Solicitud de Ayuda para Proyectos debioinformatica.uab.cat/base/documents/ProyectoMICINN/... · Web...

Comisión Interministerial de Ciencia y Tecnología

Curriculum vitae

Nombre: Antonio Barbadilla Prados

Fecha: 15 de Enero de 2009

Apellidos: Barbadilla Prados Nombre: AntonioDNI: 46119735C Fecha de nacimiento : 16712/1961 Sexo: Varón

Situación profesional actual

Organismo: Universitat Autònoma de BarcelonaFacultad, Escuela o Instituto: BiocienciasDepto./Secc./Unidad estr.: Genética y MicrobiologíaDirección postal: 08193

Teléfono (indicar prefijo, número y extensión): +34 935812730Fax: +34 935812387Correo electrónico: [email protected]

Especialización (Códigos UNESCO): 2409-GENETICACategoria profesional: Profesor Titular de Universidad Fecha de inicio: 02/11/1994Situación administrativa

Plantilla Contratado Interino Becario Otras situaciones especificar:

Dedicación A tiempo completoA tiempo parcial

Líneas de investigación Breve descripción, por medio de palabras claves, de la especialización y líneas de investigación actuales.Genética de poblaciones, bioinformática, genómica, polimorfismo, divergencia, selección natural

Formación Académica

Titulación Superior Centro Fecha

LICENCIADO EN CIENCIAS (Sección Biología) UNIV. AUTÓNOMA DE BARCELONA 1985

LICENCIADO CON GRADO (Sección Biología) UNIV. AUTÓNOMA DE BARCELONA 1986

Doctorado Centro FechaDOCTOR EN CIENCIAS (SECCIÓN BIOLOGÍA) UNIV. AUTÓNOMA DE BARCELONA 1992

Actividades anteriores de carácter científico profesional

Puesto Institución Fechas

PROFESOR AYUDANTE UNIV. AUTÒNOMA DE BARCELONA 1-3-1987/30-9-87

PROFESOR ASOCIADO UNIV. AUTÒNOMA DE BARCELONA 1-10-1987/31-12-87


PROFESOR ASOCIADO UNIV. AUTÒNOMA DE BARCELONA 15-9-1992/7-1-93


BECARIO FULBRIGHT HARVARD UNIVERSITY 1-1-1993/30-10-94

PROFESOR TITULAR UNIV. AUTÒNOMA DE BARCELONA Desde el 02/11/1994

Idiomas (R = regular, B = bien, C = correctamente)

Idioma Habla Lee Escribe

INGLÉS C C C

CATALÁN C C C

FRANCÉS B C R

Participación en Proyectos de I+D financiados en Convocatorias públicas. (nacionales y/o internacionales)

Título del proyecto: Genética evolutiva de la adaptación en poblaciones naturales de especies cactófilas de Drosophila.

Entidad financiadora: CICYT PB85-0071Entidades participantes: UABDuración, desde: 1986 hasta: 1989 Cuantía de la subvención: Investigador responsable: Antonio Fontdevila VivancoNúmero de investigadores participantes:

Título del proyecto: Estudio de los componentes de adulto de la eficacia biológica en una población natural de Drosophila buzzatii.

Entidad financiadora: CIRIT (Generalitat de Catalunya), proyectos jóvenes investigadoresEntidades participantes: UABDuración, desde: 1989 hasta: 1990 Cuantiía de la subvención: Investigador responsable: Antonio BarbadillaNúmero de investigadores participantes: 1

Título del proyecto: Biología evolutiva de las poblaciones originales y colonizadoras de especies cactófilas de Drosophila.Entidad financiadora: CICYT PB89-0325Entidades participantes: UABDuración, desde: 1990 hasta: 1993 Cuantiía de la subvención: Investigador responsable: Antonio Fontdevila VivancoNúmero de investigadores participantes:

Título del proyecto: Análisis estadístico de los componentes de adulto de la eficacia biológica en una población natural de Drosophila buzzatii.Entidad financiadora: CIRIT (Generalitat de Catalunya), proyectos jóvenes investigadoresEntidades participantes: UABDuración, desde: 1990 hasta: 1991 Cuantiía de la subvención: Investigador responsable: Antonio BarbadillaNúmero de investigadores participantes: 1

Título del proyecto: ¿Qué nos dice realmente la variación electroforética de la variación proteica?Entidad financiadora: Beca Postdocotral MEC/Fulbright y NIH (GM 21179)Entidades participantes: Harvard UniversityDuración, desde: 1993 hasta: 1994 Cuantiía de la subvención: Investigador responsable: Richard LewontinNúmero de investigadores participantes:

Título del proyecto: Significado adaptativo del polimorfismo cromosómico. Entidad financiadora: DGICYT (PB93-0844)Entidades participantes: UABDuración, desde: 1993 hasta: 1995 Cuantiía de la subvención: Investigador responsable: Alfredo RuizNúmero de investigadores participantes:

Título del proyecto: Origen y evolución molecular de las inversiones cromosómicas de Drosophila buzzatii.

Entidad financiadora: DGICYT (PB94-0923)Entidades participantes: UABDuración, desde: 1966 hasta: 1998 Cuantía de la subvención: Investigador responsable: Alfredo Ruiz PanaderoNúmero de investigadores participantes:

Título del proyecto: Distribución de las tasas de recombinación locales causadas por conversión y entrecruzamiento a lo largo del genoma.

Entidad financiadora: DGICYT - PB98-0900-C02-021Entidades participantes: UABDuración, desde: 1999 hasta: 2002 Cuantía de la subvención: Investigador responsable: Antonio BarbadillaNúmero de investigadores participantes:

Título del proyecto: Proyecto acciones especiales de difusión de la Ciencia y la TecnologíaEntidad financiadora: MCYT (PB94-0923)Entidades participantes: UABDuración, desde: 2001 hasta: 2002 Cuantía de la subvención: Investigador responsable: Antonio BarbadillaNúmero de investigadores participantes:

Título del proyecto: Genómica comparada y funcional de Drosophila: causas y consecuencias de las reordenaciones cromosómicas naturalesEntidad financiadora: MCYT (BMC2002-01708)Entidades participantes: UABDuración, desde: 2002 hasta: 2005 Cuantía de la subvención: Investigador responsable: Alfredo Ruiz Panadero Número de investigadores participantes:

Título del proyecto: Proyecto de transferencia tecnología bioinformática.

Entidad financiadora: CIDEM, colaboración Fundación Empresa y Ciencia, UABEntidades participantes: UAB y eBiointelDuración, desde: 2002 hasta: 2002 Cuantía de la subvención: Investigador responsable: Antonio BarbadillaNúmero de investigadores participantes:

Título del proyecto: Association studies assisted by Inference and Semantic Technologies (ASSIST).

Entidad financiadora: Sixth Framework Programme. STRP: Integrated biomedical information for better health. FP6-IST-2004-027510.Entidades participantes: CERHT/ITI, UAB, hasta 12 entidadesDuración, desde: 1-1-2006 hasta: 31-12-2008 Cuantía de la subvención: 140 000€Investigador responsable: Pericles MitkasNúmero de investigadores participantes:

Título del proyecto: Patterns of nucleotide diversity in different functional regions of Drosophila and Chordates.

Entidad financiadora: MECEntidades participantes: UABDuración, desde: 1-10-2006 hasta: 30-9-2009 Cuantía de la subvención: 48 400€Investigador responsable: Antonio BarbadillaNúmero de investigadores participantes: 6

1

Publicaciones o Documentos Científico-Técnicos

1Nota: Si necesita más casos, añádalos utilizando las funciones de copiar y pegar con el 2º caso.

( CLAVE: L = libro completo, CL = capítulo de libro, A = artículo, R = “review”, E = editor,S = Documento Científico-Técnico restringido. )

Autores (p.o. de firma): Barbadilla, A. & H. Naveira.Título: The estimation of parental genotypes by the analysis of a fixed number of their offspring.

Ref. revista : Genetics LibroClave: A Volumen: 119 Páginas, inicial: 465 final: 472 Fecha: 1988Editorial (si libro): Lugar de publicación: USA

Autores (p.o. de firma): Santos, M., A. Ruiz, A. Barbadilla, J. E. Quezada-Díaz, E. Hasson & A. Fontdevila.Título: Larger flies mate more often in a natural population of Drosophila buzzatii.

Ref. revista: Heredity LibroClave: A Volumen: 61 Páginas, inicial: 255 final: 262 Fecha: 1988Editorial (si libro): Lugar de publicación: UK

Autores (p.o. de firma): Barbadilla, A.Título: La estructura de la teoría de la selección natural.

Ref. revista: LibroClave: CL Volumen: Temas actuales de biología evolutiva, A. Ruiz & M. Santos (coordinadores)

Páginas, inicial: 163 final: 192 Fecha: 1990Editorial (si libro): Fac. Ciencies UABLugar de publicación: España

Autores (p.o. de firma): Barbadilla, A., J. E. Quezada-Díaz, A. Ruiz, M. Santos & A. FontdevilaTítulo: The evolutionary history of Drosophila buzzatii. XVII. Double mating and sperm predominance

Ref. revista: Genetics, Selection, Evolution LibroClave: A Volumen: 23 Páginas, inicial: 133 final: 140 Fecha: 1991Editorial (si libro): Lugar de publicación: Francia

Autores (p.o. de firma): Ruiz, A., M. Santos, A. Barbadilla, J. E. Quezada-Díaz, E. Hasson & A. FontdevilaTítulo: Genetic variance for body size in a natural population of Drosophila buzzatii.

Ref. revista: Genetics LibroClave: A Volumen: 128 Páginas, inicial: 739 final: 750 Fecha: 1991Editorial (si libro): Lugar de publicación: USA

Autores (p.o. de firma): Barbadilla, ATítulo: Estado actual de la problemática acerca del origen de los taxones de rango superior.

Ref. revista: Ameghiniana LibroClave: A Volumen: 28 Páginas, inicial: 295 final: 301 Fecha: 1991Editorial (si libro): Lugar de publicación: Argentina

Autores (p.o. de firma): Naveira, H. & A. BarbadillaTítulo: The theoretical distribution of lengths of intact chromosome segments around a locus held heterozygous with backcrossing in a diploid species


Autores (p.o. de firma): Barbadilla, A., H. Naveira, A. Ruiz & M. SantosTítulo: The estimation of genotypic probabilities in an adult population by the analysis of descendants

Ref. revista: Genetical Research LibroClave: A Volumen: 59 Páginas, inicial: 131 final: 137 Fecha: 1992Editorial (si libro): Lugar de publicación: UK

Autores (p.o. de firma): Santos, M., A. Ruiz, J. E. Quezada-Díaz, A. Barbadilla & A. FontdevilaTítulo: The evolutionary history of Drosophila buzzatii. XX. Positive phenotypic covariance between field adult fitness components and body size

Ref. revista: J. evolutionary Biology LibroClave: A Volumen: 5 Páginas, inicial: 403 final: 422 Fecha: 1992Editorial (si libro): Lugar de publicación:

Autores (p.o. de firma): Barbadilla, A., A. Ruiz, M. Santos & A. FontdevilaTítulo: Mating pattern and fitness components analysis associated with inversion polymorphism in a natural population of Drosophila buzzatii

Ref. revista: Evolution LibroClave: A Volumen: 48 Páginas, inicial: 767 final: 780 Fecha: 1994Editorial (si libro): Lugar de publicación: USA

Autores (p.o. de firma): Ruiz, A. & A. BarbadillaTítulo: The contribution of quantitative trait loci and neutral marker loci to the genetic variances and covariances among quantitative traits in random mating populations


Autores (p.o. de firma): Cáceres, M., A. Barbadilla & Alfredo RuizTítulo: Inversion length and breakpoint distribution in the Drosophila buzzatii species complex: Is inversion length a selective trait?

Ref. revista: Evolution LibroClave: A Volumen: 51 Páginas, inicial: 1149 final: 1155 Fecha: 1997Editorial (si libro): Lugar de publicación: USA

Autores (p.o. de firma): Betrán, E., J. Rozas, A. Navarro y A. BarbadillaTítulo: The estimation of the number and the distribution of gene conversion tracts from population DNA data


Autores (p.o. de firma): Navarro, A., E. Betrán, A. Barbadilla y A. RuizTítulo: Recombination and gene flux caused by crossing over and gene conversion in inversion heterokaryotypes


Autores (p.o. de firma): Barbadilla, A., L. M. King, y R. C. LewontinTítulo: What does electrophoretic variation tell us about protein variation?

Ref. revista: Molecular Biology and Evolution LibroClave: A Volumen: 13 Páginas, inicial: 427 final: 432 Fecha: 1997Editorial (si libro): Lugar de publicación: USA

Autores (p.o. de firma): Cáceres, M., J.M. Ranz, A. Barbadilla, M. Long y A. RuizTítulo: Generation of a widespread Drosophila inversion by a transposable element

Ref. revista: Science LibroClave: A Volumen: 285 Páginas, inicial: 415 final: 418 Fecha: 1999Editorial (si libro): Lugar de publicación: USA

Autores (p.o. de firma): Cáceres, M., A. Barbadilla y A. RuizTítulo: Recombination rate predicts inversion size in Diptera


Autores (p.o. de firma): Berry, A. and A. BarbadillaTítulo: Gene conversion is a major determinant of genetic diversity at the DNA level

Ref. revista: LibroClave: CL Volumen: Evolutionary Genetics from Molecules to Morphology. R. S. Singh y C. B. Krimbras (eds.) Páginas, inicial: final: Fecha: 2000Editorial (si libro): Cambridge University Press, NYLugar de publicación: USA

Autores (p.o. de firma): Barbadilla, ATítulo: La selección natural: me replico, luego existo

Ref. revista: LibroClave: CL Volumen: Evolución y filogenia de Artrópodos, Vol. 26 Páginas, inicial: 605 final: 612 Fecha: 2000Editorial (si libro): Sociedad Entomológica AragonesaLugar de publicación: España

Autores (p.o. de firma): Navarro, A. Barbadilla y A. RuizTítulo: Effect of inversion polymorphism on the neutral nucleotide variability of linked chromosomal regions

Ref. revista: Genetics LibroClave: A Volumen: 155 Páginas, inicial: 685 final: 698 Fecha: 2000Editorial (si libro): Lugar de publicación: Genetics

Autores (p.o. de firma): Casillas, S. y A. BarbadillaTítulo: PDA: a pipeline to explore and estimate polymorphism in large DNA databases.

Ref. revista: Nucleic Acid Research Web Server issue LibroClave: A Volumen: 32 Páginas, inicial: W166 final: W169 Fecha: 2004Editorial (si libro): Lugar de publicación:

Autores (p.o. de firma): Bárbara Negre, Sònia Casillas, Magali Suzanne, Ernesto Sánchez-Herrero, Michael Akam, Michael Nefedov, Antonio Barbadilla, Pieter de Jong y Alfredo RuizTítulo: Conservation of regulatory sequences and gene expression patterns in the disintegrating Drosophila Hox gene complex

Ref. revista: Genome Research Genome Research LibroClave: A Volumen: 15 Páginas, inicial: 692 final: 700 Fecha: 2005Editorial (si libro): Lugar de publicación: USA

Autores (p.o. de firma): Casillas, S, N. Petit & A. BarbadillaTítulo: DPDB: a database for the storage, representation and analysis of polymorphism in the Drosophila genus

Ref. revista: Bioinformatics LibroClave: A Volumen: 21 Páginas, inicial: ii26 final: ii30 Fecha: 2005Editorial (si libro): Lugar de publicación:

Autores (p.o. de firma): Casillas, S & A. BarbadillaTítulo: PDA v.2: improving the exploration and estimation of nucleotide polymorphism in large data sets of heterogeneous DNA.

Ref. revista: Nucleic Acid Research, Web Server issue LibroClave: A Volumen: 34 Páginas, inicial: W632 final: W634 Fecha: 2006Editorial (si libro): Lugar de publicación:

Autores (p.o. de firma): Casillas, S, B Negre, A Barbadilla and A RuizTítulo: Fast sequence evolution of Hox and Hox-derived genes in the genus Drosophila

Ref. revista: BMC Evolutionary Biology LibroClave: A Volumen: 6 Páginas, inicial: 106 final: Fecha: 2006Editorial (si libro): Lugar de publicación:

Autores (p.o. de firma): Egea, R, S. Casillas, E. Fernández, MA Senar & A. BarbadillaTítulo: MamPol: a database of nucleotide polymorphism in the Mammalia class

Ref. revista: Nucleic Acid Research, Database issue LibroClave: A Volumen: doi: 10.1093/nar/gkl833 Páginas, inicial: final: Fecha: 2006Editorial (si libro): Lugar de publicación:

Autores (p.o. de firma): Petit, N., S Casillas, A. Ruiz and A BarbadillaTítulo: Protein polymorphism is negatively correlated with conservation of intronic sequences and complexity of expression patterns in Drosophila melanogaster

Ref. revista: Journal of Molecular Evolution LibroClave: A Volumen: 64 Páginas, inicial: 511 final: 518 Fecha: 2007Editorial (si libro): Lugar de publicación:

Autores (p.o. de firma): Casillas, S., A. Barbadilla and C. BergmanTítulo: Purifying selection maintains highly conserved noncoding sequences in Drosophila

Ref. revista: Molecular Biology and Evolution LibroClave: A Volumen: 24 Páginas, inicial: 2222 final: 2234 Fecha: 2007Editorial (si libro): Lugar de publicación:

Autores (p.o. de firma): Casillas, S., R. Egea, N. Petit, C. Bergman and A. BarbadillaTítulo: Drosophila Polymorhism Database (DPDB): a portal for nucleotide polymorphism in Drosophila

Ref. revista: Fly LibroClave: A Volumen: 1 Páginas, inicial: 205 final: 211 Fecha: 2007Editorial (si libro): Lugar de publicación:

Autores (p.o. de firma): Egea, R., S. Casillas and A. BarbadillaTítulo: Standard & Generalized McDonald and Kreitman test: a website to detect selection by comparing different classes of DNA sites

Ref. revista: Nucleic Acids Res LibroClave: A Volumen: 36 Páginas, inicial:W 157 final: W162 Fecha: 2008Editorial (si libro): Lugar de publicación:

Autores (p.o. de firma): Petit, N. and A. BarbadillaTítulo: Selection efficiency and effective population size in Drosophila species

Ref. revista: J. Evol. Biology LibroClave: A Volumen: 10.1111/j.1420-9101.2008.01672.x Páginas, inicial: final: Fecha: 2008Editorial (si libro):

Lugar de publicación:

2


Participación en contratos de I+D de especial relevancia con Empresas y/o Administraciones (nacionales y/o internacionales)

Título del contrato/proyecto: Gestión del desarrollo de herramientas bionformáticas

Tipo de contrato:Convenio de colaboraciónEmpresa/Administración financiadora:Fundación empresa y cienciaEntidades participantes: 3Duración, desde: Enero 2001 hasta: Octubre 2002Investigador responsable: Antonio BarbadillaNúmero de investigadores participantes: 3PRECIO TOTAL DEL PROYECTO: 6000 €

Título del contrato/proyecto: Implementación de herramienta bioinformática

Tipo de contrato:Convenio de colaboraciónEmpresa/Administración financiadora:eBiointelEntidades participantes:3Duración, desde: Enero 2006 hasta: Marzo 2006Investigador responsable: Antonio BarbadillaNúmero de investigadores participantes: 3PRECIO TOTAL DEL PROYECTO: 2500 €

3


Patentes y Modelos de utilidad

Inventores (p.o. de firma): Título:

N. de solicitud: País de prioridad: Fecha de prioridad: Entidad titular: Países a los que se ha extendido: Empresa/s que la están explotando:

Inventores (p.o. de firma): Título:

N. de solicitud: País de prioridad: Fecha de prioridad: Entidad titular: Países a los que se ha extendido: Empresa/s que la están explotando:

4


Estancias en Centros extranjeros(estancias continuadas superiores a un mes)

CLAVE: D = doctorado, P = postdoctoral, I = invitado, C = contratado, O = otras (especificar).

Centro: HARVARD UNIVERSITY (MUSEUM OF COMPARATIVE ZOOLOGY)Localidad: Cambridge, MA País USA Fecha: Enero 1993- Sept.

1994Duración (semanas): 91

Tema: Relación variación nucleotídica y electroforéticaClave: P

Centro: Localidad: País Fecha: Duración (semanas): Tema: Clave:

5


Contribuciones a Congresos

AUTORES: Barbadilla, A., A. Ruiz, M. Santos y A. Fontdevila.TITULO: Patrón y probabilidad de apareamiento en una población natural de Drosophila

buzzatii. TIPO DE PARTICIPACIÓN: Comunicación oral.CONGRESO: XXV Jornadas de Genética Luso-Españolas. PUBLICACIÓN:LUGAR DE CELEBRACIÓN: Universidad de Alcallá de Henares, Alcalá de Henares. AÑO: 1990

AUTORES: Barbadilla, A., A. Ruiz, M. Santos y A. Fontdevila.TITULO: Adult selection on inversion polymorphism in a natural population of Drosophila

buzzatii. TIPO DE PARTICIPACIÓN: Póster.CONGRESO: Third congress of the European Society for Evolutionary Biology. PUBLICACIÓN:LUGAR DE CELEBRACIÓN: Debrecen (Hungría). AÑO: 1991

AUTORES: Barbadilla, A., A. Ruiz, M. Santos y A. Fontdevila.TITULO: Modelo estadístico y pruebas de hipótesis sobre un polimorfismo genético en dos

muestras de una población base y otra apareada. TIPO DE PARTICIPACIÓN: Comunicación oral.CONGRESO: XXVII Jornadas de Genética Luso-Españolas. PUBLICACIÓN:LUGAR DE CELEBRACIÓN: Universidad de Badajoz, Badajoz. AÑO: 1992

AUTORES: Barbadilla, A., A. Ruiz, M. Santos y A. Fontdevila.TITULO: Mating pattern and fitness component analysis associated with inversion

polymorphism in a natural population of Drosophila buzzatii. TIPO DE PARTICIPACIÓN: Comunicación oral.CONGRESO: Join meeting of the American Society of Naturalists, the Society of Systematic Biologists and the Society for the Study of Evolution. PUBLICACIÓN:LUGAR DE CELEBRACIÓN: Snowbird, Utah, USA.AÑO: 1993

AUTORES: Barbadilla, A. TITULO: ¿Qué nos dice la variación electroforética de la variación proteica?TIPO DE PARTICIPACIÓN: Comunicación oral.CONGRESO: XXIX Jornadas de Genética Luso-Españolas. PUBLICACIÓN:LUGAR DE CELEBRACIÓN: Lleida. AÑO: 1994

AUTORES: Barbadilla, A., A. Berry, E. Betrán, A. Rozas y A. NavarroTITULO: Recombinación en el nivel del DNA: conversión génica vs entrecruzamientoTIPO DE PARTICIPACIÓN: Comunicación oral.CONGRESO: XIX Seminario de Genética de Poblaciones y Evolución PUBLICACIÓN:LUGAR DE CELEBRACIÓN: Santiago de Compostela AÑO: 1997

AUTORES: Cáceres, M., A. Barbadilla, & A. RuizTITULO: Recombination rate predicts inversion size in DipteraTIPO DE PARTICIPACIÓN: Comunicación oral.CONGRESO VII Congress of the European Society for Evolutionary Biology PUBLICACIÓN:LUGAR DE CELEBRACIÓN: Barcelona AÑO: 23-28 Agosto 1999

AUTORES: Barbadilla, A, A. Blanco y M. Soldevila TITULO: Portal de análisis de polimorfismos nucleotídicos TIPO DE PARTICIPACIÓN: Comunicación OralCONGRESO XIII seminario de genética de poblaciones y evolución PUBLICACIÓN:LUGAR DE CELEBRACIÓN: Baiona (Pontevendra)AÑO: 8-11 de Noviembre 2000

AUTORES: Barbadilla, ATITULO: Evolución del genoma: interpretando las huellas molecularesTIPO DE PARTICIPACIÓN: Conferencia de Clausura CONGRESO IX seminario conjunto de las secciones de Biología Molecular y Biología del desarrollo de la Sociedad Catalana de Biología PUBLICACIÓN:LUGAR DE CELEBRACIÓN: Canet (Barcelona)AÑO: 4 -5 de Junio 2001

AUTORES: Barbadilla, A, y C. Santa,TITULO: On SNPs and related concepts.TIPO DE PARTICIPACIÓN: Comunicación Oral, Conferencia seleccionadaCONGRESO 4th International Meeting on Single Nucleotide Polymorphisms and complex genome analysis.PUBLICACIÓN:LUGAR DE CELEBRACIÓN: Wenner-Gren Center, Estocolmo, Suecia.AÑO: 2001

AUTORES: Sònia Casillas and Antonio Barbadilla

TITULO: Base de datos de polimorfismo en Drosophila (DPDB)TIPO DE PARTICIPACIÓN: Comunicación oralCONGRESO II Jornada de Biología Evolutiva. PUBLICACIÓN:LUGAR DE CELEBRACIÓN: Institut d'Estudis Catalans (Barcelona), Org.: Societat Catalana de Biologia.AÑO: 2002

AUTORES: Sònia Casillas and Antonio BarbadillaTITULO: Bases de datos y construcción de plataformas web para el análisis de secuenciasTIPO DE PARTICIPACIÓN: Comunicación oralCONGRESO : XXV Congreso de la Sociedad Española de Bioquímica y Biología Molecular (SEBBM)PUBLICACIÓN:LUGAR DE CELEBRACIÓN: LeónAÑO: 2002

AUTORES: Sònia Casillas and Antonio BarbadillaTITULO: DPDB: Drosophila DNA-polymorphism DatabaseTIPO DE PARTICIPACIÓN: PósterCONGRESO: III Jornadas de Bioinformática,PUBLICACIÓN:LUGAR DE CELEBRACIÓN: Centro de Investigación del Cáncer (CSIC-Universidad de Salamanca). AÑO: 2002

AUTORES: Sònia Casillas and Antonio BarbadillaTITULO: PDA, un pipeline para el análisis del polimorfismo nucleotídicoTIPO DE PARTICIPACIÓN: CONGRESO: III Jornada de Biología EvolutivaPUBLICACIÓN:LUGAR DE CELEBRACIÓN: Institut d'Estudis Catalans (Barcelona)AÑO: 2003

AUTORES: Bárbara Negre, Sònia Casillas, Antonio Barbadilla, Michael Nefedov, Pieter de Jong and Alfredo RuizTITULO: Reorganización del complejo de genes Hox en DrosophilaTIPO DE PARTICIPACIÓN: Comunicación oralCONGRESO: XII Seminario de Biología Molecular y del DesarrolloPUBLICACIÓN:

LUGAR DE CELEBRACIÓN: Institut d'Estudis Catalans (Barcelona)AÑO: 2004

AUTORES: Bárbara Negre, Sònia Casillas, Antonio Barbadilla, Michael Nefedov, Pieter de Jong and Alfredo RuizTITULO: Rearrangement of the Drosophila Hox gene complex: Genomic characterization of the labial-proboscipedia split in Drosophila buzzatiiTIPO DE PARTICIPACIÓN: PósterCONGRESO: International Society for Molecular Biology and Evolution (SMBE) and American Genetic Association (AGA).PUBLICACIÓN:LUGAR DE CELEBRACIÓN: State College (Pennsylvania, USA)AÑO: 2004

AUTORES: Sònia Casillas and Antonio BarbadillaTITULO: PDA, a pipeline to explore and estimate polymorphism in large DNA databasesTIPO DE PARTICIPACIÓN: Demo presentación y pósterCONGRESO : 12th International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology and 3rd European Conference on Computational Biology (ISMB/ECCB 2004).PUBLICACIÓN:LUGAR DE CELEBRACIÓN: Scottish Exhibition and Conference Centre (Glasgow, Scotland) UKAÑO: 2004

AUTORES: A. Ruiz, B. Negre, J. González, S. Casillas, A. Barbadilla, F. Casals, A. Delprat, O. Calvete, M. Nefedov, P. de Jong, I. Bosdet, J.E. Schein, R.A. HoskinsTITULO: Caracterización genómica de las reordenaciones del complejo de genes Hox en DrosophilaTIPO DE PARTICIPACIÓN: Comunicación OralCONGRESO : XV Seminario de genética de poblaciones y evoluciónPUBLICACIÓN:LUGAR DE CELEBRACIÓN: Parador de Sigüenza (Sigüenza, Guadalajara)AÑO: 2004

AUTORES: Sònia Casillas, Natalia Petit, Raquel Egea and Antonio BarbadillaTITULO: Storage, representation and analysis of nucleotide polymorphismTIPO DE PARTICIPACIÓN: PósterCONGRESO : V Jornadas de BioinformáticaPUBLICACIÓN:LUGAR DE CELEBRACIÓN: Palau de Congressos de Montjuich i Universitat Politècnica de Catalunya (Barcelona)AÑO: 2004

AUTORES: Antonio BarbadillaTITULO: Representación y análisis de la variabilidad genéticaTIPO DE PARTICIPACIÓN: Conferencia invitadaCONGRESO : Xarxa de Bioinfomàtica de CatalunyaPUBLICACIÓN:LUGAR DE CELEBRACIÓN: Monastir de les Avellanes (Lérida)AÑO: 11 Abril 2005

AUTORES: Antonio BarbadillaTITULO: Secuencias, secuencias y más secuencias: los retos bioinformáticas del tratamiento masivo de información biológica.TIPO DE PARTICIPACIÓN: Conferencia invitadaCONGRESO : Xarxa de Genòmica ambiental microbianaPUBLICACIÓN:LUGAR DE CELEBRACIÓN: Centro de Estudios Avanzados de Blanes, CEAB-CSIC, Blanes (Gerona)AÑO: 12 Abril 2005

AUTORES: Antonio Barbadilla, Sònia Casillas, Natalia Petit, Raquel Egea y Alfredo RuizTITULO: Representación y análisis bioinformática de la diversidad genética en DrosophilaTIPO DE PARTICIPACIÓN: ConferenciaCONGRESO : V Jornada de Biologia Evolutiva, Sección de Biología Evolutiva de la Societat Catalana de BiologiaPUBLICACIÓN:LUGAR DE CELEBRACIÓN: Institut d'Estudis Catalans (Barcelona)AÑO: 4 Julio 2005

AUTORES: Sònia Casillas, Bárbara Negre, Antonio Barbadilla y Alfredo RuizTITULO: Evolución nucleotídica y estructural de los genes Hox y derivados de Hox en el género DrosophilaTIPO DE PARTICIPACIÓN: ConferenciaCONGRESO : V Jornada de Biologia Evolutiva, Sección de Biología Evolutiva de la Societat Catalana de BiologiaPUBLICACIÓN:LUGAR DE CELEBRACIÓN: Institut d'Estudis Catalans (Barcelona)AÑO: 4 Julio 2005

AUTORES: Bárbara Negre, Sònia Casillas, Magali Suzanne, Ernesto Sánchez-Herrero, Michael Akam, Michael Nefedov, Antonio Barbadilla, Pieter de Jong y Alfredo RuizTITULO: Conservation of regulatory sequences and gene expression patterns in the disintegrating Drosophila Hox gene complex. TIPO DE PARTICIPACIÓN: ConferenciaCONGRESO : 10th Congress European Society of Evolutionary BiologyPUBLICACIÓN:LUGAR DE CELEBRACIÓN: Cracovia, PoloniaAÑO: 15-20 Agosto 2005

AUTORES: Sònia Casillas, Bárbara Negre, Antonio Barbadilla y Alfredo RuizTITULO: Sequence evolution of Hox and Hox-derived genes in the genus DrosophilaTIPO DE PARTICIPACIÓN: PósterCONGRESO : 10th Congress European Society of Evolutionary BiologyPUBLICACIÓN:LUGAR DE CELEBRACIÓN: Cracovia, PoloniaAÑO: 15-20 Agosto 2005

AUTORES: Natalia Petit, Sònia Casillas, Alfredo Ruiz y Antonio BarbadillaTITULO: non coding sequence modulate coding nucleotide variation in Drosophila melanogasterTIPO DE PARTICIPACIÓN: PósterCONGRESO : 10th Congress European Society of Evolutionary BiologyPUBLICACIÓN:LUGAR DE CELEBRACIÓN: Cracovia, PoloniaAÑO: 15-20 Agosto 2005

AUTORES: Sònia Casillas, Natalia Petit y Antonio BarbadillaTITULO: TIPO DE PARTICIPACIÓN: Conferència seleccionadaCONGRESO : 4th European Conference on Computational Biology / 6th Meeting of the Spanish Bioinformatics NetworkPUBLICACIÓN:LUGAR DE CELEBRACIÓN: Palacio de Congresos (Madrid, Spain), 2005AÑO: 28 Septiembre – 1 Octubre 2005

AUTORES: Sònia Casillas, Antonio Barbadilla and Casey M. BergmanTITULO: Evolution of noncoding DNA in Drosophila: implications for cis-regulatory evolution TIPO DE PARTICIPACIÓN: ConferenciaCONGRESO : Otto Warburg International Summer School and Workshop 2006 on Evolutionary PUBLICACIÓN:LUGAR DE CELEBRACIÓN: Berlín (Alemania)AÑO: 2006

AUTORES: Antonio Barbadilla, Sònia Casillas, Natalia Petit, Raquel Egea y Casey Bergman TITULO: Bioinformática de la diversidad nucleotídica: bases de datos y detección de la selección que actúa sobre las secuencias conservadas no codificadoras TIPO DE PARTICIPACIÓN: ConferenciaCONGRESO : XVI Seminario de genética de poblaciones y evolución PUBLICACIÓN: LUGAR DE CELEBRACIÓN: Sant Feliu de Guixols, GironaAÑO: 15-18 nov. 2006

AUTORES: Raquel Egea, Sònia Casillas and Antonio Barbadilla TITULO: MamPol: una base de dades per l’estudi de polimorfisme a la classe Mammalia TIPO DE PARTICIPACIÓN: Comunicación oralCONGRESO : VI Jornada de Biología Evolutiva. Org.: Societat Catalana de Biologia.PUBLICACIÓN: LUGAR DE CELEBRACIÓN: Institut d'Estudis Catalans (Barcelona)AÑO: 2006

AUTORES: Natalia Petit, Sònia Casillas, Raquel Egea, Alfredo Ruiz and Antonio BarbadillaTITULO: Comparative analysis of nucleotide polymorphism levels across different taxonomic unitsTIPO DE PARTICIPACIÓN: PósterCONGRESO : 14th Annual International Conference On Intelligent Systems For Molecular Biology (ISMB 2006). Org: International Society for Computational Biology (ISCBPUBLICACIÓN: LUGAR DE CELEBRACIÓN: Fortaleza (Brasil) AÑO: 2006

AUTORES: Sònia Casillas, A. Barbadilla and C. BergmanTITULO: Inferring constraint and adaptation on Drosophila noncoding DNA from patters of sequence evolutionTIPO DE PARTICIPACIÓN: PósterCONGRESO : Annual Meeting of the Society of Molecular Biology and Evolution, SMBE 2007PUBLICACIÓN:LUGAR DE CELEBRACIÓN: Halifax, CanadáAÑO: 24 -28 de Junio – 2007

AUTORES: Barbadilla, A., S. Casillas, N. Petit and R. EgeaTITULO: Bioinformatics of genetic diversity TIPO DE PARTICIPACIÓN: PósterCONGRESO : 9th International Meeting of Human Genome Variation and Complex Genome PUBLICACIÓN:LUGAR DE CELEBRACIÓN: Sitges (Barcelona, Spain)AÑO: 6 – 8 Septiembre – 2007

AUTORES: Sònia Casillas, Antonio Barbadilla and Casey M. BergmanTITULO: Weak purifying selection maintains highly conserved noncoding sequences in Drosophila TIPO DE PARTICIPACIÓN: Comunicación oralCONGRESO : 40th PopGroup 2006 - The Population Genetics Group Meeting. Org.: The United Kingdom's Population Genetics Group. PUBLICACIÓN:LUGAR DE CELEBRACIÓN: The University of Manchester (Manchester), UKAÑO: 2007

AUTORES: N. Petit and A. Barbadilla

TITULO: Effective population size shapes the pattens of molecular evolution in DrosophilaTIPO DE PARTICIPACIÓN: PósterCONGRESO : Annual Meeting of the Society of Molecular Biology and Evolution, SMBE 2008PUBLICACIÓN:LUGAR DE CELEBRACIÓN: Barcelona, SpainAÑO: 5-8 Junio – 2008

AUTORES: Egea, R., S. Casillas and A. BarbadillaTITULO: Standard and Generalized McDonald-Kreitman Test: a website to detect selection by comparing different classes of DNA sites TIPO DE PARTICIPACIÓN: PósterCONGRESO : Annual Meeting of the Society of Molecular Biology and Evolution, SMBE 2008PUBLICACIÓN:LUGAR DE CELEBRACIÓN: Barcelona, SpainAÑO: 5-8 Junio – 2008

AUTORES: Egea, R., S. Casillas and A. Barbadilla TITULO: Standard and Generalized McDonald-Kreitman Test: un lloc web per detectar selecció comparant diferents tipus de llocs de DNA

TIPO DE PARTICIPACIÓN: OralCONGRESO : VIII JORNADA DE BIOLOGIA EVOLUTIVA

PUBLICACIÓN: Institut d'Estudis Catalans (Barcelona)LUGAR DE CELEBRACIÓN: Barcelona, SpainAÑO: 7 Julio – 2008

AUTORES: N. Petit and A. BarbadillaTITULO: Diferencias en la eficiencia de la selección entre diferentes especies de Drosophila y mamíferos

TIPO DE PARTICIPACIÓN: OralCONGRESO : VIII JORNADA DE BIOLOGIA EVOLUTIVA

PUBLICACIÓN: Institut d'Estudis Catalans (Barcelona)LUGAR DE CELEBRACIÓN: Barcelona, SpainAÑO: 7 Julio – 2008

AUTORES: Barbadilla, A.TITULO: Association studies assisted by inference and semantic technologies. TIPO DE PARTICIPACIÓN: OralCONGRESO : EC projects symposium

PUBLICACIÓN:LUGAR DE CELEBRACIÓN: UPF, Barcelona, Spain

AÑO: 18 Septiembre – 2008

6


Tesis Doctorales dirigidas

Título: Inversiones cromosómicas en Drosophila: Origen molecular y significado evolutivo de su tamaño

Doctorando: Mario CáceresUniversidad: Autonóma de BarcelonaFacultad / Escuela: CienciasFecha: 2000

Título: Development and application of bioinformatic tools for the representation and analysis of genetic diversity

Doctorando: Sònia CasillasUniversidad: Autónoma de BarcelonaFacultad / Escuela: BiocienciasFecha: 2008

Título: Análisis de la interacción entre diferentes factores que afectan la evolución molecular, usando datos de diversidad nucleotídicas y herramientas bioinformáticas

Doctorando: Natalia PetitUniversidad: Autónoma de BarcelonaFacultad / Escuela: BiocienciasFecha: 2008

7


Experiencia en organización de actividades de I+D Organización de congresos, seminarios, jornadas, etc., científicos-tecnológicos

Título:Jornada Perspectivas sobre el genomaTipo de actividad: Jornada conferencias invitadas Ambito: Nacional

Fecha: 2000

Título: 50 aniversario del descubrimiento de la estructura en doble hélice del DNA,Tipo de actividad: Jornada conferencias invitadas Ambito: Nacional

Fecha: 2003

Título: 2nd International Postgraduate Course in Genomics,Tipo de actividad: Curso especializado Ambito: Internacional

Fecha: 2006

Título: Association studies assisted by Inference and Semantic Technologies meetingTipo de actividad: reunión Ambito: Europeo

Fecha: 2008

8

Título: Exposición "Una invitación a la bioinformática”Tipo de actividad: Exposición interactiva Ambito: Nacional

Fecha: 2008


Otros méritos o aclaraciones que se desee hacer constar(utilice únicamente el espacio equivalente a una página).

Director de la Plataforma Bioinformática Campus-Institutos de Salud de la UAB

Impulsor de iniciativas empresariales de transferencia tecnológica

Responsabilidades académicas

o 2000-04: Coordinador adjunto de Docencia de la Licenciatura de Biología,

Facultat de Ciències, UAB.

o Coordinador del plan de estudios del nuevo grado de Genética de la UAB

o Comunicador Licenciatura Biología: Presentación de las jornadas de Puertas Abiertas de Biología, Fac. Ciencias, 2000-04 (con Javier Retana)

Proyectos docentes y difusión de la ciencia

o Implementación de herramientas multimedia en toda una Titulación: el caso de Biología en la UAB. Proyectos de mejora de la calidad docente AGAUR 2004MQD 00068. 2004-06. 2004-05.

o Proyecto de acciones especiales de difusión de la Ciencia y la Tecnología. Ministerio Ciencia y Tecnología. AE00-0128-DIF. 2001-02.

o Gestor de una plataforma docente multimedia de Bioinformática. 2002-03.

o Aula permanente de genética. Ajuts projectes d'innovació docent 2007. Vicerectorat d'Estudis i de Qualitat, UAB. 2007-2008.

Publicaciones docentes:

o Barbadilla, A. 1994. Conceptos básicos de la Genética. Universitat Autònoma de Barcelona.

o Barbadilla, A., H. Naveira, M. Santos & F. Peris. 1991. Introducción al BMDP en VAX/VMS. Universitat Autònoma de Barcelona.

o Santos, M., H. Naveira, F. Peris & A. Barbadilla. 1990. Problemas de Bioestadística. Universitat Autònoma de Barcelona.

Numerosos ensayos sobre genética y evolución en Internet y medios de comunicación

Organización de jornadas científicas, exposiciones y cursos internacionales:

Nov. 2000: Organización de la Jornada de Conferencias: Perspectivas sobre el genoma, UAB

Abril 2003: Organización de la Jornada de Conferencias: 50 aniversario del descubrimiento de la estructura en doble hélice del DNA, UAB

Junio 2006: 2nd International Postgraduate Course in Genomics, UAB

Abril 2008: Exposición "Una invitación a la bioinformática", dentro del año de la computació, UAB. 15-18 de Abril

Divulgación de la ciencia:

o Invitación a impartir más de 50 conferencias de divulgación científica

o Participación en debates científicos en los medios de comunicación:

Participación en debates y entrevistas de Televisión, Radio y Prensa sobre

los temas de su investigación.

o Diversos artículos de Divulgación en Internet y medios de comunicación

Tramos de investigación y docencia: Tres tramos de investigación y cuatro de docencia

Tesis Doctorales dirigidas: 3

Tesis doctorales que dirige actualmente: 3

Trabajos de Master dirigidos: 6

Miembro de tribunales de Tesis: 18

Sociedades científicas

o Miembro de la Sociedad Española de Genètica, de la Society for the Study of the Evolution, de la Genetic Society of America y de la Society of Molecular Evolution.

Redes científicas (miembro)

o Xarxa de Genòmica i Proteòmica de Catalunya, Xarxa de Bioinformàtica de Catalunya, Xarxa GRID de Catalunya, Red Española de Bioinformática, Xarxa Genòmica Ambiental

Revisor de revistas internacionales del ámbito de la Bioinformática, Genética y

Evolución. Revistas: Bioinformatics, Genetics, Journal of Evolutionary Biology,

Genetical Research, Journal of Molecular Evolution, Genetics Selection and

Evolution, Microbial Cell Factories, Animal Biodiversity and Conservation

http://bioinf3.uab.cat/expobi2/

http://bioinformatica.uab.es/genomics

http://dna50anys.uab.es/

http://dna50anys.uab.es/

Miembro del equipo de editores de la revista Animal Biodiversity and Conservation

Coordinación y supervisión científica de la traducción al español del libro

universitario de genética: Introducción al análisis genético, Anthony J.F. Griffiths,

Susan R. Wessler, Richard C. Lewontin y Sean Carroll. 9th edición. 2008

Traductor de la revista Investigación y Ciencia

Evaluador de numerosos proyectos y solicitud de becas de Investigación Nacionales

e Internacionales

Ha recibido distintas becas, ayudas y premios a lo largo de su trayectoria docente e

investigadora

o 2000: Bolsa de viaje y matrícula para el Advanced Practical Workshop:

BiobizTM the Biotechnology Company Start-Up training program.

Subvencionado por la Comisión Europea y la OITT de la UAB.

o 1993-94: Beca MEC/Fulbright. Concedida por la Comissión de intercambio

cultural entre España y Estados Unidos.

o 1994: Premio Extraordinario de Tesis Doctoral. Junta de Govern de la

Universitat Autònoma de Barcelona.

o Numerosas bolsas de viajes para conferencias y asistencia a congresos

o 1990: Ayuda para proyectos de investigación de investigadores jóvenes.

Concedida por la CIRIT, Generalitat de Catalunya

o 1989: Ayuda para proyectos de investigación de investigadores jóvenes.

Concedida por la CIRIT, Generalitat de Catalunya

Solicitud de Ayuda para Proyectos debioinformatica.uab.cat/base/documents/ProyectoMICINN/... · Web...

Documents

Transcript of Solicitud de Ayuda para Proyectos debioinformatica.uab.cat/base/documents/ProyectoMICINN/... · Web...