Sóc fill biològic dels meus pares? Estudi de 16 marcadors genètics en 4 membres d'una família

28
Sóc fil l biològi c dels meus pares ? David Martínez Garcia Tutora: Nati Arnal

description

VIII Fòrum TRiCS David Martínez Científic - Biotecnologia Ins Antoni Martí i Franquès - Tarragona

Transcript of Sóc fill biològic dels meus pares? Estudi de 16 marcadors genètics en 4 membres d'una família

Page 1: Sóc fill biològic dels meus pares? Estudi de 16 marcadors genètics en 4 membres d'una família

Sóc fill biològic

dels meus pares ?

David Martínez Garcia

Tutora: Nati Arnal

Page 2: Sóc fill biològic dels meus pares? Estudi de 16 marcadors genètics en 4 membres d'una família

OBJECTIU DEL TREBALL

Page 3: Sóc fill biològic dels meus pares? Estudi de 16 marcadors genètics en 4 membres d'una família

HIPÒTESI

“Suposant que els dos fills fossin fills naturals de la parella, la probabilitat estadística en una prova de paternitat, maternitat i/o germandat, s’hauria d’apropar al 100%”.

Page 4: Sóc fill biològic dels meus pares? Estudi de 16 marcadors genètics en 4 membres d'una família
Page 5: Sóc fill biològic dels meus pares? Estudi de 16 marcadors genètics en 4 membres d'una família

1996: Primera PCR Multiplex

1944: Es demostra el DNA com a material genètic.

1958: Hipòtesi un gen- un enzim.

1995: Secüenciació completa del genoma d’un bacteri

2001: Publicació del genoma humà

1992: electroforèsi capil·lar

1990: Primers estudis sobre STRs

1983: desenvolupament de la PCR

2003: Inici del Projecte ENCODE

MIG SEGLE D’AVENÇOS

Page 6: Sóc fill biològic dels meus pares? Estudi de 16 marcadors genètics en 4 membres d'una família

ESTRUCTURA DEL GENOMA HUMÀ

DNA Intergènic

De copia única

Repetitiu

Pseudogens

DNA Extragènic

De copia únicaBaixa repetició

Repetitiu

Dispers

SINEs

LINEs

LTRs

Trasposons

En Tàndem

DNA satèl·lit

VNTR

STR

Page 7: Sóc fill biològic dels meus pares? Estudi de 16 marcadors genètics en 4 membres d'una família

EN QUÈ ENS DIFERENCIEM ELS HUMANS?

La variabilitat genètica

“Tan sols ens diferenciem en un 0,1 % del nostre

genoma”

Page 8: Sóc fill biològic dels meus pares? Estudi de 16 marcadors genètics en 4 membres d'una família

ELS POLIMORFISMES GENÈTICS

SNPs

SVs

INDELs

Page 9: Sóc fill biològic dels meus pares? Estudi de 16 marcadors genètics en 4 membres d'una família

ELS POLIMORFISMES GENÈTICS

VNTRs i STRs

RFLPs

Page 10: Sóc fill biològic dels meus pares? Estudi de 16 marcadors genètics en 4 membres d'una família

ESTUDI EXPERIMENTAL

• “Estudi de setze STRs per a quatre membres d'una família”

Page 11: Sóc fill biològic dels meus pares? Estudi de 16 marcadors genètics en 4 membres d'una família

MATERIALS I

PROCEDIMENTS

Page 12: Sóc fill biològic dels meus pares? Estudi de 16 marcadors genètics en 4 membres d'una família

OBTENCIÓ DEL DNA

Page 13: Sóc fill biològic dels meus pares? Estudi de 16 marcadors genètics en 4 membres d'una família

EXTRACCIÓ I PURIFICACIÓ

Tampò de lisis

Partícules magnètiques

Tampò de rentat

Tampò de rentat

Tampò de rentat

Tampò de rentat

Tampò de rentat

Contingut

Page 14: Sóc fill biològic dels meus pares? Estudi de 16 marcadors genètics en 4 membres d'una família

AMPLIFICACIÓ DEL DNA

Page 15: Sóc fill biològic dels meus pares? Estudi de 16 marcadors genètics en 4 membres d'una família

AMPLIFICACIÓ DEL DNA

Page 16: Sóc fill biològic dels meus pares? Estudi de 16 marcadors genètics en 4 membres d'una família

AMPLIFICACIÓ DEL DNA

Page 17: Sóc fill biològic dels meus pares? Estudi de 16 marcadors genètics en 4 membres d'una família

IDENTIFICACIÓ DE LES REGIONS POLIMÒRFIQUES

Page 18: Sóc fill biològic dels meus pares? Estudi de 16 marcadors genètics en 4 membres d'una família

IDENTIFICACIÓ DE LES REGIONS POLIMÒRFIQUES

Font d'alimentació

Recull de dades

ElèctrodesMostra a Analitzar

Capil·larLector

Page 19: Sóc fill biològic dels meus pares? Estudi de 16 marcadors genètics en 4 membres d'una família

STRS ANALITZADES

Page 20: Sóc fill biològic dels meus pares? Estudi de 16 marcadors genètics en 4 membres d'una família

RESULTATS

Page 21: Sóc fill biològic dels meus pares? Estudi de 16 marcadors genètics en 4 membres d'una família
Page 22: Sóc fill biològic dels meus pares? Estudi de 16 marcadors genètics en 4 membres d'una família

STR Pare Mare Germà 1 Germà 2

D3S1358 15/16 15/16 15/16 16/16

THO1 6/7 6/9.3 6/6 6/7

D21S11 30/31 30/31 30/31 31/31

D18S51 14/14 15/17 14/15 14/17

Penta_E 7/17 14/16 7/14 7/16

D5S818 11/12 11/12 11/12 11/12

D13S317 11/12 8/8 8/12 8/11

D7S820 10/10 10/13 10/10 10/10

D16S539 11/12 9/10 10/12 10/11

CSF1PO 10/12 12/13 12/13 10/13

Penta_D 9/9 11/12 9/12 9/11

Vwa 16/17 14/17 17/17 14/17

D8S1179 10/14 13/14 10/13 10/13

TPOX 8/9 8/8 8/9 8/9

FGA 23/23 20/23 20/23 20/23

HERÈNCIA D’AL·LELS

Page 23: Sóc fill biològic dels meus pares? Estudi de 16 marcadors genètics en 4 membres d'una família

CÀLCULS ESTADÍSTICS

Càlcul estadístic Mostres implicades Relacions conegudes Relacions desconegudes Resultat

Índex de paternitat amb la mare coneguda M1 M2 M3 M2 és mare de M3 M1 és pare de M3 99,9999860533486 %

Índex de paternitat amb la mare coneguda M1 M2 M4 M2 és mare de M4 M1 és pare de M4 99,9999959676124%

Paternitat i maternitat amb tots dos progenitors desconeguts

M1 M2 M3 --- M1 i M2 són progenitors de M3 99,999999999935%

Paternitat i maternitat amb tots dos progenitors desconeguts

M1 M2 M4 --- M1 i M2 són progenitors de M4 99,999999999992%

Germandat amb la mare coneguda M1 M2 M3 M4

M2 és mare de M3 i M4

M1 és pare de M3

M1 és pare de M4 99,99978%

Page 24: Sóc fill biològic dels meus pares? Estudi de 16 marcadors genètics en 4 membres d'una família

CONCLUSIONS

Mètode d’anàlisi Poder de discriminació

Sistemes ABO + Mn + Rh 1:10

Isoenzims presents en els eritròcits 1:10.000

4 tipus de VNTRs diferents 1:1.000.000

16 tipus de STRs diferents 1:10.000.000.000

Page 25: Sóc fill biològic dels meus pares? Estudi de 16 marcadors genètics en 4 membres d'una família

CONCLUSIONS

Grau de fiabilitat:

Page 26: Sóc fill biològic dels meus pares? Estudi de 16 marcadors genètics en 4 membres d'una família

CONCLUSIONS

Page 27: Sóc fill biològic dels meus pares? Estudi de 16 marcadors genètics en 4 membres d'una família

CONCLUSIONS

Page 28: Sóc fill biològic dels meus pares? Estudi de 16 marcadors genètics en 4 membres d'una família

Moltes gràcies

per la vostra

atenció !