Análisis Espacio-Temporal de la Roya del Café en: Chiapas...

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Análisis Espacio-Temporal de la Roya del Café en: Chiapas, Veracruz y Puebla Gustavo Mora Aguilera Gerardo Acevedo Sánchez Jorge Flores Sánchez Santiago Domínguez Juan J. Coria Contreras Eduardo Guzmán Hdz.. Rigoberto González Gómez Abel López Buenfíl Héctor Sánchez Anguiano Jesús García Feria Javier Trujillo Arriaga Ernesto López Armando Méndez, Julio Matuz Conde Lucìa Mendoza Gómez Mitzi González Ochoa Carolina Ramírez Mendoza Israel López Guzmán XVI Congreso Internacional y XLI Nacional de Fitopatología. Ixtapán de la Sal, Edo. México. 21-24 julio, 2014

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Análisis Espacio-Temporal de la Roya

del Café en: Chiapas, Veracruz y PueblaGustavo Mora Aguilera

Gerardo Acevedo Sánchez

Jorge Flores Sánchez

Santiago Domínguez

Juan J. Coria Contreras

Eduardo Guzmán Hdz..

Rigoberto González Gómez

Abel López Buenfíl

Héctor Sánchez Anguiano

Jesús García Feria

Javier Trujillo Arriaga

Ernesto López

Armando Méndez,

Julio Matuz Conde

Lucìa Mendoza Gómez

Mitzi González Ochoa

Carolina Ramírez Mendoza

Israel López Guzmán

XVI Congreso Internacional y XLI Nacional de Fitopatología. Ixtapán de la Sal, Edo. México. 21-24 julio, 2014

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E F M A M J J A S O N D

Inci

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(%

)

Incidencia 1982-1983 México (aprox. 650 msnm)

CICLO 1982 CICLO 1983 CICLO 1984

A

Epidemias comparativas de roya en 1980´s y 2009-2013 en México y

Guatemala

Incidencia 2009-2010, Guatemala (1500 msnm)Incidencia 2009-2013, Guatemala (600 msnm)

1982

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Incidencia Sep2013-Mayo2014 (1374msnm)

Mes

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Incidencia Sep2013-Mayo2014 (600msnm)

Mes

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Evidencia de incremento de horas favorables en el tiempo.

Coatepeque, Quetzaltenango (600 msnm)

0.0000

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2007

2008

2009

2010

2011

2012

DESPLAZAMIENTO DE MEDIA

Incidencia 2009-2010318 000 mediciones/6 años

Mora-Aguilera et al., 2013

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Rivillas et al,. 2012. (Disciplina de Fitopatología, Veintinueve Años de Convivencia con la Roya del Cafeto en Colombia. 22 de mayo del 2012)

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El Cafeto Patógeno ClimaManejo

del Cultivo

El Marco Racional Epidemiológico

Variables

Fenología EsporasPatogénesisDaño

TemperaturaHumedad RelativaPunto de Rocío

VariedadSombraEdad, otras

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Evento

Patogénesis

Periodo

Patogénesis

Germinación Colonización Multiplicación

Deposición Infección Clorosis Liberación de inóculo

Incubación (Pi)

Latencia (Pl)Generación (Pg)

Penetración 1° Síntoma visual Inicio esporulación

Finaliza esporulación

Principio de Interés: Énfasis en Germinación e Infección

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CHIAPAS: Curva epidémica y clima. Caso Municipio A. A. Corzo: A 18 julio, 2014

Pérdida estimada 28.7%Tapachula 8.5%

65% Severidad Máxima

Periodo Sostenido Daño: Fruto en Desarrollo a cosecha

20-22oC >90%HR

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VERACRUZ : Ejemplo curva epidémica y clima. Caso Soteapan: hasta 18 julio, 2014

65% Severidad Máxima

Periodo reducido Daño:Fruto maduro

>22oC

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PUEBLA parcelario: Tlapacoya– Gilberto Luna– pf.pue.tlap.1482 – La cumbre

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Defoliación: Estado de Chiapas. Septiembre, 2013 – Junio, 2014

Defoliación: Estado Veracruz. Septiembre, 2013 – Junio, 2014

Defoliación: Estado Puebla. Septiembre, 2013 – Junio, 2014

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Escenario Epidémico Caso Chiapas: periodo agosto, 2013 – julio, 2014

0.0

10.0

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% p

rom

ed

io d

e S

eve

rid

ad f

olia

r

Semana

Promedio de %SEV. MED HOJA Promedio de %DEFOL. MED

H. Roya Índice de Tejido Susceptible (Itsus)

BrotaciónBrotaciónLechoso Lechoso

Amarre

Yo= 5.5%Ymax= 26.3%

Yf= 1.2%

Soconusco

Sep-Nov > Lechoso-Consistente

6.7 hojas con roya / rama

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ModeloVARIABLES

INDEPEND.R2 R2

aj. A PERIODO ESTIMADO

SEV = 0.21INC1 + 0.11HROY1 INC1, HROY1 0.96 0.95 15 DIAS

SEV = 0.22INC1 + 0.002HROY1 INC1, HROY1 0.93 0.92 15 DIAS

SEV = 0.19INC1 + 0.15HROY1 INC1, HROY1 0.96 0.95 15 DIAS

SEV = 0.29INC1 – 0.06HROY1 INC1, HROY1 0.96 0.95 15 DIAS

SEV = 0.12INC1 + 0.33HROY1 INC1, HROY1 0.97 0.96 15 DIAS

SEV = 0.20INC1 + 0.09HROY1 INC1, HROY1 0.96 0.96 15 DIAS

SEV = 0.25INC1 – 0.01HROY1 INC1, HROY1 0.99 0.98 15 DIAS

INC = 3.31SEV1 – 0.05HROY1 SEV1, HROY1 0.93 0.92 15 DIAS

Algoritmos para toma de Decisiones en Control

1. Modelos de pronóstico subregionales de daño

2. Modelos de pronóstico regionales de daño

A) Vi=(claseTH)(Frec.)+(clase M)(Frec.)+(clase P)(Frec.)

B) Vi=1.5(claseTH)(Frec.)+(clase M)(Frec.)+2(clase P)(Frec.)

3. Modelos de estimación de perdidas productivas

P = 17.59 - 0.010 (Sev. Pl) R²=0.75

P = 18.67 - 0.012 (Hoj. Ro) ² R²=0.82P = 17.44 - 0.011 (Sev. Ho) – 0.012(Sev. Pl) R²=0.74P = 16.87 - 0.015(Hoj. Ro)2+0.002(Sev.Ho) 2+ 0.037(Sev. Pl)-0.02 (Sev.Pl)2 R²=0.79

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Estimación de Pérdidas ciclo 2013: Caso ChiapasPérdidas de producción estimadas en porcentaje Índice de

SeveridadMunicipio Modelo 1 Modelo 2 Modelo 3 Promedio

Amatan 21.0 24.0 22.8 22.6 0.52

Amatenango 20.0 26.7 23.6 23.4 0.59

A. A. Corzo 25.1 32.2 28.8 28.7 0.43

Cacahoatán 12.9 13.8 12.0 12.9 0.77

Chenalhó 21.0 24.0 22.8 22.6 0.80

Chicomuselo 6.1 5.6 7.5 6.4 0.08

Chilón 13.4 22.3 15.1 16.9 0.31

El Bosque 17.8 20.6 19.5 19.3 0.64

Escuintla 19.2 26.6 22.5 22.8 0.60

Huitiupán 25.2 25.7 24.3 25.1 0.57

Huixtla 17.9 24.8 20.5 21.1 0.69

Ixhuatán 22.3 20.1 25.1 22.5 0.49

Motozintla 1.0 10.0 1.3 4.1 0.17

Ocosingo 6.2 18.4 7.7 10.8 0.16

Ocotepec 12.0 12.7 14.8 13.2 0.28

S. J. Cancuc 28.0 32.0 30.4 30.1 0.80

Siltepec 12.2 10.7 15.0 12.6 0.25

Simojovel 31.4 32.3 35.6 33.1 0.61

Tapachula 8.0 8.9 8.7 8.5 0.41

Tapilula 21.4 26.5 23.4 23.8 0.53

Tecpatán 2.4 3.1 2.9 2.8 0.00

Tila 24.0 27.4 26.1 25.8 0.64

Tumbalá 23.9 25.6 27.0 25.5 0.68

Tuxtla Chico 0.5 0.5 0.5 0.5 0.02

Tuzantán 8.2 11.6 10.0 9.9 0.50

Unión Juárez 16.7 19.0 18.5 18.1 0.75

V. Comaltitlán 0.5 11.3 0.6 4.1 0.32

Yajalón 31.5 29.2 22.8 27.8 0.63

Regiones Índice de

SeveridadModelo 1 Modelo 2 Modelo 3 Promedio

Norte 19.2 21.8 20.5 20.5 0.5

Centro 19.1 23.2 22.5 21.6 0.6

Sur 9.4 14.1 10.5 11.3 0.5

Total Estatal 16.1 19.5 17.5 17.7 0.47

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Modelo de Pronóstico con base en Densidad de Inóculo

Modelo Var. Indep. R2 R2aj. C(p) VIF LOCALIDAD

No. Hojas Roya = 2.27 (SSEN2) SEN2 es No. Soros Senescentes en 30 días

SSEN2 0.92 0.91 5.20 1.00 R1 EL TUMBADOR

LANREF y Calderón ., 2012Datos no publicados

*

*

*

------------------------------------ region=1 local=ElTumba ------------------------------------

Trazado de hroy*dias. El símbolo usado es '*'.

Trazado de hroyest*dias. El símbolo usado es 'o'.

hroy |

100 |

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50 | o

| o*

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0 |*** ** *o o*o o

-|------------------|------------------|--

0 200 400

días

NOTA: 10 obs tiene valores ausentes. 6 obs ocultas.

Epidemia Campo Epidemia pronóstico

R2= 0.91

Región 1 El Tumbador

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Inicio de esporulaciónPunto clorótico

21 días 27 días

Día 48Día 1 Día 21

Fin de esporulación

Día 48

Simula

Seguimiento temporal de lesiones / Modelos de Pronóstico (Simulac)

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El concepto de Ventana= Periodo estacional inductivo de daño en función a variables de clima

# días0

10

20

30

40

50

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80

# H

OJA

S

H.R. H.T.

ABCPE

Teji

do

+ in

ócu

loC

lima

ind

uct

ivo

ABCPE

V1

Ventana Inductiva= f (V1, V2, V3)

T (20-22ºC) y HR(>90%)Núm. de eventos lluvia (mojado)Total de precipitación

Vi

Germinación Colonización Multiplicación

Deposición Infección Clorosis Liberación de inóculo

Penetración 1° Síntoma visual Inicio esporulación

Finaliza esporulación

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0

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10

12

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27.3

54.7

Frecu

en

cia

Clases

Horas Favorables t° 20-22°c y HR > 90% m

0

2

4

6

8

10

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0.0

26.5

53.0

Frecu

en

cia

Clases

Eventos de mojado (numero de precipitacione

0

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6

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12

14

16

0.0

123.6

247.3

Frecu

en

cia

Clases

Mm de Lluvia Coatepeque, 536 m

Vi= (Clase TH)(Frec.)+ (Clase M)(Freqc.)

+(Clase P)(Frec.)VI= V1+V2+V3

Modelo Aditivo

Modelo Ponderativo

Vi= 1.5(Clase TH)(Frec.)+ (Clase M)(Freqc.)

+2(Clase P)(Frec.)VI= V1+V2+V3

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Pronóstico regional con ventanas de Inductividad Climática

Ver: 13marzo13

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Conteo de Horas

Ventana Inductiva

(HVI):

1. Temp >20 y <22

2. Hum. Rel >90

3. HVI son acumuladas

al 18 de Octubre

Ej. HVIsem6 +

HVIsem…n

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Algoritmos para toma de Decisiones en Control

4. Indicadores epidémicos:

•Indice de Severidad (parcelas fijas y móviles) (Sev. Hoj) +(Sev. Pla) / Max (Sev. Hoj + Sev. Pla)

•Indicede Daño Integral (IDI) (parcelas fijas)

𝑆𝑒𝑣𝑒𝑟𝑖𝑑𝑎𝑑 𝑝𝑟𝑜𝑚𝑒𝑑𝑖𝑜 𝐻𝑜𝑗𝑎+𝑆𝑒𝑣𝑒𝑟𝑖𝑑𝑎𝑑 𝑝𝑟𝑜𝑚𝑒𝑑𝑖𝑜 𝑑𝑒 𝑃𝑙𝑎𝑛𝑡𝑎+𝑁𝑜.𝐻𝑜𝑗𝑎𝑠 𝑐𝑜𝑛 𝑅𝑜𝑦𝑎

𝑆𝑒𝑣𝑒𝑟𝑖𝑑𝑎𝑑 𝑚𝑎𝑥𝑖𝑚𝑎 𝐻𝑜𝑗𝑎+𝑆𝑒𝑣𝑒𝑟𝑖𝑑𝑎𝑑 𝑚𝑎𝑥𝑖𝑚𝑎 𝑑𝑒 𝑃𝑙𝑎𝑛𝑡𝑎+𝑀𝑎𝑥𝑖𝑚𝑜 𝑁𝑜.𝐻𝑜𝑗𝑎𝑠 𝑐𝑜𝑛 𝑅𝑜𝑦𝑎

𝐷𝑒𝑓𝑜𝑙𝑖𝑎𝑐𝑖ó𝑛

𝑀𝑎𝑥 𝐷𝑒𝑓𝑜𝑙𝑖𝑎𝑐𝑖ó𝑛Inc.Pla

• Indice de inóculo Potencial

Ind. 𝐼𝑛𝑜𝑐 𝑃𝑜𝑡. =𝑁ú𝑚𝑒𝑟𝑜 𝑑𝑒 𝐻𝑜𝑗𝑎𝑠 𝑐𝑜𝑛 𝑅𝑜𝑦𝑎

(𝑁ú𝑚𝑒𝑟𝑜 𝑚𝑎𝑥𝑖𝑚𝑎 𝑑𝑒 𝐻𝑜𝑗𝑎𝑠 𝑐𝑜𝑛 𝑅𝑜𝑦𝑎)

• Alerta (Semáforo):Alerta= 𝑰𝒏𝒅𝒊𝒄𝒆 𝑺𝒆𝒗𝒆𝒓𝒊𝒅𝒂𝒅

+ 𝑰𝒏𝒅𝒊𝒄𝒆 𝑰𝒏ó𝒄𝒖𝒍𝒐 𝑷𝒐𝒕𝒆𝒏𝒄𝒊𝒂𝒍+ 𝑰𝒏𝒅𝒊𝒄𝒆 𝑻𝒆𝒋𝒊𝒅𝒐 𝒔𝒖𝒔𝒄𝒆𝒑𝒕𝒊𝒃𝒍𝒆

+𝑯𝒓𝒔. 𝒇𝒂𝒗𝒐𝒓𝒂𝒃𝒍𝒆𝒔 𝒄𝒍𝒊𝒎𝒂

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Indicadores Epidemiológicos: Chiapas

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Indicadores Epidemiológicos: Veracruz

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Conclusiones Epidemiológicas1. La roya del cafeto es una enfermedad de importancia

económica con ocurrencia histórica en México de bajaprevalencia. Entre 2007-2010 ocurre un incrementoepidémicos regional excluyendo Colombia y Brasil.

2. En la actualidad, la roya en México se presenta a nivelregional con alta variabilidad de intensidad de daño siendoChiapas el mas inductivo con pérdidas municipales entre 0.5-33%. El inóculo residual 2013 sugiere la continuidad delproceso epidémico 2014 que inicia con la disponibilidad delnuevo tejido.

3. México enfrenta la roya con un inventario cafetalero viejo ycon bajo índice de vigor. La variabilidad climática sugiere queel umbral de endemicidad se incrementará con recurrentesbrotes epidémicos en el futuro.