Cuestionario de bioqumica: 1. Cmo est conformado un cido nucleico y cul es su funcin?Un cido nucleico es un polmero, el cual est compuesto por monmeros denominados nucletidos, estos a su vez estn formados por tres componentes: una base nitrogenada, una pentosa y un fosfato. La funcin de los cidos nucleicos es la de almacenar y transmitir la informacin gentica, la estructura de cada una de las protenas, de todas las biomolculas y de cada uno de los componentes celulares.2. Cules son las bases nitrogenadas y cuales estn presentes en DNA/RNA?Las bases nitrogenadas derivan de dos compuestos parentales, purina y pirimidina. Tanto el DNA como el RNA contienen dos bases purinicas, la adenina (A) y la guanina (G). El DNA y el RNA contienen tambin dos bases pirimidinicas principales. La citosina (C) se encuentra en ambos tipos de cidos nucleicos. Pero la segunda base pirimidinica es tiamina (T) en el DNA y uracilo (U) en el RNA.3. Diferencia entre DNA y RNAUna de las diferencias son sus bases nitrogenadas pririmidinicas. En DNA tiamina y citosina y en RNA citosina y Uracilo.Los cidos nucleicos contienen dos tipos de pentosas. Los desoxinucleotidos (desprotonados) del DNA contienen 2`-desoxi-D-ribosa y los ribo nucletidos (OH, en el carbono 2) del RNA D-ribosa. En los nucletidos, ambos tipos de pentosas se hallan en la forma -furanosa.4. Tipo de enlace que une a dos nucletidosLos nucletidos de DNA y RNA estn unidos covalentemente mediante puentes de grupos fosfato, en los cuales el grupo hidroxilo en 5` de un nucletido est unido al grupo hidroxilo de 3` del nucletido siguiente mediante un enlace fosfodiester.5. Diferencia entre un nucletido y nucleosido. Cmo es la orientacin de la cadena de cido nucleico y que caractersticas presenta cada extremo?

a) La diferencia es que el nucleosido es una molcula sin grupo fosfato, mientras que el nucletido contiene su grupo fosfatob) Tienen una orientacin que va desde 5' a 3' en la parte 5 contiene un grupo fosfato y en la parte 3 un OH

6. A qu longitud de onda se pueden cuantificar a los nucletidos?A longitudes de onda cercanas a 260nm.

7. Funcin metablica importante de los nucletidos de purinaPueden formar grupos aminos, adems de que pueden ser metiladas, lo que provoca que no se expresen algunos genes.8. Caractersticas del modelo de Watson y Crick para el DNA.

Las caractersticas del modelo de ADN de Watson y Crick son:1. Hay dos cadenas helicoidales de polinucletidos enrolladas a lo largo de un eje comn. Las cadenas transcurren en direcciones opuestas.2. Los ejes de azcar fosfato se sitan en el exterior y, por tanto, las bases de pricas y pirimdicas estn en el interior de la hlice.3. Las bases son casi perpendiculares al eje de la hlice y las bases adyacentes estn separadas 3.4 A. La estructura helicoidal se repite cada 3.4 A, de modo que hay 10 bases igual a 3.4 A por vuelta/3.4 A por base por cada vuelta de hlice; asimismo, hay una rotacin de 36 grados por base (360 por vuelta completa/10 bases por vuelta).4. El dimetro de la hlice es de 20 A.9. Explica la regla de ChargaffLa regla de Chargaff contiene 4 principios bsicos, que son:a) La composicin de bases del DNA normalmente vara de una especie a otra.b) Las muestras de DNA aisladas a partir de tejidos diferentes de la misma especie tienen la misma composicin de bases.c) La composicin de bases del DNA de una determinada especie no vara con la edad del organismo, ni con su estado nutricional, ni con las variaciones ambientales.d) En todos los DNA celulares, independientemente de la especie, el nmero de residuos de adenina es igual al de residuos de timina (es decir A=T) y el nmero de residuos de guanina es igual al nmero de residuos de citosina (G=C). a partir de estas relaciones se deduce que la suma de los residuos de purina es igual a la suma de los residuos de pirimidina; es decir A+G= T+C.

10. En una tabla escribe los tipos de RNA caractersticas y funcin de cada uno de ellos.

Tipo de RNAcaractersticasFuncin

RNA mensajeroConsiste en una secuencia de nucletidos que corresponde a la transcripcin de un trozo de DNA (gen).Su funcin es la de transportar la informacin gentica del ncleo a los ribosomas en que son transcritos.

RNA de transferenciaSon molculas de RNA con estructura cruciforme. Encargados de leer el cdigo del mRNA en los ribosomas e ir sintetizando la cadena de de protena a partir de los aminocidos que tiene asociados a su estructura.

RNA ribosomalEs un RNA estructural que compone los ribosomas junto con protenas.tiene una funcin de enzimtica al facilitar las interacciones para que el mRNA se acomode en el ribosoma y sea ledo por los tRNA, y al mismo tiempo facilita la interaccin con protenas enzimticas que posibilitan la formacin de los enlaces peptdicos

11. Componentes del ribosoma 70S en procariontesSus subunidades son 50S y 30S, en donde la subunidad 50S est formado por 32 protenas, mientras que la subunidad 30S est conformado por 21 protenas

12. Qu seala el dogma central del flujo de la informacin gentica?El dogma central abarca los tres principales procesos celulares en los que se utiliza la informacin gentica. El primero es la replicacin, o copia del DNA parental para formar molculas de DNA con idntica secuencia de nucletidos. El segundo es la transcripcin, proceso mediante el cual parte del mensaje gentico codificado por el DNA es copiado de forma precisa en el RNA. El tercero es la transduccin, en la cual el mensaje gentico codificado en el RNA mensajero es traducido en los ribosomas para dar un polipptido con una secuencia especifica de aminocidos.

13. A) describe el principio de la replicacin semiconservativa del DNA yB) Cmo se comprob tal modelo con el experimento de Meselson y Stahl?A) es aquella donde cada cadena de DNA acta como molde para la sntesis de una nueva cadena. El resultado son dos molculas de DNA nuevas, cada una con una cadena nueva y otra vieja.B) se comprob mediante un experimento en donde se cultivaron clulas de E. coli durante varias generaciones en un medio cuya nica fuente de nitrgeno (NH4Cl) contena 15N, el isotopo pesado del nitrgeno, el lugar del isotopo ligero normal y ms abundante, el 14N. Posteriormente las clulas de E. coli cultivadas en un medio 15N se transfirieron a un medio que contena el isotopo 14N, donde se las dejo crecer hasta la duplicacin de la poblacin celular. El DNA aislado de esta primera generacin de clulas formo una nica banda en el gradiente de cloruro de cesio en una posicin que indicaba que las molculas de DNA de doble hlice de las clulas hijas eran hbridos que contenan una cadena nueva con 14N y una cadena parental con 15N. Aunque esta hiptesis se comprob con la segunda etapa de este experimento, donde se permiti que las clulas volviesen a doblar su nmero en el medio con 14N. El DNA aislado de este segundo ciclo de replicacin mostro dos bandas en el gradiente de densidad, una con una densidad igual a la del DNA ligero y la otra con la densidad del DNA hibrido observado despus de la primera duplicacin celular.

14. en qu consiste el proceso de replicacin?La replicacin es un proceso altamente coordinado, el cual consiste en el cual una molcula de ADN de doble hlice da lugar a otras dos molculas de ADN con la misma secuencia de bases.15. Escribe en una tabla las caractersticas y funcin de las DNA polimerasas I, II y IIIpolimerasacaractersticasFuncin

Polimerasa ICodificada por el gen Pol APM: 109.000monmeroTiene un papel reparador, retira los cebadores con su actividad exonucleasa 5'- 3' y rellena el hueco con su actividad polimerasa 5'- 3'.

Polimerasa IIPM: 90.000Monmerose la asigna exclusivamente una funcin reparadora

Polimerasa IIIPM: 900.000Multmetro asimtricola enzima que realiza la mayora de la replicacin

16. En qu direccin se sintetiza una nueva cadena de DNA?

17. La cadena templete es replicada a partir de su extremo., hacia su extremo.

18. Cmo se lleva a cabo la sntesis de la hebra discontinua o retardada (esquema)?

La sntesis de la hebra rezagada se realiza en cortos fragmento de OkazakiComo se muestra en el esquema

19. Menciona las enzimas que participan en la replicacin y funcin de estas (primasas, helicasas, protenas de unin al DNA, ligasas, DNA Pol I, DNA Pol III)Primasa: sintetiza cebadores, segmentos cortos de RNAHelicasa: separacin de los cadenas parentales de DNAProtenas de unin al DNA: estabilizar a las cadenas separadas de DNALigasas: sellar mellas (huecos)Polimerasa I: eliminar cebadores de RNA y remplazarlos por DNAPolimerasa III: polimerizacin del DNA

20. Definicin de transcripcin La transcripcin, es el proceso mediante el cual se transfiere la informacin contenida en la secuencia del DNA hacia la secuencia de protenas utilizando diversos RNA como intermediarios.

21. Escribe la funcin de la RNA polimerasa en procariontes y delas RNA polimerasa I, II y III en eucariontes.En las clulas procariontes solo existe un tipo de RNA polimerasa (tambin llamada RNA polimerasa dependiente de DNA) la cual es Holoenzima formada por 5 subunidades. La cual polimeriza en sentido de 5` a 3`, adems no tiene actividad exonucleasa (es decir no es correctora) y no necesita de cebadores para llevar a cabo la polimerizacinEn clulas eucariontes existen tres tipos de RNA polimerasasRNA polimerasa I: es la encargada de una sola sntesis del RNA prerribosomico (Prep- rRNA)Polimerasa II: la principal funcin de esta enzima es la sntesis de mRNA y de algunos RNA especializados.RNA polimerasa III: sintetiza RNA de transferencia y rRNA 5S y algunos otros RNA especializados de menor tamao 22. Describe en una tabla diferentes caractersticas del proceso de transcripcin en procariontes (tipo o tipos de RNA polimerasa empleadas, terminacin de la transcripcin en cada caso).

23. Explica la funcin el factor sigma de la RNA polimerasa de E. coli, en la transcripcin de eucariontes.

24. Describe con un esquema las caractersticas de un promotor procarionte, y de uno eucarionte.

25. El alargamiento de la cadena de RNA en crecimiento durante la transcripcin es en el extremo.

26. La polimerasa se desplaza sobre la cadena de DNA (plantilla) que tiene la direccin, al mismo tiempo que va formando la cadena complementaria anti paralela de RNA.

27. Describir en una tabla las propiedades comparativas de las RNA polimerasas en eucariontes.

28. Que son los factores de transcripcin?Los factores de transcripcin son protenas que participan en la regulacin de la transcripcin del ADN, pero que no forman parte de la ARN polimerasa.29. Cul es la funcin de los factores de transcripcin generales y cul de los factores tejido-especficos?Los factores generales son aquellos que son requeridos en todos los promotores de la Pol II (factores habitualmente designados como TFII) los cuales tienen diferentes funciones como: reparacin del DNA daado. TFIIH participa en la formacin del complejo cerrado durante la formacin del complejo de transcripcin. Mientras que la funcin principal de los factores tejido-especficos es la de reconocer genes especficos de un tejido.

30. Qu significa que un factor de transcripcin actu en trans?Que son protenas sintetizadas en otros genes, los cuales pueden potenciar o reprimir la transcripcin de un gen.31. En qu consiste la terminacin de la trascripcin en eucariontes?32. en qu consiste el procesamiento del mRNA en eucariontes?33. Por qu se lleva a cabo el corte y empalme (splicing) y en qu lugar de la clula se lleva a cabo?34. Qu es un polisoma?Un polisoma es cuando se unen varios ribosomas a un mismo ARN mensajero para sintetizar protenas.35. en qu consiste la transcripcin inversa y que enzima la lleva a cabo?La trascripcin inversa es un proceso el cual es llevado a cabo por la enzima transcriptasa inversa, esta enzima es empleada por los retrovirus para la replicacin de su genoma, en otras palabras, la transcriptasa inversa utiliza RNA del virus como molde para la sntesis de una hebra de DNA complementaria.36. Definicin de transduccin.La transduccin es la sntesis de un polipptido dirigida por un mRNA, de manera que la secuencia de nucletidos del mRNA se traduce en una secuencia de aminocidos de la protena.

37. Qu factores proteicos estn implicados en cada una de las 3 fases de la traduccin?38. A) en qu direccin el ribosoma lee el mRNA?B) El ribosoma, que sintetiza primero el extremo amino o el extremo carboxilo de la cadena poli peptdica, durante la transduccin?

39. En procariontes, Cul es la funcin de la secuencia Shine Dlagarno en la transcripcin?40. La subunidad 50S presenta 3 sitios de unin del tRNA, describe nombre y funcin de ellos.41. Menciona nombres de antibiticos que inhiben la transcripcin y como la inhiben.Rifamicinas: Son antibiticos producidos por Streptomyces mediterranei, con buena actividad contra bacterias Gram-positivas y contra Mycobacterium tuberculosis. Para lograr la inhibicin del inicio de la transcripcin, se une de modo no covalente a la subunidad de la ARN polimerasa.42. Menciona caractersticas del cdigo genticoEl cdigo gentico es el cdigo mediante el cual una secuencia de nucletidos de una molcula de DNA o de RNA especifica la secuencia de aminocidos de un polipptido. Est formado por codones de 3 nucletidos que especifican un determinado aminocido o indican al ribosoma que detenga la transcripcin y libere al polipptido. Con pocas excepciones, todos los seres vivos emplean el mismo cdigo.43. Describe que es una enzima constitutiva y una enzima inducible, un ejemplo en cada caso.Enzimas constitutivas: Son aquellas en que las clulas las fabrica todo el tiempo. Siempre estn all en niveles "basales". Est o no el sustrato en ese momento. Ej.: las enzimas de la va glucoltica. Enzimas inducibles: Son aquellas enzimas que se sintetizan cuando su sustrato est presente en la clula.