Universidad Nacional Autónoma de NicaraguaFacultad de Ciencias Médicas – LeónEscuela de Postgrado en Epidemiología y Salud

Universidad Nacional Autónoma de NicaraguaFacultad de Ciencias Médicas – LeónEscuela de Postgrado en Epidemiología y Salud

Desarrollando las habilidades para el análisis de datos estadístico en

Epidemiología

Dr. Juan R. Almendárez P.

23/03/2006.

JRAP

IntroducciónIntroducción• El programa Epi-Info en su versión 3.3.2 para Windows es la configuración

de un conjunto de programas que ha desarrollado el Centro para el Control de las Enfermedades (CDC) de Atlanta, Estados Unidos y la Oficina de la Organización Mundial de la Salud en Geneva, Suiza.

• Igual que otros programas estadísticos trata de facilitar el análisis de los datos producidos por la investigación y la vigilancia epidemiológica, pero se diferencia en que a pesar de que es considerado una potente herramienta, su distribución es gratuita.

• Vamos a utilizar este programa para desarrollar un ejercicio de entrenamiento en estadística, mediante un proceso de aprendizaje activo.

• Esperando que este esfuerzo sea de mucha utilidad en su aprendizaje,

Dr. Juan Almendárez ………

JRAP

ObjetivosObjetivos

1. Diseñar un cuestionario en “Crear Vistas” 1. Diseñar un cuestionario en “Crear Vistas”

2. Introducir datos al cuestionario en “Grabar datos” 2. Introducir datos al cuestionario en “Grabar datos”

3. Procesar los datos en “Analizar datos Diapositiva 243. Procesar los datos en “Analizar datos Diapositiva 24

4. Desarrollar diferentes análisis estadísticos 4. Desarrollar diferentes análisis estadísticos

JRAP

PresentaciónPresentación• Estamos contando con información proporcionada por una base de datos de

la Encuesta Nacional de Salud Sexual y Reproductiva realizada en el año 2,000 en Nicaragua. En ese momento se realizaron 13060 encuestas a nivel nacional mediante un muestreo mediante procedimientos probabilísticos estratificados y multietápico (Estratificación por regiones geográficas, por departamento, por municipios, por lugar de residencia).

• De esa base de datos se han seleccionado solamente algunas variables, todas ellas definidas o codificadas en valores numéricos: Edad, escolaridad, años de estudio, procedencia, lugar de residencia, la presencia de recursos en el hogar como radio, teléfono, televisor, refrigeradora, bicicleta, moto y vehículo a motor; además de información sobre el acceso a la información, datos reproductivos, el conocimiento y uso de los métodos de planificación familiar.

• Los pasos para el análisis se definen de la siguiente manera: Conocer los datos, para ello se deben revisar el cuestionario y en análisis realizar frecuencias simples de todas las variables, procesamiento o manipulación de las variables y análisis propiamente dicho.

JRAP

Permite diseñar una base de datos o ver y modificar una ya existente.

JRAP

Este botón permite diseñar el

cuestionario donde se van a introducir los

datos

Si hacemos “Click en este botón ….

JRAP

Aparecerá esta nueva página de trabajo.

¡Importante!Ponga

atención.

¡Importante!Ponga

atención.

¡Este es el menú

¡Este es el menú

JRAP

JRAP

Si va a abrir un archivo ya existente

como en nuestro caso, Marque aquí.

Si va a abrir un archivo ya existente

como en nuestro caso, Marque aquí.

JRAP

Al seleccionar “Abrir” el programa nos muestra esta ventana por defecto. O sea que busca en el disco “C” en la carpeta “Epi-Info”.

Podemos cambiar la dirección marcando aquí

Podemos cambiar la dirección marcando aquí

Ó aquíÓ aquí

JRAP

Si marcamos aquí

Si marcamos aquí

Aparece esta ventana

Así podemos buscar nuestros archivos por el Sistema

JRAP

Al seleccionar el archivo “Ejercicio” nos pregunta por el nombre de la vista. En nuestro caso se llama “Endesa”. Al seleccionarlo aparece esta página.

Y, hay otras páginas másY, hay otras páginas más

Es bueno revisarla para saber qué significan los

números que aparecen en los datos

Es bueno revisarla para saber qué significan los

números que aparecen en los datos

JRAP

JRAP

Si vamos a crear un archivo nuevo,

Marque aquí

Si vamos a crear un archivo nuevo,

Marque aquí

Seleccionar la opción “Nuevo” para hacer un cuestionario.

JRAP

El programa le pedirá que le ponga un nombre al archivo que va a crear y después oprime en el botón “Abrir” del lado derecho del nombre que ha escrito.

Encuesta

JRAP

El programa le pedirá que le ponga un nombre a la “Vista” o base de datos específica. El programa Epi-Info tiene como plataforma al programa de Office “Access”. En este programa se pueden hacer varias bases de datos relacionadas. En un archivo de Epi-Info se pueden hacer varias bases de datos relacionadas también. Después aprima “Aceptar”

Datos

JRAP

El programa muestra una página de trabajo y la especificación “Haga Click en el ratón derecho para crear un campo.

Recuerde el ratón tiene dos teclas una izquierda con el que se ejecutan las ordenes y uno derecho que genera opciones. Para crear campos se oprime la tecla derecha.

JRAP

Al presionar la tecla derecha del ratón aparece esta ventana.

Aquí se escribe la pregunta.

Se puede modificar la fuente de la

pregunta

Se define el tipo de variableSe define el

número de caracteres de

la variable

El programa define un nombre para la variable,

se puede modificar al inicio

JRAP

Otras opciones.

Aquí se escribe la pregunta.

Se pueden crear valores

legales

Se establecen algunos criterios

Al final se oprime en “Aceptar”

JRAP

Aquí se ingresa para introducir los datos en el cuestionario

diseñado en “Crear Vistas”

JRAP

Una vez que se ingresa a “Grabar datos” se abre en el menú la opción “Archivos” y se selecciona la opción “Abrir”.

JRAP

Igual que en hacer vista nos aparece las opciones de archivos en la carpeta de Epi-Info. Si el archivo esta en otra carpeta se busca siguiendo las opciones.

JRAP

Aparece la encuesta diseñada en vistas pero listo a introducir datos. Se procede a introducir los datos según información de las encuestas o registros de información.

Aparece la encuesta diseñada en vistas pero listo a introducir datos. Se procede a introducir los datos según información de las encuestas o registros de información.

Número de registro

Número de páginas

JRAP

JRAP

Procesar y analizar los datos

almacenado

JRAP

Características de análisisCaracterísticas de análisis

• El programa está conformado por tres pantallas:– Pantalla de comandos: Se encuentran

definidas todas las órdenes que el programa puede ejecutar.

– Pantalla de Salida: Se registran los resultados de las órdenes que se definan.

– Pantalla de órdenes: Se registran las ordenes que se definieron. Si se graba puede ser un programa ejecutable siempre en análisis.

JRAP

Pantalla de salida de resultados

Pantalla de Órdenes

Pantalla de “Comandos” o de listado de órdenes

Pantalla de “Comandos” o de listado de órdenes

JRAP

Pantalla de salida

Pantalla de Órdenes

Se inicia toda sesión abriendo o leyendo una

base de datos.Para ello haga click en “Abrir (Leer)/Importar”

Se inicia toda sesión abriendo o leyendo una

base de datos.Para ello haga click en “Abrir (Leer)/Importar”

JRAP

Aparece esta pantalla. Ella te permite buscar tu archivo de trabajo. Vamos a trabajar con el archivo “Ejercicio”. Está en esta versión del Epi-Info.

Aparece esta pantalla. Ella te permite buscar tu archivo de trabajo. Vamos a trabajar con el archivo “Ejercicio”. Está en esta versión del Epi-Info.

Hacer Click Aquí para buscar el

archivo

Hacer Click Aquí para buscar el

archivo

JRAP

Eso te lleva al menú de búsqueda. Puede elegir donde buscar tu archivo. Posiblemente tu archivo esté en un CD. Hay que buscarlo.

Eso te lleva al menú de búsqueda. Puede elegir donde buscar tu archivo. Posiblemente tu archivo esté en un CD. Hay que buscarlo.

Modifica la dirección de tu

archivo haciendo “Click” en Mi PC

JRAP

• Una vez que has abierto tu archivo el programa te da alguna información importante:– Te dice del nombre de tu archivo y la

dirección que tiene en tu PC– Te dice del número de registros que has

ingresado o que tiene– Te muestra la orden que ejecutaste para que

apareciera lo que hiciste.

JRAP

Orden ejecutadaOrden ejecutada

Información sobre la base de datos

Información sobre la base de datos

Orden ejecutadaOrden ejecutada

JRAP

¡ Ya podemos comenzar a trabajar !¡ Ya podemos comenzar a trabajar !

• Conocer los datos.

• Corregir los datos

• Procesar o manipular los datos.

• Realizar el análisis.

JRAP

• Conocer los datos es saber que datos se han introducido en las variables del estudio.

• Saber si están completos los datos en cada una de las variables.

• Si faltan datos, conocer si es razonable que falten datos o si es necesario investigar para complementar los datos.

• Detectar errores en la introducción de los datos.

• Corregir los datos errados para su posterior utilización (Limpieza de la base de datos).

JRAP

Podemos iniciar calculando frecuencia a todas sus

variables para conocer la información que tiene y como

se distribuyen los datos

Podemos iniciar calculando frecuencia a todas sus

variables para conocer la información que tiene y como

se distribuyen los datos

JRAP

Una vez que oprimiste la orden Frecuencia aparece una ventana donde se encuentra el listado de variables. Se alcanza presionando la pestaña en “Frecuencia de:”. Posteriormente se oprime el botón “Aceptar”. Si oprimes el asterisco “*” el programa calculará la frecuencia de todas las variables.

Así podrás ver como están los datos introducidos en el programa.

Una vez que oprimiste la orden Frecuencia aparece una ventana donde se encuentra el listado de variables. Se alcanza presionando la pestaña en “Frecuencia de:”. Posteriormente se oprime el botón “Aceptar”. Si oprimes el asterisco “*” el programa calculará la frecuencia de todas las variables.

Así podrás ver como están los datos introducidos en el programa.

a

JRAP

Si establecimos calcular la frecuencia de “todo”. EL Programa nos da primero un listado de los resultados por cada variable:Si presionamos una de las variables el programa nos envía a ver el resultado de esa frecuencia en esa variable.

JRAP

Cada número tiene un significado, revisar en vistas los significados.

JRAP

También podemos hacer gráficos para comprender mejor la distribución de los

datos

También podemos hacer gráficos para comprender mejor la distribución de los

datos

JRAP

Al marcar gráfico nos aparece esta ventana y elegimos el tipo de gráfico, las variables que queremos graficar, su título.

JRAP

Este es un ejemplo de gráfico:

Tipo de gráfico: Histograma.

Variable: Edad:

JRAP

• Algunas veces los datos no concuerdan porque durante la recolección o la digitación de los datos en el programa “ENTER” se cometieron errores.

• Se pueden hacer correcciones en la base de datos desde “ANALISIS” con la orden: “Listar”

Corregir datosCorregir datos

JRAP

Seleccionar las variables a corregir

Ejecutar listar

Permitir actualizaciones

Y aceptar

JRAP

Este es el número de registro o

número de la ficha

Al finalizar las correcciones se cierra esta ventana

Al finalizar las correcciones se cierra esta ventana

JRAP

En la base de datos “Ejercicio” de la Vista “Endesa”:

En la base de datos “Ejercicio” de la Vista “Endesa”:

• Todos los datos son numéricos.

• Muchos tienen más de dos categorías

• Unos como la edad son realmente numérico, pero se debería agrupar.

• Otros datos son categóricos, pero están codificados en varias opciones numéricas.

JRAP

JRAP

• Una condición para calcular Riesgo Relativo u Odds Ratio es agrupar la exposición y el efecto en dos categorías cada una

E

X

P

O

S

I

C

I

Ó

n

Efecto

Si No Total

Si a b a+b

No c d c+d

Total a+c b+d N

• a = Personas con el efecto y expuestas.

• b = Personas sin el efecto pero expuestas.

• c = Personas con el efecto pero no expuestas.

• d = Personas sin el efecto y no expuestas.

• a+b = Todos los expuestos.

• c+d = Todos los no expuestos

• A+c = Todos los que tienen el efecto.

• B+d = Todos los que no tienen el efecto

• a = Personas con el efecto y expuestas.

• b = Personas sin el efecto pero expuestas.

• c = Personas con el efecto pero no expuestas.

• d = Personas sin el efecto y no expuestas.

• a+b = Todos los expuestos.

• c+d = Todos los no expuestos

• A+c = Todos los que tienen el efecto.

• B+d = Todos los que no tienen el efecto

JRAP

• Puede que sea necesario agrupar TODAS O ALGUNAS de las variables en dos categorías o escalas:

• Exposición: “Si/No”• Efecto: “Si/No”

• Entonces, hay que manipular las variables.

JRAP

Procesar o manipular variablesProcesar o manipular variables

• Se requieren dos pasos:

– Definir una variable nueva, con su propio nombre pero de nombre parecido a la variable que ya existe: Si vamos a procesar la variable EDAD; el nombre de la variable a crear podría ser: EXAD2.

– El segundo paso es a partir de los datos existentes en la variable existente (EDAD), agregar datos recodificados en la variable nueva (EDAD2).

JRAP

Al presionar: DEFINIR Aparece esta

ventana

Aquí agregamos el nombre de la nueva

variable: EDAD2.

JRAP

Si presionamos en recodificar

Aparece esta ventana

Aquí ponemos el nombre de la

variable inicial: EDAD

Aquí ponemos el nombre de la

variable destino: EDAD2

Aquí establecemos los valores de las

escalas.

Aquí ponemos el valor en la

nueva variable

JRAP

ComprobaciónComprobación

• Una vez que hemos realizado el procedimiento de recodificación se procede a comprobar si el procedimiento fue el correcto. Para ello:

– Se saca frecuencia de la variable Edad2– Se compara que exista igual número de

registros que en la variable EDAD.

JRAP

Los datos concuerdan

JRAP

• Ya tenemos una variable de exposición: Edad organizada en dos grupos: – Expuestas= Adolescentes; – No expuestas= Adultas.

• Nos falta definir la variable efecto. En esta base de datos hay una variable que se llama: “USAMETOD” Que significa si usa algún método anticonceptivo. El programa tiene 4 opciones: – 0=No usa; – 1=Usa método folklórico; – 2=Usa método tradicional y – 3=Usa método moderno.

• Debemos agrupar esta variable en dos categorías: Usa/No usa.

JRAP

Creamos una nueva variable: “Planifica”Creamos una nueva variable: “Planifica”

JRAP

Recodificamos la nueva variable: Planifica” en dos categorías: USA/NO USA, a partir de las 4 opciones de la vieja variable: “ USAMETOD que tenía 4 categorías.

Recodificamos la nueva variable: Planifica” en dos categorías: USA/NO USA, a partir de las 4 opciones de la vieja variable: “ USAMETOD que tenía 4 categorías.

JRAP

• Ahora podemos hacer un análisis bivariado o cruce de variables mediante la tabla 2X2. y usar la estadística que genera este tipo de análisis.

JRAP

Es importante que la variable exposición y la variable resultados esté bien definida en cada una de sus ventanas correspondientes.

Es importante que la variable exposición y la variable resultados esté bien definida en cada una de sus ventanas correspondientes.

JRAP

Vemos la distribución absoluta y relativa en porcentajes que puede ser interpretada como tasas de prevalencia.

Vemos la distribución absoluta y relativa en porcentajes que puede ser interpretada como tasas de prevalencia.

JRAP

Vemos el resultado del análisis simple de la tabla. Con su Odds Ratio y su intervalo de confianza. Además de otras estadísticas.

Vemos el resultado del análisis simple de la tabla. Con su Odds Ratio y su intervalo de confianza. Además de otras estadísticas.

JRAP

• En este caso al cruzar la edad en dos categorías: – Adolescentes– Adultas,

Contra: • planificación en sus dos categorías:

– No usa– Usa

• Encontramos que las adolescentes tienen 11 veces más probabilidades de no planificar que las mujeres adultas. (Dato tomado del OR=11) Y la asociación se dice significativa porque el intervalo de confianza no contiene al “1”

JRAP

¡Cuidado!¡Cuidado!

• Recordemos que de todas las mujeres encuestadas algunas (667) estaban ya embarazadas por lo tanto no es correcto que se tomen en cuenta en este análisis.

• Sería un error.

JRAP

Marcamos “Seleccionar”Marcamos

“Seleccionar”

Y definimos que a la variable “Embarazada” tomar en cuenta la opción “0” que son las que no están embarazadas y deberían planificar. La embarazada no debería planificar.

Y definimos que a la variable “Embarazada” tomar en cuenta la opción “0” que son las que no están embarazadas y deberían planificar. La embarazada no debería planificar.

JRAP

El programa solo va a tomar en cuenta 12393 mujeres no las 13060 que inicialmente estaban, porque una parte estaba embarazada al momento de aplicar la encuesta.

El programa solo va a tomar en cuenta 12393 mujeres no las 13060 que inicialmente estaban, porque una parte estaba embarazada al momento de aplicar la encuesta.

JRAP

Los resultados han cambiado, han cambiado poco pero han cambiado. El OR no es de 11 es de 12.2 y siempre es estadísticamente significativa porque el intervalo de confianza no contiene el “1”.

JRAP

Otros análisisOtros análisis

• Podemos hacer otros como regresión lineal y regresión logística.

• El programa tiene esa opción.

• Para la primera podemos cruzar la variable edad con la variable hijos. (Ambas son cuantitativas, condición para este tipo de análisis).

JRAP

Nos da un coeficiente de regresión de 0.35 que nos indica una pequeña asociación a incrementar el número de hijos cuando aumenta la edad.

Nos da un coeficiente de regresión de 0.35 que nos indica una pequeña asociación a incrementar el número de hijos cuando aumenta la edad.

JRAP

Graficada esta asociación se miraría así:Graficada esta asociación se miraría así:

Con una tendencia a aumentar el número de hijos a medida que aumenta la edad.

Con una tendencia a aumentar el número de hijos a medida que aumenta la edad.

JRAP

Para hacer una regresión logística y tomar en cuenta el peso de varias variables en el efecto de otra. En este caso el uso de métodos anticonceptivos. Se selecciona regresión logística y se seleccionan las variables en sus respectivas casillas: Resultados y Otras variables.

Para hacer una regresión logística y tomar en cuenta el peso de varias variables en el efecto de otra. En este caso el uso de métodos anticonceptivos. Se selecciona regresión logística y se seleccionan las variables en sus respectivas casillas: Resultados y Otras variables.

JRAP

Encontramos como peso el odds ratio de cada una de las variables. Siendo las variables de mayor peso en la causa del no uso de métodos anticonceptivos el no conocimiento de los métodos y el menor número de hijos vivos.

Encontramos como peso el odds ratio de cada una de las variables. Siendo las variables de mayor peso en la causa del no uso de métodos anticonceptivos el no conocimiento de los métodos y el menor número de hijos vivos.

JRAP

A practicarA practicar

• Bueno ahora solo les toca practicar e innovar las ideas para usar el programa como una herramienta poderosa para la estadística, la investigación y la vigilancia epidemiológica.

• Saludos

Dr. Juan Almendárez

juralpe@gmail.com