Dogma central
Organización celular procarionte y eucarionte
En eucariontes la transcripción se encuentra espacial y temporalmente
separada de la traducción
DNA RNA Transcripción
Procariontes
mRNA
rRNA
tRNA
snRNA
snoRNA
scaRNA
miRNA
siRNA
Otros no
codificantes
RNA mensajero, codifica para proteína
RNA ribosomal, componente estructural del ribosoma
RNA de transferencia, adaptador entre mRNA y proteína
RNAs pequeños nucleares, funcionan en corte y empalme de
intrones
RNAs pequeños nucleolares, procesamiento y modificación
de rRNA
RNAs pequeños de cajal, modifican snoRNAs, snRNAs,
miRNAs, regulan traducción específica
microRNAs, regulan la expresión genética
RNAs pequeños interferentes, apagan la expresión de genes
mediante degradación de mRNAs específicos y mediante
modificación epigenética del DNA
Otros RNAs no codificantes que funcionan en procesos
diversos como síntesis de telómeros, inactivación del
cromosoma X, transporte de proteínas, etc.
DNA RNA Transcripción
Eucariontes
La estructura química del RNA
Cadena sencilla
Ribosa (2’ y 3’OH)
Uracilo en lugar de timina
El uracilo se aparea con la adenina
Dúplex Región de
cadena sencilla
Tallo - asa Protuberancia
Burbujas internas
Desapareamiento, simétrica, asimétrica
Juntas
Tres tallos, cuatro tallos
El RNA es mono-catenario pero puede formar regiones de doble cadena
Estructura secundaria en el RNA mensajero
Los ribonucleótidos pueden presentar diversas modificaciones necesarias para cumplir su función
Estas modificaciones son comunes en el tRNA
Estructura secundaria y terciaria en el RNA de transferencia
Estructura secundaria y terciaria en el RNA ribosomal
Transcripción
RNA polimerasa
Solo se utiliza una de las cadenas como molde
molde
El RNA transcrito es complementario a la secuencia de
la cadena de DNA que se utilizó como molde y es
idéntico a la cadena CODIFICANTE excepto por la
presencia de U.
DNA
RNA
molde codificante
Sustratos: NTPs (ATP, UTP, GTP, CTP)
ADICIÓN DE NUCLEÓTIDOS
5’ 3’
La transcripción involucra tres etapas:
•Inicio
•Elongación •Terminación
Caja Pribnow: TATAAT
Secuencia – 35: TTGACA
Elemento UP: AAAWWTWTTTTNNNAAANNN
W: A/G
N: cualquier nucleótido
(opcional)
INICIO (Bacteria)
Promotor: secuencias que reconoce la RNA polimerasa y proteínas asociadas
a ella para iniciar la transcripción
purina
Conservación de las cajas TATA (– 10) y – 35 en procariontes
¿En cuál de las dos cadenas se leen estas secuencias?
5’ 3’
En la cadena codificante
Los promotores tienen orientación e indican el sentido del movimiento de la RNA polimerasa
La dirección de la transcripción de los genes puede variar en el cromosoma
RNA polimerasa
- no requiere cebador
- utiliza Mg2+ como cofactor
- utiliza NTPs como sustrato
- transcribe en sentido 5’ 3’
Subunidades de la RNA polimerasa bacteriana
Centro catalítico
Especificidad promotor
Factores sigma (s)
Hay diferentes factores sigma que reconocen a
diferentes promotores
HOLOENZIMA
Burbuja de transcripción y movimiento
Existen diferentes estados en la iniciación
Factores sigma
Complejo cerrado
Complejo abierto
Elongación de la transcripción
La polimerasa mantiene unos 10 nt desapareados
en el DNA: lugar donde ocurre la síntesis de RNA
Terminación de la transcripción bacteriana
terminadores intrínsecos, independientes de la proteína ρ (Rho); se forman en el RNA transcrito por apareamiento, pausan a la Polimerasa y esta libera el RNA recién sintetizado
Terminadores dependientes de Rho; La proteína Rho (helicasa) se une al RNA en regiones ricas en C (sitios rut) y avanza hasta la burbuja de transcripción donde desenrolla el complejo DNA:RNA y libera el transcrito
sitios RUT
Las rifampicinas son
antibióticos producidos por
Streptomyces mediterranei,
con buena actividad contra
bacterias Gram-positivas y
contra Mycobacterium
tuberculosis. Su mecanismo
de acción estriba en la
inhibición del inicio de la
transcripción, uniéndose de
modo no covalente a la
subunidad ß de la RNA
polimerasa bacteriana.
Rifampicina B
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