Microscopía de imágenes FTIR en Investigación Clínica. · Medida de la concentración Análisis...

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Microscopía de imágenes FTIR en Investigación Clínica.

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Microscopía de imágenes FTIR en

Investigación Clínica.

Agenda

Introducción

- Fundamentos FTIR y Microscopía IR

- Soluciones Instrumentales de Agilent

Ejemplos de Aplicación en Área Clínica

Io I

H

O

H

H

O

H

H

O

H

H

O

H

Introducción. Espectroscopía IR

La energía IR produce vibraciones moleculares

Cada tipo de enlace químico, vibra a una frecuencia específica

de manera natural

Cuando la frecuencia de la luz IR alcanza la frecuencia de

vibración del enlace, se produce la absorción

La cantidad de energía absorbida es proporcional a la fortaleza

del enlace

En conjunto de absorbancias IR para una muestra, está referida

como su espectro IR

El espectro IR de una muestra es una gráfica de la cantidad de

energía IR (eje y) que es absorbida a determinadas frecuencias

(eje x) en la región IR del espectro electromagnético.

4000 3500 3000 2500 2000 1500 1000 500

Wavenumber (cm-1)

Ab

so

rba

nc

e

1500 2000 2500 3000 3500 4000

Wavenumbers (cm-1)

1000

Cada muestra tiene un espectro IR único; de manera

que un espectro IR puede servir como una huella

dactilar de un compuesto.

Introducción. Espectro Infrarrojo

4000 3000 2000 1000

0.30

0.25

0.20

0.15

0.10

0.05

0.00

Wavenumber (cm-1)

Ab

so

rban

ce

3300 cm-1

N-H Stretch 2900 cm-1

C-H Stretch

1750 cm-1

C=O Stretch

1540 cm-1

N-H Bending

Interpretación de espectros IR

La frecuencia que absorben los grupos fucionales corresponden a la fortaleza del enlace, cuanto más fuerte es el enlace, absorbe a frecuencias más altas, y viceversa.

Cada grupo funcional absorbe a una determinada frecuencia, de manera que es posible elucidar la estructura química del material con su espectro IR.

Interpretación de espectros IR

Información cualitativa y cuantitativa

• Búsqueda en librerías

Identificación de muestras

desconocidas

Control de calidad de producto

terminado, materia prima, etc

Identificación Estructural

Un compuesto químico puede ser identificado mediante la

búsqueda en librerías comerciales o generadas por el usuario

La calibración permite predecir la

concentración mediante espectros IR

IR spectral overlay of turbine oil 5-4300ppm

3900 3700 3500 3300 3100

0.24

0.16

0.08

0.00

-0.08

Wavenumber

Ab

so

rban

ce

Concentración por

FTIR • Cuantificación

Medida de la concentración

Análisis de aceites, fuel, etc.

Portafolio Agilent en FTIR.

Exoscan/Flexscan 4500/5500t FTIR FTIR 630

FTIR 660 / 670/ 680 Microscopio 610/620

Microscopía Infrarroja - Introducción

Para qué utilizamos la Microscopía Infrarroja:

• Permite al usuario ver muestras muy pequeñas (tamaño de micras)

• Obtener espectros infrarrojos muy precisos en esas muestras

pequeñas

Modos de Medida

1. Single point – Análisis Puntual

2. Mapping

• Single point

• Linear Array

3. 2-D Focal Plane Array (FPA) Imaging

Modos de Medida

1. Single point – Análisis Puntual

2. Mapping

• Single point

• Linear Array

3. 2-D Focal Plane Array (FPA) Imaging

Single Point - Análisis puntual (I)

Muestra Grande – 250x250 um

Se recoge 1 espectro de la zona de la muestra visualizada

Area total medida en rojo.

El espectro resultante es una media

de la composición de esa zona (hasta 250x250 um)

Apertura

250 um

Se recoge 1 espectro de la zona de la muestra visualizada

Cerramos la ventana de apertura al máximo para evitar interferencia de otras zonas, obtenemos el espectro de la zona roja

La resolución espacial típica es 10-20 micras, afecta el límite de difracción espacial.

50 um

Single Point - Análisis puntual (II)

Area pequeña – 50 x 50 um

Single Point – Análisis Puntual (III)

Ejemplo – Polímero laminado de 3 capas

Modos de Medida

1. Single point – Análisis Puntual

2. Mapping

• Single point

• Linear Array

3. 2-D Focal Plane Array

(FPA) Imaging

Mappping (I)

1: Mapping Single Point Adquisición automatizada de espectros

(uno a uno) definida con un grid a una

resolución espacial definida por una

máscara. Unos cientos de puntos

pueden llevar horas.

2: Mapping Linear array Adquisición de espectros a través de

una fila de detectores (1x16). Más

rápido que single point mapping, pero

mucho más lento que los sistemas de

imagen FPA.

Modos de Medida

1. Single point – Análisis Puntual

2. Mapping

• Single point

• Linear Array

3. 2-D Focal Plane Array (FPA) Imaging

¿Qué es Imagen en FTIR?

En cada posición de la imagen hay un espectro

En cada punto del espectro hay una imagen

La imagen en cada punto del espectro está definida por la química de la muestra

Imagen FTIR. 2-D Focal Plane Array (FPA) (I) Progresión de la técnica..

Mapping Single point

• 1 espectro/scan

• Movimiento de la muestra para crear el mapa

Imagen - 2-D Focal Plane Array (FPA)

• La imagen se recoge como una fotografía “snap shot”

• 1 segundo para recoger 4096 espectros (64x64 pixel FPA)

Mayor resolución espacial

Colección de datos mucho más rápida

Mayor sensibilidad

Mapping Linear Array

• 16 espectros/línea scan

• Movimiento de la muestra para crear el mapa

Imagen FTIR. 2-D Focal Plane Array (FPA) (II)

Análisis de muestras grandes

Mapping Linear Array En 20 min hemos analizado un 5% de

la imagen

Cary 620 Imagen Química En 20 min hemos analizado un 100%

de la imagen a una resolución espacial

de 5.5 um

Agilent 610-IR Microscope Single Element & Dual Single Element

Agilent 620-IR Microscope Infrared Imaging & Single Element

Microscopios Agilent 610-IR / 620-IR

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Diseñado específicamente para microscopía

IR, amplia gama de aplicaciones

Incorpora 1 o 2 detectores puntuales.

Actualizable a FT-IR Imagen

Compatible con FT-IR Agilent serie 600

Agilent 620-IR: Lo último en microscopía

FT-IR.

Sistema completo de imagen FT-IR con

detector bidimensional (FPA*) .

Un nuevo mundo de prestaciones y

aplicaciones en microscopía IR.

Agilent 610-IR Microscope Single Element & Dual Single Element

Agilent 620-IR Microscope Infrared Imaging & Single Element

APLICACIONES

Estudio de Procesos Biológicos a Tiempo Real

Comportamiento de la B-Lactoglobulina A frente a T

Conformaciones de la Lipogenasa en distintos medios orgánicos

Estudio de Tejidos Biológicos

Distribución celular y subcelular de un tejido de una planta

Estudios de investigación en la enfermedad de Alzheimer

Estudios de investigación en Cáncer

Estudio de Procesos Biológicos a Tiempo Real (I)

Con FTIR de imagen podremos caracterizar procesos biológicos

dinámicos como:

Plegamiento de proteínas

Transiciones de membrana en células

Monitorizar rápidamente cambios conformacionales

Para simular condiciones reales se emplean accesorios que permiten

controlar T, pH, condiciones atmosféricas durante el análisis de la

muestra

Se pueden estudiar procesos cinéticos en la escala de horas, minutos,

segundos, microsegundos o nanosegundos (Software para cinéticas)

Estudio de Procesos Biológicos a Tiempo Real (II) Comportamiento de la b-Lactoglobulina A vs T

- Muestra de β-lactoglobulina A (5% w/v) en un tampón fosfato deuterado a pH 8.6.

-Espectros a diferentes temperaturas enter 40 y 96 ºC.

-Estudio de los cambios en la estructura secundaria de esta proteína que permite investigar la

relación entre la estructura y su función.

Estudio de Procesos Biológicos a Tiempo Real (II) Comportamiento de la b-Lactoglobulina A vs T

El espectro decolvolucionado adquirido a 40 ºC, muestra siete bandas, cada una de ellas asignada a una

estructura secundaria: 1691 (â-type structure), 1677 (â-sheet), 1664 (turns), 1648 (á-helix), 1634 (â-sheet), 1622 (â-

strand), 1614 cm-1 (side-chain vibrations).

El calentamiento por encima de 76 °C resulta en la desaparación de las bandas a 1677, 1648, 1634, and 1614 cm-1

(denaturation) y la aparición de bandas a 1682 y 1617 cm-1 (atribuidas a formación de enlaces intermoleculares)

Estudio de Procesos Biológicos a Tiempo Real (III) Conformaciones de la Lipoxigenasa en diferentes medios

La lipoxigenasa es una enzima que cataliza la oxidación del ácido

linoleico y otros ácidos grasos insaturados a sus

correspondientes peróxidos (precursores de aromas).

Las modificaciones en la estructura secundaria y/o terciaria de

una enzima puede ser determinantes de la especificidad que

presenten.

Espectro IR de la Lipoxigenasa en

diferentes medios orgánicos

En cloroformo, metanol y acetonitrilo, muestra una

banda de absorbancia a 1617 cm-1 que indica la

agregación b-lámina de proteínas, lo que no se observa

en hexano ni octano.

Dado que la actividad óptima de la enzima se observa

en medio acuso y en medios poco polares como hexano

y octano, la agregación b se asocia a la inactivación de

la enzima.

Estudio de Procesos Biológicos a Tiempo Real (III) Conformaciones de la Lipoxigenasa en diferentes medios

Imagen Visual Imagen Química

Espectro IR de la reacción

Se emplea FTIR de imagen para estudiar la reacción de la lipoxigenasa con y sin un

sustrato (ac. linoleico) y su bioconversión al peróxido correspondiente.

D2O (Lipoxigenasa)

Interfase

Hexano (Ac linoleico)

Estudio de Tejidos Biológicos (I)

Heterogeneidad de un tejido Las imágenes por FTIR de imagen permiten determinar en este tejido de una planta

la distribución celular y sub-celular.

Para conocer esta distribución se obtienen las

imagenes químicas a :

•1650 cm-1 – distribución de proteínas

•1730 cm-1 – distribución de lípidos

•1050 cm-1 – distribución de carbohidratos

Estudio de Tejidos Biológicos (II)

Investigación de la Enfermedad del Alzheimer

Cerebro sano

Cerebro con Alzheimer

Ejemplo del estudio del tejido cerebral del hipocampo de un ratón. El FTIR de imagen permite detectar las placas (contienen proteinas b-amiloides) y ovillos (contienen

una proteína llamada tau) que parecen ser las responsables de los daños producidos en las neuronas

en el tejido enfermo.

Estudio de Tejidos Biológicos (II)

Investigación de la Enfermedad del Alzheimer Ejemplo del estudio del tejido cerebral del hipocampo de un ratón.

- Se recogen aproximadamente 100.000 espectros a alta resolución espacial (5.5 mm) de

una sección de un tejido de 1.4 mm x 2.2 mm.

En la imagen en 3-D se observan

la distribución en el contenido en

lípidos, basándose en la

absorbancia a 1734 cm-1

(correspondiente a grupos C=O)

En los espectros IR se observa

la diferencia en lípidos que

contiene la materia gris y la

materia blanca basado en los

cambios de los grupos CH2 y

CH3.

Esta tecnología permite estudiar

la composición química de

tejidos cerebrales y el desarrollo

de plaquetas asociadas a la

enfermedad de Alzheimer.

Estudio de Tejidos Biológicos (III)

Investigación de la Enfermedad del Cáncer Detección temprana del cáncer de próstata mediante base de datos espectrales de

tejidos en diferentes estados de la enfermedad.

Secciones de tejidos enfermos

observados al microscopio y

graduados según la escala de

Gleason (escala del 1 al 5 – 1

tumor bien diferenciado y poco

agresivo, 5 tumor escasamente

diferenciado)

Imagénes FTIR de muestras de 7 mm x 7mm

Estudio de Tejidos Biológicos (IV)

Investigación de la Enfermedad del Cáncer

Se emplean espectros representativos de tejidos en diferente estado de la enfermedad para

desarrollar un test sencillo y poder predecir su grado de avance.

Resumen

•La técnica de FTIR es una técnica sencilla, versátil, que no

requiere poca o ninguna preparación de muestra y nos permite

obtener información cualitativa y cuantitativa.

•Agilent ofrece a día de hoy un portafolio muy amplio capaz de

solventar prácticamente cualquier aplicación en FTIR.

•La Microscopía en FTIR nos permite analizar muestras de muy

pequeño tamaño. Con esta técnica podemos conocer por ejemplo

la distribución de diferentes componentes en una muestra

•La Microscopía de Imagen en FTIR con detectores FPA como

el Agilent 620, ofrece múltiples posibilidades en el área de

investigación clínica, como por ejemplo el estudio de patologías

como el Alzheimer o el Cáncer.