TRADUCCIÓN
- ARN de transferencia
- Aminoacil tRNA sintetasa
- Ribosomas
-El proceso de traducción
elementos necesarios
en eucariotas
en procariotas
tRNA
aa tRNAsintetasatRNA
cargado ribosomamRNA
tRNAsAdaptan física e informacionalmenteal mRNA con la proteína codificada
Prokaryotic tRNA genes
Eukaryotic tRNA genes
7 pb
5 pb
5 pb
3-4 pb
Elementos de identidad en los tRNAs
Estructura terciaria de un tRNA
AA+ATP+AARS AARSAA-AMP+PPi
AARSAA-AMP+tRNA AARS+AA-tRNA
+AMP
enlace covalente del aminoácido al extremo 3´CCA del tRNA
Activación y anclaje covalente del aminoácido al tRNA
Yeast AspRS·tRNAasp·ATP Complejo del tipo II
E. coli GlnRS·tRNAgln · ATP Complejo del tipo I
Eucariótico Procariótico Valor S 40S 30S Masa molecular 1,400 kDa 900 kDa rRNAs 18S, 1900 nts 16S, 1540 nts Proteínas > 33 21 Valor S 60S 50S Masa molecular 2,800 kDa 1,600 kDa rRNAs 28S, 4700 nts
5.8S, 160 nts 5S, 120 nts
23S, 2900 nts 5S, 120 nts
Proteínas > 49 34
Estructura y función del ribosoma
sitios funcionales en el ribosoma
5’
3’
Estructura de la subunidad grande
1. rRNA 16S
2. rRNA 5S
3. proteínas (LSU)
4. centro peptidil-transferasa y mecanismo catalítico
rRNAs 23S y 5S en la estructura terciaria del ribosoma
estructura terciaria del rRNA 5s
Bases conservadas en la estructura terciaria de la subunidad grande
bases muy conservadas (rojo)-ligado de substrato y factores-actvidad catalítica-estabilización de estructura tridimensional (gran número de adeninas)
extensiones variables(verde)
Estructura de proteínas ribosomales
13/30 proteínas presentan extensiones largas:-estabilizan el plegamiento terciario- rellenan los huecos- funcionan como un pegamento molecular-23/29 interaccionan con más de un dominio
rRNA 23s- 1157/2923 nucleótidos hacen contactos de van der Waals con proteínas
Localización de proteínas en la subunidad grande del ribosoma
Estructura cristalográfica del ribosoma de Haloarcula marismortui a 2.4Å
Túnel de salida de la proteína y extensiones cercanas de proteínas ribosomales
Túnel de salida de la proteína en la subunidad grande del ribosoma
Comparación de las estructuras secundarias predichas para los rRNAs 16S de (a) Halobacterium volcanii, (b) levadura y (c) mitocondria bovina
Traducción
Fibroína 0.1 m
Resumen del tema de la traducción
Bioquímica de la traducción
Procariotes: 20aa/s = 20s por 400 AA/proteína
Eucariotes: 2 aa/s
1. Activación del aminoácido (ATP, aminoacil-tRNA sintetasa)
2. Pegado covalente del AA al 3´OH del CCA terminal del tRNA
3. Unión del tRNA al mRNA por apareaminento codón-anticodón
4. Formación del enlace peptídico en el ribosoma
5. Terminación del polipéptido
INICIO DE LA TRADUCCIÓN
INICIO DE LA TRADUCCIÓN
C A P DEPENDIENTE
ELONGACIÓN DE LA TRADUCCIÓN
Mecanismo de formación del enlace peptídico
Formación del enlace peptídico
TERMINACIÓN DE LA TRADUCCIÓN
Mecanismo de terminación del polipéptido
Mecanismo de inicio de la traducción en E. coli
Estructura del factor de iniciación de la traducción EF-Tu unido a GDP y a GDPNP
Orientación de las moléculas de tRNA unidas a los sitios E-, A- y P-
anticodones
Algunos antibióticosque funcionan comoinhibidores de latraducción en bacterias
Rescate de ribosomas bacterianos por Rescate de ribosomas bacterianos por tmRNAstmRNAs
Modificación de los rRNA y funcionalidad del ribosoma
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