La pelcula inicia cuando Harry y Dumbledore estn siendo fotografiados despus del regreso de Voldemort, justo donde se qued la pelcula anterior. La siguiente escena nos retrata como el mundo muggle tambin est vindose afectado por los ataques encabezados por Voldemort despus de su regreso inminente; entre las afectacin se puede ver la cada de un puesta, una tormenta que afecta de manera muy rara el clima, etc. A continuacin se ve a Harry observando un peridico en donde una de las notas hace referencia a la detencin y entrada de Lucius Malfoy a Azkaban (crcel mgica). Mientras Harry est esperando a una chica con la que va a salir, Dumbledore aparece en el andn del metro y le pide que lo acompa a un lado; el asiente y mediante una aparicin los dos son transportados a pueblo. Despus de ingresar a una casa que pareciera estar abandonada, encuentran al profesor Horace Slughorn, quien mediante un encantamiento haba logrado ocultar todo el lugar para que cualquiera pareciera que l no estaba ah, ya que tena miedo de que los mortfagos lo encontraran. Las intenciones de Dumbledore son que Horace acepte la vacante de profesor en Hogwarts usando a Harry como atractivo. Al principio Horace se niega, pero al ver a Harry lo piensa mejor y acepta pidindole a Dumbledore que le cambie el despacho por otro que le gusta ms y un aumento de sueldo. Al salir, Dumbledore trasporta a Harry a la casa de Ron, donde sus cosas ya lo esperan. En una escena paralela se puede ver a Narcisa Malfoy junto con su hermana Bellatrix Lestrange acudir a la casa de Severus Snape donde la primera le pide a Snape que ayude a su hijo Draco a cumplir la tarea que el seor tenebroso le ha encomendado; este acepta y realizan el juramento inquebrantable, un hechizo donde mediante la magia se jura cumplir una promesa que si no se cumple se paga con la vida de la persona que lo est jurando. Despus vemos a Harry junto con todos sus amigos en la inauguracin de la tienda de bromas de George y Fred; al salir ven como el callejn est casi abandonado debido a los ataques de los mortfagos, y ven como Draco y su madre van caminando sospechosamente, los comienzan a seguir pero no pueden verlos cuando entran a un local. Cuando Harry, Hermione y Ron van en el tren camino a Hogwarts, Harry les cuenta sobre sus sospechas acerca de Draco, quien piensa es un nuevo mortfago; ellos no le creen as que Harry decide ir e investigar por su cuenta, ponindose su capa de invisibilidad; pero Draco se da cuenta y por medio de un hechizo lo petrifica y le deja colocada su capa para que nadie lo encuentre dentro del tren. Es Luna la que encuentra a Harry, y juntos van caminando a la entrada de Howgard; al llegar, el profesor Flitwick les pide sus nombres para poder ingresar a la escuela y les comenta que son nuevas reglas de seguridad para proteger el castillo. Ya dentro del comedor, Dumbledore les explica que dichas medidas de seguridad son para proteger a los chicos de las fuerzas oscuras que quieren penetrar el castillo. As mismo, les comunica que el profesor Horace impartir la clase de Pociones, mientras que Snape es ahora el encargado de Defensa contra las artes oscuras. Al iniciar las clases, la profesora McGonagall le sugiere a Harry y Ron que tomen la clase de pociones con el profesor Horace. Al entrar a la clase, Harry y Ron pelean por tomar el mejor libro ya que hay uno nuevo y otro viejo, pero es Ron el que se queda con el nuevo. La primera tarea que se les es encomendada es que preparen una pocin y el que mejor la haga ser ganador de un poco de la pocin de la suerte, Felix Felicis. Gracias a las instrucciones que alguien haba anotado en el libro viejo de pociones, Harry logra ganar el premio. Harry se da cuenta que el libro le perteneci a alguien que se hace llamar el Prncipe Mestizo. Ms tarde, Harry acude al despacho de Dumbledore, donde ste le muestra el recuerdo que tiene de cuando conoci a Tom Riddle, el da que fue a recogerlo del orfanato para decirle que haba sido aceptado en Howgarts. Ah Dumbledore se da cuenta que a Tom le gusta robar cosas y le dice que eso no se acepta en Hogwarts. Dumbledore le pide a Harry que se acerque al profesor Horace y que se gane su confianza. La siguiente escena nos muestra como Harry est haciendo la seleccin de los miembros para pertenecer al equipo de Quidditch; gracias a que Hermione hace trampa con un hechizo, Ron logra quedar dentro a pesar de no ser la mejor opcin. Ms tarde, Hermione interroga a Harry acerca del libro que al parecer pertenece a un tal Prncipe Mestizo. Dicho interrogatorio sigue durante el camino a Hogsmeade, donde se encuentran al profesor Horace y este invita a Harry y Hermione a una reunin que est organizando. Ya de regreso, los tres presencian como una de sus compaeras sufre un ataque al tocar por error un collar que llevaba, y que al parecer le iba a entregar a Dumbledore. Ms tarde McGonagall los interroga y les dice que el collar tena una fuerte maldicin, y en ese momento Harry acusa directamente a Draco de ser el responsable de lo sucedido. En la siguiente escena podemos ver la reunin a la que Harry y Hermione fueron invitados por el profesor Horace, donde al parecer todos los invitados son alumnos que tienen cierto potencial de ser alguien importante cuando se graden de Hogwarts. Al finalizar la reunin, Harry se acerca al profesor y trata de hablar acerca de Voldemort, pero Horace no se muestra muy participativo. La siguiente escena nos muestra a los chicos preparndose para salir al primer juego de Quidditch, y se puede ver a Ron en un muy mal estado a causa de los nervios. Harry le hace creer que le dio a beber la pocin de suerte liquida y Ron, gracias al efecto placebo, da lo mejor de s mismo y el equipo sale victorioso. Llegadas las fechas prximas a Navidad, el profesor Horace hace de nuevo una cena en donde invita a sus alumnos predilectos, es ah donde Draco es atrapado por andar merodeando en zonas prohibidas para los estudiantes dentro del castillo. Harry lo sigue y escucha una conversacin de Draco con el profesor Snape, quien le est brindando su ayuda para cumplir la tarea que le fue asignada por Voldemort. Harry se va de vacaciones a la casa de Ron, mientras celebran navidad la casa sufre un atentado por parte de dos mortfagos. Al regresar de vacaciones, Harry acude con Dumbledore quien le muestra un recuerdo del profesor Horace en donde se puede ver al joven Tom, quien se acerca a preguntarle acerca de algo y el profesor se molesta y lo corre. Dumbledore le dice que ese recuerdo esta alterado para esconder la verdad, y es para eso que le pidi a Harry que se acercara al profesor, para obtener tal recuerdo pero en una versin ms fidedigna. Harry se acerca al profesor Horance y trata de hacerle la misma pregunta que Tom aos atrs, este se molesta al darse cuenta de que Harry est siguiendo las rdenes de Dumbledore, y lo corre de su saln. Al marcharse, Harry va directo a su habitacin donde encuentra a Ron que se ha comido todos los chocolates que una tal Romilda le ha mandado a Harry, los chocolates contenan una pocin de amor y Ron se estaba comportando de una manera un tanto extraa, as que Harry lo lleva al despacho del profesor Horace, y este le da una pocin para revertir el efecto, y lo logra. Para festejar y tranquilizar un poco a Ron, el profesor les ofrece un poco de vino, y cuando Ron le da el primer trago comienza a sufrir convulsiones. Resulta ser que el vino estaba envenenado, y que al igual que el collar, tena como destino final llegar a las manos de Dumbledore. Harry est ms convencido de que los ataques son producto de la mente de Draco, as que lo enfrenta, y despus de armarse de palabras, Harry le lanza un hechizo que ley dentro del libro de pociones sin saber qu efecto tendr. El hechizo provoca en Draco un desangrado que parece ser causa de heridas muy profundas, pero gracias a que Snape llega es l quien ayuda a Draco. Harry decide ocultar en la sala de los menesteres el libro. Al darse cuenta de que no ha prosperado en la investigacin que Dumbledore le encargo, Harry decide tomarse la pocin de la suerte al estar convencido de que esta le ayudara. Al tomarla, Harry decide ir a visitar a Hagrid y en el camino se encuentra con el profesor Horace, quien lo acompaa con Hagrid; al llegar ven a Hagrid llorando frente al cadver de Aragog, una acromntula. Despus del entierro los tres se dirigen a la cabaa de Hagrid, y los dos adultos comienzan a beber mientras que Harry los observa; cuando Horace le cuenta a Harry que tuvo un pez gracias a que Lily, la madre de Harry, se lo regal, Harry le pide que sea valiente y honrando el nombre de ella le de ese recuerdo para que pueda combatir a Voldemort; y de esa manera, Harry consigue el recuerdo. En el recuerdo se ve a Tom preguntndole al profesor en que consiste un Horrocrux; y este le explica que es magia muy negra, un hechizo que permite guardar una parte del alma de una persona y as, si el cuerpo de la persona sufre un ataque y muere, realmente no morir ya que una parte de su alma estar a salvo. Tom le pregunta de qu manera se puede fragmentar el alma, y el profesor le responde que mediante el asesinato, ya que este es un acto que va en contra de la naturaleza. Por ultimo le hace una pregunta clave se puede fragmentar el alma en ms de una ocasin; por ejemplo, en 7? A lo que la respuesta es si. Dumbledore le explica a Harry que es peor de lo que el tema, ya que entonces Voldemort logro dividir su alma en 7 partes y las ocult en diferentes objetos, y le cuenta que ha estado viajando y al parecer ya encontr un nuevo horrocrux. Es as como viajan a una isla donde encuentran un guardapelo, pero para poder sacarlo de una vasija llena de un lquido extrao Dumbledore debe de tomrselo. As lo hace pero al parecer ese lquido era un fuerte veneno, ya que comienza a delirar; como puede, Harry logra regresar con Dumbledore al castillo, y este le pide que busque a Snape para que sea l quien lo ayude; pero antes de poder ir a buscarlo, Harry se tiene que ocultar ya que Draco aparece y desarma a Dumbledore, y es en ese momento donde confianza que l ha estado detrs de todos los ataques y que su blanco siempre ha sido Dumbledore. Snape aparece y al verlo, Dumbledore le dice Por favor, Severus y Snape le lanza el maleficio asesino, Avada Kedavra. Harry queda en shock por la muerte de Dumbledore por un momento, pero cuando se recupera comienza a seguir a Snape, quien le revela que es l el prncipe mestizo. Al finalizar la pelcula, Harry le confianza a Hermione que no piensa regresar el ao que viene a la escuela ya que comenzar la bsqueda de los horrocruxes que hacen falta. Ella le dice que no ir solo, ya que ella y Ron piensan acompaarlo.