BIOST - UB
14
BIOST 3 GRUP DE RECERCA EN ESTADÍSTICA CLÍNICA, BIOINFORMÀTICA I DE LA BIODIVERSITAT COMPUTACIONAL Fuente: internet
Transcript of BIOST - UB
BIOST3GRUP DE RECERCA EN ESTADÍSTICA CLÍNICA,
BIOINFORMÀTICA I DE LA BIODIVERSITAT COMPUTACIONAL
Fuente: internet
• EL GRUP DE RECERCA EMERGENT EN ESTADÍSTICA CLÍNICA, BIOINFORMÀTICA I DE LA BIODIVERSITAT COMPUTACIONAL(BIOST3) FORMA PART DE LA SECCIÓ D’ESTADÍSTICA DEL DEPARTAMENT DE GENÈTICA, MICROBIOLOGIA I ESTADÍSTICA DELA UB,
• CENTRA LA SEVA RECERCA EN APLICAR MÈTODES D’ESTADÍSTICA COMPUTACIONAL I ESTADÍSTICA BAYESIANA A SISTEMESBIOLÒGICS, AMB ESPECIAL ÈMFASI EN DADES CLÍNIQUES, BIOINFORMÀTIQUES I DE BIODIVERSITAT.
• COL·LABOREN SOVINT EN L’ANÀLISI DE DADES DE GRANS EXPERIMENTS DUTS A TERME PER EMPRESES, EXTRAIENT AIXÍMOLTA MÉS INFORMACIÓ DE GRAN UTILITAT.
• L’ANÀLISI ESTADÍSTIC DE GRANS VOLUMS DE DADES BIOLÒGIQUES ÉS DE GRAN INTERÈS PER A LES INDÚSTRIESFARMACÈUTICA, NUTRICIONAL, ALIMENTÀRIA, QUÍMICA I MEDIAMBIENTAL, AIXÍ COM PER A CENTRES DE RECERCA IADMINISTRACIONS PÚBLIQUES.
• DINTRE DEL GRUP DE RECERCA ES PORTEN A TERME DIFERENTS PROJECTES DE RECERCA COMPETITIUS, CONTRACTES DERECERCA, 4 TESIS DOCTORALS I TRANSFERÈNCIA TECNOLÒGICA A LES EMPRESES I SOCIETAT (PROGRAMARIS, ARTICLES,PATENTS, ETC.).
• S’ OFEREIXEN SERVEIS D’ ASESORIA PER CONTRACTE, COL.LABORACIONS EN ARTICLES I AMB D’ ALTRES GRUPS DERECERCA. CÀLCUL COMPUTACIONAL. DESENVOLUPAMENT APLICACIONS WEB SHINY.
Fuente: internet
Serveis• Data-Management• Anàlisi estadístic d’assajos clínics i epidemiològics.• Desenvolupament de software, programari estadístic i simulació.• Anàlisi estadístic bayesià amb mètodes Markov Chain Montecarlo.• Anàlisi quantitatiu multivariant de la biodiversitat i de sistemes biològics complexos.• Bioinformàtica (metagenòmica, metatranscriptòmica, transcriptòmica, metilació, etc).
Projectes de transferència- Anàlisi estadístic en estudis i assajos clínics.- Classificació de tumors NE metastàtics G1/G2.- Eficàcia de la glutamina en la prevenció de la esofagitis aguda radioinduïda.- Estudi descriptiu i identificació de les icnites de la zona de Valbona (Teruel).- Efecte d’un simbiòtic en infeccions gastrointestinals de repetició en nens sans.- Estudi clínic per la visualització de certs tumors cerebrals durant la cirurgia tumoral.- Influència de biomarcadors de lesió cerebral i d’inflamació en el pronòstic de l’hemorràgia
cerebral espontània en fase aguda.- Estudi predictiu de l’impacte de factors meteorològics en el comportament dels paràmetres
fisicoquímics de l’aigua del riu Llobregat.
INTERNATIONAL COLLABORATIONS IN RESEARCH-NETS
5
J. Frías (Univ. Florida, USA) Jacqueline R Starr (Forsyth Institute, Harvard School
of Dental Medicine, USA) Kyu Ha Lee (Forsyth Institute, Harvard School of
Dental Medicine, USA) J. Caro (McGill University, Canada) S. Pichini (Instituto Superiore di Sanita) P. E. Verde (Heinrich-Heine- Universität Düseldorf, Germany(UWA) Krug S (Martin Luther University, Halle, Germany) Tamagno G (Mater Misericordiae University Hospital,
Dublin, Ireland) Fierro Maya F (Instituto Nacional de Cancerologia,
Bogota, Colombia) Costa F (Hospital Sirio-Libanes, Sao Paulo, Brazil) de Herder WW (Erasmus Medical Center, Rotterdam,
Netherlands) Jann H (Charité University Hospital, Berlin, Germany) Walter Díaz (Universidad de Antioquía, Colombia) J. Sanjuan Girbau (American University of Beirut)
Moderador
Notas de la presentación
The research and its direction implies COLABORATION WITH A LOT OF RESEARCH grOUps WORKING TOGETHER Now I WILL show YOU my INTERNATIONAL COLLABORATIONS IN RESEARCH, covering 3 continents
Jiménez Fonseca (Hospital Universitario Central de Asturias, Oviedo)
A. Galobart (I.C.P, Sabadell) B. Vila (I.C.P, Sabadell) K. Gibert (UPC) P. Fonseca (UPC) J. Casanovas (UPC) E. Cobo (UPC) A. Cobos (Dinopolis, Teruel) M. Juan Díaz (Hospital Clínico Universitario de Valencia (Valencia) A. Serrano Lázaro (Hospital Clínico Universitario de Valencia
(Valencia) A. Mesejo Arizmendi (Hospital Clínico Universitario de Valencia
(Valencia) Paloma Pizarro (Bio-Iliberis R&D , Granada) Walter Sanseverino (Sequentia Biotech, UAB Research Park) E Sanchez-Vizcaino (Hospital CIMA, Barcelona) Tomeu Rigo (Meteocat, Barcelona) Stefano Urso (Universidad de Las Palmas de Gran canaria) Hospital Sant Joan de Deu Hospital Clínico de Valencia Hospital Clínico de Barcelona AGBAR (Aigües de Barcelona) Ministerio Agricultura y Medio Ambiente (Madrid) Dinopolis (Teruel) Institut Català de Paloentologia (Sabadell) Universidad de Burgos Parc de Collserola (Area Metropolitana de Barcelona)
NATIONAL COLLABORATIONS IN RESEARCH-NETS
6
Moderador
Notas de la presentación
OTHER NATIONAL COLLABORATIONS IN RESEARCH WITH PUBLIC ENTITIES
DATA SCIENCE (CIENCIA DE LOS DATOS): APLICACIONES A LA BIOLOGÍA Y A LA
MEDICINA CON PYTHONY R
MAYO-JULIO 2018
Fuente: internet
Fuente: internet (UB)
Fuente: internet
A NEW BAYESIAN METHOD TO ESTIMATERICHNESS AND SAMPLE SIZE (SAMPLING EFFORT) IN
METAGENOMICS ANALYSIS
9
Library for R: BDSbiost3 Better to estimate richness and number of samples(effort of sampling) based on MCMC and a Diritchet-Multinomial distribution
• Species richness in an assemblage is difficult to estimatereliably from sample data because it is very sensitive to thenumber of individuals and the number of samples collectedthat tent to be low in genomic analysis (low abundance, highnumber of OTUs, variability, …).
• Is very important to know the number of samples to a correctestimation of Richness (sampling effort)
• Monleon-Getino,• Rodriguez-
Casado,• Méndez-Viera.
9/2017
https://github.com/amonleong/BDSbiost3
LIBROS
BIG DATA• HTTPS://WWW.EMAZE.COM/@AOIQFCFOQ
Big data, hacia la cuarta revolución industrial
En apenas 70 páginas, este librito esencial compila las cuestiones introductorias más básicas que cualquiera debe conocer para entender qué está sucediendo con nuestros datos. Y más después del escándalo que ha sacudido los cimientos de Facebook y de Cambridge Analytica.
El profesor Antonio Monleón coordina esta obra básica sobre lo que ya se llama la cuarta revolución industrial. Y todo lo que supone en los distintos ámbitos de la vida personal y profesional.
COLABRACIÓN EN ALGUNOS DE LOS ANÁLISIS REALIZADOS EN:
“GAIA: METAGENOMICS ANALYSIS FROM ANY MATRIX AT STRAIN
LEVEL”
12
TREX: COSMOCAIXA 27-10-17
• REVIU ELS DINOSAURES
CINNA.UPC.EDU:3838/GRBIOSTAT3/PALEO
13
Trix, el tiranosaurio más bien conservado del mundo
Desarrollo de aplicacions informáticas-web
CONTACT: PUBLICATIONS AND PROJECTSWeb: http://www.fbg.ub.edu/investigadors/grups-recerca-ub/estadistica-
clinica-biodiversitat/http://biost3.blogspot.com.es/
http://bioinformaticsbarcelona.eu/research-groups/171/clinical-statistics-and-biodiversity
contact: [email protected]
Researchgate: https://www.researchgate.net/profile/Antonio_Monleon-Getino
Google citations: https://scholar.google.com/citations?user=jTE19UUAAAAJ
https://www.ub.edu/portal/web/dp-genmicrostat/recerca-estadistica
biostatisticsbioinformaticsdata-science
https://www.ub.edu/portal/web/dp-genmicrostat/recerca-estadistica
