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1. Actividad de posgrado FORMULARIO PARA LA POSTULACIÓN DE ACTIVIDADES DE POSGRADO 1.1. Carácter propuesto: Acreditable a carreras de posgrado: doctorado 1.2. Nombre: PROTECCiÓN DE CULTIVOS: OMICAS y NUEVAS ESTRATEGIAS PARA ESTUDIAR LAS INTERACCION ES PLANTA-MICROORGANISMO 1.3. Fundamentación de la Propuesta En la actualidad, la Biotecnología es una de las principales ramas de desarrollo científico ytecnológico. La aplicacióny aspectos relacionados con la agricultura se conocen como Agrobiotecnología. Desde el nacimiento de la biología molecular, los investigadores han planteado e intentado resolver los problemas biológicos estudiando la función de los genes y productos génicos de forma individual izada. Esta aproximación "reduccionista" ha demostrado ser enormemente fructífera y ha permitido descubrir numerosos principios biológicos, sin embargo, muchas preguntas fundamentales permanecen sin respuesta. Este hecho se debe a que la mayoría de productos génicos actúan de forma conjunta y, por tanto, los procesos biológicos deben considerarse como redes complejas cuyos componentes están interconectados. El término genómica hace referencia al estudio multidisciplinario de los genomas, y se puede abordar tanto a nivel estructural como funcional.A partir de este concepto han surgido otros términos, como transcriptómica, proteómica o metabolómica, que hacen referencia al estudio de las moléculas de ARN, proteínas y metabolitos, respectivamente, producidas por un organismo dado en un momento determinado y bajo condiciones definidas. Todas estas aproximaciones se basan en el desarrollo de tecnologías de procesamiento rápido y masivo de datos que reciben en conjunto el nombre genérico de "ómicas", campo en el que la bioinformática cumple un papel fundamental. El advenimiento de las nuevas tecnologías de secuenciación masiva ha permitido que estén disponibles para la investigación y aplicación práctica distintos genomas de plantas y microorganismos patógenos y beneficiosos que ha permitido llevar a cabo estudios comparativos que han favorecido de forma considerable el entendimiento de la base genética que subyace tras sus distintos estilos de vida. El curso está dirigido a profesionales, e investigadores posgraduados en los diferentes ámbitos de la producción agronómica que quieran profundizar en la bases ómicas que subyacen y sustentas las aplicaciones agrobiotecnológicas. Así mismo, los contenidos del curso suponen una forma de actualización para docentes cuya principal actividad guarde relación pero no implique el manejo directo de las técnicas ómicas en su actividad investigadora. El programa de curso incluye contenidos metodológicos y fundamentales necesarios para la comprensión de las técnicas biotecnológicas que se aplican en agricultura y el conocimiento de la relación de las plantas con su entorno, principalmente con patógenos y microorganismos beneficiosos. Más concretamente, las competencias a adquirir por los alumnos estarán dirigidas a: a) integrar conocimientos teóricos y metodológicos imprescindibles para el saber y el hacer con genes y proteínas, profundizando sobre" las bases que subyacen en un sistema planta-patógeno, y b) aplicar los principios en los que se basan la genómica y laproteómica, bajo el compromiso del método científico y de forma ética con respecto a la legislación existente sobre organismos modificados genéticamente. Con el presente curso también pretendemos desarrollar habilidades de

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1. Actividad de posgrado

FORMULARIO PARA LA POSTULACIÓN DE ACTIVIDADES DE POSGRADO

1.1. Carácter propuesto: Acreditable a carreras de posgrado: doctorado

1.2. Nombre:PROTECCiÓN DE CULTIVOS: OMICAS y NUEVAS ESTRATEGIAS PARA ESTUDIAR LASINTERACCION ES PLANTA-MICROORGANISMO

1.3. Fundamentación de la Propuesta

En la actualidad, la Biotecnología es una de las principales ramas de desarrollo científicoytecnológico. La aplicacióny aspectos relacionados con la agricultura se conocen comoAgrobiotecnología. Desde el nacimiento de la biología molecular, los investigadores han planteadoe intentado resolver los problemas biológicos estudiando la función de los genes y productosgénicos de forma individual izada. Esta aproximación "reduccionista" ha demostrado serenormemente fructífera y ha permitido descubrir numerosos principios biológicos, sin embargo,muchas preguntas fundamentales permanecen sin respuesta. Este hecho se debe a que la mayoría deproductos génicos actúan de forma conjunta y, por tanto, los procesos biológicos debenconsiderarse como redes complejas cuyos componentes están interconectados.El término genómica hace referencia al estudio multidisciplinario de los genomas, y se puedeabordar tanto a nivel estructural como funcional.A partir de este concepto han surgido otrostérminos, como transcriptómica, proteómica o metabolómica, que hacen referencia al estudio de lasmoléculas de ARN, proteínas y metabolitos, respectivamente, producidas por un organismo dado enun momento determinado y bajo condiciones definidas. Todas estas aproximaciones se basan en eldesarrollo de tecnologías de procesamiento rápido y masivo de datos que reciben en conjunto elnombre genérico de "ómicas", campo en el que la bioinformática cumple un papel fundamental.

El advenimiento de las nuevas tecnologías de secuenciación masiva ha permitido que esténdisponibles para la investigación y aplicación práctica distintos genomas de plantas ymicroorganismos patógenos y beneficiosos que ha permitido llevar a cabo estudios comparativosque han favorecido de forma considerable el entendimiento de la base genética que subyace tras susdistintos estilos de vida.

El curso está dirigido a profesionales, e investigadores posgraduados en los diferentes ámbitos de laproducción agronómica que quieran profundizar en la bases ómicas que subyacen y sustentas lasaplicaciones agrobiotecnológicas. Así mismo, los contenidos del curso suponen una forma deactualización para docentes cuya principal actividad guarde relación pero no implique el manejodirecto de las técnicas ómicas en su actividad investigadora.

El programa de curso incluye contenidos metodológicos y fundamentales necesarios para lacomprensión de las técnicas biotecnológicas que se aplican en agricultura y el conocimiento de larelación de las plantas con su entorno, principalmente con patógenos y microorganismosbeneficiosos. Más concretamente, las competencias a adquirir por los alumnos estarán dirigidas a:a) integrar conocimientos teóricos y metodológicos imprescindibles para el saber y el hacer congenes y proteínas, profundizando sobre" las bases que subyacen en un sistema planta-patógeno, y b)aplicar los principios en los que se basan la genómica y laproteómica, bajo el compromiso delmétodo científico y de forma ética con respecto a la legislación existente sobre organismosmodificados genéticamente. Con el presente curso también pretendemos desarrollar habilidades de

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t.gestión de la información mediante la búsqueda de bibliografia científica, laconsulta de bases-de -_ ...._ ..datos y la utilización de los soportes y herramientas informáticas apropiadas en cada caso, así com~.~-W'adquirir criterios objetivos de selección de bibliografiarelevante, cerciorarse de un manera precisade los límites del conocimiento actual sobre los tipos, ventajas y posibilidades de las aplicaciones dela genómica y laproteómica a la agricultura, y conocer de primera mano los fundamentos teóricos ymetodológicos de la agrigenómica y la proteómica.

1.4. Objetivos• Tomar conciencia de la importancia de las cienciasómicas aplicadas a la

agricultura.

• Conocer las principales técnicasómicas (genómica, transcriptómica,proteómica).

• Conocer la tecnología de microarrays de ADN y sus aplicaciones.• Conocer las principales estrategias para el estudio funcional de genes.

• Adquirir conocimientos básicos de proteómica.• Conocimientos de bases de datos de genes y proteínas.• Conocer las aplicaciones de la genómica y la proteómica a las ciencias

agrarias.

• Tomar conciencia de la importancia de las técnicas ómicasen los estudios deinteracción planta-microorganismo.

• Adquirir criterios fundamentados sobre la utilización de organismosmodificados genéticamente.

1.5. Contenidos (Programa Analítico + Bibliografía)

6 de julio

Contenido 1.- Introducción: Características generales de los genomas de plantas y. .m rcroorgarusmos.

*Seminario 1: Técnicas básicas de biología molecular (enzimas de restricción, PCR ysecuenciación Sanger) y bases de datos de secuencias.

Contenido 2.- Mapas genéticos y mapas fisicos. Marcadores de DNA.

Contenido 3.- Genómica estructural: Genotecas de inserto largo.

7 de julio

*Seminario 2: Secuenciación automática (Secuenciadores de 23 y 33 generación).

Contenido 4-1.- Genómica estructural: Estrategias y aproximación a la secuenciación genómica.

Contenido 4-Il.- Genómica estructural: Estrategias de secuenciación de cDNA.

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8 de julio

Contenido 5.- Análisis de expresión génica

Contenido 6.- Genética directa (del fenotipo al gen). Mutagénesisal azar y escrutinio de mutantes.

Contenido 7.- Genética reversa (del gen al fenotipo).Mutagénesis dirigida.

9 de julioActividad no presencial: Búsqueda de información sobre. aplicaciones de las nuevas

tecnologías de secuenciación automática.

10 de julio

Contenido 8.- Proteómica: principios y aplicaciones.

Contenido 9.- Trichoderma como agente de biocontrol y como microorganismo modelobeneficioso para las plantas.

Contenido 10.- lnteracciones moleculares Planta-Microorganismo (patógeno o beneficioso).Señalización hormonal.

Bibliografia

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Velculescu et al (1995). Science 270:484-487.

Vizcaíno et al (2006). BMC Genomics 7:193 (pp. 1-14).

1.6. Metodología (consignar la carga horaria de cada una de las modalidades de clases

previstas):

- Clases magistrales, seminarios a cargo de los participantes.

- Horario de clases: Lunes a Viernes de 9 a 17.30 hs.- Jueves 9 de Julio actividad no presencial de lectura y búsqueda bibliográfica

1.7. Evaluación (explicitar condiciones para la aprobación del curso):- Individual XPresentación escrita de un trabajo y discusión de un tema.

1.8. Cupo de alumnos para el dictado (Mínimo y máximo).Destinado a: 20 alumnos como máximo. Mínimo: 6 alumnosRequisitos de los participantes: Graduados en Agronomía, Graduados en Ciencias Forestales,Biología, Biotecnología, Ciencias Ambientales.

1.9.Arancel: $ 600

1.10. Fecha estimada de dictado (inicio-finalización). Modalidad.

Del6 al 10 de Julio de 2015. Modalidad Presencial

2. Cuerpo Docente2.1. Docente responsable:Dr. Enrique Monte Vázquez, Catedrático de Microbiología, Departamento de Microbiología yGenética, Instituto Centro Hispano-Luso de Investigaciones Agrarias (CIALE).Universidad deSalamanca (España).

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2.2. Docentes Intervinientes

Dra Maria Rosa Hermosa, Profesora Titular de Microbiología,Dpto. de Microbiología y GenétiCentro Hispano-Luso de Investigaciones Agrarias (CIALE).Universidad de Salamanca (España).Dra. Cecilia Mónaco: Docente investigador del ClDEFI,Facultad de Ciencias Agrarias y Forestales.UNLP.

Indicar para cada docente:

Dr. Enrique Monte Vázquez

Tema: Lecciones 2, 3,4-1 Y 10.- Carga Horaria: 15hs- Formato:- Taller- Seminario- Clase Magistral X- Mesa Redonda

Dra Maria Rosa Hermosa

Tema: Lecciones 1, 4-Il, S, 6, 7 Y8; YSeminarios 1 y 2.- Carga Horaria: 20hs- Formato:- Taller- Seminario X- Clase Magistral X- Mesa Redonda

Dra. Cecilia Mónaco

- Tema: Lección 9.- Carga Horaria:- Formato:- Taller- Seminario- Clase Magistral X- Mesa Redonda

3. Requisitos básicos para el dictado

Todos los días del curso: cañón de proyección, pantalla y conexión a internet en aula.