LABORATORIO DE REFERENCIA EN ANDALUCÍA …...2016/01/05 · H. Costa del Sol 7 25 H. Regional de...

EL PAPEL CRÍTICO DEL LABORATORIO DE

REFERENCIA DE MICROBIOLOGÍA EN EL

PROGRAMA PIRASOA

Servicio de Microbiología

Hospital Universitario Virgen Macarena

Unidad Intercentros de Enfermedades Infecciosas,

Microbiología Clínica y Medicina Preventiva

Universidad de Sevilla

SEIMC 2016

SEIMC 2016

Programa PIRASOA

Programa integral de prevención y control de las infecciones

Relacionadas con la asistencia sanitaria y uso apropiado de los antimicrobianos

Secretaría General de Salud Pública, Inclusión Social y Calidad de Vida

Dirección General de Asistencia Sanitaria y Resultados en Salud

Dirección General de Calidad, Investigación, Desarrollo e Innovación

22 de febrero de 2013SEIMC 2016

Definición

• Es un programa de calidad asistencial, para mejorar

el pronóstico de los pacientes, reduciendo la

mortalidad y las secuelas que producen las

infecciones, en particular las relacionadas con la

asistencia sanitaria (IRAS) y las causadas por las

bacterias multirresistentes (BMR).

• Beneficio económico, por la reducción de los gastos

directos que genera el diagnóstico y el tratamiento de

los pacientes con IRAS y por BMR.SEIMC 2016

Objetivos generales

1. Reducir la incidencia de IRAS hasta alcanzar el nivel

de los países europeos con mejores indicadores.

2. Optimizar el uso de antimicrobianos hasta alcanzar el

nivel de los países europeos con mejores indicadores.

SEIMC 2016

Plataforma digital

Hospitales- Equipo de IRAS

- Equipo de PROA

Distritos- Equipo de PROA

Comité científico

Estructura y organización

Laboratorio de referencia

UGCs- Referentes

UGCs- Referentes

SEIMC 2016

Apoyo institucional

Objetivos del programa PIRASOA:

CONTRATO PROGRAMA del SAS con los Distritos yHospitales

ACUERDOS DE GESTIÓN de los Distritos y Hospitales conlas UGC

SEIMC 2016

Laboratorio PIRASOA

Antecedentes

1. Reconocimiento como laboratorio dereferencia (UPRA) en noviembre de2013.

2. Finalidad: tipado molecular debacterias MR y ofrecer informaciónrelevante en tiempo real para elcontrol de brotes producidos porbacterias MR.SEIM

C 2016

Objetivos (I)

Servir de apoyo al Programa PIRASOA en ladetección, investigación y control de brotes porbacterias MR.

Determinar la relación clonal de los aislamientos depatógenos nosocomiales MR mediante lacombinación de pruebas fenotípicas y genotípicas entiempo suficiente para poder tomar medidas decontrol adecuadas.

Estudio fenotípico y genotípico de los mecanismosde resistencia de patógenos nosocomiales de interésy que puedan favorecer el desarrollo de medidasterapéuticas y/o preventivas.SEIM

C 2016

Objetivos (II)

Identificación y seguimiento de clones demicroorganismos MR que circulen en centroshospitalarios de la Comunidad.

Creación de una base de datos con los genotiposde interés.

Servir de centro centinela para la detección denuevos mecanismos de resistencia en patógenosnosocomiales o de la comunidad.SEIM

C 2016

Metodología

Detección de mecanismos de resistencia:

Marcadores fenotípicos

Marcadores genotípicos: PCR +/-

secuenciación

Identificación molecular:

REP-PCR, PFGE, MLST, Secuenciación

Base de datos históricasSEIMC 2016

Flujo de trabajoP

rim

er

pa

so

Solicitud de estudios .

Recepción de aislados

RE

SIS

TE

NC

IA Pruebas de sensibilidad

Test rápidos

PCR de genes diana

TIP

AD

O PFGE

MLST

Comparación con basesde datos

INF

OR

ME Preliminar

Definitivo

SEIMC 2016

Perfiles de la

base de datos

de Andalucía

PFGE

Normalización

Comparación con perfiles previos

MLST

Nuevos aislados Comparación con previos

SEIMC 2016

Tiempos de respuesta

• Informe preliminar: < 10 dias

• Informe final: < 21 dias

– Estos tiempos pueden variar de acuerdo a la complejidad del brote

SEIMC 2016

SEIMC 2016

ActividadOctubre 2013-Diciembre 2015

Año Aislados Episodios Aislados/

episodio

Centros

2013 9 2 4.5 2

2014 164 57 2.8 21

2015 297 99 3 22

SEIMC 2016

MicroorganismosIncremento 60%

2014 2015

185 297

Enterobacteriaceae

K. pneumoniae 93 171

K. oxytoca 2 4

Others 17 32

No fermentadores

A. baumannii 54 64

P. aeruginosa 7 15

Others 6 0

Gram positivos

Staphylococcus spp 6 2

E. faecium 0 3

SEIMC 2016

Determinantes de resistencia

Epecies/determinante 2014 2015

K. pneumoniae 93 171

BLEE 10 66

Carbapenemasa 51 78

Carbapenemasa+BLEE 20 19

Carbapenemasa+BLEE+pAmpc 0 1

pAmpC 11 4

Carbapenemasa y BLEE negativo 1 3SEIMC 2016

Especies 2014 2015

A. baumannii 54 64

OXA-23 38 32

OXA-58 15 24

OXA-24/40 1 8

Especies 2014 2015

Otras Enterobacteriaceae 17 36

BLEE 1 7

Hiper OXY 1 0

Carbapenemasa 2 11

Carbapenemasa+BLEE 0 1

Negativo 4 23

Determinantes de Resistencia

SEIMC 2016

Aislados

/Hospital

Center 2014 2015

H. San Cecilio 27 0

H. Reina Sofia 22 32

H. Virgen de la Victoria 37 18

H. Alto Guadalquivir Andujar 14 24

H. San Juan de Dios 3 30

H. Jerez 7 31

H. Costa del Sol 7 25

H. Regional de Málaga 9 6

H. Virgen Macarena 6 22

H. Valme 3 49

H. Virgen del Rocio 0 13

H. Virgen de las Nieves 5 13

H. de la Línea 5 4

H. la Inmaculada Nuercal-Overa 2 3

H. Serrania Malaga 2 4

HARE Puente Genil 5 2

H. Infanta Margarita Cabra 0 9

H. Montilla 2 0

H. Pozoblanco 1 0

H. Riotinto 1 0

HARE Guadiato 3 1

H. Alcala la Real 1 0

H Utrera 0 3

H. Linares 0 2

H. Torrecárdenas 0 6

SEIMC 2016

K. pneumoniae

Clones relevantes

• Productores de Carbapenemasas– KPC-3

– ST512 (n = 45)

– ST258 (n = 5)

– OXA-48 +CTX-M-15– ST15 (n = 7)

– ST11 (n = 5)

– ST405 (n = 1)* producer of OXA-245+CTX-M-15

• Productores de BLEEs– CTX-M-15

– ST307 (n = 23)*

– ST405 (n = 7)

– CTX-M-15+SHV-2a– ST25 (n = 8)*

– SHV-2– ST870 (n = 10)*

*circunscritos a un solo centro

SEIMC 2016

Diseminación de K. pneumoniae productora de

KPC en la cuenca mediterránea

Israel

Woodford, J Antimicrob Chemother 2008; Kitchel, Antimicrob

Agents Chemother 2009; Samuelsen, J Antimicrob Agents

Chemother 2009; Baraniak, Antimicrob Agents Chemother

2009; Pounaras J Antimicrob 2009; Warburg, J Antimicrob

Chemother 2012; López-Cerero, Int J Antimicrob Agents 2015

KPC-3

ST512

KPC-3/ST258

KPC-2/ST258

SEIMC 2016

K. pneumoniae ST512 productor de KPC

August 2012

Córdoba

Transfer from Italy

Abril, 2013

Cabra

Febrero, 2014

Montilla

Abril, 2014

Pozoblanco

Mayo, 2014

Sevilla

Mayo, 2014

Jerez

Agosto, 2014

Alcala la Real

Agosto, 2014,

Peñarroya-Pueblonuevo

Diciembre, 2014

Puente Genil

Febrero, 2015

Andujar

SEIMC 2016

K. pneumoniae ST512 KPC-3 en 2015

Centro Periodo de los aislados

H alto Guadalquivir Andujar Febrero 2015

Mayo 2015

Agosto 2015

H Infanta Margarita (Cabra) Septiembre 2015

H SAS Jérez Enero-abril 2015

HARE del Guadiato Julio 2015

SEIMC 2016

Dice (Opt:1.00%) (Tol 1.0%-1.0%) (H>0.0% S>0.0%) [0.0%-100.0%]

PFGE EC 25922

100

95

90

85

80

PFGE EC 25922

257

2015096

2015097

2015102

2015194

2015317

2015351

2015255-1

2015089

2015256

2015258

2015339

2015350

2015352

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exudate

Orina

Orina

F rectal

F rectal

Orina

F rectal

F rectal

Orina

F rectal

Cama BOX-5

Sangre

F rectal

F rectal

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26/06/12

27/02/15

05/03/15

05/03/15

25/02/15

20/11/15

14/12/15

16/09/15

25/10/15

17/09/15

22/09/15

05/12/15

11/12/15

09/12/15

caso 1

2251724883

3033002200

3031724847

20-1031

70320

81042

14315

10234882005

14392

14640

5051246

81056

79692

H U Reina Sofia

H de Jerez

H de Jerez

H de Jerez

H U Reina Sofia

H Virgen de las Nieves


H Infanta Margarita

H de Jerez

H Infanta Margarita

H Infanta Margarita




ST512

ST512

ST512

ST512

ST512

ST258

ST258

ST512

ST512

ST512

ST512

ST258

ST258

ST258

Aparición de K. pneumoniae ST258 productor

de KPC-3

• ST258 una variante alélica de ST512ST gapA infB mdh pgi phoE rpoB tonB

258 3 3 1 1 1 1 79

512 54 1 1 1 1 1 79

Nº

Ref Muestra Fecha Origen Centro clon

Aparición de un pulsotipo idéntico a aislados del clon ST512, pero

pertenecientes al clon ST258 en H. Virgen de las Nieves noviembre-

diciembre de 2015

SEIMC 2016

K. pneumoniae ST405 productor de CTX-M-15

Dice (Opt:1.00%) (Tol 1.0%-1.0%) (H>0.0% S>0.0%) [0.0%-100.0%]

PFGE EC 25922100

95

90

85

80

75

70

65

60

PFGE EC 25922

2014131

2015136

2014132

CO-10

CO-13

CO-8

CO-1

CO-11

CO-14

CO-15

CO-16

CO-17

CO-18

CO-2

CO-3

CO-4

CO-5

CO-6

CO-7

CO-9

971

CO-12-Felipe

2015301

2015303

2016051

2016052

2015300

2015302

2015305

2015218

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CTX-M-15

OXA-245+CTX-M-15

CTX-M-15

CTX-M-15

CTX-M-15

CTX-M-15

CTX-M-15

CTX-M-15

CTX-M-15

CTX-M-15

CTX-M-15

CTX-M-15

CTX-M-15

CTX-M-15

CTX-M-15

CTX-M-15

CTX-M-15

CTX-M-15

CTX-M-15

CTX-M-15

OXA-48+CTX-M-15

CTX-M-15

CTX-M-15+TEM-1

CTX-M-15+TEM-1

CTX-M-15+TEM-1

CTX-M-15+TEM-1

CTX-M-15+TEM-1

CTX-M-15+TEM-1

CTX-M-15+TEM-1

CTX-M-15+TEM-1

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16/09/14

08/06/15

?

2013

2013

2013

2013

2013

2013

2013

2013

2013

2013

2013

2013

2013

2013

2013

2013

2013

08/11/15

10/11/15

26/12/15

11/01/16

04/11/15

10/11/15

12/11/15

25/07/15

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H Reina Sofia

H Costa del Sol

H Reina Sofia

H Reina Sofia

H Reina Sofia

H Reina Sofia

H Reina Sofia

H Reina Sofia

H Reina Sofia

H Reina Sofia

H Reina Sofia

H Reina Sofia

H Reina Sofia

H Reina Sofia

H Reina Sofia

H Reina Sofia

H Reina Sofia

H Reina Sofia

H Reina Sofia

H Reina Sofia

H La Paz

H Reina Sofia

H Torrecardenas

H Torrecardenas

H Torrecardenas

H Torrecardenas

H Torrecardenas

H Torrecardenas

H Torrecardenas

H La Línea

1er brote Neonatología


2013

2º brote Neonatología

H Torrecárdenas

2015

Brote en la comunidad

de Madrid

J. Machuca et al. JAC 2016

SEIMC 2016

K. pneumoniae productor de OXA-48+CTX-M-15

ST15

6/2014 H S Juan de Dios

10/2014 H Regional Malaga

5/2015 H Virgen de las Nieves

10/2015 H Valme

ST431 (ST15 variante)

4/2015 H Costa del Sol

4/2014 H Virgen de la Victoria

9/2015 H Infanta Margarita

SEIMC 2016

K. pneumoniae ST15 productor de OXA-48 + CTX-M-15

Dice (Opt:1.00%) (Tol 1.0%-1.0%) (H>0.0% S>0.0%) [0.0%-100.0%]

PFGE EC 25922

100

90

80

70

60

PFGE EC 25922

2015254-1

2015254-2

2015189

2014180

2015314

2014058

2014033

2014034

2014057

2014128

2014129

2014185/#1

2015014

2015018

2015050

2014149

2014033/#1

2014145

2014181

2014127

2014187

2014081

2015130

2014028

2015261

2015108

2014144

2014150

2014146

2014142

2014143

2014182

2014088

2014090

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OXA-48+CTX-M-15+TEM-1


OXA-48

OXA-48+TEM-1

OXA-48+CTX-M-15+TEM-1+SHV-1

OXA-48+CTX-M-15

OXA-48+BLEE

OXA-48+BLEE





OXA-48



OXA-48+CTX-M-15

OXA-48+BLEE


OXA-48+TEM-1


OXA-48+SHV-1

OXA-48+CTX-M-15


OXA-48+CTX-M-15

OXA-48+CTX-M-15







OXA-48+TEM-1


OXA-48+CTX-M-15

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15/09/15

15/09/15

21/01/14

10/10/14

13/11/15

07/05/14

14/09/13

16/09/13

03/04/14

29/08/14

01/09/14

03/12/14

09/01/15

19/01/15

10/02/15

29/10/14

14/09/13

26/10/14

24/11/14

03/09/14

25/12/14

20/03/13

25/05/15

250/3/14

02/10/15

22/04/15

27/10/14

30/10/14

22/10/14

13/10/14

14/10/14

12/12/14

10/05/14

09/06/14

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H Infanta Margarita

H Infanta Margarita

H U Reina Sofia

H Maritimo

H Valme

H U Virgen de la Victoria

H U Virgen Macarena

H U Virgen Macarena








H Carlos Haya

H U Virgen Macarena

H Carlos Haya

H Maritimo

H Pascual

H U Virgen Macarena

H U Virgen Macarena


H U Virgen Macarena

H Valme

H Costa del Sol

H Carlos Haya

H Carlos Haya

H Carlos Haya

H Carlos Haya

H Carlos Haya

H Maritimo


H San Juan de Dios

SEIMC 2016

K. pneumoniae productor de CTX-M-15 +/- OXA-48 grupo

ST11

5/2014 H Jerez

9/2014 H Virgen de la Victoria

3/2015 H Costa del sol

9/2015 H Linares

SEIMC 2016

K. pneumoniae ST11 productor de CTX-M-15 +/- OXA-48

grupo

Dice (Opt:1.00%) (Tol 1.0%-1.0%) (H>0.0% S>0.0%) [0.0%-100.0%]

PFGE EC 25922

100

95

90

85

80

75

70

65

60

PFGE EC 25922

2015013

2015015

2014124

2014126

2015067

242

2015083

2014086

2015259

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OXA-48+CTX-M-15

OXA-48+CTX-M-15

CTX-M-1

OXA-48+CTX-M-15

OXA-48+CTX-M-15

OXA-48+CTX-M-15

OXA-245+CTX-M-15

OXA-48+CTX-M-15

OXA-48+CTX-M-15

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30/12/14

13/01/15

20/07/14

01/08/14

02/03/15

02/2012

02/04/15

02/05/14

23/09/15

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H Pascual

H Costa del Sol


H Costa del Sol

H de Jerez

H Linares

SEIMC 2016

A. baumannii productor de OXA-23

ST2

2/2014 H. San Cecilio

6/2014 H S J Dios

10/2014 H V Victoria

12/2014 H V Macarena

3/2015 H A G Andújar

9/2015 H Costa Sol

7/2014 H V Victoria

ST85SEIMC 2016

A. baumannii productor de OXA-24/40

ST2

6/2014 H S J Dios

2/2014 H V Macarena

SEIMC 2016

A. baumannii productor de OXA-58

ST23/2015 H Regional Malaga

3/2015 H A G Andújar

8/2015 H Costa del Sol

ST982/2014 H A G Andujar

2/2015 H Virgen Macarena

SEIMC 2016

CMI. 2013

SEIMC 2016

SEIMC 2016

Agradecimientos

SEIMC 2016

Cartera de Servicios (I)

Resistencia a antimicrobianos

• Detección de resistencia a oxacilina (SARM) en Staphylococcusaureus.

• Detección de resistencia a vancomicina en Enterococcus spp.

• Detección e identificación de genes de beta-lactamasas deespectro extendido (BLEE) tipo TEM, SHV y CTX-M, másfrecuentes en nuestro entorno, en enterobacterias.

• Detección e identificación de genes de AmpC plasmídicas ycromosómicas.

• Detección e identificación de genes de beta-lactamasas quehidrolizan carbapenems (carbapenemasas).SEIM

C 2016

Cartera de Servicios (II)

Tipado molecular o Genotipado

• Enterobacterias productoras de BLEE ocarbapanemasas.

• Otras enterobacterias multirresistentes

• Acinetobacter baumannii

• Pseudomonas aeruginosa

• S. aureus resistente a meticilina.

• Enterococcus resistente a vancomicina

SEIMC 2016

LABORATORIO DE REFERENCIA EN ANDALUCÍA …...2016/01/05 · H. Costa del Sol 7 25 H. Regional de...

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