PROYECTO DOCENTE ASIGNATURA: Bioquímica II...

Grupo: Grp Clases Teóricas Bioquímica II.(933562)

ASIGNATURA:"Bioquímica II"

DATOS BÁSICOS DE LA ASIGNATURA/GRUPO

Titulación:

Asignatura:

Código:

Curso:

Año del plan de estudio:

Tipo:

Ciclo:

Período de impartición:

Departamento:

Créditos:

Dirección postal:

Centro:

Dirección electrónica:

0º

C/ PROFESOR GARCÍA GONZÁLEZ, S/N, 41012, SEVILLA

Segundo Cuatrimestre

Grado en Biología

Bioquímica II

http://www.departamento.us.es/dbiovege

Facultad de Biología

6

2009

2º

Obligatoria

1530013

Grp Clases Teóricas Bioquímica II. (2)Grupo:

Horas:

Área:

150

PROFESORADO

VARGAS MUÑOZ, MARIA DE LOS ANGELES (COORDINADOR/A)1

ORTIZ MARCHENA, MARIA ISABEL2

GONZALEZ GARCIA, MARIA DE LA CRUZ3

PEREZ RUIZ, JUAN MANUEL4

GARCIA HEREDIA, JOSE MANUEL5

MORENO BELTRAN, JOSE BLAS6

Titulacion: Grado en Biología

Curso: 2012 - 2013

PROYECTO DOCENTE

Curso académico: 2012/2013 Última modificación: 2012-10-30 1 de 21

OBJETIVOS Y COMPETENCIAS

Competencias transversales/genéricas

Objetivos docentes específicos

El objetivo final de la asignatura es que el estudiante adquiera los conocimientos básicos del metabolismo celular y de la expresión de lainformación genética. A partir de este objetivo final, podemos determinar en la programación de la asignatura una serie de objetivosespecíficos docentes:

-Entender la dinámica del metabolismo celular y captar los diseños convergentes de las rutas degradativas y los divergentes de las rutasbiosintéticas-Conocer las principales rutas degradativas y biosintéticas de carbohidratos, lípidos, compuestos nitrogenados y núcleotidos, así como suregulación-Aprender a analizar rutas biosintéticas y degradativas que comparten reacciones y enzimas comunes, y entender los mecanismos deregulación concertada y recíproca-Entender la fosforilación oxidativa como el paso final del metabolismo respiratorio y la fotofosforilación como el paso inicial delmetabolismo fotosintético-Entender la fijación fotosintética de carbono y de nitrógeno inorgánicos como las rutas fundamentales de inicio de la biosíntesis decarbohidratos, lípidos y aminoácidos en organismos fotosintéticos y en la biosfera-Visualizar anomalías congénitas en enzimas de rutas metabólicas y sus consecuencias fisiológicas y patológicas-Comprender la especialización metabólica de distintos órganos y tejidos en mamíferos y la integración y regulación del metabolismo en elconjunto del organismo-Conocer los principales procesos de expresión de la información genética y su regulación

Competencias

Habilidades elementales en informáticaCapacidad de análisis y síntesisCapacidad de organizar y planificarSolidez en los conocimientos básicos de la profesiónHabilidades para recuperar y analizar información desde diferentes fuentesResolución de problemasTrabajo en equipoCapacidad para aplicar la teoría a la prácticaHabilidades de investigaciónCapacidad de aprenderToma de decisiones

Competencias específicas

Adquirir los conocimientos bioquímicos básicos del metabolismo, su regulación y de la expresión de la información genéticaCapacidad de seleccionar información, preparar, exponer y defender públicamente un trabajoFamiliarizarse con la infraestructura general y específica de un laboratorio de bioquímicaInterpretación de datos experimentalesAprender métodos básicos de determinación de componentes celularesAprender métodos de determinación de actividades enzimáticas y su regulación in vivoManejo de bases de datos para el análisis de secuencias de genes y proteínas

CONTENIDOS DE LA ASIGNATURA

El temario se puede desglosar en 8 bloques temáticos:

Introducción al metabolismoMetabolismo de carbohidratosRespiración y fotosíntesisMetabolismo de lípidosMetabolismo de compuestos nitrogenadosMetabolismo de núcleotidosIntegración del metabolismoExpresión de la información genética y regulación

PROGRAMA DE CLASES TEÓRICAS

INTRODUCCIÓN AL METABOLISMO

Tema 1. Introducción al metabolismo.Flujos de materia y energía en la célula. Rutas catabólicas, anabólicas y anfibólicas. Sistemas de generación de energía metabólica.Evolución del metabolismo energético. Mapas metabólicos.Objetivos y Competencias: Entender la dinámica del metabolismo celular. Captar los diseños convergentes de las rutas degradativas y losdivergentes de las rutas biosintéticas. Entender la importancia de las rutas anfibólicas. A través del esbozo de la secuencia evolutiva deaparición en la biosfera de la fermentación, la fotosíntesis y la respiración, visualizar la estrategia vital de adaptación al medio yaprovechamiento de los recursos. Empezar a utilizar los mapas metabólicos como herramienta de trabajo y estudio.Número de horas: 1

METABOLISMO DE CARBOHIDRATOS

Tema 2. Metabolismo degradativo de glúcidos. I. Glucolisis.

Relación sucinta de los contenidos (bloques temáticos en su caso)

Relación detallada y ordenación temporal de los contenidos


Glucolisis: situación central en el metabolismo degradativo de glúcidos. Localización celular, fases, reacciones, enzimas. Balance energético.Regulación: enzimas reguladores, mecanismos de control.Objetivos y Competencias: Introducir el método de estudio de una ruta metabólica utilizando la glucolisis como sistema modelo. Conocer endetalle las fases, reacciones y enzimas de la glucolisis. Entender el concepto de la fosforilación a nivel de sustrato. Aprender a calcular elbalance energético de una ruta. Analizar la regulación de esta ruta introduciendo la perspectiva fisiológica en animales.Número de horas: 3

Tema 3. Metabolismo degradativo de glúcidos. II. Entrada de diferentes azúcares en la glucolisis.Degradación de otros monosacáridos: fructosa, galactosa, manosa. Degradación de disacáridos. Degradación de polisacáridos de reserva:glucógeno y almidón. Regulación de la degradación de glucógeno.Objetivos y Competencias: Analizar las rutas degradativas de otros azúcares, incidiendo en la convergencia de estas rutas en la vía centralglucolítica. Entender la regulación de la degradación del glucógeno en hígado y músculo como forma de coordinar el metabolismo de órganosen función de las necesidades generales de los organismos.Número de horas: 1,5

Tema 4. Vía oxidativa de las pentosas fosfato.Situación de la ruta en el metabolismo de los glúcidos. Localización celular. Fases, reacciones, enzimas. Carácter anfibólico. Modalidadesoperativas. Regulación.Objetivos y Competencias: Entender las funciones anfibólicas de esta ruta, como vía esencial de producción de NADPH, coenzima redoxpara procesos biosintéticos, y ribosa-5-P, para la biosíntesis de nucleótidos. Entender la flexibilidad de la ruta en función de las necesidadesmetabólicas.Número de horas: 1

Tema 5. Metabolismo degradativo de glúcidos. III. Encrucijada metabólica del piruvato.El piruvato, punto de confluencia del metabolismo degradativo de glúcidos. Posibles destinos. Vías fermentativas. Fermentación alcohólica:enzimas, balance, importancia industrial. Fermentación láctica: enzimas, balance, importancia industrial y en el ejercicio. Descarboxilaciónoxidativa a acetil-CoA. El complejo piruvato deshidrogenasa: localización celular, estructura, función, mecanismo de reacción, regulación.Objetivos y Competencias: Entender las diversas posibilidades de metabolización del piruvato, dependiendo del tipo de células y/o del estadometabólico de las mismas. Resaltar la proyección práctica de los conocimientos metabólicos. Analizar en profundidad el complejomultienzimático de la piruvato deshidrogenasa, incidiendo en su complejidad estructural y su mecanismo de reacción.Número de horas: 1,5

Tema 6. Oxidación del acetil-CoA: Ciclo del ácido cítrico.Papel central del ciclo ácido cítrico (o de los ácidos tricarboxílicos, o de Krebs) en el metabolismo respiratorio aerobio. Reacciones, enzimas ybalance. Regulación. Carácter anfibólico de la ruta: precursores biosintéticos. Reacciones anapleróticas conectadas al ciclo. Ciclo delglioxilato.Objetivos y Competencias: Entender el papel esencial del ciclo de Krebs como ruta oxidativa central del metabolismo respiratorio aerobio.Analizar el balance metabólico y energético. Entender el carácter anfibólico del ciclo, su regulación y las reacciones anapleróticas quepermiten entrada neta de esqueletos carbonados. Entender las posibilidades metabólicas del ciclo del glioxilato en plantas y bacterias.Número de horas: 2

Tema 7. Biosíntesis de glúcidos.Introducción en animales y plantas. Ruta central: gluconeogénesis a partir de piruvato. Costes energéticos. Complementos de la ruta:gluconeogénesis a partir de lactato (Ciclo de Cori), aminoácidos e intermediarios del ciclo de Krebs. Regulación concertada y recíproca de lagluconeogénesis y la glucolisis. Biosíntesis de glucógeno. Regulación concertada y recíproca de la biosíntesis y la degradación de glucógeno.Objetivos y Competencias: Aprender a analizar rutas biosintéticas y degradativas que comparten reacciones y enzimas comunes, y prestaratención a las reacciones de la gluconeogénesis que salvan pasos irreversibles de la glucolisis. Entender la versatilidad de utilización dedistintos sustratos gluconeogénicos, desde un punto de vista bioquímico y fisiológico. Entender los mecanismos de regulación concertada yrecíproca de vías biosintéticas y degradativas. Plantear las bases de la regulación hormonal del metabolismo animal.Número de horas: 2,5

RESPIRACIÓN Y FOTOSÍNTESIS

Tema 8. Respiración y fosforilación oxidativa.Introducción. Cadena respiratoria de transporte de electrones y protones. Componentes: estructura, función, reacciones parciales, reaccionesglobales, estequiometrías. Síntesis de ATP. La ATP sintasa: estructura, función, mecanismo de reacción, estequiometrías. Reacción global yacoplamiento energético en la fosforilación oxidativa. Lanzaderas y sistemas de transporte a través de la membrana mitocondrial. Regulaciónglobal del metabolismo respiratorio de glúcidos.Objetivos y Competencias: Entender la fosforilación oxidativa como el paso final del metabolismo respiratorio. Entender el mecanismo detransferencia de electrones a través de los grandes complejos proteicos de la membrana interna mitocondrial y su acoplamiento a latranslocación de protones. Comprender la estructura y mecanismo de acción de la ATP sintasa y el concepto de catálisis rotacional.Entender la transducción de la energía del gradiente electroquímico de protones en la síntesis de ATP. Entender los intercambiosmitocondria-citoplasma. Adquirir la visión global del metabolismo respiratorio de glúcidos y su regulación feed-back.Número de horas: 4

Tema 9. Fotosíntesis y fotofosforilaciónIntroducción. Pigmentos fotosintéticos accesorios y pigmentos transductores. Energética de la absorción de luz. Fotosistemas y centros dereacción. Concepto de reacción primaria. Cadena fotosintética de transporte de electrones y protones. Componentes: estructura, función,reacciones parciales, reacciones globales, estequiometrías. Síntesis de ATP: la ATP sintasa. Balances de la fotofosforilación no-cíclica y lacíclica. Regulación. Acoplamiento energético en la fotofosforilación. Procariotas fotosintéticos: consideraciones evolutivas.Objetivos y Competencias: Entender la fotofosforilación como el paso inicial del metabolismo fotosintético. Entender la energética de laabsorción de luz y la transducción de energía electromagnética en energía redox. Visualizar los mecanismos de transferencia de electrones através de los grandes complejos proteicos de la membrana tilacoidal y su acoplamiento a la translocación de protones. Comprender el origencomún de las ATP sintasas cloroplastídica y mitocondrial. Entender la


versatilidad fisiológica de la fotofosforilación cíclica y no-cíclica y su regulación. Visualizar la evolución del aparato fotosintético.Número de horas: 4

Tema 10. Asimilación fotosintética de carbono.Fijación fotosintética de CO2. El ciclo reductivo de las pentosas fosfato (ciclo de Calvin). Fases, enzimas, reacciones, balance global.Acoplamiento con la fotofosforilación. Regulación. Intercambios cloroplasto-citosol: biosíntesis de sacarosa. Biosíntesis de almidón.Regulación de la asimilación fotosintética de Carbono. Fotorrespiración. Fijación de CO2 en plantas C4 y crasuláceas.Objetivos y Competencias: Entender el ciclo de Calvin como la ruta fundamental de inicio de la biosíntesis de carbohidratos en organismosfotosintéticos y en la biosfera. Asimilar su dependencia absoluta respecto a la fotofosforilación. Abordar los mecanismos de fotorregulaciónenzimática. Entender la fisiología de la biosíntesis de sacarosa y de almidón. Entender la lógica de la regulación de la biosíntesis de glúcidosen plantas. Entender las pérdidas de eficiencia que ocasiona la fotorrespiración, y la estrategia de las plantas C4 para evitarla.Número de horas: 3

METABOLISMO DE LÍPIDOS

Tema 11. Metabolismo degradativo de lípidosIntroducción. Digestión, movilización y transporte de triglicéridos y ácidos grasos. Degradación de ácidos grasos: activación y transporte a lamitocondria, ß-oxidación y metabolización del acetil-CoA. Balance energético. Regulación. Degradación de ácidos grasos insaturados y de nºimpar de átomos de carbono. Cuerpos cetónicos. Diferencias fundamentales entre el metabolismo de lípidos en animales y plantas.Objetivos y Competencias: Entender la degradación de ácidos grasos como proceso fundamental de producción de energía en animales.Integrar el proceso en el eje del metabolismo respiratorio, con la confluencia del acetil-CoA al ciclo del ácido cítrico, y la entrada decoenzimas redox procedentes de la ß-oxidación a la fosforilación oxidativa. Entender el papel de los cuerpos cetónicos sintetizados en elhígado, como combustible alternativo a la glucosa en el cerebro, y afianzar la visión de la integración metabólica entre tejidos.Número de horas: 2

Tema 12. Biosíntesis de lípidos. I. Ácidos grasos.Etapas de la biosíntesis de ácidos grasos en animales y en plantas. Transporte de acetil-CoA desde la mitocondria al citoplasma. Formaciónde malonil-CoA. Síntesis de ácidos grasos: el complejo ácido graso sintasa. Estructura, funciones, mecanismo de reacción, evolución.Balance energético de la biosíntesis de ácidos grasos. Regulación. Elongación de ácidos grasos y formación de insaturados.Objetivos y Competencias: Entender el proceso de biosíntesis de ácidos grasos, y las diferencias entre animales y plantas debido a ladiferente localización celular de sus componentes. Entender las reacciones catalizadas por la ácido graso sintasa como el reverso de las dela ß-oxidación. Calcular costes energéticos.Número de horas: 2,5

Tema 13.Biosíntesis de lípidos. II. Derivados de ácidos grasos y lípidos isoprenoidesBiosíntesis de triglicéridos y lípidos de membrana. Biosíntesis de eicosanoides: prostaglandinas y tromboxanos. Funciones e importanciafarmacológica de la ruta. Biosíntesis de isopreno activo. Biosíntesis de colesterol y derivados. Regulación.Objetivos y Competencias: Abordar la biosíntesis de las clases principales de lípidos. Visualizar el papel central del AcetilCoA como precursorbiosintético de lípidos. A propósito de los inhibidores de la ciclooxigenasa, volver a incidir en la importancia farmacológica e industrial delconocimiento bioquímico. Resaltar la importancia fisiológica de los derivados del colesterol.Número de horas: 2

METABOLISMO DE COMPUESTOS NITROGENADOS

Tema 14. Degradación de proteínas y aminoácidos.Introducción. Digestión de proteínas exógenas. Degradación de aminoácidos: reacciones de transaminación y desaminación. Destino del N:excreción de compuestos nitrogenados. Ciclo de la urea. Destino del esqueleto carbonado: aminoácidos glucogénicos y cetogénicos.Objetivos y competencias: Abordar la digestión de proteínas procedentes de la dieta en animales. Entender las situaciones metabólicas enlas que los aminoácidos sufren degradación oxidativa en animales. Analizar los posibles destinos de los grupos nitrogenados, incidiendo en laexcreción en forma de urea propia de los mamíferos, y del esqueleto carbonado. Visualizar algunas anomalías congénitas en enzimas deestas rutas y sus consecuencias fisiológicas y patológicas.Número de horas: 1

Tema 15. Asimilación del nitrógeno inorgánico y biosíntesis de aminoácidos.Ciclo del nitrógeno en la naturaleza. Asimilación fotosintética de nitrato. Incorporación de amonio a esqueletos carbonados. Fijación denitrógeno molecular. Asimilación de azufre inorgánico. Biosíntesis de aminoácidos: familias biosintéticas. Limitaciones en animales.Objetivos y competencias: Entender que, así como la degradación de aminoácidos es propia del metabolismo animal, la asimilación denitrógeno y la biosíntesis de aminoácidos son procesos más propios del metabolismo en plantas y microorganismos. Comprender lanaturaleza fotosintética de la asimilación de nitrato. Entender las características y limitaciones de la fijación de N2. Visualizar las distintasrutas de biosíntesis de aminoácidos y las escasas consecuencias de la pérdida de muchas de ellas en animales.Número de horas: 1,5

METABOLISMO DE NUCLEÓTIDOS

Tema 16. Biosíntesis y degradación de núcleotidosDegradación de ácidos nucleicos. Reciclaje de nucleótidos. Degradación y excreción del N. Biosíntesis de novo de ribonucleótidos ydesoxirribonucleótidos.Objetivos y competencias: Entender los procesos de degradación, reciclaje y biosíntesis de novo de nucleótidos púricos y pirimidínicos.Visualizar las estrategias farmacológicas de inhibidores de la biosíntesis de nucleótidos como agentes quimioterápicos contra el cáncer.Número de horas: 1

INTEGRACIÓN DEL METABOLISMO

Tema 17. Integración del metabolismo en mamíferos.


Metabolismo específico de órganos y tejidos. Coordinación neuroendocrina del metabolismo. Regulación hormonal del metabolismoenergético: Insulina, glucagón, adrenalina. Otras hormonas relacionadas.Objetivos y competencias: Comprender la especialización metabólica de distintos órganos y tejidos en mamíferos y la integración delmetabolismo en el conjunto del organismo. Comprender la acción de las hormonas en la coordinación del metabolismo energético, integrandolas situaciones nutricionales y fisiológicas que desencadenan su liberación y actuación en tejidos diana.Número de horas: 1

EXPRESIÓN DE LA INFORMACIÓN GENÉTICA Y REGULACIÓN

Tema 18. Replicación, reparación y recombinación del DNA.Principales características de la replicación del DNA. DNA polimerasas. Replicación en bacterias. Horquilla de replicación. Replicación eneucariotas. Telómeros y telomerasa. Alteraciones y reparación del DNA. Mutaciones. Recombinación genética.Objetivos y competencias: Adquirir la base bioquímica de la transmisión de la información genética, así como de su mantenimiento y, aveces, variación y evolución. Entender el mecanismo enzimático de la replicación del DNA, y las diferencias entre procariotas y eucariotas.Conocer los sistemas de reparación del DNA que intervienen en el mantenimiento de la integridad de la secuencia. Entender las basesmoleculares y las consecuencias fisiológicas de la recombinación del DNA.Número de horas: 1

Tema 19. Metabolismo del RNA.Biosíntesis de RNA. RNA polimerasas. Secuencias promotoras, factores de transcripción y señales de terminación. Procesamiento ymaduración del RNA. El espliceosoma. Degradación del mRNA. Replicación y transcripción inversa de virus con RNA.Objetivos y competencias: Entender las bases y el mecanismo de la transcripción del DNA en los distintos tipos de RNAs. Analizar elprocesamiento del mRNA, el papel de los ribozimas, y sus consecuencias funcionales. Entender la transcripción inversa, visualizando lasimplicaciones de este proceso en el pensamiento sobre el origen de la vida.Número de horas: 2

Tema 20. Metabolismo de proteínas.Visión general del proceso. El código genético. Los tRNAs como adaptadores en la síntesis de proteínas. El ribosoma. Iniciación, elongacióny terminación de la traducción. Plegamiento y maduración de los péptidos nacientes. Degradación de proteínas: el sistema de la Ubiquitina. Elproteasoma.Objetivos y competencias: Entender la complejidad del proceso de biosíntesis de proteínas a partir de la información codificada en el mRNA.Entender el mecanismo de la traducción, junto con las posibilidades que tiene el sistema para traducir fielmente o editar y corregir el mensajegenético. Entender la función esencial de la degradación de proteínas, que impide la acumulación de proteínas innecesarias o defectuosas,en la regulación de la fisiología celular, remarcando su característica de consumir energía.Número de horas: 2,5

PROGRAMA DE CLASES PRÁCTICAS DE AULA

1. BioenergéticaCálculo del cambio de energía libre en reacciones metabólicas. Relación entre diferencia de potencial redox y cambio de energía libre.Cálculo de gradientes electroquímicos de iones. Cálculo del cambio de energía libre en sistemas de transporte a través de membranas.Cálculo de cambios de energía libre en la fosforilación oxidativa. Cálculo de la energía de fotones. Cálculo de cambios de energía libre en lafotofosforilación.Objetivos y competencias: Desarrollar la capacidad de resolución de problemas numéricos de bioenergética partir de los conceptos yecuaciones adquiridos en las clases de teoría. Profundizar en el entendimiento de las bases energéticas del metabolismo. Entender laenergética y las posibilidades de funcionamiento de los grandes procesos de transducción de energía de los seres vivos.Número de horas: 5

2. Metabolismo.Cálculo de rendimientos energéticos en el metabolismo degradativo. Cálculo de requerimientos energéticos en el metabolismo biosintético.Planteamiento y discusión de problemas metabólicos. Cuestiones de rutas metabólicas y su regulación.Objetivos y competencias: Desarrollar la capacidad de cálculo de los rendimientos energéticos del metabolismo degradativo y de losrequerimientos energéticos del metabolismo biosintético a partir de los conocimientos adquiridos en las clases teóricas. Desarrollar lacapacidad de análisis de situaciones metabólicas, experimentales o clínicas. Desarrollar la capacidad de interpretar datos.Número de horas: 2

PROGRAMA DE PRÁCTICAS DE LABORATORIO

1. Determinación de componentes celulares.Determinación de proteínas, clorofila y carotenoides en microalgas.Objetivos y competencias: Aprender métodos básicos de determinación de componentes celulares. Desarrollar la capacidad de trabajo engrupo.Número de horas: 3

2. Regulación in vivo de la actividad glutamina sintetasa.Determinación de la actividad glutamina sintetasa in vivo. Inhibición por amonio de la glutamina sintetasa.Objetivos y competencias: Aprender métodos de determinación de actividades ezimáticas y su regulación in vivo. Aprender a procesar datosexperimentales obtenidos en sus propias determinaciones. Desarrollar la capacidad de trabajo en grupo.Número de horas: 3

PROGRAMA DE PRÁCTICAS INFORMÁTICAS

1. Manejo de bases de datos para el análisis de secuencias de genes y proteínas.Búsqueda y análisis de secuencias de genes y proteínas en bases de datos tales como el Protein Data Bank, el GenBank, el Swiss-ProtProtein Knowledgebase, el Pubmed.Objetivos y competencias: Desarrollar habilidades de búsqueda y alineamiento de secuencias, comparación entre DNA genómico y cDNA,identificación de intrones y exones. Traducir secuencias de DNA en posibles polipéptidos. Obtener información


bioquímica relevante a partir de secuencias de proteínas.Número de horas: 2

ACTIVIDADES FORMATIVAS

Relación de actividades formativas del cuatrimestre

Horas presenciales:

Horas no presenciales:

Competencias que desarrolla:

Metodología de enseñanza-aprendizaje:

40.0

60.0

Adquirir los conocimientos bioquímicos básicos del metabolismo, su regulación y de la expresión de la información genéticaCapacidad de análisis y síntesisSolidez en los conocimientos básicos de la profesiónResolución de problemasCapacidad para aplicar la teoría a la prácticaCapacidad para aprender y generar nuevas ideasHabilidad para recuperar y analizar información desde diferentes fuentes

Las clases lectivas teóricas, de una hora de duración, se impartirán tres días a la semana en un aula del Edificio Rojo de la Facultad a lolargo del periodo lectivo del segundo cuatrimestre. En la impartición de estas clases se utilizará fundamentalmente el método depresentación asistido por ordenador en el que la explicación de los contenidos va teniendo el soporte en pantalla de esquemas, figurasetc. que ilustran y fijan la exposición y explicación. Para facilitar el seguimiento de la clase, la presentación completa de cada tema sepondrá a disposición de los estudiantes en la WebCT de la plataforma virtual de la Universidad. Los estudiantes podrán intervenir parasolicitar aclaraciones o solventar dudas, así como para pedir información adicional. De igual modo, se les podrá requerir a queparticipen en la discusión.

Clases teóricas

Horas presenciales:




7.0

13.0

Solidez en el conocimiento de las bases energéticas del metabolismoCapacidad de cálculo de los rendimientos y requerimientos energéticos del metabolismoCapacidad de análisis de situaciones metabólicas, experimentales y de interpretar datosCapacidad de aplicar la teoría a la prácticaCapacidad de análisis y resolución de problemas

Las clases prácticas de aula, de una hora de duración, se impartirán en número de siete en un aula del Edificio Rojo de la Facultad,adaptando su programación al desarrollo de los contenidos teóricos. El objetivo de estas clases es ayudar a entender y a fijar losconceptos y parámetros experimentales analizados en las clases de teoría y enseñar a manejarlos cuantitativamente. En estas clases,mucho más interactivas que las clases de teoría, se requerirá la participación activa de los estudiantes.

Clases prácticas de aula

Horas presenciales:




6.0

2.0

Aprender métodos básicos de determinación de componentes celularesAprender métodos de determinación de actividades enzimáticas y su regulación in vivoInterpretación de datos experimentalesCapacidad para aplicar la teoría a la prácticaCapacidad de trabajo en grupo

Esta actividad constará de un total de dos prácticas que se desarrollarán a lo largo del segundo cuatrimestre, según horario aprobadoen Junta de Facultad, en sesiones de una duración aproximada de 3 horas cada una, en los laboratorios del Departamento deBioquímica Vegetal y Biología Molecular, sitos en la primera planta del Edificio Verde de la Facultad. El profesor presentará losobjetivos, orientará el trabajo y realizará el seguimiento de las prácticas. Los estudiantes deberán realizar las prácticas siguiendo losguiones entregados por el profesor y las explicaciones previas y consultarán dudas tanto teóricas como metodológicas.

Prácticas de Laboratorio


Familiarizarse con la infraestructura general y específica de un laboratorio de bioquímicaSolidez en los conocimientos básicos de la profesión

Horas presenciales:




2.0

1.0

Manejo de bases de datos para el análisis de secuencias de genes y proteínasCapacidad para obtener información bioquímica relevante a partir de secuencias de aminoácidos y proteínasCapacidad de análisis y síntesisCapacidad para aplicar la teoría a la prácticaHabilidades para trabajar en grupoSolidez en los conocimientos básicos de la profesión

Tendrán lugar en las aulas informáticas de la Facultad, en la fecha y horario determinados por el Centro, y en una sesión de dos horas.El profesor presentará los objetivos, informará sobre las bases de datos de aplicación, enseñará a navegar por ellas y extraer lainformación de interés. El alumno deberá realizar las búsquedas orientadas y consultar dudas.

Prácticas informáticas

Horas presenciales:




5.0

11.0

Capacidad de seleccionar información, preparar, exponer y defender públicamente un trabajoHabilidades par trabajar en grupoCapacidad de generar nuevas ideasCapacidad de organizar y planificarCapacidad de crítica y autocríticaToma de decisiones

Los seminarios serán de realización voluntaria. Los estudiantes interesados en realizar esta actividad deberán inscribirse en el plazoque se abra a comienzos del cuatrimestre. Se realizarán en grupo (de 4 estudiantes), sobre un tema a elegir de una relación propuestapor la profesora dentro de los objetivos de la asignatura. La exposición de los seminarios la realizará uno de los componentes del grupoelegido por sorteo en el momento de la exposición, durará 20 minutos, en sesión pública, y se podrá utilizar para ello cualquiera de losmedios de presentación disponibles, tras lo cual los estudiantes y la profesora podrán realizar las preguntas y comentarios queconsideren oportunos. Los estudiantes entregarán a la profesora el trabajo completo por escrito el día de la exposición.

Exposiciones y seminarios

Horas presenciales:




0.0

3.0

Capacidad de análisis y síntesisHabilidades para recuperar y analizar información desde diferentes fuentesCapacidad para aplicar la teoría a la prácticaCapacidad de aprenderHábito de trabajo continuado

Búsquedas en la red y utilización de bibliografía.Ejercicios voluntarios para el alumnado, que podrá llevar a cabo donde quiera, y bajo la tutela del profesor. En la Biblioteca de laFacultad de Biología (planta baja del Edificio Verde) podrá consultar los textos recomendados por el profesorado e incluso disponer deellos en préstamos temporales regulados por normas de la Biblioteca.

AAD sin presencia del profesor


Horas presenciales:


0.0

0.0

Clases teóricas

BIBLIOGRAFÍA Y OTROS RECURSOS DOCENTES

Entre otras, son interesantes las páginas web de apoyo de los principales libros de Bioquímica, que se relacionan a continuación.

http://bcs.whfreeman.com/lehninger/default.aspPágina de apoyo al libro Bioquímica de Lehningerhttp://www.whfreeman.com/stryer/Página de apoyo al libro Bioquímica de Stryerhttp://www.aw-bc.com/mathews/Página de apoyo al libro Bioquímica de Mathewshttp://mhhe.com/mckee/Página de apoyo al libro Bioquímica de McKeehttp://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/Nomenclatura de Enzimashttp://www.rcsb.org/pdb/Protein Data Bankhttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/GenBankhttp://www.expasy.ch/sprot/Swiss-Prot Protein Knowledgebase

Otros recursos docentes

Bibliografía general

Lehninger: Principios de Bioquímica

Nelson, D.L. y Cox, M.M. 5ª ed

2009

Autores: Edición:

Publicación: 978-84-282-1486-5ISBN:

Bioquímica

Berg, J.M., Tymoczko, J.L. y Stryer, L. 6ª ed.

2008

Autores: Edición:

Publicación: 9788429176001ISBN:

Bioquímica

Mathews, C.K., van Holde, K.E. y Ahern,K.G.

3ª ed.

2002

Autores: Edición:

Publicación: 84-7829-053-2ISBN:

Bioquímica: La base molecular de la vida

McKee, T. y McKee, J.R. 4ª ed.

2006

Autores: Edición:


Bibliografía específica

Biología molecular de la célula

Alberts, B., Johnson, A., Lewis, J., Raff,M., Roberts, K. y Walter, P.

4ª ed.

2004

Autores: Edición:


Biochemistry and Molecular Biology of Plants

Buchanan, B.B., Gruissen, W. y Jones,R.L.

1ª ed.

2000

Autores: Edición:

Publicación: 0-943088-39-9ISBN:

SISTEMAS Y CRITERIOS DE EVALUACIÓN Y CALIFICACIÓN

Sistema de evaluación


Evaluación de las clases teóricas y de prácticas de aula

La evaluación de los conocimientos adquiridos en las clases teóricas y de prácticas de aula se realizará mediante un examen final enJunio, según el calendario de exámenes de la Facultad. En este examen se plantearán preguntas de desarrollo para valorar la capacidadde relacionar conocimientos, y algunas preguntas de cálculos numéricos. Cada pregunta llevará asignada una puntuación máxima. Lacontribución de la nota correspondiente al examen de teoría y de prácticas de aula será del 75 % de la calificación final. El 25 % restantecorresponderá a las demás actividades docentes. Será necesario obtener una calificación mínima de 4 sobre 10 en el examen de teoría yde prácticas de aula para que la puntuación obtenida en las demás actividades docentes sea considerada en la nota final. Para aprobar laasignatura será necesario obtener una nota igual o superior a 5, teniendo en cuenta que la nota del examen de teoría y de prácticas deaula contribuye un 75 % a la nota final.En la convocatoria de septiembre se realizará un examen final sobre los contenidos de las clases de teoría y de prácticas de aula, y semantendrán las calificaciones obtenidas en el seminario y en las prácticas de laboratorio e informáticas.A lo largo del desarrollo de las clases teóricas, al final de un tema o bloque de temas, se realizarán tests cortos (15-20 minutos deduración) sobre los conocimientos impartidos. Estos tests servirán como control de asistencia y seguimiento, y ponderarán como máximoun 10 % la nota conseguida en el examen final, siempre que ésta sea igual o superior a 4.

Evaluación de las prácticas de laboratorio

La evaluación de las prácticas de laboratorio se llevará a cabo valorando tanto la participación y aprovechamiento del estudiante como elresultado de un corto cuestionario escrito que deberán desarrollar al final de cada práctica sobre los contenidos, metodología y resultadosde la misma. La contribución de la nota de estas prácticas a la calificación final será de un máximo del 10 %.

Evaluación de la práctica informática

La evaluación de la práctica de informática se llevará a cabo valorando tanto la participación y aprovechamiento del alumno como elresultado de un corto ejercicio escrito que deberán desarrollar al final de la práctica sobre los contenidos de la misma. Su contribución a lacalificación final será de un máximo del 5 %.

Evaluación de los seminarios y exposiciones

La evaluación de los seminarios se llevará a cabo valorando tanto la elaboración del tema elegido, con especial atención en la puesta al díade la bibliografía utilizada en la preparación del mismo y su organización lógica, como su exposición oral y defensa respondiendo a laspreguntas que planteen el profesor o los compañeros. La contribución de la nota del seminario a la calificación final será de un máximo del10 %.

Se valorará el grado de consecución de los objetivos docentes de la asignatura. Los criterios de calificación se especifican en el apartadoanterior. Para aprobar la asignatura será necesario obtener una nota igual o superior a 5, teniendo en cuenta que la nota del examen deteoría y de prácticas de aula contribuye un 75 % a la nota final. A la nota del examen, siempre que esta sea igual o superior a 4, se lesumarán las notas del resto de actividades docentes, pudiendo contribuir a la nota final hasta un máximo de 1 punto, tanto las prácticas delaboratorio como los seminarios, y hasta un máximo de 0,5 puntos las prácticas informáticas.

Criterios de calificación

CALENDARIO DE EXÁMENES

CENTRO: Facultad de Biología

17/6/2013 9:30

Magna, 1.01, 1.02 y 2.01 del Edificio Rojo

Fecha: Hora:

Aula:

1 ª Convocatoria


4/9/2013 9:30

Magna, 1.01 y 1.02 del Edificio Rojo

Fecha: Hora:

Aula:

2 ª Convocatoria


17/12/2012 14:30

Magna Edificio Rojo

Fecha: Hora:

Aula:

3 ª Convocatoria

TRIBUNALES ESPECÍFICOS DE EVALUACIÓN Y APELACIÓN


FRANCISCO JAVIER FLORENCIO BELLIDOPresidente:

Vocal: AGUSTIN VIOQUE PEÑA

FRANCISCO FERNANDO DE LA ROSA ACOSTASecretario:

Primer suplente: MIGUEL ANGEL DE LA ROSA ACOSTA

MANUEL HERVAS MORONSegundo suplente:

MARIA DE LOS ANGELES VARGAS MUÑOZTercer suplente:


ANEXO 1:

HORARIOS DE LOS GRUPOS NO PRINCIPALES DE LA ASIGNATURA Y DEL GRUPO DEL PROYECTO

GRUPO: Grp Clases Teóricas Bioquímica II. (933562)

Calendario del grupo

CLASES DEL PROFESOR: VARGAS MUÑOZ, MARIA DE LOS ANGELES

HORARIO SIN ESPECIFICAR

GRUPO: Grp Clases Prácticas en aula Bioquímica II. (933565)


CLASES DEL PROFESOR: LARA CORONADO, CATALINA















GRUPO: Grp Clases en Seminario Bioquímica II. (933569)

















GRUPO: Grp Prácticas de Informática Bioquímica II. (933589)


CLASES DEL PROFESOR: GARCIA HEREDIA, JOSE MANUEL

































CLASES DEL PROFESOR: MORENO BELTRAN, JOSE BLAS













GRUPO: Grp Prácticas de Laboratorio Bioquímica II. (933573)


CLASES DEL PROFESOR: GONZALEZ GARCIA, MARIA DE LA CRUZ


CLASES DEL PROFESOR: PEREZ RUIZ, JUAN MANUEL













CLASES DEL PROFESOR: ORTIZ MARCHENA, MARIA ISABEL














PROYECTO DOCENTE ASIGNATURA: Bioquímica II...

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