Vigilancia de Laboratorio · Las cepas provenientes de LCR y/o con diagnóstico de meningitis se...

Vigilancia de LaboratorioStreptococcus pneumoniae

Chile

Instituto de Salud Pública de Chile

� Sistema de Vigilancia

� Resultados Vigilancia de laboratorio

� Vigilancia de Resistencia a Antimicrobianos

� Impacto de la Vacunación

Contenidos

Sistema de Vigilancia

Marco Regulatorio

Enfermedades Transmisibles

Vigilancia de Morbilidad

Universal

Centinela

Brotes

Vigilancia de Laboratorio

Resistencia Antimicrobianos

Agentes Etiológicos

Vigilancia Ambiental

Alimentos

Vectores

Ambiente

Subsistemas de Vigilancia

•Red de Laboratorios-Laboratorios Clínicos Públicos y Privados

-Laboratorio Nacional y de Referencia (ISP)

•MINSAL

•SEREMIs de Salud

Marco Operativo

Vigilancia Sistemática Región Metropolitana 1994-2007

Fuente: Lagos R., et al. Age – and Serotype – Specifi c Pediatric Invasive Pneumococcal Disease: Insights fromSystematic Surveillance in Santiago, Chile, 1994 – 2 007. JID: 2008: 198 (15 de diciembre): 1809 – 1817.

• Casos que requirieron hospitalización por ENI: • 2369 casos con ENI pediátrica (0 a 14 años).• Incidencia ENI anual: 10,4 x 105 habitantes.

• 79% casos <60 meses.

• Incidencia de hospitalización para ENI en niños (0– 59 meses) • 1994 – 1997: 19,3 casos x 105 habitantes.• 2000 – 2007: 28,3 casos x 105 habitantes.

• Laboratorio Nacional y de Referencia para Streptococcus pneumoniae

• Confirmación y caracterización de los aislamientos de Streptococcus pneumoniae

• Vigilancia de la resistencia a antimicrobianos

• Estudio genético

• Participa en la Red Latinoamericana de Vigilancia de Meningitis Bacteriana y Neumonía (SIREVA) de la Organización Panamericana de la Salud (OPS)

• Refuerzos de las medidas de Bioseguridad en el Laboratorio y transporte de muestra

• Registro, Control de Calidad de vacunas y Vigilancia ESAVI (ANAMED)

• Aporte de información de laboratorio para la toma de decisiones en Salud Pública

Rol del ISP

ResultadosVigilancia de Laboratorio

7,7% 7,3% 6,1%

9,6%

Tasa de casos de ENI por 100.000 habitantes, por año y región. Chile, 2007-2012.

Región Servicio de Salud 2007 2008 2009 2010 2011 2012 Total SS Total Región

Arica y Parinacota Arica 3 4 2 1 1 2 13 13Iquique 3 6 9 5 14 9 46Privado 2 2Antofagasta 10 8 15 11 10 5 59Privado 1 1 1 1 2 4 10

Atacama Atacama 11 8 3 6 8 7 43 43Coquimbo Coquimbo 26 26 27 34 27 26 166 166

Aconcagua 17 18 22 11 16 9 93Viña del Mar - Quillota 28 26 38 31 20 19 162Valparaiso - San Antonio 27 25 28 39 23 28 170Privado 1 2 6 6 11 8 34M. Norte 58 63 49 65 40 31 306M. Occidente 63 52 74 37 39 26 291M. Central 51 62 45 21 31 30 240M. Oriente 66 49 38 28 19 22 222M. Sur Oriente 75 91 67 63 62 55 413M. Sur 99 82 100 65 48 39 433Otros 26 35 21 38 30 20 170Privado 111 93 132 109 120 132 697O'Higgins 25 22 18 10 14 13 102Privado 4 7 8 1 3 2 25

Maule Maule 22 22 15 10 14 15 98 98Concepción 43 30 14 18 43 27 175Ñuble 3 3 7 7 10 9 39Talcahuano 9 9 9 11 5 10 53Biobío 12 21 25 13 13 13 97Privado 11 4 9 5 5 7 41AraucanÍa Sur 15 27 27 36 34 45 184Privado 1 4 1 4 2 2 14Valdivia 10 10 20 12 11 15 78Privado 1 3 1 5Chiloé 2 3 2 2 9Reloncaví 36 32 38 47 35 16 204Osorno 16 23 25 15 9 10 98Privado 2 5 3 1 5 16

Aisén Aisén 2 3 1 1 1 6 14 14Magallanes 1 1 1 3Otros 2 2

887 870 901 775 725 669 4827 4827

Los Lagos

Magallanes

48

69

459

2772

127

405

198

83

327

5

Valparaíso

Metropolitana

O`Higgins

Biobío

La Araucanía

Tarapacá

Antofagasta

Casos confirmados de ENI por Región, Servicio de Salud, y año.

Chile, 2007 - 2010.

TOTAL

Los Ríos

56,1

16,3

42,019.9

Vigilancia Resistencia Antimicrobianos

2007 2008 2009 2010 2011 2012

% S 72% 78% 69% 67% 73% 75%% R 28% 22% 31% 33% 28% 25%

n 109 102 97 105 80 72

% S 97% 99% 97% 94% 98% 98%% I 3% 2% 3% 5% 1% 2%% R 0% 0% 0% 1% 1% 0%

n 776 767 804 670 644 597

% S 90% 93% 89% 89% 86% 94%% I 6% 4% 10% 4% 13% 6%% R 5% 3% 1% 8% 1% 0%

n 109 102 97 105 80 72

% S 96% 98% 98% 92% 98% 98%% I 3% 2% 1% 6% 2% 1%% R 0% 0% 0% 1% 0% 0%

n 776 767 804 670 644 597

Las cepas provenientes de LCR y/o con diagnóstico de meningitis se consideraron casos de meningitis.

Meningitis

No meningitis

%S, %I, %R: porcentaje de cepas sensibles, con sensibilidad intermedia, y resistentes. n: total cepas analizadas.

Fuente: Laboratorio de Referencia de Menigitis Bacteriana. Departamento de Laboratorio Biomédico. ISP, 2013.

Susceptibilidad in vitro a penicilina y cefotaxima en cepas

No meningitis

Cefotaxima

Antimicrobiano

de S. pneumoniae . Chile, 2007 - 2012.

Meningitis

Penicilina

0%

10%

20%

30%

40%

50%

60%

70%

80%

0.0

08

0.0

15

0.0

16

0.0

3

0.0

32

0.0

6

0.0

64

0.1

2

0.2

5

0.5 1 2 4 8

16

Po

rce

nta

je

Susceptibilidad in vitro a penicilina

Susceptibilidad in vitro a penicilina, por año. Chile, 2007 -2012.

2007 2008 2009 2010 2011 2012


0%

10%

20%

30%

40%

50%

60%

70%

80%

0.0

08

0.0

15

0.0

16

0.0

3

0.0

32

0.0

6

0.0

64

0.1

2

0.2

5

0.5 1 2 4 8

16

Porcen

taje

Susceptibilidad in vitro a cefotaxima

Susceptibilidad in vitro a cefotaxima, por año. Chile, 2007 - 2012.

2007 2008 2009 2010 2011 2012


< 5 5 - 14 ≥ 15 Total

% S 63% 71% 78% 72%% R 38% 29% 22% 28%

n 176 55 298 529

% S 96% 98% 98% 97%% I 4% 1% 2% 3%% R 0% 1% 0% 0%

n 1461 373 2085 3919

% S 84% 85% 94% 90%% I 10% 11% 4% 7%% R 6% 4% 2% 3%

n 176 55 298 529

% S 95% 99% 98% 97%% I 5% 1% 2% 3%% R 0% 1% 0% 0%

n 1461 373 2085 3919


Las cepas provenientes de LCR y/o con diagnóstico de meningitis se consideraron casos de meningitis.


Susceptibilidad in vitro a penicilina y cefotaxima en cepas de S. pneumoniae por grupos etarios. Chile, 2007 - 2012.

Antimicrobiano

No meningitis

Penicilina

Cefotaxima

Meningitis

No meningitis

Meningitis

0%

10%

20%

30%

40%

50%

60%

70%

80%

90%

0.0

08

0.0

15

0.0

16

0.0

3

0.0

32

0.0

6

0.0

64

0.1

2

0.2

5

0.5 1 2 4 8

16

Porcen

taje

Susceptibilidad in vitro a penicilina

Susceptibilidad in vitro a penicilina, por grupo etario. Chile, 2007 - 2012.

< 5 5 - 14 ≥ 15


0%

10%

20%

30%

40%

50%

60%

70%

80%

90%

0.008

0.015

0.016

0.0

3

0.032

0.0

6

0.064

0.1

2

0.2

5

0.5 1 2 4 8

16

Po

rce

nta

je

Susceptibilidad in vitro a cefotaxima

Susceptibilidad in vitro a cefotaxima, por grupo etario. Chile, 2007 - 2012.

< 5 5 - 14 ≥ 15Fuente: Laboratorio de Referencia de Menigitis Bacteriana. Departamento de Laboratorio Biomédico. ISP, 2013.

Antimicrobiano 2007 2008 2009 2010 2011 2012

% S 73% 73% 72% 69% 64% 71%% I 1% 1% 1% 1% 1% 0%% R 26% 26% 27% 30% 35% 29%

n 886 870 901 775 725 669

% S 95% 93% 97% 99% 99% 99%% I 4% 6% 3% 1% 1% 1%% R 0% 1% 0% 0% 0% 0%

n 887 870 901 775 725 669

Vancomicina % S 100% 100% 100% 100% 100% 100%n 887 870 901 775 725 669

y vancomicina en cepas de S. pneumoniae . Chile, 2007 - 2012.


Eritromicina

Levofloxacino


Resultados análisis de susceptibilidad a eritromicina, levofloxacino

Antimicrobiano < 5 5 - 14 ≥ 15 Total

% S 51% 87% 81% 71%% I 1% 1% 0% 1%% R 48% 12% 18% 29%

n 1639 428 2383 4450

% S 97% 97% 97% 97%% I 2% 3% 3% 3%% R 0% 0% 0% 0%

n 1639 428 2384 4451

Vancomicina % S 100% 100% 100% 100%n 1639 428 2384 4451

Eritromicina

Levofloxacino

Resultados análisis de susceptibilidad a eritromicina, levofloxacino y vancomicina en cepas de S. pneumoniae por grupos etarios. Chile, 2007 - 2012.



Impacto Vacunación

n % n % n % n % n % n % n %

1 84 9% 155 18% 147 16% 98 13% 52 7% 34 5% 570 11.8% X X3 14 2% 34 4% 39 4% 49 6% 49 7% 61 9% 246 5.1% X4 17 2% 29 3% 19 2% 25 3% 23 3% 8 1% 121 2.5% X X5 30 3% 9 1% 23 3% 31 4% 25 3% 14 2% 132 2.7% X X6A 39 4% 39 4% 44 5% 43 6% 43 6% 27 4% 235 4.9% X6B 33 4% 42 5% 39 4% 25 3% 53 7% 23 3% 215 4.5% X X7F 49 6% 55 6% 74 8% 57 7% 44 6% 55 8% 334 6.9% X X9V 9 1% 23 3% 20 2% 11 1% 13 2% 13 2% 89 1.8% X X14 176 20% 150 17% 171 19% 146 19% 132 18% 95 14% 870 18.0% X X16F 0 0% 0 0% 2 0% 3 0% 2 0% 8 1% 15 0.3%18C 31 3% 32 4% 27 3% 27 3% 19 3% 23 3% 159 3.3% X X19A 28 3% 36 4% 43 5% 36 5% 26 4% 37 6% 206 4.3% X19F 48 5% 36 4% 31 3% 36 5% 32 4% 21 3% 204 4.2% X X23F 36 4% 23 3% 36 4% 34 4% 20 3% 24 4% 173 3.6% X XNT 102 11% 24 3% 24 3% 3 0% 8 1% 11 2% 172 3.6%

Otros 191 22% 183 21% 162 18% 151 19% 184 25% 215 32% 1086 22.5%Total 59.4%* 73,6%*

10V 13V

* Porcentaje de casos con serotipos incluidos en las vacunas 10-valente y 13-valente. Fuente: Laboratorio de Referencia de Menigitis Bacteriana. Departamento de Laboratorio Biomédico. ISP, 2013.

Número y porcentaje de casos de ENI por serotipo y año.

Chile, 2007 - 2012.Total

Serotipo

887 870 901 775 725 669 4827

2007 2008 2009 2010 2011 2012

0%

10%

20%

30%

40%

50%

60%

70%

80%

90%

100%

2007

-20

10

2011

2012

2007

-20

10

2011

2012

2007

-20

10

2011

2012

< 12 meses 12 - 23 meses Total casos

Porc

en

taje

de c

aso

s

Grupo etario y periodo

Distribución porcentual de casos de ENI por serotipo y periodo en menores de 2 años y en el total de casos. Chile, 2007 - 2012.

14 1 7F 3 6A 6B NT Otros


n % n % n % n % n % n % n %

1 7 3% 8 3% 20 9% 7 4% 3 2% 2 2% 47 4.1% X X3 2 1% 3 1% 8 4% 0 0% 4 2% 6 7% 23 2.0% X

4 5 2% 5 2% 2 1% 6 3% 3 2% 0 0% 21 1.8% X X5 4 2% 5 2% 6 3% 4 2% 4 2% 2 2% 25 2.2% X X6A 15 6% 17 7% 17 8% 17 9% 17 10% 5 5% 88 7.6% X6B 21 9% 27 12% 19 8% 14 7% 27 16% 6 7% 114 9.9% X X7F 6 2% 11 5% 7 3% 6 3% 5 3% 3 3% 38 3.3% X X9V 0 0% 4 2% 3 1% 0 0% 2 1% 2 2% 11 1.0% X X14 81 33% 74 32% 78 35% 64 33% 52 31% 14 15% 363 31.5% X X16F 0 0% 0 0% 0 0% 1 1% 0 0% 1 1% 2 0.2%18C 14 6% 12 5% 8 4% 12 6% 5 3% 5 5% 56 4.9% X X19A 12 5% 19 8% 8 4% 11 6% 5 3% 8 9% 63 5.5% X19F 23 9% 11 5% 10 4% 16 8% 12 7% 1 1% 73 6.3% X X23F 14 6% 8 3% 11 5% 10 5% 4 2% 1 1% 48 4.2% X XNT 14 6% 6 3% 1 0% 1 1% 2 1% 1 1% 25 2.2%

Otros 25 10% 24 10% 26 12% 23 12% 24 14% 34 37% 156 13.5%Total 69,0%* 84,1%*

* Porcentaje de casos con serotipos incluidos en las vacunas 10-valente y 13-valente.


243 234 224 192 169 91 1153

2010 2011 2012Serotipo

2007 2008 2009

Número y porcentaje de casos de ENI en menores de 2 años, por serotipo y año.

Chile, 2007 - 2012.Total

10V 13V

0

20

40

60

80

100

120

140

1 3 5 7 9 11 1 3 5 7 9 11 1 3 5 7 9 11 1 3 5 7 9 11 1 3 5 7 9 11 1 3 5 7 9 11

2007 2008 2009 2010 2011 2012

N°

de

ca

so

s

Año y mes

Evolución mensual de casos de ENI totales, y según pertenencia a vacuna 10-V. Chile, 2007 - 2012.

Total casos Casos serotipos pertenecientes a vacuna 10-V Casos serotipos no pertenecientes a vacuna 10-V


0

5

10

15

20

25

30

35

40

1 3 5 7 9 11 1 3 5 7 9 11 1 3 5 7 9 11 1 3 5 7 9 11 1 3 5 7 9 11 1 3 5 7 9 11

2007 2008 2009 2010 2011 2012

N°

de

ca

so

s

Año y mes

Evolución mensual de casos de ENI en menores de 2 años, y según pertenencia a vacuna 10-V. Chile, 2007 - 2012.

Total casos Casos serotipos pertenecientes a vacuna 10-V Casos serotipos no pertenecientes a vacuna 10-V

Inicio vacunación


0102030405060708090

100110120130140150

N° d

e ca

sos

2007 2008 2009 2010 2011 2012Año

Chile, 2007 - 2012.Casos de ENI en menores de 2 años, por grupo etario.

< 12 m 12 - 23 m

Inicio vacunación

0102030405060708090

100110120130140150

N° d

e ca

sos

2007 2008 2009 2010 2011 2012Año

Casos observados Casos predichos

Chile, 2007 - 2012.Casos observados y predichos de ENI en menores de 12 meses.

0102030405060708090

100110120130140150

N° d

e ca

sos

2007 2008 2009 2010 2011 2012Año

Casos observados Casos predichos

Chile, 2007 - 2012Casos observados y predichos de ENI en niños de 12 a 23 meses.

C. predichosC. observados % disminución C. predichosC. observados % disminución

< 12 m 87 81 6.9% 77 41 46.8%12 a 23 m 100 88 12.0% 97 50 48.5%Total 187 169 9.6% 174 91 47.7%

Comparación casos observados y predichos por grupo etario

Grupo de edad2011 2012

�Se construyeron modelos de Poisson para predecir el número de casos a partir de la cobertura y del tiempo, para menores de 1 años, y para niños de 1 a 2 años.

�En menores de 1 año se obtuvo que por cada unidad de aumento en el porcentaje de cobertura, se obtendría una disminución de un 4% en el número de casos.

�En niños de 1 a 2 años se obtuvo que por cada unidad de aumento en el porcentaje de cobertura, se obtendría una disminución de un 3% en el número de casos.

Modelos predictivos cobertura

Conclusiones • Reforzar la vigilancia integrada: componente

epidemiológico, clinico y laboratorial.

• Capacitar a los equipos de salud y de laboratorio para el mejor diagnóstico de la ENI.

• Diseñar las estrategias para mejorar las coberturas de vacunación.

• Realizar estudios complementarios para evaluar el impacto de la vacuna.

• Evaluar periódicamente el comportamiento epidemiológico de la enfermedad y los grupos de riesgo.

Gracias,

Vigilancia de Laboratorio · Las cepas provenientes de LCR y/o con diagnóstico de meningitis se...

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