Genomas. Partículas infecciosas que contienen ácidos nucleicos rodeados de una cápside proteica....

44
Genomas

Transcript of Genomas. Partículas infecciosas que contienen ácidos nucleicos rodeados de una cápside proteica....

Page 1: Genomas. Partículas infecciosas que contienen ácidos nucleicos rodeados de una cápside proteica. Depende de la maquinaria de replicación, transcripción.

Genomas

Page 2: Genomas. Partículas infecciosas que contienen ácidos nucleicos rodeados de una cápside proteica. Depende de la maquinaria de replicación, transcripción.

• Partículas infecciosas que contienen ácidos nucleicos rodeados de una cápside proteica.

• Depende de la maquinaria de replicación, transcripción y traducción de la célula.

• Sus genomas varían en tamaño

Virus

Page 3: Genomas. Partículas infecciosas que contienen ácidos nucleicos rodeados de una cápside proteica. Depende de la maquinaria de replicación, transcripción.
Page 4: Genomas. Partículas infecciosas que contienen ácidos nucleicos rodeados de una cápside proteica. Depende de la maquinaria de replicación, transcripción.

Estructura de algunos virusPhage

Capsid protein

TMV

Page 5: Genomas. Partículas infecciosas que contienen ácidos nucleicos rodeados de una cápside proteica. Depende de la maquinaria de replicación, transcripción.

Dos formas de empaquetar el ADN viral

Page 6: Genomas. Partículas infecciosas que contienen ácidos nucleicos rodeados de una cápside proteica. Depende de la maquinaria de replicación, transcripción.

• Se encuentra en una región llamada nucloide

• El ADN está en contacto directo con el citoplasma

Cromosoma bacteriano

Page 7: Genomas. Partículas infecciosas que contienen ácidos nucleicos rodeados de una cápside proteica. Depende de la maquinaria de replicación, transcripción.

El ADN bacteriano es circular

Page 8: Genomas. Partículas infecciosas que contienen ácidos nucleicos rodeados de una cápside proteica. Depende de la maquinaria de replicación, transcripción.

Cromosomas bacterianos

• El AND cromosómico está compactado ~ 1000 veces para que pueda entrar en la célula

Page 9: Genomas. Partículas infecciosas que contienen ácidos nucleicos rodeados de una cápside proteica. Depende de la maquinaria de replicación, transcripción.

Núcleo en interfase

Page 10: Genomas. Partículas infecciosas que contienen ácidos nucleicos rodeados de una cápside proteica. Depende de la maquinaria de replicación, transcripción.

Tipos de Cromatina

Page 11: Genomas. Partículas infecciosas que contienen ácidos nucleicos rodeados de una cápside proteica. Depende de la maquinaria de replicación, transcripción.

Cromatina Eucromatina

Heterocromatina

Eucromatina= Transcripcionalmente activa

Heterocromatina= Electrodensa, transcripcionalmente no activa

Tipos de Cromatina

Page 12: Genomas. Partículas infecciosas que contienen ácidos nucleicos rodeados de una cápside proteica. Depende de la maquinaria de replicación, transcripción.

HETEROCROMATINA EUCROMATINA

Grado de condensación del DNA

Máxima condensación de la cromatina (cercana a la de un cromosoma metafásico

Forma menos condensada

Contribución al total de la cromatina

Minoritaria, sólo algunas porciones del material genético se encuentra en esta forma: Heterocromatina constitutiva y facultativa

Mayoritaria durante la interfase

Accesibilidad de la molécula de DNA para su interacción con proteínas (DNA polimerasa, RNA polimerasas, factores de transcripción...)

No es accesible, debido a su elevada condensación. Cromatina transcripcionalmente inactiva.

Es accesible, cromatina transcripcionalmente activa.

Page 13: Genomas. Partículas infecciosas que contienen ácidos nucleicos rodeados de una cápside proteica. Depende de la maquinaria de replicación, transcripción.

Constitutiva: región de la cromatina que no se expresa. Incluye secuencias cortas repetidas

(DNA satélite) y puede tener un papel estructural en el cromosoma. Se localiza en lugares

característicos, por ejemplo, en centrómeros y telómeros.

Facultativa: toma la forma de cromosomas enteros que son inactivos en una línea celular,

aunque pueden ser expresados en otra. El cromosoma X de mamíferos, por ejemplo, el cual

es enteramente inactivo en las hembras lo que compensa el que haya dos en la hembra y uno en

el macho.

Heterocromatina

La condensación del material genético esta asociado a su inactividad pero lo contrario NO es cierto. Aunque los genes activos se encuentran en la eucromatina solo una pequeña minoría se transcribe, o sea, que esta es una condición necesaria pero no suficiente.

Page 14: Genomas. Partículas infecciosas que contienen ácidos nucleicos rodeados de una cápside proteica. Depende de la maquinaria de replicación, transcripción.

Heterocromatina vs eucromatina

• Heterocromatina constitutiva– Siempre se encuentra como heterocromatina– Es permanentemente inactiva con respecto a la

transcripción

• Heterocromatina facultativa– Regiones que se pueden interconvertir entre

heterocromatina y eucromatina– Ejemplo: cuerpos de Barr

Page 15: Genomas. Partículas infecciosas que contienen ácidos nucleicos rodeados de una cápside proteica. Depende de la maquinaria de replicación, transcripción.

Núcleos en mitosis

Page 16: Genomas. Partículas infecciosas que contienen ácidos nucleicos rodeados de una cápside proteica. Depende de la maquinaria de replicación, transcripción.

Existen tres niveles en la condensación:1) Fibras de 10 nm

Page 17: Genomas. Partículas infecciosas que contienen ácidos nucleicos rodeados de una cápside proteica. Depende de la maquinaria de replicación, transcripción.

nucleosomas

Page 18: Genomas. Partículas infecciosas que contienen ácidos nucleicos rodeados de una cápside proteica. Depende de la maquinaria de replicación, transcripción.

Estructura del nucleosoma

• Histonas; proteínasbásicas (lisinay arginina) que interaccionan

con el ADN

• El nucleosoma está formado por un núcleo de 4 histonas– Dos de cada una de H2A, H2B, H3

& H4

• La 5a histona, H1 es la que sella el nucleosoma.

Page 19: Genomas. Partículas infecciosas que contienen ácidos nucleicos rodeados de una cápside proteica. Depende de la maquinaria de replicación, transcripción.

Histona H1

Page 20: Genomas. Partículas infecciosas que contienen ácidos nucleicos rodeados de una cápside proteica. Depende de la maquinaria de replicación, transcripción.

Análisis de los nucleosomas

Page 21: Genomas. Partículas infecciosas que contienen ácidos nucleicos rodeados de una cápside proteica. Depende de la maquinaria de replicación, transcripción.

30 unitsml-1

Degradación con DNAsa I

Page 22: Genomas. Partículas infecciosas que contienen ácidos nucleicos rodeados de una cápside proteica. Depende de la maquinaria de replicación, transcripción.
Page 23: Genomas. Partículas infecciosas que contienen ácidos nucleicos rodeados de una cápside proteica. Depende de la maquinaria de replicación, transcripción.
Page 24: Genomas. Partículas infecciosas que contienen ácidos nucleicos rodeados de una cápside proteica. Depende de la maquinaria de replicación, transcripción.

2) Segundo nivel: fibras de 30 nm

Page 25: Genomas. Partículas infecciosas que contienen ácidos nucleicos rodeados de una cápside proteica. Depende de la maquinaria de replicación, transcripción.

Regiones de unión a la matriz (MAR´S)

Los MAR´S están anclados a la matriz

nuclear

25,000 to 200,000 bp

3) Tercer Nivel de Condensación

Page 26: Genomas. Partículas infecciosas que contienen ácidos nucleicos rodeados de una cápside proteica. Depende de la maquinaria de replicación, transcripción.

La condensina viaja al núcleo

La condensina se une al cromosoma

y compacta las asas

Durante interfase la condensina está en el citoplasma

Condensación del cromosoma

Page 27: Genomas. Partículas infecciosas que contienen ácidos nucleicos rodeados de una cápside proteica. Depende de la maquinaria de replicación, transcripción.
Page 28: Genomas. Partículas infecciosas que contienen ácidos nucleicos rodeados de una cápside proteica. Depende de la maquinaria de replicación, transcripción.

Centromere

Kinetochore proteins

Origin of replication

Origin of replication

Origin of replication

Origin of replication

Telomere

Telomere

GenesRepetitive sequences

Page 29: Genomas. Partículas infecciosas que contienen ácidos nucleicos rodeados de una cápside proteica. Depende de la maquinaria de replicación, transcripción.

Importancia del centrómero

Page 30: Genomas. Partículas infecciosas que contienen ácidos nucleicos rodeados de una cápside proteica. Depende de la maquinaria de replicación, transcripción.

Secuencia centromérica de Saccharomyces cerevisiae

Page 31: Genomas. Partículas infecciosas que contienen ácidos nucleicos rodeados de una cápside proteica. Depende de la maquinaria de replicación, transcripción.

Características del telómero

Page 32: Genomas. Partículas infecciosas que contienen ácidos nucleicos rodeados de una cápside proteica. Depende de la maquinaria de replicación, transcripción.

Telómeros

Page 33: Genomas. Partículas infecciosas que contienen ácidos nucleicos rodeados de una cápside proteica. Depende de la maquinaria de replicación, transcripción.

¿Qué pasa si el telómero se acorta?

Page 34: Genomas. Partículas infecciosas que contienen ácidos nucleicos rodeados de una cápside proteica. Depende de la maquinaria de replicación, transcripción.

¿Qué se necesita paratener un cromosoma estable?

• centrómero•telómero•origen de replicación

Page 35: Genomas. Partículas infecciosas que contienen ácidos nucleicos rodeados de una cápside proteica. Depende de la maquinaria de replicación, transcripción.

La epigenética se refiere a los cambios reversibles del ADN (no en su secuencia) y las proteínas que se unen a él, y que hace que unos genes se expresen o no en función de condiciones exteriores. Esta condición es heredable.

La genética son cambios a nivel de la secuencia del ADN que se heredan de una generación a otra

Epigenética

Page 36: Genomas. Partículas infecciosas que contienen ácidos nucleicos rodeados de una cápside proteica. Depende de la maquinaria de replicación, transcripción.

La metilación del ADN induce la formación de heterocromatina

Page 37: Genomas. Partículas infecciosas que contienen ácidos nucleicos rodeados de una cápside proteica. Depende de la maquinaria de replicación, transcripción.

Modificación de histonas

Page 38: Genomas. Partículas infecciosas que contienen ácidos nucleicos rodeados de una cápside proteica. Depende de la maquinaria de replicación, transcripción.

Remodelación de cromatina

Page 39: Genomas. Partículas infecciosas que contienen ácidos nucleicos rodeados de una cápside proteica. Depende de la maquinaria de replicación, transcripción.
Page 40: Genomas. Partículas infecciosas que contienen ácidos nucleicos rodeados de una cápside proteica. Depende de la maquinaria de replicación, transcripción.
Page 41: Genomas. Partículas infecciosas que contienen ácidos nucleicos rodeados de una cápside proteica. Depende de la maquinaria de replicación, transcripción.
Page 42: Genomas. Partículas infecciosas que contienen ácidos nucleicos rodeados de una cápside proteica. Depende de la maquinaria de replicación, transcripción.

El ADN se introduce con ayuda de una proteína

Page 43: Genomas. Partículas infecciosas que contienen ácidos nucleicos rodeados de una cápside proteica. Depende de la maquinaria de replicación, transcripción.
Page 44: Genomas. Partículas infecciosas que contienen ácidos nucleicos rodeados de una cápside proteica. Depende de la maquinaria de replicación, transcripción.

La cohesina se libera de las cromátidas, solo se

mantiene en el centrómero

Cohesin remains at centromere

Cohesin at centromer is degraded

Cromosomas durante la Mitosis