Memòria Anual - CRG Annual Report 2017 · 2018-07-26 · institute a israel, que arribarien al CRG...

RESUM EXECUTIUM e m ò r i a A n u a l

© CRG 2018

Realitzat peR: Departament de Comunicació i Relacions públiques

Centre de Regulació Genòmica (CRG)

Dr. aiguader, 88

08003 Barcelona, espanya

www.crg.eu

text i GRàfiCs: CientíficsdelCRG,Membresdel’equipd’AdministraciódelCRG,

Kat arney, Departament de Comunicació i Relacions públiques

Disseny GRàfiC: Ondeuev Comunicació s.l.

fOtOGRafia: IvanMarti,científicsdelCRG

víDeO: adrià sunyol

DipÒsit leGal: B 17124-2018

http://www.crg.eu

pRÒleG 4

DestaCats institUCiOnals 6

DestaCats CientífiCs 16

llar estimada 17

nedar en un mar de virus 19

Ultra-congelació 21

passa-ho 23

Classificar 25

D’acord,ordinador 27

Desempaquetant el genoma 29

RecercaiServeisCientífics 32

investigadors eRC al CRG 37

DaDes i xifRes 38

InfoRMefInAnCeR 44

AGRAïMentS 46

Continguts

4 - Resum executiu 2017

pròleg

a questany,el10d’abril,vatenirllocfinalmentlasignaturaoficialdel’acordperal’establiment

d’unasubseudel’eMBLaBarcelona.Desprésdemésde20anys,l’eMBLhaobertunanova

subseu al pRBB, adjacent al CRG. això millorarà la visibilitat internacional del pRBB i crearà,

conjuntamentamblaUnitatdeMicroscòpiaÒpticaAvançadadelCRG,unainstal·laciólíderenimatge

a europa.

Undelsfetsmésimportantsquevansucceirel2017éslacreaciód’unaxarxaentretotselsinstituts

iunitatsuniversitàriesespanyolesdistingidesambelsguardonsd’excel·lènciaSeveroochoaiMaria

deMaeztu.Aquestaaliança(SoMMa,http://somma.es/)s’hacreatpertaldepromourel’excel·lència

espanyolaenrecercaipermillorar-nel’impacteaescalanacional i internacional. Defet,elCRGés

l’institutquepresideixaquestaaliança.

Pelquefaalaciència,durantl’anyesvaduratermel’avaluaciódelprogramadeBioinformàticaiGenò-

mica.Lavaloracióvaserexcel·lentivapropiciarlacontinuïtatielreforçdelabioinformàticaalCRG.

el2017,tresdelsnostresjovesinvestigadorsprincipalsvanpassaraocuparcàrrecssèniorenaltres

institucions.MatthieuLouisésaraalDepartamentdeBiologiaMolecular,Cel·lularidelDesenvolupa-

mentdelaUniversitatdeCalifòrnia,aSantaBàrbara,alsestatsUnits;fyodorKondrashovésalDe-

partamentdeGenòmicaevolutivadel’InstitutdeCiènciaitecnologia(IStAustria),aKlosterneuburg,

Àustria,iManuelMendozaéscapd’equipal’InstitutdeGenètica,BiologiaMoleculariCel·lular(IGBMC)

aestrasburg,frança.finalment,JamesSharpeesdeixarelCRGperconvertir-seeneldirectordela

novaseudel’eMBLaBarcelona.estemenormementsatisfetsquetotsocupincàrrecsexcel·lents,un

fetquedemostral’èxitdelCRGenlaformacióilapromociódejovescientífics.Aprincipisdel2017,

elvanBokeinicholasStroustrup,queanteriormenttreballavenalaHarvardMedicalSchooldelsestats

Units, es van unir al CRG.

tambéalllargd’aquellany,id’acordambelnostreplaestratègic,vamfercanvisenlaformadecon-

tractar nous investigadors principals. per primera vegada, vam anunciar places no adscrites a cap

delsprogramesrelatiusalsprincipalstemesderecercadelnostrepla.Vamtenirmésde150sol·li-

cituds i desprésde la selecció i les entrevistes, vamcontractar dosnous investigadors principals,

l’evanovoa,del’InstitutGarvand’InvestigacióMèdicad’AustràliaiArnauSebe-Pedros,delWeizmann

institute a israel, que arribarien al CRG el 2018 i el 2019, respectivament.

Resum executiu 2017 - 5

Pel que fa al finançament, el CRGcontinuaatraient fons competitius. Cal esmentar que vamser

guardonatspersegonavegadacomaCentred’excel·lènciaSeveroochoa,distincióambunavalidesa

dequatreanysqueatorgaelMinisterid’economia,IndústriaiCompetitivitat.Aixímateix,quatregrups

van entrar a formar part de dues plataformes tecnològiques nacionals claus de bioinformàtica (Guigó,

Gabaldón,Gut)iproteòmica(Sabidó),ambelsuportdel’InstitutdeSalutCarlosIII(ISCIII).Aescala

europea,abandadenombrososprojectescol·laboratius,ésimportantdestacardosajuts:unStarting

Grantdel’eRC(Boke)iunaprovadeconceptedel’eRC(Valcárcel),aquestadarreraorientadaaprovar

elpotencialterapèuticdenousreactiusperalateràpiadelcàncerdepulmó.enl’àmbitinternacional,

Roderic Guigó va obtenir dos nous ajuts de recerca, procedents dels instituts nacionals de salut (niH).

elCRGdonasuportalaciènciaobertai,enaquestsentit,ésimportantesmentarelprojectedelaUe

lideratpelCRG:oRIon.estractad’unanovainiciativaperapromourecanvisinstitucionalsenelfinan-

çamentdelarecercaienlesorganitzacionsperafer-lesmésreceptivesalesnecessitatsdelasocietat

iabraçarelsprincipisdelaciènciaoberta.

ValasubratllarqueelCRGnoseriaunlloctanatractiusenseelsuportprofessionaliexcel·lentdels

seusdiversosdepartamentsd’administracióque,malgratl’enormecàrrega,hanaconseguitcrearun

fantàsticambientpertreballar.Mésconcretament,unadelesrecomanacionsclausperal’administra-

ciódelgrupd’expertsexternquelavanavaluarel2016,elprojectede“gestiódeprocessosempresa-

rials”,esvaimplementardurantl’anypassatambl’objectiud’avaluarimillorarelrendimentil’eficàcia

del’administraciói,pertant,permetrelamilloracontínuadelsdepartaments.

en un any ple de reptes, per primer cop hem fet front a la sortida de molts grups alhora, hem tractat

ambunacrisipolíticaaescalanacional iautonòmica i lacondiciódededuïbilitatdelnostre IVAha

entratencontrovèrsia,ambunimportantimpactefinanceriunagranincertwesa.Gràciesalsuportde

totelnostrepersonal,hemminimitzatl’impacted’aquestsreptesihemasseguratelsuportil’èxitde

totselsnostresinvestigadorsprincipals.elCRGcontinuasentunllocidealperfer-hiciènciaitenim

oportunitats i projectes emocionants al davant de cara al 2018.

Luis Serrano Director


Destacats institucionals


administracióL’equipadministratiu(incloent-hielCnAG-CRG)incloumembresde10païsosdiferentsiel2017hapro-

porcionatsuportessencialiespecíficalacomunitatdeCRGjuntamentamblesprioritatsdefinidesenel

plaestratègic2017-2021ielplad’accióanualdel’institut.

Una de les recomanacions clau del panel extern, el projecte de ¨gestió de processos de negoci¨, es va

implementardurantl’anypassatambl’objectiud’avaluarimillorarelrendimentIl’efectivitatdel’adminis-

tració i, per tant, permetre una millora contínua entre els departaments. es van continuar o iniciar algunes

activitatsperfomentarl’esperitieldesenvolupamentdel’equip,iiniciativesdeconciliacióentrelavida

laboralipersonaldelgrup,incloent-hilajornadad’administracióambtreballdegrupsobreeltemadela

innovació(dibuixos,presentacionsbreus,plujad’ideesconjuntaiactivitatscientífiques),elprogramade

teletreball,avaluacionsanualsderendimentiactivitatsde“ciènciafàcil”.

L’equipadministratiuvacontribuiraalgunesiniciativesperatotelCRG:laimplementaciódelplad’acció

d’igualtatdegèneredeLIBRA,l’excel·lènciadeRHenprojectesderecerca,laprimerareuniódelajunta

d’anticsalumnesaBarcelona,lacontractaciódenousinvestigadorsprincipals(PI)ilamarxafluidade

diversosgrupsderecerca.AquestaúltimavacoincidirambunaugmentsignificatiudePIjúniorsque

marxavendel’institut,talcomespreveuenlapolíticaderotaciócientífica.enelcontextdel’establiment

del’associaciólocalentreelCRGil’eMBLiambelsuportfinancerdelMinisterid’economia,Indústriai

Competitivitatespanyol,l’equipadministratiuvaproporcionarassessoramentisuportalaseud’eMBL

deBarcelonacreadafapocenassumptesrelatiusalestIC,prevencióderiscoslaborals,gestiód’ins-

tal·lacionsicompres.entrelesnovesiniciativesdeprevencióderiscoslaboralsdutesatermeel2017,

trobemladigitalitzaciód’unregistrecentralitzatdebioseguretatperal’úsd’agentsbiològics,aixícom

ladesignaciódecoordinadorsdeseguretatalslaboratoriscomacontacteslocalsencadascund’ells,la

qualcosaasseguralautilitzacióadequadadenormesdesalutiseguretatenellaboratori.

Ambl’objectiud’anarmésenllàdelCRG,elsmembresde l’administraciócontinuencompartintpunts

de vista i es relacionen amb altres instituts nacionals i de l’estranger, especialment amb instituts

d’eU-LIfe.esvancelebrarlocalmenttaulesrodonesenlesqualselsinstitutsCeRCAvanpermetrel’in-

tercanvideconeixementsibonespràctiques.Mésconcretament,lagerentvaser-hiponentconvidada

enduesocasionsivapresentarl’avaluaciódel’administraciódutaatermeel2016perunpaneld’experts

externsinternacionals,perlaqualcosavaservircomamodelperad’altresinstitutsnacionals.


formacióavançadaLaformacióavançadaendiferentsetapesprofessionalséselnuclidelesactivitatsdelCRG.Des

d’estudiantsdemàsters idoctoratsfinsabecaris igrupsd’investigació júnior,elCRGofereixun

entorn estimulant i enriquidor, un programa de formació integral i cursos a mida sobre habilitats

científiquesitransferibles.

PRogRaMES aCadèMICS

elPrograma InternacionaldeDoctoratdelCRGésunemblemadel compromísdelCRGamb la

formació, i escaracteritzaperunacombinacióde tutoria i formaciócientíficadedicadaadonar

suportalaindependènciailacreativitat.Durantelsmésde10anysdelasevahistòria,elprograma

segueixsentmoltatractiuicompetitiu,unaprovad’aquestèxitésquerebcadaany400 sol·licituds

demésde50 països diferents i que admet 20-30 estudiants cada curs.

L’any2017,elPrograma InternacionaldeDoctoratvaseguiratreient joves talentsde totelmón

finançatsperfonscompetitiusinternsiexterns.AmésdelaConvocatòria del Doctorat del CRG

i, juntamentambl’IRBBarcelona,elVHIRil’IDIBAPS,duematermeunprogramadeformacióen

investigació per a metges durant quatre anys, anomenat programa PhD4MD.L’objectiuallargter-

minidelprogramaésformar laproperageneraciódemetgescientíficsque impulsarà larecerca

igeneraràunmajorimpacteenelspacients.Untotalde4doctorsenmedicinas’hanunitalCRG

entre el 2014-2017.

elprogramapostdoctoraldelCRGpermetalsjovesinvestigadorstreballarenprojectesmoltcol·la-

boratiusiinterdisciplinarisendiferentsgrupsiunitatsdelCRG.Desprésd’aconseguirduesrondes

definançament,unael2009(INTERPOD)il’altrael2014(ImPuLSe ), el programa de postdocs, ha

estatguardonatambuntercerajutdelaCeatravésdeMarieSkłodowska-CurieH2020CofUnD

actions per al període 2017-2022 (INTREPiD).eltercerprogramaCofUnDpermetcol·laboracions

ambaltresinstitucionsacadèmiquesidelaindústria,demaneraqueelsinvestigadorspostdocto-

rals poden establir i mantenir connexions que resultin útils en la construcció de les seves carreres

professionalsmésenllàdelCRG.Diversos institutsde recerca, com l’InstitutCurie i l’Institutde

RecercadelaValld’Hebron(VHIR),iempresescomnovartisiesteveesvanuniralProgramaIN-

TREPiD com a socis externs.

el programa INTREPiDinclouuncurrículumdeformaciódirigitapotenciarhabilitatsnocientífiques

delsinvestigadors(perexemple, l’èticadela investigació, ladivulgacióielgènereenlaciència) i

ofereixunrecolzamentexclusiuperaldesenvolupamentprofessional.Laprimeraconvocatòriaes

va obrir el setembre del 2017 i es van seleccionar 6 nous membres.

per últim, la 5a edició del Programa Internacional de Pràctiques d’Estiu del CRG per a estudiants

universitaris es va posar en marxa el febrer de 2017: es van concedir 5 programes de pràctiques per

aproporcionaralsestudiantsuniversitarisl’oportunitatdeferrecercaalCRGdurantl’estiu(països

d’origen:Rússia,Dinamarca,Ucraïna,ItàliailaRepúblicatxeca).

elCRGtambétédiversesacordsactiusambprogramesdemàsterperaacollirestudiantspera

pràctiquesderecerca:UPf,UB,UPC,facultatdeCiènciesde laSaint-JosephUniversity (Beirut),

MIt(USA),etc.Aquestany,hemacceptatiniciarunanovaaliançaamblaUniversitatdeRichmond

(eUa) per a acollir els seus estudiants universitaris en pràctiques intensives de recerca durant

l’estiudel’anyvinent.Continuaremexplorantaltresaliancesperaatreureelsmillorsinvestigadors

júnior.

elCRGtambévacontribuiraldesenvolupamentdelnouMàster en Investigació Multidisciplinar en

Ciències Experimentals del BIST,iniciatelmesd’octubrede2017.Vanser2elsestudiantsquevan

obtenirunabecaperaferelMàsteralCRG.Actualment,téllocunanovaediciód’aquestmàster.


PRogRaMa dE foRMaCIó

L’any2017,esvamillorarelPrograma de formació avançada del CRG amb diversos cursos inter-

nacionalsd’altnivellenelmarcdelsCourses@CRG,aixícomunaofertamésricadecursositallers

científics interns.Comenanysanteriors, els cursosorganitzatspelCRGvanestar obertsa les

comunitatscientífiques locals i internacionals iesvanimpartirformaciód’altaqualitatsobreels

últimsavençoscientíficsilestecnologiesmésrecents.

L’any2017, laUnitatdeformaciódelCRGvaorganitzari impartirsetCourses@CRG de qualitat,

uncurseMBoiuncursconjuntambelfIMM,alsqualsvanassistir170participantsd’institutsde

recercade34païsosdiferents,comArgentina,Austràlia,Israel,lesillesMaurici,Singapur,Sud-àfri-

ca i eUa.

- Conformació cromosòmica (f. le Dily)

- Proteòmicaavançada(e.Sabidó)

- enginyeriadeteixits:Decèl·lulesmareaorganoides(L.Batlle)

- Modelitzaciódecèl·lulescompletes(L.Serrano,M.Lluch)

- nextflow: Genòmica in-silicoreproduïble(P.Ditommaso,C.notredame)

- C. elegans:CRISPR,RnAiigenètica(B.Lehner)

- CRISPR/Cas9:einad’ediciógenètica(C.Carolis,L.DiCroce)

- eMBo-Proteòmicadirigida:Dissenyexperimentalianàlisidedades(e.Sabidó)

- epigenèticaen investigacióclínica i translacional (L.DiCroceencol·laboracióambelfIMM i

celebrataHèlsinki)

els Courses@CRG van atraure el patrocini/col·laboració d’Amazon, Bio-Cat, Biogen, IDt, Izasa

Scientific,Leica,nemaMetrix,nikon,SigmaAldrich,Sonidel,StemCelltechnologiesitermofisher.

Undelspuntsclauperal2017vasereldesenvolupamentd’unaàmpliacarteradecursos interns

centrats en habilitats científiques i tecnològiques, així com habilitats transferibles, integritat de

la recerca i coaching professional. la formació interna ha obert noves oportunitats tant per als for-

madorscomperalsestudiants.elstècnics,elsestudiantsdeDoctoratielsinvestigadorsPostdoc-

toralsvanadquirirexperiènciaenl’ensenyamentil’intercanvideconeixements,iexperiènciaambla

restadelacomunitatdelCRG,mentreelsparticipantsesbeneficiavendel’àmpliaofertad’activitats

deformacióqueesvaoferirduranttotl’any(vegeumésavall).els23tallersvanarribaratotsels

nivellsdeprofessionalitatcientífics,desdelsestudiantsuniversitarisfinsalscapsdegrup,ihivan

assistirgairebé450participantsprocedentsdetotselsprogramesiàmbitsdelCRGiCnAG-CRG.

11tallerscientíficsitècnics:AlstallersdeLinux,Clúster,Bioinformàtica,programacióenPythoniR,

iprogramaridelclústerhivanassistirgairebé150participantsdelCRGiCnAG-CRG.

el 2017 es va implementar una formació de llibretes de laboratori electròniques (eln) per a tots els

estudiantsdedoctoratdeprimercursdel’institut,aixícomuncursd’iniciaciósobreCiènciaoberta

i integritat de la recerca.

Desdelmaigdel2017,ésobligatoriquetotselsnouscientíficsquearribenalCRGrealitzinuncurs

en línia sobre integritat de la recerca. aquest curs consta de mòduls interactius, qüestionaris, víde-

osbreusitutorialssobreèticaiintegritatdelarecerca.

Gairebé300 estudiants del CRG i CNAG-CRG, post-doctorats, tècnics i caps de grup van assistir a

12cursosd’enfortimentdeleshabilitatsencomunicaciócientífica,gestió,lideratgeiemprenedoria.

Aprendre fent ésuna iniciativaquepermetals investigadorsdelCRG ferpràctiquesadiferents

departamentsdegestiódelCRGperaobtenirexperiènciaen lagestiódeprojectescientífics, la

comunicaciócientífica i l’organitzaciód’esdeveniments i formacióperacientífics,professorsde

secundària i públic en general. vam seleccionar 10 investigadors per als següents departaments:

isa, Comunicació i ajuts a la Recerca.


Comunicació, divulgació i educació científiquesLamissiódeComunicaciódelCRGéspromoureiprotegirlareputaciód’excel·lènciadelCRG.Hoacon-

seguimmitjançanteldesenvolupamentiimplementaciód’estratègiesclares,coherentsiinteressants,

dissenyadesperapotenciar lacomprensiópúblicade lanostraciència ielnostre institut,elsseus

investigadors i el valor que tenen per a la societat.

Lasegonaediciódelprojectedeciènciaciutadana“Treu la llengua”vacomençarafinalsdel2016.

Aquestprojecte,inclòsdinsl’àmbitdelaciènciaoberta,éselprimerestudisobreelmicrobiomabucal,

quetécomaobjectiuestudiarlapetjadagenèticadediferentscomunitatsmicrobianesiexploraruna

possible relacióamb lescaracterístiquesambientalso l’estildevida.finançatprincipalmentper la

fundacióBancària“laCaixa”ielCRG,lasegonaediciódelprojectetambéteniacomaobjectiuincor-

porarnovesvariablescientífiquesipuntsfocals,aixícomabordarnousreptes,arribaranouspúblics,i

involucrar i recollir mostres de diverses poblacions i pacients que pateixen diferents malalties. aquests

objectiusesvanduratermeorganitzantunanovarutaperespanyaioferintnovesactivitatsbasades

enformatsinnovadorsiparticipatiusqueenspermetessincomprometre’nsambaquestsnousgrup

diana, comunicar la nostra recerca i els seus objectius, i compartir una resposta sobre el projecte amb

elsciutadansquehiparticipenielpúblicgeneral.Gràciesaaquestaestratègiamillorada,vamarribar

a 3.700 persones, 34 centres escolars, 13 associacions de pacients i 21 centres culturals.

Duranttotl’any,elCRGvaseguiroferintactivitatsdedivulgacióperalpúblicgeneraliactivitatsd’educa-

ciócientífica.enqualsevolcas,algunesdelesiniciativesmereixenunamencióespecial.enelmarcd’una

col·laboracióambl’empresaminiPCRielprojecte“treulallengua”,vamserconvidatsaparticiparalFes-

tival de Ciències de CambridgedeBostonal’abril.Vaserunaexperiènciamoltenriquidoraireeixida,iens

va donar molts inputspositius.tambévaminiciarambèxitunnoutallerdirigitalspares,ambeltítolde

“Els/Les vostres fills/es poden convertir-se en científics/ques”,ambl’objectiud’oferirpistesiconsells

alsparesambfills/esquehandedecidirquinaseràlasevatrajectòriaprofessional.tambévampartici-

parenunnouprojectepilotd’educaciójuntamentambmSchools, titulat “La complexitat de la vida”, que

consisteix en un conjunt de materials i recursos dissenyats per a introduir els estudiants en el camp de

lesciènciesdelavidamitjançanttecnologiesmòbils.mSchoolsésunprogramamultimèdiamultifacè-

ticdemeducaciódeMobileWorldCapitalBarcelona,encol·laboracióamblaGeneralitatdeCatalunya,

l’AjuntamentdeBarcelonailaGSMA,quepermetalsestudiantsiprofessorsintegrartecnologiesmòbils

al’aula,obrintnovesformesd’ensenyamentid’aprenentatgequemillorinl’assolimentilessortideslabo-

rals.elCRGtambévaserundelsinstitutsquevaacollirestudiantsdelaBarcelona International Youth

Challenge (BYSC),organitzatperlafundacióCatalunya-LaPedrera.elBYSCésunprogramad’excel·lèn-

ciainternacionaldeduessetmanesquetéperobjectiuestimulareltalentcientíficentrejovesd’arreudel

mónimotivar-lospertalquesegueixinamblarecercacientíficaiescullinunacarreraenciència.

Quant a les tasques de formació, el departament va acollir cinc investigadors en pràctiques dins el

programa intern d’aprenentatge basat en la pràctica, “Learning by Doing”, que va desenvolupar petits

projectesrelacionatsambladivulgacióil’educaciócientífiquesilesrelacionsambelsmitjansdecomu-

nicació.Durantl’any,tambéhemcontribuïtaduesnovesiniciativesinstitucionalsimportants:ORION i

SOMMa. ORIONésunprojecteH2020coordinatpelCRGqueesvainiciarel2017.eltemaprincipaldel

projecteéslaciènciaoberta,iexploralesformesenquèlesorganitzacionsderecercaifinançamentde


lesciènciesdelavidailabiomedicinapodenfermésobertalaformadefinançar,organitzariferrecerca.

L’equipdeComunicacionsiRelacionsPúbliquescontribueixaduratermediversestasquesd’oRIon,

enparticulareldiàlegpúblicielsexperimentscientíficsamblaciutadania.enrelacióambSOMMa,és

l’aliançadelsCentresSeveroochoaiMaríadeMaeztuperapromourel’excel·lènciaespanyolaenrecerca

ipotenciarelseuimpactesocialenl’àmbitnacionaliinternacional.LaparticipaciódeComunicacionsi

RelacionsPúbliquesaSoMMasecentraenlapromoció,visibilitatidivulgaciód’aquestaaliança.

Duranttotl’any,elscientíficsdelCRGtambéesvaninvolucrarprofundamentenlesactivitatsambdels

mitjansdecomunicació,enrelacióambelsnousavençospublicatsenrevistesd’altnivell,aixícomen

activitats institucionals i de divulgació que van permetre publicar nous articles en mitjans escrits i en

línia,itambévanparticiparenprogramesderàdioodetelevisió.elvaloreconòmicd’aquestesaparici-

onsalsmitjansvaserdemésde13milionsd’euros.

el2017tambévaserunanymoltdenspelquefaal’organitzaciódeseminaris,sessionsisimposis

científicsinternacionals,incloent-hielssegüents:“Barcelona NGS’17: Structural Variation & Populati-

on Genomics”,coorganitzadaperlaInternationalSocietyforComputationalBiology(ISCB);Enhancing

the Usage of Human Genomics data for the benefit of all. Genotype Tissue Expression, GTEx Project

Meeting; Young Scientist Networking 2017,organitzatjuntamentambeMBoiÍndiaBioScience;el“V

Core Management Workshop: Training the Trainers”; el “16th CRG Symposium: Seventh Internatio-

nal Workshop on Genomic Epidemiology”; el “15th RECOMB Comparative Genomics Satellite Works-

hop” i el “CRG Annual Proteomics Symposium 2017: Unveiling the complexity of the cell proteome”.

finançamentexternSegonselsresultatsdel’anyanterior,elsgrupsderecercadel’institutvangarantirelnivelladequatde

finançamentnecessariperareforçarlasevaposiciónacionaliinternacional.

Unavegadamés,el2017,elfinançamentaconseguitanivellnacionalvaaugmentarconsiderablement

(>10milionsd’euros).elMinisterid’economia,IndustriaiCompetitivitatespanyolvaguardonarellide-

ratgecientíficdel’institutamblanovadistinciódequatreanysde“Centred’excel·lènciaSeveroochoa”.

Amés,quatregrupsvanentraraformarpartdeduesplataformestecnològiquesnacionalsmoltimpor-

tantsrelacionadesamblabioinformàtica(Guigó,Gabaldón,Gut)ilaproteòmica(Sabidó),recolzadesper

l’InstitutdeSalutCarlosIII-ISCIII.

enelmarcdelnouPlaregionalestratègicderecerca i innovacióensalut (PeRIS2016-2020),esvan

iniciardosprojectesdecol·laboracióqueinvolucravenelsgrupsdelCnAG-CRGsobrelamedicinaperso-

nalitzada,basatsenl’anàlisigenòmicaperalapresadedecisionsclíniquesenl’àmbitdel’oncologia(Gut)

idelesmalaltiesneurològiquesraresnodiagnosticades(Beltrán).

Lamedicinapersonalitzadatambéésl’objectiudelsnousajutsdecol·laboracióconcedidesperl’H2020,

centratsen la integraciódedadesmassivesheterogènies (IASIS/tartaglia, eGA) i enmalalties rares

(SoLVe-RD/Beltrán),aixícomenunprogramapilotsobrelamilloradelareproductibilitat,lareutilitzaciói

lainteroperativitatdedades(núvoleuropeudelaCiènciaoberta-eoSCpelprojectepilotsobrerecerca).

Aescalaeuropea,entreelsmésdestacatss’inclouenunajutStartingGrantdel’eRC(Boke)iunProofof

Concepttambédel’eRC(Valcárcel);l’objectiudeladarreraconsisteixenprovarelpotencialterapèutic

delsnousreactiusperaltractamentdelcàncerdepulmó.Amés,cincinvestigadorspostdoctoralsvan

obtenirunabecaMarieS.Curie(fernández,Audergon,Stik,Rogalska,Schmiedel),quevarepresentarun

índexd’èxitdemésdel50%peral’institut.

el 2017, diversos grups de recerca van poder ampliar les seves fonts de suport extern a nivell interna-

cionaliaconseguirenfinançamentprivat.entred’altres,comptemambduesnovesdistincionsenl’àmbit

delarecercadelsInstitutsnacionalsdeSalut-nIH(Guigó)idelDepartamentdeDefensa-DoD(Serrano/

Gill)respectivament;unajutalarecercaconceditperfUnDeLA,adreçatalaidentificaciódenoustracta-

mentsperal’esclerosilateralamiotròfica-eLA(DiCroce).


InnovacióitransferènciadetecnologiaL’oficinadetecnologiaiDesenvolupamentdenegoci(tBDo)delCRGtélamissiódepropiciarl’ex-

plotaciódelarecercadelainstitucióperalbépúbliciajudaralcreixementeconòmicdelsectordeles

ciènciesdelavidaalanostraregió.elnostreobjectiuésqueelsresultatscientíficsgeneratsalCRG

esconverteixinennousproductesterapèutics,diagnòsticsid’altramenaquecontribueixinalbenestar

de la nostra societat.

Independentmentdelafasededesenvolupament,itantsiduematermeciènciabàsicacomciència

aplicadaalCRG,desdelatBDocreiemfermamentqueelsproductesiserveismésbeneficiosossón

el resultatd’avençoscientíficstrencadors.esperemqueaquestsresultatsgenerinun impactemolt

mésgrana lanostrasocietatsi rebenelsuportadequat iescanalitzena travésde l’estratègiade

comercialitzacióadient.

Pertant,durantel2017, latBDohareforçat lasevaactivitatmitjançanttrobadesperiòdiquesamb

investigadors,ambmésde450reunions,amésd’assessorarelsinnovadorsdelCRGenelprocésde

transferènciadetecnologiaambdiversoscursosdeformaciócomarala4aediciódelaBio-Business

School, la 2a edició del curs “From Science to Business”,organitzatperl’institutBIStencol·laboració

ambeSADeBusinessSchool,iatravésdediferentstaulesrodonesiseminarisamblaindústria.

Ambel compromís de promoure l’esperit emprenedor, l’equip de la tBDo vadonar suport actiu al

guardonat de la 2a edició de la iniciativa S2B Concept Challenge. Com a resultat del treball en equip,

MicroomicsS.L.esvaconstituirambèxitelsetembrede2017iactualmentdesenvolupaiproporciona

solucionsdemetagenòmicad’altaqualitatenempresesiinstitutsderecerca.

així mateix, el 2017 la tBDO va gestionar 7 projectes sota el seu programa Commercialization Gap

Fund.Caldestacarqueenund’aquestsprojectes,eldeJordiHernández,investigadorallaboratoride

JuanValcárcelijoveemprenedorqueparticipaenelprogramadelCRGEntrepreneur-in-Residence,

lideraelseuprojecteinnovadortambégràciesalsuportdelprogramaCaixaImpulse.

tambécalesmentarelnombrederegistresd’inventsrebutsiavaluats(30),lesnovespatentspriorità-

ries presentades (2, que eleven a 9 el nombre de famílies de patents actives durant el 2017) i el nombre

d’acordsnegociatambèxitamblesempreses,quevanaugmentarenun89%respecteal’anyanterior.

Pelquefaal’impacteeconòmicdelCRG,latBDovanegociarivaobteniruns279.000euros(un39%

mésrespecteal’anyanterior).

Durant l’any 2017, l’equip de la tBDova consolidar el seu compromís endiversos esdeveniments

nacionals i internacionals relacionats amb la biotecnologia i la farmàcia, com ara la Bio International

Convention, Bio Europe, la 2nd Annual Translational Microbiome Conference, etc., i va participar en

153 trobades amb empreses i inversors per a debatre sobre la cartera de tecnologies del CRG i les

possiblescol·laboracionsfutures.

Amés,PabloCironivaserconvidataimpartirconferènciesal’IeSeBusinessSchooliaparticiparen

diferentstaulesrodonespertaldedebatresobrelesestratègiesperacomercialitzarlesinnovacions

en una fase inicial.

en general, el 2017 ha estat un any molt positiu, i preveiem un esperit emprenedor positiu en els pro-

pers anys al CRG.


Dimensió nacional i internacionalESPanya

SOMMa

LanovaaliançadelscentresSeveroochoa i lesunitatsMariadeMaeztu (SoMMa;www.somma.es)

esvapresentaroficialmentl’octubrede2017.SoMMareuneix25centresi16unitatsacreditatsamb

aquestspremisal’excel·lènciaipretén:incrementarlavisibilitatdelaciènciaaespanya;promourel’in-

tercanvideconeixements,tecnologiaibonespràctiquesentreelsseusmembres,lacomunitatcientífica

internacionalielsprincipalsgrupsd’interès;col·laborarambaltrescentresd’investigacióaespanyaper

aenfortirelsistemad’R+D+i;itenirveuenlapolíticacientíficaespanyolaieuropea.Lainiciativahaestat

lideradapeldirectordelCRG,quiesvaconvertirenelprimerpresidentdeSoMMa;ilavaposarenmarxa

l’equipd’ISA.Lesactivitatsd’inicidel’aliançacomprenienl’establimentdelasevapròpiagovernança,la

presentaciódelllocwebil’organitzaciódegrupsdetreballperaassolirelsdiversosobjectius.

EURoPa

Liderant xarxes de formació i de recerca col·laborativa

elCRGlideradiversesxarxesdeformacióirecercacol·laborativafinançadespelsProgramesMarcdela

Comissióeuropeagràciesalseuexcel·lentesforçderecercaialsuportentregatdel’equipd’AfersCien-

tíficsiInternacionals.Aquestlideratgecontinuatcomportaunaaltavisibilitat,unasòlidareputacióiun

rendimentcientíficiinnovadordestacable.

elsprojectesfP7/H2020coordinatsiniciatsoenmarxaen2017inclouen:

- MycoSynVac: Coordinat per luis serrano.

- OPATHY: Coordinat per toni Gabaldón. És una xarxa de formació en la qual participen 13 investiga-

dorsjovesqueseranacollitsen11institucionsde7païsoseuropeus.

- LIBRA:CoordinatperIsabelleVernos.Éselprojecteclauperaimplementaraccionsd’igualtatdegène-

re en els instituts de recerca eU-life.

- MiniCell: Coordinat per luis serrano.

- CellViewer: Coordinat per pia Cosma.

- DivIDE:CoordinatperIsabelleVernos.estractad’unaaltraxarxadeformacióenlaqualparticipen11

investigadorsjovesqueseranacollitsen9institucionsde7païsoseuropeus.

- ORION:CoordinatperMichelaBertero.estractad’unanovainiciativaperapromourecanvisenles

institucionsquefinanceniportenatermelainvestigacióperfer-lesmésreceptivesalesnecessitats

socialsiperquèadoptinelsprincipisdelaCiènciaoberta.

Podeutrobarmésinformaciósobreelsprojectescol·laboratiusencapçalatspelCRGenactiuahttp://

www.crg.eu/content/research/projects/ec-coordinated.

Amés,elCRGcontinuatenintunapresènciaimportantendiversesxarxesrellevantsd’infraestructures

paneuropees, com ara elixiR (com a part del nucli espanyol de la infraestructura), euroBiolmaging (diri-

gint un mòdul de treball en la segona fase preparatòria i com a membre del consell interí) i els projectes

CoRBeL,eXCeLeRAteiMuGH2020.

Integració europea

EU-LIFE, European Life Sciences Institutes for Excellence,ésunainiciativaclaupresididapelCRGper

apromourel’excel·lènciaenlarecerca,consolidarlaintegracióentreelsinstitutseuropeusd’investiga-

cióenciènciesdelavidaidesenvoluparicompartirbonespràctiquesenrecerca,gestiódelarecerca

http://www.somma.es

http://www.crg.eu/content/research/projects/ec-coordinated

http://www.crg.eu/content/research/projects/ec-coordinated


iformació.DiversosmembresdelCRGparticipenactivamentengrupsdetreballd’eU-LIfe, iaquesta

participacióhadonatelssegüentsfruitsrellevants(entred’altres):

• eU-LIfeactivaenles2plataformesdegrupsd’interèsdelaCequeexisteixen(eRAiopenScience)

• 3InformesdeposicionamenteU-LIfe(declaraciófP9,informesH2020ifP9)

• CampanyaeU-LIfeambmotiudel10èaniversaridel’eRC

• Contribució/feedbackpera8informesdelaCe

• 3consultesCe(Avaluació intermèdiaH2020;Previsió |estudiDelphiperafP9(per invitació);fet

flaGsHip)

• oRIon:PresentaciódelprojectedeciènciaobertaH2020

• ImplementaciódelLIBRACareerDevelopmentCompassd’orientacióprofessionalperapostdocs(2

tallers)

• ManualitallerdecontractacióLIBRA,tallerdeconciliaciódelavidalaboralIpersonal

• Iniciativatedextechtransfer(6xerradesaprofessionalsdeVCi4formacions)

• 3 esdeveniments per crear capacitat institucional (tallers de “formar el formador” per sol·licituds

MSCA;fervídeosanivellinternperaladivulgaciócientífica;tallerdecomunicaciódecrisi)

• PresentaciódelprogramadevisiteseU-LIfe

• tallercientíficeU-LIfe“Principisdel’homeòstasi”

• PòsterdecursoseU-LIfeiunsimposieU-LIfe(fIMM+CRG)

• Llocwebibutlletí:einesmilloradesperainvestigadors(feines,finançament,notíciescientífiques)

elsServeisCientificotècnicssónmembresdelaCore Facilities Excellence Alliance “Core For Life” (www.

coreforlife.eu),queincloutambél’eMBL(Heidelberg,Alemanya),elVIB(Gent/Leuven,Bèlgica),l’MPI-CBG

(Dresden,Alemanya),elVBCf(Viena,Àustria),ielfGCZ(Zuric,Suïssa). “Core For Life”preténcompartiri

consolidarprocedimentsiuniresforçosenlaformaciódepersonalilavalidaciótecnològica,icompartir

l’accésainstal·lacionsentreinstituts.

aRREU dEl Món

Atravésdelseuequipd’AfersCientíficsiInternacionals,elCRGexploranovesoportunitatsglobalspera

atreureelsinvestigadorsambméstalent,establircol·laboracionscientífiquesidonarmésvisibilitatala

sevarecerca.Lesaccionsinternacionalsmésrellevantsdutesatermeel2017esdetallenacontinuació:

- Coordinació del projecte de mobilitat CRG-Novartis-Àfrica: vam acollir tres nous estudiants de

Sud-àfricapertalquedesenvolupessinelsseusprojectesa les instal·lacions i laboratorisdelCRG.

Actualmentcol·laboremambnovartispergarantirlacontinuïtatdelprogramademobilitat.

- Col·laboració amb la Fundació “Mujeres por África”:Vamacollirlaprimeracientíficasèniorambelsu-

portdelprograma“ellasinvestigan”.LizKizito,directoradelDepartamentd’AgriculturaalaUniversitat

Cristianad’Uganda,vaseracollidaalaUnitatdeBioinformàticaperaestudiarlavariabilitatgenètica

de Solanum aethiopicumal’Àfrica.ConjuntamentamblafundacióMujeresporÁfrica,tambévamorga-

nitzareltaller“ReptesioportunitatsperalaRecercaal’Àfrica”,quevafomentarundebatinteressant

entreelsponentsiungrannombred’assistents.

DonesenlaCiènciaAlComitèded’Igualtat deGènere (enanglèsGender Balance Committee, GBC), presidit per isabelle

Vernos,hisónrepresentadestoteslescomunitatscientífiques,aixícomeldepartamentdeRecursos

Humans (vegeu la composició completa del comitè a http://www.crg.eu/en/content/about-us-wo-

men-science/gender-balance-committee).elsobjectiusdelcomitèsóneliminarelbiaixdegèneredels

processosde selecciódepersonal, atraure i captardonescientífiques,millorar la conciliacióde la

vida laboral i familiar, fomentar el desenvolupament de la carrera professional, i establir i difondre

pràctiques laboralssensiblesa lesqüestionsdegènere.Aquestsobjectiusescorresponenambel

http://www.coreforlife.eu


http://www.crg.eu/en/content/about-us-women-science/gender-balance-committee

http://www.crg.eu/en/content/about-us-women-science/gender-balance-committee


projecte LIBRA(LeadingInnovativeMeasurestoReachGenderBalanceinResearch),finançatperla

Ue i coordinat pel CRG.

L’any2017,lesaccionsimplementadespelCRGincloïenelPlad’IgualtatdeGènere(GeP),presentat

l’agostdel2016enelmarcdelprojecteLIBRA.LesaccionsdelGePsecentrenenquatreaspectesprin-

cipals:elprocésdeselecciódepersonal,eldesenvolupamentdelacarreraprofessional,laconciliació

delavidalaboralifamiliar,ilesdimensionsdesexe/gènereenlarecerca.

L’anypassat,elsprincipalsobjectiusdelComitèd’IgualtatdeGènerevansereldesenvolupamentdela

carreraprofessionalielprocésdeselecciódepersonal.Acontinuacióse’npresentenalgunsaspectes

destacables:

dESEnvolUPaMEnT dE la CaRRERa PRofESSIonal

• esvanseleccionarduesinvestigadorespostdoctoralsdelCRGperaparticiparalprogramad’ori-

entació professional LIBRA “Career Development Compass”,l’objectiudelqualésdonarsuporta

lesinvestigadoresenelseucamíperesdevenirinvestigadoresindependentsifercarreraenl’àmbit

acadèmic (http://www.eu-libra.eu/news/20-eu-life-post-docs-their-way-become-pi-first-milestone-

knowing-how-they-want-their-career-be). el programa va ser molt ben rebut i actualment liBRa

estudialapossibilitatdemantenir-loenfuturesedicionsipermetrelaparticipaciódemésinvestiga-

dores postdoctorals.

• Després de l’èxit del programade bequesper a dones científiques (WOSS, Women Scientists

Support Grant),implementatpelComitèd’IgualtatdeGènereal2016,esvantornaraobrirdues

convocatòries l’any 2017. el sistema d’ajutsWoSS vol donar suport a dones científiques que

tenenambicióipotencialperaocuparunaposiciódelideratgeenl’àmbitdelarecerca,peròque

s’enfrontenalsreptesassociatsalamaternitat.L’any2017,quatredonescientífiquesvanobtenir

suportdeWoSS.

• Com l’anyanterior,elCRGvacelebrarelDia Internacional de la Dona el8demarç.Alpersonal

delPRBBse’lsvandistribuirfulletsonesdestacavenlestrajectòriesprofessionalsdequatrenoies

exalumnesdelCRG.el8demarçtambéesvaorganitzarunactedemitjajornadaonesvadura

termelaprojecciód’unapel·lícula,seguidad’undebat,quevacomptarambl’assistènciad’ungran

nombre de persones.

• Percelebrareldia d’Ada Lovelace,alsestudiantsadolescentsdel’àreadeBarcelonase’lsvaoferir

unmòduldidàcticd’undiasobreconeixementsdeprogramacióqueesvaduratermealCRG(esva

tractard’unainiciativaconjuntadeldepartamentdeComunicacióiRPiinvestigadoresdel’institut).

PRoCéS dE SElECCIó dE PERSonal

es van implementar diverses accions i mesures per garantir que en els processos de selecció de per-

sonalnoesproduïssinbiaixosperqüestionsdegènere.Aquestessón:

•Unnoumodeld’ofertadetreballqueincloguiinformaciósobrelaigualtatdegènereilaconciliacióde

la vida laboral i familiar al CRG, i que reflecteixi un entorn de treball divers.

•Actualmentesprojectaunvídeosobreelbiaixdegènere,perencàrrecdelainstitucióCeRCA,atots

elsmembresdelcomitèdeselecciódecapsdegruppertald’augmentarlasensibilitzaciópelquefa

alsprocedimentsincorrectes(https://www.youtube.com/watch?v=g978t58geLo).

•tambés’hadissenyatunfulletóons’enumerenelsavantatgesqueofereixelCRGalsseusempleats

pelquefaaunaconciliaciópositivadelavidalaboralifamiliar.Aquestsavantatgessónl’accésaser-

veisd’escolabressol,abeneficissocials,aoportunitatsdecarreradual,ateletreball,etc.elfulletés

compartitdigitalmentambcadascunadelescandidatesques’entrevistenambelCRG.

http://www.eu-libra.eu/news/20-eu-life-post-docs-their-way-become-pi-first-milestone-knowing-how-they-want-their-career-be

http://www.eu-libra.eu/news/20-eu-life-post-docs-their-way-become-pi-first-milestone-knowing-how-they-want-their-career-be

https://www.youtube.com/watch%3Fv%3Dg978T58gELo


DestacatsCientífics


llar estimadaescollirelllocperfecteperviureésimportant, especialment si ets un retrovirus.

a diferènciadelsviruscomeldelrefredatcomú,queinfectenlescèl·lulesi,enfer-ho,lesdestruei-

xencompletament,elVIHialtresretrovirusconverteixenlasevainformaciógenèticaenADni

lainsereixenalgenomadelseuhoste,unacèl·lulaimmunehumanaconegudacoma‘cèl·lulat’.

Algunescèl·lulesinfectadesutilitzenaquestADnviralperafermoltescòpiesdelvirus,quedesprésinfec-

tennoushostes.Peròd’altresentrenenunestatderepòs:l’ADnviralencaras’amagadinsdelgenoma

delacèl·lula,perònoprodueixvirusnous.Éselqueesconeixcomunainfecciólatent.Aquestsvirus

ocultslatentsesreactivaranmésendavanticomençaranunainfeccióactivaquepotesdevenirunaSIDA

plenament desenvolupada.

finsa10decadamiliódecèl·lulesimmunesd’unpacientambVIHpodenalbergarunainfecciólatent.

elstractamentsactualsdelVIHnomésfuncionenambvirusactius,demaneraqueelsinvestigadorshan

dissenyatmedicamentsquepoden‘desallotjar’elsvirusamagatsal’ADnifer-losvulnerablesalateràpia.

en teoria, el viH pot establir-se a qualsevol ubicació del genoma, i hauria de ser igual de fàcil eliminar-lo

dequalsevol lloc.Peròcapd’aqueststractamentspotmouretotselsvirus latents,demaneraque la

infeccióperVIHencaraésimpossibledecurardeltot.

Ara,GuillaumefilionielseuequipalCRGhandesenvolupatunamaneradelocalitzarlaubicacióexacta

delVIHlatentalgenoma,iharevelatpistesimportantssobreperquèaalgunselscostamésreactivar-se

quead’altres.

“Sabemdesdelsanys30quealgunsgenssónmésactiusqued’altres,depenentdelasevaubicacióal

genoma”,explicafilion.“Pertant,tésentitqueaixòmateixpassiambelVIH-quelisiguimésfàcilinte-

grar-seoreactivar-sedesdecertesubicacionsquedesd’altres”.

Quanestractadedecidironviure, laubicacióhoéstot.Siustraslladeuaunaciutatviva i trepidant,

probablementtrieuunazonaambcafès,barsibotigues,enllocd’unazonamortaontotestàsempre

tancat. segons han observat filion i el seu equip, el viH tindria la mateixa intenció quan es trasllada a

cèl·luleshumanes.


TREnCanT El CodI dE baRRES

Undelsproblemesprincipalsdel’estudidelainfecciólatentpelVIHésqueunasolacèl·lulapottenir

diversosvirusincrustatsenmoltsllocsdelgenoma.Aixòfaquesiguidifícilidentificarlaubicaciódecada

virusconcretiesbrinarquinsesreactiveniquinsromanenocultsdesprésdeltractament.

eltrucdelnoumètodedefilionrauenun‘codidebarres’genètic:unaseqüènciaúnicad’ADnqueels

investigadorsincorporenenelcodigenèticdelespartículesdevirusindividuals.Uncopelsviruss’han

inseritenelgenomadelacèl·lulahoste(enaquestcas,cèl·lulesimmuneshumanescultivadesallabora-

tori),elsinvestigadorsextreuenl’ADncel·lularielseqüencienperlocalitzarons’ubiquenelsviruslatents.

Icomquecadavirustéelseupropicodidebarresúnic,ésfàcilveureons’haincrustatcadascun.elcodi

debarrestambéespotutilitzarperveuresiunvirusconcrets’haactivatis’està‘llegint’,demanerasimilar

alsgensnormalsdelacèl·lulahoste.

“Hempogututilitzarlanostratècnica,queanomenemB-HIVe,perferunmapadelsllocsonliagrada

anaralVIH”,diufilion.“témoltsprejudicisiprefereixleszonesactivesdelgenoma:volanarallàonhi

hal’acció”.

Ifinsitot,entreleszonesactivesdelgenoma,elsinvestigadorshanobservatquealgunesàreesconcre-

tesdelgenomaelssónmoltmésatractivesquealtres.Perexemple,algunes‘adreces’són100vegades

méspropensesaserunvirusqued’altres,totiquelaraóperquèsóntanpopularscontinuasentun

misteri.

Comerad’esperar,laubicacióexactadelVIHenelgenomaafectalaprobabilitatqueelvirusestornia

activar.elsvirusques’havienestablertapropdels‘commutadorsdecontrol’encarregatsd’activarels

genserenmoltmésactiusqueelsd’altresllocs.totiaixí,talcomassenyalafilion,encarahihamolta

variabilitat inexplicada.

“Vampensarqueelllocd’insercióenelgenomaseriaelprincipaldeterminantdel’activitatdelVIH,però

hemvistqueelvirusentraalmateixllocendiferentscèl·lulesidesprésescomportademaneradiferent.

així que hi ha alguna altra cosa que encara no entenem.”

avançanT

AmésdedetectarpatronsenelsllocsonalVIHliagradaviuredinsdelgenoma,filionielsseuscol·le-

guestambévanobservardiferènciesclauenlamaneracomelsvirusd’ubicacionsconcretesresponien

adosmedicamentsdereactivació,elvorinostat(VoR)ilafitohemaglutinina(PHA),quetenendiferents

mecanismesd’acció.Curiosament,vantrobarqueelsvirusd’unconjuntd’’adreces’genòmiquestendien

mésaviatareaccionaralVoR,mentrequeelsques’havieninseritenaltresubicacionsesreactivaven

preferentment amb la pHa.

Aixòsuggereixqueuntractamentadreçata tractar les infeccions latentshauriadecombinarneces-

sàriamentuncòcteldediversosmedicamentsambaccionsdiferentsper tald’eliminar totselsvirus

inactius.Amblamilloradelestècniquesgenètiques,éspossiblequeenelfuturespuguidesenvolupar

lamillorcombinaciódefàrmacsdereactivacióbasant-seenelsdiferentstipusd’ubicacionsviralsdins

delescèl·lulesimmunesdelpacient,peragarantirquetotselsviruslatentssiguindesallotjatsdetots

els indrets del genoma.

Perafilionielseuequip,elsegüentpasésveuresipodenaplicarlasevatècnicadelcodidebarresper

etiquetarl’ADndelVIHlatentalescèl·lulesimmunesd’animals-o,finsitot,presesdirectamentdepa-

cientsinfectats-,encomptesdecèl·lulescultivadesallaboratori.Hihal’esperançaquelanovatecnologia

d’ediciódegens,conegudacomaCRISPR,puguifer-hopossible,totiqueencarahihamoltafeinaperfer.

“elfinaldeljocenaquestcasnoésquehihagiunfàrmacquepuguiguarirelVIH,ipotsermainoserà

possiblereactivarieliminartotselsvirusdelcos”,diufilion.“Ielqueésmésimportant,lanostrafeinaens

ajudaacomprendrelacomplexarelacióentreelvirusielgenomahoste.Cadascund’ellsésunaagulla

moltpetitaenunpallermoltgran,peròarapodemsaberexactamentons’amaguen“.

OBRA DE REFERèNCIA:

ChenHC,MartinezJP,Zoritae,

MeyerhansA,filionGJ.

“Position effects influence HIV latency

reversal.”

natStructMolBiol,24(1):47-54.doi:

10.1038/nsmb.3328.epub2016nov21.


nedar en un mar de virusUnanovatècnicadecribratgedeviruspetitsdel’aiguademarpotajudar en la cerca de patògens humans.

D esdelafinestradelseulaboratorialCRG,l’Òscarfornaspotveureelmar.Benlluny,sobreles

onades, els mariners estiren la seva captura sobre les cobertes dels seus vaixells, ja plenes de

peixosmassagransperaescolar-sepelsforatsdelesxarxes.Comméspetitssónelsforats,

méspetitessónlescriaturesquehiquedenatrapades.Peròcomn’hadeser,depetita,unaxarxapera

atraparcosestanpetitescomunvirusmicroscòpic?

per a entendre el món que ens envolta, els biòlegs volen esbrinar com interactuen els animals, les plantes

i els microbis (incloent-hi els bacteris i virus) per a crear un ecosistema. i els oceans són els ecosistemes

mésfascinantsiimportantsdelplaneta,ambmésvalorperalclimadelaterraquelesselves.

“Lamajoriadeladiversitatbiològicadelplanetaviualmar”,diufornas,capdelaUnitatdeCitometria

defluxquecomparteixenelCRG i laUniversitatPompeufabra. “elsorganismesmarinscomarael

plànctonielsbacterisfixenaproximadamentlameitatdeldiòxiddecarbonial’atmosferaigenerengrans

quantitatsd’oxigen.Peròmoltsviruselsinfectenipodriendestruir-lospotencialment.”

Defet,l’oceàéspledevirus(tansolsunmil·lilitred’aiguamarinapotcontenirunsdeumilionsdevirus),

peròescalculaquenomésenconeixemlaidentitatd’unupercentd’ells.

CaçaR El vIRUS

Amesuraquelaseqüenciaciódel’ADns’hatornatmésràpidaimésbarata,elsinvestigadorscapturen

cadacopmésdadesgenètiquesperacomprendremillorladiversitatd’espèciesquehabitenenuneco-

sistema.Però,mentrequeobtenirADnd’unanimaloplantaconcretésrelativamentfàcil,costamoltmés

captarbacterismicroscòpicsindividualsovirusfinsitotméspetits.

Latècnicaméspopularperaanalitzargenomesmicrobianssalvatgesrepelnomde“meta-genòmica”.

Implicaobtenirunamostradel’entorn,comaraunapaladadeterraoungotd’aiguaipurificariseqüen-


ciarunabarrejad’ADndetotselsmicrobisquehiviuen.esfanservirunestècniquescomputacionals

moltenginyosesperasepararelsgenomesd’espècies individuals,peròelsgenomesvíricssónmolt

petitsitendeixenaperdre’sentrelarestadedadesd’organismesmésgrans.

encol·laboracióambcol·leguesdeBarcelona,AlacantielsestatsUnits,fornasvoliatrobarlamanerade

separarvirusindividualsd’aquestabarrejademicrobispertaldepoderseqüenciarcadascunperseparat.

Aquestenfocamenthatingutèxitambcèl·lulesindividualsdeteixitsanimalsotumorsiambbacterisde

moltsentornsdiferents.Peròmainos’haviafetambunacosatanpetitacomunvirus,unesmilvegades

méspetitqueunacèl·lulahumanaestàndard.

REdUInT-ho

Peracribrarelsvirusdel’aiguasalada,fornasvaferservirunatècnicadelaboratorimoltpopularcone-

gudacomaseparaciódecèl·lulesactivadaperfluorescència(SCAf),queesfaservirsovintperasepa-

rarcèl·lules individualsd’unapoblacióbarrejada.esmarcalescèl·lulesambuncolorantfluorescent i

s’introdueixenenunamàquinaoncorrentsd’unlíquiddissenyatambcuralesenviaunaperunaatravés

d’unraiglàserperaanalitzar-les.Llavorsseseparendeformaautomàticaenplaquesmicrotituladores

peral’assaig.

ajustar la màquina de sCaf per a tractar amb una cosa tan petita com un virus va ser tot un repte. tot

iquefornasielseuequipvanaconseguirmarcarelsvirusfentserviruncolorantquetacal’ADnvíric,la

fluorescènciaésmoltlleuperquèelgenomaésmoltpetit.tambéhihamoltesaltrespartículespetites

al’aiguamarina,desdepartículesd’escombrariesabossesmicroscòpiquesextrudidesdecèl·lulesmés

gransquepodenconfondrelamàquinaseparadora.Itotelprocéshadequedarlliuredecontaminants

quepuguindanyarl’ADnifer-loimpossibledeseqüenciar.

trobarelsparàmetrescorrectesvasuposarmoltsmesosdeprovesisoluciódeproblemes.Itambéhi

vahaverelfarragósprocésdetotundiadenetejaquecaliaferabansdecadaexperiment,pergarantir

ladesapariciódetotarestad’ADnpotencialmentcontaminant.Afortunadament,fornasielseuequip

tenienaccésaunafontdevirusoceànicsbenamà,fentservirmostresdelMediterraniquetenientot

sortintdellaboratoriperaoptimitzarlatècnica.

“L’aiguademaréscomunasopa”,diufornas.“treballàvemmoltapropdelslímitsdelanostratecnolo-

gia.Peròvamajustarelslàsers,vamalentirelfluxdelamàquinaivamcontinuarfentprovesfinsquevam

aconseguirsepararvirusindividualsambèxit.”

dEl MaR a la SalIva

Amésdelessevesmostreslocals,fornastambévaaïllarvirusd’aiguamarinaobtingutsdelasuperfí-

cieidefinsa4kmdeprofunditatdelMediterraniidel’Atlàntic.entotal,l’equipvacribrarmésde2.000

partículesdemidadevirus,obtenint-neaproximadament392seqüènciesdegenomavíric.44d’ellesvan

serenviadesperaunaseqüenciaciómésdetallada,itotesvanresultarservirusquefinsllavorseren

totalmentdesconegutsperalaciència.

Amés,elsvirusqueapareixenmésvegadesenelprocésd’obtencióésmésprobablequesiguinco-

muns,cosaqueensproporcionaunalecturaaproximadadel’abundànciarelativadediferentsespècies

enaquellapartdel’oceà.totiquetrobartantsvirusnousésimpressionant,fornasveuaquestprojecte

com una prova de concepte.

“AquestprojectedemostraquepodemajuntarlaSCAfilagenòmicaperavirus”,explica.“Aratenimuna

einaquefemservirperaidentificarnousvirusend’altresecosistemes,comarapiscines,llacs,aigua

potableofinsitotfluidscorporals;jahemdemostratquepodemferservirelnostremètodeperatrobar

virusalasaliva.nosabemquinsvirushihaforaquepuguinserperjudicialsperalséssershumans,però

ara tenim una eina per trobar-los.”


franciscoMartinez-Hernandez,oscar

fornas,MonicaLluesmaGomez,Benja-

minBolduc,MariaJosedelaCruzPeña,

JoaquínMartínezMartínez,JosefaAn-

ton,JosepM.Gasol,RiccardoRosselli,

franciscoRodriguez-Valera,Matthew

B.Sullivan,SilviaG.Acinas&Manuel

Martinez-Garcia

“Single-virus genomics reveals hidden

cosmopolitan and abundant viruses”

nature Communications, 8:15892

(2017),doi:10.1038/ncomms15892


Ultra-congelacióUnnoumètodedecongelació,queespotferservirenqualsevolllocdelmón,iqueconservalescèl·lulessimplesperal’anàlisicientífica.

aquí teniu un repte: agafeu un grapat de gominoles de diferents sabors, poseu-vos-les a la

bocaimastegueu-les.Intenteuindividualitzarcadagust.Potserpodreudistingirlacirerao

lallimonaàcida,peròprobablementuscostaràidentificarcadaundelsaltressabors.Però

poseu-vos-lesalabocad’unaenunaiseràsenzilldistingircadasabor.

Aquestescenariésmoltsemblantalproblemaambquèestrobenelscientíficsqueinvestiguenels

canvisenl’activitatgenèticaqueesprodueixenlescèl·lulessimplesduranteldesenvolupamentde

malaltiescoml’Alzheimeroelcàncer.Abans,elscientíficshaviendetreballarambmostresdeteixit

quecontenienmoltsmilersomilionsdecèl·lulesifixar-seenelresultatgeneral:igualqueposar-sea

la boca tot un grapat de gominoles de diferents sabors.

Gràciesalesmilloresenlatecnologia,araelsinvestigadorspodenfixar-seenelspatronsd’activitat

genèticaenlescèl·lulesindividualsextretesdeteixitsaoanormaliobtenirunalecturafiabledelseu

“sabor”individualitzat.Perònoésfàcilobtenireltipusdemostrescorrectesperal’anàlisidelescèl·lu-

les simples.

“Hemdecomençarambcèl·lulesvivesextretesdematerialfresc”,explicaHolgerHeyn,capdel’equip

deGenòmicaMonocel·lulardelCnAG-CRG.“AquíaBarcelonaestemjustalcostatdel’hospitalitenim

totl’equipamentnecessariperasepararlescèl·lules.Peròhihamoltscentresmèdicsod’investigació

que no tenen aquesta possibilitat”.

enllocd’això,lesmostresdeteixitdelspacientsnormalmentesconservenenformaldehidis’enviena

analitzaraunaltrelloc.Peròaquestconservantfaquelescèl·luless’enganxininoespuguinseparar.

Alternativament,lesmostrestambéespodencongelarambgelseconitrogenlíquid,totiqueaixòfa

malbélescèl·lulesfinsalpuntqueesdesintegrenquanesdescongelen.Isensecèl·lulessimples,els

investigadors no poden fer-ne una anàlisi.

Peraixò,Heynvadecidirdesenvoluparunmètodealternatiuqueespoguésferservirperaconservar

lescèl·lulesrecollidesaqualsevolpartdelmóniquepermetésseparar-lesmésendavant.


MoSTRa I REfREdaMEnT

Perdesenvoluparelnoumètode,Heyn ielseuequipesvan inspiraren lacriopreservació.Aquesta

tècnicanormalmentesfaservirperaconservarcèl·lulesbiològiquesiteixitscomòvulsoembrions

encentresfIV,peròtambéalgunsatrevitsdecideixencriopreservarelseucosocervelldesprésdela

mort(totiquelatassad’èxitenladescongelaciód’embrionsfVIésbona,nohihaexemplesd’humans

criopreservats que hagin tornat a la vida!).

Durantlacriopreservació,lamostradeteixitesbarrejaambunasolucióespecialquecontéunconser-

vantquímicsuauanomenatDMSo,juntamentambunsèrumricenproteïnesderivatdelasang,ies

refredalentamentfinsa-80˚Cenuncongeladordelaboratorioa-200˚Cennitrogenlíquid.elsprimers

passos de la congelació es poden dur a terme en un refrigerador portàtil, i així es poden recollir mos-

tresenllocsremotsforad’unhospital.

Un cop congelades correctament, les mostres criopreservades es poden guardar durant almenys sis

mesos,perdespréspoder-lesdescongelar,trossejaridescompondreambenzimsperaobtenirlescèl-

lulessimplesques’hand’analitzar.Desprésd’avaluarlatècnicaambcèl·lulesobtingudesallaboratori,

mostresdesang,d’intestíidecàncer,elsinvestigadorsvanconcloureque,totiquealgunescèl·lules

quedenmalmesesiesperden,n’hihaunaproporciósignificativaquequedaintacta.

Desprésdeperfeccionarlatècnica,araHeynielseuequippodenrecuperaralvoltantdel90%deles

cèl·lulessanguíniescriopreservades,totiqueaquestaxifraésmésbaixaperateixitssòlidscomels

tumors.Caldestacarquehandemostratqueelprocésdecongelaciónoafectaelspatronsd’activitat

gènicaencèl·lulescriopreservadesencomparacióambelsteixitsfrescos,obrintlapossibilitatd’anà-

lisisdecèl·lulessimplesaequipsd’investigacióqueno tenenunaccésdirectea instal·lacions tan

complexes.

“elnostremètodeésmolteconòmicifàcil.noetcalresespecial”,explicaHeyn.“noesperàvemque

funcionéstanbé.nohihacapsenyalde“xoc”acausadelacongelacióiestembastantsegursque

obtenim una mostra representativa del teixit tal com era a la vida”.

Comquelatècnicadecriopreservacióéstansenzilla,aramoltshospitalsoptenperrecollirlesmostres

d’aquestamaneraambl’esperançadepodercol·laborarambHeynoalgunaltrelaboratoridegenòmi-

camonocel·lularenelfutur.Perexemple,elsmetgespodenrecollircèl·lulesd’untumorenelpuntde

diagnòstic,iprendremésmostresamesuraquelamalaltiaresponaltractamentoesdesenvolupauna

resistènciaiesrecau,fentserviranàlisisdecèl·lulessimplesperidentificartotselscanvisdetallatsen

elsgrupsdecèl·lulesgenèticamentdiferents,queconformenuntumor.

Amés,elsinvestigadorsquetreballenenpaïsosenviesdedesenvolupamenttenenaralapossibilitat

derecollirmostresperaprojectesderecercaqueimpliquinl’anàlisidecèl·lulessimples,fetqueera

impossible en el passat.

“toteslesmostressóncomplexesiestanformadesperdiferentstipusdecèl·lules”,diuHeyn.“Però

aquestaanàlisidetalladapelquefaalescèl·lulessimplesenspermetgenerarnousconeixementsso-

breelquerealments’estàproduintenelsteixitsinterns,comestanformatsicomfuncionen.elnostre

mètodedecriopreservacióobriràtotunmóndemostresdecèl·lulessimples.Realmentcanviaràles

regles del joc”.


amy Guillaumet-adkins†, Gustavo

Rodríguez-esteban†,elisabettaMereu†,

MariaMendez-Lago,DiegoA.Jaitin,

alberto villanueva, august vidal, alex

Martinez-Marti,enriquetafelip,Ana

vivancos, Hadas Keren-shaul, simon

Heath,MartaGut,IdoAmit,IvoGutand

Holger Heyn

“Single-cell transcriptome conservation in

cryopreserved cells and tissues”

GenomeBiology,18:45,2017,https://

doi.org/10.1186/s13059-017-1171-9


passa-hoUnequipd’investigadorshadescobertunaherènciaepigenèticapoccomunaqueespottransmetremésde14generacions.

Moltes famílies tenenherències, objectes especials que passende generació en genera-

ció, records valuosos que els arriben de temps passats. per als diminuts cucs nematodes,

aquest tresor pren la forma de marques químiques en el genoma, que transmeten informa-

ciósobrecomeralavidaenelpassat.Sorprenentment,aquestsrecordscel·lularsespodentransme-

trefinsa14generacionscomamínim,encaraque,comqueelscucsneixen,esreprodueixenimoren

enunespaidepocsdies,aixònomésrepresentialgunsmesos.

Ladescoberta,publicadapelcapdegrupdelCRGBenLehnerencol·laboracióambinvestigadorsde

l’InstitutdeRecercacontralaLeucèmiaJosepCarreras(IJC)il’Institutd’InvestigacióenCiènciesdela

salut Germans trias i pujol (iGtp), en un inici va ser casual. adam Klosin, estudiant de doctorat, estava

estudiantunscucsC.elegansalsqualss’haviaintroduïtunxipgenètic-unallargacadenadecòpies

repetidesd’ungenquecodificaunaproteïnafluorescentvermella-quanesvaadonard’unfetestrany.

Sielscucsesmanteniena20˚C,elxiptransgèniceramenysactiuicreavanomésunapetitaquantitatde

proteïnafluorescent.Peròsiescanviavaelsanimalsaunclimaméscàlidde25˚C,l’activitatdelxiptransgènic

augmentavasignificativamentifeiaqueelsanimalsbrillessinambunvermellintenssotalallumultraviolada.

I EnCaRa ES va PRodUIR Un fET MéS ESTRany.

Quanelscucstornavenatemperaturesmésbaixes,elsseustransgenscontinuavenmoltactius,cosa

quesuggeriaqued’algunamaneraencararetenienla‘memòria’delseupassatméscàlid.Misteriosa-

ment,lafluorescènciabrillantesvatransmetrealsseussuccessiusdescendentsdurantsetgenera-

cionsquevanviureatemperaturesmésbaixes,malgratqueelsanimalsd’origennoméshavienestat

exposatsatemperaturesmésaltesdurantunperíodecurtdetemps.Sorprenentment,mantenirels

cucsa25ºCdurantcincgeneracionsvacomportarquel’augmentdel’activitatdelstransgensesman-

tinguésdurantalmenys14generacionsuncopelsanimalsvantornaraunavidamésfreda.

“Ésgenial”,diuenLehner.“estractad’unsistemaartificial,peròl’efecteésmoltmarcat.Havíemdedescobrirquè

elprovocava,aixíquel’Adamvaabandonarelseuprojectededoctoratanteriorivacomençaratreballarenaixò.


fEnT Una MaRCa

Perdescobrirquèprovocavaaquestpatród’herènciaestrany,Lehnerielseuequipvanferunaanàlisi

mésdetalladadelxiptransgènic,concentratenproteïnesenformadebola(histones)quecontenen

ADndinsdelacèl·lula.

Leshistonesespodenmodificaramb‘marcadors’químics(marquesepigenètiques)dediversesma-

neres.Algunesmarquesepigenètiquess’associenal’activaciódelsgens,mentrequed’altress’associ-

enalseusilenciament.enconcret,Lehneresvacentrarenlamodificaciód’unahistonaconegudacom

atrimetilacióH3K9,queajudaaaturarl’activitatgenètica.

Comerad’esperar,elsinvestigadorsvandescobrirqueelstransgensenanimalsquesemprehavien

estat a 20ºC tenien alts nivells de trimetilació H3K9. Consegüentment, els seus transgens eren menys

actius inoemetiengairefluorescència.elscucsquealeshoresesvanposara25ºCvanperdreels

marcadors,vanactivarelseuxiptransgènicivancomençarabrillar.

Sorprenentment,aquestsanimalsambfluorescènciabrillantquehaviencrescutenelclimaméscàlid

mantenienlametilaciódelahistonareduïdaquanse’lstornavaaunatemperaturamésbaixa,cosa

quesuggereixqueaquestmecanismetéunpaperimportantenelbloqueigdelamemòriasobrela

temperatura ambiental en el genoma.

enunaanàlisiencaramésdetallada,Lehnerielseuequipvandescobrirqueunaproteïnaanomenada

Set-25éslaresponsabledemantenirelspatronsdemetilaciódelahistonaenelxiptransgènic.Però

encaranosabenexactamentcoml’augmentdetemperaturacondueixalapèrduademarquesdeme-

tilació en histones. i tampoc no saben si els patrons de metilació de la histona són els responsables

detransmetrelamemòriadetemperaturad’unageneracióal’altra,encaraquejaesdistingeixinenels

ousil’espermaisiguinpresentsenelsprimersestadisdeldesenvolupamentdelscucs.

dE gEnERaCIó En gEnERaCIó

elxiptransgènicfluorescentesvaintroduiralscucsmitjançanttècniquesd’enginyeriagenètica,aixíque

espodriadonarelcasqueactuésdemaneraestranya.PeròLehnerielseuequiptambévandescobrir

querepetitsfragmentsdelgenomanormaldelscucsques’assemblavenalsxipstransgènicstambées

comportavend’unamanerasemblant,cosaquesuggeriaqueaquestfenomenésmésaviatgeneralitzati

norestringitnomésagensdissenyatsartificialment.

“Aquestfenomennoésdeltotsorprenent”,afirmaLehner.“Hihaaltreselementsrepetitiusenlalíniagermi-

naldelscucsquecanvienlasevaactivitatdepenentdelatemperatura,isemblaqueesmantéunromanent

d’herènciaalgunesgeneracionsdesprés.Peròfinsaranohemtrobatcapgen‘regular’queescomportiaixí”.

totiqueaquestfenomend’herènciaepigenèticas’haobservatendiversosanimals, inclososmamífers,

encaranohihaevidènciesdelsefectesquepottenirallargtermini.finsitotelsmillorsexemples,com

l’impactedelafamdurantl’embaràs,esdissipenalcapd’unparelldegeneracions.Aixòfaqueelscucsde

Lehnersiguinlamostramésduradorade‘memòria’ambientaltransgeneracionalques’hagiobservatmai

enanimalsfinsadiad’avui.Peròtotiserunresultatintrigant,encaranosesapexactamentquinautilitat

pot tenir per als cucs.

“nosabembenbéperquèesprodueix,aquestfenomen,peròpodriaserunaformadeplanificacióantici-

padabiològica”,explica.“elscucsviuenpocsdies,aixíquepotsertransmetenrecordsdelescondicions

viscudes per ajudar els seus descendents a predir quin ambient trobaran en el futur”.

Perauncuc,deugeneracionsencararepresentenmenysd’unparelldemesos.Podempredirambforça

exactitud la temperaturaquehihauràelssegüentsquinzedies,aixíqueperalscucs tésentit intentar

codificarlainformacióperajudarelsseusbes-bes-bes-bes-bes-bes-bes-bes-besnets(o,mésexactament,

bescucs)apreparar-seperl’ambientenquèhaurandecréixer.Peròésquasiimpossiblepredircomserà

elclimadesprésdemoltesgeneracionsdevidahumana,aixíqueaquestamenademecanismeprobable-

mentnoésútilperaespèciesdevidamésllarga.

“Perara,totaixòsónespeculacions”,afirmaLehner.“Peròlabiologiaéstanestranyaquesiesprodueix

unacosaaixí,ésprobablequetambés’hagiproduïtperaunaltreobjectiuenalgunaltrellocdelanatura”.


adam Klosin, eduard Casas, Cristina

Hidalgo-Carcedo, tanya vavouri, Ben

lehner

“Transgenerational transmission of

environmental information in C. elegans”

science, 356(6335):320-323, doi:

10.1126/science.aah6412


ClassificarÉsl’aniversaridelteuamicivolsenviar-liunregal.L’emboliquesambcura,hiescriuselnomal’exterior,hienganxesunsegellil’enviespercorreu.Llavors,comperartdemàgia,unparelldediesdesprésarriba a casa seva.

l amàgia té llocquanels treballadorsdeldepartamentdeclassificacióde l’oficinadecorreus

reconeixenelsegellil’adreça,idesprésenvienelpaquetamblesfurgonetesderepartimentala

ubicaciócorrecta.I,gairebépassaexactamentelmateixadintredelesnostrescèl·lulesauna

escalamoltmésreduïda,jaqueellestambéempaquetenienvienal’organismepaquetsdeproteïnes,

comelsenzimsoleshormones.

Aquestaviadesecreció,talcomsel’anomena,s’haestudiatminuciosamentdurantanys.Arasabem

queaquestesproteïnessecretadesesprocessenenunamenade“fàbrica”cel·lular,anomenadare-

ticleendoplasmàtic(Re),quedespréss’envienaunaestructuradenominadaaparelldeGolgi,ones

modifiquenis’empaqueten.Lesproteïness’envienalllocadequatgràciesals“segells”iales“adreces”

moleculars:petitesregionsdelaproteïnasecretadaquelamarquenperalasevaexportació.

“Lamajoriadelesproteïnesessecretenatravésdelreticleendoplasmàticidel’aparelldeGolgi;ésunavia

queconeixemmoltbé,”explicaVivekMalhotra,capdegrupalCRG,“peròsesecretenaltresproteïnesqueno

fanaquestrecorregutinosabemquins“segells”niquines“oficinesdeclassificació”elsenvienalseulloc”.

Un RECoRREgUT no ConvEnCIonal

Aquestahistòriavacomençaral2007,quanMalhotraielseuequipesvanadonarquelescèl·lulesde

llevatilesdefongsmucilaginosossecretenunaproteïnaanomenadaAcb1sotalainaniciódenutri-

ents.Però,curiosament,l’Acb1nopresentacapdelssenyalscaracterísticsquel’enviarienatravésde

la via de secreció habitual.

enllocd’això,unesproteïnestransportadoresespecialss’hiuneixenilatransportenauna“oficinade

classificació” temporal.Aquestésel compartimentpera lasecreciónoconvencionaldeproteïnes

(CUPS,perlessiglesenanglèsdeCompartmentforUnconventionalProteinSecretion),queestàfor-


matpercomponentsdelRe,del’aparelldeGolgiidepetitspaquetsanomenatsendosomes,inomés

apareixencondicionsd’estrès.

Malhotra i el seu equip tenien curiositat per saber si hi havia altres proteïnes que emprenguessin

aquestaviapocortodoxapersortirdelacèl·lula,ivandecidirexaminarmésdetalladamentlasuperò-

xiddismutasa1(SoD1):unaproteïnaquenormalmentensprotegeixneutralitzantsubstànciesquí-

miquestòxiquesdel’organisme.Aixícoml’Acb1,laSoD1notéel“segell”habituald’exportacióquela

condueixatravésdelReidel’aparelldeGolgi,noobstanttambélasecretenlescèl·lules.

LaSoD1estàinvolucradaenl’esclerosilateralamiotròfica(eLA,tambéconegudacomamalaltiade

LouGehrigomalaltiadelesneuronesmotores)queésunaafeccióneurodegenerativa.Ésunamalaltia

queavançaràpidamentinotécura,matalescèl·lulesnerviosesques’encarreguendelmoviment(neu-

ronesmotores)i,finalment,provocalaparàlisiilamort.Propd’unacinquenapartdelespersonesque

pateixeneLApresentaundefectegenèticenelgenquecodificalaproteïnaSoD1.elsinvestigadors

pensenquelescèl·lulesadjacentssecretenlaSoD1defectuosaiquelesneuronesmotoresl’assimilen,

fetquedestrueixlesvaluosescèl·lulesnerviosesenllocdeprotegir-les.

AcausadelaimportànciadelaSoD1enl’eLA,Malhotraielseuequipvanvolerdescobrirsitambé

utilitzalaviadelCUPSpersortirdelescèl·lules,idescobrirlaidentitatdel“segell”biològicquel’hienvia.

InanICIó I ClaSSIfICaCIó

Demanerasimplificada,elscientíficsvancomençarlasevainvestigacióambcèl·lulesdellevat,quepresen-

tenviesdesecreciómoltsimilarsalesdelescèl·luleshumanesperòsónmésfàcilsdecultivarianalitzaral

laboratori.esvanadonarquequancultivavenllevatambabundànciadenutrients,lescèl·lulessecretaven

unamicadeSoD1.Peròquanlescèl·lulestenieninaniciódenutrients,n’exportavennouvegadesmés.

Després,Malhotraielseuequipvanutilitzarl’enginyeriagenèticaperamodificaralgunscomponents

molecularsbàsics(aminoàcids)delaSoD1,totcentrant-seenunazonadelaproteïnaqueésigual

tantenelllevatcomenl’ésserhumà.Vandescobrirquetansolsunaseqüènciadedosaminoàcids

erasuficientperaactuarcoma“segell”peraenviarlaproteïnaperlaviadelCUPS.I,principalment,

queelsmateixosdosaminoàcidstambéestrobenenl’Acb1,l’altraproteïnasecretadademanerano

convencional, cosa que indica que podria ser un senyal universal del CUps.

finalment,afid’observarsiaquestamateixaviafuncionavaduranteldesenvolupamentdel’eLA,elsinves-

tigadorsvananalitzarversionssanesiversionsambeLAdelaSoD1encèl·luleshumanesivandescobrir

quetambés’exportamitjançantlaviadelCUPSquanlescèl·lulesestansotalainaniciódenutrients.

tenintencomptetotaixò,Malhotraconsideraqueaquestprojecteprovaquelescèl·lulesensituació

d’inaniciósecretentantlesversionssanescomlesdefectuosesdeSoD1atravésdelaviadelCUPSique

elpetit“segell”dedosaminoàcidséssuficientperenviar-les-hi.Peròencarahihaunmisteriperresoldre.

“Moltesproteïnespresentenelmateixpatródedosaminoàcids;defet,ésmoltcomú,”diuMalhotra.

“encarahemdedescobrircomesdetectenconcretamentlaSoD1ilesproteïnesequivalentsicom

s’envienalCUPS,mentrequenopassaelmateixambaltresproteïnes”.

Malhotrapensaque,generalment,encondicionsnormals,el“segell”deduespecess’amagaalespro-

teïnescomlaSoD1il’Acb1.Peròquanhihaalguncanvi-perexemple,quanlaproteïnaésdefectuosa

olacèl·lulapresentainanició,laqualcosaafectalaformadelesproteïnes-,llavorsquedaexposada.A

continuació,apareixenlesxaperonesmolecularsperaevitarmésdesplegament,ienllocd’aixòenvien

laproteïnaalCUPSperquèsurtidelacèl·lula.

Laidentitatd’aquestesxaperonesilamaneraexactadetraslladarproteïnesalsCUPSactualmentesdes-

coneixen,peròMalhotraielseuequipsen’estanocupant.enconcret,elsinteressatrobarallòqueprovoca

la secreció perjudicial de sOD1 en els pacients que pateixen ela i, sobretot, descobrir si poden aturar-ho.

Diuque“eldescobrimentd’aquest“segell”noconvencionalquecondueixlasecreciódeSoD1ésmoltemo-

cionant”.“Actualment,noexisteixentractamentseficaçosperal’eLA,aixíqueesperoqueelsnostresdes-

cobriments puguin proporcionar la base pel desenvolupament, en el futur, de tractaments molt necessaris”

.


Cruz-GarciaD,Brouwersn,DuranJM,

MoraG,CurwinAJ,MalhotraV.

“A diacidic motif determines unconvention-

al secretion of wild-type and ALS-linked

mutant SOD1.”

JCellBiol,pii:jcb.201704056.doi:

10.1083/jcb.201704056.[epubaheadof

print] (2017).


D’acord,ordinadorUnnou“ordinadorvirtual”faquel’anàlisidedadesbiològiquessiguimésfiable.

imagineuqueesteudavantd’unacaixaenormequecontécentenarsdecalculadoresdiferents.Aga-

feulaprimeraiposeu“2+2=”iobteniularespostacorrecta.4.feuelmateixambunaaltracalcu-

ladora i obteniu la mateixa resposta, i així successivament. seguiu provant-les totes i cada cop

obteniu el mateix resultat. però, de sobte, obteniu una resposta que no esperàveu: 5. amb un càlcul

tansenzillésfàcilveurequequelcomnohasortitbé.Sihemintroduïtbélesdades,aixòvoldirqueel

processadorquehihadinslamàquinahacomèsunerror.

ara imagineu que esteu fent el mateix càlcul amb diferents grups enormes de dades genòmiques,

analitzantmilionsdebitsd’informacióenunordinador.obteniuuna respostad’unsúper-ordinador

Linuxalsoterranid’uninstitutderecerca,peròunamicadiferentdelaqueheuobtingutd’unservidor

basatalnúvoliobteniuunatercerasolucióambunMac.Pertant,perquèsóndiferentsicomsabeu

quinaéslacorrecta?

a gRanS dadES, gRanS PRoblEMES

elscientíficsquetreballenambaqueststipusdedadesgransiquebusquenpistesperapreveniro

tractar malalties humanes o aclarir processos biològics fonamentals, necessiten respostes que siguin

fiables iqueespuguin reproduir.Aixòésespecialment importanten lanovaerade lamedicinade

precisió, en la qual els metges prenen decisions sobre el tractament que hauria de rebre un pacient en

funciódelainformaciógenètica.

“Labiologiaéscadavegadaméscomputacional”,diuCedricnotredame,capdegrupalCRG.“favint

anyseramoltcarferlaseqüenciaciódel’ADn,aixíquehihaviamoltpocainformació.Miraveslase-

qüènciaenuntrosdepaperil’analitzavesamà.Araésmoltméseconòmiciràpid.Hihamoltesmés

dadesiperaixòhemdeferservirordinadorsperaanalitzar-les”.

Peròhihadiferentsprogramarisques’executenendiferentsordinadorsambsistemesoperatiusdife-

rents, i no sempre donen les mateixes respostes a partir de les mateixes dades. i com que hi ha tantes


operacionsipuntsdedadesinvolucratsenaquestscàlculsagranescala,ésimpossibleesbrinarquè

hasortitmalamenticomsolucionar-ho.Amés,diunotredame,moltagentnitansolss’haadonatque

aquestaanomenada“inestabilitatcomputacional”ésunproblemaensimateixa.

“Vasercomunaepifaniaquanensvamadonarquehihaviatantainestabilitatcomputacional.Abans,

aixònosesabia”,diunotredame.“Ésunproblemaperquèensestemdirigintcapaunaèpocaenlaqual

elsmedicamentsielsdiagnòsticsesbasenendadesgenètiques:l’ordinadorusdonaràunnombreius

dirà el vostre risc envers una malaltia o quin medicament cal prendre. però tot es basa en rànquings

iprobabilitats,demaneraquefinsitotunapetitavariacióenelresultatdelesdadespodriatenirun

impacte terrible en els pacients”.

Algunesempresesdetecnologiahanintentatresoldreaquestproblemadereproductibilitatmitjançant

la creació de costosos canals de dades fets a mida, que bloquegen els usuaris en aquesta plataforma

deprogramarienconcret.Perònotredameielseuequipvanoptarperunenfocamentméssenzill.

“Vamconstruirunaplataformad’anàlisiambunatècnicaanomenada“virtualització”,quecreadema-

neraefectivaunordinadorvirtualsimulatiidènticdinsdequalsevolmàquina”,explica.“Ésexactament

la mateixa idea que els antics simuladors de jocs dels salons recreatius dels anys 80 que podeu exe-

cutaralsvostresPC,peròaunaescalamoltmésgran”.

Aquest“ordinadordinsd’unordinador”implicaqueelsinvestigadorspuguinexecutarqualsevolprogra-

maridinsdel’entornvirtualiobtenirelmateixresultat,jaquelessevesdadessempreesprocessaran

delamateixamanera,independentmentdelamàquinafísicaqueutilitzin.

“Somungrupd’investigaciópetit,iperaixònecessitàvemunasoluciósenzillaquetothompoguésfer

servir fàcilment. i no podíem redissenyar totes les eines informàtiques que tenim. volíem seguir fent

servir elsprogramesalsquals estemacostumats”, diunotredame. “Lanostra solució és senzilla i

rendibleperquèhovamferperasolucionarlesnostrespròpiesnecessitats”.

nEXTflow al RESCaT

Desprésdelapublicacióquedescriulanovaplataformavirtual,conegudacomanextflow,notredame

ielseuequipvandecidirposar-laalalliuredisposiciód’altrespersones.Milersd’investigadorsdescar-

reguenelsistemacadamesimoltesorganitzacionsderecercal’hanadoptat,incloent-hil’InstitutPas-

teurdefrança,elSangerInstitutealRegneUnit,laInfraestructuranacionaldeGenòmicadeSuècia,el

Genome institute de singapur i els instituts nacionals de salut dels estats Units.

tambéhasorgitunagrancomunitatenlíniainternacionalperaagruparideesicompartireines,amb

el suport de tallers de capacitació i hackatons celebrats al CRG, ampliant els límits del que pot fer

nextflow.

“M’encanta aquesta tecnologia perquè és útil, però elmés important és que solucioni problemes”,

diunotredame,quereflecteixl’èxitdenextflow.“Lainestabilitatcomputacionalésunproblemage-

neralitzat,perònoteniasolució inoespotcorregir.Ésmoltemocionantsaberquehemsolucionat

un problema que la gent encara no sabia ni que existia, però que podria arribar a ser enorme ara que

entremal’eraBigData.”


DitommasoP,ChatzouM,flodeneW,

Barja pp, palumbo e, notredame C.

“Nextflow enables reproducible computa-

tional workflows.”

nat Biotechnol, 35(4):316-319 (2017).

doi:10.1038/nbt.3820.noabstract

available.


Desempaquetant el genomaCadascunadelescèl·luleshumanescontémésdedosmetresd’ADnenrotllatidensamentempaquetat,aixíqueactivarelsgenscorrectesenelmomentcorrecteésungranrepte.

p ràcticamenttoteslescèl·lulesdelcoscomparteixenlesmateixesinstruccionsgenètiques,alvol-

tantde20.000gens,codificatsenllargsfilamentsd’ADnanomenatscromosomes.Perònototes

lescèl·lulessón iguals.elsdiferentstipusdecèl·lulesutilitzenconjuntsespecíficsdegensper

poderduratermefuncionsconcretesenelcos.Perexemple,unacèl·lulahepàticahad’activargensque

codifiquinenzimsdigestiusidesactivarlesinstruccionsperalafabricaciódeneurotransmissors,mentre

queunacèl·luladelcervellhadeferelcontrari.

Iésmés,l’ADndecadacèl·lulahumanafamésdedosmetresdellarg.estàplegat,enrotllatificatdins

elnucli,unaestructuraméspetitaqueelcapd’unaagulla,juntamentambgranquantitatdeproteïnes.

D’algunamanera,enmigde totaquestenrenoumolecular, lacèl·lulahade trobarelsgenscorrectes i

activar-los en el moment correcte.

Aquestaorganitzaciódel’ADnenelnuclis’assemblaauncabdelldellanaenredat.Algunespartsestan

moltcompactadesi,end’altres,l’empaquetamentésméslax.trobarungenespecíficiactivar-loéscom

buscaruntroscurtiespecíficdellanaenmigdelcomplicatembolic,alliberant-lodequalsevolcompacta-

cióiafluixantelfilperapoder-loutilitzar.

Jas’havistqueelsgensactiustendeixenaestarempaquetatsd’unamaneraméslaxaencompartiments

“oberts”delnuclicomparatambelsgensinactius,peròsesappocsobrecoms’organitzenaquestsgens

enaquestesregionsdiferentsosobrecomcanvialasevaubicacióquans’activenodesactiven.entendre

comfuncionaaixòanivellmolecularésundelsreptesmésimportantsdelabiologiaiéselquevolresoldre

thomasGraf,capdegrupsènioralCRG.

CaP a la qUaRTa dIMEnSIó

totvacomençarel2014quanGrafielsseuscol·leguesdelCRG,MiguelBeato,GuillaumefilioniMarc

A.Marti-Renom,vanemprendreunprocésdecol·laboracióconegutcom4D Genome (projecte synergy


del’eRC)queinvestigadequinamaneral’organitzaciódel’ADncanviaamidaqueelsgenss’activenies

desactiven.

L’equipnotansolshaesquematitzatl’organitzaciódel’ADnenelnuclidelescèl·lules“enrepòs”,sinóque

elsinvestigadorstambéhanelaboratnovestècniquesinnovadoresperferelseguimentdelscanvisque

esprodueixenenl’estructuratridimensionaldelscromosomesdelnuclialllargdeltemps(laquartadimen-

sió)mentrelescèl·lulescanviend’untipusal’altre,bétemporalmentodeformapermanent.

Aquesttipusdetransiciós’observaeneldesenvolupament,mentrelescèl·lulesmareembrionàriess’espe-

cialitzengradualmententeixitsespecíficsenl’embrióoelfetusendesenvolupament.Peròaquestavega-

daGrafestavaespecialmentinteressatenveurequèpassaquanlescèl·lulesespecialitzades“reverteixen”

acèl·lulesmareenunprocésconegutcomareprogramació.

“Jahihaviaquihaviacomparatl’organitzaciónucleardelescèl·lulesespecialitzadesilescèl·lulesmare,

perònosabiendequinamaneraesproduïenaquestscanvisenel temps”,diuGraf. “nosaltresvolíem

observaraquestscanvisenelmomentenquètenienlloc,ienspreguntàvemsil’organitzaciódelgenoma

canviaabansodesprésqueelsgenss’haginactivatdurantlareprogramació.”

Perretrocedireneltemps,elsinvestigadorsdelCRGvanrecórreraunavariaciód’unatècnicadesenvo-

lupadapelcientíficjaponèsipreminobelShinyaYamanaka,quevadescobrirqueuncòctelformatper

quatreproteïnes(oCt4,SoX2,KLf4iMYC)podiarevertir lescèl·lulesespecialitzadesacèl·lulesmare.

Aquestesmolèculesextraordinàriessónfactorsdetranscripcióques’uneixenallocsespecíficsdel’ADn

propdel’inicidegensespecíficsdecèl·lulesmareielsactiven,cosaquereprogramalacèl·lulailareverteix

al’estatdecèl·lulamare.

Malauradament,peramoltstipusdecèl·lules,elmètodenoésgaireeficient.Perexemple,tansolsuna

petita fracció dels limfòcits B es poden reprogramar amb aquests factors anomenats yamanaka. això no

obstant,Grafielseuequipvandescobrirquel’addiciód’unaaltraproteïnaabansdelsfactorsYamanaka,

conegudacomaC/eBPalpha,feiaquecomamínimun95%dellimfòcitsBestornessinaconvertiren

cèl·lulesmareenelcursdevuitdies.

Agafantmostresd’aquestescèl·lulescadadosdies,elsinvestigadorspodienrecórreralestècniques4D

perferelseguimentdel’organitzaciócanviantdel’ADnenelsnuclisdelescèl·lulesmentrepassavende

limfòcitsBacèl·lulesmare.

EXPlICaCIó dE lES dadES

Perdescobrirdequinamaneraestornenaorganitzarelsgensdinsdelnuclide lescèl·lulesdurant la

reprogramació,GrafielseuequipvanferservirunmètodeanomenatHi-C.Aixòrevelasihiharegions

específiquesdel’ADnqueestoquinentresiireflecteixsil’empaquetamentéslaxocompacte.

L’equiptambévarecollirdadessobrel’estatd’algunsgens,siestavenactivatsodesactivats,itambéva

categoritzarlesmarquesmoleculars(conegudescomamodificacionsepigenètiques)quehihaassocia-

des als gens actius o inactius. la major part del treball pràctic fou dut a terme per Ralph stadhouders,

investigador postdoctoral, juntament amb el biòleg computacional enrique vidal.

Laclaudel’èxitdelprojectevaserelnouprogramari,conegutcomatADbit,creatperMarti-Renomielseu

equip.Peralnucli,ésunamicacomun“Googleearth”queagrupatoteslesdadesperaestablirunmapa

detallatdecoms’organitzal’ADnenqualsevolpartdelgenoma.

“Lageneraciódedadesésencertamaneratrivial;lasevaanàlisiéslapartdifícilirequereixmoltdetemps

ipotènciainformàtica”,diuMarti-Renom.“Aquestsexperimentsgenerenmilionsdedadesirequereixen

centenarsdemilersd’horesdetempsdecomputació,perlaqualcosaelnouprogramarieratotalment

clauperaautomatitzarl’anàlisiifer-laaccessible.”

talcomseriad’esperar,elsinvestigadorsvandescobrirquelamajoriadelsgensques’havienactivata

mesuraqueelslimfòcitsBesconvertienencèl·lulesmarepassarienacompartimentsmésactiusdel

nucli.Sorprenentment,vandescobrirqueaixòpassadiversosdiesabansquerealments’activinelsgens.


“La ideapredominanteraqueelsgenss’activenquans’uneixenafactorsdetranscripció,comaraels

factorsdeYamanaka,idespréspassenaunaregióactivadelnucli”,explicaGraf.“Peròvamdescobrirque

moltsgensesdesplaçavenprimeris’activavendesprésméstard.Aixònoeraelques’esperavaperòva

ser un descobriment interessant.”

REToRn al CoMEnçaMEnT

Grafcreuqueaquestsdescobrimentsrevelenl’existènciad’unpapermésimportantdel’organitzaciócan-

viantquetéllocalnuclidelqueescreiaprèviament,aixícomunapossiblenovafunciódelsfactorsde

transcripció.nonoméss’uneixenal’ADniencenenelgens,explica,sinóquetambécreuquetenenuna

funcióindependentiprèviaeneldesempaquetamentdelgenomaieldesplaçamentdelsgensalesregi-

ons actives del nucli.

“Uncopelsfactorsdetranscripciódesenredenl’ADniexposenelsgens,aleshoresésfàcilencendre’ls”,

diuGraf.“Ara,però,lesgranspreguntessón:comhofan,ambquitreballeniquinéselmotorqueimpulsa

lareorganització?”

Grafielscompanysdel’equip4D Genomevolensaberaraquinessónlesmolèculesquetreballencon-

juntamentambelsfactorsdetranscripcióperadesxifrarl’ADnireconfigurar-lo.Itambévolenprovari

manipularaquestesinteraccions,béalterantl’ADnocanviantlesproteïnes,peraanalitzarlesrelacions

exactesentreelscanvis4Dqueveuenenlnucliielspatronsresultatdel’activitatgenètica.

“Aprenemelsprincipisqueregeixenlesdecisionsdelescèl·lulessobreelseudestíielqueveiemenel

nostresistemadereprogramacióésunmodeldelprocessosquetenenllocenunembrió”,diuGraf.“no

tincesperapersaberquèpassadurantelprimersdiesdevidaquanneixenlesprimerescèl·lulesmare

pluripotents.”


Ralph stadhouders, enrique vidal,

françoisSerra,BrunoDiStefano,

françoisLeDily,JavierQuilez,Antonio

Gomez,SamuelCollombet,ClaraBeren-

guer,YasminaCuartero,JochenHecht,

GuillaumeJ.filion,MiguelBeato,Marc

A.Marti-Renom&thomasGraf

“Transcription factors orchestrate dynamic

interplay between genome topology and

gene regulation during cell reprogramming”

nature Genetics, 50:238–249 (2018),

doi:10.1038/s41588-017-0030-7


bIoInfoRMàTICa I gEnòMICaLesfitescientífiquesdelprogramadurantel2017incloueneldesenvolupamentdelametodologiaCap-

tureLongSeq(CLS)peracaracteritzardeformaexhaustivaladiversitatdetranscripcionsdel’ARnllarg

nocodificant;eldesenvolupamentdenextflow,unllenguatgededominiespecíficquepermetfluxosde

treballcientíficsreproduïblesiescalablesfentservircontenidorsdeprogramari;eldescobrimentd’un

ciclesexualiunaassociaciórecentambl’hostehumàenelpatogenfúngicemergentCandidaglabrata

il’algoritmeGlobalScoreperapredirlesinteraccionsdeproteïnesambgranstranscripcions.

Diversos grups del programa participen en diversos projectes genòmics de gran escala, com ara en-

CoDe,Gtex,PanCancer,I5K,f1K,WebofLifeiIASIS(primerajutaCatalunyaperalamedicinaperso-

nalitzada).

elprogramahaseguitfentúsidonantsuportal’europeanGenome-phenomeArchive(eGA)encol·la-

boracióambl’europeanBioinformaticsInstitute(eBI).L’eGAhaestatseleccionatcomaeLIXIRCore

DataResourceicomaeLIXIRRecommendedDepositionDatabase.Alhora,tambéhaestatseleccionat

comundelsProjectesd’ImpulsdelaGlobalAllianceforGenomicsandHealth(GA4GH).L’eGAéstam-

béundelsorganismespilotdedemostraciódel’europeanopenScienceCloud(eoSC).

RecercaiServeisCientíficsL’ampliventalldetemàtiques,enfocamentsitecnologiesalCRGpermetabordarunampliespectred’aspectesfonamentalsenciènciesdelavidailabiomedicina.LarecercaalCRGs’organitzaenquatreàreesprincipals:regulaciógènica;cèl·lulesmareicàncer;biologiacel·lularideldesenvolupament;bioinformàticaigenòmica;ibiologiadesistemes.Desdel’1dejuliolde2015,elCentrenacionald’AnàlisiGenòmica(CnAG-CRG)éspartd’aquestaestructuraderecerca.

Roderic GuigóCoordinador


VivekMalhotraCoordinador

JuanValcárcelCoordinador

bIologIa CEl·lUlaR I dEl dESEnvolUPaMEnTL’any2017,ellaboratorideMalhotravadescobrirelmotiudiacídicnecessariperalasecreciódesuperòxiddismutasa(SoD)1,queessegregasenselaviaendoplasmàticaconvencionalreticle-Golgid’exportaciódeproteïnes.Lamodu-laciód’aquestaseqüènciapodriaajudaracomprendrelaneurotoxicitatassociadaalaSoD1mutantenl’esclerosilateralamiotròfica.AquestlaboratoritambévadescobrirqueunaproteïnaanomenadatAnGo1,requeridaperal’exportaciódecol·làgensvoluminosos,encaixaenunanellenelsllocsdesortidadelRe,compartimentantaixíelReenregionsespecífiquesperalplegamentiexportaciódecol·làgensvoluminososdelarestadelRe.Unaltredescobri-mentd’interèsconsiderableéslademostraciódelafunciódel’esfingomielinaal’horad’organitzarlaformailafunciódelesmembranesdeGolgi.ellaboratorid’IsabelleVernosvacontinuarinspeccionantelmecanismedeladinàmicadelfusmitòticivadescobrirunnousocimitòticd’unmotorespecíficdelacinesinailasevafuncióenl’alineaciódemicrotúbulsicromosomes.SebastianMaurervaaconseguirreconstituirlamigraciód’ARnenelsmicrotúbulsin vitro.Aquestdescobrimenttancrucialéselprimerd’aquesttipusisuposaunavençessencialperaentendreelmecanismedeltransportdecàrregadependentdecinesinaenelsmicrotúbuls.ManuelMendozavadescobrirunnoumecanismedeprogressiódelciclecel·lularatravésdeladivisióasimètrica.ellaboratorideJeromeSolonvaproporcionarunaprimeradescripciódelesmodulacionsevolutivesenelprocésdesegellatepitelialentrediferentsespèciesdemosques.elseuequipvatrobarunatransicióevolutivaquevaconduiraunasimplificaciódelprocésdesegellateneltancamentdorsalivaidentificarunafuncióessencialconservadadelcitoesqueletdemicrotúbulsenelsegellatepitelial.Aquestsresultatsevidencienl’interèsgenerald’aquestdepartamental’horaabordarelsmecanis-messubjacentsalacompartimentaciócel·lular,ladivisiócel·lularil’organitzaciódelsteixits.

el2017vasertestimonidelasortidad’uncapdelgrupjúnior,ManuelMendoza,queesvatraslladarcomacapd’equipal’InstitutdeGenèticaiBiologiaMoleculariCel·lular-IGBMC(estrasburg,frança).DurantelseutempsalCRG,ellaboratorid’enManuelvarevelarunfascinantmecanismedemodulaciódelscomplexosdelsporusnuclearsdurantladivisiócel·lulari lafunciód’aquestprocésenelcontroldelaprogressiódelciclecel·lulardiferencialencèl·lulesmareifilla.Lessevestroballestambévanrevelarunaconnexiódesafiantd’exocitosiiabscisió,ielmecanismepelquallescèl·lulescontrolenl’abscisióperaassegurarlasegregaciócromosòmicanormal.estemorgullososdelsèxitsd’enManuelilidesitgemunèxitcontinuatenlasevanovafeinaafrança.enyoraremdedebòlasevacompanyoniaigenerositatielsseusdebatsacadèmics.

finalment, donem la benvinguda a dues noves caps de grup. elvan Boke va unir-se al departament com a capdegrupjúnior.estàliderantellaboratorideBiologiadelsoòcitsiLatènciaCel·lular.Durantelseupostdoca Harvard, elvan va descobrir que els oòcits agrupaven i segregaven mRna, mitocondris, Re, Golgi, endoso-mesielslisosomes,perunaproteïnagrandesordenada,anomenadaXvelo.LacreaciómediadaperlaXvelod’aquestmegasubcompartimentanomenatelcosdeBalbianiésunavençimportantipotserunagranpro-mesapercomprendreelsprincipisbàsicsdeldesenvolupamentdelsoòcitsielprocésgeneraldefertilització.elsdescobrimentsiobjectiusprincipalsdeBokeestanreconegutsperlaconcessiód’unajutStartingGrant,del’eRC.VerenaRuprechtvasercontractadadesprésdelasevabrillantinvestigacióal’IStd’Àustria.Comapostdocal’ISt,Verenavadescobrircoml’activitatcontràctilcorticalportaaunaràpidamotilitatcel·lularameboide.Aquestprocésdemigracióameboideesveuennombrosesmetàstasideldesenvolupamentidecàncer, però el mecanisme no està clar. els descobriments de verena van obrir un capítol nou en la migració cel·lularihanfetqueaquestprocésd’importànciafonamentalsiguisusceptibledefer-neunanàlisimole-cular.L’experiènciadelaVerenaenfísicaiimatgeriaaportanousenfocamentsalhorad’abordarlamigraciócel·lulariesperemquetambéperamoltsnousdescobriments.

REgUlaCIó gènICa, Cèl·lUlES MaRE I CànCERentrelesfitesmésdestacadesdelarecercaenaquestprogramadurantel2017,hihaimportantsavençosenelroldeladisposiciótridimensionaldelacromatinaenlaregulaciódel’expressiógenètica.elsmembresdelprojecte4DGenomeSynergydel’eRCvaninformardelsrolsfonamentalsdelcontextgenòmiclocalenlalatènciadelvirusVIH,del’expressiódelsgensencèl·lulesdedrosòfilaiquinainfluènciatélatopologiagenòmicaenl’activitatdelsfactorsdetranscripciódurantlareprogramaciócel·lulariviceversa.eltreballaddicionald’altresgrupsdelprogramahadesvetllatxarxestranscripcionalsambpapersclauenlaregulaciódelaidentitatdecèl·lulesmareembrionàries,re-programaciócel·lulariregeneracióorgànicaperfusiócel·lular.Aquestsprocessostambéestansentcaracteritzatsambl’úsdemicroscòpiadesúperresolució,ambelsuportdelsajutsfet.tambéesvaavançarenlacomprensiódelsmecanismesmolecularsdefàrmacsantitumoralsdirigitsalmecanismed’entroncamentienelsesforçosperdesenvolupar nous moduladors en aquests processos, amb el suport dels ajuts de la Caixa impuls i eRC-poC. Perúltim,elgrupdeBernhardPayerhainiciatunacol·laboracióamblaclínicadefertilitateugin,juntamentambelCnAG-CRG,peraexplorarlabasemoleculardel’envellimentd’ovòcitshumans.


bIologIa dE SISTEMESel2017vanmarxardosdelsnostrescapsdegrup.MatthieuLouis,capdegrupjúnior,esvatraslladar

alaUniversitatdeCalifòrnia,aSantaBàrbara,iJamesSharpe,capdegrupsènior,esvaconvertirenel

primerdirectord’eMBLBarcelona. DuranteltempsquevanpassaralCRG,el laboratorideMatthieu

Louisvaduratermeunautèntictour de force en el desenvolupament de tecnologia per implantar les

larvesdedrosòfilacomasistemaprincipalenelqualestudiarqualitativamentlapercepciósensorialiel

comportamentanimal.ellaboratorivadescobrirnouscomportaments,vadesenvoluparmètodesper

estudiar-los,vaelucidareldiagramad’instal·lacióelèctricadelsistemaolfactiudeleslarves,envaestu-

diarl’evoluciói,mitjançantl’úsd’unrastrejadoroptogenèticdebucletancat,vadesenvolupariprovarun

modelmultinivellpersabercomintegral’animalelssenyalsolfactiusdinàmics.

ellaboratorideJamesSharpehaformatpartdelprogramadesdelcomençament,l’any2006,ienJa-

mes,queenvasercoordinadordesdel2011finsal2017,vacontribuirenormementalprogrésdelpro-

gramaial’estildelaciènciaquefem.L’assolimentmésimportantdellaboratorimentreeraalCRGva

ser lademostracióqueelmecanismequeespecificaelsditsdelsmamífersésunsistemadeturing

molecular. Darrered’aquestgranassoliment,hihaundesenvolupamenttecnològicenorme,iel labo-

ratorivacontinuardesenvolupantmicroscopisiestratègiesdemodelatgeduranttoteltempsqueva

formarpartdelCRG.tambévanpublicaruncorpusdetreballfascinantqueexploraval’espaidedisseny

dexarxesgenètiquesdinàmiquesi,encol·laboracióambMarkIsalan,exmembredelprograma,vancrear

unsquantsd’aquestsmodelsdexarxesenbacteris.Éscertquetenimcincdits,peròresultaquehiha

sismecanismesperquètresgensinterpretinungradientmorfogenèticpercrearunafranja!ensfamolta

il·lusióqueSharpedirigeixilanovasubseudel’eMBLBarcelona.L’institutsecentraràenlabiologiadels

teixits i dels òrgans, i incorporarà 6 o 7 laboratoris de biologia de sistemes al pRBB, que donaran lloc a

lacreaciód’unaincomparableconcentraciódelaboratorisdebiologiaquantitativaiintegrativaaeuropa.

estemmoltorgullososdelsèxitsdelslaboratorisdeLouisiSharpe:lasevaésexactamentlamenade

ciènciaquantitativaoriginal,ambiciosa,difíciliallargterminiquepretenemdesenvoluparenelnostre

programa. els desitgem sort en les seves noves destinacions i esperem que els seus laboratoris facin

granscosesdurantmoltsanys.trobaremafaltarlasevavisiócientífica,lasevaamistatielseusuport.

el 2017 ha estat un any molt productiu per al programa. el laboratori de Ben lehner va publicar el descobri-

mentd’unamemòriaepigenèticadelmediambientduradoraitransgeneracionalassociadaalacromatina

en C. elegans,aixícomeldescobrimentquel’edatmaternaésunfactormoltimportantdevariaciófeno-

típicaenaquestesespècies.Aquestsdosestudisprolonguenl’interèsquesemprehatingutellaboratori

perentendrelescausesdelavariaciófenotípicaentreindividusgenèticamentidèntics.ellaboratoritambé

vamostrarquelessignaturesmutacionalsenclústerenmésde1.000tumorshumansespodenutilitzar

peraidentificarelsmecanismesmolecularsquecausenmutacions,entreelsqualshihaeldescobriment

d’unnouprocésmutacionalquedirigeixlesmutacionsperactivargensentumorsassociatsambl’expo-

sicióacarcinògens,entreelsqualshihaelconsumd’alcohol.ellaboratorideLuisSerranovacontinuar

desenvolupant la pneumònia per micoplasmacoma“xassísterapèutic”.tambévanpublicarl’estructuradel

cromosoma Mycoplasmaaunaresolucióde10kbivanferservirmutagènesisaleatòriesiseqüenciació

profundaperdeterminarseqüènciesclauderegionspromotoresino-transcritesqueinflueixenenl’eficàcia

detranscripcióitraduccióenaquestbacteri.ellaboratorideMaraDierssenvaprosseguirelstreballsper

comprendreelscanvisenl’arquitecturaneuronalienlaconnectivitatqueinterrompenlafunciócorticali

hipocàmpicaenelstrastornsgenètics.tambévanassenyalarquelainfusiódeneurotrofina-3rescatael

dèficitd’extinciódelaporenunmodelderatolídeporpatològica.ellaboratorideManuelIrimiahapublicat

labasededadesmésexhaustivad’esdevenimentsd’empalmamentalternatiusaparegudafinsara.elma-

teixlaboratorivaaclarir,també,elpaperil’evoluciódelsprogramesd’empalmamentdependentsd’esrpen

lamorfogènesi.Amés,caracteritzantmolecularmenteldesenvolupamentdeltubneuraldelsamfioxs,van

presentarunnoumodelimportantperal’organitzacióil’evoluciódelcervelldelsvertebrats.

Comareconeixementdelsseusèxits,ManuelIrimiavaserelegitjoveinvestigadord’eMBo,BenLehner

vaserelegitmembred’eMBoiMaraDierssenvarebrelamedallaBigVangielpremitrifermedal’impacte

social en salut.

Ben lehnerCoordinador en funcions


finalment, nick stroustrup es va incorporar al programa com a cap de grup júnior. el laboratori de di-

nàmicadelssistemesviusdeStroustrupdesenvoluparàmètodesexperimentalsicomputacionalsper

caracteritzaron,quan iperquèté lloc l’envelliment idequinamanerapodríem intervenireficaçment

enlasevaprogressió. MentrevaseraHarvard,Stroustrupdesenvolupavala ‘MàquinaLifespan’,que

permet que els investigadors rastregin desenes de milers de nematodes al llarg de tota la vida, i això

hovautilitzarperdescobrirunalleipotencialuniversalsobrelamaneraenquèlesintervencionsalteren

l’esperançadevida.nickStroustrupcontinualestradicionsdelprogramad’acollirgrupsambunapers-

pectivad’enginyeriaigrupsqueabordenunapreguntabenformuladadesd’unaperspectivamoltoriginal

(ortogonal). Benvingut, nick!

SERvEIS CIEnTIfICoTèCnICSelsServeisCientificotècnicsestàformatactualmentpersetunitatscientificotècniques:Genòmica,Proteòmi-

ca,MicroscòpiaÒpticaAvançada,CribratgeBiomolecularitecnologiadeProteïnes,Citometriadeflux(fACS),

Bioinformàticaienginyeriadeteixits.elprogramatambéinclouelServeid’HistologiailaUnitatd’emmagat-

zematgeiComputació,onnoméspodenaccedirelsusuarisdelPRBBielsusuarisinterns,respectivament.

totes aquestes unitats treballen per a implementar noves tecnologies i aplicacions com a resposta tant

a les necessitats dels usuaris com a les futures orientacions en els seus respectius camps. les noves

tecnologiesmésdestacablescreadesel2017inclouen:

• Aïllamentdevirusúnicpercitometriadeflux(peralagenòmicad’unvirusúnicil’estudidelavirosferamarina)

• Identificacióiaïllamentdevesículesextracel·lularspercitometriadefluxperal’estudidelacàrregade

les vesícules

• Generaciód’epitelimucociliarpseudoestratificatapartird’epitelibronquialhumànormaliepitelipig-

mentatderetinaapartirdecèl·lulesembrionàrieshumanes

• origenicultiudelsorganoidesintestinals

• noufluxdetreballperal’esclarimentdelscomplexosproteicsilescaracterístiquesestructuralsque

utilitzenreticlesquímics

• Protocolperalacorrecciód’errorsdelecturadeseqüenciacionsperapermetreunaaltasensibilitatde

la detecció de mutacions

• Protocoldedisminuciódeglobinaapartirdemostresd’ARnensangdurantunapreparaciónormalde

labibliotecad’ARnm

• Implementaciódelamajoriadecircuitsdebioinformàticaestàndardsanextflow

Pertaldepreveurelesnecessitatsfuturesdelarecercaenciènciesdelavida,tambéestemtreballant

peraunamajorintegraciódelesinstal·lacionsmitjançantlaimplementaciódenovesmetodologiesde

serveiscreuatsquerequereixenlacol·laboraciódediversesunitats.enparticular,estemtreballanten

enginyeriagenòmicaambCRISPR/Cas9directamentenembrions,desxifrantelproteomadelesvesícu-

lesextracel·lularsogenerantunconjuntcompletd’enzimsproduïtsinternamentperalapreparacióde

labibliotecadel’nGS.

Amés,centremelsnostresesforçosenlacol·laboracióamblaindústriaperal’exploraciótecnològica.

L’any2017,vamrealitzarlaprovad’aplicaciódeldarrerobjectiuSteDdeLeicaivamorganitzardiversos

esdevenimentsd’exploraciópertald’avaluarlesúltimestecnologiesdelmercat.

Lesinstal·lacionsbàsiquesdelCRGnonomésestanbenestablertesanivelllocal,ambusuarisprocedents

de diferents institucions espanyoles, sinó que compta també amb socis reconeguts en iniciatives

europees.LaunitatdeMicroscòpiaÒpticaAvançadaformapartdelainiciativaeuroBioimaging(euBI)de

l’eSfRIielseucap,timoZimmerman,éscoordinadornacionaldetècniquesd’imatgebiològica.Lesunitats

deGenòmicaiProteòmicasónmembresdelMeRIL,elconsorcid’infraestructuresderecercaeuropees,que

inclouinstal·lacionsrellevantsanivellinternacional(elCRGésl’únicainstal·laciódeproteòmicaaespanya).

elsServeisCientificotènicssónmembresdelaCore Facilities Excellence Alliance “CoreForLife” (www.coreforlife.

eu),talcomesdescriualasecció“Dimensiónacionaliinternacional”,dinsdels“DestacatsInstitucionals”.

MònicaMoralesCap




Cnag-CRgL’any2017,elCnAG-CRGhaconsolidatencaraméslasevaposició.LaintegraciódelaUnitatdeGenò-

micadelCRGenshapermèsreorganitzarlesactivitatsil’instrumental.AixíelCnAG-CRGsecentraràen

les aplicacions de gran qualitat i alt rendiment, mentre que la Unitat de Genòmica del CRG se centrarà

mésenaplicacionscomaralaseqüenciaciódemicroARniChIP.Juntshemcontinuatelnostrefullde

rutaestratègicpertald’oferirelmillorsuportpossiblealsnostrescol·laboradorsperalsseusprojectesde

recerca.Continuenessentd’especialatenciólesàreesderecercaentorndelpacient,comaraenmalal-

tiesraresicàncer.Desdelpuntdevistadelesaplicacions,hemampliatlanostraexperiènciaenl’anàlisi

monocel·lular,l’epigenòmica,lestècniquestranslacionalsilaintegraciódelainformaciódepoblacions.

Hemdesenvolupatencaraméslesnostrescapacitatsanalítiquesavançades.

aquest any ha estat testimoni de grans assoliments. el nostre sistema de qualitat, que funciona con-

formemental’ISo17024:2005dinsdel’àmbitd’anàlisid’ADn/ARnmitjançantlaseqüenciaciómassiva

(nGS) i lacertificació ISo9001:2015emesaper l’entitatnacionald’Acreditacióespanyola (enAC),ha

superatlesprovesdereacreditacióirecertificaciódeformabrillant.Amés,desprésd’unprogramade

formaciórigorós,elCnAG-CRGhaesdevingutelprimercentreeuropeuqueobtéelprogramadePres-

tadordeServeiscertificatdeRocheperaSeqCapeZtargetenrichmentSystems.estemafegintnoves

acreditacionsquefacilitaranlacol·laboracióambelsserveisclínics,concretamentpensantenlamedi-

cinapersonalitzada.

el2017vamincorporarunsegonHiSeq4000d’Illuminaivamretiraralgunsdelsinstrumentsdese-

qüenciaciómésvellsquehavienarribatalafidelavidaútil.S’haninvertitmolsesforçosenlareso-

luciódeproblemestècnicsinherentsalsinstrumentsdeseqüenciaciómésnousd’Illumina,elsquals

funcionenambcel·lesdefluxmodelades.S’hainclòsunamodificacióinnovadoraenelsprotocolsde

seqüenciació que permet gestionar aquest problema. en els seqüenciadors Oxford nanopore hem

aplicatunaseqüenciaciódirectadel’ARnqueobrealgunesviesinteressantsperaprojectesderecer-

ca.elsseqüenciadorsoxfordnanoporehanesdevingutuninstrumentmoltfiableiimportantenels

projectes de muntatge de novo.

LaplataformaRD-ConnectGenome-PhenomeAnalysisPlatform(GPAP),creadaalCnAG-CRG,s’hapo-

satadisposiciódelsinvestigadorsdel’europeanInternationalRareDiseaseResearchConsortium.Ja

disposademésde400usuarisis’hautilitzatenmoltsprojectesderecercasobremalaltiesrares.Va

resultaressencialperalaconvocatòriadelsBBMRI-LPC,enlaqualesvanseqüenciar900exomes.en

laRD-ConnectGPAPesvananalitzardadesiesvantransferirmostresbiològiquesal’eurobiobank.toti

queRD-Connects’estàacabant,elCnAG-CRGestàreforçantlasevafuncióenl’àmbitdemalaltiesrares

ambprojectesimminentscomaraSolve-RD.L’any2017,mésdelameitatdelesmostresdepacients

analitzadesvanpropiciaridentificacionsdegensdemalalties.

L’equipdeGenòmicaMonocel·lularhadescobertunamaneradecriopreservarmostresbiològiquessen-

secomprometreelsperfilsd’expressiógenèticacomparant-losamblesmostresacabadesdeprocessar

anivellmonocel·lular.Un resultatquehasuposatunpuntd’inflexióperquè l’úsde lacriopreservació

influeixradicalmentenl’accessibilitatalesmostres.Amés, l’equipparticipaactivamentenelHuman

CellAtlas,quepreténconstruirunacol·lecciódemapesquedescriuranidefiniranlabasecel·lulardela

salut i la malaltia.

Lamedicinapersonalitzadajaésgairebéaquíil’anàlisidelgenoman’ésl’einaprincipalperquèproporci-

ona una resolució sense precedents per al diagnòstic dels pacients. el 2017 es van iniciar naGen1000,

unprojectepilotrealitzatambnavarrabiomedifinançatpelServicionavarrodeSalud-osasunbidea,idos

projectespilots(MedPerCaniURDCat)dutsatermejuntamentambdiferentshospitalsdeBarcelonai

finançatspelPeRISdelDepartamentdeSalutdelaGeneralitatdeCatalunya.Aquestsprojectesprete-

nenintroduirl’anàlisigenòmicaenlapràcticaclínicaperalbeneficiimmediatdelspacients.Pensanten

el futur, resulta clar que el CnaG-CRG desenvoluparà una funció clau en la implementació de la medicina

personalitzadaen l’atenciósanitària.Lanostraplataformadeseqüenciació, lasofisticacióen l’anàlisi

dedadesibasesdedadesperquèlesdadesgenòmiquessiguinmésfàcilsd’utilitzarenssituenenuna

posició privilegiada per donar suport a aquesta tasca monumental.

ivo GutDirector


aRXIU EURoPEU dE gEnoMES I fEnoMES (Ega)L’eGAésunserveiperal’arxiupermanentipercompartirtottipusdedadesgenètiquesifenotípiques

personalment identificables resultatdeprojectesde recercabiomèdica.Lesdades recollidesa l’eGA

provenendepersoneselsacordsdeconsentimentdelesqualsautoritzalasevapublicaciónomésper

aunúsespecíficenrecercaoperl’úsd’investigadors‘bonafide’.estrictesprotocolsdeterminencomla

informacióesgestiona,s’emmagatzemaiesdistribueixperpartd’eGA.

Desdelseullançament, investigadorsd’arreudelmónhandepositat iacceditalesdadesdemésde

1,000estudisdediversostipusal’eGA.Aquestsestudisvariendesd’experimentsdegenotipacióagran

escalabasatsen“arrays”sobremilersdemostresenestudisdedissenydecasosicontrolsoestudis

de població, a estudis basats en la seqüenciació dissenyats per comprendre canvis en el genoma, el

transcriptomaol’epigenomatantenteixitsnormalscomendiversesmalaltiescomaraelcàncer.Coma

resultat,l’eGAhapassatdetenirunvolumdedadesd’uns50tBa3.500tBdurantelsdarrerscincanys.

L’equipdel’eGAestàimplicatendiversesiniciativesiprojectes,comaragarantirl’emmagatzematgeila

distribuciódedadeshumanespersonals;analitzarlesrelacionsentregenomesifenomes;imedicina

evolutiva.Alhora,l’eGAéselprojectedirectordelaGlobalAllianceforGenomicsandHealth(GA4GH);és

elRecursCentraldeDadesenelmarcdelprojecteeLIXIR,d’importànciafonamentalperalacomunitat

delesciènciesdelasalutilapreservacióallargterminidedadesbiològiques;itétambéunpaperrelle-

vant en els projectes exCeleRate (H2020).

JordiRamblaCap en funcions

investigadors eRC al CRG

Roderic Guigó

MiguelBeato

Ben lehner

fyodor Kondrashov

JuanValcárcel

toni Gabaldón

toni Gabaldón

luis serrano

Guillaume filion

Gian Gaetano tartaglia elvan Boke

thomas Graf

ManuelMendozaManuelIrimia

JamesSharpe

Marc Marti-Renom (CnaG-CRG)

STaRTIng gRanTS

advanCEd gRanTS

SynERgy gRanT

ConSolIdaToR gRanTS


(*) nota: les dades globals inclouen les dades del Cnag-CRg. El Cnag-CRg forma part del CRg des de l’1 de juliol de 2015.

Dades i xifres *


publicacions

finançament(M€)

projectes

publicacions totals

projectes i xarxes actius totals

ajuts postdoctorals actius totals

projectes europeus Coordinats actius totals

pressupost total

finançamentextern concedit el 2017

CRG

són projectes eRC actius (16beneficiariseRC)

són altres projectes de recerca i xarxes H2020 actius

són projectes europeus coordinats actius

són projectes de recerca internacionals actius (no Ce)

CnaG

publicacions en Accésobert

publicacions 1r Quartil Mitjanafactord’Impacte225

124 19

7

42,6

34,4

12

18

7

11

8,2

70% 89% 8,8

Nota: Aquest gràfic inclou els fons competitius aconseguits durant el 2017 i pendents de resolució final o del conveni de l’ajut a 31/12/2017.

Públic-Nacional: 40% - 9,3

Públic-Europa: 27% - 6,3

Vendes Externes: 23% - 5,3

Privat-Filantròpic i Patrocinis: 3% - 0,6

Públic-Regional: 5% - 1,1

Públic-Internacional: 2% - 0,4

Privat Transferència de Tecnologia: 1% - 0,3

total23,3


personal

total

PERSonal ToTal

InTERnaCIonalITaT

498* * EJC, equivalent jornada

completa: 482

a 31 de desembre de 2017

total

nacionalitats representades

CapsdeGrup+Capsd’Unitat estudiants de Doctorat

Investigadors/esPostdoctorals total personal de Recerca

total total total

PRogRaMES dE RECERCa

SERvEIS CIEnTIfICoTèCnICS

adMInISTRaCIó I SUPoRT CIEnTífIC

gRUPS dE RECERCa

CRG

CRG CnaG-CRG

CRG CRG CRG

CnaG-CRG CnaG-CRG CnaG-CRG CnaG-CRG

324

41

60% 50%

70% 60%

98 76 28296

419 79

51 72 26

28 47 4 2

Categories de Recerca edat

Staff Scientists 3%

Investigadors/es Postdoc. 41%

Caps de grup 11%

Caps d’Unitat 5%

Estudiants de doctorat 40%

>50 anys 20 (4%)

40-50 anys 111 (22%)

30-40 anys 263 (53%)

<30 anys 104 (21%)


Gènere

Caps de grup Caps d’Unitat Staff Scientists Investigadors/es Postdoctorals

Estudiants de doctorat

36%

Sol·lICITanTS En PRoCESSoS dE SElECCIó

donES PonEnTS ConvIdadES

CANdIdATS/ES SElECCIoNATS/dES EN

PRoCESSoS dE SElECCIó

donES PER CaTEgoRIES PRofESSIonalS

Dones DonesHomes Homes

947 34965 2949.5% 54%50.5% 46% Una millora de gairebé el 4%

comparat amb 2016

esdeveniments

Simposis/CongressosInternacionals Seminarisd’Altnivell10 151

29% 29% 57% 46% 52%


Desenvolupament de tecnologia i negoci

novestecnologiesidentificades enprocésd’avaluació

acords signats amb empreses i inversors el 2017

ProjectesGestionatsenProcés deValorització

spin-offs (Microomics)

priority pCt national phases

30

34 7 1

2 1 3PaTEnTS

formacióAvançada

tesis CURsOs CientífiCs

CoURSeS@CRG CURSoSD’InnoVACIóCoMPetènCIeStRAnSfeRIBLeSIDeSenVoLUPAMent

pROfessiOnal

tesis Doctorals llegides Cursos interns Cursos externs participants

Cursos internacionals

Cursos

Cursos interns

participants* participants

participants

23 11 5 300

7 2 11

147 22276

*32 països diferents


Relacions amb els mitjans

XaRXes socials

Divulgació i eDucació científiques

Comunicació,divulgacióieducaciócientífiques

AparicionsenMitjans

Activitatsorganitzades (en 39 categories

d’activitatsdiferents)

PúblicBeneficiaritotal

escoles i estudiants

públic General

@CRGenomica CRG‘M’agrada’alapàgina Visualitzacions Canal

@cnag_eu CnaG-CRG

escrits Online Blogs

Ràdio tv

2.567

237 13.807

9.176

4.631

8.761 3.0253.299 142.535

1.653 1.393

272 1.985 276

19 15

SEgUIdoRS TwITTER SEgUIdoRS lInkEdIn faCEbook yoUTUbE


Informefinancer


Origen i Destinació dels Recursos Operatius Gestionats

oRIgEn RECURSoS oPERaTIUS En MIlIonS d’EURoS

dESTInaCIó RECURSoS oPERaTIUS En MIlIonS d’EURoS

0,12Ingressos financers

0,3%

17,4finançament Extern

44%17,1

finançament basal

43%

5,3Serveis

13%

oRIgEn RECURSoS oPERaTIUS

39,9

1,3altres

3%

30,6Recerca i Serveis Cientificotècnics

77%

3,4administració

9%4,6

lloguer i Manteniment Infraestructura

11% dESTInaCIó RECURSoS oPERaTIUS

39,9


Agraïments


MembresdelPatronat

finançadorspúblics

finançadorsPrivats

obRa SoCIal “la CaIXa”LafundacióBancària“laCaixa”dónasuportadiversesiniciativesclaualCRG,comaraelProgramaInternacio-

naldeDoctoratdesdel2008ialtresactivitatscientífiquesidedivulgaciódesdel2014:l’associacióentreelCRG

ieleuropeanBioinformaticsInstitute(eMBL-eBI)peragestionarconjuntamenteleuropeanGenome-phenome

Archive(eGA),ilaprimerainiciativadeciènciaciutadanadelCRG‘treulaLlengua’(‘SacalaLengua’).Alaprime-

rameitatde2016,lafundacióvadecidirfinançargenerosamentlasegonaedicióde‘treulaLlengua’,que

vacomençaral’octubrede2016.Durantel2017,elprojectevaorganitzarelsegon‘tour’anivellespanyol,

abordantnousreptes,assolintnouspúblicsobjectiuirecollintmostresdecol·lectiusdiferentsipacients

de diferents malalties.

elsuportdelsnostrespatrons,ifinançadorspúblicsiprivatsésclauperaaconseguirlamissió delCRGdecaraadescobririferavançarelconeixementenbeneficidelasocietat,lasalutpúblicailaprosperitat econòmica.

Els fons FEdER i FSE han estat instrumentals en els últims anys a través de diferents esquemes de finançament i en una varietat d’activitats en suport de la nostra recerca i per mantenir les nostres infraestructures en l’avantguarda de la tècnica. Per a més detalls sobre els projectes cofinançats amb aquests fons, visiteu la secció ERdF ANd ESF FUNdS AT THE CRG (www.crg.eu/en/content/erdf-and-esf-funds-crg) al web del CRG.

http://www.crg.eu/en/content/erdf-and-esf-funds-crg


fUndaCIón boTínLafundacióBotín,atravésdelasevaàreadeciència,iencol·laboracióambl’oficinadeDesenvolupa-

mentdenegoci itecnologiadelCRG,promou la transferènciaalmercatdels resultatsde la recerca

produïdaalslaboratorisdelDr.JuanValcárcel(finsel2016)ielDr.LuisSerrano(2007-2013)almercat.

Hofanproporcionantrecursoseconòmicsidegestióperaidentificarideesprometedoresiresultatsen

unaetapainicial,avaluant-neelpotencialilamillorformadeprotegir-losatravésdelsdretsdepropietat

intel·lectualiindustrial,icercantelssocistecnològicsiindustrials,oelsinversors,perfacilitarl’entrada

delestecnologiesoelsproductesenelmercatpelbeneficifinaldelasocietat.

fUndaCIón RaMón aRECESLafundacióRamónArecesoferíunfinançamentdetresanysperaunjoveinvestigador/apostdoctoralde

gran talent per fer recerca al CRG. la investigadora postdoctoral seleccionada en una convocatòria com-

petitivavaserlaXianghuaLi,quetreballàallaboratoridelDr.BenLehnerfinsalprimertrimestrede2017.

fUndaCIó CaTalUnya-la PEdRERala fundació Catalunya-la pedrera dóna suport a les activitats de formació professional per als estu-

diantsjovesiambtalentperfomentarelseuinterèsperlaciènciaiemprendreunacarreracientífica.

Lesactivitatsprincipalsinclouenestadesd’estiucientífiquesaMónnaturaPirineusialCRG,onels

estudiantsprenenpartenlessessionsiesdevenimentsal’entorndetemescientíficsambl’objectiude,

finalment,proposaridesenvoluparlasevapròpiaideadeprojecte.Desdel2016,elCRGtambéésun

dels instituts que acull estudiants de la Barcelona international youth science Challenge (ByisC), un

programainternacionald’excel·lènciadedossetmanesal’estiuquebuscaestimulareltalentcientífic

entreelsjovesdetotelmónifomentarelseuentusiasmeperdesenvoluparunarecercacientíficaiuna

carreraenl’àmbitdelaciència.

FUNdACIÓ MARATo TV3elfundacióMaratótV3finançadiversosprojectesd’investigaciódirigitsperinvestigadorsdelCRGre-

lacionatsamb lesdiferentsedicionsde lamarató televisiva: tresprojectesde l’edicióde2012sobre

“Càncer”(thomasGraf,PiaCosmaiSusanadelaLuna),dosprojectesdel’edicióde2013de“Malalties

neurodegeneratives” (fátimaGebauer iLucianoDiCroce),unprojectede l’edicióde2014sobre “Les

malaltiesdelcor”(GianG.tartaglia)idosprojectesdel’edicióde2016sobre“Lesionsmedul·larsicere-

bralsadquirides”(MarcMartí-RenomiMaraDierssen).

novaRTISnovartismantéunaextensacol·laboracióambelCRG.De2003a2016,l’empresadonàelseusuporta

l’organitzaciódelssimposisanualsdelCRG,itambévafinançarunabecaanualperainvestigadors/es

postdoctorals en el camp de la genòmica entre el 2004 i el 2012. al 2012, es va crear el nou programa

demobilitatCRG-novartis-Àfricaperavançarenrecercabioinformàtica,genèticaigenòmicaal’Àfrica,

acompanyantcientífics/quesafricans/esjovesiprometedors/es.elprogramapermet,anualment,acollir

finsaquatreinvestigadors/esenestadisprimerencsdelasevacarreraprocedentsd’universitatsafrica-

nes,perrealitzarunaestadade6mesosalCRG,iduratermeelseuprojectederecercasotalasupervisió

d’un/ainvestigador/aprincipaldelCRG.

aXa RESEaRCh fUndLa“CàtedraAXAdePredicciódelRiscenmalaltiesrelacionadesambl’edat”vasercreadael2014perunperí-

odede15anysambunadotaciód’unmiliód’euros.elDr.BenLehnervasernomenatprimertitulard’aquesta

càtedrapercontinuarlasevatascaeneldesenvolupamentd’unamedicinapersonalitzadaqueofereixiales

persones una millor protecció davant dels riscos únics que encaren en malalties com el càncer. al 2017, el

Dr.BernhardPayervasernomenatelsegontitulard’aquestacàtedraperunperíodede3anys.


fondaTIon JERoME lEJEUnELarelacióentreelCRGilafundacióJeromeLejeunevacomençarfamoltdetemps.Handonatsuport

adiversesdelesiniciativesderecercadeMaraDierssenvinculadesamblaidentificaciódelesbases

molecularsigenètiquesendiversespatologiesacompanyadesderetardmental:lasíndromedeRett,

lasíndromeXfràgil, lasíndromedeWilliam-Beureni lasíndromedeDown.Dierssentambévarebre

elprimerPremiInternacionalSisley-JeromeLejeuneel2010.Al2016,atorgarenunabecaalprojecte

d’eduardSabidóenl’elucidaciódelmecanismed’acciódel’epigalocatequina-3-gal·latcomaagentte-

rapèuticenelfenotipcognitiuenmodelsderatolinsambsíndromedeDown(2015-2017).Mésrecent-

ment,al2017,alaMaraDierssenlifouconceditunnouprojecte,titulat‘GeneradordelCanviepiGenètic

enSíndromedeDown’(2017-2019).

aECCenelsdarrersanys, l’AssociacióespanyolaContraelCàncer (AeCC)hadonatsuportaunasèriede

projectesiiniciativesderecercapercientíficsdelCRG.el2015,PedroVizán(allaboratorideLucianoDi

Croce)varebrelaBecadeRecercaoncològicadel’AeCCperaunprojectequepreténidentificari“atacar”

lescèl·lulesmareimplicadesenelcàncer,quefinalitzaràel2019.

ZIMIn foUndaTIon Gràcies a la zimin foundation, es va celebrar a Barcelona, durant dos anys consecutius (2016 i 2017),

laSchoolofMolecularandtheoreticalBiology(SMtB),organitzadapelnostreinvestigadorfyodorKon-

drashov.LaSMtBvareunir,duranttressetmanesal’agost,vuitantaestudiantsd’ensenyamentsecun-

dariambtalent i intel·lectualment inquiets,ambdestacatscientíficsdetotelmón,totsellstreballant

plegatsenexperimentscientíficsrealsquepodrienaportarresultatsinnovadors.elsestudiantsvandedi-

carelstresprimersdiessimplementadescobrirelsdiversoslaboratorisqueparticipenenelcursd’estiu

perquèposteriormentpoguessintriarelprojectecientíficqueelsinteressés.Comaactedecloenda,els

estudiants van preparar una sessió de pòsters per presentar els resultats dels projectes desenvolupats

durant les setmanes anteriors.

fUndaCIó bbva a la convocatòria 2016 de les Beques de la fundació BBva per a investigadors i creadors culturals, neus

Martínez,delgrupdeJamesSharpe,vaserguardonadaambunajutperalseuprojectederecercatitu-

lat“non-InvasivefacialBiomarkersofMentalDiseases”.L’objectiudelprojecteeracrearunaaplicació

d’anàlisiimodelatgefacialambvalordediagnòsticipronòsticdemalaltiesmentalsrelacionadesamb

alteracionsgenètiquesdelDYRK1Aitambétraduïblesaaltrestrastorns.

ThE vElUX foUndaTIonSLesfundacionsVeluxestanfinançantelprojectederecercatitulat“RegeneratingPhotoreceptorsinRe-

tinitisPigmentosa”,de lanostraPIPiaCosma.Laretinitispigmentosa(RP)ésunamalaltiagreuque

afectaunadecada3.500persones,lesqualspateixenunapèrduaprogressivadelavisióiperalaqual

nohihacapcuraactualment.L’objectiudelprojecteesposaraprovalareprogramaciómediadaperfusió

cel·lularcomateràpiaenratolinsrd10,unmodelderatolíambRP,ambl’objectiufinalderegenerarels

fotoreceptors i assolir el rescat funcional de la visió.

SwISS naTIonal SCIEnCE foUndaTIonLaSnSfestàfinançantactualmentunprojectedelnostrePIJamesSharpetitulat“Reaction-diffusion

networks underlying pattern formation of lymphoid tissue”. el projecte explora els diversos escenaris

possibles de formació de patrons en el teixit limfoide.


patrocinadors

fUndaCIón ESPaÑola PaRa El foMEnTo dE la InvESTIgaCIón dE la ESClERoSIS laTERal aMIoTRófICa (fUndEla) el nostre investigador principal luciano Di Croce va rebre un ajut de fUnDela el novembre de 2017 per

abordarlaidentificaciódenovesdianesterapèutiquesperaltractamentdel’eLA,emprantelcribratge

defactorsepigenètics.

glEnn foUndaTIon foR MEdICal RESEaRCh LaGlennfoundationfinançaactualmentelprojecte ‘temporalscaling inC. elegansaging’,delnostre

InvestigadorPrincipalnicholasStroustrupfinsal’octubrede2018.

ThE baRCElona InSTITUTE of SCIEnCE and TEChnology (bIST)el BISt contribueix a diverses iniciatives actives al CRG. en primer lloc, co-financia 2 beques fI de

l’AGAURalslaboratorisdelsInvestigadors/esPrincipalsPiaCosmaiRodericGuigódurantquatreanys.

D’altrabanda,dosprojectesdelaprimeraConvocatòriaIgnitedelBIStvanésserconceditsainvestiga-

dorsdelCRG.elprimervaserperalaVictoireneguembor(laboratoriPiaCosma)iestitula‘‘GenStorm

anintegratedapproachtovisualizeandmodelthespatialconformationofgenesatthenanoscalelevel’

(març-novembre2017).elsegonvaserperenIshierRaote(laboratoriVivekMalhotra),pelseuprojecte

‘‘enlighteningtAnGo’(març-novembre2017).

visita la versió completa a: annualreport2017.crg.eu

http://annualreport2017.crg.eu

Membres del Patronat:

Membre de:

Centre de Regulació Genòmica

Edifici PRBBDr. Aiguader, 8808003 Barcelona, Espanya

Tel.: +34 93 316 01 00Fax +34 93 316 00 99

[email protected]://www.crg.eu

Visita la versió completa de la Memòria Anual 2017: annualreport2017.crg.eu

http://www.crg.eu

http://annualreport2017.crg.eu

Memòria Anual - CRG Annual Report 2017 · 2018-07-26 · institute a israel, que arribarien al CRG...

Documents

Transcript of Memòria Anual - CRG Annual Report 2017 · 2018-07-26 · institute a israel, que arribarien al CRG...