Profesor: Dr. José Luis Medina Franco

Diseño de Fármacos Asistido por ComputadoraDepartamento de Farmacia, Facultad de QuímicaDIFAQUIM, UNAMEdificio F, cubículo 305medinajl@unam.mxwww.difacquim.com

Martes 9:00 – 12:00 AMSalón 2 de Posgrado, Edificio B, Facultad de Química

Facebook (DIFACQUIM, UNAM)

¿Motivación para inscribirse al curso?

Semestre 2019-1

Definir:

• Quimioinformática

• Bioinformática

• Modelado molecular

• Espacio químico

• Similitud molecular

Presentación del Curso

➢Temas del curso

➢Bibliografía

➢Programa de actividades

➢Evaluación

➢Cronograma

Semestre 2019-1

Temas

Semestre 2019-1

• Introducción al diseño de fármacos

• Historia de la quimionformática

• Bases de datos moleculares

• Representación molecular

• Espacio químico

• Similitud molecular

• Cribado virtual

• Panoramas de actividad y activity cliffs

• Tópicos selectos

Libros de Texto y Artículos Principales

• Leach AR, Gillet VJ (2007) An Introduction to Chemoinformatics. Dordrecht, The Netherlands: Springer

• Gasteiger J, Engel T. (2003) Chemoinformatics: A Textbook. Weinheim, Germany: Wiley VCH

• Schleyer PvJ. Ed. (1998) Encyclopedia of ComputationalChemistry. New York, USA: Wiley

Semestre 2019-1

Lecturas Complementarias

Semestre 2019-1

Lecturas Complementarias

Semestre 2019-1

Duffy BC et al. (2012) Bioorg Med Chem 20:5324-5342

Revistas Científicas*Para participaciones en clase

• Journal of Chemical Information and Modeling*

• Journal of Cheminformatics*

• Molecular Informatics*

• F1000Research, Chemical Information

• Molecular Diversity*

• Journal of Computer-Aided Drug Design

• Journal of Medicinal Chemistry*

• ChemMedChem

• Otras Med Chem …

Semestre 2019-1

Desarrollo y aplicación de métodos

Investigar: ¿cuál es el enfoque(scope) de cada revista?

Aplicación de métodos

Modelado molelcular (3D)

Dinámica de las sesiones y actividades

• Repaso de tarea

• Clase

• Exposición de tema asignado

• Exposición de tema libre de revistas de revistas quimioinformáticas(applicación Researcher)

• Práctica y ejercicio(s) en clase

• 2 exámenes escritos (teórico, práctico)

• Presentaciones orales

• Guía de estudio del curso (resumen):

– Entrega el 24 de abril, 2018

Semestre 2019-1

Exposiciones de temas

• Se proporciona un artículo (o capítulo de libro) base 1 semana antes.

– Identificar un artículo adicional al proporcionado.

• Exposición oral de 30 min.

• Resumen en inglés del tema (oral, no lectura de resumen).

• TODOS entregan un resumen breve del artículo base (en inglés).

• TODOS hacen al menos una pregunta en inglés al ponente.

Semestre 2019-1

Asignados

Libre

• Antes de cada sesión, identificar un artículo de interés de revista de quimioinformática.

• En la clase, 1 o 2 alumnos darán un resumen oral breve del artículo (5-10 min) enfatizando en objetivo, estrategia, significancia y conclusiones (se recomienda la aplicación Researcher).

Guía de Estudio

• Formato cartel

– Para impresión larga y en tamaño oficio/carta

– Resumen ilustrado de conceptos más importantes del curso

• Versión en Español y Inglés

• Considerar desarrollar en formato digital:

– Página Web

– Aplicación para smartphone

Semestre 2019-1

Ejemplo de guía de estudio

Semestre 2019-1

Ejemplo de guía de estudio

Semestre 2019-1

Criterios de Evaluación

Semestre 2019-1

Actividad % Calificación final

2 examenes parciales 40%

Exposiciones 35%

Tareas 15%

Participaciones en clase 10%

TOTAL 100%

• Para escribir la calificación en actas:

Intervalo Calificación

oficial

de 0 a 5.99 puntos 5

de 6.0 a 6.59 puntos 6

de 6.60 a 7.59 puntos 7

de 7.60 a 8.39 puntos 8

de 8.40 a 9.39 puntos 9

de 9.40 a 10 puntos 10

Semestre 2019-1

Sin clase:21 agosto y 18 de septiembre (congresos)

Tecnología… y DiFAC?Expectativas Esperadas vs. Reales

The Hype Curve of Technology

Semestre 2019-1

Próxima sesión: 228 agosto, 2018

• Revisión de tarea: perfil de revistas

• Exposición del tema: Historia breve de la quimioinformática

– Lecturas base:

– WIRES Comput. Mol Sci. 2011, 46-56

– Molecules 2016, 21, 151

– Expone:

• Clase y práctica: bases de datos moleculares

• Consultar: Manual de Quimioinformática, Capítulo 1 (disponible en www.difacquim.com)

Semestre 2019-1