinámica Viral
Días de infección
Carg
a v
ira
l
inmunofluorescencia
Aislamiento viral
Instituto Nacional de Salud
BAJO
VOLUMEN
HISOPO DE MADERA
INCORRECTOCORRECTO
Muestra: Hisopado
Instituto Nacional de Salud
Muestra de Aspirado Nasofaringeo
INCORRECTOCORRECTO
Instituto Nacional de Salud
CORRECTO INCORRECTO
Muestras de tejidos post-mortem
Instituto Nacional de Salud
muestra: sangre total que envían con tejidos
INCORRECTO
Instituto Nacional de Salud
En los casos de Enfermedad Similar a Influenza – ESI y/o casos de
Infección Respiratoria Aguda Grave –IRAG: se realiza la recolección de
muestras respiratorias únicamente en las UPGDs seleccionadas para la
vigilancia centinela en los departamentos priorizados. Estas muestras son
procesadas para diagnóstico de Influenza y otros virus respiratorios por la
técnica de inmunofluorescencia y/o rRT-PCR en los respectivos laboratorios
departamentales o distrital de salud pública (LDSP),
Vigilancia Virológica IRA
Los LDSP capacitados para realizar el diagnóstico de Influenza y otros Virus
Respiratorios por la técnica de Inmunofluorescencia (IFI), deben procesar las
muestras de casos captados en la vigilancia centinela de ESI-IRAG y remitir
mensualmente la información de las muestras procesadas y el control de
calidad indirecto al INS.
Instituto Nacional de Salud
En un caso fatal con alta sospecha de muerte por algún agente
respiratorio, se recomiendan cortes de tejido del tracto respiratorio en solución
salina refrigerados para análisis virológico con contra muestra en formol
tamponado al 10% para estudio histopatológico y se deben enviar al INS.
Si es sospecha de un caso de IRAG inusitado se debe recolectar muestra y
enviar al INS
Los Departamentos que no tengan capacidad diagnostica solo deben
recolectar muestras que cumplan con la definición de caso IRAG inusitado
o cuando se trate de un caso fatal.
Vigilancia Virológica IRA
Instituto Nacional de Salud
Distribución de virus de influenza y otros virus respiratorios. Colombia
sem 36
0%
10%
20%
30%
40%
50%
60%
70%
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1 3 5 7 9 11 13 15 17 19 21 23 25 27 29 31 33 35 37 39 41 43 45 47 49 51
Po
rce
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vas
Otros Bocavirus Coronavirus Rinovirus Metapneumovirus Adenovirus VSR
Parainfluenza Influenza B A(H3) A no subtipificado A(H1N1)pdm09 % Positivos
Fuente: Red Nacional de laboratorios de influenza y otros virus respiratorios
Instituto Nacional de Salud
Distribución de influenza (tipos y subtipos). Colombia. 2015
0%
10%
20%
30%
40%
50%
60%
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90%
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Nú
mero
de c
aso
s p
osit
ivo
s
Semana Epidemiológica
A(H1N1)pdm09 A no subtipificado A(H3) Influenza B % positivos a influenza entre total de muestras
Fuente: Red Nacional de laboratorios de influenza y otros virus respiratorios
Instituto Nacional de Salud
Proporción acumulada de los virus de influenza y otros virus
respiratorios
A(H1N1)pdm095%
A(H3)5%
Flu B1%
Parainfluenza 12%
VSR 51%
Adenovirus7%
Metapneumovirus4%
Rinovirus4%
Coronavirus5%
Bocavirus5% Otros
1%
A(H1N1)pdm09 A no subtipificado A(H3) B Victoria B Yamagata
B linaje no determinado Parainfluenza VSR Adenovirus Metapneumovirus
Rinovirus Coronavirus Bocavirus Otros
Fuente: Red Nacional de laboratorios de influenza y otros virus respiratorios
Instituto Nacional de Salud
0
50
100
150
200
250
300
1 4 7 10 13 16 19 22 25 28 31 34 37 40 43 46 49 52 3 6 9 12 15 18 21 24 27 30 33 36 39 42 45 48 51 2 5 8 11 14 17 20
2013 2014 2015
A(H1N1)pdm09 A no subtipificado A(H3) influenza B Parainfluenza VSR Adenovirus
Metapneumovirus Rinovirus Coronavirus Bocavirus Otros Muestras Negativas
Núm
ero
de m
uestr
as p
ositiv
as
Circulación del virus de influenza y otros virus
respiratorios, Colombia 2010 - 2014
N=6.460 muestras
positivas
26,5% 39,8% 57,3%
Instituto Nacional de Salud
Vigilancia de ESI
Fuente:INS
Instituto Nacional de Salud
Vigilancia de IRAG
Fuente:INS
Instituto Nacional de Salud
Circulación viral en ESI
ESI
2013 2014 2015
Fuente:INS
Instituto Nacional de Salud
Circulación viral de IRAG
IRAG
2013 2014 2015
Fuente:INS
Instituto Nacional de Salud
Resumen
• Los LDSP que han sido capacitados para realizar el diagnostico deInfluenza y otros Virus Respiratorios por la tecnica deInmunofluorescencia (IFI), deberan procesar las muestras de casoscaptados en la vigilancia centinela de ESI-IRAG, que tengan hasta7 dias de inicio de sintomas, las muestras que tengan mas de 7dias de inicio de sintomas deben ser procedas por LSPDcapacitado para realizar PCR o remitirlas al INS.
Por lo anterior, se debe remitir de inmediato las muestras con resultado
positivo para influenza tipo A y B por IFI al LSPD capacitado para PCR o
al INS, con el fin de realizar la debida subtipificacion del virus de Influenza
tipo A y confirmacion de influenza B
Instituto Nacional de Salud
Resumen
• Los LDSP con capacidad de realizar diagnostico molecular de Influenza
A, mediante la tecnica de PCR en tiempo real (rRT-PCR), deberan
procesar las muestras de todos los casos de IRAG con fecha de inicio
de sintomas hasta 10 dias de incio de sintomas , exceptuando los casos
de IRAG inusitado los cuales se deben remitir al INS.
Adicionalmente, las muestras con resultado positivo para Influenza A
que no se puedan subtipificar, es decir, que no correspondan A(H1N1)
pdm09, con el fin identificar otro subtipo del virus de influenza.
Instituto Nacional de Salud
Retos en la vigilancia por laboratorios
Mejorar el sistema de información desde el nivel local hasta el nivel
nacional articulada la información de vigilancia epidemiológica con la
información del laboratorio.
Fortalecer la vigilancia virologica y epidemiologica de IRA en cuanto a
captación del caso (ESI/IRAG, IRAGi), recolección, procesamiento,
transporte y notificación y ajuste del caso
Fortalecer la RNL para que el diagnóstico del laboratorio permita la
detección oportuna de la circulación de agentes virales de interés en
salud pública.
Hacer retroalimentación de la información desde el nivel nacional
hasta el nivel local
Descentralizar el diagnóstico molecular influenza a otros laboratorios
del país.
Instituto Nacional de Salud
Agradecimientos
A las UPGDs que son la vital para la vigilancia
centinela de IRA en Colombia.
A los Laboratorios de Salud Pública que hacen
parte de la Red Nacional de Influenza y otros
virus respiratorios del país.
A las referentes de Vigilancia epidemiologica de
los LSP, del INS (Diana Malo y Paola Pulido) y a
los referentes de IRA del Minsterio de Salud.
A las estudiantes y compañeras que han hecho y
hacen parte del grupo de influenza y otros virus
respiratorios del INS
Instituto Nacional de Salud
Instituto Nacional de Salud
PBX: (57-1) 220 77 00
Bogotá, COLOMBIA
www.ins.gov.co
Línea gratuita nacional: 01 8000 113 400
GRACIAS
Dirección de Redes en Salud PúblicaDirección de Vigilancia y Análisis del Riesgo en Salud Publica
Equipo Funcional IRA
Juliana Barbosa – Erika Ospitia
[email protected] - [email protected]
Diana Malo – Paola Pulido