DIGITALIZAÇÃO DE COLECÇÕES BIOLÓGICAS

Braga, 5-7 de julio de 2006

Nodo español de GBIF: GBIF.ES

Unidad de Coordinación del Nodo Español de GBIF http://www.gbif.es

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La Ministerio español de Ciencia y Tecnología firma el MoU. España se convierte en miembro y participante con voto de GBIF

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Resolución del MCYT publicada en el Boletín Oficial del Estado (BOE) por la que se encomienda al CSIC la implementación y la gestión científico técnica del Nodo Nacional de GBIF, con una dotación económica de 336.570 €. Además, se aprueba la concesión de ayudas para la realización de acciones especiales en el marco del Plan Nacional de Investigación Científica, Desarrollo e Innovación Tecnológica 2000-2003 y sucesivas.http://www.boe.es/boe/dias/2002-07-12/tiffs/A25605.tif

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3

Se transfieren al CSIC los fondos para el establecimiento de la Unidad de Coordinación.

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Nombramiento del responsible del Nodo español.

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3

Se crea la Unidad de Coordinación y se inician sus actividades. Se emplea nuevo personal (un especialista en Tecnología de la Información y un coordinador de proyectos). Se inicia el trabajo real.

10 / 2003

El sitio web de GBIF-España está operativo y comienza a servir datos a GBIF. http://www.gbif.es

GBIF en España

Francisco Pando, Asamblea de la AHIM, 2003

Organización del Nodo español

• No va a haber una gran base de datos central

• Cada colección va a crear, mantener y gestionar su base de datos, y controlar qué información hace accesible

(y cuál no) por Internet

• La red puede ser simétrica, en el sentido de que todos los centros participantes sean a la vez puntos de

acceso para toda la información

• Ejemplos:

Red Mundial de Información en Biodiversidad

http://www.conabio.gob.mx/remib/doctos/remib_esp.html

The Species analyst:

  http://www.speciesanalyst.net/zportal/tsasimple.asp

Francisco Pando, Asamblea de la AHIM, 2003

El Nodo español de GBIF se concibió como el sistema español de Información sobre Biodiversidad, integrado por una Unidad de Coordinación (UC) y por una federación de bases de datos integrada por los Centros Asociados a la Red (CAR). Se organizó, por tanto, como un sistema distribuido:

• Analizar el estado de sus colecciones

• Preparar proyectos de informatización:

– Acciones especiales

– “Seed money” GBIF

– Etc.

• Adecuar las colecciones (conservación y acceso)

• Mantener las base de datos

¿Qué tienen que hacer los Centros de la red GBIF?

Francisco Pando, Asamblea de la AHIM, 2003

Esta misión se plasma en las siguientes tareas:

• Proporcionar soporte técnico (información, formación, estándares, software y asesoramiento)

• Asegurar la coherencia entre las iniciativas nacionales y la arquitectura informática de GBIF, para garantizar la interoperabilidad

• Investigar como maximizar el valor de los datos, al desarrollar herramientas de análisis, validación y visualización de los mismos

• Recopilar y difundir información relevante para las colecciones y para el conocimiento y gestión de la información sobre biodiversidad

Unidad de CoordinaciónUnidad de CoordinaciónMisión: apoyar a las colecciones, centros y proyectos relevantes sobre biodiversidad para que participen en GBIF

Nodo español de GBIF

Unidad de CoordinaciónUnidad de Coordinación

Acceso unitario informaciónAcceso unitario información

DiseñarEstablecer y apoyar la estrategiaAsesorar

CAR

CAR

CAR

CAR

CAR

CAR Analizar estado coleccionesPreparar proyectos con criterios UCAdecuar coleccionesInformatizarActualizar información

Francisco Pando, Asamblea de la AHIM, 2003

Crear la Unidad de Coordinación

Toma de decisiones iniciales: prioridades, criterios, estándares y tecnología

Recabar la información sobre las colecciones y su estado

A la fase 1

Francisco Pando, Asamblea de la AHIM, 2003

Puesta a punto del software

Preparación de la documentación de referencia de la aplicación

Programas de formación

Presentación

Puesta en marcha de un servidor Web

A la fase 2

Francisco Pando, Asamblea de la AHIM, 2003

Priorizar la adecuación de las colecciones clave necesitadas

Inicio informatización otras colecciones clave

Puesta en Internet de las bases de datos de estas colecciones

Completar informatización colecciones grandes con programa de informatización

Actuación piloto

A la fase 3

Francisco Pando, Asamblea de la AHIM, 2003

Incorporar BBDD no basadas en colecciones de biodiversidad

Puesta en Internet de las bases de datos de estas colecciones

Herramientas para explotar la información

Expandir la actuación de la fase 2

Francisco Pando, Asamblea de la AHIM, 2003

Apoyo a los proyectos de informatización

• Acciones Especiales 2003 (se concedieron para informatizar colecciones, pero no específicamente para GBIF):

Nº Acciones concedidas………….12Total € invertidos………………… 264.078

• Acciones Complementarias 2004 (específicamente para GBIF):

Nº Acciones concedidas………….18Total € invertidos………………… 626.050

• Acciones Complementarias 2005:

Nº Acciones concedidas………….23Total € invertidos………………… 464.300

Software para informatización de colecciones bíológicas

• HERBAR 3.5a (Pando et al., 2005)

• ZOORBAR 1.0 (Pando et al., 2005)

• BIBMASTER 2.8 (Pando et al., 2005)

Programa de formación

Talleres formación software:

• Taller sobre informatización de colecciones botánicas. Valencia, 22-26 de septiembre de 2003.

• Taller de iniciación a la aplicación HERBAR. Madrid, 28-30 noviembre y 1 diciembre 2005.

• Taller-ensayo sobre el uso de BIBMASTER. Madrid, 14-15 marzo 2005.

• Taller para usuarios avanzados de HERBAR. Madrid, 28-30 septiembre 2005.

• Taller de iniciación a la aplicación ZOORBAR. Madrid, 14-16 febrero 2006

Otros talleres:

• Réplica del taller GBIF MODELLING BIODIVERSITY DATA. Madrid, 19-21 octubre 2005.

• Réplica del Taller GBIF ECOLOGICAL NICHE MODELLING. Madrid, 10-12 mayo 2006.

Informe de Colecciones: Objetivos• Identificar cuántas

colecciones biológicas existen y dónde se encuentran.

• Organizar los contactos con cada una de las colecciones.

• Promover su participación en GBIF, tanto a nivel nacional como internacional.

• Comunicar e intercambiar experiencias y proyectos entre ellas.

Sobre la base de datos de BioCase, el Nodo español compuso el Informe sobre las Colecciones de Historia Natural españolas accessible en:

http://www.gbif.es/InformeColecciones_in.php

Informe sobre las Colecciones de Historia Natural españolas

Alberto González Talaván

Acceso a los datos desde el portal del Nodo español:

http://www.gbif.es/ic_busquedas_in.php

Barcelona

Alberto González Talaván

Actuaciones relevantes

• Colaboración con organizaciones que asocian a distintos tipos de colecciones: AHIM (Proyecto 'Spanish and Portuguese Platform for Botanical Biodiversity Data Online' (2003).

• Fomento y apoyo a la creación de una Asociación Española de Colecciones de Historia Natural.

• Desarrollo del portal de consulta de datos de colecciones y proyectos españoles.

• Asistencia a Congresos, Simposios, Jornadas, etc. a fin de transmitir nuestra iniciativa a un amplio espectro de potenciales proveedores.

Desarrollo de la Unidad de Coordinación

• Instalación de nuevos servidores

• Aumento de las funcionalidades del portal y desde marzo de 2005, está operativo el portal de consulta de datos de GBIF procedentes de las colecciones españolas.

• Servicio de “Hosting”

• Crecimiento del equipo humano de trabajo. En la actualidad cuenta con:

– Responsable de la UdC: Node Manager.– Coordinador de proyectos.– Administrador de la red local y de servidores– Documentación y apoyo a usuarios– 2 Programadores/analistas de software

A modo de conclusión: Situación actual del Nodo español

• A día de hoy la incorporación de datos de colecciones españolas a GBIF alcanza la cifra de 790.000 registros, procedentes de 51 bases de datos, albergadas en 25 instituciones.

• Se trabaja en nuevas herramientas de software: Asistente para georreferenciación y nuevas funcionalidades para los programas ya en uso.

• Participación activa en GBIF internacional: Talleres, convocatorias de proyectos, subcomités, etc.

• Se ha puesto en marcha un plan de colaboraciones internacionales: INBio (Costa Rica), Instituto Humboldt (Colombia) , Red CYTED para la conservación e informatización de colecciones biológicas y Mentoring con Portugal.