El mejoramiento genético en la acuicultura Genetic improvement in aquaculture
Presented by Wayne Knibb [email protected]
gracias por la invitación para visitar y hablar
Australia y México tienen en común algunos de los más altos de la biodiversidad ... Parte de la biodiversidad está en el campus de la USC
Australia and Mexico have in common some of the highest biodiversity… Some of the biodiversity is on the campus at USC!
Genetic improvement – which method for industry?
I reviewed and published this subject in 2000
Here I will revisit this topic now in 2015
DOI: 10.1046/j.1365-2109.2000.00393.x
Mejoramiento genético - ¿cuál es el mejor método para la industria? He revisado y publicado este tema en 2000 Aquí voy a volver a este tema en el año 2015
USC trabaja la ciencia de la selección y domesticación:
USC works on selection and domestication of :
Overseas
¿Por qué la genética? Why genetics?
La genética puede cambiar la forma o el comportamiento de los animales para adaptarse a un propósito determinado Genetics can change the shape or behaviour of animals to suit a given purpose
La genética ha sido un éxito para la producción animal y vegetal terrestre - considere las comidas que has tenido hoy Genetics has been successful for terrestrial animal and plant production - consider the meals you’ve had today
Respuesta corta Short answer:
¿Por qué la genética? respuesta más larga Why genetics? – longer answer
Why genetics
productivity
profit
seeds
diseases
cumulative
Social outcomes
¿por qué la genética
Productividad
lucro
semillas
enfermedades
acumulativo
Los resultados sociales
¿Por qué la genética? respuesta más larga Why genetics? – longer answer
Why genetics
productivity
profit
seeds
diseases
cumulative
Social outcomes
¿por qué la genética
Productividad
lucro
semillas
enfermedades
acumulativo
Los resultados sociales
Pero, ¿cuánto de la mejora se debió a la genética? But how much of the improvement was due to genetics?
Alrededor del 90% About 90% doi: 10.3382/ps.0731785
¿Por qué la genética? respuesta más larga Why genetics? – longer answer
aumento de la productividad y la fiabilidad trae beneficio para los consumidores y la estabilidad a la industria increased productivity and reliability brings benefit to consumer and stability to industry
Why genetics
productivity
profit
seeds
diseases
cumulative
Social outcomes
¿por qué la genética
Productividad
lucro
semillas
enfermedades
acumulativo
Los resultados sociales
Why genetics?
Más lucro More profit Productos acuícolas tienen pequeños márgenes Aquaculture commodities have small margins Genética, con una generación, pueden duplicar el lucro Genetics, with one generation, can double the profit
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No Genetics With Genetics
Perc
ent
Profit over costs
Costs Return Return from genetics (one generation)
Why genetics
productivity
profit
seeds
diseases
cumulative
Social outcomes
¿por qué la genética
Productividad
lucro
semillas
enfermedades
acumulativo
Los resultados sociales
Las nuevas industrias que producen y venden "semillas“ New industries that produce and sell "seeds"
Why genetics
productivity
profit
seeds
diseases
cumulative
Social outcomes
¿por qué la genética
Productividad
lucro
semillas
enfermedades
acumulativo
Los resultados sociales
Why genetics?
1970 1975 1980 1985 1990 1995 2000
Epitheliocystis
Disease
Emergence of diseases in Israeli Mariculture
Amyloodinium ocellatum
Kudoa sp.
Lymphocystis
Cryptocaryon irritans
Myxidium leei
Mycobacterium
Pasteurella piscicida
VNN nodavirus
Occurrence
DOI: 10.1046/j.1365-2109.2000.00393.x
Why genetics
productivity
profit
seeds
diseases
cumulative
Social outcomes
¿por qué la genética
Productividad
lucro
semillas
enfermedades
acumulativo
Los resultados sociales
Why genetics?
Soluciones para las enfermedades? Solutions for diseases?
Las ganancias son acumulativos cada generación Gains are cumulative each generation
2002 2003 2004 2005 2006 2007 2008 2009
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Pe
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e c
on
tro
lAlto beneficio para los retornos de costes High benefit to cost returns The annual cost/benefit is 1:50 for the UK porcine breeding program (Mitchell et al. 1982), and 1:15 for Atlantic salmon (Gjedrem 1997).
Why genetics
productivity
profit
seeds
diseases
cumulative
Social outcomes
¿por qué la genética
Productividad
lucro
semillas
enfermedades
acumulativo
Los resultados sociales
Why genetics?
Los resultados sociales Social outcomes
Why genetics
productivity
profit
seeds
diseases
cumulative
Social outcomes
¿por qué la genética
Productividad
lucro
semillas
enfermedades
acumulativo
Los resultados sociales
Why genetics?
Types of genetic
gain
Mutations
Hybrids between species
Hybrids within species
Chromosome changes
Single Sex
Genetic Engineering
Selection between
lines
Selection within lines
omics
Major Genes
Diferentes formas de hacer mejoramiento genético Sólo unos pocos tienen éxito y predecible !! Different ways of making genetic improvement Only few are successful and predictable!!
Tipos de ganancia genética
Las mutaciones
Los híbridos entre especies
Los híbridos dentro de las
especies
Cambios en los cromosomas
Soltero Sexo
Ingeniería genética
La selección entre líneas
La selección dentro de las
líneas
'ómicas
Principales genes
Knibb, 2000, DOI: 10.1046/j.1365-2109.2000.00393.x
¿Qué valor de nuevas mutaciones? What value are new mutations?
carpa espejo mirror carp
colores en espáridos colours in sea bream
Las principales mutaciones genéticas Major gene mutations
tilapia roja Red tilapia
Knibb, unpublished
Types of genetic
gain
Mutations
Hybrids between species
Hybrids within species
Chromosome changes
Single Sex
Genetic Engineering
Selection between
lines
Selection within lines
omics
Major Genes
Tipos de ganancia genética
Las mutaciones
Los híbridos entre especies
Los híbridos dentro de las
especies
Cambios en los cromosomas
Soltero Sexo
Ingeniería genética
La selección entre líneas
La selección dentro de las
líneas
'ómicas
Principales genes
Report card:
Procedimiento genética
Publicaciones Uso commercial
volumen comercial Predecir resultado?
Ejemplo Manejo de la enfermedad?
Las mutaciones >10 <10 smenor no carpa espejo ?
Genetic Procedure Publication Number used commercially
Commercial volume Predictable outcome?
Example Used to manage disease
Classical Mutations >10 <10 small no mirror carp ?
Major genes Infectious Pancreatic Necrosis
• IPN is a virus, causes mortality to fry • Two major loci detected using DNA/molecular
approaches. • Explain ∼25% of variance. • In reality, selection is applied on the basis of survival,
not genes: Storset et al. 2007
Major Quantitative Trait Loci Affect Resistance to Infectious Pancreatic Necrosis in Atlantic Salmon (Salmo salar) Houston et al. 2008 Roslin Institute doi: 10.1534/genetics.107.082974
Types of genetic
gain
Mutations
Hybrids between species
Hybrids within species
Chromosome changes
Single Sex
Genetic Engineering
Selection between
lines
Selection within lines
omics
Major Genes
Tipos de ganancia genética
Las mutaciones
Los híbridos entre especies
Los híbridos dentro de las
especies
Cambios en los cromosomas
Soltero Sexo
Ingeniería genética
La selección entre líneas
La selección dentro de las
líneas
'ómicas
Principales genes
• IPN es un virus, causa de mortalidad de alevines • Dos principales loci detectados utilizando / enfoques
moleculares de ADN. • Explique ~ 25% de la varianza. • En realidad, la selección se aplica sobre la base de la
supervivencia, no genes: Storset et al. 2007
Report card:
Procedimiento genética
Publicaciones Uso commercial
volumen comercial Predecir resultado?
Ejemplo Manejo de la enfermedad?
Principales genes <5 0 ninguno sí IPN acaso
Genetic Procedure Publication Number used commercially
Commercial volume Predictable outcome?
Example Used to manage disease
Major genes <5 0 No yes IPN potential
Hybrids Los híbridos entre especies Between species:
Mule: horse donkey hybrid
Types of genetic
gain
Mutations
Hybrids between species
Hybrids within species
Chromosome changes
Single Sex
Genetic Engineering
Selection between
lines
Selection within lines
omics
Major Genes
Tipos de ganancia genética
Las mutaciones
Los híbridos entre especies
Los híbridos dentro de las
especies
Cambios en los cromosomas
Soltero Sexo
Ingeniería genética
La selección entre líneas
La selección dentro de las
líneas
'ómicas
Principales genes
Los híbridos entre especies / Hybrids (interspecific)
sparus another goes with hybrid set.JPG
Sparus aurata
X red sea bream goes with hybrid set.JPG
Pagrus major =
Híbrido / hybrid
Rasgos mejorados / combinar rasgos de los padres / Improved traits/ combine traits of parents Hybrid striped bass: considered better suited for culture in ponds than either parent species because they are more resilient to extremes of temperature and to low dissolved oxygen
Gorshkov, Gorshkova, Hadani, Gordin and Knibb, 2002 DOI: 10.1046/j.1439-0426.2002.00334.x
Esterilidad/ sterility
Róbalo rayado híbrido/ Hybrid striped bass
Types of genetic
gain
Mutations
Hybrids between species
Hybrids within species
Chromosome changes
Single Sex
Genetic Engineering
Selection between
lines
Selection within lines
omics
Major Genes
Tipos de ganancia genética
Las mutaciones
Los híbridos entre especies
Los híbridos dentro de las
especies
Cambios en los cromosomas
Soltero Sexo
Ingeniería genética
La selección entre líneas
La selección dentro de las
líneas
'ómicas
Principales genes
Report card:
Genetic Procedure Publication Number used commercially
Commercial volume Predictable outcome?
Example Used to manage disease
Interspecific hybrids >100 <10 Small to medium no Striped bass possibly
Genetic Procedure Publication Number used commercially
Commercial volume Predictable outcome?
Example Used to manage disease
Interspecific hybrids >100 <10 Small to medium no Striped bass possibly
Los híbridos dentro de las especies / Hybrids (interspecific)
Example to restore gene variation lost in separate lines
Types of genetic
gain
Mutations
Hybrids between species
Hybrids within species
Chromosome changes
Single Sex
Genetic Engineering
Selection between
lines
Selection within lines
omics
Major Genes
Tipos de ganancia genética
Las mutaciones
Los híbridos entre especies
Los híbridos dentro de las
especies
Cambios en los cromosomas
Soltero Sexo
Ingeniería genética
La selección entre líneas
La selección dentro de las
líneas
'ómicas
Principales genes
Pérdida y recuperación de la diversidad genética en masa seleccionada camarones plátano Loss and recovery of diversity in mass selected banana shrimp Knibb et al. 2014. doi:10.1016/j.aquaculture.2014.02.026
Types of genetic
gain
Mutations
Hybrids between species
Hybrids within species
Chromosome changes
Single Sex
Genetic Engineering
Selection between
lines
Selection within lines
omics
Major Genes
Tipos de ganancia genética
Las mutaciones
Los híbridos entre especies
Los híbridos dentro de las
especies
Cambios en los cromosomas
Soltero Sexo
Ingeniería genética
La selección entre líneas
La selección dentro de las
líneas
'ómicas
Principales genes
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Knibb et al. 2014. doi:10.1016/j.aquaculture.2014.02.026
Selected for the growth of each line separately for 15 generations
we started a closed breeding nucleus with 20 different DNA sequences and made ~10 separate lines
empezamos un núcleo de cría cerrada con 20 secuencias de ADN diferentes e hicimos ~ 10 líneas separadas
Seleccionado para el crecimiento de cada línea por separado durante 15 generaciones
90% of variation lost
90% de la variación perdido
Crossing restored variation Cruzando variación
restaurado
Types of genetic
gain
Mutations
Hybrids between species
Hybrids within species
Chromosome changes
Single Sex
Genetic Engineering
Selection between
lines
Selection within lines
omics
Major Genes
Tipos de ganancia genética
Las mutaciones
Los híbridos entre especies
Los híbridos dentro de las
especies
Cambios en los cromosomas
Soltero Sexo
Ingeniería genética
La selección entre líneas
La selección dentro de las
líneas
'ómicas
Principales genes
Hybrids Within species (between lines), intraspecific hybridization:
Why?: • Recover from
inbreeding • Form an outbred
nucleus • heterosis?
Conclusion: Interspecific hybridization is widespread , and supports initiation of a breeding program.
Los híbridos dentro de las especies
¿Por qué?: • Recuperarse de la
endogamia • Hacer un núcleo para
comenzar la selección
• heterosis?
conclusión: La hibridación interespecífica es generalizada, y es compatible con el inicio de un programa de cría.
Types of genetic
gain
Mutations
Hybrids between species
Hybrids within species
Chromosome changes
Single Sex
Genetic Engineering
Selection between
lines
Selection within lines
omics
Major Genes
Tipos de ganancia genética
Las mutaciones
Los híbridos entre especies
Los híbridos dentro de las
especies
Cambios en los cromosomas
Soltero Sexo
Ingeniería genética
La selección entre líneas
La selección dentro de las
líneas
'ómicas
Principales genes
Genetic Procedure Publication Number used commercially
Commercial volume Predictable outcome?
Example Used to manage disease
Intraspecific hybrids ~100 >1000 (most informal)
High, when linked to selection
No? Restore variation; Selection nucleus
Not directly
Procedimiento genética
Publicaciones Uso commercial
volumen comercial Predecir resultado?
Ejemplo Manejo de la enfermedad?
Los híbridos dentro de las especies
~100 >1000 la mayoría son informales
alta, cuando se vinculan a la selección
no? restaurar variación; núcleo de selección
no directamente
Report card:
Chromosome set manipulations (mostly triploids) The major consequence of triploidy is gonadal sterility, prevention of sexual maturation, genetic containment = better growth improves flesh quality at time of sexual maturation But outside the time of sexual maturation, triploids slows growth and reduces survival
Types of genetic
gain
Mutations
Hybrids between species
Hybrids within species
Chromosome changes
Single Sex
Genetic Engineering
Selection between
lines
Selection within lines
omics
Major Genes
Tipos de ganancia genética
Las mutaciones
Los híbridos entre especies
Los híbridos dentro de las
especies
Cambios en los cromosomas
Soltero Sexo
Ingeniería genética
La selección entre líneas
La selección dentro de las
líneas
'ómicas
Principales genes
Manipulaciones conjunto de cromosomas (en su mayoría triploides) La principal consecuencia de la triploidía es esterilidad gonadal, la prevención de la maduración sexual, contención genética = Mejor crecimiento mejora la calidad de la carne en el momento de la maduración sexual Pero fuera de la época de la maduración sexual, triploides ralentiza el crecimiento y reduce la supervivencia
Cromosoma establecer manipulaciones (triploides) Chromosome set manipulations (triploids)
Gorshkov, Gorshkova, Hadani, Gordin and Knibb, 2002 DOI: 10.1046/j.1439-0426.2002.00334.x
Sea bass triploids, Felip et al. (2001)
Types of genetic
gain
Mutations
Hybrids between species
Hybrids within species
Chromosome changes
Single Sex
Genetic Engineering
Selection between
lines
Selection within lines
omics
Major Genes
Tipos de ganancia genética
Las mutaciones
Los híbridos entre especies
Los híbridos dentro de las
especies
Cambios en los cromosomas
Soltero Sexo
Ingeniería genética
La selección entre líneas
La selección dentro de las
líneas
'ómicas
Principales genes
Uso commercial / Commercial use: • rainbow trout in USA, Canada, France, Japan, UK,
Korea, Iran, Turkey, Poland and Chile; • brown trout in UK and France; • brook trout in Canada and France; • Atlantic salmon in Canada and Chile; • Arctic charr in France, Canada, Iceland and Austria; • chinook salmon in Canada; • amago salmon, Oncorhynchus rhodurus, masu
salmon, O. masou, coho salmon, ayu, hirame, Paralichthys olivaceus, and cyprinid loach in Japan;
• grass carp in the USA • Pacific oyster
Presently, the total European triploid trout production is estimated at 15,000 t. In Europe, nearly 20% of the production is now based on triploid oysters, while in the USA around 50% of cultured Pacific oysters are triploids.
Types of genetic
gain
Mutations
Hybrids between species
Hybrids within species
Chromosome changes
Single Sex
Genetic Engineering
Selection between
lines
Selection within lines
omics
Major Genes
Tipos de ganancia genética
Las mutaciones
Los híbridos entre especies
Los híbridos dentro de las
especies
Cambios en los cromosomas
Soltero Sexo
Ingeniería genética
La selección entre líneas
La selección dentro de las
líneas
'ómicas
Principales genes
Cromosoma establecer manipulaciones (triploides) Chromosome set manipulations (triploids)
Report card:
Genetic Procedure Publication Number used commercially
Commercial volume Predictable outcome?
Example Used to manage disease
Chromosome manipulation
>100 ~10 Moderate possibly Triploid oysters Sort of
Procedimiento genética
Publicaciones Uso commercial
volumen comercial Predecir resultado?
Ejemplo Manejo de la enfermedad?
Cambios en los cromosomas
>100 ~10 mediano acaso ostras triploides
acaso
Soltero Sexo (todas hembras o todos macho) Monosex (all female or all male)
trout males may have deterioration of meat quality at maturation. Problems avoided by use of all-female XX diploids. All-female stocks are produced by crossing normal females with genetic females sexually inverted with androgens. 80% of the European trout production in freshwater is based on all female diploid stocks, even though females grow nearly 10% slower than diploid males up to pan-size.
INDIRECT MONOSEX PRODUCTIONINDIRECT MONOSEX PRODUCTION
Juvenile fish(males and females)
Juvenile fish(males and females)
TestosteroneTestosterone
Phenotypic males (males and inverted males)
Phenotypic males (males and inverted males)
X femalesX females
100% females(without hormones)
100% females(without hormones)
Types of genetic
gain
Mutations
Hybrids between species
Hybrids within species
Chromosome changes
Single Sex
Genetic Engineering
Selection between
lines
Selection within lines
omics
Major Genes
Tipos de ganancia genética
Las mutaciones
Los híbridos entre especies
Los híbridos dentro de las
especies
Cambios en los cromosomas
Soltero Sexo
Ingeniería genética
La selección entre líneas
La selección dentro de las
líneas
'ómicas
Principales genes
2cm
Gambas de agua dulce M. rosenbergii machos crecen grandes que las hembras Freshwater shrimp M. rosenbergii males grow larger than females
Types of genetic
gain
Mutations
Hybrids between species
Hybrids within species
Chromosome changes
Single Sex
Genetic Engineering
Selection between
lines
Selection within lines
omics
Major Genes
Tipos de ganancia genética
Las mutaciones
Los híbridos entre especies
Los híbridos dentro de las
especies
Cambios en los cromosomas
Soltero Sexo
Ingeniería genética
La selección entre líneas
La selección dentro de las
líneas
'ómicas
Principales genes
Genetic Procedure Publication Number used commercially
Commercial volume Predictable outcome?
Example Used to manage disease
Monosex >50 <10 Moderate yes Freshwater prawn
no
Procedimiento genética
Publicaciones Uso commercial
volumen comercial Predecir resultado?
Ejemplo Manejo de la enfermedad?
Soltero Sexo >50 <10 mediano sí gambas de agua dulce
no
Report card:
Ingeniería genética/ Genetic engineering
Salmón del Atlántico para la comida/ Atlantic salmon for food
Nuevas variedades para acuarios/ New varieties for aquaria
Para la investigación/ For research
Types of genetic
gain
Mutations
Hybrids between species
Hybrids within species
Chromosome changes
Single Sex
Genetic Engineering
Selection between
lines
Selection within lines
omics
Major Genes
Tipos de ganancia genética
Las mutaciones
Los híbridos entre especies
Los híbridos dentro de las
especies
Cambios en los cromosomas
Soltero Sexo
Ingeniería genética
La selección entre líneas
La selección dentro de las
líneas
'ómicas
Principales genes
Report card:
Genetic Procedure Publication Number used commercially
Commercial volume Predictable outcome?
Example Used to manage disease
Genetic engineering ~20 0 0 ? none Not commercially
Procedimiento genética
Publicaciones Uso commercial
volumen comercial Predecir resultado?
Ejemplo Manejo de la enfermedad?
Ingeniería genética ~20 0 0 ? no Ninguno comercialmente
La selección entre líneas/ Selection Between lines
Elija la mejor cepa antes de comenzar la selección/ Choose the best strain before starting selection
0
10
20
30
40
50
60
70
80
USA 2 Central America South America USA 1 South East Asia
Ave
rage
Wei
ght
in g
ms
Origin
Weight of different vannamei shrimp lines
Lines of Pacific white leg shrimp (Litopenaeus vannamei) from different origins show major differences in reproductive performance and growth traits, deformity, body colour and survival rate Giang, Ninh, Muu, Nguyen, Knibb in prep.
Types of genetic
gain
Mutations
Hybrids between species
Hybrids within species
Chromosome changes
Single Sex
Genetic Engineering
Selection between
lines
Selection within lines
omics
Major Genes
Tipos de ganancia genética
Las mutaciones
Los híbridos entre especies
Los híbridos dentro de las
especies
Cambios en los cromosomas
Soltero Sexo
Ingeniería genética
La selección entre líneas
La selección dentro de las
líneas
'ómicas
Principales genes
Report card:
Genetic Procedure Publication Number used commercially
Commercial volume Predictable outcome?
Example Used to manage disease
Selection- Among strains
~100 >10 Moderate No Labrax in Israel Possibly
Procedimiento genética
Publicaciones Uso commercial
volumen comercial Predecir resultado?
Ejemplo Manejo de la enfermedad?
La selección entre líneas
~100 >10 mediano No Lubina en Israel
acaso
La selección dentro de las líneas/ Selection Within lines La selección para growth, resistencia a enfermedades, la conformación del cuerpo, color/ Selection for growth, disease resistance, body conformation, color.
2002 2003 2004 2005 2006 2007 2008 2009
0
20
40
60
80
100
Pe
rce
nta
ge
of th
e c
on
tro
l
Types of genetic
gain
Mutations
Hybrids between species
Hybrids within species
Chromosome changes
Single Sex
Genetic Engineering
Selection between
lines
Selection within lines
omics
Major Genes
Tipos de ganancia genética
Las mutaciones
Los híbridos entre especies
Los híbridos dentro de las
especies
Cambios en los cromosomas
Soltero Sexo
Ingeniería genética
La selección entre líneas
La selección dentro de las
líneas
'ómicas
Principales genes
La selección dentro de las líneas Selection Within lines - heritabilities
Selección tendrá éxito siempre que la variación genética de estos rasgos, es decir, no cero heredabilidades
heredabilidades: cuánta variación para el peso, la reproducción, la supervivencia, la grasa, índice de condición, los niveles de virus, se debe a la genética
Selection will succeed provided there is genetic variation for these traits, ie non zero heritabilities
heritabilities: how much variation for weight, reproduction, survival, fat, condition index, virus levels, is due to genetics
ISSN 0792-156X
10.1016/j.aquaculture.2006.05.039
10.1186/s12863-014-0132-5 10.1016/j.aquaculture.2006.05.042
10.1016/j.aquaculture.2013.03.002
Types of genetic
gain
Mutations
Hybrids between species
Hybrids within species
Chromosome changes
Single Sex
Genetic Engineering
Selection between
lines
Selection within lines
omics
Major Genes
Tipos de ganancia genética
Las mutaciones
Los híbridos entre especies
Los híbridos dentro de las
especies
Cambios en los cromosomas
Soltero Sexo
Ingeniería genética
La selección entre líneas
La selección dentro de las
líneas
'ómicas
Principales genes
La selección dentro de las líneas Selection Within lines - heritabilities Familias camarón muestran diferencias hereditarias en los niveles del virus = primero de estos informes en la acuicultura Shrimp families show heritable differences in virus levels = first such report in aquaculture
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LOG
HP
V c
op
y n
um
ber
Family
Knibb et al. 2015. doi:10.1016/j.jip.2015.05.002
Types of genetic
gain
Mutations
Hybrids between species
Hybrids within species
Chromosome changes
Single Sex
Genetic Engineering
Selection between
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Tipos de ganancia genética
Las mutaciones
Los híbridos entre especies
Los híbridos dentro de las
especies
Cambios en los cromosomas
Soltero Sexo
Ingeniería genética
La selección entre líneas
La selección dentro de las
líneas
'ómicas
Principales genes
La selección dentro de las líneas - respuestas de selección Selection within lines – selection responses
For growth, see Nguyen’s paper
Species Trait Gain Generations
where Response per generation
Salmon growth >50% >10 Norway, etc
5
disease resistance Norway, etc
Tilapia growth Asia 5
salinity tolerance Asia
Vannamei fisease/ white spot ~80% ~10 Columbia 5
growth ~50% ~10 Asia
Carps, various
growth 5
disease
Kingfish growth/ condition index
20% 2 Australia 5-10
Many other examples ==== wayne read the reviews
Types of genetic
gain
Mutations
Hybrids between species
Hybrids within species
Chromosome changes
Single Sex
Genetic Engineering
Selection between
lines
Selection within lines
omics
Major Genes
Tipos de ganancia genética
Las mutaciones
Los híbridos entre especies
Los híbridos dentro de las
especies
Cambios en los cromosomas
Soltero Sexo
Ingeniería genética
La selección entre líneas
La selección dentro de las
líneas
'ómicas
Principales genes
Report card: Genetic Procedure Publication Number used commercially
Commercial volume Predictable outcome?
Example Used to manage disease
Selection- within lines
~100 ~20 Very substantial Benefit cost: 10:1 to 50:1
Yes; if control inbreeding managed, and correlated responses understood
Salmon Norway
Yes
Procedimiento genética
Publicaciones Uso commercial
volumen comercial Predecir resultado?
Ejemplo Manejo de la enfermedad?
La selección dentro de las líneas
~100 ~20 Gran beneficio Sí, si el control de la endogamia logró, y las respuestas correlacionadas entiende
salmón de Noruega
sí
Report card:
Previously, selection was without knowledge of the genes (the “black box”) Now we have tools to open the black box… = possibility for “marker assisted selection” “genomic selection” so it is better than that based on the phenotype. Most of the new recently publications in aquaculture genetics concern some type of ‘omics!!!!!!!!!!! DNA microarrays GWAS SNP chips Evidence this works in dairy cattle, but there are special considerations here. No demonstrated used in aquaculture
doi: 10.7150/ijbs.3517
‘omics Anteriormente, la selección fue sin el conocimiento de los genes (el "recuadro negro") Ahora tenemos herramientas para abrir el cuadro de negro ... = Posibilidad de "La selección asistida por marcadores" "Selección genómica" por lo que es posiblemente mejor que la basada en el fenotipo. La mayor parte de la investigación en acuicultura de hoy se refiere a algún tipo de 'ómicas !!!!!!!!!!! microarrays de ADN GWAS chips de SNP Evidencia esto funciona en el ganado lechero, pero hay consideraciones especiales aquí. No se ha demostrado en la acuicultura
Types of genetic
gain
Mutations
Hybrids between species
Hybrids within species
Chromosome changes
Single Sex
Genetic Engineering
Selection between
lines
Selection within lines
omics
Major Genes
Tipos de ganancia genética
Las mutaciones
Los híbridos entre especies
Los híbridos dentro de las
especies
Cambios en los cromosomas
Soltero Sexo
Ingeniería genética
La selección entre líneas
La selección dentro de las
líneas
'ómicas
Principales genes
Report card:
Procedimiento genética
Publicaciones Uso commercial
volumen comercial Predecir resultado?
Ejemplo Manejo de la enfermedad?
Las mutaciones >10 <10 smenor no carpa espejo ?
Principales genes <5 0 ninguno sí IPN acaso
Los híbridos entre especies
>100 <10 pequeño y mediano no Striped bass acaso
Los híbridos dentro de las especies
~100 >1000 la mayoría son informales
alta, cuando se vinculan a la selección
no? restaurar variación; núcleo de selección
no directamente
Cambios en los cromosomas
>100 ~10 mediano acaso ostras triploides
acaso
Soltero Sexo >50 <10 mediano sí gambas de agua dulce
no
Ingeniería genética ~20 0 0 ? no Ninguno comercialmente
La selección entre líneas
~100 >10 mediano No Lubina en Israel
acaso
La selección dentro de las líneas
~100 ~20 Gran beneficio sí salmón de Noruega
sí
'ómicas >100 1 ? sí Camarones en Indonesia?
sí
Genetic Procedure Publication Number used commercially
Commercial volume Predictable outcome?
Example Used to manage disease
Classical Mutations >10 <10 small no mirror carp ?
Major genes <5 0 No yes IPN potential
Interspecific hybrids >100 <10 Small to medium no Striped bass possibly
Intraspecific hybrids ~100 >1000 (most informal)
High, when linked to selection
No? Restore variation; Selection nucleus
Not directly
Chromosome manipulation
>100 ~10 Moderate possibly Triploid oysters Sort of
Monosex >50 <10 Moderate yes Freshwater prawn
no
Genetic engineering ~20 0 0 ? none Not commercially
Selection- Among strains
~100 >10 Moderate No Labrax in Israel Possibly
Selection- within lines
~100 ~20 Very substantial Benefit cost: 10:1 to 50:1
Yes Salmon Norway
Yes
‘omics >100 1 ? Yes Shrimp Indonesia?
Yes
Genetic improvement – which method for industry?
I reviewed and published this subject in 2000
Here I will revisit this topic now in 2015
DOI: 10.1046/j.1365-2109.2000.00393.x
Mejoramiento genético - ¿cuál es el mejor método para la industria? He revisado y publicado este tema en 2000 Aquí voy a volver a este tema en el año 2015
La selección dentro de las líneas/ Selection Within lines La selección para growth, resistencia a enfermedades, la conformación del cuerpo, color/ Selection for growth, disease resistance, body conformation, color.
2002 2003 2004 2005 2006 2007 2008 2009
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Types of genetic
gain
Mutations
Hybrids between species
Hybrids within species
Chromosome changes
Single Sex
Genetic Engineering
Selection between
lines
Selection within lines
omics
Major Genes
Tipos de ganancia genética
Las mutaciones
Los híbridos entre especies
Los híbridos dentro de las
especies
Cambios en los cromosomas
Soltero Sexo
Ingeniería genética
La selección entre líneas
La selección dentro de las
líneas
'ómicas
Principales genes
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