MARCADOR DE BRECHA MEDIANTE ...Porcentaje de cicatrización 2,37 0,1252 En general, no existen...

38
Marina De Andrés Zamora Grado en Ingeniería Electrónica y Automática Industrial MARCADOR DE BRECHA MEDIANTE MICROFOTOGRAFÍA SOBRE CÉLULAS EPIDÉRMICAS CULTIVADAS EN PETRI PARA DETERMINAR EL EFECTO DE ELECTROTERAPIA Trabajo Fin de Grado

Transcript of MARCADOR DE BRECHA MEDIANTE ...Porcentaje de cicatrización 2,37 0,1252 En general, no existen...

Page 1: MARCADOR DE BRECHA MEDIANTE ...Porcentaje de cicatrización 2,37 0,1252 En general, no existen evidencias de diferencias significativas al comparar los experimentos control con los

M a r i n a D e A n d r é s Z a m o r a G r a d o e n I n g e n i e r í a E l e c t r ó n i c a y A u t o m á t i c a I n d u s t r i a l

MARCADOR DE BRECHA MEDIANTE MICROFOTOGRAFÍA SOBRE CÉLULAS EPIDÉRMICAS

CULTIVADAS EN PETRI PARA DETERMINAR EL EFECTO DE

ELECTROTERAPIA

Trabajo Fin de Grado

Page 2: MARCADOR DE BRECHA MEDIANTE ...Porcentaje de cicatrización 2,37 0,1252 En general, no existen evidencias de diferencias significativas al comparar los experimentos control con los

Estructura

Proyecto de investigación biomédica

Proyecto de ingeniería

Análisis de los resultados

Conclusiones

Preguntas, dudas…

Page 3: MARCADOR DE BRECHA MEDIANTE ...Porcentaje de cicatrización 2,37 0,1252 En general, no existen evidencias de diferencias significativas al comparar los experimentos control con los

Motivación del proyecto

Colaboración entre la Universidad Politécnica y el Laboratorio del Servicio de Bioectromagnetismo del Hospital Universitario Ramón y Cajal de Madrid.

Automatización de una etapa de análisis y procesamiento de imágenes

de microscopía. Técnica experimental laboriosa, monótona y subjetiva. Solución eficaz y objetiva. Ahorro de tiempo al personal especializado y

perfeccionamiento de las técnicas utilizadas.

Page 4: MARCADOR DE BRECHA MEDIANTE ...Porcentaje de cicatrización 2,37 0,1252 En general, no existen evidencias de diferencias significativas al comparar los experimentos control con los

Investigación biomédica en Electroterapia

Objetivo del estudio de investigación. • Nivel biológico

¿Qué es la Electroterapia?

Aplicación de energía electromagnética al organismo.

0 Hz - 1.000 Hz (baja frecuencia)

450.000 - 600.000 Hz (alta frecuencia)

Transferencia Eléctrica Capacitiva Resistiva (TECR)

TEC: Transferencia Eléctrica Capacitiva

TER: Transferencia Eléctrica Resistiva

Page 5: MARCADOR DE BRECHA MEDIANTE ...Porcentaje de cicatrización 2,37 0,1252 En general, no existen evidencias de diferencias significativas al comparar los experimentos control con los

Protocolo de investigación empleado

1. Cultivo o siembra de células epiteliales.

• Queratinocitos humanos.

• Placas Petri. Una semana.

• Cultivos control y cultivos tratado.

2. Realización del surco en la monocapa.

• Micropipeta P1000 o P200.

• Longitud del surco: ~ 2 ó 3 cm.

Page 6: MARCADOR DE BRECHA MEDIANTE ...Porcentaje de cicatrización 2,37 0,1252 En general, no existen evidencias de diferencias significativas al comparar los experimentos control con los

Protocolo de investigación empleado

3. Dibujo de marcas guía en las placas Petri

Page 7: MARCADOR DE BRECHA MEDIANTE ...Porcentaje de cicatrización 2,37 0,1252 En general, no existen evidencias de diferencias significativas al comparar los experimentos control con los

Protocolo de investigación empleado

4. Realización de imágenes de microscopia a las cero horas

• Microscopio Nikon. Objetivos 10x.

• Cámara Nikon D90.

• Seis imágenes por placa Seis puntos.

Page 8: MARCADOR DE BRECHA MEDIANTE ...Porcentaje de cicatrización 2,37 0,1252 En general, no existen evidencias de diferencias significativas al comparar los experimentos control con los

Protocolo de investigación empleado

5. Electro-Estimulación de las placas Petri • Electrodos conectados en serie.

• 50 ó 100 µA/mm2 aplicados en pulsos de cinco minutos cada, aprox., 4 horas.

• Experimentos a cuatro, seis, doce o veinticuatro horas.

6. Obtención de imágenes de microscopía post-tratamiento / Siguiente estimulación

Page 9: MARCADOR DE BRECHA MEDIANTE ...Porcentaje de cicatrización 2,37 0,1252 En general, no existen evidencias de diferencias significativas al comparar los experimentos control con los

Problemática a resolver mediante procesamiento de imágenes

Estado de la técnica antes de automatizarla.

Medida de un área sobre microfotografías

Page 10: MARCADOR DE BRECHA MEDIANTE ...Porcentaje de cicatrización 2,37 0,1252 En general, no existen evidencias de diferencias significativas al comparar los experimentos control con los

Objetivos del proyecto de ingeniería

Diseño y búsqueda de algoritmos de procesamiento de imágenes para un determinado tipo de microfotografías.

Interfaz Gráfica de Usuario de uso lo más simple e intuitiva posible. Procesamiento por directorios o carpetas.

Rapidez, precisión y generación/extracción de valores numéricos.

Page 11: MARCADOR DE BRECHA MEDIANTE ...Porcentaje de cicatrización 2,37 0,1252 En general, no existen evidencias de diferencias significativas al comparar los experimentos control con los

Herramientas para el procesamiento de microfotografías

Image Processing Toolbox

CMEIAS (Center for Microbial Ecology

Image Analysis System)

Instituto Nacional de Salud Mental (NIMH)

MATrix LABoratory

Page 12: MARCADOR DE BRECHA MEDIANTE ...Porcentaje de cicatrización 2,37 0,1252 En general, no existen evidencias de diferencias significativas al comparar los experimentos control con los

Algoritmos de segmentación y procesamiento

Algoritmo empírico

Algoritmo de segmentación por textura

Page 13: MARCADOR DE BRECHA MEDIANTE ...Porcentaje de cicatrización 2,37 0,1252 En general, no existen evidencias de diferencias significativas al comparar los experimentos control con los

Algoritmos de segmentación y procesamiento

Page 14: MARCADOR DE BRECHA MEDIANTE ...Porcentaje de cicatrización 2,37 0,1252 En general, no existen evidencias de diferencias significativas al comparar los experimentos control con los

Algunos ejemplos…

Page 15: MARCADOR DE BRECHA MEDIANTE ...Porcentaje de cicatrización 2,37 0,1252 En general, no existen evidencias de diferencias significativas al comparar los experimentos control con los

…Los algoritmos también cometen errores

Page 16: MARCADOR DE BRECHA MEDIANTE ...Porcentaje de cicatrización 2,37 0,1252 En general, no existen evidencias de diferencias significativas al comparar los experimentos control con los

Interfaz de aplicación biomédica.

Posibilidad de intercambiar, de manera sencilla, el algoritmo seleccionado para el procesamiento.

Procesar automáticamente carpetas de microfotografías.

Uso fácil e intuitivo.

Page 17: MARCADOR DE BRECHA MEDIANTE ...Porcentaje de cicatrización 2,37 0,1252 En general, no existen evidencias de diferencias significativas al comparar los experimentos control con los

Interfaz de aplicación biomédica. Funcionamiento.

Page 18: MARCADOR DE BRECHA MEDIANTE ...Porcentaje de cicatrización 2,37 0,1252 En general, no existen evidencias de diferencias significativas al comparar los experimentos control con los

Interfaz de aplicación biomédica. Funcionamiento.

Page 19: MARCADOR DE BRECHA MEDIANTE ...Porcentaje de cicatrización 2,37 0,1252 En general, no existen evidencias de diferencias significativas al comparar los experimentos control con los

Interfaz de aplicación biomédica. Funcionamiento.

Page 20: MARCADOR DE BRECHA MEDIANTE ...Porcentaje de cicatrización 2,37 0,1252 En general, no existen evidencias de diferencias significativas al comparar los experimentos control con los

Interfaz de aplicación biomédica. Funcionamiento.

Page 21: MARCADOR DE BRECHA MEDIANTE ...Porcentaje de cicatrización 2,37 0,1252 En general, no existen evidencias de diferencias significativas al comparar los experimentos control con los

Interfaz de aplicación biomédica. Funcionamiento.

Page 22: MARCADOR DE BRECHA MEDIANTE ...Porcentaje de cicatrización 2,37 0,1252 En general, no existen evidencias de diferencias significativas al comparar los experimentos control con los

Interfaz de aplicación biomédica. Funcionamiento.

Page 23: MARCADOR DE BRECHA MEDIANTE ...Porcentaje de cicatrización 2,37 0,1252 En general, no existen evidencias de diferencias significativas al comparar los experimentos control con los

Interfaz de aplicación biomédica. Funcionamiento.

Page 24: MARCADOR DE BRECHA MEDIANTE ...Porcentaje de cicatrización 2,37 0,1252 En general, no existen evidencias de diferencias significativas al comparar los experimentos control con los

Interfaz de aplicación biomédica. Funcionamiento.

Page 25: MARCADOR DE BRECHA MEDIANTE ...Porcentaje de cicatrización 2,37 0,1252 En general, no existen evidencias de diferencias significativas al comparar los experimentos control con los

Interfaz de aplicación biomédica. Funcionamiento.

Page 26: MARCADOR DE BRECHA MEDIANTE ...Porcentaje de cicatrización 2,37 0,1252 En general, no existen evidencias de diferencias significativas al comparar los experimentos control con los

Interfaz de aplicación biomédica. Excel.

Page 27: MARCADOR DE BRECHA MEDIANTE ...Porcentaje de cicatrización 2,37 0,1252 En general, no existen evidencias de diferencias significativas al comparar los experimentos control con los

Herramientas y técnica para el análisis estadístico de datos

ANOVA Simple

Distribución t de Student

Page 28: MARCADOR DE BRECHA MEDIANTE ...Porcentaje de cicatrización 2,37 0,1252 En general, no existen evidencias de diferencias significativas al comparar los experimentos control con los

Análisis de resultados. Experimentos estimulados a 50 µA/mm2

Porcentaje de superficie de brecha a un tiempo T.

Time = 4 horas

• Variable dependiente: Th

• Numero de observaciones: 164

• Número de niveles: 2 (C = Control = 0, T = Tratado = 1)

CT Casos Media

0 78 58,52

1 66 58,78

Page 29: MARCADOR DE BRECHA MEDIANTE ...Porcentaje de cicatrización 2,37 0,1252 En general, no existen evidencias de diferencias significativas al comparar los experimentos control con los

Análisis de resultados. Experimentos estimulados a 50 µA/mm2

Porcentaje de superficie de brecha a un tiempo T.

Time = 6 horas

• Variable dependiente: Th

• Numero de observaciones: 69

• Número de niveles: 2 (C = Control = 0, T = Tratado = 1)

CT Casos Media

0 36 42,99

1 33 46,66

Page 30: MARCADOR DE BRECHA MEDIANTE ...Porcentaje de cicatrización 2,37 0,1252 En general, no existen evidencias de diferencias significativas al comparar los experimentos control con los

Análisis de resultados. Experimentos estimulados a 50 µA/mm2

Porcentaje de cicatrización a un tiempo T.

Time = 6 horas

• Variable dependiente: (0h-Th)/0h*100

• Numero de observaciones: 69

• Número de niveles: 2 (C = Control = 0, T = Tratado = 1)

CT Casos Media

0 36 26,61

1 33 25,07

Page 31: MARCADOR DE BRECHA MEDIANTE ...Porcentaje de cicatrización 2,37 0,1252 En general, no existen evidencias de diferencias significativas al comparar los experimentos control con los

Análisis de resultados. Experimentos estimulados a 100 µA/mm2

Porcentaje de superficie de brecha a un tiempo T.

Time = 6 horas

• Variable dependiente: Th

• Numero de observaciones: 209

• Número de niveles: 2 (C = Control = 0, T = Tratado = 1)

CT Casos Media

0 106 51,68

1 103 54,47

Page 32: MARCADOR DE BRECHA MEDIANTE ...Porcentaje de cicatrización 2,37 0,1252 En general, no existen evidencias de diferencias significativas al comparar los experimentos control con los

Análisis de resultados. Experimentos estimulados a 100 µA/mm2

Porcentaje de cicatrización a un tiempo T.

Time = 6 horas

• Variable dependiente: (0h-Th)/0h*100

• Numero de observaciones: 209

• Número de niveles: 2 (C = Control = 0, T = Tratado = 1)

CT Casos Media

0 106 27,64

1 103 24,52

Page 33: MARCADOR DE BRECHA MEDIANTE ...Porcentaje de cicatrización 2,37 0,1252 En general, no existen evidencias de diferencias significativas al comparar los experimentos control con los

Conclusiones proyecto de investigación

Tiempo (h)

I/sup Variable dependiente Razón F Valor - P

6

50 µA/mm2

Porcentaje de brecha 0,94 0,3348

Porcentaje de cicatrización

0,13 0,7166

100 µA/mm2

Porcentaje de brecha 2,24 0,1362

Porcentaje de cicatrización

2,37 0,1252

En general, no existen evidencias de diferencias significativas al comparar los experimentos control con los tratado.

Una inhibición de la emigración de las células epidérmicas puede afectar favorablemente al proceso general de cicatrización de heridas cutáneas, al evitar problemas originados por el cierre prematuro de la epidermis con respecto a la dermis. Cierre en falso.

Posible tendencia a que existan diferencias significativas en los experimentos estimulados a 100 µA/mm2. A partir de esta intensidad por unidad de superficie, la temperatura aumenta y las células sufren hipertermia.

Page 34: MARCADOR DE BRECHA MEDIANTE ...Porcentaje de cicatrización 2,37 0,1252 En general, no existen evidencias de diferencias significativas al comparar los experimentos control con los

Conclusiones proyecto de ingeniería

Logro de la automatización de la etapa.

Aplicación informática que facilita el análisis y el procesamiento de imágenes de microscopía.

Implementación de un método medida preciso y objetivo.

Herramienta intuitiva y de fácil uso.

Importante ahorro de tiempo, pudiendo procesar y analizar una cantidad determinada de microfotografías en pocos minutos.

Aporte al gran mundo que engloba lo relacionado con la investigación y el desarrollo.

Page 35: MARCADOR DE BRECHA MEDIANTE ...Porcentaje de cicatrización 2,37 0,1252 En general, no existen evidencias de diferencias significativas al comparar los experimentos control con los

Publicitación del Congreso de INDIBA

Page 36: MARCADOR DE BRECHA MEDIANTE ...Porcentaje de cicatrización 2,37 0,1252 En general, no existen evidencias de diferencias significativas al comparar los experimentos control con los
Page 37: MARCADOR DE BRECHA MEDIANTE ...Porcentaje de cicatrización 2,37 0,1252 En general, no existen evidencias de diferencias significativas al comparar los experimentos control con los
Page 38: MARCADOR DE BRECHA MEDIANTE ...Porcentaje de cicatrización 2,37 0,1252 En general, no existen evidencias de diferencias significativas al comparar los experimentos control con los

FIN

Rueda de preguntas, dudas…

…¡¡GRACIAS!!