Post on 08-Nov-2018
Es todo el ADN que un organismo contiene. 1920, Hans Winkler abreviatura de palabras gene ycromosoma.
Tamaño de algunos tipos de genomas
Organismo Tamaño Genoma
(pares de bases)
Fago
λ 5×104
Escherichia coli 4×106
Levadura 2×107
Caenorhabditis elegans 8×107
Drosophila melanogaster 2×108
Humano 3×109
Prueba genéticaTratamiento de enfermedadGenómica microbianaBioarqueología.Antropología Evolución PaleogenéticaFilogenómica
• Genealogia de genes• Dificultad para unir
diferentes tipos de analisis.
• Hay información que escapa a la capacidad de genes individuales “función de intrones”, arreglos genomicos, realciones epigeneticas, etc.
• Con la revolución de la tecnología, ya existen nuevas herramientas.
• ION TORRENT
http://www.iontorrent.com/
Es una plataforma de análisis de genomas en interface Unix.Unix, es un sistema adaptable y libre, de uso para redes (internet, y . . workstation, etc)
Objetivo. Comparar el resultado generado por diversos programas. Usa modelos para procariota y eucariotas.
Se utiliza la herramienta de comparación de Artemis (ACT).Se utiliza para comparar la secuencia posición y arreglos genómicos de secuencias de especies diferentes.Se analiza:
Evolución genómica y para buscar o probar modelos de genes.
Sirve para revisar y comparar la calidad de diferentes secuencias que pueden ser de la misma especie. Complicaciones en el ensablaje del genoma.Puede indicar sitios con problemas de secuenciacion o SNP.
Utiliza lenguaje de programación de DOS, UNIX y PERL (Practical Extraction Report Language).Esto debido a la cantidad de información que reta la capacidad de los programas de análisis.
Como una aplicación derivada del análisis de arreglos genómicos y presencia y ausencia de secuencias.Se espera resolvería problema de filogenia del gen vs filogenia de especie.
Permite busqueda de información de genes, blast, dominios en una proteina.Pagina de EMBL-EBI que contiene secuencias de genomas.