Post on 15-Nov-2018
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EndogamiaApareamiento no-aleatorio(consanguinidad)
GENETICA DE POBLACIONES:
Luis Eguiarte,Valeria Souza,et al.
Edogamia: se reduce la proporción de homócigosf. alélicas constantes
apareamientos no-aleatorios...
Endogamia más extrema...autoferilización...
A aA AA Aaa Aa aa
cada generación se pierda lamitad de H
se pierde la endogamia en una generaciónde apareamientos al azar!
Endogamia todos los loci igual... sel y mutación loci ind.
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la deriva no cambia la Hobs.dentro de las poblaciones pero si las f. alélicas.la endogamia cambia la H, pero f.alélicas cts.
Coeficiente de endogamia f
p. de dos alelos idénticos por “ancestría” o autócigos(homócigos, pero las dos copias son de un solo ancestro reciente)
p. de tomar el alelo p. de que sea autócigo IBD
homócigos normales
autocigos por endogamia
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aumenta
aumenta
disminuye
Si hay endogamia, f mayor que 0 y sereducen los H proporcionalmente
el máximo valor def es 1, sólo homócigos0= Hardy-Weinberg
estimación (indirecta) de f
(directa promediode pedigris)
Lobos Grises Escandinavos
4 + 4 fundadores...
4
relación f (directa del pedrigi) y H...
Micros, 29 loci de 29 lobos
esperada
Las f. alélicas cts. en endogamia Genotipos relativos de genesrecesivos
aumentan muchísimo, ya quese expresan los recesivos deletéreos
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individuos enfermos, el % de sus padres que eran primos hermanos
f=1/16
entre más raro es el alelo, mas dramático es el incrementoen los recesivos con endogamia
La f que se produce en diferentes apareamientos endogámicos
Autofertilización estricta
Tipos de apareamientos y progenie
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pero...no cambianlas frecuencias alélicas p /q
los heterócigosse reducen a la mitaden c/ generación
HP=p
H=0
se pierdetoda la var.genéticaen ca. 6 gen.
Autofertilización Parcial S+T=1
S proporción auto, T cruzada
no cambia las f. alélicas
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no se pierde la H (la regenera T)
S=0.9
H.W.
a más variación y mayor T (menor S) se puedemantener mayor He
si t es muy grande, la (s/2)t es casi cero
La f al tiempo t, si hay autofertilización parcialS =
y T= (1-fe)/ (1+fe)solo si toda la endogamiase debe a autofertilización
ESTIMACION S: 2 enfoques, directa de familias, e indirecta de la f e
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De f y de la progenie: solo iguales si no hay otras fuentes deendogamia, ya se llego al eq. y no otras fuerzas evolutivas
mamás homocigas
mamás heterocigas
estimaciones experimentales directasa partir de análisis de semillas en plantasmadre
Hijos heterócigos de madres homócigas
f. alélicadel aleloque NOtiene la madre
proporción dehijos heterócigosde madreshomocígiasii
El estandard es el programa deKermit Ritland: MLTR
puede estimar la T por familia y para lapoblación con errores, por loci o multilocicon o sin el genotipo de la madrepara genes codominantes y dominantesentre más baja la T necesita más hijos porfamilia (para detectar eventos de T)...
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Estimado directo T =0.02 a 0.05... Feq (de esa T) =0.9 a 0.96
F real de 0.539 a 0.851, mucho más baja quela esperada... SN vs. homócigos?
Pinus radiatamicrosátelites
F y T en el equilibrio por familia y sitio
f
Las T y S muy variables entre individuosen una población y entre dif. poblacionesClegg (1980)
Diferencias entre familias debidas a genética(forma de las flores, alelos de incompatibilidad,recursos y néctar) y puramente ecológicos(como les fue en ese año y lugar, luz, temp.,humedad)
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También se pueden obtener en animalesque se autofertilizan:Caracoles dulce-acuáticos Bulinus truncatusEstimación indirecta de S a partir de frelativamente cte. en el tiempo
Bidens menziensii:Compuesta de HawaiiVariación entre sitios y plantasRitland y Ganders (1985)
Endogamia biparental: la generada porapareamiento entre parientes que nos sea por autofertilización
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Tm- Ts: si es positiva hay endogamia biparental:Ts incluye otras formas de endogamia, la Tm solo es autofertilización
Tm =1Ts menor a 1:no se autofertilizan pero si secruzan entre parientes(dispersión de polen y semillaslimitadas!)
40% de cruzas entre hermanos completos!
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transplanta plantas, para evitar cruzas con parientesla Tm-Ts es = 0 en ambos casos
Evolutionary Ecology of Tequila, Mezcal and other Agaves.
Luis E. Eguiarte
Instituto de Ecología, Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM), México.
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Luis E. Eguiarte
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Luis E. Eguiarte
Instituto de Ecología, Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM), México.ALTAVARIACIÓN
GENÉTICA
Evolutionary Ecology of Tequila, Mezcal and other Agaves.
Luis E. Eguiarte
Instituto de Ecología, Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM), México.
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Luis E. Eguiarte
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ALGO DE ENDOGAMIA, Fis positiva... Poca diferenciación
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Luis E. Eguiarte
Instituto de Ecología, Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM), México.
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Luis E. Eguiarte
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las autoplinizaciones no dejan semillas.las cruzas entre morfos mejores!
Evolutionary Ecology of Tequila, Mezcal and other Agaves.
Luis E. Eguiarte
Instituto de Ecología, Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM), México.
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Luis E. Eguiarte
Instituto de Ecología, Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM), México.
estimaciones genética, no se produce progeniepor autofecundiación, la Fis no fue significativa...
Tasa de polinización cruzada, t
cruza entre hermanos entre primos hermanos
usados para producir líneas “puras”Hermanos: en 18 generaciones se pierde H
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La mitad de H se pierde en 10 generaciones
la probabilidad de heredarun alelo a un hijo es ½
así podemos calcular la probabilidad que un alelo lleguea un descendiente
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la probabilidad total es la p de queel alelo llegue por una vía x la p deque llegue por la otra vía
coeficiente de endogamia de Z
y como son dos alelos, se suma 1/64+ 1/64
estimación de hermanos completos en latabla, como son dos CA y 4 alelos, f= ¼(1/2 x 1/2) (una vía) x (1/2 x 1/2) (otra vía) x4 alelos 16/64 autocigos= ¼= f
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no secuenta
1) una cadena comienza con un padresube al CA y baja al otro progenitor
3
1
2 4
5
3
2) si hay más de un CA, sesuman las cadenas seis en c/ cadena 1/64 + 1/64
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3) si el ancestro común ya era endogámico
donde f CA(i) es el coeficiente de endogamiadel ancestro endogámico i en cadenas complicadas:
1) cada individuos solo una vez en la cadena2) que la cadena desciende del CA a los padres
Ejemplo: Pedigrí condos complicaciones:a) de B a Y por E y por Lb) H ya es endógamof=0.125
apenas como cruza entreprimos hermanos
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Depresión por Endogamia
la progenie endogámica funciona peorque la progenie de cruzas al azar!
evita que se evolucione a la autofecundación
la depresión por endogamia es talvez el principal problema para la genética de la conservación!
En muchos casos se pierden los linajes endogámicos: la depresión porendogamia muy grande
= en muchos agaves!aumenta la depresión
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la w decrece como al aumentar f, la endogamia
tamaño decamada
sobrevivencia
una cruzaentre hermanoste baja law ca.35%comparado la progenieproducto decruzas al azar!
fin sexta sesión endogamia