Vigilancia Salmonella y Shigella: Colombia

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Fuente: Grupo de Microbiología Grupo de Microbiología Salmonella spp. Distribución de la susceptibilidad antimicrobiana por serotipos y año Distribución por procedencia y por año Distribución por serotipo y por año

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Grupo de Microbiología

Salmonella spp.

Distribución de la susceptibilidad antimicrobiana por serotipos y año

Distribución por procedencia y por año

Distribución por serotipo y por año

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Shigella sp.

Distribución de la susceptibilidad antimicrobiana por año

Distribución por procedencia y por año

Distribución por serotipo y por año

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Perfil de resistencia de los aislamientos de Shigella sp. 1997-2011

Año de aislamiento

1997 1998 1999 2000 2001 2002 2003 2004 2005 2006 2007 2008 2009 2010 2011

Cloranfenicol 46,9 65,1 50 33,5 28,9 41,1 42,2 38,8 45,2 43,2 52,1 62,7 60,6 55,4

Trimetroprim- sulfametozaxol 85,7 77,4 79,7 85,9 85,3 85,6 89 81,3 86,2 88,9 81,2 85,8 84 75,4 68,6

Ampicilina 65,3 74,7 62,2 56,4 50,6 49,8 55,7 63,1 55,7 68,2 59,3 65,1 69,3 76,8 66,8

Tetraciclina 97,5 96,4 91,9 94,5 95,3 97,1 97,5 93,5 96,5 94,9 93,8 95,4 89,3 90,0 84,5

Amoxacilina/ac .clav 9,5 19,6 11,9 19,8 43,3 38,6 54 64 30,8 12,1

Cefotaxima 0 1,2 1,4 0 0 0 0,4 0,6 0,3 0 0 0 0 0 0

Ciprofloxacina 0 1,2 0 0 0 0 0,4 0,3 0 0 0,3 0 0 0 0

Gentamicina 0 1,2 0 0,6 0 0 0,4 0 0 0,9 0,6 0,5 1,3 0 0

Ceftazidima 0 0 0,4 0 0,3 0 0 0 1,3 0 0

Acido Nalidixico 0,6 0,7 0,7 1,9 2,5 2,8 2,2 0,9 9,3 2,4 3,6

Datos hasta diciembre 31 de 2011

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Perfil de resistencia de los aislamientos de Shigella sp. 1997-2011

Datos hasta diciembre 31 de 2011

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Distribución de los aislamientos de Shigella sp., por procedencia y por año. 1997 – 2011

Departamento

Año de aislamiento Total

1997 1998 1999 2000 2001 2002 2003 2004 2005 2006 2007 2008 2009 2010 2011

n % n

Bogotá 27 47 46 102 107 181 225 287 246 153 246 130 130 195 214 2336 72,10

Antioquia 16 8 2 64 30 61 41 40 34 40 48 41 33 41 70 569 17,56

Valle 0 3 5 3 3 11 2 11 11 8 4 1 0 3 22 87 2,69

Santander 4 16 14 7 6 3 1 2 1 0 2 1 1 3 16 77 2,38

Nariño 0 0 0 1 0 1 0 1 2 2 6 20 8 14 5 60 1,85

Boyacá 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13 23 10 12 58 1,79

Cundinamarca 0 0 2 0 17 11 2 4 7 3 0 0 0 0 4 50 1,54

Norte Stder 0 0 0 0 2 2 0 0 3 1 2 4 3 4 15 36 1,11

Guainía 0 0 0 0 0 2 7 7 5 1 0 0 4 0 3 29 0,90

Huila 0 0 0 1 0 1 1 1 4 3 4 4 2 3 5 29 0,90

Risaralda 1 9 2 2 0 2 0 1 0 0 1 1 2 2 4 27 0,83

Arauca 0 0 0 1 1 1 2 2 2 0 0 0 0 0 2 11 0,34

Tolima 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 3 1 1 0 0 11 0,34

Atlántico 0 0 0 1 2 0 0 0 1 0 0 0 0 4 3 11 0,34

Amazonas 1 0 0 2 0 0 0 1 0 1 3 0 0 2 0 10 0,31

La Guajira 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4 0 0 0 0 4 8 0,25

Caldas 0 0 0 0 2 0 1 0 0 1 0 0 0 2 0 6 0,19

Cesar 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 0 0 3 0 6 0,19

Meta 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 2 2 7 0,22

Magdalena 0 0 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 4 0,12

Casanare 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 1 0 0 2 5 0,15

Bolívar 0 0 0 0 0 0 0 2 0 0 0 0 0 0 0 2 0,06

Guaviare 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 2 0,06

Córdoba 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 2 0,06

Sucre 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 2 0,06

Total 49 84 74 184 171 277 282 360 318 217 324 218 210 289 388 3445 100,00 Datos hasta diciembre 31 de 2011

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Distribución de los aislamientos de Shigella sp., por serotipo y por año. 1997 – 2011

Serotipo

Año de aislamiento Total

1997 1998 1999 2000 2001 2002 2003 2004 2005 2006 2007 2008 2009 2010 2011 n %

sonnei 18 21 21 83 79 163 153 175 168 119 178 141 100 167 228 1814 52,7

flexneri 29 61 48 89 83 106 119 168 129 87 140 77 105 119 154 1514 43,9

boydii 0 1 2 8 7 7 9 14 19 11 6 0 5 1 1 91 2,6

dysenteriae 2 0 2 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 6 0,2

NST 0 1 1 4 1 1 1 2 2 0 0 0 0 2 5 20 0,6

Total 49 84 74 184 171 277 282 360 318 217 324 218 210 289 388 3445 100,0 Datos hasta diciembre 31 de 2011

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Distribución de la susceptibilidad antimicrobiana de los aislamientos de Salmonella spp. por serotipos - 2011

Serotipos n %

Resistencia antimicrobiana %- 2011

AMP CXT CAZ CIP C TE SXT

I R I R I R I R I R I R I R

Typhimurium 261 30,3 3,4 29,9 1,1 2,3 0,4 3 2,7 2,3 0 21,8 0,4 78,2 15,7

Enteritidis 277 32,2 0,7 7,2 0 0 0 0 0 0,4 0,7 0 0,4 7,6 0 6,1

Typhi 58 6,7 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0

Otras 265 30,8 0 6 0,4 3,4 1,1 2,6 0,4 2,6 1,1 3 2,6 23 0 6

Total 861 100 Datos hasta diciembre 31 de 2011

Los espacios en blanco equivalen a 0%

AMP = ampicilina CXT = cefotaxima I = intermedio CIP = ciprofloxacina C = cloranfenicol R = resistente CAZ = ceftazidima TE = tetraciclina SXT = trimetoprim sulfametoxasol AN = ácido nalidixico

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Distribución de la susceptibilidad antimicrobiana de los aislamientos de Salmonella spp. por serotipos - 2010

Los espacios en blanco equivalen a 0%

AMP = ampicilina CXT = cefotaxima I = intermedio CIP = ciprofloxacina C = cloranfenicol R = resistente CAZ = ceftazidima TE = tetraciclina SXT = trimetoprim sulfametoxasol AN = ácido nalidixico

Serotipos n %

Resistencia antimicrobiana %- 2010

AMP CXT CAZ CIP C TE SXT

I R I R I R I R I R I R I R

Enteritidis 240 28,5 0,8 5,8 0 0,4 0 0 6,4 0,5 0,4 0,4 6,2 9,2 0 3,7

Typhimurium 217 25,8 6,5 28,1 0 0,5 0,4 0,9 6,4 0,5 0,5 12,4 0,9 84,4 0 19,2

Typhi 83 9,9 0 1,2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1,2

Otras 302 35,9 0,3 3,3 0 0,7 0 0,3 0,7 0,3 0 1,3 6,3 17,5 0 2,3

Total 842 100,0

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Distribución de la susceptibilidad antimicrobiana de los aislamientos de Salmonella spp. por serotipos - 2009

Los espacios en blanco equivalen a 0%

AMP = ampicilina CXT = cefotaxima I = intermedio CIP = ciprofloxacina C = cloranfenicol R = resistente CAZ = ceftazidima TE = tetraciclina SXT = trimetoprim sulfametoxasol AN = ácido nalidixico

Serotipos n %

Resistencia antimicrobiana % -2009

AMP CXT CAZ CIP C TE SXT

I R I R I R I R I R I R I R

Enteritidis 232 31,6 0 2 0 0,5 0 0,8 0 0 1 0 2 3 0 3

Typhimurium 204 27,8 2 32 0,5 0 0 0,4 1 0 1 0 2 3 0 3

Typhi 87 11,9 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1

Otras 211 28,7 0 3,8 0,9 0 0 0,5 0 0 4,7 0,9 9 32,2 0 2,4

Total 734 100,0

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Distribución de la susceptibilidad antimicrobiana de los aislamientos de Salmonella spp. por serotipos - 2008

Serotipos n %

Resistencia antimicrobiana %- 2008

AMP CXT CAZ CIP C TE SXT

I R I R I R I R I R I R I R

Typhimurium 151 31,3 11,2 34,4 2 0,7 0 3,3 0,7 0 8,6 18,5 7,3 74,8 0 24,5

Enteritidis 134 27,7 0,7 2,1 0 0,7 0,7 0 0 0 0 0 3,7 3,7 0 0,7

Typhi 52 10,8 1,9 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0

Otras 146 30,2 0,7 5,5 0,7 1,4 0 0,7 0 0 2,7 0,7 9,6 17,1 0 6,2

Total 483 100,0

Los espacios en blanco equivalen a 0%

AMP = ampicilina CXT = cefotaxima I = intermedio CIP = ciprofloxacina C = cloranfenicol R = resistente CAZ = ceftazidima TE = tetraciclina SXT = trimetoprim sulfametoxasol AN = ácido nalidixico

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I R I R I R I R I R I R I R

AMP CXT CAZ CIP C TE SXT

Po

rce

nta

je

Antibioticos

Porcentaje de aislamietos resistentes Salmonella Typhimurium 2008 a 2011

2008

2009

2010

2011

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Fuente: Grupo de Microbiología

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I R I R I R I R I R I R I R

AMP CXT CAZ CIP C TE SXT

Po

rce

nta

je

Antibioticos

Porcentaje de aislamientos resistentes SalmonellaEnteritidis 2008 a 2011

2008

2009

2010

2011

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Distribución de los aislamientos de Salmonella spp. por procedencia y por año 1997– 2011

Departamento Año de aislamiento Total

1997 1998 1999 2000 2001 2002 2003 2004 2005 2006 2007 2008 2009 2010 2011 n % Antioquia 25 33 48 47 49 121 124 111 129 154 214 166 206 264 256 1947 34,4

Bogotá 41 49 42 60 96 63 54 70 134 88 140 154 220 249 245 1705 30,4

Valle 2 6 5 10 11 9 23 23 27 33 34 25 39 59 47 353 6,3

Nariño 0 0 6 0 2 2 24 13 35 35 25 5 14 44 27 232 4,4

Córdoba 0 0 0 0 0 48 19 35 1 0 0 0 0 3 16 122 2,2

Santander 16 12 11 21 3 7 5 5 8 11 17 22 21 16 48 223 4

Huila 2 0 0 7 2 5 5 11 9 4 3 28 42 27 22 167 3,1

Tolima 4 5 3 3 1 2 3 1 4 4 5 6 9 5 4 59 1,1

Caldas 6 0 5 0 2 0 1 6 0 3 4 3 21 10 12 73 1,4

Cauca 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15 6 3 11 35 0,7

Caquetá 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 3 2 4 10 0,1

Norte Stder 2 7 4 0 0 0 4 1 3 1 2 8 17 50 62 161 2,3

Risaralda 1 3 1 4 2 4 1 3 0 2 1 3 18 28 26 97 1,6

Guainía 0 0 0 0 1 1 2 5 10 0 0 0 0 1 3 23 0,4

Atlántico 0 0 1 1 2 0 2 4 1 4 2 3 45 10 11 86 1,5

Boyacá 0 0 0 0 0 0 0 0 12 0 0 16 25 31 24 108 1,9

Cundinamarca 0 0 0 0 1 4 0 4 2 0 0 1 0 0 2 14 0,2

Magdalena 0 0 2 1 0 0 1 1 2 4 0 2 1 0 1 15 0,3

Arauca 0 0 5 1 0 1 0 0 0 1 0 2 1 3 4 18 0,3

Cesar 0 0 0 2 1 1 0 1 2 1 2 3 3 2 0 18 0,3

Amazonas 1 0 2 0 0 0 0 0 2 2 3 1 1 4 1 17 0,3

Putumayo 0 0 0 6 0 0 0 0 0 0 0 0 3 0 1 10 0,2

Quindío 0 0 0 0 0 3 0 2 0 0 0 0 5 4 3 17 0,3

La Guajira 0 2 0 0 1 0 0 0 1 1 0 0 0 0 5 10 0,2

Vaupés 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0

Meta 0 0 1 1 0 1 0 0 0 2 0 13 30 20 16 84 1,4

Chocó 0 0 0 0 0 0 3 0 0 0 0 3 0 6 0 12 0,2

Bolívar 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 1 1 5 0,1

Vichada 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 0 0 0 2 0

Casanare 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 3 0 2 0 0 7 0,1

Sucre 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9 9 0,1

Guaviare 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0

100 117 137 164 174 272 271 296 383 352 455 483 734 842 861 5641 100

Datos hasta diciembre 31 de 2011

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Fuente: Grupo de Microbiología

Distribución de los aislamientos de Salmonella spp. por serotipo y por año 1997 – 2011

Serotipo Año de aislamiento Total

1997 1998 1999 2000 2001 2002 2003 2004 2005 2006 2007 2008 2009 2010 2011 n %

Typhimurium 27 29 41 43 43 74 118 121 138 151 207 149 204 217 261 1823 32,32

Enteritidis 64 45 42 56 76 55 48 71 124 75 93 134 232 240 277 1632 28,93

Typhi 1 5 10 19 3 20 17 15 45 21 38 52 87 83 58 474 8,403

Otros 8 38 44 46 52 123 88 89 76 105 117 148 211 302 265 1712 30,35

Total 100 117 137 164 174 272 271 296 383 352 455 483 734 842 861 5641 100

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Fuente: Grupo de Microbiología

Los 10 serotipos de Salmonella spp. mas frecuentemente encontrados en el año 2011 en Colombia.

Rango Serotipo n %

1 Enteritidis 277 32,2

2

Typhimurium 240 27,9

Typhimurium var. 5- 21 2,4

3 Typhi 58 6,7

4 Dublin 26 3,0

5 Agona 16 1,9

6 Muenster 16 1,9

7 Braenderup 15 1,7

8 Panama 14 1,6

9 Saintpaul 14 1,6

10 Derby 12 1,4

11 Otros 152 17,7

Total 861 100 Datos hasta diciembre 31 de 2011

Page 16: Vigilancia Salmonella y Shigella: Colombia

Fuente: Grupo de Microbiología

Los 10 serotipos de Salmonella spp. mas frecuentemente encontrados en el año 2010 en Colombia.

Rango Serotipo n %

1 Enteritidis 240 28,5

2 Typhimurium 162 19,2

Typhimurium var. 5 - 55 6,5

3 Typhi 83 9,9

4 Panama 80 9,5

5 Dublin 25 3,0

6 Saintpaul 19 2,3

7 Uganda 18 2,1

8 Weltenreden 17 2,0

9 Braenderup 13 1,5

10 Derby 13 1,5

11 Otros 117 13,9

Total 842 100,0

Page 17: Vigilancia Salmonella y Shigella: Colombia

Fuente: Grupo de Microbiología

Los 10 serotipos de Salmonella spp. mas frecuentemente encontrados en el año 2009 en Colombia.

Rango Serotipo n %

1 Enteritidis 232 31,6

2 Typhimurium 157 21,4

Typhimurium var. 5 - 47 6,4

3 Typhi 87 11,9

4 Derby 40 5,4

5 Dublin 26 3,5

6 Braenderup 17 2,3

7 Saintpaul 14 1,9

8 Uganda 11 1,5

9 Newport 10 1,4

10 Agona 7 1,0

11 Otros 86 11,7

Total 734 100,0

Page 18: Vigilancia Salmonella y Shigella: Colombia

Fuente: Grupo de Microbiología

Los 10 serotipos de Salmonella spp. mas frecuentemente encontrados en el año 2008 en Colombia.

Rango Serotipo n %

1 Typhimurium 114 23,6

Typhimurium var. 5 - 37 7,7

2 Enteritidis 134 27,7

3 Typhi 52 10,8

4 Dublin 19 3,9

5 Saintpaul 14 2,9

6 Derby 12 2,5

7 Braenderup 10 2,1

8 Javiana 7 1,4

9 Newport 6 1,2

10 Sandiego 5 1,0

11 Otros 73 15,1

Total 483 100,0

Page 19: Vigilancia Salmonella y Shigella: Colombia

Fuente: Grupo de Microbiología

Patrones de PFGE-Xbal prevalentes de Salmonella Typhimurium

Colombia, 2005 (n=131)

Total de patrones de PFGE encontrados en S.Typhimurium 1997 - 2005 (n=193)

Departamento

Aislamientos recibidos

Total estudiado

Patrones PFGE-Xbala

COINJPX.XO1b

n n % 0003 0010 0062 Otros (n=22)

Antioquia 67 20 30 1 0 8 11

Bogotá 39 17 44 0 1 1 15

Valle 6 5 83 0 0 1 4

Nariño 18 18 100 0 0 0 18

Otros (6) 8 8 100 0 0 1 7

Total 138 68 49 1 1 11 55

Page 20: Vigilancia Salmonella y Shigella: Colombia

Fuente: Grupo de Microbiología

a Los patrones se establecen en un porcentaje de los aislamientos confirmados

en los departamentos bCO: Colombia; IN:Instituto Nacional de Salud; JPX:S.Typhimurium; X01: Xbal

Patrones de PFGE-Xbal prevalentes de Salmonella Enteritidis

Colombia-2005 (n=122)

Departamento Total recibido Total procesado

Patrones PFGE-Xbal COINJEG.XO1a

n n % 0001 0002 0022 otros (6)

Antioquia 20 6 30 5 1

Bogotá 70 53 76 50 1 2

Valle 13 13 100 11 2

Otros (6) 19 14 74 10 1 2 1

Total 122 86 70 76 2 2 6

Total de patrones de PFGE encontrados en Salmonella Enteritidis 1997 -2005 (n=45) a CO: Colombia; IN:Instituto Nacional de Salud; JEG:S.Enteritidis; X01: Xbal

Page 21: Vigilancia Salmonella y Shigella: Colombia

Fuente: Grupo de Microbiología

Patrones de PFGE-XbaI prevalentes de Salmonella Typhi

Colombia - 2005 (n=37)

Departamento Total recibido Total procesado

Patrones PFGE-Xbal COINJPP.XO1a

n n % 0035 0002 Otros (15)

Antioquia 25 21 84 9 3 9

Bogotá 4 4 100 4

Valle 3 3 100 3

Otros (2) 12 12 100 12

Total 44 40 91 9 3 28

Page 22: Vigilancia Salmonella y Shigella: Colombia

Fuente: Grupo de Microbiología

Caracterización molecular de brotes de Salmonella spp. por PFGE

Colombia-2005

Serotipo Departamento (municipio) n Fecha Patrones PFGE

Xbal (X01) BlnI (A26)

Typhimurium (JPX)

Nariño (Sotomayor) 10 13/06/2005 COINJPX.XO1.0139 SD

Nariño (Buesaco) 7 14/06/2005

Enteritidis (JEG)

Bogotá 41 20/05/2005 COINJEG.XO1.0001 COINJEG.A26. 0001

Typhi (JPP)

Antioquia (Apartadó) 10 07/06/2005 COINJPP.XO1.0035

SD Antioquia (Apartadó) 3 19/07/2005 COINJPP.XO1.0002

Boyacá (Tunja) 9 11/0172005 COINJPP.XO1.0029

Braenderup (JBP)

Nariño (San Bernardo) 10 25/07/2005 COINJBP.XO1. 0001 SD

n = número de aislamientos estudiados SD: sin datos Fuente: Grupo de Microbiología - Laboratorio de Biología Molecular

Page 23: Vigilancia Salmonella y Shigella: Colombia

Fuente: Grupo de Microbiología

Patrones de PFGE-XbaI (COIN.JPX.X01)a prevalentes de Salmonella Typhimurium Colombia, 2006

Año 2006 (n = 151)

Departamento Aislamientos

recibidos n

Total estudiado

Patrones PFGE-Xbal

COIN.JPX.X01

n % 0013 0062 0194

Otros

Antioquia 76 35 46 4 6 6 19 Bogotá 32 21 66 0 7 0 14 Valle 15 11 73 0 1 0 10 Nariño 13b 8 62 0 0 0 8 Santander 4 4 100 0 1 0 3 Caldas 2 2 100 0 0 0 2 Risaralda 2 2 100 0 1 0 1 Tolima 2 1 50 0 0 0 1 Cesar 1 1 100 0 1 0 0 Atlántico 1 1 100 0 0 0 1 Arauca 1 1 100 0 0 0 1 Meta 1 0 0 0 0 0 0 Amazonas 1 0 0 0 0 0 0

Total 151 87 58 4 17 6 60

aCO: Colombia; IN:Instituto Nacional de Salud; JPX:S.Typhimurium; X01: Xbal bDe estos aislamientos, 9 fueron aislamientos monofásicos: 1,4,5,12:i:-

Page 24: Vigilancia Salmonella y Shigella: Colombia

Fuente: Grupo de Microbiología

Patrones de PFGE-XbaI (COIN.JPX.X01)a prevalentes de Salmonella Typhimurium Colombia, 2007

Año 2007 (n = 207)

Departamento Aislamientos

recibidos n

Total estudiado

Patrones PFGE-Xbal

COIN.JPX.X01

n % 0013 0062 0168

Otros (n=41)

Antioquia 108 108 100 12 12 49 36

Bogotá 60 60 100 5 10 8 37

Valle 16 16 100 0 5 0 11

Nariño 9 9 100 0 4 0 5

Santander 9 9 100 0 2 0 7

Tolima 1 1 100 0 1 0 0

Caldas 1 1 100 1 0 0 0

Casanare 1 1 100 0 0 0 1

Amazonas 1 1 100 0 0 0 1

Huila 1 1 100 0 1 0 0

Total 207 207 100 18 35 57 98

aCO: Colombia; IN:Instituto Nacional de Salud; JPX:S.Typhimurium; X01: Xbal

Page 25: Vigilancia Salmonella y Shigella: Colombia

Fuente: Grupo de Microbiología

Patrones de PFGE-XbaI (COIN.JPX.X01)a prevalentes de Salmonella Typhimurium Colombia, 2008

Año 2008 (n =139 )

Departamento Aislamientos

recibidos n

Total estudiado

Patrones PFGE-Xbal

COIN.JPX.X01

n % 0257 0013 0168 0011 Otros

Antioquia 60 59 98 17 8 10 1 24

Bogotá 54 50 93 6 2 2 11 29

Santander 11 11 100 1 0 0 1 9

Valle 6 6 100 2 0 0 0 4

Boyacá 3 3 100 2 0 0 1 0

Nariño 2 1 50 0 0 0 0 0

Tolima 1 1 100 0 0 0 0 0

Risaralda 1 1 100 0 0 0 0 0

Cesar 1 1 100 0 0 0 0 0

Total 139 133 96 28 10 12 14 66

aCO: Colombia; IN:Instituto Nacional de Salud; JPX:S.Typhimurium; X01: Xbal

Page 26: Vigilancia Salmonella y Shigella: Colombia

Fuente: Grupo de Microbiología

Patrones de PFGE-XbaI (COIN.JPP.X01)a prevalentes de Salmonella Typhi

Colombia, 2006

Año 2006 (n = 21)

Departamento Aislamientos

recibidos n

Total estudiadob

Patrones PFGE-Xbal

COIN.JPP.X01

n % 0005 0064 Otros

Antioquia 13 13 100 6 2 5

Bogotá 3 3 100 0 0 3

Valle 2 2 100 1 0 1

Atlántico 1 1 100 0 0 1

Huila 1 1 100 1 0 0

Amazonas 1 1 100 0 1 0

Total 21 21 100 8 3 10

a

CO: Colombia; IN:Instituto Nacional de Salud; JPP:S.Typhi; X01: Xbal

b Total de ailamientos estudiados

Page 27: Vigilancia Salmonella y Shigella: Colombia

Fuente: Grupo de Microbiología

Patrones de PFGE-XbaI (COIN.JPP.X01)a prevalentes de Salmonella Typhi

Colombia, 2007

Año 2007 (n = 38)

Departamento Aislamientos

recibidos n

Total estudiadob

Patrones PFGE-Xbal

COIN.JPP.X01

n % 0005 0031 Otros

Antioquia 24 24 100 10 1 13

Bogotá 7 7 100 0 4 3

Valle 2 2 100 1 0 1

Tolima 2 2 100 0 0 2

Nariño 1 1 100 0 0 1

Santander 1 1 100 0 0 1

Atlántico 1 1 100 1 0 0

Total 38 38 100 12 5 21

a

CO: Colombia; IN:Instituto Nacional de Salud; JPP:S.Typhi; X01: Xbal

b Total de ailamientos estudiados

Page 28: Vigilancia Salmonella y Shigella: Colombia

Fuente: Grupo de Microbiología

Patrones de PFGE-XbaI (COIN.JPP.X01)a prevalentes de Salmonella Typhi

Colombia, 2008

Año 2008 (n= 52)

Departamento Aislamientos

recibidos n

Total estudiadob

Patrones PFGE-Xbal

COIN.JPP.X01

n % 0005 0074 Otros (n = 8)

Antioquia 13 13 100 7 0 6

Bogotá 5 4 80 1 0 3

Nte de Santander 4 4 100 0 4 0

Valle 3 3 100 0 0 3

Cauca* 15 15 100 0 0 15

Meta* 10 7 70 0 0 7

Santander 1 1 100 1 0 0

Risaralda 1 1 100 0 0 1

Total 52 48 92 9 4 35

a

CO: Colombia; IN:Instituto Nacional de Salud; JPP:S.Typhi; X01: Xbal

b Total de ailamientos estudiados

* Aislamientos pertenecientes a brotes

Page 29: Vigilancia Salmonella y Shigella: Colombia

Fuente: Grupo de Microbiología

Caracterización molecular de brotes de Salmonella spp. por PFGE Colombia, 2006

Año 2006

Serotipo Departamento

(Municipio) n Fecha

Patrones PFGEa

XbaI (X01) BlnI (A26)

Enteritidis (JEG)

Nariño (Sandoná) 2/3 27/02/2006 COIN.JEG.X01.0045

SD Nariño (Pasto) 2 03/04/2006

COIN.JEG.X01.0045 COIN.JEG.X01.0008

Typhimurium (JPX)

Antioquia (Medellín) 2 05/04/2006 COIN.JPX.X01.0194 SD

Variante Typhimurium (JPX)

Nariño (Sandoná) 4/9 14/06/2006 COIN.JPX.X01.0219 SD

Typhi (JPP)

Antioquia (Medellín) 2 05/04/2006 COIN.JPP.X01.0005 SD

Muenster (TDS)

Nariño (Túquerres) 3/4 02/11/2006 COIN.TDS.X01.0001 SD

aCO: Colombia; IN:Instituto Nacional de Salud; X01: Xbal; A26:BlnI

n: número de aislamientos estudiados SD: sin dato

Page 30: Vigilancia Salmonella y Shigella: Colombia

Fuente: Grupo de Microbiología

Caracterización molecular de brotes de Salmonella spp. por PFGE Colombia, 2007

°CO:Colombia; IN:Instituto Nacional de Salud; X01: Xbal; A26:BlnI

n: número de aislamientos estudiados

Año 2007

Serotipo Departamento

(Municipio) n Fecha

Patrones PFGEa

XbaI (X01) BlnI (A26)

Albany (TDC)

Valle (Cali) 2 30/10/2007 COIN.TDC.X01.0001 COIN.TDC.A26.0001

Braenderup (JBP)

Antioquia (Medellín) 2 02/03/2007 COIN.JBP.X01.0001 COIN.JBP.A26.0001

Derby (JDP)

Nariño (Pasto) 3 03/09/2007 COIN.JDP.X01.0001 COIN.JDP.A26.0001

Enteritidis (JEG)

Bogotá 2 19/04/2007 COIN.JEG.X01.0001 COIN.JEG.A26.0001

Essen (ESN)

Antioquia (Medellín) 2 15/03/2007 COIN.ESN.X01.0001 COIN.ESN.A26.0001

Javiana (JGG)

Antioquia (Medellín) 2 01/04/2007 COIN.JGG.X01.0001 COIN.JGG.A26.0001

Muenster (TDS)

Nariño (Pasto) 2 03/09/2007 COIN.TDS.X01.0001 COIN.TDS.A26.0001

Sandiego (JLX)

Bogotá 2 19/06/2007 COIN.JLX.X01.0001 COIN.JLX.A26.0001

Typhi (JPP)

Bogotá 2 28/06/2007 COIN.JPP.X01.0031 COIN.JPP.A26.0002

Antioquia (Sabaneta) 2 26/06/2007 COIN.JPP.X01.0002 COIN.JPP.A26.0001

Antioquia (Medellín) 3 25/07/2007 COIN.JPP.X01.0064 COIN.JPP.A26.0003

Antioquia (Medellín) 3 15/08/2007 COIN.JPP.X01.0005 COIN.JPP.A26.0001

Antioquia (Medellín) 2 03/09/2007 COIN.JPP.X01.0005 COIN.JPP.A26.0001

Typhimurium (JPX)

Bogotá 2 23/01/2007 COIN.JPX.X01.0195 COIN.JPX.A26.0007

Bogotá 2 06/02/2007 COIN.JPX.X01.0154 COIN.JPX.A26.0008

Antioquia (Medellín) 2 26/06/2007 COIN.JPX.X01.0216 COIN.JPX.A26.0006

Nariño (Pasto) 3 04/10/2007 COIN.JPX.X01.0062 COIN.JPX.A26.0005

Page 31: Vigilancia Salmonella y Shigella: Colombia

Fuente: Grupo de Microbiología

Caracterización molecular de brotes de Salmonella spp. por PFGE Colombia, 2008

Año 2008

Serotipo Departamento (Municipio) n Fecha

Patrones PFGEa

XbaI (X01) BlnI (A26)

Nottingham (NOI) Atlántico (Barranquilla) 2 19/05/2008 COIN.NOI.X01.0001 COIN.NOI.A26.0001

Enteritidis (JEG) Huila (Neiva) 2 09/05/2008 COIN.JEG.X01.0001 COIN.JEG.A26.0001

Enteritidis (JEG) Antioquia (Bello) 11 10/06/2008 COIN.JEG.X01.0001 COIN.JEG.A26.0001

Give (JEX) Huila (Neiva) 11 15/06/2008 COIN.JEX.X01.0001 COIN.JEX.A26.0001

Typhi (JPP) Cauca (Caloto) 13 23/12/2008 COIN.JPP.X01.0031 COIN.JPP.A26.0006

Typhi (JPP) Meta (Granada) 5 18/12/2008 COIN.JEX.X01.00058 COIN.JPP.A26.0004

aCO: Colombia; IN:Instituto Nacional de Salud; X01: Xbal; A26:BlnI

n: número de aislamientos estudiados

Page 32: Vigilancia Salmonella y Shigella: Colombia

Fuente: Grupo de Microbiología