Mètodes d'anàlisi de dades de biodiversitat

Xavier Font* Jordi Carreras* Francesc Oliva**

*Departament de Biologia Vegetal, Universitat de Barcelona

** Departament de Bioestadística, Universitat de Barcelona

Vernacular (FR): Pyrale du maïs

Vernacular (ES): Piral del maíz

Diagnosis: Wingspan 26-30mm; sexually dimorphic;male: forewings ochreous to dark brown; female: forewings pale yellow; …

Alimentación: Zea mais L.

Species: Ostrinia nubilalis (Hübner, 1796)

Family: Pyralidae

Order: Lepidoptera

Class: Insecta

Genus: Ostrinia Hübner, 1825

Vernacular (EN): European Corn-borer

Familia: Gramineae

Taxonomía y nomenclatura

Colección: LU LepidopteraRecord id: LU_003217País: GaliciaCoordenadas03.047˚E 48.730˚NFecha: 28 Junio 2005Recolector: P. Pando

Especimen y observación

Interaciones ecológicas

Locus: AAL35331Definition: acyl-CoA Z/E11 desaturase

1 mvpyattadg hpekdecfed...

Mapa genético

Average RainfallLocation: 48.82°N 2.29°E Jan Feb Mar Apr ...182.3 120.6 158.1 204.9 ...

Datos abiòticos

Descripción

Pheromones of Ostriniahttp://www.nysaes.cornell.edu/fst/faculty/acree/pheronet/phlist/ostrinia.html

Bibliografía i recursos Web

Synonym: Pyralis nubilalis Hübner, 1796

Criterios IUCN, Leyes,etc.

Conservación/ProtecciónDatos sobre biodiversidad

P. Pando

Autoría del dato

Coordenadas 03.047˚E 48.730˚N

Species: Ostrinia nubilalis

P. Pando

Fecha: 28 Junio 2005

Average RainfallLocation: 48.82°N 2.29°E Jan Feb Mar Apr ...182.3 120.6 158.1 204.9 ...

Datos abiòticos

Fuentes de información:

-GBIF (http://www.gbif.org)

-BioCase (http://www.biocase.org)

-RED MUNDIAL DE INFORMACIÓN SOBRE BIODIVERSIDAD (http://www.conabio.gob.mx/remib/doctos/remib_esp.html)

-Species analyst (http://www.iabin-us.org/projects/species_analyst/species_analyst.html)

Proyectos de informatización de datos de Biodiversidad Internacionales

•Estatales-Proyecto Anthos (http://www.anthos.es/) -Nodo nacional GBIF (http://www.gbif.es/gbifes.php-SIVIM (http://www.sivim.info)

Proyectos de informatización de datos de Biodiversidad en España

•Autonómicos-Banco de datos de Cataluña (http://biodiver.bio.ub.es/biocat/)-Atlas de la flora de Aragón (http://www.ipe.csic.es/floragon/)-El Banco de datos de Biodiversidad de la comunidad

Valenciana (http://www.gva.es/)

-Biota”, de la Comunidad Autónoma de Canarias (http://www.gobcan.es/medioambiente/biodiversidad/ceplam/

bancodatos/biotaespecies.html) -Otros en desarrollo (Illes Balears y País Vasco)

Proyectos de informatización de datos de Biodiversidad en España

•Institucionales (museos, institutos de botánica, etc.)-Real Jardín Botánico (CSIC), Herbario de Criptogamia

http://www.rjb.csic.es/herbario/crypto/crydbe.htm-Herbario de la Universidad de Granada (http://drimys.ugr.es/)-CeDocBiV (http://herbaribcn.ub.es/biocase/cgi/querytool.py

Datos GBIF

Data Providers 266 

 Datasets 7621 

 Searchable records 151,222,333 

Datos GBIF

30.956.394 registros con coordenadas

JDBC

Wel

wits

chia

Inte

rne

t

Fagus

Quercus TurboVeg XMLNew XML schemas?

ABCD (BioCase)DarwinCore II (GBIF)

Anthos

Taxus Zamia Ginkgo Georeferenced data

Collections Specimen data

Specimen digititation

= Servicio Web Zamia = Programa gratuïto Taxus = de pago

Yucca

Cartography

WMS

Xanthorrhoea

Xanthorrhoea Araucaria

Xanthorrhoea Araucaria

WMS

• Todo el software de VegAna está escrito en lenguaje Java, que permite que funcione en todas las plataformas que soportan el Java Virtual Machine (JVM). Por ejemplo: Linux, Windos o Mac.

• Principalmente, se distribuye mediante un modo basado en la web, gracias a la tecnología Java Web Start.

• Una vez se tiene el Java instalado, los programas de VegAna pueden iniciarse tan solo con el enlace de vuestro navegador de internet.  

• http://biodiver.bio.ub.es/vegana/ 

I Jornades Catalanes de Conservació de Flora

I Jornades Catalanes de Conservació de Flora

B-VegAna:

JDBC

Wel

wits

chia

Inte

rnet

B-VegAna

I Jornades Catalanes de Conservació de Flora

I Jornades Catalanes de Conservació de Flora

B-VegAna:

JDBC

Wel

wits

chia

Inte

rnet

Fagus

Quercus TurboVeg XMLNew XML schemas?

ABCD (BioCase)DarwinCore II (GBIF)

Anthos

Taxus

Quercus

Fagus

Fagus

Fagus

QUERCUS

Editor de tablas de Trabajo

• Procesamiento de la nomenclatura

• Elaboración y publicación de tablas (RTF)

• Espectros de atributos.

• Generación de tablas sintéticas

• Exportación para análisis multivariante

I Jornades Catalanes de Conservació de Flora

B-VegAna:

JDBC

Wel

wits

chia

Inte

rnet

Fagus

Quercus TurboVeg XMLNew XML schemas?

ABCD (BioCase)DarwinCore II (GBIF)

Anthos

Taxus Zamia

Zamia

I Jornades Catalanes de Conservació de Flora

VegAna: Zamia

B-VegAna:

JDBC

Wel

wits

chia

Inte

rnet

Fagus

Quercus TurboVeg XMLNew XML schemas?

ABCD (BioCase)DarwinCore II (GBIF)

Anthos

Taxus Zamia Ginkgo

Ginkgo

I Jornades Catalanes de Conservació de Flora

B-VegAna:

JDBC

Wel

wits

chia

Inte

rnet

Fagus

Quercus TurboVeg XMLNew XML schemas?

ABCD (BioCase)DarwinCore II (GBIF)

Anthos

Taxus Zamia Ginkgo

Yucca

Yucca

Cartography

WMS

Georeferenced data

I Jornades Catalanes de Conservació de Flora

B-VegAna:

JDBC

Wel

wits

chia

Inte

rnet

Fagus

Quercus TurboVeg XMLNew XML schemas?

ABCD (BioCase)DarwinCore II (GBIF)

Anthos

Taxus Zamia Ginkgo Yucca

Cartography

WMS

Georeferenced data

WebHerb

Collections Specimen data

Specimen digititation

I Jornades Catalanes de Conservació de Flora

B-VegAna:

JDBC

Wel

wits

chia

Inte

rnet

Fagus

Quercus TurboVeg XMLNew XML schemas?

ABCD (BioCase)DarwinCore II (GBIF)

Anthos

Taxus Zamia Ginkgo Yucca

Cartography

WMS

Georeferenced data

Collections Specimen data

Specimen digititation

Araucaria

Araucaria

I Jornades Catalanes de Conservació de Flora